1MPCA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA01
3TDJA 4GOTA 4DXBA 1IXCA 4R73A 4ECFA 1XVYA 3K6WA 3TELA 3U8QA 3IB0A 4YKIA 2OJTA 3CG3A 5H8FB 1OLAA 4OYVA 2YPNA 5I56B 4F1UA 5TPAB 1PBQA 3N6UA 1QVSA 2IA4A 3O6HA 3C9HA 1P1NA 1MG1A 3EHUA 3IR1A 3PPPA 4O3CA 3H4ZA 2I4CA 1Y3PA 5TPAA 2FNCA 1LCTA 4KCCA 4H6DA 2D3IA 3VVEA 4IO6A 3TAJA 2UVHA 1R9QA 1II5A 1FW0A 2O1MA 4TOZA 4ELRA 4Z7EA 4EUOA 3IORA 3N26A 4QSEA 2OLBA 1B5JA 3SETA 3FZVA 3OELA 4BDMA 3T66A 4XKNA 4XKRA 1YPNA 3TCHA 2F7CA 2DWHA 1B3EA 3GLBA 5DEXB 2ZNUA 3EHSA 3KN7A 3O2AA 3QAXA 3PMWA 3QUJA 3LC8A 4YMAA 2PYYA 2HQ0A 4R6KA 5K2XA 2RC7A 3B6TA 3UGWA 4IGRA 1Q1KA 5JK4A 3G3IA 2F6PA 4OWDA 4ZE8A 3IL1B 3Q29A 1A55A 5DEXA 1JNFA 3QK6A 4F3SA 1B1XA 3RT8A 2G93A 1MQDA 2FA7A 4IY5A 3K6VA 1ZMGA 3GBAA 3OEKA 3TTKA 4JB7A 1A8FA 4QSCA 2H98A 1DSNA 3RUMA 1D4NA 3THIA 1EZPA 4FIMA 1MM6A 4JWOA 3UA8A 3R7XA 1MXXA 2BJJX 4KYDA 2F5XA 4RK2A 3PV0E 3K2DA 3TUSA 2RCBA 3GBBA 4QF9A 3OSRA 2ABHA 3OO6A 1ZTYA 3Q27A 5A5XB 2Q2CA 3AXFA 5HM4B 1NNTA 4RK9A 2V3UA 1JEVA 4YB5A 4YZZA 1NH8A 3T96B 1NL5A 3C33A 2DXYA 2PVUA 5J1DA 1MQHA 4NF4B 3KN8A 2B3BA 3TODA 5I2KB 3S4UA 2DVCA 3L6HA 4GD5A 2NUVA 1MXZA 5A5XA 5KCJB 5AA2D 4AQ4A 3H6WA 5CMMA 1LB9A 4YICA 2RINA 1RYOA 2F35A 1B7UA 4OQOA 3GXAA 1OIBA 5CMBA 2D5WA 4NF6B 3LSWA 4U23A 1T0KA 3KSXA 5I2KA 2H4IA 1GV8A 1JEUA 3A3CA 4NEDA 4FATA 5KCJA 2R71A 3CFZA 3S9LC 3KGCA 3RTFB 4L17A 5AA1A 4R9FA 2KLFA 3FJGA 1MXVA 4NF6A 3SEYA 2OZZA 1LLSA 3MPKA 4Q8RA 4G8HA 3HHFA 3PMVA 4RPOA 1DOTA 5CC2A 3CFXA 4RY1A 1LFIA 4QSDA 4ESWA 3K6UA 2ZNSA 4LP2B 5F7VA 3FJMA 3S9EA 3IOVA 2PBWA 1MH3A 3TZAA 1JETA 3IX1A 2YJPA 2ZYOA 3MZBA 3ODBA 2PMSA 3W15C 4E0WA 4JSOA 1F9BA 5CRYA 4G4PA 4F31B 3S2VA 4NF8B 2Z8DA 1JW5A 1ZKBA 1MRPA 4GLIA 3QYTA 1D9YA 4N07A 3LR1A 4EDPA 4KI0E 2DP8A 2I48A 3KEIA 2AL4A 4IO5A 2I3WA 2OK2A 4LA9A 5AA3A 4BDRA 4NF8A 4X9TA 1D9VA 2UYEA 4YU0A 3B6WA 1LB8A 4ONYA 