1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
5K2YA 4RY1A 1NNKA 4F39A 5I59A 3EF7A 1LCTA 2DQVA 3GLBA 4LVQA 1TWYA 1B1HA 1M5BA 4BDNA 1QUJA 2XXWA 3O28A 1ELJA 3CI8A 2V84A 3G3GA 2ONKE 5CMKA 1MXZA 1MQHA 4GL8A 3H6VA 1GR2A 4O3AA 2F6GA 5JK4A 3KN3A 2ZNSA 3CSGA 3S2VA 5BUUA 2F97A 3MWBA 4IY6A 4LQ5A 2O1MA 1SYHA 3KZGA 2UYEA 5AA4A 4LA9A 4HCYA 1LB9A 2G93A 2RCAA 3KJ7A 3N26A 3IOTA 4JWYA 4BDLA 2QS1A 3H6WA 3MQ9A 4H6DA 4LZ8A 1EZ9A 4EQ7A 5H8FA 5B70A 1PC3A 1OLAA 2I0CA 5DVJA 2NUVA 4KHZE 3FUZA 3A09A 5LOMA 1BIYA 1QUKA 3CVGA 1M5FA 2Q2CA 1IXIA 2DWAA 2AL4A 3TTNA 1MPDA 4ZZEA 3KFMA 1UQWA 1VFDA 1A7LA 4H67A 2DYXA 2H5YA 4YB6A 1JW5A 2DWJA 5I84A 4JBZA 4LQ2A 1MDP1 4ZEIA 4F1YA 1B5IA 1B52A 4GRKA 2F7BA 4FORA 5H8FB 3OSRA 3T22A 5TP9B 3C4MA 4DCYA 3CFZA 2VGQA 1LFIA 3G3KA 2NWJA 3SDFA 3A3UA 3RTWB 3K6WA 3PD9A 2HFBA 4OTEA 4OYVA 1LBCA 3WAEA 4JSOA 3P7IA 2D3IA 3O97A 4R6YA 1B4ZA 3KJTA 3LC8A 4PP0A 5CM6A 4U2RA 4NE4A 2YPNA 2FYIA 3FZVA 1DSNA 1PEBA 3PGFA 3TAJA 4ZECA 1MQGA 4IGTA 4GXSB 4BDMA 1NH8A 2P2AA 3RT8A 4H8IA 1SI0A 3QUFA 5JTYA 4X1DA 3PUXE 5TPAA 2R6GE 1MXYA 1B6HA 3LSXA 4KCCA 3W15C 3GBAA 2XD3A 3PPRA 3C36A 5DYHA 4F3BA 4Q0CA 3IO4A 2PT1A 3U8QA 1B40A 5F7VA 1I69A 1VFEA 2DE2A 2OJTA 1OMPA 1Y4TA 4DXUA 1JQFA 4FAJA 2QPQA 2Q89A 4LZ7A 4NEDA 1S7YA 2F7AA 2Q9TA 1MPBA 1FTLA 1MS7A 1MDQA 3IJOB 5JTYB 2A5TA 3ZSFA 4ZDMA 3H3GA 5TPAB 1A8FA 3E3KA 1P1WA 4OFLA 3PV0E 3R6UA 5J1DA 4YB5A 2ZMBA 3U94A 3I5OA 4G8NA 5DTBA 4JB7A 3VXCA 3FV2A 2H4IA 2DXYA 3TTKA 3B6QA 1N7XA 4KR5A 4ZEKA 5KZTA 4HCWA 4KYSA 1SD3A 2HAVA 5CMMA 4GL0A 4PFYA 1Y3NA 1PB7A 1URSA 3IK6B 5B7DA 4TLLB 1AIVA 1LAFE 3O66A 2HZLA 3O2AA 1URDA 3T9VA 1S50A 4N13A 1LCFA 2A5TB 4YB7A 1FQBA 1MQJA 2F35A 5L9OA 3IOUA 1IUDA 4PFTA 3SEXA 5L8DA 1N3WA 4HTGA 1MQDA 4IGRA 5K2XA 2RCBA 3FD3A 3FJGA 5ELVA 3VVFA 1N0TA 3MP6A 1IQ7A 1XC1A 5I2KB 4OESA 4F1UA 3BBRA 3K1NA 4DXCA 1JNFA 4K3FA 4NTLA 3IOVA 3W9WA 2YJPA 1VSOA 3VVEA 1TXFA 4GFRA 3SKPA 4KFQA 2O69A 1YAEA 4OEVA 1M5EA 3MZBA 2FA7A 5KDTB 4N6PA 1QUIA 3K01A 3SEWA 2O84X 5CMCA 1S9TA 1XVYA 2I48A 1GV8A 4QFNA 3RTFB 3LR1A 5L9SA 2GRVA 3H6UA 