1LLSA

Crystal structure of unliganded maltose binding protein with xenon
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title DETECTION AND CHARACTERIZATION OF XENON-BINDING SITES IN PROTEINS BY 129XE NMR SPECTROSCOPY
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 130
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA01
1D4NA 2Z8EA 3SETA 1IUDA 3FIRA 5K2XA 1MDP1 5CI5A 4OYVA 2F7BA 2R71A 4XTCQ 5J1DA 3V89B 1ZU0A 2Y7KA 3RTFB 5I56B 3IOUA 3TTLA 1B3GA 1SI1A 3MZBA 4MBPA 3MP8A 1MDQA 3ILUB 3IO4A 4JSDA 2AIXA 1SYHA 1MH3A 1JNFA 3SEVA 3U72A 5I57B 2UYFA 1URGA 3CVGA 2I4CA 4GFRA 1IQ7A 4GL8A 2Z22A 3SEWA 1H76A 5I84A 1LBCA 4FEDA 4KPTA 3Q26A 2P0SA 4GLIA 4H8JA 1OQGA 1XS5A 2QSXA 5L9SA 2VP1A 1CE2A 1UTBB 3EHUA 2QL3A 3WAFA 3R26A 2QS3A 1M5BA 4R6HA 4F2QA 1ANFA 4YB5A 4POXA 4C1UA 1B3HA 1NMUA 3THIA 4F39A 4FEBA 4K3FA 2YPNA 3GLBA 2ANJA 4U22A 3TKDA 4KR5A 5FTHA 2Q8JA 4YB7A 3FXRA 3KSJA 2IA4A 2XXYA 3MJNA 4F1VA 4TOZA 1PBQA 1POY1 1SYIA 1JW1A 1A99A 1NH8A 1XT8A 4KD5A 3TPAA 2RC7A 2ONRA 3UIFA 2XX9A 1GR2A 3T9VA 4C0RA 3I5OA 3G3KA 2IEEA 4H1XA 1WDNA 3FXUA 4YMAA 3MC2A 1JEVA 4QF9A 3HV1A 4IY6A 4YAHX 3CRBA 5CBSA 5ITOA 3TTRA 2I6EA 2QS4A 4ZEBA 2UVIA 3CSBA 1I69A 4BDOA 1JW4A 3O28A 1MRPA 3KJTA 4EQ7A 1CB6A 3MZ1A 5AE4A 4RJZA 2UVGA 2FYIA 3QSLA 1MY2A 3SESA 1YPNA 1SBPA 2X7QA 3MPLA 2F36A 1Y4CA 1EU8A 3DP6A 5HM4B 2XXIA 4XKQA 3ILTB 5I57A 2DE2A 2PT2A 4F29A 1MM6A 5H8FB 3RGYA 2O51A 3PPQA 2H25A 3C4MA 3FVKA 3K4UA 1GV8A 3V5AA 4PFWA 1VSOA 1H3DA 2DVZA 3ZKLA 4E0WA 1ZMGA 3M3FA 2O68A 3N6TA 4QRZA 1F9BA 5H8NB 1UTBA 4JBZA 2ZYNA 3K1MA 1LBBA 2HCAA 1IXGA 3C34A 3L6HA 5LOMA 2HQ0A 2REGA 3JZJA 3MAMA 4EXLA 2F34A 2NOOA 1BP5A 1MQDA 4IO2A 3U1OA 1MXXA 3TTNA 1MXZA 4ND9A 2KLFA 