1MQJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with willardiine at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA01
2ZNSA 3K6UA 1LBBA 4FECA 1B3LA 1VFEA 1P1NA 3MZBA 4I62A 1CB6A 5BUUA 3B6QA 1B4ZA 1BP5A 5I56A 1MXXA 4JDFA 1QKBA 3KGCA 1IEJA 4MLVA 4YB5A 4NF6A 1LBCA 1A99A 1GGGA 1FTMA 4I9DA 3CFZA 4IY6A 5KDTB 4WEDA 3H7MA 1Y4TA 2BJJX 3IJXB 4GD5A 5I56B 3TTMA 3UIFA 4NEDA 3N6TA 2ALUA 2ZXTA 2Y7IA 5CBRA 4ZZEA 1Y9UA 3I5OA 5H8NB 4U4XA 1FTKA 3TEPA 1LAFE 1NH7A 5A5XA 1B5IA 2Y7KA 3VVDA 3TYHA 5DTBA 4GLIA 3VFJA 1MQIA 4JWYA 1MXWA 3T9XB 1MQJA 4F1YA 1N3XA 4FORA 5CMKA 3AXFA 4LZ8A 1XC1A 2YJPA 2CMOA 3KEIA 4KD5A 1OLAA 1O7TA 2A5TA 3Q25A 1AL3A 1LFHA 1H3DA 2OJTA 4N6PA 3QXMA 1USYH 1L5TA 4G68A 5L8DA 2ONKE 2P1SA 4M1VA 2A5TB 3TCFA 3KOTA 2B3FA 2H98A 4RY1A 1DTZA 4F3PA 1MH4A 5AA1A 4G68C 1AH5A 1XT8A 2Q9TA 1QVSA 1NMUA 3C31A 3TTNA 2RKMA 3MQ9A 2R9JA 4PFTA 1VE4A 1HSJA 4U1OA 4X9TA 3IL1B 3ZKLA 4R9FA 3LSLA 2PT1A 3PUYE 4H5FA 4ZEDA 3PUZE 2DWAA 5ICQA 4XXUA 5FTHA 4H6DA 2QS2A 4BDMA 1NH8A 2V25A 3UK4A 4F18A 3OO6A 4WKMA 5DYHA 4ZE9A 2F8DA 3Q28A 4OZ9A 4JXIA 2AYSA 5L9OA 4FAJA 2XXHA 1FTOA 1XS5A 3LSFB 2DE4A 3RGYA 1Y1ZA 1PB8A 5FHMA 3D4GA 3SETA 1QULA 2DOJA 4NF4A 1N04A 4ISUA 2I4CA 4X1DA 2G93A 3FXRA 4EQ9A 4RA1A 2XXWA 1Y3PA 3A3CA 4QSEA 3TMGA 1HSLA 2F34A 4NF5B 4BDLA 3O6HA 4DXBA 4ONYA 4C1UA 4F3SA 3Q29A 3RT6B 2ZYMA 1XHYA 2I48A 4R9GA 2OWTA 3HN0A 1JQFA 2W7YA 3VLUA 3UGWA 3QSLA 5K2XA 1ANFA 3E4RA 3TQLA 3G7WA 3A09A 4LVQA 4KYEA 1IXCA 1ZBMA 2HEUA 4F1UA 3M3KA 3PMVA 1OVBA 3FVOA 3PUWE 2NUVA 5EYFA 1LAGE 1P1UA 5I2NA 4JSOA 5B7DA 4U22A 1SW5A 1D4NA 2RF1A 4ESXA 1D3KA 1EH3A 2ZNUA 4P11A 4Q5TA 4HW8A 5H8SA 3EF7A 2O84X 1FQBA 2PBWA 1P1WA 4LZ7A 1N76A 2D3IA 4FJPA 4F3GA 4LA9A 2B3BA 4F31B 3ILTB 1LFIA 1BTJA 3KOSA 1LFGA 2O7UA 1POY1 4ZS9A 1SI1A 3S9EA 5F1QA 1IQ7A 3S2VA 3JZJA 2Z8FA 5CC2A 2QMWA 4IO6A 1LAHE 3RQTA 3RY3A 1WDNA 4LQ5A 2Z8DA 3G3HA 4NTLA 4IO2A 1R1NA 3RTFB 3S9MC 1TT1A 4HS7A 2REJA 3JYRA 4H5GA 3H6UA 4F1VA 4QFOA 3MVWA 4ND9A 1BIYA 3LR1A 3VLWA 3MP1A 5I58A 4KCCA 1DSNA 3TTLA 2I0CA 4XKRA 4RK2A 2GHBA 3OEKA 3FV2A 4IY5A 5TP9A 2F7AA 