1MPCA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA01
4QSEA 4IY6A 3S2VA 5I57B 1MXWA 1UQWA 1TFAA 2RC7A 3KFMA 2XX8A 4QSDA 3FJGA 5I84A 1B58A 3S4UA 1I6AA 1RYXA 3H6TA 1GVCA 3KGCA 4POXA 3K01A 3CI8A 4F3PA 1JVYA 5I58A 1OQHA 3RQTA 5I57A 2I3WA 1DSNA 4ZEBA 1N04A 4ZDMA 1XS5A 4QSCA 2V3TA 4MH5A 2Z23A 3TMGA 3JZJA 3EHTA 4N07A 1MQJA 1B7ZA 1FTJA 3Q26A 3TAJA 2GFEA 3S9MC 3EPEA 5DVIA 4PFTA 4DCXA 3VFJA 1N0TA 3FIRA 4KI0E 3FASA 1QUJA 1B4HA 5H8QB 4FAJA 4C1UA 1MPDA 1A7LA 2O1MA 4GFRA 3K4UA 2Q2AA 5CBRA 3GXAA 4OWDA 4Q0CA 2P1SA 1A55A 2Y84A 4P11A 3T9UA 1SW5A 2V3UA 5H8QA 3T9VA 4KR5A 3HV1A 3TEPA 3MVYA 1B7UA 2XXHA 3RNNA 1R1NA 2ZXTA 3RT6B 2XXVA 5I2NB 3KBRA 5FHNA 1IXGA 4IO7A 3SKPA 4TLLB 4QFNA 2I4CA 4YKIA 4RPNA 1XC1A 2OJTA 3EF7A 3F11A 1QKAA 5HM4B 3OMBA 3OEMA 5I2NA 1EZPA 5FTHA 3KSJA 3B7DA 5CI5A 2ZNUA 4OENA 2AL5A 3DLNA 3PPNA 4PE5B 4ESXA 4EQ9A 3T22A 4XKRA 4IO6A 3CFZA 3KEIA 2HXWA 3C36A 1URSA 3H3GA 5L8DA 3FVNA 2LAOA 4LQ5A 4U23A 5ITPA 4QFLA 3N5LA 3MVZA 3MUQA 1D3KA 1LCTA 3IK6B 3A3CA 2RCAA 1B5JA 3LBSA 2F6GA 2I0CA 2Z8FA 5I59B 2X7QA 4LA9A 1B4ZA 1QJMA 2M8CA 5J1DA 1R9QA 2XXPA 4LUBA 3TTLA 2GHBA 4O3AA 4P0GA 2DWAA 5TU0A 2XXWA 3PUVE 2F35A 4KYEA 5I59A 1EZOA 2Z22A 1A8FA 1POTA 4JWYA 2X7PA 4H65A 2QS3A 4IGRA 2OWTA 4Q5TA 3IORA 5FHMA 3K00A 1POY1 3G7WA 1QUIA 1FTOA 3B6QA 1BP5A 3PPOA 3CSGA 1B3LA 1IQ7A 2DVZA 1B2HA 2QS1A 3DP4A 5FHOA 3O28A 2F36A 2DWHA 2P0SA 1LAXA 3DM0A 1XVYA 2HZKA 3G3HA 5B70A 4F22A 1OVBA 3AXFA 4YICA 4EQ7A 4RA1A 1TT1A 3N94A 2F8DA 1JNFA 3SEUA 1PC3A 3HCQA 3IJOB 5H8NB 4BDOA 3G3GA 4KQPA 1XT8A 3CRBA 3PMVA 1AMFA 1MDQA 2FYIA 3IJXB 1B7HA 2OWSA 3SEVA 5H8NA 4OETA 2R71A 3O66A 5DEXB 1P1UA 4FEDA 1PBQA 4JB7A 4YU0A 3L6HA 1NNFA 4NWCA 4HCYA 3PPRA 2VD2A 1SBPA 2RC8A 2QPQA 4FJPA 5DEXA 3H6VA 1ZU0A 2HAUA 3UORA 3FXRA 1SI0A 1DMBA 3UA8A 2ALUA 2Y7PA 1B5HA 1HSEA 1DTGA 1MXYA 2DE4A 4EUOA 2O1LA 2D3IA 1A99A 1OQGA 1P1QA 