3WAFA 4ZDMA 1PB7A 5TP9B 5H8SA 2NOOA 3MBPA 1URGA 4G68C 1MQIA 3DELB 1XS5A 1JW1A 1XHYA 5L8DA 4YKKA 5ICQA 3T93B 1VSOA 4NTLA 3L6GA 3KSJA 1ELJA 4GXSB 2A5TB 1D3KA 4X1DA 4ZZEA 4YAHX 1LFGA 5TP9A 2I6EA 4DE8A 1MPBA 2I0BA 3BFUA 4JWYA 4U1ZA 4NMYA 5I57B 1SQYA 4GF8A 4ZZAA 2A5TA 1S7YA 4R75A 3M3FA 1NNFA 2YLNA 5DVFA 2VHAA 1Y1ZA 1B4HA 1URSA 3R6UA 3C34A 3O28A 1M5DA 1MH4A 2Y7WA 3IAZA 4FEBA 5I57A 5DTBA 3VXBA 3PPNA 4FORA 3RPWA 3ONMA 2X7QA 1GTKA 3V8XB 2DVZA 2NXOA 3MAMA 3ZS6A 1SI1A 3FD3A 2AIXA 3IO6A 4XIGQ 1FTMA 3IOUA 5KDTB 4ZS9A 3FXUA 3MWBA 1GVCA 3VLWA 4LQ2A 3E13X 1SW4A 4G8NA 5JEIA 4R9GA 2ZYNA 1ZJLA 1EU8A 1Z7ME 3VV5A 3PUYE 3H3GA 4UACA 4XKPA 5KDTA 1LGBC 3H7MA 3RTWB 1B3GA 4U2RA 3FUZA 3O97A 2P2AA 3FXRA 4OFJA 3EPEA 4YB6A 1MDQA 5BWJA 4R6HA 1N3XA 1B1HA 2Y7PA 4HS7A 3MP8A 4OERA 1LFHA 3MQ9A 1LAHE 2X7PA 2DWJA 2ONKE 2B3FA 3K00A 3KFMA 3C4MA 2HXWA 1FQAA 3SEWA 5AE4A 2DOJA 3I6VA 1PDAA 3OO8A 4WEPA 4F2QA 1GGGA 4F18A 5I2NB 1B58A 1SYHA 3S9MC 4ISUA 1VFDA 2REGA 2REJA 2I58A 4DZ1A 4R74A 4QFOA 4KD5A 1TT1A 1Z7NE 2OWTA 1US4A 1URDA 5ELVA 3SEXA 5I2NA 1B52A 1UQWA 4KFQA 4HW8A 4MFIA 3D4GA 3U1OA 1LAGE 1BP5A 2QMWA 1S9TA 1IXIA 2Q2AA 4R6YA 3BKIB 2XXUA 3EHTA 3KBRA 1PC3A 2OCUA 4IGTA 4IO7A 3FIRA 3GZGA 3MVZA 2QS2A 4U4XA 3P7IA 2UXAA 1N3WA 2V3QA 5H8FA 4TLMB 3TPAA 2I4BA 5I56A 4LONB 4ZEKA 3KOTA 4AB5A 3PD8A 5FTHA 1B9JA 2DS9A 4KYSA 4LZ8A 3H03A 4HTGA 3V83A 2QS3A 4F2OA 3C32A 3LSLA 2Y7RA 2O6AA 1SYIA 3TQWA 2DYXA 4TLLB 1WVJA 3RT6B 1MM7A 3PMXA 2GRVA 1KWHA 1M5EA 1SW2A 2O51A 2OBGA 1B05A 2H99A 1H45A 3V89B 4I9DA 4RJZA 1MPCA 2V3TA 1OLCA 1N7XA 1P1UA 1WODA 1OVTA 4OEUA 3A09A 3WAEA 1H76A 4BDLA 3K1MA 2Q9TA 1QUKA 1JQFA 4EF1A 3FASA 4G8MA 5ICTA 4OENA 4MBPA 1CE2A 4GL0A 3KN3A 1M5FA 3IB1A 3H6VA 1A8EA 3MZ9A 4KHZE 1VR5A 2DXRA 4F3PA 5DYHA 2R9JA 4O3BA 4X48A 4G77A 4YMBA 4QFKA 2ONRA 2V84A 1SDXA 3U94A 5TU0A 4GWOA 1NKXA 5HPQA 4H67A 1B3HA 1L5TA 3FVNA 