1MXZA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 1 um brw)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxzA01
1XS5A 4U21A 5I84A 1B51A 2VD2A 3S4UA 3KSXA 3OMBA 3MP1A 4IB2A 1FQBA 2VOZA 4BDLA 3GZGA 1OVTA 3A09A 4U2RA 4ZECA 1JVYA 4RPOA 5DTBA 4EQBA 3S9LC 5JK4A 1IXIA 2ZMBA 2NUVA 4ELQA 2FA7A 3IORA 2QS4A 4KFQA 1GR2A 2QS3A 1MPDA 2XD3A 3T96B 4EXLA 5B7DA 4LZ8A 1SYHA 2DQVA 2GRVA 1P99A 4H67A 4LZ7A 5ITPA 2O84X 2QSXA 1FTJA 3CI8A 3F11A 3TFLA 4QFOA 3BKIB 3UP9A 4YAHX 5I2NB 4QF9A 1QJMA 3C36A 3MPLA 2D3IA 4YKIA 2DE2A 3LR1A 3Q28A 2E1SA 3TKDA 3RY3A 4UACA 5I2NA 3H6UA 4X9TA 2Q2CA 1MQDA 1P1UA 5L8DA 3TEPA 4NF5B 1P1WA 4EDPA 3TTNA 4ELPA 1LAFE 3VLVA 1RKMA 4DE8A 2Z23A 2Q9TA 4XKQA 4YKJA 1H43A 5FHNA 2V3TA 4DIGA 1JEVA 3VLUA 4POXA 1A54A 1MXXA 5FTHA 3UORA 3MP6A 3MC2A 1NL5A 4F2OA 3W9VA 2Z8DA 1ZKBA 1N3WA 4GIZA 5EHSA 1USYE 4BDMA 4U1ZA 3L6GA 1DSNA 5AE4A 4R2BA 2RF1A 3VVEA 4OEUA 4RJZA 4AB6A 2I6EA 1Y3NA 4LVQA 4YICA 4FATA 1PB8A 3CFLA 1MPBA 5TU0A 4KYSA 4RY1A 4ISUA 1JW4A 3SEVA 4PFUA 4GWOA 1B05A 3LSXA 2HEUA 3TMGA 2V84A 4R2FA 4R6HA 3VDFA 4MBPA 1TWYA 3FGSA 3G3HA 2ONSA 3OELA 4U1OA 3S9NC 5H8FB 3T66A 1VE4A 4QFLA 1MQIA 1EZ9A 4IO5A 5CC2A 1QULA 2XHDA 4JXIA 1S9TA 1IEJA 1US5A 3IL1B 1SI1A 4THIA 2DYXA 2XXUA 3JYRA 1IXCA 1TFAA 5ITOA 5H8FA 1N0TA 3U1OA 4KR5A 1MY0A 3H6VA 1SYIA 5K2XA 2QPQA 5A5XA 3TAJA 2V25A 2RC7A 2ESNA 2UVGA 2F7CA 4HCWA 3G3IA 3HO7A 1Y20A 5IKBA 2HCAA 3V89B 3MVXA 5CM6A 3PMVA 1MXWA 2QRYA 2QS2A 3P7IA 1FCKA 5TPAB 2PT1A 1NH8A 2A5TB 1MH3A 3OSRA 1N84A 5ICTA 4OESA 3RUMA 4O3AA 1SW5A 3G3JA 1P1QA 2Z22A 4EF1A 2XX8A 5TPAA 2F35A 4NF6B 2A5TA 2F6GA 1YCJA 3SESA 4G77A 3T9VA 1RYOA 3H3GA 1JQFA 1I6BA 3G3KA 4O3CA 1SI0A 4NF6A 2O7IA 1OVBA 1QUIA 5HPQA 2CMOA 3LUYA 5AA4B 3DP6A 3K00A 3GBAA 4PP0A 3ZKKA 1VFDA 2XXPA 4G2ZA 3CR9A 4ZEDA 3FV1A 1MY3A 4I1DA 3PPQA 4G68A 1O63A 4JWXA 4R6YA 4H8JA 1NNKA 2Q89A 3IAZA 4HS7A 3TZAA 2Z8FA 1N76A 1B5JA 4PFTA 1H76A 3AXFA 1B9JA 2Y84A 4IO6A 3Q27A 2B3FA 2CZLA 1OLCA 5CMKA 1M5BA 1N7XA 4RPNA 4MLVA 3M3KA 1DPEA 1B7HA 2I0CA 2G93A 1UTBB 3ZS6A 1II5A 1AL3A 1Y3QA 4PE5B 5IAIA 2F34A 2YLNA 1A99A 