1LAXA

Crystal structure of male31, a defective folding mutant of maltose-binding protein
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTDPKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a defective folding protein
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN MUTANT MALE31
total genus 126
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA01
1PB7A 4TOZA 3TTMA 4U1OA 4OENA 1J1NA 4GL8A 5EHSA 3WAEA 1ATGA 3PD9A 4TLLB 3KFMA 3MJNA 3SEXA 1B7HA 4JDFA 4NF4B 2F35A 3CG3A 4HS7A 1MY4A 1NKXA 4F22A 1M5BA 4XKQA 5I57A 4IO2A 2O6AA 5I2KA 3V8XB 3CSGA 1LB8A 5CBRA 3RLFE 1IXGA 2AIXA 1OVBA 1NH7A 3IORA 1MDP1 3E9XA 4WEDA 3JYRA 2G93A 3ZS6A 4DCXA 5H8QA 3K6UA 4YICA 1SI0A 3EHUA 2A5TB 4JBZA 2HQ0A 2B3FA 1TFAA 5KZTA 2AL5A 3D4GA 1MPBA 2NVUB 4XKRA 1XC1A 3K6WA 1FQEA 1OLAA 2F6GA 2Q2CA 2DYXA 3A3CA 4QF9A 5J1DA 2XX7A 4G4PA 1TFDA 3KOTA 3FJGA 1DTGA 5DVJA 1NNTA 3QYTA 3FD3A 3SETA 4C1TA 4G8NA 3K4UA 4H8IA 3KJTA 3QSLA 4PQJA 4FAJA 1JW1A 3K6VA 3V89B 1CB6A 2KLFA 3I5OA 4OEUA 4NWDA 5EHMA 3U93A 3RT8A 1OMPA 3MC2A 2QJEA 4XKPA 3TTKA 1Y20A 4BLAA 3GBAA 3IJOB 3VFJA 3OO8A 4IY6A 4QFOA 2O68A 4C1UA 4JWYA 1DSNA 4YMAA 4IO4A 3H03A 4EDPA 3CIJA 2OWSA 4ELQA 3PUVE 3GBBA 2H99A 4EXKA 1R6ZA 1MM7A 4R74A 2ZYOA 3FV2A 3SDFA 2GH9A 2F78A 1POY1 1SYIA 5H8NB 1ZU0A 5FTIA 4MBPA 2ANJA 1QUKA 2DS9A 2ESNA 3O66A 2P1SA 4ESXA 1A7LA 4HCYA 2ZXTA 5A5XB 3I3VA 4QFLA 2REGA 2PVUA 3ZKLA 1KWHA 4KI0E 1MXWA 3G3JA 1MQJA 1M5FA 3KSXA 4XXUA 1N76A 4ZZEA 5ITPA 3UGWA 4H0WA 3PGFA 1CE2A 4NF6A 2FNCA 1MQGA 2XXQA 4KD5A 4FEBA 2ZNSA 4GOTA 1LGBC 2HFBA 2DVZA 3KN3A 1I6BA 4QSCA 1UTBB 3VVDA 1OQHA 1POTA 4POXA 1FTLA 2V3QA 4PP0A 3IOUA 1MXUA 4ONYA 2OBGA 1JNFA 4FECA 1B9JA 1H43A 3IO4A 1I69A 4R6KA 4GIZA 1SYHA 