1JNFA

Rabbit serum transferrin at 2.6 a resolution.
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
EKTVRWCAVNDHEASKCANFRDSMKKVLPEDGPRIICVKKASYLDCIKAIAAHEADAVTLDAGLVHEAGLTPNNLKPVVAEFYGSKENPKTFYYAVALVKKGSNFQLNELQGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLLCDLPEPRKPLEKAVASFFSGSCVPCADGADFPQLCQLCPGCGCSSVQPYFGYSGAFKCLKDGLGDVAFVKQETIFENLPSKDERDQYELLCLDNTRKPVDEYEQCHLARVPSHAVVARSVDGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSGDFQLFSSPHGKNLLFKDSAYGFFKVPPRMDANLYLGYEYVTAVRNLREGICPDPLQDECKAVKWCALGHHERLKCDEWSVTSGGLIECESAETPEDCIAKIMNGEADAMSLDGGYVYIAGQCGLVPVLAENYESTDCKKAPEEGYLSVAVVKKSNPDINWNNLEGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNRINHCRFDEFFRQGCAPGSQKNSSLCELCVGPSVCAPNNREGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKSQTVLQNTGGRNSEPWAKDLKEEDFELLCLDGTRKPVSEAHNCHLAKAPNHAVVSRKDKAACVKQKLLDLQVEFGNTVADCSSKFCMFHSKTKDLLFRDDTKCLVDLRGKNTYEKYLGADYIKAVSNLRKCSTSRLLEACTFHKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal and molecular structures of diferric porcine and rabbit serum transferrins at resolutions of 2.15 and 2.60 A, respectively.
pubmed doi rcsb
molecule keywords serotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 219
structure length 674
sequence length 674
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1jnfA03
2DWAA 2RF1A 2DS9A 1VE4A 4EDPA 2QL3A 4LZ8A 3KFMA 4F3GA 1UTHA 5CC2A 4F3BA 3PMWA 4GIZA 4IO6A 3DELB 3A3UA 4IY6A 1Y1MA 2G93A 3HO7A 2Z8DA 4QFKA 3N6UA 3EPEA 1IUDA 2THIA 4ZEFA 1P1OA 4Q5TA 4G68B 3BFUA 3C31A 1HSEA 3USDA 1LAGE 1NH7A 1O64A 2X26A 4Z0IA 3U93A 2VGQA 4MF3A 4DZ1A 2D5WA 5I2NA 3MVWA 4ONYA 1MQHA 3H03A 3KN8A 3FVKA 5HPQA 1MPDA 3RT6B 5ICQA 3ODBA 3UA8A 2O6AA 1Y9UA 1QUJA 2ANJA 4ZEBA 3C9HA 2IEEA 2B3FA 1JW5A 