1SQYA 3UP9A 3ZSFA 2Q2CA 2ABHA 1ZTYA 4ELRA 3S2VA 5K2YA 3IB0A 1MY1A 2QJEA 3K1PA 1H44A 4X1DA 4QFNA 3O6GA 2XXXA 1UIVA 3K6VA 1TFDA 4H0WA 1LFGA 2Q88A 4N6PA 3A09A 4RK9A 2XXRA 3H03A 4AQ4A 4G2ZA 5CC2A 5H8QB 4EF1A 2I0CA 1O7TA 2V3QA 4MLQA 3TDJA 3K2DA 4HTGA 4OETA 1P1UA 4H5GA 5TP9B 3FGSA 4YKPA 3K00A 1FQEA 4QFPA 3KJ7A 4FAJA 5AA3A 3MVYA 3O6HA 1XHYA 1EH3A 1FTJA 4ZZEA 1MQGA 1AH5A 2DXYA 3PPNA 5I58A 3QUJA 5HBCA 4ELQA 1MH4A 4NWCA 2UXAA 5DEXA 4P0GA 1EZ9A 1B7ZA 3FVNA 4XKRA 1TFAA 3VE1B 4ECFA 4GXSB 2DOJA 3MZ9A 2Q89A 3VLUA 1MS7A 4IGTA 2XXPA 4KYEA 2R6GE 4ISUA 5EYFA 4F3BA 1B0HA 1ZLQA 4R6YA 3HCQA 2XHDA 4OESA 4PP0A 3E3KA 2QS1A 1P1NA 5KCJA 2HEUA 5DVJA 1QJMA 3OSQA 1B40A 3TQLA 3G3IA 3IL1B 3SKPA 3IOTA 1A54A 4XIGQ 1SW2A 1NNPA 3S9MC 5I59B 3CI8A 4ZEKA 2X7PA 3FVGA 3KBRA 3QYTA 5EHSA 2V25A 1MXVA 1LCFA 4R6KA 1LFIA 5FHMA 3CFLA 3Q27A 3L6GA 2CZLA 3FD3A 3MP1A 4NE4A 1QW0A 2XXVA 3H3GA 5CMKA 3H6VA 3OSRA 4KCDA 3OEKA 4OMBA 3WAEA 3A3UA 3ZKKA 3SEYA 4IO4A 4H5FA 4IO6A 1RKMA 4X1BA 3DLNA 4X9TA 2A5TB 3RPWA 4ZDMA 5CMMA 4OFOA 2NVUB 3E13X 4NF4B 4PE5B 2V3TA 5CMBA 2XXQA 5H8QA 5IKBA 4F2OA 4JB7A 4XKPA 4DDDA 5CRYA 3U93A 2QMXA 1R6ZA 1UQWA 2RINA 5DVFA 3LSFB 4F1YA 1NNTA 3VVEA 1PDAA 1B32A 2Y7PA 3FJMA 2QPQA 4R9FA 3HHFA 5CBRA 4YB6A 3K02A 4DZ1A 1MY4A 3RY3A 2O84X 1MPCA 1MQJA 2H9BA 4KFQA 3HHGA 1LAHE 1B3FA 3DELB 3OENA 4OQOA 1B7HA 2I3VA 3TELA 4RK2A 4U2RA 4BDMA 3CFZA 1MQHA 3W9WA 1DTZA 1MY0A 4G68A 2P2AA 1SW4A 1JEUA 2OWSA 3DP8A 3HO7A 3VFJA 2NXOA 1VR5A 4YMBA 4L17A 4H8IA 4ZS9A 1P1QA 3SEUA 1ZIUA 4NWDA 1A7LA 2GRVA 3PUXE 1N04A 4N07A 1JW5A 1ZBMA 3TTKA 1O64A 2Q2AA 3CR9A 1QKAA 4P0IA 5I59A 3FXQA 3K01A 2DWIA 1MQIA 2HZLA 4F18A 4RNSA 3ONMA 2GHAA 3FZVA 5ITPA 1Y3PA 2I49A 2LAOA 3U92A 3VXBA 