1IXGA

Phosphate-binding protein mutant with thr 141 replaced by asp (t141d), complexed with phospate
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
publication title A low energy short hydrogen bond in very high resolution structures of protein receptor--phosphate complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 107
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA02
1A40A 2F6GA 1B3EA 4G8NA 2A5TB 2Q2CA 1ZJLA 4U22A 5LOMA 3SEWA 1XS5A 2B3BA 4POWA 3IB1A 1LAXA 4DLDA 2B3FA 1PBPA 4P11A 4IGRA 2PMSA 3C36A 1LAFE 1I6AA 2P1SA 4POXA 2ONKE 3K1MA 1YAEA 5I2KA 1AMFA 1B4HA 1QULA 1YTVA 4HTGA 1B5JA 2W7YA 3FASA 1MY4A 4EXLA 3U94A 3H03A 1FTKA 3C9HA 2O84X 4ESWA 4ZE9A 4GLIA 1B1HA 5KCJA 2REGA 3EPEA 1Y20A 2ZYNA 2THIA 5EYFA 4KHZE 1NH7A 2QL3A 3O9PA 3O29A 4XKNA 4OXVA 5DEXB 3DM0A 3MZ1A 2O1LA 1FQAA 2Y7IA 1VFEA 4ZEIA 2I3VA 3C35A 4QFNA 1IXGA 3UP9A 4KR5A 3HSTA 3HV1A 5ITOA 1MXZA 2DWAA 1NNKA 1OLAA 4LZ8A 2F34A 2QRYA 3LSWA 4F3BA 1B1XA 4IB2A 2H99A 1SYHA 2F8DA 5L9SA 2DWIA 2ZYOA 2GRVA 3H6WA 3K00A 2HQ0A 1NKXA 2PBWA 3IJOB 4EQBA 3FATA 4YU0A 5ELVA 1XT8A 2Y7PA 4Q0CA 2IEEA 5IAIA 5DVJA 4IO3A 4GXAA 4NF8A 2HZLA 2ESNA 4R2FA 1FTMA 4U21A 1RYXA 3LSLA 3P7IA 4H67A 3T9VA 2E0SA 5HBCA 5AA3A 2FYIA 1MY2A 4F1VA 5I58B 2HZKA 1VE4A 1R6ZA 4TLMB 2ZNUA 1RKMA 1MQIA 4OHNA 1I69A 3IB2A 2BJJX 2PVUA 1OQGA 2DSFA 5H8FB 3T66A 4QFKA 1GR2A 2VOZA 4FORA 3VV5A 3BBRA 3TTNA 1NMUA 4JDFA 3USDA 2HXWA 5I56B 3JV9A 2B65A 2XXVA 3BFTA 4F29A 4OYVA 1JEVA 2GHBA 2RF1A 1OMPA 1VR5A 3G3GA 4QFLA 4OFJA 1B0HA 4H1XA 2PYYA 1M5BA 4EQ7A 3CFZA 3D4GA 2R71A 3E4RA 3FVGA 3OEKA 4O3CA 2F97A 3PPRA 2ZMBA 2XXUA 5I2KB 1B7UA 3KFMA 4RYAA 1Z7ME 1QW0A 2ZXTA 1TWYA 3MPKA 3E13X 4IO7A 2V84A 4ZEBA 4RXLA 2D21A 