2HEUA 5H8HB 1DPEA 4BDOA 4E0WA 2I49A 4RY1A 1FQFA 3W9WA 3U1OA 1EU8A 3RQTA 3FXRA 2DE3A 1JEUA 1URGA 1US4A 2O51A 4BDRA 1IXHA 2ZYNA 1N3WA 4GD5A 4F2QA 3O9PA 3PPNA 3T9XB 3HN0A 4KR5A 5LOMA 3MP1A 4DXBA 2XXXA 1Q1KA 5I59A 4YKIA 1NFTA 1MDQA 4YMBA 4MLVA 1NMUA 5TP9A 1MH4A 1MY2A 3MZ9A 5L9OA 2AYSA 1UQWA 4JWXA 3ZKKA 5TPAA 2UYFA 3TYHA 4EF1A 5KDTA 4LATA 1NH8A 1JW4A 3K6XA 3T22A 4OVJA 4H65A 4PFUA 1P1OA 3UP9A 3P7IA 1N0TA 4RK2A 2Q89A 2UYEA 4DZ1A 4RA1A 2H25A 5AA3A 3VXCA 3WAFA 4YB5A 4G8MA 4NWCA 5I56A 1XVXA 4EF2A 2ABHA 4NTLA 2ONSA 3OSQA 3O6HA 3MBPA 3K1MA 2NWJA 1URDA 2XXYA 3ZSFA 5K2XA 1B7UA 3MZ1A 3E3KA 3W9VA 3Q29A 2Y7WA 5CMBA 3TTLA 4ZEDA 2QSXA 3S9NC 4GLIA 3GLBA 5HM4B 4O3BA 2CZLA 4BDQA 1PDAA 4GVOA 4LZ8A 4OTEA 2DWAA 4MH5A 3TUSA 1NNPA 2LAOA 1O63A 2R71A 4ESWA 3OXNA 2GRVA 3U8QA 4HTGA 4E0XA 1MS7A 2A5TA 3O29A 4IGTA 4Q5TA 2Z23A 2ONKE 3T96B 3MZBA 4L17A 5AA4B 3LBSA 3FVKA 4ZEFA 4DE8A 1B0HA 3C36A 1LLSA 4U4SA 4LZ7A 4ZECA 4IB2A 4KQPA 1MXXA 1GV8A 3EN3A 3OSRA 2UVHA 3MUQA 4JSOA 2RF1A 2QS2A 4C0RA 4G8HA 4FIMA 2VOZA 5KCJA 4UACA 3IOWA 4POWA 3MPLA 1OQGA 4IO3A 2RKMA 2FYIA 4RPOA 1BTJA 1LAGE 3VDFA 1GVCA 2XD2A 1RYOA 3FVNA 1DMBA 2P0SA 2XHDA 2PBWA 4TQUQ 1O7TA 2XXUA 1Y9UA 3RT6B 4QRZA 4U22A 2PYYA 3BFTA 2Q2AA 3IJXB 3BBRA 1AOVA 4LA9A 4F3PA 2PT2A 2OZZA 2HCAA 1SQYA 5H8FB 1MPDA 3FUZA 3U72A 5I58A 2NUVA 3QK6A 3QUFA 5ISUA 1FQCA 2D3IA 3SERA 5DVFA 1MXYA 3TCGA 5CM6A 1HSLA 4U2RA 3IOTA 1XT8A 4BDLA 2RC9A 4QHQA 5H8NA 3K2DA 2VGQA 4YB6A 1B5IA 4NMYA 3K1PA 3MVXA 4OEVA 4JSDA 5A5XA 2H4IA 4YKKA 3Q25A 1B32A 2DWJA 1B3FA 1B46A 2O1LA 3M8UA 3BFUA 5ITOA 1B6HA 2DE4A 2UVIA 1B0LA 3FASA 3IB0A 3N94A 3UIFA 3T9VA 3KGCA 5CI5A 4Q8RA 4QSDA 2QRYA 3HHGA 1IQ7A 3KEIA 1WODA 1MG1A 4FATA 5K2YA 1IXCA 1WVJA 