1UIVA 1GR2A 3Q28A 4G2ZA 1YTVA 2PX1A 1A99A 4N6PA 4PETA 3FVOA 3UK4A 3RQTA 4F3BA 5LOMA 3FJ7A 2DWAA 2VGQA 1USYH 3RY3A 1IITA 4H5GA 5I58B 5H8HB 1LCFA 2RF1A 2ANJA 2UYFA 1FCKA 1FQBA 4NF4A 3D4CA 3HSTA 4ELOA 2XXRA 4PFTA 4OMBA 3N6TA 1ZIUA 2OWSA 3LBSA 5I58A 2H9BA 3MJNA 4H0WA 3H06B 2IEEA 1B7ZA 1QULA 2GHBA 4EQ9A 1POY1 4H1XA 5FHMA 1JVYA 1FQCA 1TWYA 2ESNA 4KQPA 4RXLA 2E1SA 2ZXTA 4WEDA 3QXMA 1TXFA 2XX9A 5CI5A 2XX8A 3E9XA 3MVYA 2X26A 3K1NA 5K2YA 4OZ9A 1EZOA 3TMGA 1B5HA 2DQVA 3CRBA 1IXHA 3MP1A 4P0GA 2XXQA 4DLDA 4QFLA 3E4RA 3FXQA 2GH9A 4DIGA 4YKJA 3O6GA 1UIUA 5H8NB 3C31A 5AA4B 3HHGA 2Z22A 1O7TA 5M2VA 3G7WA 1A40A 3JV9A 3QSLA 4OFLA 3SESA 1QW0A 4ESXA 1DPEA 4H5FA 5H8NA 5AA4A 1UTBB 1FQFA 2HEUA 4OEVA 3PU5A 2XXTA 3K6XA 2UVGA 4PQJA 3IOWA 1IXGA 4QFNA 5IAIA 1S50A 4I1DA 1UTBA 1OQGA 1BLFA 1WDNA 2XXHA 1DPPA 3IK6B 4H8IA 3MPLA 1R9LA 3BBRA 4FEDA 2CMOA 3DP4A 2O7IA 4Q30B 3TTRA 1P1OA 1N84A 3G3GA 4BLAA 1J1NA 4HCWA 5KZTA 3CFLA 4YKPA 1QUJA 3PPQA 5I84A 1DTZA 4MH5A 1QJMA 5F1QA 4NF5B 4MLVA 3KJTA 3TCGA 4F1VA 2XXYA 2XX7A 2FYIA 3TKDA 5EYFA 1YAEA 2VP1A 5FTIA 3OXNA 4EQ7A 1B40A 1VE4A 3MZ1A 1NNPA 3TQLA 5L9MA 2QRYA 3PUVE 4F3GA 3FV1A 4NF5A 1ATGA 5FHNA 1YCJA 3G3HA 3SEUA 1PB8A 3T9XB 3KOSA 3CVGA 2O7UA 3PUWE 3EF7A 3PD9A 3I3VA 3O66A 1ZU0A 1PB9A 3VFJA 3MVWA 3CSBA 3TTLA 1MY4A 4DXCA 4PE5B 3SDFA 3OENA 1I6QA 4I8CA 3ILTB 3JZJA 1B5IA 4DCXA 3TCFA 2V25A 5ISUA 2XHDA 2QJEA 4U1OA 1AOVA 1MQJA 1M5BA 2DE3A 5CM6A 2UVJA 2NVUB 4FJPA 2P0SA 4QHQA 4ZEDA 5FHOA 3RLFE 1QKAA 1XVXA 4R2BA 1AMFA 1FTKA 5JTYB 1MY1A 1N7WA 2QS1A 3RNNA 2XXXA 1B0LA 2XXIA 5B7DA 4F29A 4O3AA 3R26A 4F1YA 1OQHA 1NNKA 4LZ5A 4OHNA 2QMXA 4G68B 5JTYA 2O1LA 1O64A 2LAOA 4GVOA 1FTJA 2HAVA 3MC2A 1IEJA 2NWJA 3KZGA 2XXVA 1SW1A 2Y84A 1MXWA 1EZ9A 4GL8A 1UTHB 4ZEFA 1R1NA 1FTOA 1H3DA 3B7DA 2H5YA 3VLUA 2H25A 4MF3A 2RKMA 3C35A 1Y3QA 4GFRA 4FECA 3G3FA 4BDOA 2XXPA 3A3UA 4NWCA 4Z0IA 