2HQ0A 3WAEA 2ONKE 1NNKA 4GQOA 4IB2A 3H03A 1MY3A 3R7XA 4QRZA 4KCCA 3ILUB 1VE4A 1TXFA 2ONRA 4EDPA 5AA3A 3EHSA 4YB6A 3RTFB 4KD5A 2NUVA 3IB2A 1SDXA 1MH4A 2DWJA 4ND9A 2F78A 1LAGE 3TPAA 1XVXA 4QFPA 3U93A 1H3DA 1B32A 4EXLA 4U21A 4GOTA 3HPIA 5CMCA 4GVOA 1MRPA 3IB0A 4GL0A 3FV1A 3FGSA 3CG3A 4O3BA 1R6ZA 1TWYA 3CFLA 3IO4A 5K2XA 4GWOA 2OZZA 3BKIB 3M3FA 2VGQA 2DE3A 2Y7WA 4POWA 1ZBMA 4YZZA 1WDNA 3U1OA 2ONSA 4F31B 3K6VA 3ODBA 3PD9A 4JDFA 1ELJA 1NH7A 1UIUA 2DOJA 3MZBA 4YB5A 4I62A 4U4SA 2PYYA 4X1BA 1PBPA 1ATGA 2XD3A 4X9TA 3V5AA 3PUWE 1MY2A 2VD3A 4Q8RA 3DP8A 1QKBA 1VFEA 1M5FA 4OTEA 1PB7A 2B65A 1B5IA 3S9EA 1Y4CA 3HO7A 4FEBA 1FW0A 4FE8A 2H9BA 4JXIA 2F7AA 3VLWA 4DXCA 4OEVA 1IEJA 4HTGA 4UA8A 1Y1ZA 1URDA 2NWJA 3TCHA 4HW8A 4RNSA 4NF5B 3TTMA 2I48A 1R9LA 3SEYA 3SEWA 3N26A 3SEXA 1N7XA 1Y3NA 3D4CA 1SW2A 3R6UA 5EYFA 2KLFA 1GR2A 2REGA 2V3QA 1OMPA 2O68A 4OEUA 4BDRA 4NF5A 4R75A 2HAVA 1ZKBA 3LSWA 1MS7A 2YJPA 5M2VA 3PD8A 3KSXA 5ITOA 1MG1A 3U94A 4OYVA 4GLIA 3PMXA 3GBBA 3TTKA 4ZECA 5KDTA 3M3LA 5JTYB 1MH3A 4PQJA 1H45A 5DT6A 5I2KB 4MLVA 1OIBA 4OERA 1MQDA 2OK2A 3S9LC 1EZ9A 5JTYA 4ONYA 4OHNA 1CB6A 3RLFE 4ZEDA 5JK4A 1Q1KA 2CMOA 5CMMA 3TQLA 4KYDA 1JEVA 2V93A 4ELRA 2VP1A 5CC2A 3RT8A 3N6TA 4H8JA 1GTKA 3Q28A 1J1NA 2I6EA 5FTIA 4KCDA 3L6GA 2PBWA 3MWBA 2O7IA 1AOVA 3TUSA 4H67A 3LSXA 3U92A 1IITA 1B1XA 3VXCA 4G4PA 3W15C 5DVJA 4MBPA 1KWHA 4OZ9A 2UYEA 3I6VA 1LGBC 1JEUA 2FNCA 2H99A 2E1SA 2UVIA 3MAMA 5L9SA 2PX1A 1MY1A 2I49A 4HS7A 3W9VA 3I5OA 2QS4A 3OSQA 5ICQA 3PUZE 4DZ1A 4R9FA 1P1NA 1II5A 3UK4A 3MVXA 1B3GA 4LQ2A 1H76A 3T9HB 4BDNA 2XXXA 4ISUA 3QXMA 2QMWA 3T9XB 1RKMA 4THIA 3K2DA 4C0RA 1HSLA 1WVJA 3TODA 3IOTA 4E0WA 5F7VA 1JW5A 4ZE8A 1Y20A 2XXRA 3Q27A 3IAZA 3O97A 2F97A 5DVFA 3LR1A 1B9JA 1MPBA 3TDJA 4H5GA 5I56B 3PMWA 3H4ZA 4ECFA 4QFKA 3C32A 4XKQA 4RPOA 1LLSA 1FQFA 2RCBA 2I4BA 4R6HA 3EHUA 1TFDA 3E3KA 1EH3A 2XXTA 