1LAXA

Crystal structure of male31, a defective folding mutant of maltose-binding protein
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTDPKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRIT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a defective folding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN MUTANT MALE31
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 126
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA01
4QFPA 4ZEBA 1SQYA 4DCYA 4NF4B 1NNFA 1HSJA 5DT6A 4GIZA 3IJXB 3G3IA 3QK6A 2AL4A 4FATA 1MS7A 2QS3A 1L5TA 4LUBA 4IY6A 1FQFA 3MVXA 5AA3A 1ATGA 3OMBA 3VE1B 2H4IA 1S50A 4R6YA 2Q9TA 2AYSA 2F6PA 3K00A 2XX8A 3KBRA 1MXWA 4MBPA 3FXRA 3UP9A 3U72A 1FTOA 5EYFA 4ZDMA 1MY1A 2A5TA 3PPNA 1P1UA 3RT8A 3V89B 1GVCA 4JWXA 3KN3A 4LP2B 1FQDA 4F1VA 5H8NB 4OTEA 1IXGA 3A09A 3LSFB 3MAMA 3N94A 4ESWA 4UA8A 2XX7A 4AQ4A 1USYE 4ZS9A 3QIMA 1XOCA 2I3WA 4POXA 1B32A 2W7YA 1MXVA 4WEPA 2NOOA 1FQBA 3RGYA 3MP1A 4IO3A 1DOTA 3IJOB 2RC9A 3QYTA 1JETA 5AA4A 2QS4A 3FVNA 3K01A 3DP6A 3Q26A 4Z7EA 3H3GA 3E9XA 2V3QA 1I6BA 3VVFA 3H6WA 1N7WA 4JWOA 1VFEA 4FECA 4QSCA 4G8HA 1XT8A 4U1OA 1SDXA 3KZGA 2F5XA 4R75A 5B7DA 4FAJA 5TPAB 2VGQA 2F36A 1S7YA 3KEIA 5L9OA 4E0WA 4R9GA 2F6GA 2ALUA 2V3TA 4JDFA 4XKPA 4FORA 1VSOA 4RK2A 2PBWA 1GTKA 3RT6B 1QUIA 3GZGA 5B70A 3EHUA 3LR1A 2ZYMA 4F19A 1OMPA 1A54A 5EHMA 2P2AA 4OYVA 3PUWE 1NNPA 3T9HB 3IR1A 3GLBA 3IOUA 1Z7ME 4IGRA 1XS5A 4PQJA 4TQUQ 2O6AA 3VDFA 4LATA 4JB7A 2Q89A 1ZU0A 5H8QB 2PT2A 1ZTYA 1FCKA 4GQOA 3B6WA 1S9TA 1HSLA 1LFHA 1B5HA 5JTYB 1YPNA 3KJTA 1H43A 2B3BA 3IOWA 3CG1A 3OD7A 1M5BA 3D4CA 1JVYA 3ODBA 2RF1A 4NF6B 3HO7A 5L8DA 2ESNA 1XC1A 2OWSA 3TDJA 1POTA 3IB1A 5FHOA 2RKMA 1B46A 4POWA 5H8QA 3S2VA 4G8MA 5DVFA 4MLQA 4OFLA 1I6AA 3GBAA 3N6UA 1Q35A 3FVKA 4H5FA 5CC2A 3PUXE 4QFOA 1MPBA 1B3FA 4XIGQ 3SDFA 3EHTA 3O28A 3IOVA 1FTMA 3LSWA 1D9VA 3K6WA 3FXUA 4OZ9A 1D4NA 1DMBA 3C31A 3SETA 5TU0A 4XTCQ 2NWJA 5ICQA 4TOZA 3TTRA 