1MXUA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine (control for the crystal titration experiments)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxuA01
1QUIA 1SW5A 2XXXA 2I4BA 4GFRA 3TAJA 1B3LA 2Y7PA 3ODBA 1T0KA 5H8NA 4R2FA 3GZGA 1B51A 4ECFA 3HHFA 3ZKKA 2I0CA 3H7MA 1SD3A 4IO7A 5B7DA 3O2AA 1USYH 1MS7A 2Y84A 1HSJA 2FNCA 4GRKA 1SW2A 4POWA 3I3VA 4TLMB 4IY6A 3EHUA 4LQ5A 4UA8A 1JVYA 3KOTA 2E1SA 2OK2A 3C9HA 1DPEA 2XX8A 2DQVA 5FHNA 3B7DA 1R9QA 1FTLA 1NMUA 5TPAA 3OSRA 3VLWA 1H45A 4ONYA 2P0SA 5I56B 4G68C 1SYHA 4Z7EA 1LBCA 3PUWE 2V3UA 1LSTA 1BKAA 4KCDA 1FTKA 4EQBA 1FCKA 2UYEA 4G2ZA 1H76A 3SEVA 1BLFA 3KSJA 4DXCA 1I69A 1J1NA 3VLUA 2ONKE 1MQDA 4MFIA 4OTEA 2OCUA 4F22A 1MQGA 3MVZA 1A8FA 5M2VA 1MXWA 4YB6A 2DWJA 2F5XA 4RYAA 1UQWA 1MPCA 4JSOA 2RKMA 5DVJA 2DE2A 3A3CA 2V93A 4NEDA 2F7BA 4DCYA 3RLFE 3V8XB 4FEDA 3RT8A 3K2DA 3R26A 1URDA 4KFQA 2XXTA 4F31B 1RKMA 2DE3A 3O6IA 4GXAA 3HN0A 2Q9TA 3FVGA 4NF6B 3G3KA 3RN8A 2G29A 4F19A 5ITPA 4ZDMA 4QFNA 1DOTA 3K6UA 3SETA 5JK4A 1XC1A 3IB2A 1YAEA 2UXAA 2F7CA 1JW1A 2XXVA 4MH5A 4ESWA 1JVXA 3VVEA 5H8FA 4OQOA 2F97A 2RC9A 3KJTA 5HBCA 4LA9A 2ZYKA 1TXFA 4LP2B 5BUUA 1R1NA 5H8SA 3AXFA 3PPNA 4OEVA 3TKDA 1M5DA 2R71A 3LSLA 4I62A 2Z8DA 5DT6A 4DXBA 5I2NA 1SYIA 2OJTA 4MLQA 3O9PA 3KFMA 4GD5A 1FQFA 3PD8A 3MZ9A 3E3KA 2Y7RA 1MRPA 3IK6B 3IOWA 1TFDA 3RPWA 2Z8FA 1XVXA 3FD3A 5LOMA 2F78A 1JNFA 2O84X 2WKYA 3VV5A 1WVJA 4U23A 1NFTA 4XKPA 3SEWA 1HSLA 1B0LA 5H8HA 4R9GA 3A09A 5CI5A 4YU0A 1MDP1 1MPDA 4QRZA 2XHDA 4ZS9A 3HSTA 4OZ9A 4I1DA 4LVQA 4F3PA 3VLVA 1LGBC 4K3FA 1ZMGA 4AQ4A 4XXUA 2PBWA 3K6WA 3MVYA 1P99A 3TTKA 3D4GA 3UGWA 4KD5A 1UTHA 4JWOA 3S4UA 3CFXA 5JTYB 2P1SA 4FATA 5FTHA 1P1WA 2E0SA 3G3HA 3B6WA 3EPEA 3H6VA 4OFOA 1FTJA 1MY4A 1B9JA 1EU8A 4BDQA 2I58A 1AMFA 2X7PA 3EF7A 4YB5A 3HV1A 4ZEFA 1B58A 2UVIA 3C31A 1ZLQA 4LQ2A 5AA4A 2VOZA 1WODA 2DOJA 4ZEKA 3T9VA 1MPBA 3HPIA 5ICTA 2F35A 5TU0A 1URSA 2I0BA 2V3TA 4RJZA 4RPNA 2O6AA 3K01A 1B5HA 4R73A 5I58B 1IZ1A 5AA2B 4H5FA 4M1VA 2HEUA 3CR9A 3BBRA 3MUQA 1MQHA 1US5A 2UYFA 1R9LA 4WEDA 4EDPA 3PMVA 3ZSFA 3UA8A 5KDTB 3RUMA 5DEXB 