1IXGA

Phosphate-binding protein mutant with thr 141 replaced by asp (t141d), complexed with phospate
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A low energy short hydrogen bond in very high resolution structures of protein receptor--phosphate complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
total genus 107
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA02
3EHSA 1UTHB 1B1HA 1B0HA 3QSLA 5ICQA 5I57B 3FXUA 1NFTA 3SKPA 4RPOA 3V8XB 2XXYA 1B46A 3LSLA 3OENA 4EQBA 2CMOA 1XVYA 4XTCQ 3RT6B 4RK2A 5M2VA 1N3WA 3CSBA 3MWBA 1KWHA 2GRVA 3C31A 3DLNA 4OHNA 4R73A 2VGQA 4KI0E 1L5TA 4QSCA 3B7DA 1O63A 5CBRA 4IY6A 1MPCA 3TTKA 2Q88A 1GV8A 4H0WA 4ESXA 3HSTA 3IX1A 4C1TA 3MVWA 3S9EA 2OLBA 1LFHA 3BFTA 4Q0CA 3FGSA 2O51A 2BJJX 3Q28A 3OEMA 2IA4A 4ELPA 3RN8A 3G3HA 3KOSA 2OJTA 1NKXA 1USYE 4BDMA 4RYAA 1JW1A 1JQFA 3SEXA 1WVJA 2HEUA 3QAXA 2ONRA 1JETA 5L8DA 5H8NA 5IAIA 3UIFA 4C1UA 5I2NA 1Q35A 2HFBA 1MXVA 3TMGA 1XOCA 1VE4A 1A7LA 4ELRA 4WEDA 1MXYA 1VFEA 4QSDA 2YLNA 3TEPA 3VFJA 3TZAA 1MG1A 3W15C 1UIUA 3FVGA 4MH5A 4G68B 3I3VA 2RC7A 3TCHA 2XX8A 2PMSA 1QJMA 1IEJA 1PDAA 2PT2A 4THIA 5AA3A 2XXRA 1LSTA 3CI8A 2OBGA 1B5IA 3A3CA 3M3KA 3TCGA 3TCFA 5ITPA 3I5OA 3HCQA 2HZLA 2X26A 3AXFA 3UA8A 5K2YA 3N26A 3BBRA 5A5XB 2ALUA 2B65A 4NF8A 4G2ZA 1S7YA 2DWIA 4ND9A 5EHSA 3G3FA 4ISUA 1LBBA 1FTMA 5FTIA 1H3DA 3CR9A 4ZZEA 3FJ7A 2I6EA 3K6XA 3TTRA 1FQAA 4QSEA 4DIGA 3C9HA 4F18A 2RC9A 1S9TA 3VVEA 3EPEA 3VE1B 3FIRA 3QYTA 2Z8FA 1QKBA 1SDXA 4G8MA 4KQPA 4DDDA 4IO6A 4F2OA 1D9VA 1MQGA 1YCJA 3RPWA 1P99A 1LBCA 3T96B 4MBPA 5DEXA 2HZKA 1JNFA 1IITA 1XHYA 4ZEIA 3FD3A 3TUSA 3CG1A 2ZMBA 3Q27A 3K4UA 3W9WA 1ELJA 1IZ1A 5F7VA 2QRYA 3Q26A 4NE4A 4XKQA 4HTGA 4L17A 1DPPA 