1MM6A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of activation and selectivity in a ligand-gated ion channel: Structural and functional studies of GluR2 and quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm6A01
1MY2A 1DPPA 4HW8A 2UVHA 2OBGA 2FNCA 1DMBA 5CC2A 4JWOA 1JETA 1B32A 3ECRA 3F11A 4QF9A 3FJ7A 2IEEA 3T93B 1XVYA 1MXZA 3EF7A 5I58A 4GFRA 3MZ9A 4LZ7A 3L6GA 3L6HA 1ZJLA 3KZGA 4EUOA 2HZLA 2XXUA 1JVXA 3U94A 1SBPA 5K2XA 2CMOA 2YJPA 1DTGA 4KHZE 1VSOA 3OEMA 4XTCQ 3TCFA 5B70A 2Z8DA 1ZIUA 1EZPA 3CFXA 1FQDA 3K6WA 3C9HA 4HCYA 5L9OA 1OVBA 2R9JA 3ILTB 5FHMA 1M5CA 4GF8A 3PUXE 1IZ1A 5TPAB 4BDQA 4FAJA 4QFOA 2P2AA 1LAFE 2O68A 4ZEDA 3K1PA 3K00A 1N7WA 4LP2B 1MXWA 2ESNA 4ND9A 1MXUA 5A5XB 1PC3A 4I9DA 4F29A 1OIBA 1D9YA 4ZEBA 4MLVA 5L9SA 2NOOA 1SW2A 3CSBA 4OXVA 3KN3A 2RF1A 3BBRA 2Y7PA 3KJ7A 3Q26A 3K2DA 4JB7A 3SEWA 5J1DA 4F18A 1QVSA 3KOTA 3SEVA 2OLBA 5AE4A 4F1UA 2DXRA 3TAJA 2O84X 2HXWA 2HAVA 1J1NA 1N0TA 1B52A 1DSNA 4G2ZA 3G3GA 4JXIA 5TU0A 1URSA 1O7TA 1FQEA 2XD2A 4QFPA 3T96B 4IO4A 2ZNTA 3IOVA 3MVZA 3U72A 3B6TA 2V93A 3TDJA 3SEXA 2QL3A 4JSOA 2ZYOA 4FJPA 2E1SA 1NH7A 4C0RA 4P0GA 2QS1A 3KSJA 3R26A 4R9FA 4BLAA 3C34A 3HSTA 3MP6A 1N3XA 3TODA 1XVXA 5KCJA 2YLNA 1B3LA 3BKIB 4YB5A 2H99A 3H7MA 1JEVA 2OWSA 3V89B 4RY1A 4H67A 3DP4A 3T9HB 1P1NA 2THIA 1RYOA 3G3FA 5DEXB 3FJMA 4IB2A 5I58B 2QPQA 5EHSA 2G93A 1LAHE 3H03A 1S9TA 2O51A 5H8HB 1SDXA 1ELJA 2P0SA 4OERA 2H25A 2D21A 4F3PA 3U1OA 1KWHA 3IO4A 4PE5B 3O66A 4OZ9A 2UVIA 4ZECA 2UXAA 3R7XA 1FCKA 1IXCA 4E0XA 4F1YA 4BDNA 4DCXA 4RK9A 5DVFA 2V84A 3HCQA 2HCAA 1BLFA 1B1HA 1MQGA 1EZOA 3M3LA 4PFTA 3EPEA 3K4UA 1MQIA 2YPNA 2QS3A 2O1LA 2I0BA 2DWHA 1YAEA 1PB7A 4MBPA 4YMBA 4IGRA 4JWXA 3UGWA 1NNTA 2A5SA 4F19A 1HSLA 1R1NA 5I56A 3RTFB 3T22A 2PT2A 3DM0A 2F6PA 1POY1 3UK4A 3N94A 2RCBA 4ELOA 4U23A 3O6GA 5KZTA 3QK6A 4Z0IA 2HQ0A 5LOMA 1B3GA 2RC7A 2Q8JA 2OCUA 1GTKA 2H98A 3IOWA 3O97A 1B0LA 4YB7A 3EN3A 4QSDA 1LCFA 3MC2A 1A7LA 2ANJA 1P1WA 3K6VA 3QUJA 3S4UA 1MRPA 1XOCA 3IO6A 3VVFA 2RKMA 5DTBA 3SDFA 5H8QB 5ITOA 4HCWA 2HAUA 2ZYNA 4IY6A 1QULA 5KCJB 2XD3A 3SETA 3M8UA 3OSQA 1WDNA 