1Q35A 4P0GA 3T93B 4OERA 2GH9A 4GWOA 1MH4A 2O68A 4EF2A 4ELPA 1B0HA 4DCXA 3PD8A 4KQPA 1NNFA 3BFUA 3MZ9A 1Q1KA 1LBBA 3T66A 3IB1A 4H1XA 3TZAA 3IOWA 4YU0A 1XT8A 3A3CA 1Y1MA 3M3KA 3MBPA 1HSLA 1NNPA 1POY1 4U4XA 1MXUA 2HAUA 4X1BA 3VLUA 3Q26A 3CFXA 4JDFA 4GOTA 4F3SA 2Z8FA 1O64A 4NMYA 4WKMA 4NWDA 1LAGE 1ZBMA 4QSEA 4Z7EA 4QFPA 4R75A 3U92A 1P1NA 5H8QA 1IITA 3T96B 3FXQA 4RPOA 4OENA 5AA2A 1MG1A 4U1OA 5FHNA 2QSXA 2DP8A 5JEIA 1UTBA 4R73A 3EHUA 3M8UA 4Q5TA 3FXRA 2I4CA 3K6VA 1MY1A 3OD7A 2H9BA 4LONB 4U4SA 3OXNA 2XXXA 1A99A 3BFTA 4ELOA 3PMVA 3FIRA 2QS2A 1PBQA 3TCGA 3UK4A 3KN7A 2QS3A 1D3KA 2I58A 1B2HA 3H6TA 1USYE 2DOJA 4ZEDA 2OWTA 3MVXA 2HZKA 2I3VA 4QF9A 3RLFE 5DVIA 1PB9A 2QMWA 5AA2B 4NF8B 4G8MA 2VD3A 2XX9A 4GXAA 2Y7PA 3K6XA 4YZZA 1MY2A 1F9BA 3OMBA 3ODBA 3MW0A 2XX7A 3OEKA 1IIWA 3FVNA 4THIA 3O6HA 3E13X 4AQ4A 3S9MC 3UN6A 1MY3A 1QKBA 3ZS6A 2LAOA 1DMBA 1RYXA 4FEDA 3TTLA 3TCFA 3HO7A 4ZZAA 5ITOA 3UIFA 4UA8A 2Z8DA 3SEVA 3G3IA 4I8CA 4YMAA 3T9UA 3S4UA 4JWXA 3FASA 3SERA 3QXMA 4NF6A 3BKIB 4R9FA 5I59B 3ZKLA 3VDFA 4IO5A 4TLMB 2ONRA 2H99A 3TMGA 2FNCA 4GD5A 5CI5A 3TYHA 3G3FA 3QIMA 1Y20A 2P1SA 4ZEFA 1KWHA 4HS7A 1AH5A 1ZJLA 3GZGA 2Y7WA 3UA8A 2I0BA 2ANJA 2XD2A 2V3QA 2HQ0A 2UVHA 1SW1A 3KSXA 2ESNA 2H98A 3VV5A 1GGGA 5FHMA 4Q30B 5ISUA 3O9PA 5AA4B 3D4GA 4NF6B 4WEPA 2OLBA 2F6PA 2XXUA 4UACA 1NFTA 4ND9A 1ZLQA 2AL5A 3TFLA 2XX8A 2ZYKA 4IO4A 4C1TA 5I2NA 3K4UA 1P1QA 3VXBA 1I6AA 3LBSA 3K02A 3CG3A 3RGYA 1PDAA 1LB8A 3CRBA 2DWIA 4YKPA 5AE4A 1PB8A 1FCKA 4LATA 4H8JA 1OLCA 2ZNTA 2V93A 1BKAA 3MJNA 1IZ1A 4DE8A 2RKMA 4EXLA 3SESA 2QRYA 3QK6A 3VLVA 4F1VA 4PE5B 1WDNA 1US4A 1XOCA 4BLAA 3Q27A 1UIVA 4JSDA 4F18A 4EXKA 4PFWA 3PUVE 1B3GA 5I2NB 3Q25A 2E0SA 1B58A 4KI0E 3CG1A 1CE2A 1IXCA 4QFOA 1SVXB 4IO6A 1OQHA 1B0LA 2PT2A 2H25A 3IB0A 5DEXA 3OENA 2UXAA 2O51A 4RK9A 3K2DA 2DVCA 2XXRA 3DELB 1H3DA 4F29A 1FTMA 1MY0A 3PPOA 1SW5A 3H03A 2ZYOA 3CR9A 1POTA 3KBRA 2IEEA 5FTIA 3TKDA 1EZPA 4QSCA 5TU0A 3HHFA 1NH7A 3B6WA 1A54A 1N3XA 2RC8A 2F78A 3SEYA 1WODA 4X9TA 1Z7ME 5EHMA 1B3LA 3OO7A 3JYRA 4LUBA 1QVSA 5DEXB 3AXFA 