3TUSA 1B0LA 2VHAA 1CE2A 3UA8A 3A3CA 3C9HA 2UXAA 3K6XA 1FQAA 4YKKA 4P0IA 1LB9A 4LP2B 4GOTA 2A5SA 4YB6A 2DXYA 3DELB 3PPNA 3K1MA 4KHZE 4TLMB 3TDJA 3VVFA 5I59B 4LA9A 4F2QA 1JEUA 4HCYA 5B70A 4N07A 5AA1A 5I57B 1QUJA 1URGA 4P0GA 3IR1A 1USYH 4KD5A 5I59A 4KYDA 4I8CA 4X48A 3H06B 4MF3A 1GV8A 3W15C 1MQHA 3H03A 3VV5A 3R7XA 5DYHA 3IOVA 4OERA 2H99A 4C1UA 2XX9A 1M5EA 4YMAA 2RCAA 2FNCA 3B7DA 3TCGA 2AL5A 1IIWA 4AB5A 1ZBMA 1SD3A 1PC3A 2YJPA 2O7UA 1B2HA 4LQ2A 1M5DA 4U22A 5I56B 3LC8A 4XXUA 4G8MA 3M3FA 1MM6A 1GGGA 5ISUA 2H9BA 2RCBA 3VXBA 1F9BA 1A8EA 5I56A 1Y4CA 1B7ZA 3FVGA 3O6HA 3RTFB 2HXWA 3C31A 3HPIA 2XXQA 1NKXA 3PUXE 5CMBA 4NE4A 5HBCA 1GVCA 3KBRA 3TPAA 3PUYE 1H44A 1LFGA 2ZYKA 1B58A 3KOSA 2OBGA 2H4IA 2XXRA 2W7YA 3MZ1A 4XTCQ 4RNSA 3TTKA 3K6UA 1VSOA 3UIFA 2H5YA 4G68C 1D3KA 4WKMA 4X1DA 1P1OA 4RA1A 1IZ1A 1BIYA 3CSGA 3RLFE 4OZ9A 1ZU0A 1BP5A 3TODA 4WXJA 5CMCA 3QUJA 1LB8A 4POWA 1DOTA 3OXNA 1NNTA 2DP8A 4H1XA 4YMBA 3W9WA 3FZVA 2ZNSA 1TT1A 2I48A 1PEBA 4Z7EA 1LAXA 4XKPA 3O66A 3TELA 2ANJA 1SDXA 2UYEA 1B6HA 4OMBA 1UIUA 4KCCA 1MPCA 3PGFA 4MLQA 4KYEA 3H7MA 4GL8A 4ELOA 1CB6A 1O64A 3EHTA 1Y4TA 3MVWA 1Z7NE 3U93A 2XX7A 1R1NA 2DWJA 4FJPA 5CI5A 3K4UA 1FTMA 1IITA 3DP8A 4F1UA 3TTMA 2PX1A 5DVFA 3LSWA 4NF5A 4ZS9A 1S50A 1YAEA 1JETA 2XD2A 5FHMA 4ZE8A 3OEMA 3EF7A 2RC9A 1ANFA 3E9XA 4G4PA 3E4RA 1H45A 3ZSFA 1DTZA 4FE8A 5EHMA 4FAJA 2D21A 1BKAA 2O69A 2XXHA 3SEYA 3K01A 1JW5A 1WODA 3PPPA 3MQ9A 3RN8A 3IK6B 3OOAA 1LAHE 4EF2A 4LUBA 3M3LA 4RK9A 4OQOA 3IOWA 1SQYA 3QIMA 1NH7A 3I5OA 1MS7A 3PMXA 2DWHA 1MY2A 1FTKA 3ZKLA 3BFTA 2Y7PA 2NOOA 4F22A 3K6VA 3FXRA 1NFTA 1B0HA 4GRKA 1ELJA 1B5IA 1AH5A 1P1NA 4QFPA 1TXFA 5KCJB 4YB7A 4EQ7A 3GBBA 1XOCA 2PBWA 5AA2B 2WKYA 1OQGA 3QYTA 2AYSA 1LFIA 4JWYA 3B6WA 4NMYA 4GQOA 1LGBC 1S7YA 1OLAA 1KWHA 4OEVA 2PMSA 1B3HA 3ODBA 1GTKA 3KN3A 3EQ1A 2LAOA 1SBPA 1MXZA 2QMXA 4BDNA 3KN7A 3QSLA 5L9SA 1B3LA 1J1NA 5ICQA 4ZEFA 4P11A 4M1VA 3T9HB 3CG1A 4H5GA 4H65A 1AOVA 3HSTA 4KQPA 1D4NA 2E0SA 1JW1A 4NF4B 1PB7A 3N6UA 3A3UA 1I6QA 3PPRA 1MH4A 4GL0A 3IX1A 3FASA 3MZBA 3R26A 3K1NA 2VGQA 3CSBA 1XHYA 3MAMA 