3MP6A 4WXJA 4FJPA 3D4GA 3B6TA 2RKMA 1BLFA 3UA8A 1J1NA 1GGGA 3T9HB 1S9TA 1IXHA 3I6VA 4Q30B 2ZYMA 1Y9UA 5B70A 3D4CA 5F1QA 3I3VA 4HCYA 3GXAA 1GTKA 1NNKA 5AA2B 2A5TA 2R9JA 1TXFA 4C1TA 4FE8A 3JYRA 2HFBA 2AL4A 1LAFE 4NF4A 3BFTA 3O66A 2F6PA 4G8NA 2G93A 1WODA 1LAXA 4H67A 3T9UA 1NFTA 1B1XA 3IO6A 4TQUQ 4EQBA 2F35A 2OBGA 3Q28A 4GRKA 4YICA 1MPDA 1Y1MA 4OTEA 1IITA 4GWOA 5AA4B 3VVFA 3MW0A 2X26A 3FASA 3PD9A 1LGBC 3TZAA 2ZYKA 4WEPA 1M5EA 2V3UA 2HZKA 2RC9A 2AYSA 3SDFA 3VDFA 3N6UA 4I1DA 4IO7A 4U4XA 4ZECA 3C33A 1IXCA 2Y84A 4EQ9A 4LQ2A 4PFTA 4EXKA 1HSJA 4RA1A 1USYH 1OVBA 1FTMA 1YCJA 4QHQA 5ELVA 4AB5A 3VLVA 3O29A 5I58B 3DP4A 4JWYA 4LATA 3RT8A 3OO8A 5DEXB 1FCKA 4LA9A 5KZTA 2H98A 3C32A 2ONKE 1MM7A 4POWA 1IZ1A 3IJOB 1BKAA 1RYOA 3FV2A 3BFUA 3VVDA 2XX7A 4THIA 2YLNA 4JDFA 1FW0A 4FECA 2Y7RA 3PMVA 3TUSA 1H43A 4G4PA 1B05A 3PUZE 1Y3NA 1US5A 2WKYA 5DVIA 4R72A 3RT6B 2V84A 5KCJB 2DE4A 4NF6B 4GF8A 2G29A 1ZJLA 3KFMA 5AA2A 4EF2A 1VFEA 3ODBA 3PMXA 1SW1A 4U21A 3SERA 4Q0CA 4E0XA 4OXVA 1AL3A 2D3IA 1N84A 4G8HA 3O9PA 3OD7A 1S7YA 2O7IA 2E0SA 3H6UA 3OMBA 1B1HA 2M8CA 2UYEA 2O7UA 1LLSA 2F7AA 5ICQA 2PX1A 4ESXA 3TCFA 1A55A 3TTMA 1EZOA 4KYSA 2O69A 1N76A 4GD5A 4RYAA 4DE8A 3C35A 3B6WA 4GOTA 2QRYA 2THIA 4Q8RA 1D9VA 1YAEA 4F3SA 1AIVA 5AA4A 1SDXA 3C36A 4DIGA 1II5A 2B3BA 3T96B 4U1ZA 1B2HA 4KQPA 5H8HB 4I9DA 4QSCA 5L8DA 3PUVE 1HSLA 3S9LC 1Q1KA 4O3CA 1B4HA 2ZNSA 4DCXA 2Y7IA 3H6TA 1B5HA 3MQ9A 2PVUA 3N26A 5FHNA 2ZMBA 2UVJA 3T93B 3K0VA 5AA2D 1GVCA 2DYXA 3T9XB 3PGFA 3JV9A 4BDLA 4U4SA 3GBBA 3RN8A 1R9QA 3OO9A 1LB8A 3QAXA 4WEDA 5JTYA 4JXIA 2F6GA 2DS9A 4QFLA 3PUWE 4Z0IA 4G68B 3HPIA 3BBRA 3KN7A 1A8EA 1Y20A 4YZZA 1M5DA 2REJA 3ECRA 3MUQA 1B4ZA 1ATGA 4PETA 2DWHA 3SEXA 