1MM7A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a zinc crystal form at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanism of Activation and Selectivity in a Ligand-Gated Ion Channel: Structural and Functional Studies of GluR2 and Quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A01
1JW1A 1LSTA 2DE3A 4F19A 1Y4TA 2UYEA 1B4HA 3IX1A 1B3LA 2R6GE 2G93A 4ZZEA 4C1UA 3H7MA 2O69A 1EZ9A 2O51A 4F31B 3GBBA 2I3WA 1TT1A 4ND9A 3RPWA 2PX1A 4DIGA 1YCJA 2XXRA 3C36A 3O6HA 2P2AA 4X1DA 3K6UA 3IJOB 1URGA 3KJTA 3EF7A 4R74A 3LSLA 1WVJA 2QMWA 3VLUA 3U92A 4G68B 3P7IA 2DYXA 1H76A 4U21A 1VR5A 4FORA 3U1OA 4OTEA 2ESNA 2PVUA 1ZTYA 3T9VA 2I0BA 1Q1KA 4FJPA 4MLQA 4ELOA 2RCAA 4QFKA 4E0WA 4EDPA 3V89B 1QUJA 1MQDA 4YU0A 2XXQA 3HV1A 3UP9A 4X9TA 3KN7A 3A3UA 1P1QA 1T0KA 3N94A 2VGQA 2OBGA 3UK4A 2Y7PA 1LBBA 4U4XA 4F3BA 1MDQA 1XVYA 5CMKA 4WEPA 2RCBA 4DDDA 1MQJA 3UA8A 2PT1A 3JYRA 1ZJLA 2NWJA 4G8MA 1P1WA 5L8DA 2R71A 1R9LA 5H8QA 4F1YA 1HSLA 2UVIA 2O7IA 2QS2A 4O3AA 4MH5A 5AA4B 5TP9A 1Y20A 3HSTA 5FHNA 2OWTA 5ISUA 1MG1A 4Q8RA 1MY4A 3TYHA 4RYAA 4C0RA 3QK6A 5FHMA 2R9JA 3OENA 1DPPA 4EXKA 3T22A 1KWHA 1B3HA 1A99A 4KI0E 1LLSA 3TEPA 4GWOA 3N6TA 5ITPA 1F9BA 3FV1A 2QJEA 2OLBA 3WAFA 5ICQA 3HHFA 4N07A 1USYE 3FZVA 3DLNA 4POWA 2O68A 1H45A 1JVXA 1QW0A 1P1OA 4NF6B 1N0TA 2H25A 4GOTA 1B6HA 3Q29A 1JEVA 1NH7A 1PBPA 2GH9A 3OSRA 1SDXA 1TFAA 1OLAA 4LZ5A 2Z8DA 4RXLA 5AA1A 4O3CA 4HS7A 4H5GA 2UXAA 3DP6A 3QAXA 3PD9A 4MBPA 1S50A 4DLDA 4FIMA 1B58A 1P99A 4XKNA 5B7DA 3JV9A 1SYHA 4QSEA 3CFXA 4U4SA 2A5TB 4OQOA 3C33A 4OFJA 2ANJA 2ALUA 2XXVA 4YICA 3RQTA 4X48A 3UORA 4H6DA 4WKMA 3TELA 4H65A 3CRBA 1QJMA 3H3GA 4QFOA 3EPEA 5H8HA 4L17A 4DCYA 2DWJA 3VLVA 4OEUA 