2ESNA 3MBPA 3LSXA 1FTJA 3DP8A 3CFLA 2DWHA 4I9DA 1FQDA 4DCYA 4X48A 4PE5B 3SDFA 2XD3A 1NH7A 4H5GA 1BKAA 2GH9A 2DOJA 5H8NB 4NF4A 4N6PA 4ESWA 3ZSFA 4NMYA 1MQJA 3ZS6A 4ZDMA 2NVUB 3SEUA 2OWTA 3F11A 3UGWA 1PB9A 5BWJA 4LZ8A 2ZNSA 4OESA 5H8HA 3H6VA 2Q2AA 4KPTA 3TTNA 1WDNA 4OVJA 1IXHA 1DSNA 2O7IA 1M5CA 4QHQA 3TPAA 2VHAA 4OFJA 1JEUA 1D9YA 4R9GA 3G3GA 1N7WA 4JWOA 1SQYA 1QULA 2HXWA 1JW5A 1OQHA 3PU5A 3ONMA 3K6UA 2F6GA 1MQDA 3N6UA 4N07A 1FTKA 3D4CA 5IKBA 4YU0A 2QSXA 4UACA 4ZE9A 1A40A 2XXUA 4OERA 2OCUA 5JEIA 4F1UA 2P0SA 4LP2B 5DVFA 1Y1MA 4RXLA 1I6QA 2NXOA 4I8CA 1EZ9A 4R6YA 3RGYA 4LVQA 3LR1A 1D3KA 1JW4A 3FXRA 3SETA 3TAJA 2RF1A 3G7WA 3S9NC 4PP0A 1B4HA 3H06B 4BLAA 3HPIA 2AYSA 5KDTB 1VFDA 2H9BA 1FQCA 3GLBA 3USDA 5H8QA 3PPNA 3O6IA 1VR5A 2P1SA 1ZU0A 1LAHE 4ECFA 1M5DA 2R9JA 3DP6A 1LB8A 4WEPA 5L9MA 3FUZA 1R1NA 2Y7WA 1MM7A 4EDPA 2Y7KA 5DEXB 2QS1A 2Y7RA 3OO6A 4H65A 4POWA 3C34A 4OETA 5ELVA 1NMUA 2XX7A 2F97A 2F7AA 2ZNTA 3R26A 1PBPA 5I58B 5LOMA 1H76A 3PD9A 4F3BA 1B4ZA 1MY1A 1OVBA 4YB6A 2F35A 2I58A 3MVZA 3MAMA 4DE8A 4QFPA 3EN3A 4WXJA 2NWJA 3GBBA 3MZ9A 3KN7A 2B3BA 3PUZE 4ZEDA 2DP8A 4G68C 2ZYNA 3K00A 1P1OA 3QXMA 3S9MC 4QFNA 3L6HA 1N3XA 5H8HB 3H6WA 4FAJA 4RNSA 1MRPA 1AIVA 5CRYA 2X7QA 1S50A 4U4SA 3SESA 5AA4A 1SW1A 4PQJA 1SW5A 4IY5A 1B5HA 4GLIA 1YAEA 1LAXA 3MZ1A 3K1NA 4I62A 4NWCA 1AMFA 5TP9A 1MY4A 1TT1A 1Z7NE 4FEBA 3O6HA 1SI1A 3OOAA 2O1LA 1Y1ZA 4BDNA 3H3GA 4RK9A 1MQHA 2QJEA 3O29A 3FXQA 1N76A 1NNKA 3B6QA 3SEVA 3K6VA 1GVCA 4P0GA 1DPEA 2UVIA 3PD8A 4BDQA 1WODA 2FYIA 4FJPA 3CIJA 1BTJA 2DQVA 4R6HA 4Q5TA 3U94A 1PB8A 3TQLA 4OFOA 3RT8A 1POTA 1N7XA 2QPQA 3FJGA 5I59A 5L9SA 4QFKA 4ZS9A 3U72A 3EQ1A 5H8QB 3B6WA 3PUYE 2QMWA 1CE2A 2D3IA 1Y3PA 3RTWB 1GGGA 3THIA 