1MXXA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 um brw)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA01
2ABHA 4GWOA 4RK2A 4OVJA 4ELQA 1EZOA 4NF4A 5A5XB 1MY2A 3A3UA 1SI0A 2ZXTA 1M5FA 3HN0A 1JEUA 4HCWA 4H5GA 2V3TA 4FIMA 3LUYA 1PB8A 3IR1A 1B5JA 1FTJA 1B0HA 1P99A 4EF2A 3FV2A 3H3GA 2HQ0A 1FQCA 3OO7A 2PX1A 2Z8FA 1UIVA 2OJTA 1D9YA 2AL4A 1XHYA 2F5XA 3RQTA 2ZMBA 1LFIA 1OVTA 3PMWA 5I57B 5H8FB 3WAFA 3T96B 4FECA 3KOSA 2I6EA 3TEPA 5KCJB 3G3JA 2RF1A 2PVUA 5ICTA 3E3KA 1N0TA 2ZNTA 2KLFA 3LBSA 3C33A 1SYHA 3K6VA 3MVXA 2CZLA 1UTHB 3KBRA 5AE4A 5TU0A 5H8HB 1Y3NA 3SESA 4ZE9A 3O6GA 4P0GA 1QKAA 2F34A 4AB5A 2F7CA 3RTWB 4NF6A 4UACA 4Q30B 1MXXA 1M5DA 3S9MC 5HBCA 1N84A 5CMMA 2R71A 2E0SA 1DOTA 1HSJA 1A8EA 2I4BA 3BBRA 1BIYA 4HS7A 3B7DA 4U1OA 3S9LC 1LFHA 4TLMB 3CSGA 4RJZA 2V3QA 4NWCA 3PUWE 4DLDA 3N94A 1B6HA 1ANFA 5CMCA 1MY1A 1AH5A 1S50A 1O64A 4QFPA 1JETA 4ZEFA 3TTKA 3T9VA 1I6QA 2OZZA 1MQJA 3R7XA 4EQ7A 1NNTA 1B2HA 3KG2A 4UA8A 2REGA 4ESWA 5IAIA 3SEWA 4RPNA 1B52A 4YZZA 1GVCA 3HCQA 3KN7A 1I69A 4JSOA 4GOTA 1B1XA 4GIZA 3FV1A 1ATGA 4N6PA 2UYEA 3K6WA 3PMXA 4ELOA 4IO5A 3FGSA 4ISUA 5BWJA 1RYXA 1OVBA 2XXIA 2Z23A 3TTMA 4XKQA 1PBPA 1LAHE 4LP2B 1H45A 1DTGA 3TAJA 1FTMA 3K1MA 3K6XA 4WEDA 5FTHA 1A54A 4ONYA 1MH3A 4YKJA 3OMBA 4QFNA 2DSFA 4PETA 3WAEA 4XKNA 2I49A 4HCYA 3T22A 2QMWA 2VD2A 3OOAA 1AIVA 2NVUB 5CRYA 3U92A 2R6GE 1QULA 3RLFE 5DVJA 2I3WA 3TCGA 3DELB 2AYSA 4G8MA 5CI5A 1YPNA 1WDNA 4F39A 1XVXA 3LC8A 4KYEA 3DP6A 1Y1ZA 4MBPA 1N7WA 2O51A 2VHAA 1IITA 4FEDA 2XXWA 2XX7A 1AL3A 3K6UA 2Y7KA 4QSEA 4THIA 3MP8A 2YJPA 3IK6B 1XOCA 5ICQA 4KPTA 1NNFA 3GBAA 4PFUA 2Q8JA 1SI1A 4ELPA 1SD3A 3H7MA 5AA4A 4X48A 4C1UA 4GVOA 2ZNSA 3A3CA 3TTLA 1MG1A 1ZKBA 2PT2A 1P1WA 4I1DA 1FW0A 2O84X 2D21A 3PPNA 4DDDA 3M3KA 5DVIA 1VR5A 2QJEA 4AB6A 3HSTA 4EUOA 3O6HA 3MJNA 4DZ1A 4EXLA 4OFOA 3KN3A 3I5OA 3R6UA 1PC3A 1MPBA 5AA1A 3TPAA 3CRBA 4ZEKA 4POXA 1VSOA 3FJMA 5KZTA 2XD2A 4BLAA 2Z8DA 2W7YA 3CFXA 1NNPA 2ZYNA 3O28A 5H8QA 2Z22A 3V83A 4GQOA 5HPQA 3EQ1A 4R2FA 2XXTA 4QFOA 4IO6A 4XTCQ 4NTLA 1LSTA 1BLFA 3LSLA 1FQBA 3PMVA 