1IQ7A

Ovotransferrin, c-terminal lobe, apo form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
343
structure length
341
Chain Sequence
RIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESCSKDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Anion-mediated Fe3+ release mechanism in ovotransferrin C-lobe: a structurally identified SO4(2-) binding site and its implications for the kinetic pathway.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 102
structure length 341
sequence length 343
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iq7A02
4U1ZA 3CVGA 1B32A 1FCKA 3LSXA 4ZDMA 1Q35A 3PUZE 4BDLA 3K6UA 1MY0A 4NF4A 2DS9A 3EN3A 3SEVA 3K4UA 1LSTA 4X48A 1ZMGA 3CFXA 4F39A 1B7HA 1XVXA 4QFPA 4C0RA 2F36A 2Y84A 1B3GA 4IGRA 3SESA 3PMXA 2DYXA 1SW5A 3PMWA 3R7XA 4OEUA 1H43A 2A5SA 2DWAA 1FTOA 1JQFA 3TQLA 1N7XA 4OERA 3QIMA 1YTVA 2E1SA 3FXUA 3TTMA 4AB5A 2B65A 4TQUQ 4PQJA 5FHNA 2Y7WA 3QK6A 2X7PA 4RPNA 3WAEA 1OIBA 3DP6A 2NXOA 4ZE8A 1SW1A 2PT1A 1UQWA 1FQFA 1B51A 1WDNA 4X1DA 1LBBA 3IL1B 3HPIA 3FATA 3TTLA 2O1MA 2F6PA 1B6HA 1LB8A 5AE4A 5H8FA 1YPNA 2NVUB 5H8NB 4XKRA 4GD5A 4ZEKA 4IO2A 5I58B 4O3BA 1LAXA 2XXVA 4XTCQ 3RUMA 4G77A 5CBRA 5FHOA 3IAZA 3KZGA 3TTNA 2ZXTA 1B5JA 1JVYA 3DP8A 2GH9A 4QFOA 3FVOA 2RC8A 4R2FA 4NF6B 1F9BA 1RYXA 2R71A 3CR9A 3I3VA 2R9JA 1JEUA 3V83A 2QMWA 2GHBA 3T22A 1O7TA 2O68A 4GF8A 3CG1A 1NNKA 4X9TA 1D9YA 1WVJA 2OK2A 1JW5A 2HZKA 3MW0A 2Q2AA 4F3SA 2F78A 3UN6A 4F18A 2ZYMA 4OFJA 4OFOA 3FJMA 3O66A 1PBPA 2H99A 1AH5A 3M3FA 3C4MA 1POY1 1MQJA 1FQBA 2XXIA 2P1SA 4DXBA 3G3JA 4H1XA 4M1VA 2D21A 2ZYKA 2V3QA 3MP6A 4F2QA 1USYE 1P1UA 1CE2A 3PMVA 4NMYA 1N0TA 4ECFA 3RLFE 3PUXE 3Q29A 4N07A 3HO7A 2QMXA 1O64A 1GR2A 1UTBB 5CMMA 3OENA 5H8QB 3OO8A 2I0CA 3HHGA 4RK9A 4PFWA 3FIRA 2Z8EA 3B7DA 2V25A 1UIUA 1N3WA 4KYDA 1XOCA 1A99A 2FA7A 2QS4A 1FQEA 5AA1A 4OYVA 4MBPA 3UGWA 4OMBA 3G3GA 3W9WA 4JXIA 3B6TA 2ZNUA 1S7YA 3C32A 4IO5A 4I8CA 2I6EA 5IAIA 5CRYA 5I56A 3SEUA 5H8HB 2ZYNA 