1MPDA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg), complexed with maltose
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpdA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpdA01
2YJPA 1LSTA 1N84A 4Q0CA 3IAZA 3FASA 3S9MC 5JK4A 5DEXA 1MPBA 3Q29A 2XXPA 4GL8A 4OWDA 1NH8A 4OEVA 2P0SA 4JWXA 2XX9A 5AA2A 1MXZA 4ONYA 2QMXA 2OBGA 4QSEA 4U23A 3SKPA 3WAEA 3KOTA 2LAOA 2F6GA 1Z7ME 4DXCA 1A54A 3MBPA 1VE4A 4KQPA 4I8CA 4G68A 3R7XA 5CM6A 4XKNA 1UIVA 3BFUA 3FVNA 1ZLQA 4KCCA 4IB2A 4OYVA 2OJTA 4OFJA 3IO4A 3D4CA 4GIZA 3RLFE 1JQFA 2M8CA 1MQHA 1TXFA 5H8QB 3Q25A 5DVFA 3UN6A 1UTHA 2ZNUA 1VFDA 3TELA 4G4PA 2Y7RA 5I2NA 2QS2A 2OWSA 3OO7A 1B5HA 4OENA 2OLBA 5EYFA 1P1QA 3PMVA 4H0WA 1B7UA 4G68C 2DP8A 4OTEA 2DE3A 2F7AA 5H8HA 4IO3A 3K4UA 4N07A 1B4HA 1ZBMA 1NMUA 1MQGA 2O68A 3O2AA 1H44A 5CRYA 3MC2A 3SEYA 4Q5TA 1SQYA 3ONMA 3DP8A 1H45A 3UP9A 1URGA 1US4A 1BLFA 1SDXA 3MWBA 1MY0A 4DDDA 1B0HA 1AIVA 1Z7NE 1MXWA 5I84A 4RXLA 5ICTA 4LQ2A 3UORA 1NNKA 4OVJA 1WVJA 1ZTYA 1LAFE 2H98A 4DCYA 3M3LA 3PPPA 4ESWA 1LFGA 4KD5A 1DTGA 5AA4B 3QAXA 5DTBA 4QFOA 2NOOA 4QFLA 3ZKLA 1GGGA 3FIRA 5TPAB 1A7LA 3HHGA 4NF8B 4PQJA 4ZE8A 3IOVA 1MXVA 2F5XA 5ISUA 4NF4B 4JXIA 1ELJA 3RT8A 4FATA 2ONSA 3U92A 3PMXA 4LONB 4C1UA 4LZ7A 3O9PA 1QJMA 1A40A 1PDAA 2H25A 1GVCA 3FVKA 2Q2CA 4XXUA 3FJ7A 4PETA 3VLWA 1URSA 4DXUA 1M5FA 4ZS9A 4YB6A 2DVZA 5L9MA 5H8FA 1MY2A 3G3IA 3CG1A 4NE4A 3SEWA 1Y1ZA 4ND9A 4U22A 3OO9A 3K01A 2RINA 3V8XB 3IB2A 2Q88A 4EXLA 4Q30B 3TCGA 2VHAA 2QPQA 3DM0A 3CFZA 4OXVA 4L17A 1QKAA 4R72A 2UYFA 5I57B 3RPWA 3T9VA 3T9XB 4YKPA 4EF2A 3C36A 1P1UA 2R6GE 2V25A 2Y7PA 3C35A 1S50A 4M1VA 3TUSA 1II5A 4FAJA 2X7PA 2GFEA 2DXRA 4OESA 3KFMA 3LSXA 1LBCA 1Y3PA 4RK2A 4XKQA 1O7TA 3CVGA 4GXSB 2QRYA 2V93A 1J1NA 5KZTA 1VSOA 2RC7A 5FTIA 2HZLA 4PFUA 4JSOA 4P11A 3DLNA 4LZ8A 2GHAA 1OIBA 1JW5A 1ZKBA 5I56B 2G29A 3K1NA 1FTMA 4YKKA 1FQCA 2UVIA 1B4ZA 2O6AA 2V3TA 4GD5A 2XXIA 2Z22A 4JDFA 1JW1A 4F3GA 1HSLA 3OMBA 4R2BA 1DOTA 2ZYOA 1MDP1 4ZZEA 3PGFA 3PUZE 2O7IA 2HXWA 1LB9A 3FGSA 3EF7A 3MP6A 4ZEIA 4G8MA 3FVOA 3K2DA 1NKXA 4F2OA 1SI1A 1D9VA 3CRBA 3C31A 2E0SA 