3DM0A 1NNTA 3E13X 3S9LC 2F8DA 2VD3A 2Q2AA 1AL3A 4H5FA 4OFLA 2THIA 4NEDA 2NUVA 3BFUA 3V5AA 5L9SA 2I0CA 3TKDA 1MXUA 4TOZA 1D9VA 5DEXA 5CC2A 2H99A 3TTRA 4RY1A 2QS4A 3FVGA 4WXJA 3PUZE 4F2QA 3B6QA 1LAHE 1UIUA 3BFTA 2O84X 2Y7WA 1VFEA 4H67A 3MP1A 3MZBA 3N5LA 3M8UA 1Y9UA 2OZZA 1B3EA 4G68A 4XXUA 2Z8FA 1H43A 1MH3A 3F11A 2NOOA 1N84A 3T66A 4F3GA 4BDMA 3MQ9A 2AL5A 4H8IA 4GXAA 1IXGA 4XKQA 5CMMA 1RYXA 3VV5A 1MPBA 4QF9A 2REJA 4ECFA 1OVBA 1US4A 1SW1A 3MVWA 3KG2A 4LA9A 3K00A 1Y1ZA 2V3QA 4MF3A 4RA1A 1JEUA 3U72A 2REGA 2AYSA 2HZLA 4ISUA 2XXIA 2AIXA 4Q5TA 3TCGA 3PUXE 1ZKBA 3VE1B 4YB6A 5AE4A 1D4NA 1SI1A 1QVSA 2HFBA 4DCXA 2AL4A 4F1UA 3VXCA 5F7VA 2FA7A 5AA4A 4DZ1A 4FECA 3U93A 2XXTA 3MWBA 3SERA 5I56A 4LONB 4TLLB 1NL5A 3FJGA 2XD3A 4G8HA 3S4UA 2X26A 2QS3A 2I58A 3MC2A 4P0GA 4KQPA 3C4MA 1NFTA 3RT6B 2YLNA 1O7TA 2OK2A 1A54A 4U22A 4ZEIA 4KCCA 3ZS6A 1WDNA 1JETA 4G2ZA 1UTHA 4R6HA 2RINA 3G3GA 1RYOA 4R6KA 4IB2A 4ZE8A 4JWOA 4RPNA 5DVFA 4OFOA 3K6XA 2YPNA 3ECRA 2I4BA 5AA2D 1R6ZA 4PFYA 4R75A 2V25A 2OWSA 4XKRA 3IK6B 2Z8EA 3IJXB 5CBRA 4HCWA 3DELB 2O1MA 4NF8A 4GD5A 5KDTB 3IL1B 2A5TA 4YKKA 5DYHA 3CG1A 5I2KB 4F29A 2V84A 4N6PA 4U1OA 2CMOA 4BLAA 1A8EA 3OO7A 4DXUA 3LR1A 3BBRA 5KCJB 1B51A 1QUKA 1P1UA 3MZ9A 4ZEFA 1Y3NA 2Q2CA 3FXRA 3OEMA 3FD3A 5CMCA 1OVTA 2HCAA 1I6QA 2HZKA 3C9HA 1I69A 4F3SA 4QSDA 2WKYA 4G68C 3IORA 3V8XB 4LATA 2F97A 4PFTA 4ESXA 3KFMA 2NXOA 3AXFA 4NF4B 3TQWA 1OQHA 3C31A 3V83A 4WEDA 2O7UA 5H8FB 5L9MA 1OMPA 3U94A 2F36A 2DP8A 3GXAA 4LUBA 1N7XA 5ITOA 2I6EA 4NMYA 3D4CA 4JSDA 2DOJA 1CB6A 2QS1A 4UA8A 3IOUA 3B7DA 3TCHA 4I9DA 1LAFE 2H4IA 3OEKA 4PETA 3TDJA 1MXYA 4IGRA 1FW0A 4N13A 1VE4A 3A09A 5J1DA 1MXZA 4IGTA 2XX7A 4JXIA 3QIMA 3MAMA 1PC3A 