5ICTA 3CR9A 1O64A 4H5FA 2THIA 3CVGA 4ZEKA 2HFBA 3QSLA 1I6QA 4JWXA 4MLQA 1ZIUA 1Y1MA 2NXOA 1LBBA 4RJZA 3B6TA 5AA4B 1NMUA 3RGYA 3V8XB 5LOMA 1RYOA 1LFGA 2O69A 1M5CA 4EQBA 4R72A 2GHAA 4EXKA 3IOVA 4G8MA 1MM6A 3K1NA 5AA4A 5CMKA 4AQ4A 3JV9A 4XKPA 4L17A 1DPEA 3CG1A 3EN3A 3KOSA 4GD5A 4F2OA 1ZLQA 5A5XB 2PMSA 3H6WA 2UVHA 1IUDA 4JSDA 2NOOA 3ZSFA 1URGA 2Y7IA 5A5XA 1GV8A 4G77A 4U1ZA 2WKYA 4P0IA 3M3KA 4LZ8A 3O6GA 1H43A 4U4XA 4R6KA 1S9TA 2Y7KA 3VVFA 4RK9A 4XXUA 1SYIA 4XTCQ 2X26A 4I1DA 3PPQA 2UVGA 4OESA 3ZS6A 3O6IA 1P99A 4H8IA 3MPKA 4QF9A 5KZTA 3ILTB 4YKKA 3KG2A 1MQIA 4EF1A 3RN8A 3MVWA 5HPQA 4R73A 4WXJA 1SVXB 2DSFA 4DCYA 4TLMB 2F7BA 4R9GA 5CM6A 1I6BA 4IO3A 2PT2A 4OVJA 3UN6A 1NNPA 1A40A 2ZYNA 2DE2A 3VLUA 1PEBA 2VOZA 2QRYA 1MXZA 4UACA 1I69A 4RK2A 1MQGA 1SW1A 2O51A 1OVTA 2UYFA 2H5YA 4FIMA 1YTVA 4YKPA 2ZYOA 5BWJA 3E13X 3I3VA 4F1YA 2B3FA 3UGWA 1IXIA 3FZVA 3CIJA 2GRVA 3FXQA 1B3EA 2W7YA 4F39A 1FQEA 4GXSB 3RUMA 1USYE 3IR1A 1NFTA 2Z8DA 4G68C 1LSTA 4Z0IA 2OBGA 4H6DA 5AA2D 2H98A 4N6PA 4BLAA 3O6HA 3IOWA 4R74A 1H44A 1N84A 1Y9UA 2XHDA 3C9HA 2ZYMA 1Z7NE 3PUXE 1MXUA 4FECA 4GXAA 1D9VA 1JETA 4NEDA 4R2BA 4MF3A 2DYXA 2ZYKA 4AB6A 1FCKA 4YMAA 1O63A 1BTJA 4X1DA 3GBAA 1O7TA 4I9DA 1QW0A 2DXRA 1B46A 2G29A 4BDLA 3TKDA 2RINA 4FORA 4OFOA 3LSFB 4PFYA 5EHMA 2Q2CA 4ZZEA 3OELA 4ZZAA 2P2AA 4F19A 1FQCA 2Q8JA 1JQFA 4LONB 3FVGA 2R6GE 3G3IA 3FD3A 4H0WA 3G3KA 3T93B 5K2YA 1USYH 1LAHE 5CMBA 1NH8A 3SERA 1L5TA 3H7MA 1MPCA 3O2AA 4GIZA 5ELVA 4RXLA 4C1TA 3IO6A 3HSTA 3TTNA 2O84X 4G8HA 4KYSA 3A09A 2R9JA 4I8CA 4QHQA 4F3SA 1M5DA 3JYRA 3PUYE 4Z7EA 1LB9A 3OEKA 4IO2A 3IB1A 2NVUB 3VLVA 4DXUA 1UIVA 3FVKA 4R6YA 2UXAA 4YMBA 1US5A 2D5WA 1S7YA 1GGGA 1MY4A 3TFLA 1D9YA 2Y7RA 4GF8A 2ZMBA 1D4NA 2YLNA 3FUZA 1FQBA 3W9WA 1Q35A 3K6UA 2Q88A 1YCJA 4ELOA 2O7UA 1US4A 2DVCA 4JSOA 1DTZA 3ECRA 3UIFA 3RPWA 4LZ7A 4JBZA 3VVDA 1MM7A 5I58B 3QK6A 