2I3WA 2V3UA 2GFEA 4OHNA 3G3GA 1B4HA 3FASA 2XD2A 3C36A 5CBSA 5ELVA 4LQ2A 1FCKA 1MXUA 3TUSA 3F11A 3H03A 4GFRA 3DP6A 3K6VA 1R9QA 3O2AA 4R6KA 5K2YA 1H45A 1UTBA 4YKPA 3PMWA 4G8NA 5DEXB 5JK4A 4YZZA 4PQJA 3VLVA 2R71A 1FW0A 3FJMA 4I8CA 2AL4A 2P2AA 4R6YA 1H76A 1B1HA 2X7QA 4KFQA 1JNFA 1PEBA 4Z7EA 3TCHA 1MQDA 1WODA 3N94A 4JWXA 4N13A 4POWA 4MBPA 1R9LA 3HO7A 2IEEA 3LSXA 5H8HB 4I1DA 3M3FA 3HHFA 3FXUA 2UVIA 3MJNA 1KWHA 3U1OA 2DXYA 3PV0E 4OFLA 4R2FA 1GV8A 1OQHA 1ZTYA 4R75A 3TCGA 3FUZA 4ZE8A 3VXBA 1QUJA 2VD2A 4NF8B 4IB2A 2XXYA 1Y4CA 5AA3A 4DCYA 3UN6A 1B40A 2Q2CA 3IOTA 5I59A 1S9TA 5TPAA 1A8EA 4QF9A 1Z7ME 1YTVA 3Q26A 1OLCA 4G8MA 2VHAA 1CE2A 4G4PA 1N7XA 1LCTA 2RINA 3VVEA 3CFLA 4GVOA 4N07A 4R2BA 5J1DA 3E9XA 5DT6A 5KZTA 1M5EA 3EQ1A 2HZLA 2ZYKA 5I84A 5H8FB 3TKDA 3MPKA 1FQCA 3B6WA 3TQWA 3TAJA 2NXOA 5CRYA 5EHSA 1Y1MA 3U72A 1SD3A 1I6BA 3KG2A 3C32A 4HTGA 1A40A 1MY3A 1MRPA 3PPPA 4EQBA 1XOCA 2F5XA 4FEDA 1I6QA 1MXYA 1LCFA 2DSFA 4ELRA 4LP2B 5ICTA 1B51A 2V84A 4OERA 4JBZA 1B52A 1MG1A 3OO9A 5CI5A 3H6VA 3ZS6A 4YMBA 2DQVA 2XXUA 4BDNA 1MXVA 3V83A 4NF6B 3PUXE 3S9NC 3QIMA 1N0TA 4ZEIA 3KSJA 3PUVE 1DPPA 1B32A 1MY0A 3VDFA 2NVUB 4PFYA 2E0SA 4F39A 5CMBA 2DYXA 5FHNA 3K1MA 1ZU0A 1H43A 5A5XB 1JETA 4ZZAA 3USDA 1I6AA 4TLMB 4YKJA 4QFLA 1US4A 3FATA 3O97A 3ZKKA 1ZMGA 1O64A 3MBPA 2XX7A 1F9BA 1LAXA 1SI0A 2XXQA 1VFDA 2ZYOA 1T0KA 3O6IA 2RC9A 4BDQA 4X48A 5LOMA 2ZYNA 4RJZA 3CR9A 3M3LA 1QUIA 5CMMA 1PB7A 4LATA 4GF8A 4FIMA 4PFWA 3PD8A 3N6UA 4G68B 1DPEA 2PT2A 2PMSA 1PC3A 2O69A 3D4CA 5TU0A 4E0WA 3S4UA 5M2VA 3GXAA 4UA8A 4KI0E 5ISUA 3KN3A 5I2KA 3IR1A 4K3FA 5HPQA 4G2ZA 3IB2A 2H25A 3E13X 3TELA 3SERA 1OIBA 1YAEA 1S50A 1BLFA 2XXRA 1QJMA 3SKPA 4OETA 1B3HA 1P1QA 3TTRA 2HFBA 2VOZA 4RK9A 3OO7A 1MY4A 4WEPA 3QUFA 4PP0A 2XHDA 1MY1A 4ZDMA 4EDPA 3FXQA 3WAEA 1B7UA 3MUQA 3U92A 4Q30B 1TFAA 1B9JA 3HCQA 4KPTA 4C0RA 5H8QA 3PPNA 5AA2A 1B0HA 4F2OA 2DE3A 2UYFA 3TPAA 3W9WA 1LSTA 1LB9A 3G3JA 4NF4B 4DDDA 3MVXA 3OELA 1NKXA 3MVYA 1IXIA 1ZIUA 1MM6A 4AB5A 2H99A 2WKYA 3W9VA 2R6GE 1SW2A 5JTYA 2F35A 2OBGA 4FATA 3KSXA 2VGQA 3OENA 3O29A 3CI8A 