1M5DA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y702f) in complex with br-hibo at 1.73 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5dA01
3SEXA 2ZYOA 4FAJA 5I2KA 1N7XA 3A09A 3MAMA 3VLVA 3TTKA 4LATA 3DP8A 1A99A 3KG2A 4G77A 4FEDA 3TCGA 4R9GA 3MP8A 4I9DA 1YCJA 3KJTA 1SW4A 1ZIUA 4OEUA 3H03A 1Q35A 1URGA 2UVJA 3AXFA 5AA3A 2ABHA 1MXXA 3WAEA 3CG3A 4XIGQ 2RCAA 2RC8A 2B65A 2H4IA 1KWHA 3QSLA 2OZZA 4ESXA 5L9OA 3A3CA 4KCDA 4F3SA 3LSFB 4THIA 4RK2A 5TPAB 4ZS9A 3S2VA 3SERA 4LA9A 2GHBA 1T0KA 3TQLA 1OIBA 3ONMA 2DXYA 1N3XA 1ZMGA 4E0WA 1B5IA 1SQYA 1Y1MA 4F2QA 1LAFE 2I48A 4OERA 5F1QA 3PMWA 4KYEA 4WXJA 3O28A 3CI8A 4G4PA 3THIA 3E13X 2XXHA 3V83A 1PC3A 1NNKA 3DP4A 4R74A 2V3TA 1F9BA 2R71A 1VSOA 1SYHA 1PBQA 2GFEA 1LFHA 4YB7A 3LR1A 2UYFA 3LSLA 5H8NA 2UYEA 3FUZA 2HAVA 1OVTA 4C0RA 1AMFA 2OCUA 4LZ5A 3FIRA 1XHYA 2O7UA 5DVFA 3TTMA 4OFJA 3T9VA 1FTMA 3CIJA 4FJPA 1Y3QA 1OLAA 3FVKA 3KZGA 5EHSA 5AA4B 1L5TA 4F2OA 2H5YA 4LZ8A 1JVXA 2F97A 4EQBA 2F7AA 4QFKA 4JWOA 4KPTA 3HV1A 1XS5A 2RC7A 4F1VA 4ND9A 3CSGA 2GRVA 2FNCA 3ILUB 3FVOA 4O3CA 4DLDA 4YKJA 2DYXA 4F1UA 1P1UA 4IO6A 1LAGE 2XXQA 3PV0E 2ZMBA 4EXKA 3QYTA 4O3AA 2NUVA 4NWDA 1GVCA 1DPEA 2DWIA 1R6ZA 4NF5A 3MC2A 3OOAA 3N6UA 5DTBA 3IO6A 2I4CA 4QFOA 3CSBA 3IB0A 2PX1A 3TTRA 2P2AA 2DWJA 2Z23A 5I57B 4KI0E 3HCQA 4IO7A 3K4UA 2XXTA 1J1NA 2RINA 4Q8RA 4AB6A 3OEKA 1O63A 1SW5A 3CFZA 4F1YA 5B70A 1B6HA 3HHFA 5JEIA 4RPNA 3B6WA 2XXXA 3PD8A 2A5TA 4EQ7A 4U22A 3VFJA 1EU8A 3UK4A 1R9LA 3BFUA 2ANJA 4NF4A 4EQ9A 2I4BA 4QF9A 5CBSA 3WAFA 4TLLB 3FGSA 4F22A 4NF6A 3SKPA 1I6QA 2THIA 2XD3A 5AA2A 3VLUA 3VE1B 5B7DA 3USDA 3HHGA 1H76A 1MQGA 5A5XB 5K2YA 1H43A 2I49A 3JYRA 2PBWA 4H8IA 5AE4A 4N13A 4L17A 1SI1A 2QS4A 1VR5A 1ZTYA 2PVUA 4GXAA 3U93A 1B2HA 4IO3A 2G29A 3G3GA 1QJMA 2YPNA 1WODA 3LC8A 5ICQA 1IUDA 3OXNA 5F7VA 4NTLA 1B9JA 3FASA 2DQVA 1MQDA 5ITOA 1N3WA 4Z7EA 1LGBC 1NNTA 1ZU0A 1MXUA 4EF2A 2AIXA 2R6GE 1USYH 2VD3A 3IJOB 3IAZA 2HQ0A 2ESNA 1ZLQA 3O2AA 3PPPA 4GXSB 5I58A 4QSCA 4R9FA 1NMUA 2Y7KA 3EHSA 4XXUA 3FJGA 3G3KA 2XD2A 3DP6A 4GWOA 1URDA 3JZJA 1FTJA 3TZAA 3FJMA 1LCTA 