1B9JA 1MY1A 3LC8A 4TOZA 3T96B 5IKBA 1I69A 1QW0A 2ANJA 3LUYA 4AQ4A 2ONKE 1LAHE 1SBPA 1B51A 1B7HA 1RYOA 1MY3A 4DE8A 3VFJA 4GQOA 1FQDA 3KZGA 4JBZA 5CI5A 5DT6A 4QFKA 2H5YA 4R75A 3FVGA 1FQFA 1SW5A 4F39A 2XXWA 4U1ZA 4YICA 4BDRA 2HZKA 4N13A 3E3KA 1UTHB 1SYIA 4QSCA 4G2ZA 4X1DA 2KLFA 5TP9B 3FXUA 3PUWE 4PFTA 4HTGA 1LAXA 1B3GA 4R2FA 1IXCA 5CC2A 2B65A 1FTLA 1JNFA 1HSEA 3K00A 5CMCA 4FJPA 5H8HB 3MUQA 2QMWA 5KDTB 3QYTA 2ESNA 3TEPA 4PFWA 2HAVA 3THIA 1BP5A 4MBPA 2XX8A 4TLLB 2THIA 4PP0A 5IAIA 4E0WA 4F22A 4IO2A 1Y1MA 1NFTA 1MY4A 5I59A 4XKPA 2AYSA 2F97A 2RCBA 5L8DA 2F34A 5KCJB 3S9LC 1JVXA 1H3DA 3IX1A 4ZECA 2UYEA 1PEBA 1ATGA 3A3UA 3IJOB 1R9LA 4RJZA 4DXBA 1TFDA 2ALUA 3RT6B 5I2KB 1ZMGA 3PUXE 4QFNA 2XXTA 2I49A 1I6AA 3HV1A 3HN0A 1MG1A 2P1SA 5JTYA 2RC9A 3N26A 4ZEDA 4NF5A 3H7MA 1EZ9A 2XHDA 2HAUA 3SEVA 2OWTA 1FQBA 4OQOA 2DOJA 4YMBA 3PPOA 1EH3A 3PU5A 3S4UA 1OQGA 2O84X 3FJMA 2DE2A 2DWAA 3T22A 4KI0E 3E13X 2XXYA 1JVYA 1B32A 3W9WA 5AA1A 2XXVA 4NWCA 1FQEA 4IO7A 1SVXB 3HO7A 3WAFA 4R6YA 5FHMA 1EZOA 3FUZA 3IK6B 1QVSA 4QRZA 5H8FB 1P99A 2UVJA 1UTBB 2O51A 1LGBC 2I6EA 3OEMA 2RKMA 3PD8A 1URDA 3RNNA 3N6TA 2Z23A 1JEVA 3RQTA 3FXRA 1KWHA 3RTWB 3PUVE 4ZDMA 3V89B 5H8SA 1N76A 4TQUQ 1QUJA 3H3GA 5F7VA 1Y3QA 3IB1A 1XVYA 4LZ5A 3A3CA 5CBSA 2ZYMA 1GTKA 1USYH 4IO5A 4YAHX 1MXYA 1DSNA 3MVWA 2Y84A 2NXOA 4NF6B 3DP6A 2E1SA 1D9YA 1UQWA 2QS4A 1LCFA 2Y7IA 3OENA 3FJGA 3SESA 3K0VA 1MQJA 2RCAA 1NL5A 3SDFA 5H8NA 1R6ZA 3TMGA 2F7CA 3G7WA 2DXYA 2XD2A 4DCXA 2NVUB 1AL3A 3IOTA 2I0CA 4KCDA 3H6TA 3PMWA 4O3AA 3B7DA 3PPRA 1BKAA 4OERA 1R9QA 4BDQA 3W9VA 3CSBA 4KR5A 1PB7A 4AB6A 4I9DA 3O6HA 1FTOA 4BDLA 1RYXA 4YB7A 3O6GA 2F35A 4THIA 2V84A 1S9TA 1EZPA 4R73A 1MXXA 3VVEA 5EHMA 4QHQA 2FA7A 3RTFB 4HCWA 2HQ0A 2GHBA 4TLMB 3D4GA 4BLAA 1USYE 2O1LA 5HPQA 3MZBA 4GLIA 3VXCA 4ELPA 1M5EA 2Z8FA 3SEXA 4MH5A 4KPTA 3O66A 3KN3A 4KHZE 1M5CA 2QSXA 2QS1A 5ITOA 3C9HA 4RA1A 1US5A 2HEUA 1DMBA 5I58A 4FEBA 2ZMBA 2DE4A 2I58A 1LB8A 2XXQA 3K6XA 4N6PA 3KG2A 2A5SA 4XTCQ 5A5XA 3FV2A 4LP2B 2W7YA 3EPEA 3O28A 4H5FA 3BFTA 2Q89A 1B3FA 4F19A 5ICQA 4ZEBA 3B6QA 1PBPA 1QUKA 4MLQA 2ONRA 