1N3XA 2QS2A 1ZMGA 4M4GA 3P7IA 4FATA 2AYSA 3Q29A 4R2FA 5I2KA 4F3GA 5CRYA 4GRKA 2F7CA 1B0HA 3RY3A 2DWIA 4IO5A 3RTWB 1FTLA 1PB9A 4PETA 3K02A 5H8FB 3O29A 5AE4A 4XIGQ 1N7WA 2PT1A 3QUFA 4QFOA 2RKMA 3QUJA 1XHYA 2I58A 3HN0A 3GZGA 4NF8B 5H8FA 2F34A 4OFLA 3TCGA 4U2RA 1LB8A 1B6HA 3C31A 2IA4A 2UVJA 1QVSA 1B1HA 4ESWA 4NF8A 3VVEA 4ELPA 4RY1A 1B51A 3ZKKA 3TCFA 5BUUA 5JEIA 4NF4B 1JVXA 4DLDA 3K0VA 4OXVA 3IOUA 2ZNSA 2FA7A 1MXXA 4G68B 3C33A 2ZNTA 1QULA 2QSXA 4NF4A 3VXBA 3OOAA 3OXNA 5DYHA 3OO9A 5ISUA 4HCWA 2H4IA 2Z8EA 1YPNA 3OENA 3M8UA 4G68A 2RF1A 1FQDA 5AA2B 4F3BA 3THIA 3KN8A 3MP1A 2QMXA 1AL3A 5DTBA 1CE2A 1AIVA 2HCAA 1VR5A 1FTKA 2H25A 2XX9A 3HHFA 5AA2A 4F1VA 1UTBB 1AH5A 2B3BA 2IEEA 4DIGA 3FVOA 3KZGA 1NNTA 4NTLA 1DOTA 4BDQA 4Q30B 2OLBA 3SETA 3IX1A 3B6WA 2GH9A 3ZKLA 1Y3PA 3C35A 1UTBA 4DE8A 1Y3QA 5I56A 2AIXA 1M5EA 3E4RA 4TOZA 4XKNA 2ABHA 1PDAA 1P1WA 3C4MA 3PPPA 3DP6A 4IY5A 1VSOA 4ZS9A 4LATA 2Q89A 3MP8A 1ZTYA 3WAFA 4NMYA 3QYTA 3N6UA 1P1OA 4PFWA 1LFIA 3R26A 4BDMA 3V83A 1S50A 4OMBA 2RC9A 4MFIA 1A54A 3K6XA 3Q25A 2G93A 3KN7A 1B40A 2V25A 2XXYA 3UP9A 1HSJA 4LP2B 4DXBA 4F1UA 1LBCA 5IKBA 4KPTA 3VE1B 3S9NC 3MZ1A 4OQOA 1A8EA 1FTMA 1IZ1A 4DDDA 4LVQA 2XXIA 2REJA 1YAEA 3OO8A 4EF2A 4O3CA 1VFDA 3H06B 4WEPA 4YB7A 2E0SA 1Y4TA 3A3UA 2XXQA 3MP6A 3QAXA 5CBSA 1M5BA 2I3VA 3OO6A 4G2ZA 3G3JA 4NWDA 3D4GA 2O6AA 2XD2A 1MXVA 3DELB 2DQVA 2HZLA 3SDFA 3SESA 4AB5A 2ANJA 3KJ7A 4F2QA 1LAFE 4U22A 2YPNA 1IXCA 2CZLA 1N3WA 3O9PA 4M1VA 1T0KA 4ELQA 3PGFA 3MJNA 4ZEIA 4F29A 4IGTA 4H1XA 5H8SA 1BLFA 3FJ7A 1BKAA 5B7DA 3LUYA 2VHAA 3ONMA 5TPAB 4JWOA 3BBRA 3MPLA 1JW4A 1B52A 3C34A 4G8NA 1PB8A 3MBPA 4NE4A 3U8QA 1MQHA 2PVUA 1Z7ME 5TPAA 5EHSA 1LFHA 3VDFA 4N13A 3BFUA 3VV5A 5IAIA 1B3FA 4F18A 5H8HB 2V84A 5TP9B 3MQ9A 1NKXA 2ESNA 3HHGA 1ANFA 1WODA 1B3HA 2HEUA 1QUKA 4TQUQ 3USDA 1N76A 3K1MA 3KOTA 5L9MA 3K1PA 3MW0A 5H8HA 5TP9A 1SQYA 