1NH8A 2X7QA 1I6QA 3T9UA 3LSWA 3FVKA 4GVOA 1LCTA 4JWYA 3VDFA 3MAMA 4U4SA 3U72A 4OTEA 4MF3A 4XKPA 3RN8A 4Z7EA 2I49A 2O69A 2RCBA 4NF5B 4KQPA 2H9BA 5DEXB 5KDTA 4YU0A 4GL0A 3EF7A 3O6IA 3QUJA 3UIFA 2DP8A 1ZU0A 1TFAA 1L5TA 4YKKA 3LUYA 4NF8B 4Q0CA 4H65A 2I58A 3C35A 3MUQA 3KN8A 5L9OA 3H3GA 2F97A 2OBGA 4ZS9A 3TTRA 2VOZA 2P2AA 1B46A 2ABHA 2RCAA 1ELJA 4H6DA 3TODA 5ICQA 4P0GA 1IZ1A 1URSA 5DT6A 2OWSA 2W7YA 2M8CA 3O6HA 4H5FA 3G3HA 4FECA 1JVXA 3KSXA 3BKIB 3OEKA 3M3LA 4LZ5A 5L9SA 1A40A 3N6UA 2UYFA 3HCQA 4H5GA 2PX1A 4IO7A 1ZBMA 4RPOA 1NNPA 5L9MA 3PPQA 5IKBA 4WKMA 4F2OA 1MM6A 1SD3A 1IQ7A 5ISUA 3FJ7A 4WEPA 3D4GA 3RT6B 4QSCA 4XKQA 1IXIA 2O84X 3N6TA 1SW4A 4LQ5A 4F31B 1NL5A 4Q5TA 1LLSA 2I48A 4FEBA 2I3VA 3SETA 4YMAA 3U92A 3PD8A 1NKXA 4I9DA 2BJJX 1OVTA 4RY1A 3CI8A 3C33A 3EHUA 1N04A 3CFLA 3KFMA 4LZ8A 4F1YA 1LB9A 1H76A 1QUIA 4L17A 2D3IA 4DDDA 2B3FA 4IO3A 1PDAA 3ODBA 4PETA 2XD3A 4DCYA 3KJ7A 1OMPA 2XXQA 2QSXA 3TCFA 2Q9TA 4G68C 1ZIUA 1IEJA 3T9XB 5AA2B 4MLVA 4U1OA 1MS7A 5CMKA 4KPTA 4R2BA 4RXLA 4KYEA 3SKPA 1MY2A 1JNFA 2PMSA 5DTBA 3ZKLA 4C1TA 3IJOB 3BFUA 2Z8DA 1SYIA 3A3UA 4KI0E 1Z7NE 2ALUA 1TFDA 4QFNA 2H4IA 3N5LA 5HPQA 4G68B 5I2NB 1D4NA 3RTWB 3IB1A 2B3BA 1Y3NA 3VXCA 2PYYA 1JW4A 2ONKE 4ZEDA 4O3CA 1ZKBA 1XVYA 3GBBA 1EH3A 4MH5A 1NMUA 3A09A 4DE8A 5TPAB 4PP0A 2HAUA 4LP2B 3S2VA 2ESNA 4EUOA 5ITPA 1BP5A 1FTLA 3G3FA 3IJXB 3G3IA 3CRBA 3T9VA 4HCYA 1HSJA 1P1QA 4FIMA 1R9LA 1BIYA 4U22A 1MY4A 3KEIA 1JEVA 4X1BA 1QUKA 2AL4A 1Y20A 1MPDA 4FATA 1OLAA 3O28A 2ONSA 3KOSA 5I59B 2F34A 4EF2A 4DXUA 1B4ZA 4EF1A 5DVFA 3U94A 2CMOA 2QS1A 3AXFA 1UTBA 1OQGA 3VVEA 1P99A 3MVZA 2HEUA 1S9TA 4QRZA 4YZZA 3WAFA 3OOAA 5TP9B 4H67A 3PPRA 4FEDA 3ECRA 2ZNSA 4ZZEA 1ZLQA 4NE4A 2G93A 3UA8A 3KG2A 4XXUA 3C34A 1MG1A 1R6ZA 1B2HA 4KYSA 3IOUA 3GLBA 1DSNA 3K1MA 1ANFA 4RYAA 4YKPA 1H44A 1LAGE 1EZOA 3Q28A 1A8EA 2I3WA 3KJTA 1MXXA 2V3TA 1XHYA 3QSLA 1B4HA 4C1UA 2PVUA 3FUZA 2O7UA 1A7LA 5I57B 3VE1B 2LAOA 1LFGA 1QUJA 3UK4A 4OETA 3S9LC 4P0IA 