4NF4A 3CG3A 2F8DA 3FVKA 3MJNA 1BLFA 3K2DA 2OZZA 2QS1A 4OFJA 2V3UA 1RYXA 5AA4A 3IB0A 4GXSB 2IEEA 2DOJA 3D4CA 2O51A 3N26A 4L17A 3TTRA 2XXWA 2B65A 4XKNA 3IJXB 2YPNA 3D4GA 4XKRA 1LBCA 2OK2A 5BUUA 5J1DA 1DPPA 2UVJA 1VFEA 3UK4A 4FEBA 3O2AA 3T22A 2Y7IA 4LATA 3OO8A 1DMBA 1B4ZA 3TQWA 4FORA 1WDNA 4QFNA 5LOMA 1QVSA 4OETA 4EUOA 3N5LA 2QJEA 2PT2A 1MRPA 2HZLA 1UTBA 3O6GA 3RT8A 2ABHA 5KZTA 4R9GA 1B3FA 4OHNA 1PBQA 3KJTA 3I3VA 1FQFA 4DLDA 4NF8B 3I6VA 3BBRA 3MW0A 4Q30B 1Y1ZA 4ZZAA 4OTEA 2DVCA 2DWIA 3O9PA 3OEKA 3M8UA 2P0SA 4GFRA 2NWJA 2O1LA 4F3SA 4NF8A 5CBRA 2OCUA 2GHAA 4U23A 4F18A 2F5XA 4DZ1A 3N6TA 4R9FA 3SDFA 1HSJA 1QKBA 1BTJA 1URDA 1FTOA 5DEXB 4LZ5A 4Z0IA 1XVXA 3RTWB 2DXRA 3IJOB 3PUZE 1EZPA 4BDOA 5I57A 1B32A 1SW2A 5DEXA 2GH9A 3JV9A 2G29A 3U94A 1FQEA 4C0RA 3HN0A 5FTIA 5CMMA 2OWTA 5ELVA 1SVXB 2HQ0A 3VVDA 1WVJA 4IO7A 2R6GE 3HHGA 2F7BA 1HSLA 3QAXA 1IQ7A 1UTHB 1YPNA 1US4A 2I4BA 4YU0A 1SW4A 3FV2A 4YKPA 4DXBA 1OMPA 3EN3A 3THIA 1O7TA 1UTHA 3KG2A 3VE1B 3EHUA 1MQJA 2Y7WA 3K1PA 3DM0A 2UVIA 2NVUB 3B6TA 3FJ7A 3C32A 3OD7A 2D5WA 3KZGA 1N04A 3E13X 3Q26A 5F7VA 1MXYA 3S2VA 2Z8EA 1XC1A 2M8CA 4ZEIA 5EYFA 1LAGE 4QSEA 3S9EA 3N94A 3PUVE 4HTGA 3VLWA 2R71A 3SKPA 4JSOA 1L5TA 2RC8A 2Y7KA 2ZNTA 1R9QA 3VFJA 1EZOA 1EH3A 4I62A 4H6DA 4H5FA 4DXCA 4EQ9A 3PUWE 1ATGA 1D9VA 1A40A 1POY1 1QKAA 3IOTA 3FJMA 1Y3PA 5KDTB 2ZYNA 2RKMA 4X1BA 4RXLA 4XIGQ 1OQHA 5TP9B 4GXAA 3KGCA 3O29A 3TQLA 2O68A 5KDTA 2ZYOA 1FQDA 1FQCA 5AA2D 3S9MC 3HHFA 2I58A 2X7QA 5TP9A 4F39A 1MQGA 1XT8A 2I3VA 5FHOA 1IXHA 2RINA 2NXOA 2VP1A 1D9YA 4ESXA 5L9OA 1URSA 4TLLB 4ELRA 5F1QA 4MH5A 3PD9A 4EXKA 1A8FA 4TOZA 3T9UA 4R75A 4QSCA 1OIBA 1NNFA 3T93B 1Y1MA 4KI0E 2XXVA 2PVUA 3T9XB 2Y7RA 4DXUA 4O3BA 1B40A 3MWBA 2HFBA 3UGWA 3RNNA 4ZE9A 3C34A 3KJ7A 1A55A 3QXMA 4OFLA 4GD5A 3EPEA 2I0BA 2X26A 1FTLA 4FEDA 1UIVA 4FECA 2F36A 3MP8A 1PDAA 1HSEA 4JB7A 4R72A 2FYIA 1JNFA 1EU8A 4QRZA 1MDQA 4UA8A 5DVIA 3KFMA 3Q29A 2O6AA 1FW0A 2DS9A 3FD3A 4G8NA 1MXUA 4NWDA 1LLSA 5BWJA 2OJTA 3GXAA 4KCDA 4HW8A 3K6WA 2ZYMA 3SERA 1QUKA 4F3PA 3TYHA 4YZZA 4DDDA 3ILUB 4IO2A 1B3EA 1M5FA 