4GVOA 4NTLA 4NF6A 1QUKA 1XOCA 1MG1A 2DWAA 3V83A 1B6HA 4H65A 2OJTA 4M1VA 1B0LA 1PB8A 4YKKA 4OHNA 4IY5A 5TPAB 4LZ8A 2H4IA 3PPOA 1L5TA 4LP2B 2VHAA 3KN3A 4U1OA 2I0BA 3P7IA 5I2NB 2OZZA 1IEJA 3IOVA 4OERA 3PV0E 2OCUA 4YKIA 1QUIA 1LCTA 5H8HA 4GIZA 2HXWA 4R2BA 2ESNA 3W15C 1N0TA 1KWHA 3R6UA 3CFXA 3FJGA 1H45A 4OFJA 3U8QA 3Q29A 1S50A 1POTA 4OEVA 3M8UA 2XXWA 3H4ZA 2D5WA 3O2AA 3OXNA 4BDQA 3IX1A 2O1LA 3TCHA 3VLWA 1P99A 2Z8DA 2ZXTA 3UK4A 2V93A 1MY3A 3N5LA 3EHSA 1B51A 1NKXA 4KYDA 1I6BA 1LB9A 2O1MA 5L9MA 4LQ5A 1PC3A 5B7DA 4OEUA 5ISUA 4IO3A 4LZ5A 1OIBA 1LSTA 1O63A 2RF1A 2DE3A 5I2KB 2PMSA 4UA8A 3C31A 4ZEIA 1IIWA 5A5XA 3MVXA 4JWXA 3OO6A 3TEPA 1R1NA 4ZE8A 4BDNA 3CSGA 3G3FA 3LSLA 3OO7A 4RPNA 3TMGA 3EHTA 5IAIA 2QMWA 3T66A 1SD3A 4H6DA 2PYYA 3IORA 4HW8A 3FATA 1MXWA 1NL5A 1IXIA 4NF5A 4HS7A 5TPAA 5ICTA 4MFIA 1XVXA 3LUYA 3RTWB 1VE4A 4G77A 2I48A 4UACA 2VD2A 1JVXA 1DMBA 3IB2A 4LVQA 4BDRA 3MPKA 4LUBA 5I2NA 2F7CA 1OLCA 1RYXA 2PBWA 2DP8A 1XVYA 2O6AA 4I8CA 2QS2A 1B3EA 1NNFA 2AL5A 3KG2A 2DXRA 4Z7EA 3CG1A 1A40A 3AXFA 1FQDA 3IOWA 2I4BA 2A5SA 5KDTB 1VFDA 4NMYA 1XC1A 1QUJA 3FVOA 3PPRA 1PBPA 2VD3A 2ZNUA 3G7WA 1M5CA 2I3WA 5FHOA 1US4A 2RCBA 4ZZAA 4JWOA 3PD8A 3PPPA 3S9EA 4FATA 1FQCA 3H6WA 1B5IA 4RPOA 3PUYE 1PB9A 2GHBA 1USYE 4TLMB 3KSXA 1B7UA 3RUMA 2YJPA 4OENA 3FJ7A 4O3AA 3EPEA 3GZGA 1OVTA 3LSWA 3B7DA 5JK4A 4NF8B 2E1SA 5I2KA 3C9HA 2Q9TA 1HSEA 3USDA 3LC8A 4F3PA 3H06B 2OLBA 2I58A 4QSEA 4GL0A 4F3GA 3O6IA 4ESWA 1I6QA 4F1UA 5I56A 1YTVA 4KCCA 1SVXB 1SI0A 2F5XA 3H7MA 4ELOA 5JTYB 3HN0A 3FUZA 1PEBA 4IO5A 2NWJA 5L9OA 1N3WA 4YU0A 5M2VA 1M5FA 2DQVA 3K1NA 4PFUA 3KGCA 4GQOA 4F22A 2F8DA 4OFLA 1DOTA 4KHZE 4R2FA 3VV5A 5CMCA 3EN3A 1N3XA 3O97A 2XD3A 3E9XA 1B5JA 