3IOVA 4R74A 1NH8A 4PETA 3BFTA 2ZNTA 2Y7WA 5DVFA 1SDXA 1OVBA 4RXLA 3K4UA 5AE4A 4F18A 2AL5A 2Q89A 2CMOA 4KYSA 2V3QA 2DS9A 3BKIB 3KSXA 1O7TA 4Z0IA 3U72A 5F1QA 1SI1A 1B32A 3L6HA 1BTJA 3G3FA 3TPAA 3PGFA 3IOUA 1Z7ME 3FATA 4E0XA 4OHNA 1EZOA 1B3FA 4P11A 1RYXA 4NF4B 2XXRA 2P2AA 4O3BA 3M3FA 5IAIA 3C4MA 4TLLB 3UORA 3C34A 4QSEA 4ESXA 1PBPA 4P0GA 4R72A 5TP9A 3JZJA 3QK6A 3WAEA 3MWBA 3PD9A 4H67A 1JEVA 2R9JA 1II5A 2CZLA 4R9FA 4PFYA 3KBRA 4H0WA 3MQ9A 1EZ9A 2G93A 3SEXA 2DWHA 2ZMBA 2VD3A 3O97A 3IO6A 1H3DA 3PUZE 1A40A 3C32A 3GLBA 3G3JA 3PUVE 3IR1A 1I6QA 4PE5B 4FIMA 3FVNA 4OFJA 4C0RA 1SBPA 4YKJA 4KPTA 1Y3PA 2ZNSA 3Q27A 1XS5A 1Y20A 3B6TA 3VXCA 3O6HA 1QKBA 4YKPA 3S2VA 2BJJX 4F39A 1B1HA 1XOCA 1UIUA 2THIA 3OELA 3K0VA 1LFGA 2W7YA 5IKBA 3PU5A 2XX7A 4R2BA 1B05A 2NOOA 4PP0A 5K2XA 1D4NA 2ABHA 2QPQA 3UN6A 4RY1A 1SVXB 4THIA 1BIYA 3MP8A 1Q35A 3CSGA 4C1UA 3MPKA 1B46A 5DYHA 4R6KA 1ELJA 4EF2A 2OWSA 4ZE9A 2DSFA 2XX9A 5I2KA 1QJMA 4YMBA 1Z7NE 1P1QA 3IJOB 1LAHE 5A5XB 1ZKBA 2I3WA 5I57B 3RTWB 3THIA 4YB7A 5CRYA 1JW4A 1LB9A 2R6GE 1LLSA 4KYEA 1GVCA 4H8IA 2DWIA 2D21A 4OEUA 1USYE 2GH9A 1LAGE 1NNTA 3G7WA 3P7IA 2QS4A 2I4CA 3FUZA 3IORA 4LZ8A 2O69A 4QFLA 2IEEA 3TTLA 3TYHA 4U4SA 4U22A 3MW0A 4UACA 5H8QA 3E13X 4LZ7A 2B3BA 1UTBA 1YPNA 1Y1ZA 2RCBA 3H4ZA 3V83A 4Q5TA 4EXLA 1AL3A 4IB2A 2ESNA 3VFJA 3QUFA 1MY3A 1MM7A 4PFWA 3TQLA 1JW5A 4F3GA 4ZE8A 2XD3A 5TPAB 1OMPA 1MXXA 2HXWA 3OOAA 1MY0A 3MPLA 3RTFB 1N84A 4Q0CA 2NUVA 3TQWA 5CMCA 5AA1A 3CVGA 2VD2A 4G77A 3ECRA 1Q1KA 4JBZA 4E0WA 4I9DA 2F6PA 4H5GA 3EN3A 3K1PA 4F3BA 3BFUA 1VSOA 3PMXA 4OMBA 3OENA 4DE8A 3WAFA 4ELPA 3HO7A 4F2QA 1A8EA 2PVUA 1Y4TA 2I6EA 4IO6A 2REJA 4G8NA 1IITA 3KN7A 3TTNA 5L9MA 3T9XB 1CE2A 3DP6A 4DLDA 3MVWA 4X1DA 2A5TA 3QXMA 1Y3NA 2IA4A 5JTYA 4AB6A 1KWHA 3CG3A 4R6YA 3GBBA 1MXVA 2VHAA 1S9TA 2M8CA 2DVCA 2QL3A 4BDRA 1N3WA 2VGQA 3DP4A 2QJEA 1CB6A 2Y7IA 4EQ7A 4HW8A 2AL4A 4KR5A 2DXRA 4U4XA 1LFIA 5I2NB 1UIVA 1M5BA 1QVSA 1Y4CA 4OXVA 2OLBA 3H6UA 1B7UA 1FW0A 2HQ0A 4JWYA 2UVJA 1ZIUA 2ZYOA 5I58A 3G3IA 1P1NA 2PX1A 5AA2A 1B7ZA 3Q26A 1SW1A 3S9MC 1MM6A 2HCAA 5ISUA 3SKPA 4QFOA 