1M5EA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with acpa at 1.46 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5eA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5eA01
3PUYE 1FQFA 3B7DA 3HHGA 4NF8A 4EUOA 1B7UA 5EHMA 1Q35A 2Q88A 5TP9B 1B5HA 4NF6A 4RY1A 1FTJA 4KYEA 1JETA 4JXIA 3E4RA 3MZ1A 1JQFA 1NKXA 3M3KA 1QVSA 4PE5B 4OENA 1N7XA 2I4BA 1SYHA 2O7IA 2PX1A 2R6GE 4FIMA 4F3PA 4RPOA 3S9MC 1D9YA 5FHMA 4WEDA 4OERA 3OELA 3C34A 3IO4A 4YKIA 5H8NB 3MZ9A 5I58B 3D4CA 3DELB 2IEEA 3TPAA 3OEKA 4C0RA 1P99A 4HW8A 2ZNTA 2HZKA 5CMCA 3TUSA 4H1XA 3PD8A 3FJMA 1XT8A 2H25A 3BBRA 1NNFA 4EQ7A 3IOVA 2VD3A 3G3HA 1MY0A 2A5TB 3MP6A 3UIFA 3SESA 4GLIA 2QL3A 4RK9A 5I56A 4LP2B 1ZBMA 1D3KA 1JW4A 1US4A 3UK4A 2GHAA 3K00A 4GQOA 2OZZA 3DLNA 4HCWA 1B3HA 3KSJA 2XXPA 3QK6A 4DE8A 1Y4CA 3SEUA 2FA7A 4ND9A 2XXUA 1H3DA 1NH8A 3VLUA 4YICA 3H06B 3TFLA 1UTHA 2ABHA 3TZAA 4XIGQ 2UVJA 1HSLA 4MFIA 3HPIA 4QFLA 4GIZA 2XXTA 2GHBA 4Z0IA 2XXRA 3P7IA 1MY2A 4IO7A 1ELJA 3TTLA 1M5DA 4G68A 4KYSA 3T9UA 1B58A 2QJEA 1VSOA 1JEUA 2R71A 1Y3NA 2OBGA 1EZPA 1TFDA 2M8CA 4HTGA 4R72A 4ZEDA 3VFJA 2PBWA 1GTKA 4F3GA 1SDXA 3S9LC 3G3FA 2HQ0A 3FIRA 1B5JA 2XXXA 3D4GA 3MBPA 3Q28A 2YPNA 4N13A 3THIA 3WAFA 1ZIUA 2F34A 4BDRA 1F9BA 2VP1A 3H6VA 3UN6A 4EF1A 3GLBA 2ESNA 3K2DA 4FORA 1LB9A 1XS5A 3LSLA 1SBPA 4QSCA 1QULA 5K2YA 4OWDA 3G3GA 2I49A 4R74A 4PFTA 4U2RA 4R6YA 4N07A 2RC7A 4NF4B 4PFUA 3T9VA 3CG3A 4YB5A 3HN0A 4H67A 1IIWA 5BUUA 3HO7A 2Y7WA 2GRVA 3LSXA 4JB7A 1VFEA 4F1VA 1B1XA 1R1NA 1MQHA 1PBPA 1LCFA 2QMXA 2DVCA 1JW5A 4QF9A 1BLFA 5H8NA 5I58A 5CC2A 1EZOA 4OFLA 4YB7A 1UTBA 3PUVE 3MVYA 1ZTYA 1POY1 1N04A 3SEYA 3PGFA 1IXCA 4KI0E 4WKMA 3U1OA 4EXKA 3S2VA 3KOTA 3I6VA 2V3UA 4AB6A 4HCYA 2O68A 1LFGA 4H8JA 2GH9A 2ZMBA 1N84A 1OLAA 4RYAA 2V25A 2XXYA 4X48A 1B52A 1JVXA 1B3LA 4GD5A 4OQOA 4C1TA 4OYVA 3PD9A 4QFNA 4U22A 1LB8A 1Y4TA 2PT1A 1XVYA 4JSOA 3SDFA 3IB2A 3KN7A 2Y7PA 4NF6B 5H8HB 2B65A 3C9HA 1EH3A 3QUFA 4FAJA 4DXBA 1UIVA 2H5YA 3TAJA 4KQPA 2VHAA 5CRYA 4TQUQ 3MVXA 5B70A 1MRPA 3JZJA 5JEIA 1B6HA 5H8QB 1IITA 1R6ZA 3TYHA 1AOVA 3KN3A 1SW1A 4P0GA 1A40A 1LAGE 