2Q88A 1NNPA 3GLBA 3OENA 3IO6A 4PQJA 4NTLA 4OVJA 1LFHA 2Q8JA 3ONMA 4N6PA 3WAFA 3IB1A 4IGTA 4Q0CA 3KN8A 3H6TA 1N3XA 2ONKE 5A5XB 5KCJA 4R74A 2AIXA 3JZJA 3MVYA 3QUFA 4C1TA 2XXIA 2F6PA 3EHSA 5I58A 3UN6A 5AA2A 1AMFA 1N7WA 3OO9A 3MBPA 5HM4B 2GHBA 1B5HA 3DLNA 4JBZA 2X7PA 2ALUA 3MZ9A 4MFIA 2B3BA 2IA4A 5DT6A 4JSDA 4GVOA 4H8IA 5JEIA 5H8SA 1MY4A 2ZXTA 1PB9A 1UQWA 5H8NB 4BDQA 1MXVA 3OSQA 3C4MA 4K3FA 3QK6A 4F31B 3PV0E 2ONRA 4PFYA 3RGYA 3G7WA 5H8NA 4E0XA 1MG1A 3O97A 3L6HA 3LBSA 3U72A 2GFEA 4IGRA 5AA3A 1MY1A 4BDRA 1LCFA 3PPOA 2O1MA 3CRBA 1AIVA 1PBPA 4ZZEA 4NEDA 2HAUA 2H25A 3PD8A 3CVGA 2REJA 3PU5A 1B52A 1YTVA 1SW1A 4OXVA 4RK2A 4FIMA 3PMWA 4OFOA 3IO4A 3DP4A 5CRYA 5H8HB 4F3GA 1ZTYA 1MM7A 3MVZA 3CFXA 3FXUA 3G3FA 3H4ZA 2PYYA 4G68B 1R6ZA 4OENA 3TTLA 3FVNA 4PETA 1Z7ME 3BFUA 2DE3A 2DSFA 3Q25A 4R6KA 4ZEKA 4ESWA 2XXYA 5H8HA 4YB5A 3SEUA 3FXQA 4TQUQ 4ZDMA 3V5AA 4IO4A 1R9LA 3OO7A 1TFDA 2I4CA 4F29A 2I49A 2ZNUA 5H8QB 4JDFA 2R9JA 5CBSA 4ECFA 2V93A 3MPKA 1LCTA 3KSJA 3SEWA 3USDA 3MUQA 5DVJA 5H8QA 3R6UA 1I6AA 4QFKA 4F1YA 5I2KB 3KOTA 4GF8A 4G8HA 4WEPA 2V3QA 4M4GA 1B7UA 2KLFA 3CIJA 1VR5A 4AQ4A 2XXXA 4Q5TA 1A7LA 1QW0A 4IO3A 2BJJX 5I2KA 1XVYA 3ILTB 3TCFA 4R73A 1LBBA 1Q35A 3LSFB 1NMUA 4ZEBA 4NWCA 1ZJLA 2UYFA 4BLAA 3FJGA 4U4XA 4I9DA 2F7AA 1POTA 1B46A 1T0KA 2I3WA 2UVHA 2F78A 2P2AA 1IXGA 4OWDA 3O6IA 2HAVA 2VD3A 4QHQA 4KPTA 3RPWA 4N13A 4WEDA 3K02A 3HV1A 1ZLQA 2REGA 1LSTA 1JVXA 2QMWA 2DWAA 2DE4A 4ONYA 4E0WA 4ND9A 4U4SA 2H98A 4PFWA 2P1SA 3FVOA 4IY5A 3G3GA 5M2VA 3LSLA 4F1VA 3RT6B 3O28A 3ECRA 4JWOA 5JTYB 3U8QA 1B4HA 2THIA 3RQTA 1H3DA 3SEXA 3TCHA 1B3GA 3K0VA 3C35A 4QSDA 1B1XA 4F3BA 2Q2AA 5JTYA 1M5CA 4LONB 4GLIA 2HZKA 2OWSA 3WAEA 3FATA 3B6QA 3C33A 3HCQA 2F97A 2XXTA 4LQ5A 3CFZA 1DTGA 3SETA 3VXCA 3FIRA 3OO6A 4DCXA 4OYVA 1B1HA 1I69A 2DVZA 4F19A 3U92A 1ZIUA 1ZMGA 3IOUA 1Y9UA 5L9MA 3FUZA 4DCYA 5I58B 3E3KA 2AL4A 3V83A 3KEIA 4Q8RA 1MDP1 2OLBA 5K2YA 1IUDA 3H6WA 4H0WA 2QL3A 4IY6A 4RYAA 3V8XB 1Q1KA 3IB2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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