3H3GA 4DDDA 1B4ZA 1BP5A 2H99A 1ZJLA 4PQJA 1M5CA 1S50A 1PB9A 2B65A 4LUBA 1YTVA 3LBSA 5H8HB 1YCJA 3MZBA 4P0IA 4OYVA 3FVKA 1SW4A 2ONSA 3CFZA 2F6GA 2XD2A 3MZ1A 4ZECA 3CSBA 4L17A 2VP1A 3KZGA 3EHTA 4DIGA 1NH7A 4RNSA 5DTBA 3Q28A 4I8CA 1QUKA 3T9UA 4NF5A 4C1TA 3EQ1A 2F7AA 2HFBA 3HHGA 3K02A 2YLNA 1QW0A 4QFPA 3KJ7A 1UTHB 4U2RA 1MH3A 5F7VA 3H06B 3K1MA 4Q30B 4EXKA 5KCJB 2DE4A 5I59B 4MLVA 4GIZA 3EHSA 1S7YA 4YZZA 3E4RA 1GTKA 2KLFA 3T96B 3S9LC 3MJNA 3PPQA 4RA1A 2HAVA 5K2YA 3W9WA 4GXSB 1N76A 1OIBA 2O1MA 3N5LA 4BLAA 1MXYA 3DP8A 3KN3A 4X9TA 4G8HA 1NL5A 4FAJA 5AA4B 1L5TA 2QRYA 1LAXA 3QUJA 2XXIA 3VE1B 4X48A 1ATGA 4XKNA 2XXPA 2UVHA 1B3GA 4TOZA 1VE4A 3OEKA 1OLAA 5CMMA 4U1ZA 3PPPA 3VVFA 3U92A 5CBRA 4NF8B 3TDJA 4RK9A 3FXUA 3UP9A 5ITOA 4GL0A 2X26A 1B40A 4ZEBA 4IY5A 3FV2A 2ANJA 4WEPA 3JV9A 3RNNA 1EH3A 1MXZA 4F29A 3PPOA 3D4CA 3FV1A 1MDQA 2O7IA 4EUOA 4H1XA 4U21A 1LCTA 3UK4A 2D5WA 2PT1A 3OO8A 3ONMA 3QAXA 1IQ7A 5CC2A 1D3KA 1B3EA 1NNPA 5CMKA 1B3HA 4XKQA 1B7HA 2QMWA 5ICQA 1B5IA 2QS2A 4F3SA 4FECA 2PT2A 1B2HA 3Q25A 3QIMA 4OETA 4ELRA 4IGRA 3TZAA 2Q8JA 3OMBA 3CI8A 2PYYA 2H98A 3K6VA 3O29A 1MH4A 5B70A 5TP9B 3LC8A 3RGYA 4JWXA 3CIJA 3N6UA 4H6DA 1B4HA 5I56A 1FTOA 3K1NA 3I6VA 1LBBA 2GFEA 5I84A 3E9XA 2V25A 1DPPA 4G68B 4QSCA 3ILUB 4Q8RA 3O6GA 4PFTA 1DTGA 4NE4A 4BDLA 1FQDA 3FASA 4O3AA 1B0HA 2UVGA 2Z8EA 3A3UA 3F11A 2O1LA 1P1OA 4KI0E 5CBSA 2DP8A 4IGTA 1FQAA 4GF8A 3OD7A 3V89B 3CFLA 5BWJA 5FTIA 3SERA 2REGA 2H4IA 3W15C 2O68A 4M4GA 2ZYNA 2PMSA 2O51A 3TTRA 1M5FA 3T9HB 3OO7A 4KHZE 4ZZAA 3DELB 2DVZA 3SEUA 1QUJA 4WKMA 1OVTA 3M3LA 4N07A 1PDAA 3TELA 1IEJA 3OEMA 4NF6A 2XXQA 3VXBA 4H65A 3LSFB 1TWYA 5H8NB 3SESA 2V84A 2DWAA 2FYIA 4IO3A 1LFHA 1IIWA 1DMBA 1RYOA 4G4PA 4DXUA 2Z23A 1PB8A 2GHAA 3USDA 3SDFA 1OLCA 2F34A 2I48A 5I2KB 4QSDA 3R6UA 1AOVA 4KQPA 5EHMA 3TFLA 3TTMA 2ONRA 4GOTA 2Z22A 1XHYA 3MP6A 4H8JA 2RC8A 4YAHX 2H9BA 2OZZA 3TCFA 1ANFA 1IXHA 2HZLA 3ZS6A 1MXUA 1D9VA 3OO9A 4ZEDA 1N04A 1NKXA 4OVJA 3HCQA 4GQOA 4HCYA 3KG2A 2O7UA 1MG1A 5CM6A 3LSXA 3ZKLA 1ZTYA 4F1UA 3U94A 3PUXE 1F9BA 4KYDA 4WXJA 1SI0A 1O63A 1QULA 4F1VA 