1SVXB 4OETA 1UTBA 1JEVA 3Q28A 1XHYA 4ISUA 2YJPA 4DDDA 3U92A 1JW5A 3O28A 3DLNA 4EQ7A 1VSOA 4ZEIA 3VLUA 4HCWA 3KG2A 4AB6A 2DP8A 3TELA 2Y7KA 4WEPA 4X1DA 2OLBA 1B05A 3TTNA 3KJ7A 1UIUA 4YAHX 2ZNUA 2H5YA 4ZE8A 5I84A 4F39A 3TDJA 3JV9A 2Q88A 4DCYA 1QUJA 2RCBA 5CMKA 1TWYA 3JZJA 1N04A 3T9HB 4YKPA 4ZEKA 3MVZA 3K00A 1NNFA 3QIMA 2THIA 2X7PA 3TODA 4XKNA 4NF5B 1A8EA 3CFXA 1I6QA 3USDA 3PPRA 2X7QA 2G29A 3ONMA 2AL4A 4PE5B 3RTFB 3U94A 3SEVA 2F7AA 1LFIA 2V3UA 5AA2A 3DP8A 2NXOA 1MH3A 3HO7A 1LFHA 4R75A 2OK2A 4GXAA 3CG1A 3VLVA 2XX9A 4I9DA 3FATA 1FW0A 4F3GA 3T9UA 1H76A 1B7ZA 3KSJA 4G68B 1UIVA 1EZOA 5M2VA 1BP5A 1S50A 2X26A 3LSLA 1QW0A 4OZ9A 1LCFA 1A8FA 2O84X 3Q26A 4MLQA 3R7XA 2PT1A 2ZYKA 4ZZAA 3F11A 4LQ2A 1FTKA 5FHOA 1FQDA 1ZBMA 4OYVA 1B4ZA 1T0KA 5IAIA 5BUUA 4THIA 2FA7A 2GFEA 1M5EA 3C31A 4G77A 5JTYB 1MXVA 3SKPA 1URSA 1AH5A 2ZYMA 4GF8A 4M4GA 4R9FA 4XIGQ 3V5AA 1B1HA 1Z7ME 3E13X 4GQOA 3TKDA 1JETA 2E0SA 3OO9A 3LSFB 4YU0A 4YZZA 1TXFA 4TLMB 2ZNTA 4OXVA 3KN7A 3H7MA 1IITA 3RTWB 5HBCA 2XXTA 3IR1A 1B40A 3RGYA 5AA1A 4DLDA 3PMXA 1ZMGA 2I48A 1PEBA 1XVYA 2VHAA 4UA8A 1JQFA 3TCFA 3MQ9A 4BDNA 1QVSA 1MY3A 4NF8B 3VVFA 3OD7A 4H5GA 3H6UA 4N6PA 4OMBA 5DEXB 2Y7IA 2O69A 1MY1A 1AMFA 4GL0A 1BKAA 2HXWA 4GFRA 3M3KA 1N7XA 4F31B 1OLCA 2XXHA 2OCUA 1UTHB 2DWIA 5FTHA 1B3LA 3B6WA 4PETA 1B1XA 4ECFA 2V25A 4P0GA 4KHZE 4KYDA 1B2HA 1EZ9A 3N6TA 5DTBA 3K0VA 4OFJA 1AIVA 4H1XA 3R26A 1B3HA 4R72A 3GXAA 4JWOA 1YAEA 4F3BA 1FQBA 4N07A 5H8FA 1P99A 2DSFA 3VV5A 4ELRA 3TQLA 1B5HA 2V3TA 4PFYA 1FCKA 1QULA 4RJZA 4N13A 3S9EA 1Q35A 4MFIA 2A5SA 4FEDA 3B7DA 3CFZA 3TMGA 3Q27A 3N6UA 3RPWA 3OOAA 1MM6A 4KYEA 3O2AA 4I1DA 1B4HA 2Z22A 4QFPA 1AL3A 3TEPA 2H9BA 4NF4A 2UVGA 4DIGA 1R1NA 1GGGA 4G68C 