1MPCA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA01
3IO6A 2X26A 3TODA 1MY0A 3L6HA 1B52A 1H45A 3U92A 3RLFE 4QFLA 5AA2B 4C0RA 3VVEA 3ILUB 1LBCA 1MS7A 3KN3A 3UN6A 2Q2AA 2THIA 3HHGA 1HSJA 1CE2A 4DDDA 2I6EA 3KGCA 4QFPA 1B3HA 3ONMA 1TXFA 1UTHA 1B6HA 5DYHA 1URSA 4GRKA 4F31B 3O9PA 1B3GA 4NWCA 3N26A 2DVCA 2OK2A 1N3WA 2D3IA 4EF1A 5KCJB 3TTNA 1NL5A 2DE4A 3QUFA 4QSEA 3MP8A 2GH9A 1ZLQA 4KHZE 1M5FA 1N0TA 1RKMA 2HCAA 1QUKA 2F8DA 2G29A 4HS7A 4OTEA 1A55A 4ZEDA 2XXIA 3IOUA 3MP6A 4FECA 5CRYA 4HCWA 5H8QB 2ZNUA 3MVZA 3TKDA 3FVGA 4F2OA 5AA4B 5A5XB 2I3VA 2Q89A 3PPOA 2F5XA 4U21A 1YCJA 4ELOA 3PPQA 5FHNA 4FORA 4BDQA 2OLBA 5I58A 1A54A 4TLLB 4HCYA 1EZ9A 2B65A 2I48A 1D4NA 1EU8A 2HXWA 1JNFA 3CSBA 4I8CA 3QAXA 4ZZAA 4BDNA 3O6IA 3SEUA 4LP2B 4KFQA 3HV1A 1Y3PA 5AA2A 1PB9A 1IXCA 1XHYA 2V93A 3G3HA 4FJPA 3S4UA 4XKQA 1N84A 4XKPA 1MQJA 2Y7PA 3PMXA 3VLWA 3CIJA 1DPEA 2CZLA 3KSJA 4IO7A 4QRZA 4N6PA 3ZKLA 3FVNA 3KN8A 2G93A 3QK6A 3SETA 1ZU0A 4ECFA 3C4MA 1FTLA 3KOSA 4IO3A 1R6ZA 4G77A 4YMBA 5KCJA 2NXOA 4F1YA 4BLAA 1D3KA 5CMMA 4OZ9A 3Q28A 5CMKA 1VE4A 5IKBA 4GXSB 3OO7A 4OETA 5ICTA 2E0SA 3T66A 3FJMA 1JEVA 1P1NA 3KG2A 3T93B 4ESXA 4DIGA 2H98A 5H8QA 4F1UA 2F78A 2H5YA 4ZEBA 5AA4A 1A40A 5A5XA 1XC1A 2I3WA 3FASA 3ZS6A 3H3GA 1P1WA 2ZYMA 1N7XA 1IITA 2GHBA 3KJTA 5FTHA 4UACA 4U4SA 5DT6A 1YTVA 3H6TA 4Z0IA 2RCBA 4R73A 4AB5A 3TPAA 2XD3A 4MBPA 5ELVA 3TTLA 2Z8FA 1FQBA 3OEKA 2RC8A 3N6TA 1US4A 3S2VA 3FJGA 2RC9A 5DVFA 5JTYB 4PFTA 1MPCA 3O28A 1OMPA 2H25A 2XXRA 4EDPA 3ZSFA 4ZE9A 2XXTA 3B6TA 5CI5A 3FVOA 1M5EA 3IOVA 1MY3A 2OZZA 4ZS9A 3TTMA 1Q35A 3CR9A 2QL3A 1SW4A 1FQFA 4R72A 3OMBA 2I0CA 4H6DA 5AA3A 2HAVA 2H99A 4NE4A 2NOOA 3K4UA 2O84X 3SKPA 1JW1A 2QS3A 1HSLA 3V8XB 2Z8DA 1N3XA 2DVZA 3T9XB 4GWOA 2Y7KA 3RTFB 3IK6B 3HCQA 4F3PA 4X48A 3CFZA 4DE8A 3K02A 3G3GA 3N94A 3FJ7A 5BUUA 2QJEA 5JEIA 1P99A 1LAHE 5I59B 1P1QA 3MZ9A 3K0VA 1POY1 4YZZA 1FTMA 4LONB 1JEUA 2ZNTA 3Q29A 1B5IA 1A7LA 2O7UA 1LFGA 4BDOA 5KZTA 3LSFB 2DE2A 2XXYA 1MY1A 4LVQA 3MZ1A 3QXMA 1MPBA 3RQTA 3IAZA 1MY4A 3QSLA 4ZECA 2KLFA 1XVYA 4LA9A 2GHAA 