4ZS9A 3IO6A 1LAFE 3FVGA 4OXVA 5K2YA 4K3FA 1QW0A 1M5EA 1SYHA 5H8QB 5JK4A 1AIVA 1J1NA 1GV8A 4XIGQ 2AIXA 1EU8A 2NXOA 3HV1A 2O1LA 5I59B 5AA4B 2H4IA 5KCJA 4NWDA 4DCYA 1L5TA 4XKPA 1MH3A 4N07A 2H5YA 1MY1A 3OOAA 3DLNA 4KD5A 4OYVA 5IKBA 1P1NA 1B3LA 3OSRA 4E0XA 3QK6A 4KYSA 5DVIA 4YB7A 3TKDA 1DSNA 4YAHX 4YKPA 3EHUA 2VD3A 2YLNA 3DP4A 1Y3NA 3FJMA 3QUFA 4HCWA 3W9WA 3L6GA 3KJTA 4N13A 1URGA 1B1HA 2I49A 5H8FB 1OLAA 3OXNA 2R71A 2P2AA 4F22A 3K02A 2UXAA 1OQGA 1XC1A 1MQGA 4JWXA 1BIYA 3MQ9A 4U21A 1HSJA 3DP6A 1VR5A 4OWDA 3MUQA 1P1QA 1RKMA 3GXAA 1B4HA 3O29A 3TFLA 4ELRA 1PBPA 3SEYA 1R6ZA 1MRPA 4G8NA 2HXWA 3OO7A 3TZAA 4G77A 2Y7KA 1SI0A 1YAEA 3Q29A 5TPAA 1LCFA 4FATA 2D3IA 2PT2A 4YMBA 4OFJA 1NNFA 3K6XA 1N84A 1A55A 1US5A 1OVBA 2V3UA 4BDNA 5I2NB 1OMPA 4U23A 2O1MA 5B7DA 2XXHA 1IXCA 1UIVA 4AQ4A 4XKNA 3FASA 1IXIA 3QUJA 1JW1A 4OZ9A 5I57B 4TOZA 3IOTA 2UVJA 4NWCA 1POY1 4H0WA 3A3CA 3VLVA 2UVGA 4QF9A 4P0IA 1XT8A 3QYTA 4DXBA 5A5XA 4OETA 3O66A 3HHFA 4PFWA 1JW4A 1MDP1 4R74A 1Q35A 1TFDA 4DXUA 3CFLA 3K1PA 1LAHE 4ZEKA 5DYHA 4NEDA 5HBCA 3PUZE 3VXCA 2XXTA 1P99A 1AL3A 5KCJB 2PT1A 3K1MA 1OVTA 5EHSA 4MH5A 5DT6A 4ELQA 2VOZA 4G68A 1YPNA 1LB8A 2CMOA 4GD5A 2Q8JA 3D4CA 1FQAA 1B51A 3LBSA 3HPIA 4BDOA 1D4NA 3PU5A 4YB6A 3RY3A 3O97A 4GF8A 4OTEA 3FVNA 3LUYA 3PUXE 1H3DA 3FV1A 4OFOA 4QSEA 3OO6A 4UA8A 3PPNA 3N26A 2W7YA 1B1XA 3B6TA 4MFIA 2M8CA 2FYIA 2AL4A 2O7UA 3PUWE 3OO8A 3QXMA 4GRKA 3VVDA 5H8QA 3H6TA 2Q2AA 4XTCQ 1TXFA 1N7XA 4M1VA 3FUZA 2Y84A 1B5JA 1MM7A 3ILUB 4QSCA 5I59A 3FXRA 5AA4A 1D3KA 2O68A 3P7IA 1JEVA 3V8XB 3VE1B 4BDQA 3ECRA 1LAXA 2Q89A 3ZS6A 2DVZA 3ONMA 3VV5A 3CFZA 1JVYA 4ZE9A 1Y20A 1TT1A 3TUSA 4G8HA 4G2ZA 5TPAB 3RNNA 3Q28A 2F36A 3PPRA 5ICTA 2O7IA 2VP1A 4C1UA 2GHAA 5I84A 3HHGA 5I58A 3TTNA 3KOSA 4OQOA 1A54A 2RKMA 