1PBQA 5DT6A 3TAJA 1FQAA 3T93B 4NF6B 3K1NA 4YKJA 5EYFA 1MRPA 2DOJA 1O64A 4FJPA 4ZE9A 4ND9A 1LFGA 3G3GA 3EHSA 5I2NB 1FTJA 4H67A 3MVYA 3QUJA 2VP1A 4F19A 3KN8A 5TU0A 3FZVA 2QL3A 1QKAA 5CMCA 3MWBA 3H06B 1D4NA 4RYAA 2OWTA 5CRYA 2UXAA 1D3KA 3SEWA 4R73A 1M5CA 1A55A 1ZIUA 3LC8A 1Y1MA 1BIYA 1SW5A 1XS5A 3SESA 4BDMA 4WKMA 4IO7A 2XXIA 5IKBA 1PB8A 3IK6B 2Q8JA 1SBPA 4ZS9A 3CSBA 1OVTA 4Q30B 4H8JA 3W15C 4NEDA 5B70A 3PUWE 1N84A 1VR5A 1MY0A 1H3DA 3C35A 3FIRA 4I8CA 3VLWA 3O97A 1II5A 2ALUA 3KZGA 4IY5A 5B7DA 4XTCQ 2F5XA 4F1VA 3C34A 4G68A 3OEKA 1ZLQA 2HAVA 4ZDMA 1XOCA 1IUDA 1B3GA 2F6PA 4H5FA 4U1ZA 2IEEA 5ICQA 5ELVA 2ZMBA 1VFEA 2Z8EA 3S9MC 5FHMA 3C9HA 2DE2A 1VFDA 4IO6A 3MVWA 5HPQA 4RK9A 3ILTB 5CBSA 3PPOA 1QKBA 5L8DA 2D5WA 3CRBA 4F29A 5I56B 2RC7A 2ONRA 5L9MA 3FGSA 1LB9A 4WXJA 3DP6A 4DXUA 1LAFE 1ZKBA 3OO6A 4FE8A 3HHFA 3S2VA 4OWDA 5JTYA 1LSTA 2B65A 3EHTA 1DOTA 5JK4A 3FXQA 3GZGA 3PPQA 2XXPA 3LSWA 1D9YA 4KCCA 2I4CA 3IX1A 3KBRA 1IZ1A 4RXLA 3TTRA 1PC3A 4LP2B 2HZKA 3H6WA 3IL1B 5H8HA 2RC8A 5AE4A 1R9LA 3BKIB 3G3KA 2XXVA 2F7BA 1YPNA 1I6AA 1JVXA 1SDXA 4K3FA 4R2BA 3PD8A 2P2AA 3OMBA 2HAUA 3H6TA 3UA8A 1NL5A 3RUMA 1YCJA 4KCDA 3FVOA 4LUBA 2REJA 4KFQA 3OENA 2QPQA 3EQ1A 1LAXA 4NF8A 1FTOA 2DQVA 3B6TA 4QFKA 5DEXA 1B3EA 2GHAA 5KCJB 3OO7A 2GHBA 3FJMA 3ODBA 1VE4A 1LCTA 3H3GA 4LONB 3G3FA 3UN6A 4ELPA 1UTHA 2XX8A 4FORA 2VD2A 2QS4A 1Y4TA 3M3FA 4NE4A 3N26A 1A99A 3PMWA 4EQ9A 1Z7NE 4QSEA 5BWJA 2F7CA 3UK4A 3HV1A 1SW2A 4R9GA 2Y7RA 5I58B 1MXZA 1A54A 3UORA 1EZPA 1B52A 4ELOA 3VE1B 3SEUA 3I6VA 2DVCA 1M5DA 1DTZA 2V93A 1IXIA 1HSEA 3HSTA 1IIWA 2O7UA 3TQWA 2E1SA 1RKMA 4U23A 2RCAA 3CVGA 3DELB 4F3SA 4ZEBA 5CC2A 4JXIA 2VD3A 4R6HA 4P0IA 3IB1A 3T66A 4IO5A 2Y7PA 5I57B 2YPNA 