5HM4B 3SESA 4PETA 4U4SA 4QSDA 3VXCA 2XXPA 3KJTA 3UA8A 1LLSA 4YU0A 2DVZA 4ZECA 1B46A 1US5A 1H44A 3BFTA 3CSBA 4HCWA 3OO8A 2Y7WA 1Q35A 1N7WA 2X26A 3LC8A 2KLFA 2RCBA 2Z8EA 3K4UA 3OXNA 3FJ7A 4GIZA 2H5YA 5I2NB 4KCDA 3U93A 3OMBA 3I3VA 3MC2A 1Y20A 4AB6A 2E1SA 4OVJA 4F29A 1O63A 1URDA 2AL5A 4Q0CA 3OOAA 5DVFA 3IX1A 2V3QA 2D21A 5FTIA 2QS4A 1USYE 2QPQA 1FTJA 3FJGA 4ESWA 2Z23A 3RPWA 1DMBA 3FVNA 5BWJA 1PBPA 3OSQA 3RTWB 2Q8JA 3KZGA 2REGA 4OFOA 4RYAA 4KQPA 2QSXA 2VP1A 4GL0A 4ECFA 5F7VA 4OENA 4EXLA 1GVCA 3W15C 2DXRA 1GR2A 2H9BA 5L9MA 4GWOA 1OQGA 4MFIA 3M8UA 3MZ9A 4FEBA 1EZ9A 3BKIB 2ZMBA 4YICA 3EPEA 3PGFA 2Y84A 1J1NA 3DM0A 5I58B 4G77A 4OESA 1YPNA 1AMFA 1B1XA 4KHZE 1ZJLA 3CSGA 1IITA 1SVXB 2YLNA 2X7PA 1SBPA 5TP9B 5AA4A 2Y7RA 2GRVA 3RNNA 4QHQA 1MH3A 4ZEBA 4LUBA 4MH5A 2ESNA 4H8IA 4Z0IA 4F2QA 1B2HA 1JVYA 3K02A 3CG1A 2OWSA 3C4MA 3EHTA 5KCJA 4PFUA 3IAZA 3K00A 3DP4A 4GXSB 1UTBB 3N5LA 4OWDA 2ABHA 3EHUA 4R6HA 2I3VA 2XXXA 4GQOA 1PBQA 1OMPA 3RUMA 4PE5B 1A7LA 1II5A 4R74A 4DXUA 1B0LA 2UVJA 5DVJA 3PMXA 5ITOA 4R72A 3TFLA 4KYSA 3FIRA 4IO5A 3PU5A 1QUKA 2Q2AA 1MPBA 1MS7A 2F97A 4H0WA 4EXKA 3K6WA 1UIVA 3KFMA 4C1TA 2QS1A 2F6PA 4TLLB 4IGRA 3KN7A 2F7CA 4DIGA 2HQ0A 1AIVA 1SDXA 3P7IA 4G8HA 3G3FA 3GLBA 2O7IA 2ANJA 3G3IA 4ELPA 1BKAA 1FQAA 1YCJA 3LSWA 2HAUA 2O1MA 2F7BA 1B7HA 1ATGA 2QJEA 3QAXA 1GTKA 5CMCA 3Q27A 1R6ZA 1RKMA 5I59B 5TPAB 2Q88A 3WAFA 3TZAA 3SEYA 3QUJA 3DELB 3IB0A 5ITPA 2PYYA 4OYVA 3E3KA 2UVHA 5B70A 1DTGA 1EU8A 4U2RA 2DE2A 2OZZA 4E0XA 4RXLA 4FE8A 4POXA 1JW1A 2F36A 3FV1A 4OTEA 1HSEA 5KDTA 2D5WA 3BFUA 2OCUA 1JW4A 3PPRA 2B65A 4H8JA 2VD3A 3B6TA 3CIJA 5H8NA 3O66A 4XKNA 2V3TA 4DCXA 2M8CA 3U94A 1POTA 4MLQA 2UXAA 4NMYA 4Q8RA 3T93B 1DOTA 2NOOA 3O9PA 5IAIA 3IO4A 4OFJA 4AQ4A 5AE4A 2XX9A 4NWDA 2OK2A 3HSTA 3TODA 4ZEKA 1Z7NE 2QRYA 3MW0A 4EF2A 1URSA 1MPDA 1RYXA 2I4BA 4IGTA 3L6GA 3MPLA 1UQWA 2DP8A 3SEVA 1N84A 3T9HB 1P1OA 4YMAA 4NE4A 3VV5A 4F19A 3MWBA 3SEWA 3BBRA 4TQUQ 5DVIA 1VSOA 2DWJA 2I58A 2F78A 3IK6B 4XIGQ 1IIWA 2ONRA 1MXZA 3VVFA 4OEUA 1P99A 3O28A 3OD7A 2AIXA 2RC7A 3K0VA 3SEUA 1M5FA 1NFTA 3R26A 4NWCA 