4BDMA 3T9XB 4DE8A 3M3FA 2HEUA 4G68A 4F1VA 2QMXA 4Q5TA 4XKRA 1QVSA 1LGBC 3KOTA 1SYIA 5F7VA 2XXYA 4HTGA 2BJJX 4IGTA 3HHGA 4F3PA 2FNCA 5CBSA 3SEVA 1IIWA 2H9BA 2XD3A 4YKPA 1FQDA 4R73A 1Z7NE 1B3EA 4O3AA 1B1HA 2AIXA 4YB7A 2V93A 2A5SA 2B3FA 4ECFA 1R1NA 3G3FA 2Q88A 1MPDA 2Z8EA 4OEUA 2ZYKA 3DP8A 2DXYA 2XXHA 3C4MA 4KYDA 1GR2A 2HXWA 4GFRA 5TPAA 4IB2A 3KGCA 4YMAA 2O69A 1B9JA 1TT1A 3K02A 4YKKA 3Q29A 1Y3PA 4TOZA 2QSXA 4ZZEA 1JQFA 1L5TA 1SVXB 2VGQA 4KR5A 3TELA 4LVQA 5DTBA 4QFKA 3Q28A 1MXWA 3M3LA 3S4UA 2GFEA 1MQGA 3EHTA 1POY1 1A8FA 1MXUA 5L9OA 2XXXA 4QSDA 1OQHA 3BFTA 2ONKE 4F29A 1CB6A 2X26A 1Y20A 3IJXB 3K00A 4R6YA 1QUKA 1UTBA 3G7WA 1B32A 4YB6A 1N76A 2HZKA 2H4IA 2UVHA 3HHFA 3IB0A 4RYAA 2DWAA 1UQWA 1LB9A 4G2ZA 1B58A 2F7BA 2DP8A 2UVGA 3EPEA 4QHQA 4DCYA 1FQAA 3IB1A 1B4HA 5DT6A 2DOJA 4YAHX 4GD5A 2Y7PA 5JTYA 1JVXA 3C32A 3G3HA 3HO7A 3OEKA 4F31B 5EYFA 1A55A 3G3GA 3LSWA 1H44A 3PUVE 3U72A 1IZ1A 1B0LA 2UVIA 4YMBA 4R74A 1ZMGA 3C35A 3P7IA 4PE5B 4NF5B 3G3KA 2DQVA 3PPQA 1ZBMA 2OK2A 4OFJA 2OWSA 4Z0IA 3OO6A 3I6VA 4ZZAA 4KCCA 4R9GA 3DP4A 2P0SA 3GZGA 2F35A 5EHSA 3C36A 4ZEDA 2ONSA 5K2YA 5L9MA 3K1NA 3OD7A 2DS9A 1P1OA 3FXQA 4KFQA 4EQBA 1Y3QA 2VD3A 4JBZA 4IGRA 3MPKA 2RCAA 3TTNA 4LUBA 4N07A 3LR1A 4FE8A 1B05A 2I0BA 3USDA 2REJA 1US5A 4BDNA 2FYIA 1XS5A 2H99A 3PUZE 4O3CA 3QSLA 4I8CA 3S9EA 3DLNA 1JNFA 2B65A 2O1LA 5I2KB 3O29A 4PFWA 5B7DA 5FTIA 3M8UA 5KDTB 2HAUA 3SEUA 2F78A 3K2DA 2O7UA 3UP9A 2DYXA 4F1UA 5CC2A 5DEXA 2DE4A 3MC2A 3FXUA 2GH9A 1MDP1 2F36A 2Y84A 3FXRA 3TKDA 3SEXA 1IXHA 1NFTA 4IO2A 1TXFA 3OO8A 3IORA 2X7QA 3W9VA 3RGYA 3ILTB 2Y7WA 3FJ7A 4ZDMA 1URDA 3JZJA 1USYH 1LCFA 1URGA 4QRZA 4BDLA 2Y7RA 1OMPA 1TFAA 3TTRA 3H6VA 1D3KA 3S9NC 2I48A 1WODA 2OBGA 4G68B 1URSA 1SW4A 4GLIA 3N26A 2RC8A 2ZYMA 5AA2B 2O68A 5CMKA 2E1SA 2VP1A 2RC7A 5A5XA 3UN6A 1SW5A 2DWHA 4H0WA 2OCUA 4RK9A 1IEJA 3SEYA 2I4CA 3O6IA 4RXLA 2YLNA 4NF8A 5LOMA 5ELVA 3MP6A 4KD5A 4LQ5A 3PPOA 2QS4A 1N04A 1PEBA 1USYE 4FORA 4OWDA 3T9UA 3QK6A 2HFBA 4DXCA 2Q89A 1DSNA 3D4CA 4C1TA 5JK4A 4G77A 1OLCA 4F3SA 2A5TB 1Z7ME 3K01A 4R72A 4EDPA 3ONMA 2D5WA 