3PPQA 4WEPA 4IY5A 1MQDA 2PYYA 3K02A 3T9HB 5BWJA 1PB9A 2A5TB 3H06B 3PUYE 4C0RA 4BDNA 4IGTA 3UA8A 2O7UA 4R9FA 3SETA 4MLVA 5I59B 3IO6A 1OVBA 3GBBA 3U1OA 4H65A 4XIGQ 4OHNA 2NWJA 1SD3A 1B5IA 2WKYA 3TCFA 2DWJA 1YPNA 4KYSA 4QFPA 3KOSA 4M4GA 5H8QA 1LFHA 3Q27A 3TQWA 3EHUA 2Q9TA 4YKIA 4NTLA 5L9OA 2CZLA 2DSFA 2PMSA 1O64A 3W15C 1R1NA 3RY3A 2D5WA 3Q28A 4U2RA 4DLDA 4F1UA 3U93A 1YAEA 2AL4A 3RGYA 3LSLA 4YB5A 4OEUA 3VV5A 1AOVA 1AH5A 2AL5A 4UACA 3S9EA 1FCKA 1HSJA 2VD3A 3PPNA 3SERA 1B58A 2UVHA 3MJNA 2DVCA 4O3CA 5DEXB 5AE4A 3RUMA 3KJTA 3LSWA 4YU0A 5AA2B 3IB0A 1POY1 2F7BA 1B46A 4JSDA 1H76A 3VDFA 3GBAA 3TYHA 4EUOA 1FW0A 1MM7A 1OVTA 3L6GA 1B7ZA 4OMBA 1B6HA 2Y7WA 4FE8A 4G68B 2F6PA 2R71A 1A8FA 1IZ1A 3MVYA 1Y9UA 5B70A 5HBCA 4ELRA 2IEEA 3CFXA 4FORA 1B3HA 4LVQA 2D21A 5AA4A 4EQBA 4GOTA 1B1HA 5FHOA 3JZJA 5TPAA 3DP4A 4NF8A 3CFLA 3M3KA 3B6WA 3OD7A 3S2VA 4NF4A 3OSRA 1B0LA 5I2NB 2PT1A 4DZ1A 4G8NA 2VD2A 3OSQA 4F18A 4RK9A 4E0XA 4NWDA 3DELB 2PBWA 1PBQA 3TODA 1I6BA 4G8HA 3T93B 3ZKKA 5EHSA 1MH3A 1XS5A 3ILTB 1ZU0A 3LR1A 1N7XA 3N94A 4NMYA 1A99A 4ELOA 1LLSA 1M5BA 3I5OA 3VVDA 1NNFA 1LCTA 3EN3A 3OELA 1D3KA 3MPKA 3LSFB 1B2HA 3VXBA 1B52A 3HPIA 1Q35A 2P2AA 4GFRA 1RKMA 1D4NA 1TT1A 2PX1A 5I57A 3H6VA 4QF9A 1B3LA 3N6UA 4LATA 1QUIA 1SYHA 3LBSA 2AIXA 3KEIA 2XXHA 2XXXA 3P7IA 1IQ7A 4H5GA 2I3VA 2Y7KA 3GZGA 2YLNA 4YKJA 3TKDA 4Q8RA 2DWHA 4U21A 1N0TA 3V5AA 5I56A 3TTMA 3CR9A 1ANFA 3IOUA 5K2YA 4IGRA 2ABHA 2V3UA 1F9BA 1XVXA 5AA3A 4ELQA 2RC8A 2XD3A 3OOAA 3VE1B 4POWA 5ITPA 1P1NA 2ZNTA 2NUVA 3QIMA 3R6UA 5HM4B 2O1MA 2Q2AA 3I3VA 3KBRA 3UK4A 3ZSFA 4U4XA 3H03A 1MS7A 1SI0A 1P1WA 3JYRA 5BUUA 1GR2A 3ECRA 4R74A 1WDNA 1MRPA 3C33A 3H6WA 2G93A 3BKIB 3OXNA 2REGA 3FATA 1IXGA 4HCYA 4MFIA 2Z8DA 4EQ7A 1IEJA 4ZE9A 1N04A 3CI8A 2VOZA 1NNTA 4GVOA 4JB7A 4F1YA 1L5TA 3ILUB 3K1MA 3TDJA 4KYDA 5CMKA 3MP8A 2UXAA 4QSDA 1MPDA 1WODA 3TTLA 2O69A 4OETA 3SEUA 5AA2D 4F3BA 3IL1B 5TP9A 3FV1A 4X9TA 1N7WA 5CMMA 4ZZAA 5K2XA 2UVGA 3ZS6A 4OFLA 1DTZA 3MAMA 3OO8A 1MM6A 1LFIA 3TTKA 1JW4A 3IJXB 4OZ9A 2DWIA 2REJA 5KDTA 2B3FA 1NH7A 3TQLA 1EU8A 4ECFA 2DS9A 3C34A 3UIFA 2GH9A 