4GQOA 3LC8A 2Y7KA 4ZS9A 1Q35A 3TPAA 1A99A 3B6WA 2DE2A 2X26A 5KCJB 1N3WA 3HO7A 1ATGA 1B3LA 3IOUA 3VLUA 5TU0A 2D3IA 2V25A 4BDOA 3OO6A 3ZSFA 3OO7A 4DXBA 1B7ZA 4AQ4A 4NWCA 4O3AA 2G29A 2Q9TA 2Y7WA 1F9BA 5FHMA 4FEBA 4GIZA 3GLBA 3DP6A 3A09A 2HCAA 4QFPA 1RYOA 1Y9UA 3S9LC 4UA8A 3KJTA 1SW5A 2NUVA 1MXWA 4OQOA 1B46A 1B5IA 2I3WA 4TLLB 5ICQA 4OETA 1N04A 1EZPA 1H45A 3FJ7A 3H7MA 2RC7A 1P1WA 3K4UA 3O28A 3IAZA 2XXXA 4NF8B 4ELRA 3MWBA 1IXCA 2XXHA 1LB9A 3RPWA 4KCCA 4GOTA 3G3IA 2VP1A 4PQJA 3KZGA 4FEDA 3U8QA 1O63A 2VD2A 2O51A 3SEVA 4YKKA 1IEJA 3MC2A 5J1DA 1XVXA 1AL3A 3H6VA 1SW2A 2REJA 1L5TA 3MP8A 3DELB 2F7CA 2DXYA 3T9HB 2YPNA 3RNNA 4KD5A 4N13A 4U4SA 4KYEA 3GBBA 2UVJA 2RCAA 1XVYA 4RK9A 3MVZA 3VDFA 4QSDA 4H8IA 5EHMA 4X9TA 3IX1A 4R6KA 2F35A 3N26A 3W15C 1O7TA 2DE3A 2AL5A 3IO6A 4LONB 1Y3NA 2OJTA 2H5YA 3O6GA 3V83A 2Z23A 4WEPA 3TUSA 2R6GE 2CMOA 2QS2A 2X7PA 3T9UA 3A3UA 4OENA 1YCJA 3EHUA 4R74A 3FV1A 4FECA 3Q26A 2O68A 2UYFA 4R75A 5TP9A 3SETA 3QK6A 3VVFA 3KSXA 1IQ7A 3W9WA 4MH5A 3MP6A 1GTKA 3S9EA 4F18A 3TQLA 2OWSA 4LP2B 2Z8DA 3S9MC 1B52A 1D4NA 1EZ9A 2DE4A 1N3XA 1MY0A 1M5EA 4C0RA 1AIVA 3DP4A 2OCUA 2Q88A 2Q8JA 3OENA 1N7XA 1ZIUA 4RY1A 5DYHA 5ITPA 3TTMA 4AB5A 3RGYA 4OEVA 3TELA 5JK4A 2ALUA 3TODA 2ABHA 3KBRA 3V5AA 2AL4A 3UN6A 3UIFA 1CE2A 5B70A 1ANFA 1JNFA 1XHYA 2XXQA 3MJNA 5ICTA 1H76A 4PETA 1B7HA 5L9MA 3CVGA 2I49A 1B3HA 2XXTA 5CMBA 4C1UA 2OZZA 4ZEDA 3QSLA 2UVGA 2UXAA 5BUUA 4ZDMA 1PC3A 1OVTA 4RK2A 4FE8A 2QS4A 4R9GA 3E9XA 4QSEA 1NH8A 3MBPA 3K6VA 4YB6A 1UTBA 2KLFA 3PUVE 2QJEA 3O66A 1B32A 3KSJA 3MPLA 3U93A 2E1SA 2QS1A 1URGA 2H98A 3QUFA 3LBSA 5H8NA 3OMBA 2O69A 1Y3PA 4H0WA 1GVCA 3PPOA 5KZTA 2F7AA 1A7LA 1MH4A 3IJXB 5EHSA 1MXVA 4OFLA 3MVXA 1GGGA 3SEUA 3LSFB 