4XKRA 1HSEA 4XKQA 3IO6A 2Z22A 3HHGA 4MLQA 2UYFA 3V5AA 4P11A 1EZOA 2AIXA 1SBPA 2VHAA 1SW4A 3LSFB 3FVOA 4G77A 1LLSA 2ZYNA 4G68A 4PQJA 4DDDA 4EQ9A 1D9YA 3IR1A 1TT1A 1SQYA 1YCJA 1PBPA 4KYDA 3TTRA 1J1NA 2GHBA 2KLFA 3Q29A 2O7UA 5HM4B 2VP1A 1B51A 3C35A 3TQLA 1MH3A 5CC2A 1AMFA 2X7QA 4IB2A 2XXQA 2XXTA 4NF4A 1L5TA 5I58A 3MPLA 3VLWA 5BWJA 1LAHE 1VE4A 4LZ5A 2IA4A 3SETA 1VR5A 3V83A 3ONMA 3OSQA 3IJXB 3PU5A 2GHAA 3C32A 3K0VA 1FQCA 1AL3A 5CMBA 4ESWA 4XXUA 3USDA 1N7WA 4MFIA 1ZIUA 3TPAA 2DXRA 2XXPA 3KGCA 4OVJA 1FW0A 1SW2A 2RC9A 5I58B 2Y7IA 4U22A 3RT6B 1B7ZA 4BDQA 1LSTA 3C34A 1B7UA 4U1ZA 2F8DA 3E4RA 2ONSA 4N07A 1YTVA 1BTJA 1M5CA 3RNNA 4R2FA 2ABHA 3N6UA 3HV1A 1H43A 4DXBA 3UORA 4ECFA 1MM7A 1TFAA 5H8HA 3E9XA 3K6UA 3TDJA 3KOTA 3HN0A 1NKXA 2X26A 2F5XA 4KPTA 5L9MA 2OCUA 3PPNA 3EN3A 1MPCA 3KEIA 3R7XA 3FATA 1WVJA 4JWOA 2WKYA 2PX1A 2XXIA 1JW4A 1P1UA 3K1MA 3WAFA 1EH3A 3LSLA 4WXJA 2DE3A 3FXUA 1N04A 3N6TA 3OO9A 1R1NA 3QSLA 1T0KA 3OEMA 1IXGA 2B3BA 3DP4A 2THIA 1ATGA 1LFGA 2PMSA 4R6KA 2XHDA 1LAXA 2O6AA 5H8QB 1HSJA 1O63A 2QMXA 3FGSA 3U93A 2RINA 1JEVA 1UTBB 4GIZA 2F34A 2HXWA 1MY4A 1A55A 4C0RA 4O3BA 3DP8A 2QJEA 2XXYA 1YPNA 3OO8A 3M3FA 3O6GA 4FJPA 4H0WA 1N76A 2UVGA 2DWHA 3IX1A 4OXVA 1GTKA 4TOZA 3Q28A 4QRZA 4KD5A 3OOAA 4R72A 3ILTB 3MVWA 3QUJA 4ISUA 3MZ1A 5AA2D 1MQIA 2XXVA 3ZKKA 4P0IA 4RPNA 4G2ZA 3KG2A 4FIMA 2Z8EA 2Q2AA 4FECA 3HCQA 1ZU0A 1DTGA 4ESXA 3FJMA 2HEUA 2OZZA 3GBBA 3MP8A 1RKMA 5A5XA 4IO2A 4YKJA 1N84A 5ICQA 4F3GA 2Y7KA 1LFHA 3RY3A 1SYIA 3MVZA 3OO6A 2REJA 1BLFA 4KYEA 4LP2B 4YKKA 4R2BA 1ZMGA 2NOOA 2E1SA 1B9JA 3MUQA 4QSDA 3O29A 1B3EA 4GQOA 4F19A 3RQTA 4I9DA 2NVUB 2F36A 2QS4A 4EUOA 5TP9A 5DT6A 3QYTA 3IORA 3G7WA 5H8NA 4POWA 4L17A 2V25A 5A5XB 1BP5A 1FTJA 4R9GA 4YAHX 3GXAA 4M1VA 4G4PA 4OMBA 4U21A 5FTHA 3S9NC 2W7YA 1FQEA 1NNTA 2RF1A 2DS9A 4XKNA 3UP9A 1P99A 3LUYA 1LGBC 2I4BA 3B6TA 4BDRA 4OFOA 5ITPA 4FE8A 1JETA 5KCJA 1B05A 3MVYA 5H8SA 2ALUA 4F2QA 1Y9UA 4XTCQ 1B5HA 1JW1A 3PMXA 5DVFA 3QAXA 3T9HB 3B7DA 1Y1ZA 3O6IA 4RXLA 4RK2A 2OK2A 4OEUA 5CBSA 5CBRA 2Y84A 1QKAA 4XKPA 5H8NB 