3L6GA 2YPNA 2QSXA 4POXA 5FHMA 4G8MA 4IO2A 4HCWA 2NXOA 3T93B 2DYXA 3OO6A 3TCGA 2OBGA 2XXWA 2F36A 3RT6B 3MBPA 3H03A 2XXHA 5H8QB 1N7XA 1PB7A 2D3IA 1UTBB 4X1BA 3C35A 5CMBA 1IXCA 3M8UA 3LUYA 4JSDA 2QS1A 1MY2A 1JETA 2FA7A 1FQBA 3M3KA 3TEPA 5J1DA 3Q29A 1AIVA 4BDMA 1MY1A 3G3GA 1US4A 2QMXA 4RPOA 2I3VA 4KCCA 3FJ7A 4BDOA 4N6PA 1GV8A 3U8QA 2ZXTA 2RC7A 3IO4A 1WDNA 4OERA 1QKAA 5JEIA 5HM4B 1A55A 3FJGA 1AH5A 1GR2A 3RQTA 1XVYA 1I6AA 5DVIA 5H8FB 4BDNA 3LR1A 3LSWA 2RF1A 2B3FA 3OXNA 3MVXA 4HS7A 5KZTA 3FXRA 4EQ9A 4HTGA 1Y9UA 3MAMA 4JXIA 1VFEA 4GL8A 4ND9A 1MQJA 3IB0A 1A99A 1N3XA 3FGSA 3PV0E 3KOSA 4PFUA 4NTLA 3IOTA 4N13A 1D9YA 2A5SA 3IAZA 1IXIA 4FJPA 4LONB 4XTCQ 3CG1A 5EHSA 2A5TB 4TQUQ 3MP1A 5KCJA 4MBPA 3H6WA 5I59A 3PMWA 4DCXA 1FQEA 3QYTA 3JYRA 5FHOA 3N94A 5KDTA 2Q2AA 5DEXA 1P1UA 3V5AA 1PEBA 4ISUA 4YKIA 3TCHA 2ZNUA 4F1YA 4U1OA 5AA2D 3FZVA 3OSQA 3IB1A 1I6BA 3TMGA 2HZKA 4NWDA 1N0TA 3N26A 3N6TA 3RY3A 3TODA 3T66A 3MC2A 1PBQA 4ZZEA 4NMYA 4NWCA 2H25A 4ELOA 3TUSA 3KEIA 1B52A 3O28A 1M5EA 2AYSA 1NNFA 3GXAA 4FORA 3K6XA 3C36A 2ZYMA 1POY1 2HAUA 1VR5A 4QF9A 4LZ5A 4NF4A 3PUYE 4YKKA 1OQGA 1PC3A 4IO4A 3VDFA 2XXYA 5L9SA 4NF8A 2NVUB 4IO5A 3S9NC 4EF1A 2LAOA 3QSLA 2YJPA 1XT8A 3C33A 3R7XA 3GBAA 2XXUA 4XIGQ 3FIRA 3K00A 4OFLA 1R6ZA 3FJMA 3O66A 1B6HA 1DSNA 3W9VA 4OESA 4DZ1A 3KN8A 4R6HA 4GLIA 3KGCA 4QHQA 2AIXA 1URGA 4F2OA 4R75A 5EYFA 1B5JA 1ZU0A 1EZPA 1JEUA 4YICA 1NNKA 3S9EA 3U1OA 2NWJA 4NF5B 1OQHA 3SEYA 3PPRA 2DXYA 1ZBMA 4LATA 1H43A 3FVOA 4GVOA 1A7LA 1N7WA 4YMAA 2GRVA 3I5OA 5HPQA 1IUDA 3IL1B 2Y7KA 2F8DA 1JQFA 2Q88A 4OWDA 2OWTA 1IXGA 4O3CA 1Y1MA 2Q2CA 1MQIA 3DM0A 1H44A 1O64A 1A54A 4G68A 3U93A 1TFAA 1FQCA 5L8DA 1HSEA 3UIFA 4ELQA 4JB7A 2ALUA 1FTMA 1VFDA 4AB5A 1LCFA 2RINA 1Y3QA 4QFKA 4RK2A 1TT1A 4MF3A 2H5YA 4ZEIA 5A5XA 1POTA 3IX1A 4FE8A 5I57A 2RCAA 5L9OA 1LAFE 3VVDA 3H6TA 4XKRA 3IJXB 3T22A 3FXQA 4GWOA 5AA3A 1GGGA 1DTZA 4OENA 2I49A 3ILTB 2X7QA 5ELVA 1B1XA 1LB8A 4JDFA 1SQYA 2QS3A 2GHBA 4FEBA 3B6QA 3CRBA 3DLNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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