1JW1A 1FW0A 4LUBA 3OEMA 3QXMA 4U23A 1OQHA 3FVNA 3TFLA 3UK4A 4XKQA 4PE5B 1S9TA 4I8CA 3KEIA 4L17A 3Q27A 1H43A 3KG2A 3JYRA 1UIVA 5HPQA 2I4BA 4IO5A 1B9JA 3BFUA 2YLNA 5TP9B 2XXWA 4H8JA 2XXIA 1EU8A 1WODA 4IY5A 4R72A 5AE4A 3O2AA 2HEUA 4TQUQ 2V3QA 3IOWA 4RA1A 5FHNA 1UQWA 3TAJA 1MY3A 2AIXA 3ZKKA 1MPCA 4DCYA 3M3FA 1SW4A 1IZ1A 3G3JA 5CI5A 1JQFA 4PFYA 5IKBA 3V8XB 1IUDA 1MY1A 3OSQA 1IXHA 3G3HA 3HCQA 2F78A 3RQTA 1ZU0A 1POY1 1MRPA 3CSBA 2RCBA 1PDAA 3HPIA 5A5XA 4G8MA 3CFLA 2O1MA 2Y84A 2VHAA 3OXNA 2YJPA 2ANJA 3FUZA 3SEXA 3RT6B 4UACA 4R2BA 4LZ5A 1SW1A 2CZLA 4QFOA 4NE4A 3ECRA 4ZE8A 1OVBA 4I62A 5CMMA 5CRYA 2RC9A 3PV0E 4DXUA 2QMXA 1OLCA 1Y4CA 5TPAA 3MZ9A 1USYH 1FTOA 1ELJA 1HSEA 1XC1A 3U1OA 4JXIA 1B3GA 3S4UA 1AH5A 4GL0A 1MPBA 1JETA 4LZ7A 4C1TA 5AA4A 5F1QA 3RTFB 4BDMA 4ECFA 1FQEA 4KQPA 3PGFA 1UTBB 1LFGA 4K3FA 5H8SA 4GFRA 3FXUA 5DTBA 3MW0A 5JTYA 4KI0E 3S9NC 3VVEA 1R9LA 5H8NB 4JWOA 4NF6A 5I84A 1LLSA 3FIRA 3LSXA 2RKMA 3HN0A 3BKIB 4YKJA 1DOTA 3RT8A 3R6UA 1DTGA 3N94A 1VFDA 4LQ2A 3PU5A 3SERA 2F6PA 3VXBA 3TKDA 4XKPA 4R6YA 3MZBA 3PMVA 1II5A 4F3SA 4M4GA 5FHOA 1SQYA 4H5GA 3R26A 4LQ5A 1BLFA 4QRZA 5I57A 4ZECA 1DPEA 4DXCA 1N76A 1ZKBA 2PT2A 3V89B 4G8HA 5JEIA 3SKPA 3PD8A 3K1NA 1N7WA 3KN3A 1SYIA 2XD3A 4U1OA 1BIYA 4IY6A 1Y4TA 3G3KA 3O6HA 3RLFE 3HHFA 3C31A 3TTLA 4I1DA 3PD9A 4X1BA 1URDA 3R7XA 3Q29A 2Y7RA 4P0IA 3H6UA 2XXRA 2V3UA 1POTA 1SBPA 5F7VA 2O6AA 4FAJA 3TQWA 5A5XB 4M1VA 5I59A 1LFHA 4OVJA 2Z8FA 3OO9A 1NFTA 1USYE 4LA9A 4F3PA 4IGTA 2IA4A 1B5HA 1DTZA 4GF8A 2F36A 3QIMA 3PMXA 3C4MA 3RY3A 4PFTA 1LAGE 4OFOA 2H25A 4ELPA 2XXPA 5CC2A 4GD5A 2I58A 1IXIA 1B2HA 1MS7A 3FJMA 5TPAB 1QUIA 4OWDA 4F22A 2P0SA 2ZYKA 1SD3A 3A3CA 3CRBA 3E3KA 1FQBA 3JZJA 2QSXA 3U92A 4ZZAA 