4R74A 3K00A 2Q88A 2HCAA 4IY5A 3JV9A 1QJMA 2DSFA 3M3LA 3HSTA 1OVBA 2Y7RA 2P0SA 2B3FA 2UVJA 1MRPA 1DOTA 4E0XA 1P1OA 4NF5A 3G3JA 1M5DA 3H7MA 1FQFA 4Z0IA 5KCJB 1I6QA 4H5GA 1FQDA 1B5JA 1O7TA 3KN8A 3ECRA 4AB6A 4ONYA 4BDOA 4RJZA 3C33A 1DPEA 3JZJA 4XIGQ 4U23A 3FVGA 2V3UA 3PUZE 2ZNUA 1US5A 1CB6A 4GF8A 1R6ZA 3MP1A 1B1XA 1H44A 5AA1A 3C9HA 3THIA 1II5A 3PUYE 1B3HA 5M2VA 2I49A 2QL3A 3MAMA 1B46A 3I6VA 5EHSA 4WEDA 4KCDA 5HPQA 2A5SA 1TFDA 3U1OA 4NF5B 2DVZA 2ZYMA 1FTOA 5HBCA 5CRYA 4RNSA 1QW0A 3FV1A 1B32A 4O3CA 4F22A 1OQGA 3N5LA 4G68C 2O1LA 4POXA 3PPQA 3C31A 1MM6A 1D4NA 4OFJA 4DZ1A 1FTKA 3FJ7A 5IAIA 2CZLA 3F11A 2XXHA 4YICA 2M8CA 4EDPA 1QULA 2OBGA 4MF3A 5I57A 1NL5A 1Y4CA 4RYAA 3VE1B 2G29A 4IO7A 5I2KA 1Y3QA 4QFKA 3EQ1A 1H76A 1B3FA 4MLVA 3G3HA 4GLIA 1XVXA 3H4ZA 4F31B 2CMOA 5ICTA 4FATA 2GFEA 4FEBA 4OETA 1ZKBA 3KOSA 4H5FA 5KDTA 3R26A 4HW8A 3IL1B 3TEPA 1B7HA 3L6HA 3EHTA 3TCHA 3RN8A 4AB5A 2PYYA 4JXIA 3W9VA 3TELA 3PUWE 5IKBA 5I57B 4OZ9A 3CFLA 4G68B 1FQAA 3LSWA 4PFUA 3U72A 3PMWA 3VVDA 4I62A 1A40A 3CIJA 3CSBA 3DLNA 4QFLA 2I6EA 2X7PA 1NMUA 2R9JA 1SI1A 4OWDA 1D9VA 1Y3PA 3DM0A 4IO3A 1B4HA 2PVUA 3IB2A 2DE4A 2REGA 3TQWA 3ILUB 4GVOA 1XHYA 1AOVA 3PPPA 5AA3A 3H06B 1UTHA 1GVCA 2NXOA 4PETA 1ZTYA 1ANFA 1MXWA 4TQUQ 3KSJA 4NF4B 4G8HA 4EQBA 4ZE9A 1JVXA 2ZXTA 4YKIA 3EPEA 4QHQA 1XS5A 1R9LA 1Z7NE 1OIBA 1JEUA 4Q8RA 2AYSA 2B65A 1MXXA 1IXHA 4NWCA 3MC2A 3TTMA 1DPPA 1I6BA 2BJJX 4OQOA 3SEUA 2D5WA 2V3TA 3HPIA 3S9LC 2F7CA 1URGA 2RC7A 3TODA 4F2OA 5EYFA 5I56A 5F1QA 1UTHB 2VD2A 2VOZA 3K1PA 3VFJA 4X48A 3IAZA 4YMBA 1OVTA 3D4CA 1EU8A 4ZEBA 4ELQA 2OWSA 3RPWA 3DP6A 1R9QA 2R71A 4C1UA 5FHOA 3OELA 1USYH 2PBWA 4MH5A 3EHSA 4NF8A 2UVIA 1SDXA 1MXVA 1IEJA 4DIGA 3V89B 3TUSA 2YLNA 4ZS9A 3S9EA 1UIUA 3T9XB 2O7IA 1A8EA 3N94A 4I1DA 4ELRA 4EF1A 5I56B 1DTZA 2Q8JA 1JVYA 5H8HB 4M4GA 3L6GA 4H65A 3V8XB 4E0WA 1H45A 3RUMA 4RA1A 4R6HA 3FVKA 2I3WA 3UGWA 2Z23A 4F3PA 4DLDA 4OHNA 4ZE8A 3I3VA 2D21A 1RYOA 4MBPA 3MPKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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