3SEYA 3G3KA 3PPRA 5I2KB 3M8UA 4PFTA 1NNPA 3ZKLA 1D4NA 2UXAA 3C35A 3MP1A 4JSOA 3IO4A 1B0LA 1I6BA 3OSRA 3KGCA 2DYXA 2XD2A 1PEBA 2XX9A 1A54A 2PYYA 2XXHA 3A3UA 3RLFE 3QIMA 4NTLA 4R2FA 2OWSA 4EXKA 2FA7A 1B2HA 1JVXA 5EYFA 2O68A 2I4CA 1H45A 3CFZA 3OMBA 1B7UA 4Q8RA 3M3LA 4RPNA 4F2QA 2H4IA 2DVCA 3FV1A 3FASA 1QUIA 3H6TA 2YPNA 2V3TA 3T9UA 1TXFA 2ZYOA 5JTYB 2O1MA 5TU0A 1MXUA 2RC8A 2UYEA 2RKMA 1IXCA 4LQ2A 2F5XA 1MY2A 4OYVA 2Y84A 1O7TA 1YPNA 3LC8A 5H8SA 4H6DA 2Z8EA 4LQ5A 2QS2A 3BKIB 4FATA 2UVGA 5B70A 4F39A 2UVHA 1LGBC 1BIYA 2VOZA 1RYXA 4PFUA 1QW0A 3HV1A 1JVYA 1IXIA 1Y9UA 3PPOA 2FNCA 4ZEFA 3OO9A 5TPAA 1LAGE 3H4ZA 2F36A 3KSJA 5CMBA 1N04A 3ZKKA 4YB7A 1EH3A 2DE4A 3KOTA 1I69A 2Y7PA 4YKJA 4KYDA 4P11A 1OMPA 2Q89A 1UTBA 4U21A 3K0VA 4YZZA 3H6UA 2G29A 2ZYMA 3E13X 1IIWA 4POXA 3OELA 1FW0A 3OO8A 3Q25A 1MDQA 4OWDA 1HSLA 2H25A 1EU8A 2I3VA 4XXUA 3N6TA 1NNFA 3RNNA 2H98A 1LB9A 5DT6A 2V93A 2D21A 1M5FA 4LA9A 4XKPA 4F3SA 1A55A 1MPBA 2A5TA 5I2NB 4NF6A 3MVXA 3PGFA 4R9FA 4U1ZA 4H5FA 5J1DA 4OTEA 2QMXA 3VVFA 1B9JA 1N84A 2O84X 2RCBA 5L9OA 3OEKA 1MPDA 1XVXA 5ITOA 4C0RA 3IR1A 3E4RA 3FVNA 1B1XA 3S2VA 5CMKA 2HAUA 2G93A 5HM4B 4LONB 5CMMA 1P1QA 2I48A 3C33A 1LFGA 1II5A 3R7XA 1Q1KA 1M5EA 1ZIUA 1LFIA 4EF1A 4KR5A 5CM6A 4HCWA 5FTHA 5I84A 5AA2A 4DZ1A 4LZ5A 2XXXA 1Y4TA 4ZEKA 5I57A 4NF8B 3CRBA 3OSQA 4TLLB 1SBPA 5HBCA 1XS5A 4JBZA 1DMBA 3C4MA 2I4BA 5F1QA 3OD7A 1ATGA 3PV0E 3UK4A 2XXIA 4FEDA 3T22A 2V3UA 3IOVA 3UN6A 3V5AA 1PC3A 1R9LA 3IAZA 3U93A 1MH4A 1MY0A 3FZVA 4NF5A 3N5LA 4KYEA 1UQWA 4DXUA 2M8CA 3IJOB 1MY3A 4O3AA 5B7DA 4ZECA 1UIVA 3RTFB 2PT1A 4FIMA 4OFLA 3RQTA 3IB2A 1AL3A 2ZYKA 1IQ7A 2HAVA 2O69A 3GXAA 3PPPA 4K3FA 4OEVA 1B3LA 1UTBB 4GL0A 1TFAA 2KLFA 3UP9A 2I49A 4F3PA 