3MP8A 1A8FA 1B6HA 3KBRA 1JVXA 2UYEA 1NNTA 4UACA 2XXVA 4ELQA 1B3EA 2XX8A 4P0IA 1FQEA 3IORA 3ZSFA 1B5JA 3H4ZA 1MQHA 1FQDA 2PX1A 2HAVA 4TOZA 1NNKA 1XVXA 5I2KB 3H06B 3S9LC 4M4GA 2FA7A 2HXWA 4F22A 2O51A 1SYIA 3T9VA 1MY2A 3DLNA 3CVGA 1I69A 3SEXA 4U1ZA 4XTCQ 2QMXA 4YB6A 3LUYA 4L17A 1D9VA 4EQ7A 4NF5A 3ODBA 2DWHA 1Y3QA 1PB9A 1MDQA 1FTLA 4U21A 3QYTA 1ZKBA 4DZ1A 1LB8A 3H6WA 3T96B 1IUDA 3T66A 3OSRA 2H4IA 3B7DA 3OEMA 5AA2D 5H8QB 5AA2B 3LBSA 1Q1KA 1TFDA 3RN8A 2IA4A 3MVZA 3V89B 3G3KA 3ONMA 2G29A 2FNCA 2UVGA 4RPNA 3IJOB 3H6TA 3TDJA 2PVUA 1IXGA 5JTYB 1ZLQA 4XKPA 4OMBA 3T22A 4F3BA 3QK6A 4QFNA 2GHAA 4IO4A 4OQOA 3TTKA 4RNSA 3VE1B 5CM6A 1IZ1A 4U23A 1IXHA 4QSCA 4P0GA 1JEVA 3C34A 1UTHA 1TWYA 1NNPA 3K2DA 2O1LA 3V8XB 3CFXA 4QRZA 3IOUA 1B3GA 1A55A 1B7ZA 2QL3A 2I49A 3PPOA 1TXFA 4IO3A 3HPIA 1UTHB 2O6AA 2Z22A 4THIA 1ELJA 3PD9A 3MAMA 4IO7A 2P0SA 3EN3A 5I57A 4O3CA 1MM7A 3ECRA 2QS3A 4DE8A 3K1NA 4JWOA 1OVTA 3FVKA 2XXIA 3JV9A 2LAOA 3UORA 1VR5A 4BLAA 1M5DA 2XXTA 4H65A 4GL8A 1A54A 5I57B 4EUOA 1B05A 4BDOA 1RYOA 3T9UA 1WVJA 3K01A 4OXVA 4YKIA 2Y7PA 1LGBC 2THIA 3ILUB 2RCAA 4WXJA 3EHSA 3IOWA 4QFPA 3GBAA 1QW0A 3IO6A 4DLDA 3DP8A 4JSDA 1MDP1 2FYIA 1JW5A 3CRBA 2Q89A 1NL5A 4GOTA 1MQGA 5DEXA 1M5CA 3HV1A 4BDRA 3A3UA 3UP9A 1SW4A 3HHGA 1SW1A 1EZPA 3U8QA 3FD3A 1AOVA 4R73A 1XVYA 5AA4B 4XKQA 1S7YA 2I6EA 1MPCA 1URGA 3GBBA 2ONSA 3FZVA 3KN8A 2DS9A 1B58A 3PPQA 4X1BA 3RT8A 1JEUA 2HCAA 2O68A 4H1XA 4YB7A 1N3WA 3CG3A 5KCJB 2DWIA 5EHMA 5H8HA 4RPOA 4QFKA 3C9HA 3V5AA 4YKKA 1QKAA 4OEVA 2OLBA 1SYHA 3MZ1A 2A5SA 2GH9A 3R6UA 3RLFE 3THIA 3FGSA 1PDAA 5FHOA 2NWJA 3MP6A 3FVGA 1SQYA 2XD3A 4EF1A 4LZ5A 4NF8A 3C33A 3C35A 4HCYA 2ZNTA 1UIUA 2CZLA 3IOVA 3L6HA 4ELOA 2YPNA 1D9YA 3O6GA 2I0BA 4GRKA 2F6GA 2DVCA 3K1PA 4GXAA 3N26A 3H3GA 4O3BA 3K6XA 3GZGA 4KR5A 1FQFA 3SDFA 5H8FA 5IKBA 3KJ7A 4DXCA 4JB7A 4H67A 4MF3A 2HZKA 5JEIA 3R7XA 1B3FA 1EZOA 5L9SA 1NNFA 1B5HA 5HBCA 4ZEFA 1Y3NA 4O3AA 1M5BA 3IB1A 4LONB 3I6VA 4YAHX 2V93A 2RC8A 4KYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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