2B65A 3HN0A 5CMBA 5DEXA 4ZZAA 4GXSB 3PV0E 4KI0E 2HAUA 2NVUB 2HZKA 4RJZA 4F18A 4H5GA 1US4A 5I56A 2B3BA 5H8FA 1JVXA 2R9JA 2V3TA 1FTKA 5B70A 4GL8A 2Z23A 5TU0A 4KFQA 4QFOA 3LR1A 3T9UA 3C4MA 1B3GA 4Q0CA 1PB7A 2D21A 1GR2A 4KCCA 2OZZA 4QFPA 3PUVE 4F2QA 5FTHA 3IX1A 5A5XB 4H1XA 1B7HA 5FHMA 2QMXA 1B7UA 3RQTA 4LVQA 3MBPA 3SETA 3MVXA 3OMBA 1I69A 3CSBA 5LOMA 4P0GA 5AA1A 3OEKA 1A99A 4FE8A 1N0TA 1RYXA 5CMMA 3K00A 2XD2A 3C36A 3VVEA 3MVZA 1OIBA 3GBBA 1II5A 3IB0A 4JSDA 3EHSA 3VLWA 4I62A 3H6VA 4JWOA 4OEUA 4OMBA 4O3CA 3FIRA 4GLIA 3T9VA 4RNSA 4Q8RA 2Z22A 1BKAA 1R1NA 4POXA 1LBCA 3KZGA 3SEXA 2OK2A 2XX7A 3C33A 3K0VA 1B6HA 3IB2A 3FJGA 4LQ2A 1DTZA 3W9VA 3E9XA 3TTMA 4JB7A 1MM6A 5EYFA 1QUIA 3JYRA 2Q88A 4HS7A 5I57A 4ZZEA 3TCHA 4YKJA 3CRBA 4ESXA 2YPNA 5FHNA 1TFAA 3IB1A 1AMFA 3Q25A 3GBAA 4G8MA 1H43A 1N76A 3I6VA 1ZIUA 1TWYA 4U22A 4RK9A 1WODA 3K6WA 3VVFA 1FTMA 2Y7IA 3IAZA 3TMGA 4EF2A 1GTKA 2VHAA 2E1SA 1P1WA 1B0LA 2DWJA 4BDRA 2Y7WA 3U1OA 4F3PA 3G3GA 1B32A 1FQDA 1Y4CA 5L9OA 5CM6A 3OELA 1FTOA 3VLUA 4F1VA 1DTGA 3G3KA 2RCAA 5JTYA 3MPLA 3PD8A 3HCQA 2V25A 1MS7A 5I2KA 1AOVA 1A7LA 1Y3PA 3V89B 5I58B 4NF6A 3T9HB 4BDLA 4R75A 4O3BA 5FHOA 5DEXB 2F5XA 1O63A 4ZDMA 1MXWA 2UYFA 4OHNA 1NH8A 3UORA 1SD3A 1S50A 2Z8FA 5L8DA 1Y3QA 1USYE 4G4PA 5I56B 2QSXA 3IOWA 2G29A 1M5FA 2QS4A 1M5DA 3KBRA 5AA2D 2HEUA 4JDFA 1MQJA 4NF5A 3AXFA 2P0SA 3FGSA 4IO2A 2F34A 4FEBA 1H45A 4DXCA 2QJEA 3SEVA 4UACA 3DP8A 3UP9A 3O9PA 5ISUA 3DM0A 3I5OA 4EQ9A 2OJTA 4LUBA 4ESWA 3PUYE 4Q30B 2GHBA 1A8EA 3VDFA 3PMXA 1R9QA 3MP6A 1SYIA 4YB5A 2I6EA 3R26A 3MZ9A 3FJ7A 3W15C 5H8NA 2DP8A 3QSLA 1B58A 2A5TB 3PGFA 1IQ7A 2RC9A 3TTRA 4H6DA 3ZSFA 4PFYA 2ZYOA 2DE2A 3RPWA 3TPAA 1ZLQA 2ZXTA 2I58A 1XOCA 1LCTA 4RK2A 2F78A 1PB9A 3O6IA 2I48A 4R9FA 4NTLA 5F7VA 5DTBA 1Q1KA 