3TUSA 4DCXA 1N3XA 5ELVA 1OLCA 4U21A 5B7DA 2DVZA 1SYHA 4G8MA 4YB6A 4PFTA 3IB0A 2QS3A 1MH3A 2HQ0A 1MDQA 3MQ9A 1MM7A 2YLNA 4NF5A 1DMBA 3SEWA 1B3HA 3QXMA 4BDNA 1SI1A 3FVGA 3VVFA 3GBAA 3RGYA 3LSLA 3T66A 1PB9A 3PUYE 2XX8A 3FD3A 1EU8A 1I6BA 1A54A 1SI0A 3K6WA 1FQAA 4F1VA 3OSRA 3FZVA 4XKNA 4OESA 1MPBA 1IXCA 3CFZA 1Y4TA 3MP1A 4R6HA 3FXRA 1UTHB 4IO6A 4OENA 4F3BA 1B1HA 1SDXA 1UIVA 4TLMB 3UORA 4NF4B 1Y1ZA 3QAXA 4DXCA 2DE2A 5AA4A 3SDFA 3MVYA 4ZZAA 1QKBA 4EQBA 4G4PA 1SQYA 1TXFA 2A5TA 1S50A 3CSGA 1QULA 1A55A 3MC2A 4BDRA 3I6VA 4JBZA 3TMGA 1T0KA 3RNNA 1AIVA 1FTMA 5JTYB 4ESWA 1VE4A 1N76A 4F22A 1IUDA 4IY5A 3QYTA 1URDA 3K02A 5FTIA 1FQCA 5DYHA 3VLVA 3W9VA 5A5XA 4LVQA 4I62A 4R9FA 3PD9A 1ZJLA 3EHTA 3DELB 4G8HA 3SEXA 1SBPA 5EHSA 5H8FB 3FV2A 4P11A 1PC3A 1MXVA 5CC2A 5I2KA 4RA1A 3OEMA 4GRKA 1QJMA 3LR1A 4NWCA 3BBRA 3ILTB 4GXAA 1DTGA 3K6XA 3ONMA 1PB8A 3HHFA 4KD5A 4LA9A 4G8NA 4ZEIA 1Q1KA 4FE8A 3USDA 2OCUA 3LBSA 1R9QA 4ELQA 3RT8A 4ND9A 2QS2A 3VLUA 4GQOA 4OWDA 4BDOA 1MH4A 4LQ2A 4N6PA 2XXUA 2XXTA 1B05A 3MVXA 4R74A 4R75A 3KSJA 3OD7A 3IO4A 2XXRA 4JWOA 2E0SA 4GIZA 4QFLA 2H5YA 4YKIA 4POXA 3KN7A 1LFIA 1XS5A 4EDPA 2XHDA 1RKMA 1HSEA 4THIA 4AB6A 1MXZA 1D3KA 3MVWA 4G68A 5CM6A 1Y9UA 2UVHA 5KCJB 1B0HA 2RINA 3N94A 4DLDA 2O1LA 5LOMA 2Q89A 5F1QA 3MJNA 3TFLA 1KWHA 4KR5A 1DTZA 3RY3A 2FNCA 4Q30B 4YB5A 4ISUA 1MXWA 4ZEFA 3PPPA 2O6AA 3O2AA 3IB2A 1M5EA 4K3FA 3TTKA 4U4XA 1POTA 1QKAA 2GHAA 3VLWA 4OZ9A 3JV9A 1B52A 1USYH 3JZJA 1OVBA 3RQTA 2X26A 4QSDA 1ZTYA 4DIGA 4LZ7A 2PT2A 3H03A 1BTJA 2DOJA 3GXAA 2UXAA 1QVSA 4YB7A 3V89B 1B5HA 3K2DA 2DQVA 4KCDA 3R26A 3BFTA 3M8UA 1MY3A 1A8FA 5I56B 2DWIA 3E4RA 5H8SA 1BLFA 5HBCA 5H8NA 2I4CA 1CB6A 2NUVA 2YJPA 1EZPA 1JW1A 2HXWA 3VV5A 5I58A 4HS7A 4MFIA 1FTKA 1N84A 2Z23A 4FAJA 1IIWA 3ILUB 5I57A 4F3GA 5DVIA 1US4A 2GFEA 3E9XA 5L8DA 2I4BA 1BKAA 4NF6A 4DZ1A 1LAFE 2Q88A 4ZECA 5EHMA 4OFLA 4U2RA 1LFHA 5K2XA 3TELA 1MXUA 4I1DA 4BDMA 2XX7A 2O51A 5I84A 1VFEA 2RC9A 3LC8A 2G29A 2WKYA 4O3AA 2DWJA 