2XX8A 4MLVA 5BUUA 2HAUA 4M4GA 3FV1A 4QFKA 1MXYA 5KDTA 3MVWA 3IR1A 5DYHA 1EZPA 3TCGA 4GXAA 4R75A 5DTBA 4PQJA 4DLDA 4O3BA 4R73A 3V8XB 1TWYA 3EF7A 4XXUA 4FIMA 3QUFA 4KI0E 3R7XA 3K6UA 1A8FA 3QIMA 3LSXA 4G8MA 3LR1A 4EUOA 4F19A 3QK6A 3U94A 5FTIA 3IJXB 1TT1A 2ONSA 2BJJX 2XXUA 2FNCA 4DCYA 1Z7NE 1AMFA 1BIYA 2D21A 3B6QA 2UVHA 4LZ7A 3K6XA 1Q35A 4DXCA 4FORA 4G68C 3RLFE 1NH7A 4WKMA 3ZS6A 1N7XA 1ELJA 2DWJA 4NF8A 4R9GA 3VXCA 3HSTA 4ZEDA 3CG3A 2RC8A 4YKJA 4DXUA 4LONB 4X48A 3RQTA 1Y1ZA 5CM6A 2OK2A 2VGQA 2HAVA 2B65A 4JSOA 1DSNA 2H5YA 3MWBA 4OVJA 3OOAA 1R9LA 3E4RA 3KOTA 3LBSA 1B52A 3BKIB 1WVJA 1JVYA 1URDA 4MF3A 2RCAA 4XKNA 2P1SA 4OZ9A 1B3LA 2XD2A 1SW5A 5H8SA 3TYHA 1OLAA 1LAGE 1P1OA 3G3HA 1Y4TA 1PB7A 2NUVA 3M3KA 5F7VA 1FTKA 4I62A 3MBPA 1UTHB 3UGWA 5H8FA 5A5XB 4R74A 4HCWA 5EHMA 1T0KA 1FQFA 3EQ1A 1QVSA 4RY1A 2H99A 1FTOA 2FA7A 4DXBA 2Z23A 5HPQA 5H8NA 2B3FA 2OWTA 1QKBA 3KEIA 5AA1A 3OEMA 3IK6B 4TLLB 2Z8FA 2VOZA 1FQBA 4NF5B 1DPPA 3T22A 1D9YA 4Q5TA 2XXHA 2XXTA 3KZGA 3N94A 4F31B 3PU5A 2ZYOA 1Y3QA 3CIJA 1BTJA 2PT1A 5BWJA 3GBAA 3F11A 5DT6A 1P1WA 3W9VA 3RNNA 2Y7WA 3M3LA 4P11A 4ZE9A 3IB1A 5JEIA 1AOVA 3UN6A 4EDPA 1FQAA 2ALUA 1QULA 1B46A 3TAJA 4QFOA 1OMPA 1URSA 1DPEA 3KN8A 3S4UA 2F78A 3TQWA 3UORA 3G3JA 1MXUA 2CMOA 1ZKBA 4IB2A 3TFLA 4MH5A 4QSDA 1FTLA 5TU0A 4BLAA 4ZEFA 4ELPA 3KOSA 3Q25A 1Z7ME 1JETA 4ONYA 3IAZA 4U23A 1DTGA 3OELA 3PMWA 4IGRA 5TP9A 2W7YA 4RXLA 4N13A 4OWDA 3G3GA 2F97A 1MPBA 4AB6A 1B58A 2DVCA 2ZNTA 3A3CA 3QXMA 1UIUA 3DM0A 2GH9A 3S9NC 1N7WA 3MVZA 1OQHA 1I6AA 4NEDA 2DSFA 1JQFA 1D3KA 4PFYA 1B9JA 3K6WA 3TODA 1UTHA 2GFEA 1LFHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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