4MH5A 5DTBA 3RNNA 1FCKA 3VE1B 2XXPA 1OLAA 4C1UA 5JTYA 4AB6A 4OFJA 4GVOA 4YMAA 1EZOA 2QS4A 1SW1A 1MQHA 3V5AA 3M8UA 3MWBA 3BFUA 4DCXA 4R74A 4DXBA 3SEVA 2UVHA 4IO4A 1JVYA 3UORA 2XD2A 4Q30B 3N6UA 4OHNA 1RYOA 5H8NB 1QUIA 1P1OA 4KI0E 2UVIA 3PGFA 4G68C 3JZJA 3MP1A 1SI0A 3PUXE 1IUDA 1URDA 1D9YA 5DVIA 1AIVA 4OERA 2PX1A 4TOZA 4PQJA 1LGBC 3SEWA 1A8FA 4YB6A 3C36A 4LZ8A 3A3CA 3EHTA 2V3UA 1T0KA 1PBQA 4ELQA 4H5FA 2XXQA 3VFJA 3PD8A 2UVGA 5EYFA 2GFEA 5BWJA 3U94A 1R9QA 4OVJA 4I9DA 1VFEA 3PV0E 1D9VA 3D4CA 5I59A 1B2HA 4ESWA 1UIUA 5DEXB 4TQUQ 1MXZA 2M8CA 4NF4B 3BBRA 2O1MA 3RGYA 3DELB 2XX8A 2R71A 2YLNA 3EHUA 2X7PA 1VFDA 3PPPA 3MPKA 4ZEIA 2R9JA 3VVDA 2HZKA 3K2DA 1ZIUA 5FHMA 1NNTA 1Z7ME 1FTOA 2HZLA 3G3JA 1O7TA 3C9HA 1UTBB 1LAGE 3IB0A 1I6AA 1LCTA 3MVYA 4KD5A 3K6UA 3H6VA 2PYYA 1US5A 1XOCA 3T96B 3DP8A 3M3FA 1M5CA 1MPDA 2IEEA 2QS1A 2Z22A 1DSNA 2QPQA 3OO8A 4G8NA 3G7WA 1B46A 3WAEA 1LCFA 2Q2CA 4ONYA 2HEUA 4WEPA 4O3AA 1IXHA 2A5SA 5H8NA 3UK4A 1Q1KA 1NH7A 4IGRA 4G8HA 3DM0A 5CBSA 3O6GA 1OLCA 2F97A 1AOVA 1LSTA 3FV2A 4RYAA 2PT1A 3PUYE 5B7DA 2DP8A 5HBCA 1MM6A 1SVXB 3P7IA 4E0XA 5AA1A 2RKMA 4NEDA 3A09A 4GL8A 2D5WA 1B0LA 3BKIB 5K2YA 5AE4A 4O3CA 1PB7A 3H4ZA 2A5TB 3LC8A 5DEXA 3LSLA 2REJA 3LR1A 4H8JA 5AA2D 2DWIA 3H6UA 2O69A 3OELA 4NF4A 1IXGA 1AL3A 1SDXA 2DSFA 2H4IA 4MLVA 2F6GA 3B6QA 4X9TA 4M1VA 1NH8A 3IO4A 3CFLA 4I62A 4GXAA 2DWJA 4BDMA 1PBPA 2OBGA 5CBRA 1KWHA 2VD2A 3S9MC 3MQ9A 4FE8A 1SI1A 1B9JA 3K1MA 1P1UA 2R6GE 2W7YA 1UTBA 4YKIA 2VGQA 2DQVA 5I57B 3QUJA 2OJTA 2ESNA 4BDRA 3UIFA 1MM7A 2QMXA 2ZYOA 1A8EA 4MF3A 2ZMBA 2REGA 2YJPA 3D4GA 4RK2A 4KPTA 3VLUA 4QHQA 2UVJA 2UXAA 4L17A 3B7DA 3MUQA 5JK4A 3U93A 1NNFA 3K01A 4H67A 5CMBA 1MQIA 2XX9A 1FTJA 1ZBMA 2FNCA 3LBSA 3FV1A 4JDFA 4YKKA 1JW5A 5TP9B 4YU0A 1F9BA 3UP9A 3V83A 4DXCA 2XX7A 3TDJA 5H8FB 1MQGA 1USYE 3IL1B 3KJ7A 1LLSA 4U23A 3KBRA 3U1OA 2F36A 4ZEKA 1DTZA 2BJJX 1B3EA 1NMUA 1B40A 1ZTYA 2AL5A 1B5JA 2A5TA 4Q8RA 1N76A 1SQYA 3OOAA 3GBBA 3W9WA 3I6VA 2AIXA 2QS2A 4FIMA 3ILTB 3K00A 3K6XA 4H0WA 4U1ZA 2XXXA 2DE3A 2XXWA 1LFHA 4TLMB 3F11A 3PMVA 