3MVXA 1H44A 3U8QA 3FATA 1NNFA 1YAEA 2F6PA 5I57A 4G77A 1B52A 3TTMA 4ZS9A 4I62A 2XHDA 2ONSA 3ONMA 3W15C 2ONRA 2IEEA 2VD2A 5LOMA 1TFDA 5I58A 2XXWA 3TTNA 2G29A 2KLFA 1MH4A 5CM6A 1O64A 4TLMB 3IR1A 5DT6A 4OVJA 4C1TA 3PMWA 1MPDA 1N76A 4FE8A 1QKAA 2Y84A 3G3FA 5AA2B 2BJJX 2FYIA 1N04A 3K0VA 5DVIA 3LBSA 1HSJA 2UVGA 3SKPA 1UTBB 2HAUA 2V93A 3H03A 4YMBA 3C35A 2GHBA 4U23A 4XKPA 4JBZA 3CFLA 3O9PA 3UGWA 4IO2A 3ILUB 4K3FA 2F35A 1B40A 3CIJA 5IKBA 1A7LA 3FVKA 1FTJA 2XXPA 5EHMA 1XC1A 3KSJA 1DSNA 3QUJA 1IXHA 5DTBA 3HO7A 3RNNA 2IA4A 2DSFA 4XIGQ 3IB1A 5AA3A 1B7UA 2HQ0A 3TZAA 3CR9A 4NE4A 3M3KA 4E0XA 3O97A 3QXMA 1LGBC 2ZMBA 1FTOA 1Y1MA 1B5JA 3IOVA 2F5XA 1B7ZA 2DS9A 1LFGA 1BIYA 2HEUA 4GL8A 3I5OA 2F34A 3M3FA 4YZZA 3O66A 5KCJA 4IY6A 5FTHA 1XOCA 2XX9A 3W9VA 1ZMGA 2I49A 4GRKA 3MVYA 4EF1A 4NF5B 4HCYA 4JSOA 1LAGE 4XTCQ 3O2AA 4ZEKA 5CMBA 3I3VA 3LSFB 1SVXB 3K1NA 1Y4CA 4ELPA 3ZSFA 2ZXTA 4DE8A 4BDNA 3O28A 1FTKA 3MP8A 2M8CA 3MPKA 2DQVA 4PE5B 4NF4A 1N3XA 3PV0E 3O6GA 4JDFA 3VDFA 4IO6A 4KPTA 3H6UA 1Y3QA 2ZNSA 4AB6A 4OETA 1QULA 4RNSA 3MBPA 1US5A 2DXRA 4GQOA 1GTKA 3D4GA 1TWYA 1AIVA 4LZ7A 4R2BA 2Q89A 1YPNA 4OZ9A 4IO5A 3PPQA 4KHZE 4MFIA 3QSLA 3FUZA 1B1HA 5JTYB 4GF8A 4FEDA 3LUYA 3Q25A 4HTGA 2ABHA 2A5SA 3PUVE 5K2YA 3KSXA 4LQ5A 3ZKLA 1M5FA 4GXSB 4EUOA 2VOZA 3FXUA 3FJ7A 3RTWB 2Z22A 1B5HA 4H1XA 4OERA 2XXXA 3OD7A 3FJMA 1SW5A 3RT8A 3HN0A 1I6AA 1GR2A 1B4ZA 3EQ1A 1EZOA 2HXWA 1NNPA 5I2NB 3CI8A 2Y7KA 4I1DA 1MY2A 4ZECA 3RN8A 2PYYA 3S9MC 1USYH 3CSBA 4YKJA 4R9GA 3H6VA 4KCDA 3OO6A 1MS7A 3C34A 4X1BA 1QKBA 2F78A 1MQGA 1DPEA 1FTLA 4PFUA 3TODA 2F6GA 3OMBA 2F7BA 1BKAA 1MY1A 5AA2A 3SEXA 1DTGA 3PUWE 1N7WA 3PPNA 2O1LA 2F7CA 3K02A 3E3KA 3PMXA 1UTBA 3A3CA 4OHNA 