3BFTA 5KCJB 5HBCA 1IIWA 3FJMA 3H6UA 1FQAA 2D21A 1EU8A 4RYAA 1MDP1 3CSBA 1IXHA 5AA1A 3T96B 3TELA 1NL5A 5KCJA 1SW4A 4X48A 3G3FA 3CFXA 3MZ9A 3FV2A 3FXUA 1UTHB 3FATA 3TYHA 4GL8A 4E0XA 3KJTA 2DXYA 1B0LA 4ZEFA 3OD7A 2I0BA 4PFUA 2QL3A 4PP0A 2BJJX 4KHZE 3LC8A 3V89B 3OSRA 1UTHA 3PV0E 1ZJLA 2F5XA 3TZAA 1SI1A 1XOCA 4LZ5A 2A5TB 3IL1B 4IO4A 4NF6B 1MY0A 2F6PA 5F1QA 1LCFA 3LSLA 4U1OA 2A5TA 2DS9A 3OO7A 4YKJA 4WEDA 1B05A 1SD3A 4KFQA 2Q9TA 4NF6A 3E9XA 2OCUA 4ZE9A 3TQWA 4OFJA 2A5SA 3K6WA 1JW1A 1BIYA 3KN3A 3TTRA 4YAHX 2DP8A 3EQ1A 2XX7A 3MC2A 3GLBA 5L9OA 2XXUA 3QIMA 4WKMA 4K3FA 3PU5A 5KDTB 1DPPA 3U72A 2AL4A 1OLCA 1SYHA 3T66A 1F9BA 1OLAA 2QJEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EQ8A 4QSEA 4IY6A 3S2VA 5I57B 1MXWA 1UQWA 1TFAA 2RC7A 3KFMA 2XX8A 4QSDA 1NV5A 3FJGA 5FBPA 5I84A 1B58A 3S4UA 1I6AA 1RYXA 2CEYA 3H6TA 1GVCA 3KGCA 4POXA 3K01A 3CI8A 3GYYA 4F3PA 1JVYA 5I58A 1OQHA 3RQTA 5I57A 2I3WA 1DSNA 4ZEBA 1N04A 4ZDMA 1XS5A 4QSCA 2V3TA 4MH5A 2Z23A 3TMGA 2F3DA 3EHTA 3JZJA 1FPJA 1LBYA 4N07A 1MQJA 1B7ZA 1FTJA 3Q26A 3TAJA 2GFEA 2HPGA 1FJ9A 3S9MC 3EPEA 5DVIA 4PGPA 4PFTA 4GWWA 4DCXA 3VFJA 1N0TA 3FIRA 4P9KA 4KI0E 3FASA 1QUJA 1B4HA 5H8QB 4FAJA 4C1UA 1MPDA 1A7LA 2O1MA 4GFRA 3K4UA 1IMAA 2Q2AA 5CBRA 3GXAA 4OWDA 4Q0CA 4PFBA 1FTAA 5EYHA 2P1SA 1A55A 2Y84A 2KQZA 4P11A 3T9UA 1SW5A 2V3UA 5H8QA 3T9VA 4KR5A 3HV1A 4N8GA 3TEPA 3MVYA 1B7UA 2XXHA 4NHBA 3RNNA 1R1NA 2ZXTA 3RT6B 2XXVA 5I2NB 3KBRA 5FHNA 1IXGA 4IO7A 3SKPA 4TLLB 4QFNA 2I4CA 4YKIA 4RPNA 1XC1A 2OJTA 3EF7A 4N81A 3F11A 1QKAA 5HM4B 3OMBA 3OEMA 5DW8A 5I2NA 1EZPA 5FTHA 3KSJA 3B7DA 5CI5A 2WEFA 4NAPA 2ZNUA 4OENA 1VDWA 2AL5A 3DLNA 3PPNA 4PE5B 4ESXA 4EQ9A 3T22A 4XKRA 4IO6A 3CFZA 4PC9A 3KEIA 2HXWA 3C36A 1URSA 3H3GA 5L8DA 3U65A 3FVNA 2LAOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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