4O3CA 4OHNA 1I6AA 2F97A 1OVTA 1B3FA 2X7QA 4FE8A 1FQAA 4EQBA 4IO6A 2QSXA 2XX8A 2Z22A 4X9TA 2YJPA 4JSDA 2F78A 4XTCQ 4F31B 4DDDA 4QSEA 1XHYA 3R7XA 1PEBA 2VD2A 3CFZA 2QPQA 4R9FA 3N5LA 3Q29A 4U1OA 4KR5A 3CI8A 3K6UA 2Q2CA 1Y1ZA 3VXBA 2ZYMA 5L9MA 1DSNA 3A3UA 4YKJA 3W9VA 4R2FA 1XVXA 4BDNA 4WXJA 1D9VA 3VV5A 3KSXA 3PUZE 5F1QA 1NFTA 5DT6A 1MS7A 1DOTA 4RNSA 4NF4A 4F18A 4NMYA 4ZE8A 3AXFA 5H8FA 3RTFB 3UA8A 2V84A 3K0VA 1Q1KA 1MPCA 4G68B 1MY4A 1P1QA 2QRYA 5I84A 3SEWA 1VE4A 4YMAA 4LONB 4R6KA 3ONMA 4FECA 3TTRA 3U92A 2F5XA 3DP4A 4DCXA 3FATA 3T9XB 3EPEA 2RCAA 3H3GA 3SEVA 3TTMA 1Y3QA 4RK2A 1IXHA 1FQCA 4POWA 3U8QA 5DTBA 3FVGA 2DQVA 1NL5A 4LUBA 5DEXA 3PU5A 1M5FA 4YZZA 1FCKA 3DP8A 4XKRA 3LC8A 2Z8FA 1Z7ME 2HCAA 1L5TA 1IQ7A 4ZEKA 3ILUB 2D5WA 5CMBA 2HXWA 5I2KA 3R6UA 2DS9A 2R9JA 1O64A 4LATA 1CB6A 3N6UA 3LR1A 3GBAA 1IUDA 2ONKE 5H8HA 1FQEA 1YAEA 1OMPA 3T66A 1LFHA 1OIBA 1FQDA 1SW2A 1BIYA 1CE2A 1Y3PA 1LAXA 4X1BA 4OZ9A 1MQJA 3PMVA 1I6QA 1MXWA 3OO7A 4ZECA 3OOAA 5ELVA 4OFJA 5H8QA 3CVGA 2ZXTA 1LBCA 1Y9UA 4H5GA 2LAOA 4IB2A 4G8HA 1RYXA 3G7WA 4BDQA 1IZ1A 4I8CA 1UTBB 1B3EA 5L9OA 3FV1A 1TT1A 5K2XA 2O1LA 2FNCA 2UXAA 3O66A 1A54A 4U21A 3V89B 1TFAA 3IOWA 4QHQA 4PFWA 4ZZEA 4GVOA 1SI0A 4Q8RA 1A99A 4H5FA 4JBZA 4PETA 3HV1A 2DWHA 1RYOA 3OMBA 4Z7EA 4F29A 1B51A 1FTMA 3K02A 1FQBA 3FVKA 3K1PA 4KCCA 4KHZE 3RY3A 3TTNA 2I0CA 4OESA 5CBSA 1S9TA 3Q25A 2HEUA 1LAHE 3KOSA 1AH5A 2O1MA 2PVUA 3O6HA 3OO9A 3LSFB 2ONRA 4LZ8A 5TPAA 3M3LA 4OEVA 3PUWE 2O69A 3GXAA 3TCGA 4THIA 3MVWA 3FASA 4ESWA 2Y84A 3W9WA 3WAEA 3CSBA 5CI5A 4LZ5A 4DLDA 1NH7A 1D4NA 3PPNA 2H4IA 3B6QA 4TLLB 1GV8A 2QS2A 3Q26A 3IO6A 1P1OA 1Y1MA 4TLMB 3MAMA 3HCQA 4G4PA 3EHUA 1MH4A 3E3KA 4I62A 1PB8A 1OQGA 2I48A 2Y7IA 1QKBA 3FVOA 3RT8A 1VFDA 2RC8A 3TDJA 3TODA 2F6PA 2HZLA 4BDLA 1B32A 1J1NA 3VVEA 3MPKA 3M8UA 4EXLA 2XX9A 2H98A 1PDAA 2O6AA 3F11A 3GZGA 4Q30B 3C31A 3C4MA 3CR9A 3EF7A 2AIXA 2I6EA 3RPWA 1B0HA 2Z8DA 3LBSA 1PB7A 4FJPA 3C36A 4GL0A 1S50A 3MVZA 4GL8A 1HSJA 2V93A 3KJ7A 3PUXE 1LFIA 5DYHA 2F35A 3KGCA 2I0BA 5IKBA 4GXSB 1DTGA 4LA9A 3VLVA 3IORA 1B40A 2FYIA 4F2QA 5H8FB 2Y7RA 1B7ZA 