1LFHA

Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change
Total Genus 219
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
219
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEEGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular replacement solution of the structure of apolactoferrin, a protein displaying large-scale conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 219
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lfhA03
4ONYA 3HN0A 4JXIA 1N7WA 4YKKA 3VV5A 4JWYA 1R9QA 1Y3QA 2O84X 1M5EA 3FXQA 3K1NA 4U21A 5J1DA 2XXVA 3PUZE 1H44A 3QAXA 2XXWA 3RY3A 5F1QA 4DXUA 1EZ9A 3IOVA 4HW8A 4H5FA 3EF7A 3A3CA 4JDFA 4FJPA 4BDRA 3TQLA 2KLFA 2F36A 2Z23A 4IO6A 4EQ9A 2IEEA 2R9JA 1Q35A 2Y7KA 5EHSA 3I5OA 2RC9A 1NNKA 2ZNSA 5H8FA 2QS2A 3IB0A 4ELQA 4LP2B 1USYE 4DXBA 2Y7RA 4Q5TA 2IA4A 2G93A 4JSDA 1MQGA 1SW2A 1Y1MA 1MH3A 3O2AA 5ICTA 1H3DA 4G68A 4PFTA 3KN3A 3MAMA 5FHMA 4WEDA 3IOWA 1NKXA 4OXVA 1QKBA 2NXOA 3ILUB 2NOOA 5AA1A 1OIBA 1ZBMA 4NMYA 2F7AA 1GR2A 1WODA 3G3JA 2ONSA 2OZZA 4NTLA 2QS4A 4FEBA 3O97A 2UVJA 4OQOA 1ZU0A 1POTA 3RUMA 3MC2A 2VGQA 3TCHA 3K6VA 1MXXA 3K1MA 1SVXB 3GXAA 4KYEA 3DP6A 4YB5A 2R71A 4FIMA 2ZNTA 3FIRA 5H8FB 3OELA 2Q89A 4OENA 3PMVA 1ZMGA 3BFTA 5CMKA 4UACA 4LZ7A 1IZ1A 4PP0A 2F35A 1ANFA 1RYOA 4EF2A 2P2AA 3TKDA 4LZ8A 3CIJA 4F31B 2X26A 4IY6A 4EF1A 4H5GA 3CSGA 3DELB 1YTVA 5AA2D 3A3UA 4IB2A 3FVOA 5DTBA 4P0GA 4OWDA 3Q25A 4GIZA 2YJPA 1VE4A 4OEVA 2B65A 2HAVA 3PUWE 4DE8A 4Q0CA 3CG3A 4MBPA 1XVYA 1JVYA 4PE5B 5H8SA 4JBZA 4WKMA 3FJ7A 2QSXA 4M1VA 1Z7ME 2GFEA 3S9LC 3KGCA 2F7CA 2XXYA 1NNTA 3TQWA 1IEJA 2DXRA 3BKIB 4NF6A 1IQ7A 1II5A 2XXHA 3H7MA 1LFIA 4GL0A 5DVIA 4ELPA 3VVFA 1MQDA 1B05A 5CMMA 3BFUA 2UXAA 5ELVA 4IGRA 2I3WA 4LONB 1US5A 3OEMA 3OMBA 3PPPA 1MDQA 1QVSA 3EN3A 4ND9A 4I1DA 1IXIA 4DIGA 4KYDA 4MLVA 2AL4A 2H9BA 4Q30B 4ESWA 2GH9A 4R2FA 4QFPA 4H65A 1GV8A 1MXZA 3S9EA 1A7LA 4K3FA 2BJJX 2PBWA 4WEPA 2I4CA 3O9PA 4ZDMA 5TP9A 2Z8EA 