4IO7A 3WAFA 3CFXA 4H8IA 2ZNUA 3FJMA 3EHUA 1URSA 3IOWA 4ELOA 2DE3A 4MF3A 2XXTA 3ECRA 3A09A 1B52A 4JXIA 5JK4A 4OEUA 1LLSA 3KFMA 1Y3NA 2XXPA 3VDFA 4QRZA 2NOOA 1PB7A 4OZ9A 1FCKA 4F1YA 1MS7A 4JWXA 4G68A 1F9BA 4NF4B 1T0KA 5HPQA 4NF6B 1NH8A 3EHTA 1FTOA 4R6KA 4GL8A 4GXSB 3T9HB 3IJXB 1IUDA 2B3FA 2REGA 3UORA 2I3WA 4YB5A 1LCTA 1GTKA 3E3KA 4GQOA 4GF8A 4GRKA 4FORA 1PBQA 4TQUQ 1ANFA 4G8NA 2Q2CA 4NEDA 4GWOA 5A5XA 4I1DA 3TTLA 2AIXA 4YAHX 3LSWA 3KEIA 4Q30B 3BFUA 2DS9A 4F3GA 2DXRA 2O6AA 2Q9TA 5AA2B 3MVYA 3IK6B 1QVSA 3FVKA 5FHMA 1A99A 4MLQA 1SD3A 3IB0A 3S4UA 2ONKE 2XXWA 3TFLA 3MQ9A 4PFWA 3FVOA 3H03A 2A5SA 4GFRA 1I6AA 4IB2A 3VV5A 4H8JA 4MFIA 4XIGQ 1O64A 2I0CA 1QUKA 4PFYA 5KCJA 4NF5B 1B58A 3TODA 2D5WA 3O97A 3K02A 4KD5A 4DXCA 3SERA 1OVTA 1MH3A 4IO3A 3I6VA 4EQ7A 1DTGA 4RJZA 1URGA 3O28A 5AE4A 3KN8A 2DVZA 1R6ZA 3LBSA 2VD2A 4YKPA 1SYHA 1QUJA 2XHDA 2PBWA 4DXBA 2F34A 3KJTA 4JDFA 4E0WA 3MP6A 4YKIA 5FHNA 4KCCA 3KJ7A 4F1VA 5H8FA 5CI5A 2X7PA 2AL5A 3M3FA 4M4GA 1B32A 4R72A 4JB7A 3FATA 3O6GA 4LZ7A 4G77A 4TOZA 1B3FA 4EF2A 1US4A 3Q29A 1MDP1 5I56A 4GD5A 3E9XA 3ILUB 3H7MA 1IXGA 4ZZAA 1J1NA 4F19A 1OLAA 2R6GE 4H1XA 3IB1A 2Q8JA 3MPLA 1P1UA 1MM6A 4GIZA 3U1OA 3S9LC 1RYOA 3B6TA 2F6PA 1MXWA 4IO2A 4F29A 3LSFB 4U22A 1B6HA 3DP4A 4F31B 2QL3A 4OENA 3V83A 1VSOA 1LAFE 5AA4B 3VXCA 1USYH 1P1WA 3MC2A 4X9TA 1FTLA 2V25A 4DLDA 4RY1A 5TP9B 3WAEA 4AB5A 4BDOA 4BDRA 3PUVE 4R2BA 2F78A 5CBSA 4U2RA 2IEEA 5AA2D 3O66A 1MQIA 4KFQA 1ZBMA 5KDTA 1FQBA 4KCDA 4PETA 1MXZA 3VLUA 4HW8A 3D4GA 2V84A 3O9PA 4IO4A 1AH5A 2PVUA 3TKDA 4QFLA 1H43A 2H5YA 5CC2A 1B51A 3MZBA 5DVIA 5KCJB 2VD3A 3OO7A 4NWDA 5I59B 4IGTA 3L6GA 1B05A 2REJA 2UVJA 4RA1A 1Z7ME 4YMBA 1ZTYA 1POY1 1NL5A 5K2XA 4O3CA 1ZJLA 3DELB 