5K2XA 3VVEA 3ILUB 1DTZA 3KN8A 3B6WA 1Y1MA 5FHMA 3PUYE 2P1SA 1Q35A 5H8FA 5I57A 4OYVA 1QUIA 2Q2CA 3JV9A 3ZSFA 1GV8A 5H8NB 2QS1A 3CIJA 4JWOA 4RA1A 1B46A 5I84A 1N3WA 2CMOA 4DIGA 3BKIB 3MW0A 5I2NB 3PD9A 1UTHA 1II5A 3EF7A 5I58B 3H6UA 4F2OA 4BDRA 3U1OA 2H25A 5H8HA 2F97A 1MDQA 4IO3A 3H03A 1TFDA 3TYHA 2ANJA 3H6WA 2DXRA 1D9VA 4KI0E 1O7TA 3E13X 2UVJA 3K1PA 4MFIA 1P1NA 2R9JA 4F3GA 3FATA 4DCXA 4P0IA 4NF4B 3MVYA 3IOVA 3GLBA 1SQYA 4OERA 4AQ4A 1GGGA 4NWDA 1UIUA 3FZVA 5L9SA 4BDOA 3DM0A 3IOUA 5CBRA 4H67A 4U21A 4EF1A 1NNKA 3UK4A 4TLLB 5JEIA 4KCDA 4OZ9A 1LBBA 1XT8A 1PB7A 3KJ7A 1MM6A 3SETA 2NXOA 4NMYA 4I62A 1OQGA 2O7IA 1R9QA 4G68C 1Y4CA 1B5HA 4QFLA 2XX9A 4P11A 1S7YA 3T66A 2UXAA 3TZAA 4WKMA 3CFLA 1H76A 4OHNA 2P2AA 1F9BA 3MPLA 1VFDA 4FAJA 3QIMA 4ZEIA 1A99A 2IEEA 1TWYA 1EU8A 1YAEA 1RKMA 3IO4A 2I3VA 4NF6B 4LATA 4LQ2A 1FTKA 3TCFA 3TFLA 3K0VA 3RNNA 3OENA 1SW2A 4LZ7A 4BDQA 3B6QA 1NL5A 2V84A 1IXIA 1D4NA 1S9TA 3C9HA 3EN3A 4O3BA 3GBBA 1B5IA 4U23A 4X1BA 3TUSA 1B4ZA 1LAFE 3CI8A 4YU0A 4ZECA 3FIRA 5DEXB 3OSQA 2XXRA 1IUDA 3Q26A 2Y7IA 3RTFB 2QS3A 5TP9A 1Y9UA 3IX1A 3PV0E 1LLSA 3OSRA 3TQLA 1N3XA 3IOWA 3TDJA 4KQPA 3RT6B 2B3BA 2QL3A 2PT1A 1DMBA 3IAZA 4FATA 3VDFA 2Q9TA 5I56A 5I59A 1NH7A 3U94A 5AA2D 3U8QA 1HSEA 5AA3A 3GXAA 4XKPA 2X7PA 3S2VA 3VV5A 4IY6A 4ZE8A 4OXVA 3UGWA 3FASA 3VE1B 5H8SA 1B3HA 5IKBA 4U2RA 1FTOA 4Q0CA 4MLVA 3T93B 3H6TA 1MH4A 3O2AA 1P1QA 4H8JA 1HSLA 3TCHA 4H65A 1MQIA 1B3GA 3C31A 1LAXA 2OWTA 4NF8B 1B7HA 3H06B 3L6HA 4ZEBA 3QXMA 4RPOA 1DPEA 1QKBA 3CG1A 1MQDA 1ZLQA 4U1ZA 2QS2A 3I3VA 2HAVA 3MBPA 3FVGA 1VFEA 3VVDA 2H5YA 1B40A 4GXSB 2RKMA 2FA7A 1LBCA 1MXZA 1MY4A 2NWJA 4F3BA 3N6TA 1IXCA 5EHMA 4E0XA 3EHSA 3UA8A 2I58A 2DVCA 1SDXA 2OLBA 3PPPA 3IOTA 1BP5A 5AA4B 4NE4A 1Q1KA 1JW1A 3VLVA 4OQOA 3UIFA 4TQUQ 3RPWA 3Q27A 5HM4B 1WVJA 1H43A 3R26A 1B7UA 4E0WA 4KHZE 4LONB 1H3DA 3IB2A 1GTKA 4PFTA 1OLAA 3IL1B 3TQWA 1P1UA 3QUJA 2DWIA 3PD8A 4FJPA 3HPIA 3CVGA 4LZ5A 3E9XA 3ODBA 4YB5A 4DXBA 1FCKA 1YCJA 3PU5A 4OETA 2GRVA 5J1DA 3K4UA 3PGFA 2GHBA 3VXBA 3MZBA 2M8CA 4G4PA 4RNSA 2RC9A 2LAOA 2XHDA 3O97A 1A7LA 