5I58A 1TWYA 1P1NA 2ABHA 3OO8A 1JETA 2VOZA 3UA8A 1Y4CA 1FW0A 3H6UA 3HV1A 3TTKA 1B3EA 2O68A 2AL5A 2ESNA 3WAFA 2O7UA 3PUXE 1SBPA 1FQFA 1USYH 3TTMA 3EHSA 4KFQA 3B6WA 4PFWA 1YCJA 4R6KA 1SI0A 4KHZE 3FV2A 2A5TA 2Q2CA 1I6BA 1ATGA 5FHNA 4ZEFA 1EU8A 1P1QA 3M3KA 1O7TA 3TTLA 1QW0A 5I59A 3FGSA 3PMXA 5JK4A 3C33A 4LUBA 4GOTA 5TP9B 5I58B 2I3VA 1P1WA 2H98A 1UTHB 4KI0E 3HHFA 3S2VA 1N3XA 1Z7NE 4RK9A 1VSOA 3CRBA 2AIXA 1WVJA 2DYXA 2PMSA 4GLIA 3QUJA 3DLNA 4TLMB 1N84A 1NMUA 3SKPA 2A5TB 1R1NA 1IXCA 3GBAA 3IR1A 1B0LA 1B7ZA 2I48A 1SW5A 4EDPA 3B6TA 1BLFA 4WXJA 3A09A 2XD3A 1PB7A 3KG2A 5I59B 5CC2A 4JSOA 3T93B 5H8NA 2HZKA 1ZTYA 4TOZA 4MH5A 4RK2A 2DE4A 5AA2A 2B3FA 3C4MA 5M2VA 3JYRA 4OETA 1D9VA 3FATA 4HCYA 3KSJA 2H99A 2F6GA 5CMCA 2CMOA 3VXBA 3MJNA 4F3GA 2ZNUA 4U4XA 3SETA 3OXNA 3ZS6A 1A8FA 4O3BA 1LSTA 3OD7A 1OLAA 3K0VA 2XXUA 1TFAA 1H43A 3W15C 3O66A 1GGGA 2UVGA 4FEDA 3TODA 3DP8A 4U2RA 1MXWA 3M3FA 2QMWA 3KN7A 4RPOA 3RQTA 3C35A 2THIA 3KJTA 3ECRA 3QIMA 2I58A 3MVZA 2RF1A 3TYHA 5CMBA 2XX7A 3RLFE 3OENA 3KJ7A 4DZ1A 1LAXA 4HS7A 4HTGA 3HPIA 4G77A 4IGTA 2PX1A 5AA2B 2DWJA 1JW1A 2DWIA 1B51A 3FUZA 1MS7A 3OOAA 1MQIA 1WDNA 2Y7IA 4QF9A 2R6GE 3IAZA 5AE4A 4NWCA 3ZKLA 2ZYKA 5I84A 3VLVA 2QJEA 2O1LA 2RINA 4YMAA 1DSNA 3U94A 1LGBC 2Z22A 1A55A 2QRYA 3RPWA 1FQAA 3IB2A 1S9TA 1JW4A 5BWJA 4GQOA 2P0SA 5KDTA 1B3FA 4RJZA 1US4A 3IO4A 1XVXA 1Y3NA 5BUUA 3MVWA 1LAFE 4FORA 2YPNA 4NF8B 4RPNA 2DE3A 4R6YA 1CB6A 4F1YA 1J1NA 2NVUB 1FQEA 3KEIA 5DYHA 5I2NB 4C0RA 4DCXA 3TELA 3THIA 4MF3A 4R2BA 4F3PA 2D21A 1POY1 3G3KA 2ONRA 3CSBA 5AA4B 3RT6B 5AA3A 1SYIA 2Q88A 1MDP1 4H6DA 3MP8A 1MPBA 2YLNA 4KPTA 3K6XA 2FA7A 5L9MA 3MWBA 2DVZA 3FVNA 2HCAA 4YKPA 4F18A 2GRVA 2G29A 5ISUA 4H67A 3ILTB 4P11A 3OO9A 4F39A 5CBRA 5KDTB 3H06B 4IO2A 1VR5A 4QFLA 2V25A 2FNCA 3SERA 1HSEA 4THIA 1QKAA 2P1SA 1MPDA 4F29A 3MPLA 1QUJA 3HSTA 1B9JA 1B58A 2WKYA 4RXLA 4N6PA 1PB9A 2RCAA 3KZGA 4NF4B 3C36A 3D4GA 4R6HA 2Z8DA 5K2YA 2PYYA 3CI8A 4DXCA 1JVXA 