5FTHA 5CMBA 5AA1A 3G3JA 1B6HA 4RXLA 1USYH 2Z8FA 1B0HA 1H44A 4U1ZA 1SW5A 4KFQA 2YJPA 4AB6A 5I2NA 1PB7A 3G3HA 2O7IA 4XKRA 4H8JA 2Y7WA 4WEDA 3EQ1A 2HQ0A 3MUQA 4FEDA 3K6UA 4OFJA 3C34A 4U4SA 1IIWA 4IO4A 3HV1A 1URGA 4X1BA 1H76A 3PUYE 1A8EA 2QMWA 2DOJA 3MVYA 4I8CA 2ZNTA 2XXTA 1AMFA 4WKMA 1DTGA 4PP0A 4ECFA 4R74A 1NH8A 1B5IA 2ZYKA 2UYEA 1POY1 2ANJA 5KDTA 4U21A 3SERA 5FHNA 3TPAA 1A99A 2M8CA 4FEBA 1J1NA 3LSLA 4RK9A 1UIVA 3T9VA 3OO9A 4C1UA 4R72A 2Z8EA 3PPRA 4NWDA 3ZSFA 5HPQA 4GLIA 4X1DA 1M5FA 1RKMA 1LAGE 4F31B 3EHSA 2QS1A 4N6PA 3P7IA 2PT1A 4M1VA 1SBPA 1FW0A 3RLFE 2GH9A 3U93A 5ITPA 1OVTA 5H8HA 5TP9A 3T66A 1MQDA 2DE4A 3LUYA 4F3PA 3IORA 4NMYA 3O2AA 4KYEA 1A55A 4I1DA 1AH5A 4GL8A 3O66A 3UGWA 4OEUA 4OHNA 1ELJA 3FV1A 2DP8A 4NF8A 3V8XB 4GXSB 4JSOA 4PETA 5EHSA 2XXXA 4EF2A 4P11A 2QSXA 1ZJLA 3G7WA 2F8DA 3O6IA 3I5OA 3M3FA 3VXCA 5JK4A 1RYXA 3OEKA 1I69A 4O3CA 2KLFA 3PPQA 3S9NC 1NMUA 1IUDA 2O84X 3JZJA 4OWDA 1NNKA 2IEEA 4RA1A 1QKBA 1B40A 1XHYA 4F2QA 4OQOA 1MQGA 2ZYNA 3L6HA 2V25A 5AA2B 4LZ7A 5J1DA 3TKDA 4R6HA 4M4GA 3FJGA 1SI0A 4X9TA 2P1SA 1F9BA 1ZLQA 3SEXA 1B51A 5I2KA 2F7BA 3RTFB 4G2ZA 1LAHE 1UTHB 4HCYA 4IB2A 1SD3A 3VLVA 4ZEFA 2VD2A 3G3FA 3TTLA 1Z7NE 1WDNA 3VV5A 4XXUA 5IKBA 1FQAA 1ZIUA 2I58A 3IL1B 4ZE9A 1Y1ZA 1P99A 2ZNUA 1PB8A 3UA8A 5HM4B 2RC7A 4YB5A 3H7MA 1VR5A 2E0SA 4LQ2A 4YB7A 1N0TA 3T93B 1SYIA 5DTBA 4MFIA 2D21A 1YAEA 1Y3QA 1JW1A 3IO4A 1Y3NA 4RY1A 4YKKA 1JW4A 3CRBA 2X7QA 1ZBMA 4I9DA 1Y4TA 2I4BA 4UACA 1Y4CA 2ZYOA 3MP8A 4U23A 3E3KA 2AL5A 2GRVA 1QUJA 2Q8JA 2IA4A 3IOTA 1VE4A 3PMWA 2HXWA 4NF5B 5I58B 1MDQA 3GBBA 3PUZE 4JXIA 3A3CA 2G29A 3R6UA 1R6ZA 4YKIA 4ZEDA 3TCFA 3H03A 2V93A 3MZBA 4NF4A 2BJJX 3H6UA 2XXUA 4G77A 3MPLA 3MBPA 4Q5TA 3TZAA 1FQEA 2FA7A 3KOTA 3PD8A 1B4HA 4IO5A 1PC3A 1ZKBA 4ELPA 2HEUA 1M5EA 4QSDA 1BTJA 2GHBA 3OOAA 3LBSA 3S4UA 1B1HA 3QAXA 4LONB 3BFTA 2G93A 2VOZA 3FZVA 3UIFA 1MG1A 4ZEKA 3K1NA 1CB6A 5I59B 4N07A 1TFDA 4F1YA 4ZZEA 1N7XA 4R2FA 2HCAA 3CSBA 