3PUVE 1LGBC 4BDQA 4MLQA 3N26A 2XD2A 4GL8A 3F11A 3KGCA 1IITA 4RJZA 4FJPA 3TYHA 4G2ZA 3B6WA 5BWJA 1B1XA 1B7ZA 1DPPA 1MQDA 2XX9A 5CI5A 2XXPA 2QPQA 3C36A 2O7IA 4IGTA 4ELRA 3FGSA 1H3DA 5CMBA 3MBPA 3MPKA 4FORA 3CSBA 3CIJA 3TKDA 3V5AA 4LATA 5CBSA 3ZKKA 2VD2A 4GWOA 4NWDA 4E0XA 3G3KA 3H6UA 5BUUA 4U23A 3TCHA 4YMBA 5TU0A 5JTYA 1MQGA 1MDP1 3MZ1A 3EPEA 2OJTA 5H8QA 1VR5A 2D5WA 3KN3A 3RTFB 3V8XB 2DWHA 3DLNA 4PFUA 1R1NA 3OO9A 1GV8A 2ONRA 1Y3PA 4JB7A 3H6TA 2XXXA 1II5A 1ATGA 5DVJA 1B58A 4E0WA 3C31A 5FHMA 4R72A 5H8HA 2RC7A 3MPLA 1AL3A 4QSEA 4ELPA 3IOWA 1PB7A 3Q26A 3T9HB 1LBCA 3TCGA 2V84A 3IOVA 3L6HA 1NNTA 4QHQA 4JWXA 4R6YA 4YKJA 3PU5A 3HN0A 5DEXA 3HV1A 3H6VA 2DVCA 2AYSA 4F29A 3OMBA 1XC1A 3IR1A 3E3KA 1TWYA 2Y7IA 4TLLB 3PPOA 4NF8A 1URGA 3TQWA 2ANJA 2F8DA 4POWA 4H8JA 1NH7A 3THIA 3S4UA 2NWJA 3T93B 3EQ1A 2OLBA 2OWTA 2REGA 4EQ7A 2QJEA 1NFTA 4M4GA 5J1DA 2VHAA 4OEVA 4IO4A 3O9PA 4BLAA 1N7WA 3QUFA 3H4ZA 3S9NC 1IXGA 4H0WA 1M5DA 2FYIA 5KCJA 2DSFA 3O97A 4RNSA 4ESXA 4PE5B 3O29A 3IO6A 4OVJA 1Y4CA 3KBRA 3IOTA 2H25A 2ZYOA 1B5IA 3TPAA 1SVXB 4YICA 4LUBA 3IORA 3Q27A 1B3EA 1B0LA 2ZNTA 1FW0A 2XXHA 2VD3A 4KCCA 2Q2CA 3SERA 4JSDA 1HSLA 1NNFA 1P1NA 3FXQA 1FQDA 3TEPA 4KFQA 1H45A 3PUWE 2HFBA 2F7CA 4HTGA 3TZAA 2VGQA 3FV1A 1OQHA 5CMCA 2Q8JA 2F6GA 3IX1A 5HM4B 1I69A 3MP8A 3GZGA 2OZZA 4Z0IA 3G7WA 3EHSA 4HW8A 4RK2A 2F7BA 1FTJA 4Q8RA 4WXJA 4KHZE 1SW2A 3OXNA 5EYFA 1WODA 4HCWA 1LAHE 3U93A 4EXLA 1B9JA 3C9HA 3TDJA 3OO6A 2R6GE 1XT8A 3VXBA 3S9MC 4AQ4A 1D9VA 1YCJA 4UA8A 2V3UA 3DP4A 1DPEA 5AA2A 4ZE9A 2IEEA 3JYRA 2DXRA 4IY6A 4R9GA 1M5BA 3TAJA 4TOZA 2Y7PA 2HAVA 4GFRA 3ZS6A 2F5XA 2HCAA 4N13A 1GGGA 4GOTA 2REJA 3PV0E 4F3PA 5JEIA 3K01A 2F35A 4GXSB 1LCFA 1B7UA 3FVNA 5I2NA 4F1UA 1MQHA 3LSFB 1I6AA 3O6GA 4OHNA 3OELA 2V93A 1B40A 5M2VA 3CG3A 3K6VA 5AA4B 2UVJA 2QL3A 2XXWA 2XXYA 4JDFA 3K00A 3DM0A 3HSTA 5TPAA 2A5TB 5AA3A 1US5A 1Z7ME 1AMFA 1P1OA 3MZBA 4H8IA 3ZSFA 4IB2A 4XIGQ 1VFDA 2P0SA 1IXHA 4QF9A 1P1WA 2DXYA 3RPWA 3IK6B 3P7IA 