3O9PA 1UTHA 4IO3A 3T9UA 4KYEA 1PEBA 5ITPA 3S9NC 1Y4TA 3UN6A 1SVXB 3K1PA 5AA2B 2HAUA 3K4UA 4ELPA 1JW4A 2THIA 3SEVA 3USDA 4EXLA 4I62A 1EH3A 1SI0A 2F6GA 3IJOB 5AA2A 2I0CA 1FQEA 2RCAA 1HSLA 5H8QB 3IB2A 1IQ7A 3SERA 1MXYA 3HV1A 3LSFB 1TFAA 4AB6A 1IZ1A 4RPNA 2D21A 4F22A 3VXCA 1MPDA 1R6ZA 1B7HA 1Q35A 4E0XA 5DVJA 5CMKA 5CMCA 5DVIA 3UORA 1N0TA 2AL5A 4NE4A 5H8QA 1N76A 5BUUA 4JWXA 3ZKKA 1POTA 1QKBA 4U4SA 1USYE 4OETA 3MVXA 3LUYA 4GIZA 5B70A 2XXWA 3CSGA 3HCQA 2ONSA 4X1BA 4DXUA 2DE4A 2ZMBA 4BDNA 2V93A 4IY6A 5CBRA 1B3LA 3OD7A 4EF2A 2R6GE 3K01A 1M5CA 1ZBMA 3N5LA 4WXJA 4OVJA 4F19A 4PFYA 4ND9A 4IB2A 3PGFA 3EN3A 3HN0A 2ALUA 1BTJA 1AH5A 1SW5A 1Y1MA 1IUDA 3KJ7A 3VE1B 2CZLA 1B3FA 1MY2A 2RC8A 3CI8A 2F8DA 3OOAA 4C1UA 1ZLQA 1RYXA 4THIA 4QFPA 1BKAA 1US5A 2AYSA 1MY0A 2HCAA 1NH7A 3H6TA 3DP8A 3RGYA 4H8JA 1IIWA 2PT2A 3OEMA 3E3KA 3T9VA 2F7AA 3M3KA 3I5OA 3FGSA 3CR9A 5H8HA 3IO4A 4BDQA 3KG2A 1Y4CA 3G3JA 3Q26A 3VDFA 1H43A 4HCYA 1Y20A 3FATA 4Q0CA 3N94A 3TFLA 1HSJA 1B2HA 4DDDA 3HPIA 3H6UA 1SBPA 3T9HB 4LZ7A 2O68A 4RYAA 1B4ZA 4QRZA 3BFTA 3ZKLA 2M8CA 1Y9UA 4XKQA 4DCYA 5EHSA 1A7LA 1B6HA 3F11A 3K0VA 4RA1A 4TQUQ 3DP6A 3OMBA 2VOZA 1LBBA 1Y3NA 3O29A 4PFWA 3VVFA 3C36A 4M1VA 4JXIA 3W9VA 4U21A 4LATA 3EQ1A 3U92A 2QPQA 2I49A 4P0IA 2B65A 1NFTA 4IO2A 3RN8A 4POWA 3CG1A 4OFOA 3ZSFA 2VD3A 4UA8A 4N13A 3V5AA 1QUIA 2Q8JA 2P1SA 2E0SA 1XC1A 2F7BA 3M3LA 3JYRA 3DLNA 4PFUA 4OESA 1ANFA 5L9SA 3IOTA 3OO7A 1PBPA 3DM0A 1NMUA 2RC9A 4NWDA 2O84X 4C0RA 3LSXA 2F36A 2HFBA 4JBZA 4POXA 3TTMA 3PUXE 1I6BA 4GQOA 1P1WA 2I3VA 3UIFA 2ZYMA 2F78A 3VLVA 3W9WA 3U72A 4C1TA 1O63A 3TTNA 3PUZE 4PP0A 1FQDA 4F39A 3U93A 2Q89A 4OTEA 1AL3A 1DMBA 2Z23A 2GHAA 2WKYA 1A54A 4M4GA 1H44A 4WKMA 1MQGA 1HSEA 1XT8A 1LBCA 1B32A 4RNSA 1MS7A 1B0HA 3G3KA 5ITOA 1CB6A 4GRKA 2UVIA 4U22A 4YB7A 2QS4A 2W7YA 1LAXA 1LAFE 2Y7IA 3SKPA 3TYHA 1BIYA 3M8UA 4KR5A 4P11A 4LQ5A 