3KZGA 1FQFA 2ONSA 4G4PA 3VLVA 2DWAA 2GFEA 5DYHA 2OZZA 1M5BA 2E0SA 3DM0A 2LAOA 1URDA 3EF7A 4ONYA 3K6WA 3KN3A 5I58A 4AQ4A 1B7HA 3FV2A 1OQGA 3IL1B 3TDJA 1GR2A 3O2AA 1B7ZA 4TLMB 4GOTA 5ISUA 1Y3QA 3T66A 4EXLA 1H44A 3GZGA 4HCYA 4U4XA 1JEVA 5H8FB 1Y20A 4P0IA 1RKMA 3MP8A 4KYSA 1HSJA 3PMVA 1A8FA 5FHOA 1TFDA 5KZTA 2RCAA 4X1DA 2F8DA 2ANJA 3P7IA 1AOVA 4O3BA 2PX1A 4N13A 5I56B 2QS3A 3OXNA 3SEWA 2I0BA 2XXQA 1MXXA 4XKRA 4YMAA 3T9XB 2HCAA 3V89B 2DXYA 5CMCA 1B3EA 3PUWE 3QUJA 3KSXA 2XXVA 3HHFA 3IO6A 3ILTB 2ZXTA 2WKYA 1DTZA 2Z8DA 1UTHA 4EUOA 2E1SA 3C36A 3N94A 1EZOA 1XT8A 4WKMA 4QF9A 4ZE8A 3KG2A 3K1PA 3ODBA 3CSGA 3G3IA 1A8EA 2CZLA 2F7CA 2RINA 2OK2A 4DCXA 3HN0A 4E0XA 3RUMA 3U8QA 3VXBA 2YJPA 4R74A 3RY3A 3GBAA 3TYHA 4ELQA 2DSFA 1N0TA 4F22A 1EZPA 5TPAB 1XC1A 4YKKA 4R75A 1FQEA 3G3JA 3JV9A 3K1MA 4BDLA 3JZJA 3MUQA 1SVXB 3PPQA 4QFOA 3TQWA 4GXAA 4UA8A 3LUYA 1YTVA 2THIA 3IOUA 4FE8A 2DE2A 4MLVA 3MPKA 3QUFA 1B40A 4KHZE 5AA1A 4XKNA 3IOTA 3R6UA 2O7UA 4U23A 5ICTA 1B5JA 2V3QA 1SW2A 3T93B 3C32A 5BUUA 5I2KA 1NNTA 4U1OA 2P2AA 5EHMA 4IO5A 1CB6A 3VVDA 3HO7A 2GHAA 4H67A 4ZEBA 1ZMGA 2VP1A 2F7BA 3PMWA 4FECA 3MW0A 1BP5A 1SYIA 4Z7EA 1SW4A 1ZLQA 3HHGA 2DWJA 4LATA 2Y7IA 1HSEA 1US5A 4M1VA 4LUBA 4AB6A 3K2DA 1Y4CA 3CG3A 4YICA 2Z23A 2Z22A 2QS4A 2ABHA 3MJNA 2H99A 4JSDA 2NUVA 2A5TB 1LCFA 1TWYA 4GVOA 4IGRA 4EQ9A 5DTBA 4G8HA 1R9QA 2W7YA 3IORA 1QKAA 4JWYA 2R71A 1OIBA 3PUXE 1SI0A 3QK6A 3PMXA 4X1BA 4Z0IA 3JYRA 4OQOA 3W9VA 5JTYA 1B3HA 1B3GA 2AL4A 3T9VA 4HS7A 1BLFA 1DOTA 3TTMA 3VLWA 1OLCA 5DVJA 3KBRA 2GHBA 1ZKBA 3CVGA 1P1NA 3TELA 4OXVA 2UYFA 4OMBA 2HQ0A 3K01A 3U92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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