5EHMA 2DYXA 1OLCA 2DWIA 3JV9A 1Z7NE 1FTJA 1ZJLA 5KZTA 2VD2A 4DLDA 3MZ1A 2Q9TA 1NKXA 3B7DA 3U94A 1SBPA 4H5FA 4Z7EA 4IY5A 3JZJA 4H67A 2H99A 1MPCA 3K01A 1R9LA 2WKYA 2Y7RA 3H6WA 1AH5A 4HW8A 2RC8A 4POWA 4RY1A 4MBPA 1UQWA 1MXYA 4OERA 4F31B 3KN7A 2F97A 1I6QA 1NL5A 2XXIA 3WAEA 3TCGA 4R73A 4IO7A 3TYHA 4YZZA 2PVUA 2NUVA 3T22A 4EUOA 4R72A 4PFTA 2DVCA 2X7PA 1IXHA 1N3XA 1GVCA 4ZEIA 1ANFA 4TQUQ 5J1DA 4YKKA 2BJJX 3Q26A 4PFUA 5JTYB 3TCFA 2Q2CA 3L6HA 5I2KB 5KDTA 1SW4A 2XXXA 1LBBA 4LQ5A 4R2BA 2DE3A 4NF6B 1QJMA 1B40A 1MY0A 4RYAA 4F3SA 2ZMBA 3ILTB 3Q27A 2ZYKA 5AE4A 4WEPA 5ELVA 1ZTYA 4H8IA 1HSLA 1N7WA 3G3FA 4XKQA 1URDA 1FTLA 2HFBA 4NF8A 2QRYA 4NF5B 1LB9A 1MY2A 2DXYA 5ITPA 2F6GA 3EQ1A 1MPBA 2REGA 3S9NC 1MXZA 1ZMGA 3FXUA 3LSLA 2XX9A 2FNCA 2QS3A 4F1UA 2XD3A 1XVYA 1QKBA 3K1NA 4KCDA 1EZPA 4FIMA 3F11A 1NFTA 5HM4B 3G3HA 1DPPA 1SQYA 1DMBA 2I0CA 3OD7A 2F35A 5FTIA 1XVXA 4ECFA 5K2XA 4DIGA 1ATGA 5H8NB 1SW2A 4NF4A 1ZU0A 3IK6B 3N6TA 3O28A 3S4UA 4U4SA 4R9GA 1FQEA 2ABHA 1CE2A 3PPOA 4ZE8A 3K2DA 1MQIA 3KGCA 2HCAA 1PC3A 1YCJA 3UGWA 5CMCA 3H06B 2F7AA 1JNFA 1OQHA 4JWYA 1I6BA 1I6AA 5L9SA 5AA3A 3S9MC 2V3QA 3LSFB 1RYOA 3U8QA 4KQPA 3KOTA 2H98A 3G3IA 3KJ7A 4RPOA 1S9TA 4EXLA 3GZGA 4R2FA 2ZNTA 4GQOA 1URSA 4HCYA 2LAOA 2A5SA 4AB6A 1EZOA 3BKIB 1QULA 3G3JA 4N6PA 1PBQA 2F6PA 5JEIA 3BFTA 3M8UA 4MLVA 3MAMA 2F7BA 2GFEA 1DPEA 1B0HA 3VFJA 1DOTA 1Y1ZA 3PMVA 1PEBA 4FEDA 3SERA 5CMKA 2FA7A 1UIUA 2I4BA 4GVOA 2ONRA 4WKMA 4TLMB 5CBRA 3RGYA 3FVOA 2A5TA 2O84X 1SVXB 2HAVA 4LP2B 1MH4A 1MDQA 1Y4TA 2O69A 4R6HA 2GH9A 3I3VA 1GGGA 3B6QA 4ZEDA 3D4GA 1B5IA 5KDTB 3SDFA 4X1BA 4X48A 4IO5A 1A40A 1MY4A 3LSXA 1FCKA 3IOVA 2QMWA 2I3VA 3KN3A 3EF7A 5IAIA 3RT8A 1B46A 2CZLA 3IO4A 4ND9A 3IL1B 1XHYA 1B3HA 4U1OA 1N04A 3TAJA 1EZ9A 4NF8B 2QPQA 4I8CA 2R6GE 