2O1MA 3IB2A 1S7YA 4F18A 1P1WA 3ECRA 1P1NA 5I2KB 2F34A 2QS1A 3A3UA 4U21A 4LVQA 2D21A 3CR9A 1ZJLA 3RN8A 3A09A 2R9JA 5I2NA 1LAHE 2QMWA 5H8SA 3MP6A 1R9QA 3DM0A 3G7WA 5AA4A 4X48A 3FXUA 1MQIA 4F1UA 5H8QB 3RY3A 4KYSA 2I58A 2WKYA 3MAMA 3C33A 1WDNA 1QJMA 2CMOA 1US5A 4OFLA 3N5LA 5L9SA 1PB9A 4JB7A 4X1BA 1N7WA 1ELJA 4HW8A 2F8DA 2BJJX 2OJTA 3V83A 3PPPA 5AA2D 2V84A 3O6GA 3EF7A 1A40A 4GXSB 2XXRA 3FVGA 1GR2A 4GRKA 1MQHA 1B58A 4R6YA 5F7VA 3PMVA 4LQ5A 1Y3QA 3G3IA 1ANFA 3AXFA 3R6UA 2QS3A 1DPPA 2Z8FA 1PBPA 4F2OA 5AA2B 3K02A 2H98A 3VVEA 2Q9TA 2DWHA 3OEMA 3HCQA 2XXWA 4AQ4A 3O6IA 1JVYA 4RNSA 3TFLA 1D9VA 2B3BA 1RYXA 4H6DA 1H45A 2QMXA 4PFTA 4Q0CA 2F97A 3LSXA 3PU5A 3RNNA 2Y84A 3PUYE 1F9BA 2I0CA 5JEIA 3B6QA 1S9TA 2O7IA 3L6HA 1IEJA 4YB7A 3HPIA 3OELA 3QAXA 4IGRA 1SW1A 2F36A 1P1QA 4G2ZA 3L6GA 2HZLA 3S4UA 1B51A 4F1YA 5FHNA 1SD3A 2IA4A 3SEYA 3H4ZA 5ICTA 2R6GE 4M1VA 3TCHA 1LBBA 2I3WA 1Y3NA 4R2FA 2Z8DA 3IAZA 4Z7EA 4I62A 4X9TA 1L5TA 1MPCA 1Y4CA 1H44A 1Y1ZA 4AB5A 2XD3A 1QUIA 5F1QA 1OIBA 2DXYA 1ZTYA 2UVJA 4P11A 3LR1A 1B5JA 3MW0A 4QFNA 1EH3A 5DVIA 4RPNA 2I6EA 3PUZE 4OFOA 3D4CA 1NNKA 4U4XA 5CMMA 3H6VA 3EPEA 2I4BA 4O3CA 3FV1A 3TPAA 4GWOA 3C32A 3THIA 4NF5A 1LBCA 1TT1A 4O3AA 3QXMA 1Y3PA 3CFLA 4OERA 1MQDA 1GTKA 1FTMA 3PUXE 4PFWA 2M8CA 3TZAA 5I59B 3MP8A 4OQOA 2PX1A 3VXBA 3S9LC 3LUYA 1HSJA 5TP9B 3E4RA 3IOVA 4OESA 1P1UA 3PV0E 3KOSA 3M3LA 3CI8A 3K01A 2PMSA 5TPAB 5KDTB 3FJ7A 1USYE 2I3VA 2W7YA 1BLFA 1USYH 3DP4A 2YLNA 4Z0IA 1YTVA 4DXCA 1SI1A 4EQBA 1SW4A 3C4MA 3IO6A 4OHNA 2RINA 2DXRA 4KPTA 3MPKA 1N3XA 4MF3A 5DYHA 2NOOA 2I0BA 3G3HA 4EUOA 4LZ5A 4EXLA 3ILUB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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