1SI0A 1ZBMA 5AA4B 2Q89A 1EZOA 1B51A 1WDNA 4NWDA 2H9BA 2UYEA 4F1UA 3CR9A 3M3LA 4ZZEA 3N6TA 3IK6B 5JTYB 5AA1A 2NXOA 1LBBA 1US5A 3PUWE 4NF6B 3MVWA 1MQHA 3MQ9A 2NVUB 3N5LA 3KOSA 1LSTA 4N6PA 1MG1A 4HCYA 4U2RA 5H8QA 3K2DA 5DVFA 3CIJA 2UVHA 1S50A 3WAFA 1A8EA 3TCGA 4G2ZA 1JVXA 3ILUB 4R73A 1D9YA 3FVKA 1IITA 2QMWA 1ZMGA 4FIMA 1BTJA 3K6WA 2OLBA 1QKBA 2ZYMA 5M2VA 1A8FA 4EF1A 4DE8A 3OOAA 5I57B 3L6HA 3PUXE 1JVYA 4KFQA 4YZZA 4DCXA 5CMCA 3EQ1A 2I48A 5HM4B 4F2OA 1LB8A 3I6VA 5DT6A 3H6TA 1XOCA 3EHSA 3FJGA 3IORA 4YMAA 4NEDA 1M5FA 3C33A 1QKAA 2I0CA 2X7QA 4PP0A 3QAXA 2PT1A 1AOVA 1KWHA 3CI8A 1QUJA 1YPNA 5CBSA 1IIWA 3F11A 1LFIA 4YB5A 1FTLA 5I59B 3D4CA 4G4PA 4NF4A 3IOTA 1LCFA 2OK2A 2A5SA 1PBQA 4OTEA 4H5FA 1URSA 3K6UA 3VXCA 3TZAA 3H06B 5DVIA 4G68A 2DYXA 2F7BA 3SEYA 1LGBC 4OESA 3VLVA 2GFEA 4MFIA 1I6QA 4Z0IA 4QSCA 3W9VA 4JB7A 1B3FA 4RPNA 3EN3A 4RNSA 1T0KA 1FQDA 2PX1A 4MBPA 1Z7NE 3VFJA 3N6UA 4OZ9A 1N84A 2HAUA 2GHAA 5AA2D 5K2XA 1N0TA 3G3FA 2O7UA 4DDDA 5BWJA 1NL5A 1Q1KA 3CG3A 3VVDA 3IO4A 4KYDA 3M3KA 2NWJA 1QUKA 1BP5A 1JW4A 1JEUA 1R1NA 1NNPA 2Z22A 4HCWA 1O64A 2UVIA 2AYSA 2XXYA 3UORA 1JW5A 1SVXB 3K0VA 4NMYA 4ZEFA 1UTHA 1PB9A 3PPNA 1MQJA 4Q5TA 3I5OA 3IB0A 1LCTA 3TCHA 4GVOA 2ONSA 4OERA 5KDTA 3FXQA 2FNCA 3B6QA 3IOVA 1H3DA 2DOJA 1B0LA 4R9FA 4RPOA 4GXSB 3FV2A 2XHDA 5FTHA 1EH3A 5H8QB 3GXAA 1FQFA 1MQGA 1MPDA 3G7WA 3K01A 4G68C 3LR1A 4WXJA 1Y1MA 4BLAA 1FTJA 3TYHA 3T96B 3FGSA 5L8DA 3CG1A 3OD7A 1B6HA 2XX9A 4ELOA 3KN8A 1P99A 3CSGA 4FJPA 4EXKA 4THIA 4YKIA 1WVJA 3KGCA 2XD2A 1BKAA 3O97A 1OIBA 4GL8A 5K2YA 5ISUA 2Q2AA 3IR1A 4U4XA 2WKYA 5H8HA 2VD3A 4Q8RA 1P1NA 3ZKLA 3OELA 1MM7A 4YMBA 3C34A 2NOOA 1MM6A 4F19A 1QJMA 3T22A 4RJZA 4NF5A 4EQ9A 1Y3QA 1MDP1 3C32A 1A54A 