1MQHA 2VOZA 2P1SA 2D5WA 2V3QA 1I6BA 1BP5A 3IL1B 3MWBA 3VXBA 3JV9A 1FTKA 1LCFA 4POWA 4JB7A 4DXBA 4EF1A 1TXFA 1TWYA 2A5SA 3K6XA 1QUJA 5FHMA 4ZE9A 3O29A 1JEUA 4H5FA 3ZKKA 1MQIA 4HS7A 4MH5A 2D21A 5CMKA 3FVGA 4I8CA 2I0CA 3CR9A 1QUKA 4BDOA 5CMMA 3K6VA 3KN7A 4Q30B 2DWAA 1QUIA 3V8XB 5CC2A 5TP9A 4BDQA 3LBSA 2O84X 4YAHX 2Q9TA 3RTWB 2XXUA 3RLFE 3QAXA 1YTVA 2OWTA 4C1TA 1TFAA 3K1PA 5HPQA 2XXIA 5H8FA 1Y9UA 1HSJA 4ZEKA 4H67A 4KYSA 4P11A 1HSLA 1Y1ZA 1YPNA 2QL3A 5DVJA 4P0GA 5KDTB 2H99A 3RTFB 3OSRA 4KD5A 2V25A 3E3KA 2UXAA 1MQJA 3E9XA 4WEDA 1UTBA 1ZBMA 4ZECA 4QFLA 3QIMA 3MVYA 1LLSA 4I1DA 4ELPA 4OYVA 1ZKBA 1B51A 4IO5A 3FXUA 5DYHA 1RYXA 3CG1A 3KSXA 3VVEA 1N76A 2CMOA 3PGFA 4EDPA 4G2ZA 3FVNA 1BTJA 5JTYA 1B40A 4OWDA 2UVIA 1DTZA 4GD5A 5EHMA 1ATGA 2HEUA 1MDP1 2XHDA 3SEVA 4R6KA 1NH8A 4GOTA 2V93A 1MXVA 4XKPA 1UTHA 3MVXA 3IORA 3RNNA 1M5EA 1JQFA 1LAXA 4PE5B 4JXIA 4NMYA 3TPAA 5BWJA 4LONB 4ELOA 2Y7PA 2XX8A 2XXRA 1B3HA 2O69A 5FHNA 5CMBA 3KOSA 3TODA 4DZ1A 5I59A 4LQ5A 1P1QA 3PPOA 4XKNA 2KLFA 4OFLA 2ALUA 4GQOA 3K6UA 4DCXA 4KYDA 4X1BA 1B3LA 3TCHA 2F6PA 2GH9A 4U1OA 1MDQA 4MBPA 3TAJA 3MBPA 3G7WA 3RN8A 4R2FA 2QRYA 2M8CA 2QS1A 3EHUA 4FEBA 2XXVA 3R26A 2A5TB 4BDMA 5HM4B 3H4ZA 1FTOA 3E4RA 4TQUQ 5K2XA 3T96B 3S9MC 3O6HA 1QVSA 4DDDA 1D4NA 1FQFA 3PPRA 2E0SA 1Y3NA 5H8QB 2R9JA 4PP0A 4ELRA 5I56A 1QW0A 5CI5A 4KFQA 2Z22A 2O1MA 4OENA 4IO4A 3C34A 1MY4A 4NE4A 4BDNA 1US4A 3HPIA 3U94A 1PB7A 2V84A 4PFWA 2QS2A 1IQ7A 2Q2AA 4E0XA 3KN8A 4HCWA 3RQTA 3C33A 4RPOA 4ECFA 3H7MA 3N26A 3QXMA 1MH3A 4Z0IA 2ZNSA 2Q88A 1B46A 3GLBA 4GVOA 1MXWA 1MY3A 2Q8JA 3TTNA 3UGWA 1SVXB 4YZZA 3GBAA 3TCFA 3M3FA 1EZOA 3DELB 4NF8B 4GFRA 4K3FA 1UIUA 1LSTA 2ONRA 2Q2CA 3CFXA 2ZXTA 4PFYA 2FA7A 3U92A 3DLNA 4JDFA 1DPPA 5TPAA 4JWYA 4H65A 2QJEA 4NEDA 4F29A 2F78A 4YKKA 2DXRA 1DOTA 1VFEA 2V3UA 2XXPA 2QMXA 2HXWA 4DIGA 4RK9A 4H5GA 4KHZE 2X7QA 5JK4A 4JBZA 4YB5A 2P0SA 3P7IA 5EYFA 4YKIA 1IXIA 3H3GA 3MZBA 3FZVA 3RT8A 3G3HA 3TDJA 1XC1A 5ICTA 4BDLA 2Y84A 3S9NC 1SI0A 3PMXA 2B3FA 1H44A 1PDAA 4DE8A 1M5BA 3SESA 3TUSA 3TFLA 4OZ9A 4FATA 3VV5A 1OQHA 3M3KA 5I2NB 3SEUA 4QRZA 