1MXXA 3DP6A 4F22A 4R2FA 4NF6B 3ODBA 4PFUA 4YKJA 4YICA 2LAOA 1YAEA 1O64A 1L5TA 4F19A 3UGWA 5I57A 4RXLA 4FEDA 5I2KB 5L8DA 3VVFA 4XKNA 4POWA 3MVWA 5L9SA 2F34A 3FGSA 1MDQA 2VD3A 1POTA 1SD3A 4DXUA 3GXAA 3M3KA 1Z7NE 5EHMA 2CMOA 4G2ZA 3GLBA 2PT2A 4JSOA 3SESA 2DWAA 3IR1A 1Y4CA 3T9VA 2WKYA 1PB8A 4MFIA 2QMWA 2PMSA 3KEIA 3FUZA 3TMGA 1IIWA 4X1BA 3TQWA 4XKRA 4AQ4A 5EHSA 1IEJA 3TFLA 3V89B 5M2VA 3SEYA 4R2BA 3Q25A 5TP9A 3IB2A 4NF5B 2RINA 2ZYNA 3PPNA 2P2AA 4U4XA 4R6KA 5H8FA 2O7IA 4P11A 4C1TA 2Y7RA 2F6PA 2ZNSA 4O3BA 4FATA 4LATA 2DOJA 1MH4A 5CM6A 4NF8A 4H8IA 3TEPA 1JETA 1A99A 3OSQA 3FIRA 2OWSA 4OEUA 4PFWA 4M4GA 2DWHA 2XXUA 1OQHA 1GVCA 1IXIA 2I0BA 4EQBA 2XXHA 3KN7A 4H65A 4NF6A 1B7HA 1N04A 4EXLA 2PVUA 1S50A 5I2KA 1QKAA 4KYSA 1MQDA 3E4RA 3KFMA 2DXRA 4F39A 3MJNA 2RC7A 3PUVE 2IA4A 3LUYA 1ZKBA 1B0HA 1Y3QA 3Q27A 4U22A 1AMFA 3IOTA 1OIBA 4E0WA 2XXVA 2ZXTA 3C33A 4ISUA 3RTWB 3VXCA 4IO2A 1RYXA 2B3BA 1WODA 1QW0A 3FXQA 2OCUA 3PPRA 5ITPA 3OD7A 4F3SA 1BKAA 3CSGA 1Y3NA 2UYFA 1DTGA 3USDA 4ELRA 4NF5A 3OO9A 3O2AA 4QFOA 5FTIA 2Q88A 3ECRA 3KSXA 3HO7A 5K2XA 4PETA 3SDFA 4EUOA 4GOTA 3TCGA 1PEBA 5F7VA 1FTKA 4THIA 4OENA 3DLNA 1B4ZA 4XTCQ 3ZKKA 4YB5A 3RN8A 2FA7A 3EPEA 1Y1ZA 4RA1A 4DZ1A 2V3QA 4QFKA 4N07A 4NTLA 3VXBA 3KZGA 1B5HA 3LSXA 3C35A 4IGTA 4GFRA 5TPAB 1QJMA 3G3KA 3EHSA 4PE5B 2F35A 2OWTA 4UA8A 4MLQA 1J1NA 3S9NC 2O51A 4KQPA 4F3BA 3TELA 4KYDA 3HHFA 2F7BA 4GIZA 1TFAA 2HFBA 3VV5A 3MPLA 3U72A 4LZ5A 3T9UA 3TTKA 3IJXB 3CRBA 3HSTA 3GBAA 3QYTA 4DLDA 4RK9A 3IJOB 3M3LA 3FATA 4OWDA 4I1DA 2ANJA 2QSXA 3FVKA 4R9FA 5LOMA 2I4CA 5ITOA 4EQ9A 1ELJA 3E9XA 1AH5A 1XT8A 2I49A 4IB2A 4OFOA 3EF7A 1TFDA 2ONRA 1ZMGA 2H9BA 1EZPA 3OEMA 3K1PA 4JBZA 3MW0A 3T22A 4Q5TA 5J1DA 2DXYA 1QKBA 4K3FA 3FXRA 1S9TA 4H1XA 2ONKE 4G68B 1I69A 3OXNA 3JYRA 4ND9A 3L6GA 4GD5A 4LQ2A 4F1VA 2B3FA 3EQ1A 1I6QA 2V25A 1FQDA 3Q26A 3TQLA 3RUMA 3IB1A 2F7CA 4GF8A 1SW5A 1JVXA 4RPNA 1B7ZA 3VDFA 3RPWA 4WXJA 3K1NA 1UIVA 4IY6A 3SEXA 4EF2A 5CC2A 3PUWE 3N5LA 2GRVA 5TPAA 4OYVA 4OXVA 5L9OA 4KYEA 3WAFA 4NMYA 1MXVA 1BP5A 3H03A 3TTRA 4R75A 2ALUA 2V84A 