4P0GA 3E9XA 3CG3A 3IORA 3QXMA 3HHFA 2FNCA 4IO6A 2QJEA 3TCHA 3EHTA 2RF1A 1Y20A 2Q8JA 5KCJA 1B1XA 4RYAA 1O63A 1GV8A 4EDPA 5M2VA 1XHYA 5CBRA 4H1XA 5I2KA 4LUBA 2F78A 5CMBA 1IXIA 1FQAA 4POXA 4R6HA 3KJ7A 4I1DA 3G3FA 4ISUA 3KSJA 2B3BA 1MXUA 3FD3A 2I0BA 3C32A 4BDMA 4EQ9A 2ZXTA 4RPOA 3KGCA 1OLCA 5FTHA 4O3BA 3KSXA 1A55A 4P0IA 3N5LA 3KN8A 4GRKA 3PV0E 4IY6A 4RY1A 3TTNA 4XKRA 4JWYA 1N3WA 2FYIA 1IUDA 4H8JA 4F3SA 5F1QA 5DVJA 5JEIA 1MH4A 3UGWA 1T0KA 4LA9A 3U94A 4FEDA 1IITA 2H9BA 3TFLA 2OZZA 4UA8A 2HFBA 4JWOA 3L6HA 1UTBA 1XC1A 4Z0IA 2BJJX 3ODBA 2QL3A 1YCJA 1OQHA 4GF8A 2ZYKA 4GXAA 5TU0A 1Y3NA 1B05A 2D3IA 2VP1A 3E4RA 2GRVA 1PB8A 1Q1KA 3QSLA 4R6KA 1A8EA 4ZEFA 2X7QA 3BBRA 3S9NC 1YTVA 2QS3A 4MF3A 1BIYA 5J1DA 1DPPA 3K6UA 4WKMA 1SW2A 5JTYB 1JETA 4NF6A 1BTJA 4H67A 3A09A 4YMAA 4NF5B 4F3PA 4IO4A 1MQIA 3QUJA 4GL0A 5LOMA 3MZ9A 3U72A 3K6WA 4EXKA 1B40A 4WXJA 1CE2A 5ELVA 4HS7A 2Z8EA 1PC3A 1CB6A 4PFYA 4K3FA 3TTRA 2F36A 3KN7A 3CSGA 3AXFA 1AMFA 2PT2A 4WEDA 2DQVA 2R9JA 3HSTA 1NNPA 4FIMA 1QKBA 2I4CA 4HW8A 1IXHA 1VR5A 3MPLA 3TAJA 4X1BA 4RNSA 5DVIA 4H6DA 4LQ5A 4I62A 1Y4TA 3OO6A 3VLVA 1S7YA 1UIUA 4OFOA 4KFQA 3O6IA 4F2QA 3VVFA 4G77A 3O29A 4F31B 4GWOA 3G3KA 5FHNA 2I4BA 3MW0A 2CMOA 2V3QA 5L9SA 2ZYNA 1FTKA 4EF1A 1B3EA 4U1OA 2I48A 1DPEA 4ESXA 3I6VA 1OLAA 4Z7EA 3HCQA 4PE5B 5DYHA 1P1OA 3F11A 1ZIUA 3TPAA 3K1PA 4FECA 3GXAA 3MQ9A 2I3WA 3M8UA 3VLUA 1B5JA 5H8NB 1QULA 1SW4A 3EQ1A 1M5DA 1ZJLA 3PD9A 3QK6A 2X26A 2DYXA 3V83A 3OEKA 3H4ZA 3JV9A 1Y4CA 3MVZA 4F1VA 1SW1A 3FZVA 2H99A 2YPNA 1FTJA 4X48A 1LBBA 3IR1A 2XX7A 3G3JA 1LAGE 1JEUA 2XXRA 1VFEA 4RPNA 2OK2A 3M3FA 2A5TA 1POTA 4ZEKA 3Q26A 4H8IA 1H43A 1TWYA 3QUFA 3MZ1A 1N3XA 3T9UA 4C1TA 4AB5A 1OMPA 3B6TA 3MVXA 3H6UA 3K6VA 1MPCA 2HCAA 4BDOA 3G3HA 4NEDA 2XXUA 1I6QA 2IA4A 4U4SA 1XT8A 4YZZA 3MP1A 5I58B 3EHSA 2PVUA 3RN8A 2ZNSA 2H4IA 3IOWA 3C4MA 3CIJA 1MDQA 3O97A 4R9GA 1XOCA 2VGQA 3U8QA 2OCUA 3TZAA 2F8DA 3USDA 3FXQA 1TFAA 4F29A 5A5XB 3G3GA 5B7DA 3R26A 4DIGA 1IIWA 4KYEA 3GLBA 3T66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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