1XT8A 1J1NA 1L5TA 1O63A 4EQ7A 1A40A 5IAIA 2I48A 1MY3A 4F18A 1GVCA 4KYDA 3C32A 1WODA 3PPPA 3PUYE 3H6WA 1PB9A 4JWXA 1XVXA 1DMBA 4G8NA 2UVHA 2HAVA 2QPQA 3RY3A 3MP6A 4RPOA 1MXVA 2H98A 3OO9A 4NF6A 4ESWA 3MPLA 3IB0A 3E4RA 1B05A 1BLFA 1DTZA 1SQYA 4R72A 3R7XA 1M5DA 4IO4A 3TCFA 3R26A 2V3TA 3N6UA 2XXYA 5F1QA 3PD8A 4QSCA 1JW5A 1SW4A 4QHQA 5EHSA 2E1SA 3O6IA 2VP1A 1TXFA 4GIZA 3SEYA 1FQBA 1M5BA 1RKMA 2RC7A 2I4CA 3TQLA 3SEWA 2X7QA 4POXA 4NF5A 1R1NA 2RF1A 4R2FA 3FXQA 3KBRA 1GGGA 4LP2B 3VVFA 3RGYA 2Q8JA 4QFPA 1NKXA 4I8CA 1BP5A 3T96B 1S7YA 2QSXA 1POY1 4FAJA 1IEJA 3SDFA 1VFDA 3TAJA 4UACA 5A5XB 4EQBA 4LVQA 4YAHX 4ONYA 4BDLA 3M3LA 2DXYA 4G4PA 1NNKA 4YB5A 2OCUA 3IO6A 5H8HB 2ZYMA 1II5A 4FATA 3HPIA 1ANFA 4YKIA 2VHAA 4QRZA 3TMGA 4OENA 3TTKA 1UIVA 4F3PA 3S2VA 1PEBA 2B3BA 1B3FA 3I6VA 5FHOA 3SETA 5JTYA 4JWYA 1QUIA 3GZGA 2DVCA 3UN6A 3H6TA 3IAZA 3VVEA 5DEXB 4P11A 4O3BA 5HM4B 2Q9TA 2XX8A 1A55A 3TUSA 2E0SA 4YMAA 4F39A 1M5EA 2QL3A 1PB8A 1MY0A 1MPCA 3G3JA 3WAEA 2DVZA 3MZ1A 4KD5A 2DWHA 1AOVA 4NWCA 4NWDA 2Y7RA 1PBQA 3KOTA 3THIA 3B6TA 5I2NA 5JEIA 1GV8A 1FQAA 4R6YA 5M2VA 5BUUA 3DP8A 3H06B 3L6HA 1LB9A 1FQDA 5DVJA 3L6GA 3JZJA 1IXCA 3KN8A 3MW0A 1B9JA 3O29A 4RK2A 2ZYNA 2GHAA 4OYVA 3K6WA 1EZPA 2ZNUA 3TPAA 4R73A 4BDRA 1LFIA 3CG3A 1SW2A 4QFNA 2F7AA 1IXIA 1FQCA 5H8NB 1IUDA 1D9YA 4ZZAA 1FQFA 4R9FA 3UIFA 3USDA 5B70A 5FTIA 4OMBA 4OXVA 4OEVA 4KFQA 4Q0CA 2DE2A 2PT2A 5ELVA 2Q88A 3OSQA 4EF2A 3VXBA 4AB5A 1AMFA 2H5YA 3LSWA 1B2HA 1SI0A 4M4GA 3K2DA 3VFJA 1NMUA 1URSA 3IO4A 5I56B 4OWDA 4Q30B 3MUQA 2LAOA 2H9BA 4YKPA 5EYFA 3KEIA 3CSGA 4BDQA 3OELA 3PPOA 1ATGA 3BKIB 1Y3PA 3FGSA 3Q27A 3MVZA 1HSEA 4THIA 1JVYA 3K1MA 1B1XA 3VLWA 4AQ4A 2ZYOA 1UTHB 1LCTA 3E9XA 