3U93A 3P7IA 1MS7A 2I6EA 4ZE8A 3V5AA 4BDRA 4KR5A 4ESXA 2D5WA 4LONB 3N5LA 2ZNSA 4H8IA 3TFLA 2XX8A 1MM7A 1GGGA 3QSLA 3FD3A 4F31B 3PU5A 1NNKA 4HS7A 2R6GE 4OEVA 3V83A 5TPAA 1RYXA 1JVYA 3RY3A 1LAGE 2B3FA 2AL4A 3HO7A 3EHTA 1ANFA 3VLVA 4N13A 2O1MA 3GBAA 3UIFA 3HV1A 2VD2A 1B3EA 2UYEA 5CBRA 4G8HA 4I62A 1SQYA 4GL8A 3MW0A 4XKPA 1XT8A 1IEJA 2VD3A 4PQJA 4O3AA 3ONMA 1LLSA 3T9VA 1BIYA 3MZ1A 3OO6A 2RC8A 3PUVE 1JEUA 1M5DA 2H4IA 1URDA 3MAMA 1UTBA 3TMGA 1F9BA 2PYYA 1R9LA 3IJXB 2Y84A 1AH5A 1OVTA 1D9VA 2UVJA 1BKAA 2XXIA 1FQFA 3OMBA 3PPNA 1A54A 4NMYA 5ISUA 4QSCA 4QFLA 4H6DA 1AMFA 1SW1A 2F97A 5I57B 1MM6A 2V3QA 4OMBA 2Z8EA 3H06B 1SI1A 3H3GA 2F36A 3TYHA 4ZE9A 4Q0CA 2ABHA 1IIWA 1A8FA 1Y9UA 5I2KB 4TQUQ 4U4SA 4H5FA 1MPBA 1CB6A 3LSXA 4X1BA 4GL0A 3A09A 5ITPA 2PX1A 2PVUA 4QHQA 4U1OA 2QS4A 4IO3A 5DEXA 4JBZA 4GQOA 1US5A 5H8HA 1US4A 3QYTA 4YKJA 2HZKA 4JSDA 4GLIA 5AA1A 5KDTA 3RUMA 3MP8A 1Y4CA 4I8CA 2GFEA 1ZU0A 4IO2A 4TLMB 1TWYA 2OWTA 2ONSA 4DIGA 3CRBA 4FATA 3IB0A 4OWDA 4OFLA 3OSRA 1SYIA 1QW0A 3C32A 1USYE 4NTLA 1QUJA 3PPQA 5TP9A 3B7DA 3D4CA 4FEBA 4BDOA 3C33A 4XKQA 3PPPA 5DYHA 1UIUA 2O7IA 3PUWE 2IA4A 3TTRA 4ZEFA 3PD8A 1OQGA 4EF2A 4IO6A 3N6TA 1TXFA 2P1SA 1B5IA 2F78A 3MUQA 1B9JA 1H45A 1P99A 4NF8B 1LBBA 1NL5A 3JZJA 1H3DA 3U8QA 2F5XA 3G3JA 3KEIA 2O6AA 4DXBA 4GOTA 1UTBB 3TCGA 1FTKA 2DE2A 1Z7ME 5CMCA 1FTLA 2Q89A 1IQ7A 5BWJA 3VXCA 1PB8A 3EHSA 2H5YA 4LQ2A 3RLFE 4LZ8A 4LZ5A 2GHBA 1NNPA 4FORA 2NWJA 4MH5A 1A55A 1Y20A 5I59A 5ICQA 4H5GA 1VFDA 4U4XA 1P1UA 4F1VA 3O6HA 2I3WA 5H8QA 3BFTA 1MY0A 5JTYA 2ZXTA 3S2VA 3FV2A 3B6WA 4ESWA 3KG2A 3Q28A 3HHFA 3M3KA 1JW5A 3TTKA 2ONKE 4QFNA 1B1XA 4GWOA 1LSTA 4EDPA 1N76A 4KCCA 1N3WA 5H8SA 2GRVA 4Q5TA 4Q8RA 4GRKA 4O3CA 3VLUA 3V8XB 3RN8A 3OD7A 4R73A 4F2OA 1NMUA 3CG1A 4WXJA 4K3FA 5KDTB 2UVGA 5F1QA 3S9MC 1N7XA 4LUBA 4ISUA 2PBWA 2Z23A 3UP9A 2XXYA 3E9XA 1IITA 4KFQA 1QUKA 5IKBA 1B7UA 4GXSB 4U2RA 1NFTA 3THIA 4EQ7A 1S50A 1YTVA 2M8CA 4IGTA 1LB9A 4KD5A 2QRYA 4IO7A 5CMKA 4MLQA 3G3KA 1P1OA 5TP9B 5F7VA 2Q2CA 4WEDA 1LFIA 1IUDA 3FVNA 3C35A 3MVXA 3VLWA 2I4BA 2XXHA 3N6UA 2B65A 4FECA 5L8DA 4POXA 4PFUA 3QXMA 5BUUA 