1XOCA 2ZNTA 3OO9A 2DE2A 2QL3A 4ZEIA 3B6QA 2HZKA 4JDFA 3QIMA 1MXUA 3IJXB 5IKBA 5L9OA 1DTGA 5I59B 3OSQA 1P1QA 2QSXA 1B51A 3VVDA 2F97A 1I6AA 2ZYKA 4FAJA 2Z8FA 3K02A 1VFEA 1MY3A 3Q25A 2Y7KA 3FV2A 1SD3A 5EHMA 5I59A 3T22A 2O69A 4R2FA 1MDP1 4XTCQ 3UP9A 2VD2A 3PPOA 3MP6A 4KPTA 4MLQA 2DSFA 2PT1A 3PPRA 2XD2A 3CIJA 3ECRA 3MW0A 4FE8A 1OVBA 1FTLA 5HBCA 4ZEBA 1B46A 4OXVA 2DWIA 3O6IA 4EQBA 4KCDA 4JSDA 4ZECA 3ILUB 2A5SA 4K3FA 3TEPA 3QUFA 2HZLA 1JVXA 2F34A 4R72A 1OMPA 5DT6A 1I69A 1RKMA 2G29A 1TFDA 1AIVA 2GFEA 4ZE9A 4IO4A 4Q5TA 1P99A 3FVGA 4ELQA 4G68A 3MUQA 3FVKA 4XXUA 2Z8EA 5CBSA 2Q88A 4EXKA 4GXAA 4H65A 4LUBA 3HO7A 1N04A 4LVQA 2XD3A 1LSTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TDJA 4GOTA 4DXBA 1IXCA 4R73A 4ECFA 1XVYA 3K6WA 3TELA 3U8QA 2R8TA 1FBHA 3IB0A 4YKIA 3B8BA 2OJTA 3CG3A 5H8FB 1OLAA 3T0JA 1AWBA 4OYVA 2YPNA 5I56B 4F1UA 5TPAB 1PBQA 2CEXA 3N6UA 1FJ9A 1QVSA 4OVSA 4PC9A 2IA4A 1YXIA 5T3JA 3O6HA 2ZZXA 3C9HA 1P1NA 1MG1A 3EHUA 3IR1A 4O94A 3PPPA 4O3CA 2HXRA 3H4ZA 2I4CA 1Y3PA 5TPAA 2FNCA 1LCTA 4KCCA 4H6DA 2D3IA 4OVQA 3VVEA 4IO6A 3TAJA 2UVHA 1R9QA 1II5A 1FW0A 2O1MA 4TOZA 4ELRA 4Z7EA 4EUOA 3IORA 3N26A 4QSEA 4AS5A 2OLBA 1B5JA 3SETA 3FZVA 3OELA 4BDMA 3T66A 4XKNA 4HE2A 1YPNA 4XKRA 3TCHA 2F7CA 2DDKA 2DWHA 1B3EA 3GLBA 5DEXB 2ZNUA 3EHSA 3KN7A 3O2AA 3QAXA 3PMWA 3QUJA 3LC8A 4YMAA 2PYYA 2HQ0A 4O7MA 4R6KA 5K2XA 2RC7A 3B6TA 3UGWA 4IGRA 1Q1KA 5JK4A 3G3IA 3E79A 4MEVA 2F6PA 4OWDA 4ZE8A 3IL1B 3Q29A 1A55A 5DEXA 1JNFA 3QK6A 4F3SA 2KR0A 1B1XA 3RT8A 2G93A 4XF5A 1MQDA 2FA7A 4IY5A 3K6VA 1ZMGA 3GBAA 3HFUA 4X8RA 3OEKA 3TTKA 4JB7A 1A8FA 4QSCA 2H98A 1DSNA 3RUMA 1D4NA 2WYPA 3THIA 1EZPA 4FIMA 1MM6A 4JWOA 3UA8A 3R7XA 1MXXA 2BJJX 4KYDA 1IMFA 2F5XA 4RK2A 3PV0E 3K2DA 3TUSA 2RCBA 3GBBA 4QF9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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