2I0BA 5H8NA 1FTLA 1P1OA 4DXBA 2R71A 1IXHA 3FXQA 3RNNA 1Y9UA 4G4PA 1MQJA 4YZZA 4H5GA 3CG3A 1MXUA 3T9UA 5I59A 1JW5A 1MY0A 3G3KA 2HAVA 2DS9A 3VLWA 1EZ9A 1MY3A 5DYHA 1TT1A 1AOVA 2UXAA 4EXKA 2REJA 2HZLA 2Y84A 1OLCA 1UTBB 3E4RA 3B7DA 2THIA 3TTKA 2H9BA 4QFKA 4KPTA 1ANFA 4C1TA 4IO7A 4OFOA 5TPAA 3MJNA 4H8IA 4OMBA 3UN6A 1GGGA 4BDMA 1B0LA 3K1MA 2XXHA 2F7CA 5K2YA 5CMMA 3PD9A 4ELQA 3QUFA 1R9LA 1I6QA 3L6GA 4FE8A 3U8QA 1A40A 2ONSA 3TYHA 2GHAA 2H99A 3RQTA 3A3UA 1DPEA 3ZKKA 3D4GA 4OENA 5AA2D 3CFXA 1LFGA 1P1NA 2Z22A 3W9VA 4BDQA 4U2RA 1NH7A 4GL0A 2FNCA 4O3AA 2Y7IA 5BWJA 1R1NA 4RYAA 4DE8A 3SEYA 4JWYA 4OXVA 4KD5A 1LB9A 2I6EA 2O51A 1MXZA 3H6VA 4F3SA 1JQFA 3Q27A 5F1QA 5I56B 2A5SA 2UYFA 2P0SA 4G68B 4GRKA 4ZECA 1EU8A 3MVWA 1PBPA 4QSEA 5JTYA 3N6TA 2ZNSA 1SYHA 2QJEA 3ECRA 1GR2A 2RINA 3OSQA 4HS7A 2UVJA 3DP4A 1R9QA 4NF6A 2OWTA 4BDNA 3VXBA 3TCHA 1SVXB 3K4UA 5KZTA 2VHAA 3C35A 3JV9A 5FTIA 3SEUA 5HBCA 2O68A 2F34A 3RY3A 2X26A 1DSNA 3MQ9A 3VLUA 5I84A 1QW0A 4O3BA 4GD5A 4XKQA 3SKPA 2QRYA 2LAOA 3MC2A 1LBCA 3K6VA 4NE4A 1EZOA 3CIJA 3TMGA 1N76A 1MQHA 2XX9A 3H6TA 3Q29A 3S9LC 2HFBA 1H45A 4KYSA 5KCJB 3E13X 4BDOA 4R2BA 4OEVA 1CE2A 1PDAA 5DVIA 4NEDA 3W9WA 4NWCA 3KOSA 1QKAA 5A5XB 1UQWA 4F29A 3IK6B 4ISUA 4QF9A 3Q28A 1TXFA 3DELB 1LCTA 3I3VA 1SW4A 2PVUA 4MH5A 2D5WA 4IO6A 4ONYA 5DVJA 4KR5A 1URDA 5ITOA 5ELVA 4QRZA 3ILUB 3ONMA 5L9MA 3USDA 4OESA 2XXPA 3PPPA 5FHMA 4MF3A 2QS2A 1IEJA 3DLNA 5DEXB 1A7LA 1OVBA 4N13A 1B2HA 4KI0E 4YMBA 5I57B 4IY5A 4ELOA 2YPNA 5AE4A 3FGSA 2RCBA 4RPOA 3MZ9A 1FTKA 4RNSA 3PMVA 1FQCA 4NTLA 2RCAA 3K02A 3LC8A 1B7ZA 2DWAA 1LLSA 2VP1A 3U92A 4LQ5A 3DP8A 4MLVA 1ZMGA 5LOMA 3FIRA 5DEXA 3H4ZA 4F3BA 2YLNA 3Q25A 2F35A 3RTWB 4E0XA 1MY4A 2Z23A 1NNTA 4P0GA 3GXAA 1URSA 1DPPA 4LZ8A 3T22A 3HN0A 3C32A 3U1OA 3QXMA 3EN3A 2DWHA 4F22A 2O7UA 2RC8A 3OSRA 1PBQA 2QL3A 2QMXA 3K2DA 1B7HA 2I49A 3ILTB 2Y7RA 3V83A 3MZ1A 3KN8A 2V84A 1IZ1A 3ZS6A 1LGBC 1PB9A 2DE3A 1MXYA 5AA2A 3FD3A 2PMSA 1B4ZA 