2DXYA 4C1UA 5HPQA 1NH8A 4UACA 2ZYKA 2Q2AA 3KJTA 2REGA 1LAXA 4ONYA 2UYFA 2NVUB 5I84A 1GR2A 2Z8FA 4R2BA 4GD5A 1HSJA 4OESA 4YU0A 5AA2A 1IXGA 4H1XA 1TT1A 1A40A 4PFYA 4DE8A 3K6UA 4OFJA 3PV0E 3IJOB 4YMAA 4IO5A 1PB9A 4X48A 4OVJA 1LCTA 3MZBA 3ZKLA 3FGSA 1PEBA 3PUYE 1FQCA 1SD3A 5I57A 3VVEA 1B3FA 2W7YA 2HEUA 2F6GA 4R6YA 3FJGA 3E4RA 4KYEA 3KOSA 5I59B 4G8NA 3I6VA 3VXBA 5I2KA 3JV9A 2DQVA 4R75A 2VHAA 1SI0A 4YZZA 3MJNA 5JTYB 3IORA 1YCJA 3OEKA 4G68C 4FEDA 3PPOA 2DVZA 3E3KA 1MPCA 3C4MA 4EXLA 3W9VA 2DOJA 4ZEIA 3FXUA 4G77A 4G8MA 1EU8A 3KSXA 4ZZEA 3DP8A 4GXAA 4MF3A 1OQHA 1ZKBA 4H65A 4E0WA 1YPNA 2RCAA 3MWBA 3LSFB 3H6UA 5B7DA 4G68B 2A5TB 1JQFA 4OTEA 2QJEA 2OZZA 2DP8A 1B7HA 3UA8A 4GIZA 1FQBA 2QS2A 1MY3A 3G7WA 1MPDA 4ELPA 3PMXA 3OO7A 4ELRA 1IXIA 5ELVA 4GVOA 2F7BA 3MPLA 1N04A 4U21A 3MPKA 4U22A 3Q27A 3USDA 1EH3A 4LATA 3FZVA 3O28A 1MDQA 3G3IA 2GHAA 5EHMA 1Z7NE 4KYSA 3FXRA 4NF8A 2R71A 1POTA 3H4ZA 1MG1A 3RGYA 1D3KA 1B2HA 1ZLQA 1I69A 3RPWA 4NF5B 5AA2B 3HPIA 3JYRA 5AA4B 1QKBA 1I6BA 1PDAA 3GBBA 4ZDMA 3FUZA 3H6TA 1P1QA 1VFEA 3KFMA 3SEUA 4RYAA 1ATGA 1B3HA 5H8FA 3CR9A 1D4NA 2DWJA 2ZMBA 3TTLA 3GXAA 3W15C 2Q9TA 2Q88A 2DWAA 1H43A 4EQBA 3IK6B 4RPOA 1AL3A 1EZ9A 1I6AA 3PD9A 4RA1A 1JNFA 3EHUA 4RPNA 4PFWA 4R72A 2CZLA 2Y7WA 1SVXB 3U92A 1CE2A 2Z22A 1MY1A 3FXQA 4OEUA 4R6KA 3KN8A 1ZMGA 3ILUB 5DVIA 4OETA 2XXRA 1Q1KA 3CSGA 3PUZE 1LB8A 1MH4A 4OHNA 2OJTA 5IAIA 3TZAA 4P11A 1XHYA 1R9QA 1A8EA 3SERA 1O63A 4LA9A 4F3GA 2V3TA 2I4CA 4ZZAA 1B46A 4OFOA 3PMWA 2AYSA 3CG3A 3ODBA 3VV5A 3TTMA 1S7YA 2NXOA 3A3CA 4M4GA 3VVDA 4YICA 4EXKA 1OLCA 2H9BA 4R9GA 1FTOA 1ZTYA 3LC8A 1MQJA 2VGQA 2B3BA 1N84A 4TOZA 2XXVA 4R2FA 1Y4TA 1MQDA 1Y3PA 5CI5A 1WODA 2XX7A 2FA7A 1NNFA 3TELA 1B40A 4HTGA 2Y7IA 5EYFA 1JW1A 3OXNA 3S9NC 1HSEA 2VP1A 1H76A 1VR5A 4JDFA 4NWDA 1UTHA 3C31A 4KYDA 3T9UA 2DVCA 3OELA 4NWCA 3VDFA 1M5FA 2AIXA 3MBPA 2DE3A 2ONRA 4N6PA 3DLNA 3LSLA 2KLFA 4NE4A 4YB6A 3VE1B 2RC9A 3QIMA 1OLAA 4IY5A 2BJJX 4NF4B 1I6QA 2ALUA 4XIGQ 1QUIA 1B58A 2I48A 1Y1MA 1OMPA 3A3UA 5HM4B 1R6ZA 4BDMA 1MXYA 5CBSA 5H8FB 1IXHA 2D3IA 3WAFA 5FHNA 3H6VA 5FHOA 2GH9A 1GVCA 1UQWA 