3EHTA 5I2NA 2I6EA 3RUMA 1NNTA 1SI1A 2M8CA 4O3BA 3MVYA 4EUOA 3KJ7A 3T9XB 1LBCA 1R9QA 2DVCA 3PMWA 3CFXA 3PUYE 3TEPA 1MQDA 1PB8A 5B7DA 3GBAA 1HSJA 4BDLA 3K6XA 4YKPA 2GH9A 1TT1A 2QS3A 4MLQA 4HS7A 3UGWA 3O6IA 3LUYA 3FVOA 3PUZE 3TTRA 1B40A 1TXFA 2V93A 4NF4B 1PB7A 1M5CA 4ND9A 3RTWB 3TMGA 4QHQA 2V3TA 2FA7A 2HAVA 2P2AA 2D5WA 4G68B 1MH3A 4H65A 2LAOA 1FQCA 4H6DA 1B4ZA 5AA2A 3MUQA 4JWYA 4AB6A 3B6TA 4JBZA 2F5XA 3VLWA 1TFAA 2G93A 2XX7A 1GV8A 4EF2A 4F1YA 4X1DA 4BDRA 3AXFA 4G77A 4YAHX 5CBRA 1D3KA 3T93B 2ONRA 2A5TA 3HHGA 3H3GA 1VSOA 3WAEA 2QPQA 4R6HA 4MLVA 4GWOA 4KPTA 3RN8A 1UTHB 2DWHA 4XKRA 3K1PA 1ZLQA 3SESA 3ILTB 4OMBA 5KDTB 2RC8A 4IO4A 3M8UA 5CMKA 4PFUA 5FTIA 2RINA 4Q30B 4E0XA 2I4CA 3ZS6A 3DLNA 1B05A 1D9VA 4XXUA 3OO8A 4I9DA 4HW8A 1QVSA 1MDQA 1P1QA 1P1OA 5CM6A 4QF9A 2H4IA 4KYSA 3ONMA 3KOTA 3VE1B 4BDQA 4OEUA 4KCDA 1FCKA 4DIGA 4E0WA 2HFBA 4IO2A 2I0BA 2O7IA 1Y1ZA 4JSDA 4TOZA 2R9JA 5H8HB 3I3VA 5DEXA 4X48A 3TDJA 4WEDA 4ZEKA 4Z7EA 3EF7A 4NF5B 3TTKA 4ONYA 1LAHE 2Z8EA 3ODBA 1MXUA 5I2NB 3FZVA 1I6BA 1UIUA 4YB7A 1PEBA 3MAMA 4FATA 2DP8A 3FD3A 1TFDA 3U72A 1US4A 3QUJA 1HSLA 1M5DA 1CB6A 3DP8A 3H4ZA 1NNFA 3S2VA 2XX8A 4XTCQ 3TCFA 3Q25A 3MP1A 3GZGA 4GRKA 4MF3A 2DXRA 4WKMA 3OSRA 4ESXA 4YICA 4XIGQ 2OBGA 2DS9A 1B58A 3UA8A 3SDFA 2ZNSA 4EDPA 4JSOA 1S7YA 2DWJA 4F31B 1ZTYA 1SDXA 3K02A 4ELQA 1P1UA 1DSNA 4ISUA 4LATA 3PPQA 5I58A 1DMBA 5L9OA 1MXYA 3QYTA 4P0GA 4PFWA 1DPPA 3THIA 3PPPA 4BDNA 4F2QA 2OWTA 3KN7A 3B7DA 1H44A 3FXRA 5AA2B 1J1NA 3Q28A 1MXXA 5H8FA 2DQVA 4F3GA 4U1ZA 3IL1B 3L6GA 4IO6A 1A55A 2ZNTA 2DVZA 2VGQA 4F39A 5I56A 4N07A 4DZ1A 4NTLA 4LVQA 4JWXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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