2V3UA 4GFRA 2XXWA 4EQ9A 4JBZA 3OO8A 3EF7A 3OO7A 1UTHA 1B05A 3C4MA 3M3KA 4BDLA 4Q0CA 2REGA 2I0CA 3T96B 4F39A 3IO6A 4OETA 1II5A 4GWOA 4PFTA 1D9YA 1QJMA 4KCCA 2F97A 2UVHA 3HSTA 4FJPA 5L9SA 3TAJA 3VVEA 3PPOA 3RN8A 3C36A 5IAIA 1N3XA 2A5TB 4R6KA 1BLFA 2DE2A 3WAFA 1OQHA 4KHZE 4GF8A 4EDPA 3OELA 3PUVE 1IQ7A 1LAFE 4ELRA 3CFLA 1N04A 2Q2CA 3DM0A 1P1WA 3KJ7A 1LSTA 2ZXTA 2XD2A 1DTZA 2B65A 3OO6A 4KQPA 4EF1A 4EQ7A 4YAHX 3MP6A 4ND9A 3KSXA 2Y7PA 4NF5A 2DWJA 5I58A 5AA4B 4X48A 1EZPA 1B1XA 4GOTA 5ICTA 1EH3A 2ZMBA 4DIGA 1MPDA 1BP5A 3TTMA 1UIUA 1JEVA 4L17A 2Y7KA 3K0VA 2O69A 2XXQA 2X7PA 3C9HA 1P1QA 4XKNA 2PX1A 4DLDA 1MPCA 4R9FA 1MDP1 5CM6A 3IB2A 5CI5A 5CBSA 1IITA 4GXAA 2Z8DA 4QFLA 3FATA 4FIMA 2Q88A 2NXOA 4DXUA 3F11A 1OLAA 2PYYA 4EQBA 2DWIA 3KSJA 1VFDA 3BBRA 4I62A 1Y3PA 4F3GA 5CMKA 3FV2A 3KFMA 4ZZAA 2I48A 3HPIA 4PE5B 2DYXA 3BKIB 2I3VA 3S9MC 1AIVA 4JSDA 1MXXA 2F7AA 3TEPA 2DSFA 3FASA 4YICA 4WXJA 1US5A 4KCDA 2XXRA 1UTBA 2B3FA 1YTVA 3N26A 2VD3A 3WAEA 4Q8RA 1MM6A 1D3KA 3IX1A 4F1UA 2ABHA 3CFZA 1B58A 1JEUA 3PV0E 5H8SA 2O1MA 4KYDA 4H67A 4RPNA 3H06B 2DVCA 4QFNA 5JEIA 3FVGA 1FTJA 3JYRA 1M5CA 2F78A 1MQIA 4C0RA 3CSGA 4G8NA 2H25A 3RPWA 3IB0A 4OVJA 3FJMA 3UORA 3MPKA 4HW8A 1Q1KA 3T9XB 1LCFA 2NUVA 1O63A 4PFWA 1MY2A 1M5DA 1TFAA 3MW0A 5H8FB 3U94A 3TELA 1MRPA 3LSXA 5ISUA 1HSEA 2I4CA 2H5YA 2H98A 1BKAA 4TLMB 3R26A 3VFJA 3OENA 4EXLA 5BUUA 4PFUA 3AXFA 4ESXA 4ZE8A 5I56A 2OJTA 1NL5A 3V5AA 5I2NB 4G68A 2XXVA 3N5LA 4G68C 4YMAA 2QPQA 2FYIA 3O97A 3PMXA 5H8FA 4EUOA 1LAXA 1Y1MA 3KGCA 2UVIA 4PFYA 4R73A 1WVJA 4K3FA 1B3EA 1US4A 3UK4A 4DXCA 4AB5A 3FJ7A 3O6GA 5KDTB 1T0KA 3TCGA 3TUSA 3CVGA 1O7TA 2Q2AA 3TQWA 5CBRA 1IXIA 3CI8A 3G3GA 4TLLB 3VVDA 4H0WA 1IXCA 3THIA 3S9EA 2R9JA 4DZ1A 5KCJA 2AIXA 4RJZA 1RYOA 1OQGA 4LVQA 3TTNA 1LBBA 3IAZA 2DQVA 4H65A 2O1LA 1B9JA 5H8HB 5TP9B 3O9PA 2HZKA 3OXNA 2ONRA 5A5XA 5CRYA 2OZZA 3B6TA 3CR9A 4OERA 2WKYA 1N3WA 1XVYA 3M3LA 3KN7A 1B3HA 3KG2A 1OIBA 3K6XA 4NF8B 3QSLA 