3KBRA 5K2YA 1II5A 4YKKA 4NF6B 1MDP1 2ZNUA 4H8JA 3I5OA 2XXWA 2F7AA 3GLBA 4XKRA 3MQ9A 4R6HA 1SW4A 2WKYA 4YKPA 3O2AA 2OK2A 1Y1ZA 3FVKA 3RQTA 3VFJA 1LFHA 3LBSA 1FQAA 5H8NA 4L17A 4DXUA 2NUVA 3IR1A 4UA8A 1B51A 1AIVA 3IX1A 5ICTA 3O29A 2I58A 1B6HA 3DP6A 3FVOA 3IOTA 3K1MA 4DLDA 3GZGA 1ZBMA 4X1DA 3I3VA 3RT6B 4G68A 2A5TA 4Z7EA 2XXXA 1LFGA 3IB1A 4XXUA 1O64A 1JW4A 2ZYMA 1Y3QA 3FATA 3ZSFA 1DTZA 3C36A 1B4HA 1B5JA 1T0KA 5CMBA 1H44A 5L9MA 3EQ1A 1B4ZA 3G3HA 3B6QA 3M3FA 2F8DA 2FYIA 3ZS6A 1UTHB 4QFKA 4THIA 2X7QA 3OO8A 2X26A 2QSXA 4QSEA 5FTHA 1AOVA 2F34A 2DYXA 1USYH 1B0HA 3E13X 4KI0E 3OOAA 3IL1B 3IB2A 4NF5A 3CVGA 3ZKKA 3TUSA 2LAOA 5AA4A 3MVYA 3OENA 3IAZA 3TPAA 4RJZA 1GV8A 5CM6A 3SESA 4YKIA 3Q25A 3RNNA 1UIVA 4WKMA 3CFZA 4C1TA 4N07A 3H6WA 2XXTA 3PMVA 2F35A 4ELQA 3Q29A 3RT8A 5DT6A 1B05A 1RKMA 3RTWB 4KQPA 3KGCA 1B7ZA 1MH3A 2XX9A 1Y3NA 2XXQA 1MY4A 2DE4A 3KN7A 2DWIA 2Y7KA 2QMWA 1FTJA 4P0IA 3SKPA 3FV1A 1BP5A 4F3SA 3BFUA 4H0WA 5I2NA 1PBPA 1QJMA 3O6IA 3TKDA 3K02A 2VOZA 3W9WA 4F22A 4PETA 1FW0A 4ZEKA 4DXCA 2F7CA 2O69A 5CMMA 1L5TA 2O7UA 2PMSA 4EQ9A 3LSWA 1B5HA 1URGA 3TQLA 4AB6A 5H8NB 3FVGA 2V3UA 2RINA 3FASA 5JEIA 3OO9A 5JK4A 3CIJA 4WEPA 3R6UA 1VE4A 4XKNA 4LQ5A 4PP0A 3WAEA 2PT1A 3TCHA 4LVQA 3PPRA 2I3VA 4POWA 3TQWA 4AQ4A 2E0SA 1Q35A 3T66A 1SYHA 3K01A 1M5EA 2G29A 3TEPA 2DS9A 5FTIA 4BDLA 3LUYA 4NEDA 2XHDA 1LBCA 2DSFA 4F3BA 4RXLA 2I0CA 2XXPA 2AL5A 4FE8A 4DZ1A 4FIMA 4MFIA 1DPEA 4YAHX 1M5BA 3MP1A 1LGBC 3UN6A 4F39A 4EF1A 3CFLA 4ECFA 5A5XA 1QKAA 5CRYA 3S9LC 2HFBA 3K1NA 4RK2A 4DCYA 4O3BA 2Y7RA 2V25A 4NF4A 4R74A 3D4GA 3PGFA 3N26A 3TTNA 3K6XA 1MXXA 5AA3A 3HHGA 3QUFA 1WVJA 3FIRA 1MQHA 3MVWA 1PBQA 3T9XB 3SEYA 4DDDA 2I49A 4OYVA 5I56B 5DVJA 1TFDA 3O9PA 4NF6A 2QMXA 1TFAA 4KPTA 4I1DA 4X9TA 1FTMA 3K0VA 5M2VA 4TLLB 1XS5A 4QRZA 1MXVA 2X7PA 1BTJA 3CI8A 3LR1A 1A99A 1DOTA 3AXFA 4U1ZA 4M1VA 2REJA 5AA2D 1XC1A 5I2NB 4RNSA 3HN0A 4OQOA 1NKXA 4G4PA 3S9EA 4ZS9A 3IOUA 4F2QA 1SW5A 4KCDA 4JWYA 4OENA 3QAXA 4Q30B 4AB5A 3UORA 5HBCA 3DELB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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