4LZ7A 3TYHA 3RY3A 1R9LA 2VOZA 5L9MA 4KCDA 2F7AA 1FW0A 1B58A 4RJZA 1TWYA 4YKPA 1GGGA 1I6BA 5HM4B 5ICQA 3S9EA 1XVXA 1MXUA 3IX1A 1H44A 3O97A 4RY1A 4G8MA 2Z23A 4YB7A 1MRPA 4Q0CA 4RNSA 4GLIA 4ZDMA 4NWDA 2YPNA 4OESA 3CFXA 3E3KA 4IY5A 3R26A 4WKMA 5I56B 1MG1A 4R6YA 3C31A 1SW2A 3TCHA 3UA8A 3S9LC 3FD3A 3TZAA 1M5DA 3MZBA 4JXIA 4LUBA 3U8QA 1DPPA 2XHDA 3PMWA 2X7QA 4G68A 1JW4A 1MXWA 1QVSA 1N7WA 2O6AA 1Y20A 4LQ5A 3I3VA 3CG1A 4F2QA 1GTKA 4NF8B 1ATGA 3K6VA 3R6UA 3TCFA 1ZJLA 3G3IA 2VP1A 2HQ0A 3VLVA 2Y84A 2FYIA 1BLFA 5KDTB 1XS5A 1URGA 4XIGQ 4JWYA 1SYIA 4PFYA 4QF9A 1FQAA 3H6WA 4ZE8A 1VR5A 2Y7WA 1H76A 3IORA 1Y4TA 4OMBA 2I4BA 1H3DA 4ZZEA 3K6WA 3MAMA 2V3TA 1LBBA 1OVTA 4ZEFA 4P0IA 3DP4A 4PP0A 4Z7EA 5CMCA 3TUSA 1MH3A 2Q8JA 1OVBA 4H5GA 3RT8A 4EXKA 1B51A 3CVGA 2NWJA 1NNPA 3OO6A 5I56A 3I5OA 4R9GA 3O6HA 4JSDA 5I2NB 3THIA 2O68A 4ELPA 5B70A 4FEBA 1CB6A 3O29A 1FQEA 4OEVA 2E1SA 4OQOA 2PBWA 1QULA 1ANFA 3HPIA 1LB9A 3FXUA 4GQOA 2D21A 1O63A 4EQ7A 1B7UA 3BFTA 4U2RA 1BTJA 3PUZE 4U1OA 3MC2A 3HN0A 1H43A 4FAJA 3MVXA 4GL0A 4RPOA 1LB8A 3JV9A 2QRYA 2I58A 2Y7IA 1OQGA 1YPNA 4QSCA 5KDTA 3TAJA 1B3FA 3OENA 1B1HA 2UYEA 5H8HB 3AXFA 1PDAA 4WEDA 1PC3A 2ABHA 3FZVA 4G4PA 4N13A 3LSWA 3H7MA 3O66A 4IO6A 1LAFE 5F1QA 4DCYA 1UQWA 1M5BA 1USYH 1IQ7A 2NUVA 4QFNA 3B6WA 3QIMA 2RCAA 1NFTA 3IOWA 3C32A 1HSEA 1VSOA 3CI8A 2RF1A 4QSDA 1B3LA 2P1SA 3C34A 1Y9UA 1QUJA 4JWOA 1Y1MA 2VHAA 2ZYKA 1FQCA 3G3FA 4X1DA 4OFLA 4R6HA 1WVJA 3W9VA 1B05A 3EN3A 4KCCA 5I2NA 1IZ1A 1UTHB 2Q9TA 3CG3A 5ISUA 4HTGA 3SERA 4F18A 5HPQA 1MDP1 1GV8A 1B1XA 1DOTA 1NNKA 1GR2A 2DYXA 3OSRA 1MY2A 3A3UA 1DMBA 3E13X 5I84A 2ONSA 1B4HA 1LAXA 4JWXA 4HW8A 5IAIA 3PD9A 1BIYA 2AL4A 4IO5A 3RT6B 2P0SA 1TT1A 2HAUA 4KR5A 2O1LA 3GZGA 4XXUA 4YAHX 1EH3A 1NKXA 3T9HB 5FHOA 1B32A 3W15C 4BDLA 1S7YA 4F29A 4P0GA 5H8HA 1JQFA 3KOTA 4JB7A 3R7XA 3PU5A 2NVUB 1LFIA 1MXYA 1SYHA 3H06B 5H8SA 3MBPA 1R1NA 2DS9A 4F3GA 2Z8EA 5DVJA 5I58B 5TU0A 2AYSA 1SBPA 1II5A 1WDNA 4POXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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