4XKRA 1SYIA 4Q0CA 2H9BA 2REGA 3OD7A 4YICA 3SDFA 4EXLA 2RCBA 5AA4A 2ONKE 3UA8A 3BFTA 3N94A 5TP9B 2O68A 3FJ7A 3W9WA 2ZYKA 4G8NA 1DTGA 1B58A 5KCJA 1FTLA 1DSNA 2HAUA 1PB9A 3MQ9A 4N6PA 4R73A 5AA2D 2XX9A 4RY1A 3SETA 1MH4A 4G8MA 4N07A 2PT2A 2O6AA 1B05A 1PBPA 1Y3PA 4U21A 2LAOA 4KR5A 2Y7IA 4H1XA 3IX1A 4X1DA 1GR2A 5H8HB 3K1NA 3RPWA 5DT6A 2I3WA 3VVFA 2AL4A 1RKMA 3DM0A 1B3FA 1IZ1A 1B3GA 1VFDA 3TYHA 3IOUA 4UACA 5I57A 2DWHA 4QSDA 1LB9A 3O6IA 2DVCA 3C36A 1AIVA 3EQ1A 1M5DA 4RNSA 3RT6B 4YU0A 3CFLA 2F35A 3C35A 1LBBA 3VVDA 3IB2A 3T66A 3QK6A 4FECA 5DVIA 5I2KB 4KQPA 3FV1A 3HN0A 4LQ2A 4U23A 1LFIA 3QUJA 5AA1A 3LSXA 1A7LA 1Z7ME 3TTLA 2RC9A 3N5LA 5I84A 4H6DA 3A3UA 4NWCA 1AOVA 1S50A 4U1ZA 1IXGA 3KJ7A 3G3IA 4JSOA 1QKBA 5LOMA 5A5XA 4IY5A 1FQDA 1Z7NE 3PUXE 4RA1A 2IEEA 3IJXB 3OO8A 1M5CA 2OBGA 1JW1A 4G8HA 5M2VA 1JVYA 2Z8DA 4IB2A 3O97A 5DEXA 3OEMA 3OO9A 3KOTA 3IOWA 5KZTA 5I59B 4DXCA 1B1HA 3O9PA 1Y4TA 2DS9A 4QFNA 1A8FA 4ZEDA 2OWSA 1O64A 3LSWA 2NVUB 2W7YA 4F3GA 3C32A 4AQ4A 4GIZA 1XT8A 4IO2A 3L6HA 2I0BA 1NFTA 3T93B 3SEWA 1LBCA 1PEBA 3C4MA 2I6EA 3KFMA 3RUMA 1A40A 4XTCQ 1P99A 5ELVA 4BDRA 4OQOA 4FORA 3G3FA 4WKMA 4XKQA 3D4GA 1B0LA 3OENA 4M4GA 1TFDA 2Z8FA 1VE4A 2DVZA 3H6VA 3KBRA 3M8UA 1S7YA 3VXCA 2QS3A 5H8NB 4ELQA 3PUWE 3FD3A 3C9HA 2AYSA 4U2RA 5I56B 2F34A 1H45A 2AL5A 4RXLA 1A54A 2B3BA 4LP2B 1D9YA 3Q27A 1AH5A 3MW0A 1MRPA 1I69A 3IB1A 1IEJA 4POXA 3IOVA 3RY3A 3S4UA 1OQGA 2PYYA 1XVYA 5J1DA 4R75A 4O3BA 3S9EA 4G68A 4KCCA 1HSEA 3K0VA 4RJZA 3UN6A 1R1NA 1MM6A 4JWXA 3U72A 1B4HA 1GV8A 2NOOA 4MFIA 3C31A 1SW2A 1DMBA 1H3DA 3TEPA 3MPKA 4DXUA 1I6AA 2VP1A 3K00A 5CM6A 3HSTA 5CRYA 3I5OA 4U4XA 3MVWA 3EHTA 2RKMA 2RF1A 5IAIA 1CE2A 2BJJX 1POTA 4QHQA 4NF5B 1MG1A 4F3PA 1Y20A 1FQAA 3T22A 3EF7A 4ZZAA 4ESWA 1IITA 1MY0A 2VHAA 1MPCA 1FQCA 2E1SA 4I62A 3MPLA 2X7PA 3IR1A 3GXAA 2NXOA 2ONSA 3MJNA 4FE8A 4X9TA 1YAEA 1IIWA 5L9MA 4F39A 3H6WA 3U1OA 4PFUA 2HZLA 1POY1 4OETA 1B0HA 1D3KA 3OSQA 1N84A 4PETA 5KDTA 1B52A 4LVQA 3ECRA 2F5XA 4ISUA 2VD2A 3ODBA 2O1LA 1XOCA 3Q26A 4NF4B 3TELA 2DOJA 4FIMA 3HO7A 2REJA 3MP6A 4Q5TA 1QKAA 4NF6B 2DSFA 