2W7YA 1QW0A 4DIGA 4NF5A 2WKYA 3S4UA 3T96B 3VXCA 1DMBA 1H44A 3FJGA 4F39A 5M2VA 4OXVA 1SW5A 3O6GA 3QSLA 3CSGA 4IGRA 1O7TA 5LOMA 4KCDA 1R9LA 1B0LA 3SERA 4KPTA 4K3FA 1YCJA 4GFRA 3IR1A 4MBPA 2Q2AA 5B7DA 4QRZA 3TMGA 1FW0A 3SKPA 5DEXB 1I6BA 2CZLA 4NEDA 2Q9TA 1OLCA 2DOJA 3QXMA 5KCJA 4QFKA 2P0SA 2VOZA 3T93B 3OENA 5CMKA 3HHFA 1JW1A 3H6WA 5I2KB 5ISUA 1B7HA 4HS7A 1WDNA 3IB0A 4OEUA 2GFEA 4C1UA 4EQ9A 4O3BA 2ZYOA 1JVYA 3KBRA 4PQJA 1LGBC 1P1NA 3E13X 4I1DA 5BWJA 3A3CA 3PPPA 4G8NA 3IX1A 4GRKA 2DWJA 4DXCA 2NXOA 1LBBA 3UGWA 4GXAA 4IY6A 4F2OA 3OXNA 1SI1A 1P1WA 3R26A 5CMMA 1A7LA 4DCYA 5I2NB 1MXXA 1SW4A 2DYXA 1KWHA 2ZNUA 3QIMA 4H0WA 4XKNA 4F19A 3O29A 3V5AA 4BLAA 3UP9A 5A5XB 1FTKA 1A8EA 3N6TA 1MDP1 3O28A 4JWOA 2DXRA 4RJZA 3T9HB 3H7MA 1RKMA 4RA1A 3K01A 4NWDA 2VGQA 3CFLA 1PC3A 3U72A 3O9PA 3EN3A 1MM7A 5L8DA 2H9BA 3ILTB 1EU8A 2O7UA 1A55A 3VLWA 4H8IA 3FV2A 3PPQA 3C35A 5HPQA 1URGA 4O3AA 4PFYA 3O6IA 5I59B 5AE4A 4ELOA 4R73A 3RN8A 3FVNA 3IL1B 5TPAB 3DP6A 3B6TA 4PP0A 3MJNA 4ESXA 3GBBA 1BP5A 4XXUA 1MXYA 3HSTA 3V83A 3OSQA 3KZGA 2DE4A 3RTWB 3FXQA 2DWAA 4KYDA 2X26A 3RQTA 5ICQA 1JNFA 2IA4A 2RC9A 5AA1A 2HAUA 4NTLA 2D21A 1MPDA 2OJTA 4GF8A 3JV9A 3KJTA 5KDTB 2G29A 2ZYKA 1N3WA 5H8SA 1BKAA 1MH3A 3OEMA 3QAXA 4QFOA 1ATGA 4ELQA 5FTHA 3IJOB 5AA3A 4POXA 4R6HA 4JWYA 1N7WA 3Q27A 1US5A 1USYH 1MXUA 1N76A 1MQIA 4JDFA 4QSDA 1URDA 3VVDA 4MH5A 1HSEA 2DP8A 3N94A 3MZBA 2I4CA 2NVUB 4OTEA 5DVJA 1LLSA 4U4SA 2RCBA 4LZ7A 1SD3A 5IAIA 2Z23A 4IY5A 1M5BA 3UORA 4IO2A 2AL5A 4E0WA 3ODBA 4U1ZA 4IGTA 1QUJA 2F6GA 4KFQA 2E0SA 1PB9A 4ZEFA 4YKPA 3IJXB 1FTLA 2OLBA 1NNTA 4NF5B 4ZDMA 3EHSA 3K6WA 1N0TA 3MP1A 1QUIA 1M5CA 2D3IA 3O2AA 4R2BA 2Y7KA 4G8MA 5JTYA 4LVQA 4WEPA 1LAFE 1XC1A 3VDFA 5I2NA 5TU0A 1VR5A 1LSTA 4FATA 1DPPA 1MQGA 2F7CA 4U4XA 4ISUA 2B3BA 4YU0A 4ELRA 4X1DA 1QKAA 2ZYNA 5L9SA 3BKIB 5HM4B 5A5XA 4N6PA 5CM6A 1EZ9A 4OMBA 4NE4A 3MC2A 3IOTA 3U94A 5HBCA 2F7BA 1TWYA 2G93A 1IXGA 3K6VA 3K1NA 2F7AA 3H6TA 5KCJB 2P1SA 4H65A 4YAHX 4XKQA 3C33A 3MWBA 1H43A 1S7YA 5JK4A 2NUVA 3K6XA 3MQ9A 3ZS6A 1WODA 2XXVA 3U93A 5DVIA 4M4GA 3KFMA 3K1MA 3RUMA 1Z7NE 