4IO4A 2NWJA 2RKMA 1LBBA 4IO5A 4LVQA 2DOJA 2PVUA 3QK6A 3PMWA 1DOTA 4M4GA 1R9LA 2W7YA 4GFRA 1AMFA 1LBCA 1MXYA 1LFHA 3VVEA 4QSDA 2ZXTA 1TT1A 4QFNA 3I6VA 4ZEDA 2B3BA 3S9NC 4F3SA 4X9TA 5IAIA 2O1MA 3K00A 5HBCA 4BLAA 3H6WA 3G3IA 3MPKA 4G8HA 5ITOA 3OEKA 3CFXA 1FTLA 1UIVA 1NH8A 2X7QA 3IOUA 1UIUA 3U1OA 4XKQA 1T0KA 4GXSB 1A8EA 1N0TA 1SD3A 1PEBA 3G3GA 2F34A 1FQBA 3C32A 5KZTA 1LAGE 3N26A 1O64A 1YAEA 3EQ1A 2PT2A 3IJXB 4FATA 2Q9TA 1B3GA 5DVFA 3MVYA 1LB9A 4DDDA 3MP6A 4G8MA 3EHUA 2DVCA 4GXAA 4R74A 4EXLA 1MPCA 4N13A 4QFKA 2DWHA 4RNSA 3CVGA 1A99A 1MG1A 1UTHA 3CFZA 3VLUA 4QRZA 4GRKA 1OVTA 1Y1ZA 3TAJA 3H6VA 5HPQA 3CR9A 4YKJA 5EYFA 4BDNA 3Q29A 1B7UA 2O7IA 1MM7A 4EUOA 3CFLA 1BP5A 2NUVA 2HZLA 4C1UA 3FZVA 2H4IA 1DPPA 1DPEA 2DXYA 3TCGA 4LATA 1AIVA 4IY5A 3LBSA 4OFJA 3U93A 3K02A 4U23A 5TU0A 4YKIA 4ESXA 3LC8A 3H3GA 3R7XA 1FTMA 4AB5A 1VFDA 3GZGA 2V84A 3KN8A 3TMGA 2DE2A 1D9YA 3N6TA 3K01A 4EQ7A 3HHGA 3PGFA 4YZZA 3D4CA 2UYFA 1XT8A 1OMPA 4EQBA 4U1ZA 3RTWB 2ANJA 4LQ5A 1PB8A 5CRYA 2F97A 2F5XA 1FQCA 3QXMA 4FECA 3PU5A 1ELJA 1DTZA 4OERA 4LA9A 2Y7WA 4NWDA 4O3AA 3KBRA 2QS3A 3SEVA 2XXXA 4G4PA 4XTCQ 1DTGA 1B2HA 5FHOA 1I69A 4QHQA 1SW4A 3FD3A 4RA1A 2I49A 1B0HA 1EH3A 1QUIA 4R73A 3MZBA 1B5JA 3U8QA 4F2QA 3SEUA 3ODBA 2REJA 1MY4A 5H8QA 3T9VA 1B40A 3V89B 3TZAA 3FVKA 4F22A 1M5DA 3V5AA 5L9SA 3N94A 3GLBA 1LFGA 3E4RA 5KCJA 1SW1A 1B46A 1O63A 2VP1A 3HO7A 3N6UA 3UK4A 2HQ0A 2UYEA 2GHAA 3M8UA 2I6EA 1UQWA 3G3FA 2Q8JA 3JV9A 4YAHX 4PQJA 4I62A 4G8NA 1N7XA 2Q2AA 3PPRA 4OFOA 4OHNA 4KQPA 2RC8A 2HEUA 1B1XA 3R26A 1S7YA 4UA8A 1M5CA 3B6QA 3DP4A 1DMBA 4FE8A 1B32A 5JTYA 1M5FA 3FASA 4MFIA 2QS1A 1JEUA 4QSCA 1LB8A 4GF8A 2XXRA 5H8QB 3Q27A 2UVHA 4NF8A 4OZ9A 4PETA 3TFLA 4H0WA 1D4NA 1ZKBA 1FTKA 4G68C 5KCJB 3TEPA 4KCDA 4YMBA 5I2NA 2HXWA 2XX8A 1H45A 1F9BA 1P1OA 4ZS9A 4OTEA 3OSRA 1HSJA 4X1DA 5AA4A 1FCKA 1AOVA 2V3QA 4ZZAA 2XXQA 4ELRA 3V8XB 4ISUA 3OO6A 4POXA 3IB1A 4KD5A 4PFUA 5I56A 4Z7EA 3SESA 2DS9A 5DT6A 1IXHA 