2OCUA 1WODA 1QUKA 1MH4A 3I6VA 1PEBA 1N84A 4IGTA 2D3IA 3BFUA 3TFLA 1B3LA 2XHDA 1B5JA 1NKXA 3OEMA 1B7UA 3HHFA 2XXIA 3C33A 4Q30B 1JVXA 3O29A 4HTGA 4F2OA 1B3GA 5I57A 4DDDA 3QUJA 1NFTA 2OK2A 3HCQA 4YKPA 5K2XA 4P0IA 3TQLA 1GV8A 4DCXA 2DVZA 1QULA 2XXYA 4YKJA 4Z0IA 5I2KB 3MVZA 3FVOA 4GVOA 4YU0A 4F18A 3R7XA 1LFIA 4BDRA 3SEWA 4U22A 1SI1A 1Y20A 1MH3A 3SESA 1YCJA 1MM7A 3ZKLA 1AL3A 2HAUA 4H1XA 5M2VA 2ONKE 2CMOA 2E1SA 3MWBA 2CZLA 4ZEIA 3M8UA 3W15C 4LA9A 4LZ5A 4IO2A 1KWHA 3FUZA 3TODA 1O64A 1TWYA 4QHQA 2OLBA 4HCWA 3EPEA 3RUMA 1LB8A 3HHGA 1JNFA 2DXYA 4U4XA 5F7VA 3B6QA 3O6HA 3K1PA 3SEVA 2NVUB 1SW2A 2DXRA 1A8FA 2R6GE 5CMCA 1QVSA 1SW1A 4BLAA 2OBGA 1XVXA 1H3DA 4H6DA 1BIYA 3PU5A 3PGFA 2GFEA 2UVGA 2XD3A 4YB6A 4THIA 1B52A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QFPA 4ZEBA 1AWBA 1SQYA 1FBGA 4DCYA 4NF4B 1NNFA 1HSJA 5DT6A 4NN3A 4GIZA 3IJXB 1Q9DA 3G3IA 3QK6A 2AL4A 4FATA 1MS7A 2QS3A 1L5TA 4LUBA 4IY6A 1FQFA 3MVXA 5AA3A 1ATGA 3OMBA 3VE1B 2H4IA 1S50A 3EKIA 4R6YA 2Q9TA 2AYSA 2V4CA 2F6PA 3K00A 2XX8A 3KBRA 1MXWA 4MBPA 2Y5KA 3FXRA 4P1LA 3UP9A 3U72A 1FTOA 5EYFA 4ZDMA 1MY1A 2A5TA 3PPNA 1P1UA 3RT8A 3V89B 1GVCA 4JWXA 3KN3A 4GWXA 4LP2B 1FQDA 4F1VA 5H8NB 4OTEA 1IXGA 3A09A 3LSFB 3MAMA 3N94A 4ESWA 4UA8A 2QFLA 2XX7A 4AQ4A 1USYE 4JVIA 4ZS9A 3QIMA 1XOCA 2I3WA 4POXA 1B32A 2W7YA 1MXVA 4WEPA 2NOOA 1FQBA 4NG7A 3RGYA 3MP1A 4IO3A 1DOTA 3IJOB 4MNIA 2RC9A 3QYTA 1JETA 4PAKA 3T1BA 5AA4A 4P47A 2QS4A 3FVNA 3K01A 3DP6A 3Q26A 1SPIA 4Z7EA 3H3GA 4X04A 3E9XA 3ROJA 2V3QA 1I6BA 3VVFA 3H6WA 1N7WA 4JWOA 2HXRA 1VFEA 4FECA 4QSCA 4G8HA 1XT8A 4U1OA 1SDXA 3KZGA 2F5XA 4N81A 4R75A 5B7DA 1FPJA 4FAJA 5TPAB 2VGQA 1FPIA 2F36A 1S7YA 3KEIA 2XWIA 5L9OA 4NHBA 4E0WA 4R9GA 2F6GA 2ALUA 2V3TA 4JDFA 4XKPA 4FORA 1VSOA 1IMEA 1KA1A 4RK2A 2PBWA 1GTKA 3RT6B 1QUIA 3GZGA 5B70A 4O8MA 3EHUA 3LR1A 1FRPA 2ZYMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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