3TODA 1LLSA 1MXVA 2AYSA 3GLBA 2XXPA 4PP0A 3SESA 2DWHA 4DE8A 1JEUA 4H8JA 1B52A 3V5AA 5CBSA 3LSWA 3MP1A 4X9TA 3M3FA 3T66A 5DVJA 2XHDA 1FW0A 4LZ7A 1ZBMA 2XXUA 3E3KA 4IO3A 1BP5A 1POTA 4OVJA 1MG1A 3E4RA 2PX1A 1SW1A 1D9VA 3C35A 3CSGA 3CVGA 3M3LA 4NF4B 1T0KA 2RC7A 2Y7PA 4EF1A 3CIJA 3OO9A 3TELA 1JQFA 4I9DA 5H8HA 3RTFB 1S7YA 4YICA 4I1DA 3TTLA 3H7MA 3LC8A 3U72A 3S9EA 2H9BA 4BDMA 2UYEA 3ZKKA 2H25A 3M3KA 2ZYMA 4C1TA 3CR9A 1H44A 1MXXA 4QHQA 1B05A 3OSQA 5TP9A 4KPTA 3MP8A 2UVHA 2PBWA 3H6UA 1JETA 3C34A 4JSOA 1M5BA 4YKIA 3H4ZA 4E0WA 2V84A 3RLFE 2ALUA 5CRYA 2X7QA 4QFLA 2QS1A 2XXWA 2DOJA 3R6UA 5ITOA 3K4UA 1BTJA 3O2AA 2HZLA 2OWTA 2RINA 4F29A 1CB6A 3MPKA 4F19A 2ESNA 4U4XA 3MZBA 4IO4A 3S9LC 3OENA 2XXQA 3T9XB 1WDNA 3O6GA 2I0BA 3A09A 3S2VA 1QKAA 2REJA 2ZNSA 2YJPA 1VSOA 1EH3A 5AA2A 5H8SA 3FXQA 1UTHB 1IIWA 4THIA 1IEJA 1B3EA 1B3FA 1IXGA 4GOTA 1H76A 1QUKA 4NMYA 4OFLA 3G7WA 2RCBA 1PDAA 1Z7ME 2I4CA 1VFEA 1NNPA 3IOUA 1P1UA 4R6KA 1UTBA 3B6WA 4WEDA 3H3GA 4TLLB 4EQBA 4ZECA 3TDJA 4KR5A 1LFIA 3R7XA 2ZNUA 3ZKLA 4DCXA 3SKPA 1LFHA 1FQFA 4FECA 1B2HA 3O6HA 3TTKA 4GXAA 4RPNA 4U2RA 1ZKBA 1IITA 4YMAA 4LONB 1SDXA 2XXVA 3V83A 3T96B 2XXRA 2I3WA 4JBZA 3CG3A 4BLAA 2ONKE 4OENA 4WXJA 4EXKA 3N94A 1FQBA 2NOOA 4G68C 3K6VA 4FAJA 4FORA 2AL5A 3FATA 3MJNA 4RXLA 4F39A 1B5HA 2XX8A 3RUMA 4IGTA 1NMUA 2ONSA 3WAFA 3THIA 2OCUA 3SEUA 2PMSA 3C32A 4PE5B 5H8HB 5L9MA 5DVFA 1PB8A 1A8FA 4LA9A 1D9YA 4AB5A 3E13X 1MXUA 1SI1A 3QIMA 1WVJA 4OESA 3FZVA 4IGRA 4XKRA 1VFDA 3BBRA 3UIFA 3MW0A 4LATA 4NE4A 5CI5A 2OWSA 1NNKA 2UVIA 1B9JA 2F8DA 2DE4A 5TP9B 1LFGA 4YU0A 3FD3A 4FJPA 5BUUA 1LGBC 3IJXB 4QFNA 3UN6A 1NNTA 3KEIA 3RN8A 4GL0A 2QS2A 4GWOA 2PYYA 3CG1A 2F7CA 3TQWA 2O51A 3EN3A 1M5CA 4O3AA 3RTWB 4F1YA 2OBGA 1LSTA 4PQJA 3KG2A 4H65A 4M4GA 1XS5A 