4ELOA 3A3CA 1MQIA 4ONYA 2QRYA 1GTKA 1M5FA 5FTHA 3S9EA 3K0VA 2YPNA 2DE3A 3M3KA 1YAEA 5ICTA 2ZMBA 5I59A 1MRPA 2Y7KA 4R6KA 1MPCA 5AA2D 1EZ9A 2NOOA 5A5XB 2H98A 3L6GA 3T96B 5B70A 1O63A 1TT1A 5TP9A 4F19A 2UVIA 3W15C 2PBWA 2UYEA 1RYOA 5ITOA 1VSOA 2THIA 3H7MA 3PGFA 4WEDA 3H6WA 2Y7RA 1GVCA 2AIXA 5I2KB 4OXVA 3FASA 1QW0A 4JSOA 5K2YA 1PEBA 2VP1A 1B3LA 2Z8FA 1DOTA 4ZEBA 3PPNA 2RF1A 3R6UA 3H06B 4LONB 4PFYA 3VFJA 4NEDA 3UP9A 4EXKA 3FJGA 5KDTB 3KOTA 3K1PA 1B3FA 2KLFA 1JETA 2DE4A 2RKMA 5F7VA 1PBQA 5KZTA 2HZLA 1Y3QA 1AOVA 3U8QA 1J1NA 3Q25A 2IA4A 3B6QA 2UVGA 3VVDA 5JK4A 2Z22A 3MZ9A 4QFKA 3E13X 4YAHX 3SEYA 4UACA 4GLIA 2GRVA 1MY1A 3OSQA 2I0BA 4OQOA 4R73A 2CZLA 3K1NA 4NTLA 1Y1MA 4EQ9A 3U1OA 1M5CA 2F7AA 3MWBA 2AL5A 3OO7A 1UTHA 3D4CA 1MXYA 3I5OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U1ZA 1SPIA 3CVGA 1B32A 1FCKA 3LSXA 4ZDMA 1Q35A 1FJ6A 3PUZE 4BDLA 3K6UA 1MY0A 3BIHA 4NF4A 4H45A 2DS9A 3EN3A 3SEVA 3K4UA 2HHMA 1IMDA 1LSTA 4X48A 1ZMGA 3CFXA 4PBHA 1B7HA 4F39A 1XVXA 4QFPA 4C0RA 2F36A 5IZ3A 2Y84A 1B3GA 1NV5A 4IGRA 4O7MA 3SESA 4AS4A 3PMXA 2DYXA 1SW5A 3PMWA 3R7XA 4OEUA 1H43A 2A5SA 2DWAA 1FTOA 1JQFA 3TQLA 3KBZA 4NAPA 1N7XA 4OERA 1FBFA 3QIMA 1YTVA 2E1SA 4QXDA 1RDXA 3FXUA 3TTMA 4OVSA 4AB5A 2B65A 4TQUQ 4PQJA 5FHNA 2Y7WA 3QK6A 2X7PA 4RPNA 3RPLB 3WAEA 1OIBA 3DP6A 2NXOA 4ZE8A 1SW1A 2PT1A 4X8RA 1UQWA 1FQFA 1B51A 4GWUA 4OVRA 1WDNA 4X1DA 2FHYA 1LBBA 3IL1B 3HPIA 3FATA 3TTLA 2O1MA 2F6PA 1B6HA 1LB8A 1LEVA 5AE4A 5H8FA 4GWZA 1IMAA 1YPNA 2NVUB 5H8NB 3MSTA 4HE2A 4XKRA 4GD5A 4N8GA 4ZEKA 4IO2A 5I58B 4O3BA 1LAXA 1FBGA 2R8TA 2XXVA 4XTCQ 3RUMA 4G77A 1XI6A 5CBRA 5FHOA 3IAZA 3KZGA 3TTNA 2ZXTA 1B5JA 1JVYA 3DP8A 2GH9A 4QFOA 3FVOA 2RC8A 4R2FA 4NF6B 1F9BA 1RYXA 2R71A 4P1LA 3CR9A 3I3VA 2R9JA 4FBPA 1JEUA 3V83A 2QMWA 2GHBA 3T22A 2FVZA 1O7TA 2O68A 4GF8A 3CG1A 1NNKA 4X9TA 1D9YA 4GBVA 1WVJA 2OK2A 1JW5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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