3KSJA 1NH8A 1SW1A 5H8QB 4H1XA 3TODA 3T9HB 1J1NA 3VLWA 2RINA 4IO4A 2QPQA 1PDAA 4EQ9A 3SERA 2PMSA 4QSCA 3MQ9A 2F7AA 1EZPA 5CMBA 3VXCA 2THIA 3N5LA 2Q2AA 1ZJLA 3PUXE 1IXGA 2IA4A 2ONRA 1M5BA 3FD3A 5L8DA 4F18A 2NOOA 5ITPA 3SKPA 4H6DA 2NUVA 1BKAA 3MUQA 5FHNA 4ESXA 4JWYA 3L6GA 3QYTA 1MQHA 4LZ8A 3VVFA 2XXVA 4GRKA 3RY3A 4XIGQ 5M2VA 1I6AA 4R9FA 2PBWA 1B7ZA 4YKIA 3LSFB 1I6BA 3CR9A 1KWHA 2HZLA 4OMBA 4F2QA 4F1YA 2XXQA 2F6GA 1LFGA 1MY0A 2ZNUA 1MXVA 5F1QA 2V25A 4OEVA 3W9WA 3V8XB 2V3UA 1ZU0A 3OELA 1SBPA 1B51A 5TPAB 1VE4A 3THIA 4JWXA 3O66A 3LSXA 2ALUA 2D3IA 2PYYA 5B70A 1N7XA 3ZKLA 3IO6A 4NF5A 4HW8A 4JB7A 4OESA 1NKXA 2XX8A 3O9PA 4H5FA 5KCJA 4WXJA 2VOZA 4R2BA 3OO9A 5TP9B 4F22A 4JSDA 1MRPA 1NMUA 3CSBA 2HCAA 4MLQA 3BFUA 4YICA 5ITOA 1A40A 3ZKKA 5I56B 5I59B 4X1DA 1UTBB 1Y4TA 4U4SA 1B3LA 5DYHA 2I0CA 4H8IA 4WEPA 2DWJA 3MAMA 4GL0A 3ECRA 3Q25A 3CFZA 3G3IA 2RCBA 4Q8RA 2WKYA 5I2KA 4OENA 4NEDA 3F11A 4K3FA 4ND9A 5JTYB 5KDTA 4ZS9A 2F8DA 1CE2A 1JW5A 4X9TA 3A09A 2XXPA 1DPPA 3PPRA 3KFMA 3ZS6A 4I9DA 4QF9A 3H4ZA 1MS7A 2YPNA 5ISUA 1BTJA 2XXUA 4XXUA 3E4RA 3FVNA 4GXAA 3B6TA 2GHAA 1FQFA 2H98A 3N6UA 4U22A 3FJGA 1R6ZA 1MXYA 3UORA 1QJMA 3C34A 1US4A 3SDFA 1EZ9A 4FEBA 4OTEA 3RUMA 4ELRA 4MH5A 2G29A 1LCTA 4G8NA 1PB9A 2DVZA 2ZYOA 4IY5A 1JEVA 5DVFA 1LB8A 4Z7EA 4R6HA 1ELJA 1MPCA 2G93A 3FVKA 4R6KA 4JXIA 3U93A 5AA2A 1JW4A 3QUFA 1O63A 1XVYA 1EH3A 4JDFA 3KSXA 2QRYA 3FVOA 3MZ1A 1AMFA 4G8HA 3JYRA 1FTLA 1OIBA 4M1VA 3CG3A 3D4GA 3KEIA 1XC1A 2O6AA 1AOVA 3TMGA 3MVZA 4RY1A 4PFYA 2A5TA 4KYSA 3V5AA 4LA9A 3RN8A 3MVWA 4PQJA 1ZIUA 4GF8A 1YTVA 1ZTYA 1JVYA 1POTA 5BUUA 1PBQA 2ESNA 1RYOA 1LAGE 1M5CA 3OXNA 3AXFA 4OFLA 1MY3A 4PP0A 3HV1A 3RT8A 3MZ9A 4L17A 3VLUA 3W15C 4GL8A 5H8NA 3FUZA 4POWA 4M4GA 1QW0A 5CM6A 4C0RA 2F6PA 4F19A 1IQ7A 4EXKA 3OEMA 4U4XA 1M5EA 5I2NA 3QAXA 3IJOB 5I58A 3EHUA 1B3FA 3V89B 1FQEA 2DE2A 4MF3A 1QUJA 1R9LA 3MP1A 4R75A 3KJTA 3MWBA 1MM7A 4DXUA 5FHOA 2UYFA 2AL5A 3KZGA 1T0KA 4N13A 4IO7A 2O1MA 3VFJA 2DE3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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