1O7TA 1MY3A 4P11A 4U1ZA 2DQVA 4R6YA 4KYEA 3CFXA 3TEPA 5BWJA 2E0SA 4EQ7A 3PPQA 4ELOA 3MVYA 3VXBA 1FQCA 2ZYNA 4QRZA 5AA2B 2XXYA 3IJOB 1BLFA 2Z8EA 2DSFA 1KWHA 1YTVA 3K6UA 4ISUA 5F1QA 3MC2A 4XXUA 3U92A 2IA4A 3HSTA 3CI8A 1MQDA 3KSJA 2KLFA 3EHTA 3OEMA 4KYDA 4HTGA 3T93B 4IB2A 1QVSA 3UK4A 1IZ1A 1ELJA 1UTBB 2HQ0A 3N5LA 4QSDA 3QAXA 1USYH 4X1DA 2GRVA 4GFRA 5M2VA 4RA1A 3IORA 4OEVA 4LZ5A 1B7ZA 3KSXA 3SEWA 3TQLA 4ELPA 3FV2A 4KHZE 4F2OA 4DDDA 1F9BA 4PETA 2V93A 1N3WA 3PD9A 2OLBA 1SW5A 3PPPA 1B4ZA 4C0RA 4MLQA 3IR1A 3MWBA 2DXRA 2P1SA 2NWJA 4L17A 4JXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DWAA 2RF1A 2DS9A 1VE4A 2Y5LA 4EDPA 2QL3A 4GX3A 4LZ8A 3KFMA 4F3GA 1UTHA 5CC2A 4F3BA 3PMWA 4GIZA 4IO6A 1RDXA 3DELB 3A3UA 4IY6A 1Y1MA 2G93A 3HO7A 2Z8DA 4QFKA 3N6UA 3EPEA 1IUDA 1FPEA 2THIA 4ZEFA 1P1OA 4Q5TA 4G68B 3BFUA 3C31A 1HSEA 3USDA 4N15A 1LAGE 1NH7A 1O64A 2X26A 4Z0IA 3U93A 2VGQA 4MF3A 4DZ1A 2D5WA 1KA1A 5I2NA 3MVWA 4ONYA 1MQHA 3H03A 3KN8A 3FVKA 5HPQA 1MPDA 4O8MA 3RT6B 5ICQA 3ODBA 3UA8A 2O6AA 1Y9UA 4PF8A 1QUJA 2ANJA 4ZEBA 3C9HA 2IEEA 2B3FA 1JW5A 4ZS9A 3IO6A 1LAFE 3FVGA 4PGPA 4OXVA 1FPFA 5K2YA 5EYGA 4K3FA 1AWBA 1QW0A 1M5EA 1SYHA 5H8QB 5JK4A 3A29A 1AIVA 1J1NA 1GV8A 4XIGQ 2AIXA 1EU8A 2NXOA 3HV1A 2O1LA 1NV0A 5I59B 5AA4B 2H4IA 5KCJA 4NWDA 4DCYA 1L5TA 4XKPA 1MH3A 4N07A 2H5YA 1MY1A 3OOAA 4OA4A 3DLNA 4KD5A 4OYVA 5IKBA 1P1NA 1B3LA 3OSRA 4E0XA 3QK6A 4OVPA 4KYSA 5DVIA 4YB7A 3TKDA 1DSNA 4YAHX 4YKPA 3EHUA 2VD3A 2YLNA 3BIHA 4PF6A 3DP4A 1Y3NA 3FJMA 3PTYA 3KBZA 3QUFA 4HCWA 3W9WA 3L6GA 3KJTA 4N13A 1URGA 1B1HA 2I49A 5H8FB 1OLAA 3OXNA 2R71A 2P2AA 4F22A 3K02A 2UXAA 4H45A 4MNCA 4QXDA 4PBHA 1OQGA 1XC1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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