2DE4A 1MS7A 3M3LA 5AA2B 4X48A 2F8DA 5H8SA 3OO7A 4ZDMA 4GL0A 1MPBA 4R72A 4ONYA 3ZSFA 4HW8A 3VDFA 3PU5A 1WVJA 4F19A 3K2DA 4QSEA 1MY2A 3KSJA 2DE3A 3F11A 3BKIB 3H6TA 3EN3A 3U8QA 3B6TA 1B1XA 4QFPA 4OHNA 3MVZA 1GGGA 4MF3A 4PQJA 1MXZA 2Q89A 4JSDA 3S9LC 3PMVA 2I58A 1B3EA 5KCJB 3UORA 1JW5A 1FQEA 4DCYA 1NNPA 1N04A 2X26A 4TOZA 2GHAA 4ZZEA 2Y7RA 4R2BA 5L8DA 4ZE8A 3MP1A 1JW4A 4OTEA 1URSA 4U4SA 5I58B 2ZNTA 1NNFA 1B7ZA 2IA4A 2DP8A 3ZKLA 3LUYA 2PT1A 3PD9A 4F18A 3BBRA 1USYE 5FHOA 5CBRA 1MY1A 5ISUA 1OLCA 3H6UA 3PUVE 2DE2A 4F3BA 1LB8A 2QMWA 2HFBA 3ZS6A 1O7TA 4IGTA 3PPNA 3G3JA 5CMCA 2HZKA 2Y7WA 3T9XB 4YB6A 3B6QA 1P1OA 3GZGA 2HCAA 3B7DA 4GL8A 2H98A 4HTGA 3R7XA 3FV2A 3L6GA 2XXYA 5H8QA 5FTIA 1R9QA 2F7BA 3K02A 2XXWA 4ZEFA 3CRBA 3FXQA 4OVJA 4IY6A 3FXRA 1ANFA 2QPQA 2OLBA 4YKPA 5IKBA 1MM7A 3IOTA 3OO6A 4R6HA 3T9UA 2H25A 3OELA 2I3VA 1B7UA 3D4CA 3TMGA 5DEXB 4YMBA 4OMBA 3W9VA 4AB5A 1N7WA 4P0IA 2ZYNA 4OFOA 1GTKA 5H8FB 2YJPA 3PPQA 3N6TA 3O6GA 1B5HA 1BIYA 2O51A 4OEVA 3O66A 4ZEBA 1B7HA 1S9TA 3K6WA 1EH3A 4NF8A 1P1WA 1UTBB 4F31B 2Z8EA 1OVBA 1B4ZA 2QSXA 4RYAA 2F7CA 2YLNA 3MZ1A 1P1NA 4EUOA 1MXYA 3CVGA 2F6GA 1BLFA 3MUQA 1FQBA 1EZ9A 3TQWA 2UVHA 1SD3A 3KN3A 1ZJLA 3K1MA 4OESA 1MPDA 1WDNA 5TU0A 2O7IA 4UA8A 3H06B 3KGCA 5JTYB 3UP9A 1TT1A 2ZYMA 4ZEIA 2VGQA 1US5A 1Y4CA 4YMAA 1XVXA 2F36A 4R6YA 3QUFA 3IK6B 1JEVA 3SEYA 4G68B 2NWJA 1CB6A 4GRKA 4TLMB 3ILTB 3R6UA 5FTHA 1UTHB 4IGRA 4C1UA 5L9SA 4WEPA 1NKXA 1M5FA 5I2NA 2OK2A 1A8EA 1JNFA 1RYOA 2ZNUA 4LZ7A 5HBCA 3V89B 3VLWA 1IXCA 1FCKA 1QULA 1II5A 1UIVA 3GBBA 3V5AA 4BLAA 1A55A 4PFTA 2OJTA 1ELJA 3EPEA 1BKAA 4GLIA 3W15C 1B5JA 3TKDA 1B32A 2CZLA 1Q1KA 4H0WA 4HCYA 2D3IA 3RGYA 1IXHA 3MZ9A 3Q25A 1PB8A 4MLQA 1LFGA 1EZPA 1SDXA 3I3VA 1D9VA 3FATA 5H8HA 3PUYE 3Q28A 1JETA 5ITPA 1NH7A 2XX7A 1UQWA 1NL5A 3PUZE 4G68C 3I6VA 2G93A 1FW0A 2UVGA 1SBPA 2FYIA 1OMPA 4MLVA 3Q29A 2WKYA 4GF8A 4M1VA 3OMBA 1LAHE 4H8JA 1N0TA 4OXVA 5BUUA 1AL3A 3T9HB 1SW1A 3KEIA 3K01A 3UIFA 4LUBA 2PMSA 3IO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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