1B3HA 3KSXA 1LLSA 1NFTA 4R72A 5B7DA 2REGA 4U1OA 2VD3A 1B5HA 1NNFA 1URSA 1MM6A 5JTYB 4PFYA 5H8HA 3MVXA 2DQVA 3MQ9A 1OQGA 3VXCA 4X1BA 1MRPA 1OLCA 4NEDA 4JWXA 3UP9A 1SI1A 2HAUA 3MZ1A 4XKRA 3IORA 1B5IA 1M5BA 4ECFA 3E9XA 2XX9A 2V3UA 1OVBA 4H8JA 4OYVA 2QMXA 3O28A 5FTIA 2OK2A 2RCBA 5IKBA 4FAJA 5DVJA 2HFBA 4NF4A 1JEVA 5I56B 3LUYA 1XS5A 1CE2A 1FQDA 1Y9UA 4G2ZA 1IUDA 1EZOA 2X7PA 4H1XA 3O29A 3K4UA 4IO7A 4OMBA 4KYSA 4MLQA 4I8CA 2H25A 1R6ZA 3W9VA 3T22A 4XXUA 4F1VA 3T9XB 5H8HB 1TXFA 4R9FA 1URDA 2XHDA 3SEYA 2OCUA 1URGA 4DCYA 1OQHA 3GBBA 3L6GA 3K6UA 1N04A 4U22A 1AH5A 1LCTA 2OBGA 2E0SA 1MY1A 3IK6B 3UIFA 3C34A 3EPEA 3IOTA 1S50A 3IO6A 4XKNA 1XHYA 2Y7PA 1PC3A 1BTJA 3MP1A 2V93A 1RYXA 3S9MC 5L9OA 1FTJA 3RN8A 3LSFB 1PBQA 3LSWA 3TPAA 4G68B 5CI5A 1QUKA 4RYAA 3ONMA 1I6AA 2I4BA 3K6WA 2RC7A 5I2KA 2ALUA 2XD2A 1JNFA 2ZYMA 1YPNA 4YB6A 1B4ZA 2QL3A 1TFDA 5EHMA 2O69A 2CZLA 1JQFA 1QULA 1B3LA 4HCWA 4P0IA 2F7BA 1NL5A 1IXGA 1B1HA 5CM6A 1Y20A 1MY3A 3SDFA 1L5TA 2DSFA 1JW5A 4F19A 4EXKA 4NF5A 3ZKKA 4YB7A 4Q8RA 2O51A 1SDXA 3F11A 3MZ9A 3SEXA 3MBPA 4JWOA 3E3KA 1I6QA 3C31A 4GWOA 1GVCA 1ZJLA 2FYIA 2QPQA 3FXUA 4BDOA 3PV0E 4GVOA 3TTRA 3O6GA 4AB6A 5A5XA 3C9HA 1SYHA 2LAOA 3DM0A 4ZEKA 3O6IA 5I2KB 4ZECA 3P7IA 2DP8A 2XXPA 1BKAA 5TPAA 1PBPA 2M8CA 1UTBA 3T96B 1B4HA 3T9UA 3KOSA 4YICA 3RGYA 3E13X 3MW0A 4ZE8A 3UN6A 3PD8A 3T9HB 3EHTA 4QFOA 1P1UA 3RTFB 2OLBA 2VHAA 3G3HA 5K2XA 5DEXA 5HM4B 3T66A 3L6HA 1MY0A 3K1PA 3OSQA 1Y4TA 3PPOA 3B7DA 4NF5B 3CG1A 4L17A 4E0WA 4ZE9A 4QSEA 1MQJA 5B70A 4E0XA 2I0CA 4IO3A 1XC1A 1MH4A 4TLLB 3UGWA 1B7HA 2ONKE 3Q28A 4OEUA 4NF6B 1LAHE 1KWHA 1A54A 4X48A 5I57A 3K2DA 3LSLA 5A5XB 2ZYOA 3VVDA 2ZMBA 2H5YA 3W9WA 5TPAB 2F6PA 1UTBB 1IIWA 1H76A 1NNPA 3WAEA 3KFMA 4JB7A 2OJTA 4ZEIA 3QSLA 3M3LA 4BDMA 1B52A 1VFEA 1D3KA 4OESA 4I9DA 4LQ2A 1MY2A 1P99A 5JEIA 4GD5A 4F1UA 1EZPA 5DEXB 1AL3A 3HCQA 2Y84A 1ZIUA 1HSLA 4F3BA 4R9GA 1Q1KA 3LSXA 3UORA 1FTOA 2A5SA 2ZYNA 3BBRA 3N5LA 3TDJA 5ICQA 3IX1A 