1R9QA 2XXUA 1POTA 5KDTA 4IY5A 4FEBA 5I2KA 4TQUQ 1IZ1A 4LQ2A 3FVOA 1MXWA 3SEVA 1PDAA 3G3IA 1MDP1 4OESA 1AH5A 4ELRA 1B46A 2ONKE 3TTLA 4F2OA 4ZEDA 3W9WA 4NF8B 3RUMA 5TPAB 4H8JA 2XD2A 1MXXA 4Z7EA 1ZLQA 1B3GA 1MQIA 1S9TA 3ODBA 2DWAA 1FCKA 4GVOA 4KYEA 1ZU0A 5A5XA 3SESA 2QMXA 4KYSA 1H3DA 2D3IA 3B6WA 4RJZA 2B3FA 1UQWA 1CE2A 3FASA 4RK9A 5H8FA 5KZTA 3FV2A 2UVJA 3K01A 5I59B 1IQ7A 4IO3A 2O6AA 2RC9A 1SD3A 1SBPA 1XS5A 2OJTA 3OXNA 1A8FA 5HBCA 3HHGA 4LZ8A 1N3WA 5L9OA 1FQEA 2DWIA 1JW4A 1MRPA 1OIBA 3KJ7A 5BWJA 3OOAA 1B0HA 3H4ZA 2D21A 1DOTA 1LFHA 3G3KA 4NTLA 4F1VA 2GFEA 2XXHA 4GL0A 1SYIA 2UYFA 2YJPA 3T9XB 3QUFA 4ELQA 2V3UA 3K4UA 2ZYKA 3LSXA 4EXLA 1B5IA 2GRVA 3PMVA 2W7YA 1ZIUA 3ZKKA 5JK4A 4GFRA 3PU5A 1BTJA 4F22A 2RC8A 3VVDA 1Z7NE 3R6UA 2RKMA 2D5WA 2PBWA 3EHUA 3PPRA 3TFLA 3T9HB 5I57B 1LBCA 5CRYA 1MM7A 5HPQA 3LC8A 2QRYA 1P1NA 3IOTA 1MM6A 3T93B 5H8NA 1IIWA 5CI5A 4P0IA 3Q28A 5I58B 4H0WA 4EQ9A 3G7WA 1Q35A 1ELJA 1VSOA 1B0LA 5ICTA 4ZDMA 2Z23A 3ILTB 1B32A 4MLVA 4IO7A 1IITA 2CZLA 5H8QB 2PMSA 3OO8A 2Y7IA 1EU8A 3EHSA 4ZEBA 1XHYA 4GLIA 5TP9B 3S9EA 1JNFA 3T9UA 2NVUB 2P1SA 3RLFE 3IB2A 1NH8A 4QFLA 5K2XA 3EN3A 1PB7A 1JQFA 3IOWA 5CBSA 2P0SA 4M1VA 3N26A 3KOSA 4YB7A 1LCFA 3KZGA 3PGFA 1ZBMA 3K1PA 5I84A 3GLBA 4KR5A 3KGCA 1URDA 1Z7ME 2B65A 2FNCA 3DP4A 1EH3A 2I3VA 3GBAA 3MJNA 1OQGA 3G3HA 3S9NC 1YTVA 4BDOA 1LB8A 3HCQA 4PQJA 1I6BA 3QYTA 3K6VA 3CFZA 3Q26A 4JB7A 5TPAA 3CVGA 4U1ZA 3EHTA 1LAXA 1FTMA 4PFWA 3KN3A 2X7PA 4U2RA 1M5CA 2DE4A 1OLCA 4Z0IA 3FIRA 1B7HA 4HW8A 4PP0A 3SEUA 1MQHA 5H8SA 2ZNTA 4DXBA 4DXCA 5I59A 4ZE9A 1D3KA 5TU0A 3FVNA 3RTFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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