1QUKA 1B2HA 5I59A 3PMWA 1MG1A 3VVFA 2CMOA 2P2AA 3A09A 1FTOA 2F8DA 3G3JA 3KN8A 1USYE 1QJMA 2F36A 1ZU0A 3W15C 4OVJA 5AA2B 1MDQA 1R9QA 4E0XA 1IEJA 2I3VA 1B05A 3H6UA 2OCUA 2Q89A 3IOUA 1MY3A 1JEVA 2OWSA 5KDTA 1AIVA 4P0IA 3TQLA 4IO4A 3OO8A 3V8XB 3ZKLA 4DXUA 5FHNA 3KEIA 5AA2D 4OETA 4ECFA 1NNPA 4YB6A 3B6WA 3TTKA 3RNNA 1SYIA 3LUYA 1MY1A 2DE2A 4TOZA 2REGA 3IB1A 1XOCA 4BDOA 1LCTA 4UA8A 2XXHA 2O84X 1B9JA 4ZE9A 4G77A 1POTA 2RF1A 3USDA 1OQHA 3N26A 1O63A 3PV0E 4U23A 2KLFA 4FEDA 3IK6B 3VE1B 2DXYA 3TQWA 3PPOA 1ZMGA 3TKDA 4RPNA 2B3FA 1ANFA 5I57B 3C32A 3ZSFA 2UVIA 3TEPA 2NOOA 1DPEA 1GGGA 3RGYA 5ITOA 5J1DA 5TP9A 3ECRA 5DVFA 4BDMA 3RLFE 2OK2A 5EHSA 4ZEIA 3PPRA 3FXUA 3TELA 1B46A 5AA4B 4ZEBA 4MF3A 1B1HA 4F1YA 2XX7A 4F3SA 2E1SA 3FGSA 4F22A 4ONYA 3MW0A 2YLNA 4F3BA 3OSRA 2QS4A 1N3XA 3PMXA 3JYRA 3L6GA 1I69A 2A5TA 1UQWA 2DWIA 2ALUA 3TCFA 2OWTA 2I3WA 1PBQA 4UACA 3CG1A 3H4ZA 4FEBA 3G3IA 3KG2A 3TCHA 1T0KA 3FZVA 4M1VA 2V3TA 3S9NC 1P1UA 4L17A 3S9EA 4MLQA 1MM6A 2DSFA 4ELPA 3IAZA 1H45A 3ZKKA 2ZNSA 2QMWA 4NF8B 4XKPA 2I58A 2ANJA 5AA2A 1IXIA 4P11A 3O97A 5FTIA 5ICTA 4RXLA 1M5EA 5ITPA 2NWJA 2XXQA 3SEXA 3QYTA 3BFUA 4KD5A 1II5A 5JTYB 1WVJA 2REJA 4LQ5A 4IO5A 2HAVA 4G68C 2RINA 2UVHA 2Z8EA 3I3VA 3EHTA 1ZKBA 3QUJA 3K4UA 2UYEA 1Y20A 3E9XA 1MQDA 4Q5TA 2H99A 4OFOA 4EF2A 1SQYA 4GWOA 5KZTA 1SVXB 4LQ2A 1MPBA 1B5IA 1OVBA 1UIUA 1B4ZA 1B4HA 2XHDA 5I56B 4AB5A 4Q0CA 4R75A 2UVGA 3T22A 3BFTA 2PT2A 2DVZA 1MXZA 1MXVA 2THIA 4QFPA 4ZS9A 2PMSA 2RKMA 2QS3A 5EYFA 4ZZAA 4H6DA 2V3QA 1H76A 5CBRA 4AQ4A 5I57A 3FUZA 3OD7A 2Q8JA 3H03A 1AMFA 3I5OA 4NWCA 1YTVA 2X7PA 1UTHB 2XD2A 1NNKA 3CRBA 2PYYA 3OO6A 1TXFA 3CFXA 1ZJLA 4IO3A 2UYFA 2HFBA 3FD3A 3DM0A 2O51A 5AA4A 3LSWA 5FHOA 3CIJA 4YMBA 2QS1A 3FJ7A 2XXIA 3MP8A 2XD3A 3L6HA 1DTZA 5F7VA 4GOTA 2ONSA 3M3FA 3MPLA 4YKKA 2DE3A 3RT6B 1ZLQA 2AYSA 1A8FA 4EDPA 2AL4A 4MLVA 1GR2A 4F1UA 2XXWA 1URSA 4R9GA 2A5SA 3MUQA 1AL3A 1GVCA 4I9DA 4DZ1A 1BTJA 4G2ZA 3G3KA 1NMUA 1YPNA 4JWXA 3EQ1A 3SETA 3FXRA 2BJJX 1B3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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