3VLWA 2AYSA 1XOCA 3PPQA 5I57B 3FV1A 4F2OA 3QUFA 3H03A 4ZZEA 3I3VA 5FTHA 3TCFA 3FVGA 2D3IA 2OWTA 3IL1B 4KCCA 2OWSA 3TTNA 2PT1A 1ZLQA 3Q26A 3QYTA 2Z8FA 4LZ5A 2I0BA 1SQYA 3H6TA 4RY1A 4XIGQ 3V83A 4DLDA 2DWAA 1N3WA 1IITA 3PPNA 2GHBA 4XKPA 2E1SA 4OFLA 1QJMA 5L8DA 3U92A 4GL8A 4C1TA 4O3CA 3VDFA 4BDLA 3LR1A 2F78A 1NH7A 2XXIA 3RT8A 4YU0A 3SEWA 1N76A 3R6UA 3FJGA 3RNNA 2VD2A 3VE1B 3AXFA 4ELOA 1PDAA 4N07A 4OVJA 1B6HA 3JZJA 2UVIA 3KOTA 4TQUQ 3O6HA 3FXRA 3OO7A 1RKMA 3VFJA 1MXUA 4NE4A 1Y3PA 3H4ZA 2D5WA 4R75A 4POWA 1A40A 2V3TA 3TUSA 4H8IA 5LOMA 3PD9A 5CBSA 3G7WA 1MXVA 4ZEBA 1BIYA 3MUQA 3IJOB 4U4SA 3U72A 5ITPA 3PUVE 2O6AA 3FJMA 4BDQA 4KR5A 2XXTA 4Z0IA 1GTKA 4AQ4A 5H8NB 1LCFA 3ZSFA 3USDA 5F7VA 1MQHA 3S4UA 2F8DA 3PUYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IMCA 4ONYA 1FJ6A 3HN0A 4JXIA 1N7WA 4YKKA 3VV5A 4JWYA 1R9QA 1Y3QA 2O84X 1M5EA 3FXQA 3K1NA 4U21A 5J1DA 4MMPA 2XXVA 3PUZE 1H44A 3QAXA 2XXWA 3RY3A 5F1QA 4DXUA 1EZ9A 3CHGA 3IOVA 2Y5KA 4OVPA 4HW8A 4H5FA 3EF7A 3A3CA 4JDFA 4FJPA 1YYZA 4BDRA 3KC1A 2DDKA 3TQLA 2B4LA 4P3LA 2KLFA 2F36A 2Z23A 4IO6A 1FTAA 4EQ9A 4GWWA 1FPGA 2IEEA 2R9JA 1Q35A 2Y7KA 5EHSA 3I5OA 4OVRA 2RC9A 1NNKA 2ZNSA 5H8FA 2QS2A 3IB0A 4ELQA 4LP2B 1USYE 2FIEA 4DXBA 2Y7RA 4Q5TA 2IA4A 2G93A 4JSDA 1MQGA 1SW2A 1Y1MA 1MH3A 3O2AA 5ICTA 1H3DA 4G68A 4PFTA 3KN3A 3MAMA 5FHMA 4WEDA 3IOWA 1NKXA 4OXVA 1QKBA 2GQ1A 2NXOA 3ILUB 4N91A 4FBPA 2NOOA 5AA1A 1FBDA 4MNIA 1OIBA 1ZBMA 4NMYA 2F7AA 1GR2A 1WODA 4PTKA 3G3JA 2ONSA 2OZZA 2FIXA 4P56A 4NTLA 2QS4A 4FEBA 3O97A 2UVJA 4OQOA 1ZU0A 1POTA 3RUMA 3MC2A 2VGQA 3TCHA 1FPJA 3K6VA 1MXXA 3K1MA 4H45A 1SVXB 3GXAA 4KYEA 3DP6A 2WBBA 4YB5A 2R71A 5I3SA 4FIMA 2ZNTA 3FIRA 5H8FB 3OELA 2Q89A 4OENA 3PMVA 1D9QA 4PF8A 1ZMGA 3BFTA 5CMKA 4UACA 4LZ7A 1IZ1A 4PP0A 2F35A 1ANFA 1RYOA 4EF2A 2P2AA 3TKDA 2ZZVA 4LZ8A 3CIJA 4QBAA 4F31B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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