1N0TA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-atpo at 2.1 a resolution.
Total Genus 84

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS6 (71-73)S1 (6-10)S4 (51-55)TVIa1 (13-16)TI2 (56-59)3H2 (28-31)S2 (18-19)3H1 (23-25)AH1 (35-47)TI3 (66-69)TIV2 (65-68)S5 (62-64)AH2 (74-80)S7 (85-86)O3 (206-261)O1 (88-90)AH3 (94-98)S14 (218-220)S8 (100-102)AH9 (230-244)TIV3 (105-108)S12 (188-193)S13 (208-211)S9 (107-109)TI'1 (184-187)S10 (111-116)TII1 (116-119)AH4 (124-129)AH6 (153-164)AH7 (174-184)TIV4 (130-133)S11 (134-136)TIV6 (165-168)TIV5 (138-141)AH5 (142-149)TVIa2 (203-206)AH10 (246-256)AH8 (194-201)TI4 (256-259)S15 (223-225)TII2 (225-228)S3 (32-33)TI1 (20-23)O2 (119-121)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Competitive antagonism of AMPA receptors by ligands of different classes: crystal structure of ATPO bound to the GluR2 ligand-binding core, in comparison with DNQX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n0tA01
1NL5A 1FTOA 2HFBA 2I3WA 5CRYA 2A5TB 3MP1A 4KYEA 1GGGA 2XX9A 1I6BA 3G3HA 3PMVA 4GL8A 1B4ZA 1M5BA 3MC2A 2G29A 2DVCA 1USYE 3PUWE 2O1LA 1MY1A 1B3GA 4P0GA 3FGSA 5L9MA 4IB2A 2HXWA 2XXTA 4U21A 3H06B 2GRVA 1NNKA 2GHBA 4QFPA 4EUOA 4PETA 1IZ1A 2Z8EA 4IGRA 4LVQA 1MXUA 2DXRA 2FYIA 2PMSA 4LZ8A 1I69A 1PB9A 1HSJA 2LAOA 1A7LA 1DTZA 3OEKA 5CMMA 5CBSA 1B3EA 3IK6B 1BP5A 4H8JA 4ONYA 1SI0A 2ABHA 3C31A 4JBZA 3G3GA 3DELB 4ECFA 4C1TA 2HAVA 4MLQA 3OMBA 2RC9A 3TTKA 4QHQA 3T9HB 3OSRA 4OYVA 4NF8A 4RY1A 4RA1A 3KN8A 3UGWA 3SDFA 1TFAA 1H3DA 3TMGA 5AA2B 2Z22A 4HS7A 4Z7EA 3TZAA 3C34A 2QRYA 4GRKA 4MLVA 4GLIA 4XIGQ 2OWSA 3SEYA 4LZ7A 1WDNA 3CFLA 1MQDA 1B58A 5H8QB 3MVZA 5AA3A 1QULA 2RF1A 3FVNA 4XXUA 3TTNA 4Q30B 1OVBA 2ZNTA 1NNPA 4LA9A 2UXAA 5AA2D 2RINA 4PFUA 2HZKA 4ZS9A 3KEIA 4QF9A 4R72A 4JWOA 2Y7RA 3MZ9A 4OQOA 1GR2A 2GH9A 5HBCA 4F39A 4EXKA 4RXLA 1B40A 1JEUA 3O2AA 2B3FA 1B52A 3OD7A 3N6UA 5I58A 1D4NA 4OEUA 2ONRA 1URSA 2F7BA 1A99A 3KGCA 3GXAA 4FIMA 4U4SA 1GVCA 3G3JA 3FV2A 1ZLQA 4R2BA 4GL0A 3TUSA 1II5A 1SDXA 4NF6B 4JDFA 3A3CA 4DXUA 2PT1A 3PU5A 1MY2A 1QUIA 1R9QA 1SQYA 5BWJA 1B1XA 1LCTA 1B0HA 5CBRA 4FATA 3W9VA 4PQJA 4TOZA 1PDAA 4LQ5A 1NMUA 3HO7A 1HSLA 4OXVA 1LB9A 2H98A 4ZZAA 1ZKBA 1Y3NA 4OWDA 2XX8A 2CMOA 2QS2A 3CFXA 4ZE8A 3BKIB 3L6GA 4YMAA 4G68B 3KG2A 5DYHA 5AA2A 3RT6B 4ZEDA 3HHGA 3CRBA 4PE5B 1EZOA 4OMBA 4OETA 4WXJA 3I3VA 3K2DA 1B3FA 4JWYA 3O28A 2DE2A 3GZGA 4AB5A 1MM7A 3TCGA 4C1UA 4U1OA 1A54A 4QFNA 1MXZA 5TPAA 2REGA 3C32A 2Q89A 3QXMA 1EU8A 3KJTA 1CB6A 4HW8A 3C4MA 4O3BA 4HTGA 3T9VA 3CFZA 1D9YA 4M4GA 4GFRA 5LOMA 4RNSA 4NE4A 1AL3A 1Y3QA 3H6WA 3MP8A 2OZZA 4H8IA 4R73A 2XD2A 1QKAA 4G68C 3ZKLA 2V3QA 2OJTA 1WODA 1NH8A 1MQIA 3K00A 2Q8JA 3THIA 3PD8A 4U4XA 3H6TA 5DTBA 4DIGA 1EH3A 1B32A 2DXYA 4YKJA 3IX1A 5I56B 5DT6A 4YZZA 2V3UA 5ICQA 3K1NA 2X7QA 4O3CA 4GD5A 2NOOA 1MM6A 4BDQA 4ELRA 4BDRA 2F5XA 1YTVA 1PBPA 4U22A 3V83A 1D9VA 4NF6A 5I57A 2PYYA 4E0XA 3M3LA 3S9NC 5AA1A 3WAEA 4XTCQ 1LFIA 3MZBA 4JSOA 5I84A 3TODA 4U2RA 2V93A 3PUXE 4F31B 3E3KA 3RTFB 4OZ9A 2CZLA 3DP4A 1DPPA 1UQWA 3E9XA 3FUZA 3OENA 2XXYA 4YU0A 2DQVA 3OSQA 3Q25A 3UN6A 4YB6A 2DS9A 1WVJA 3IB1A 3HCQA 3FZVA 3FATA 1N3XA 2E1SA 2O69A 3VLVA 3TTRA 3V8XB 4R6YA 1B3LA 3QIMA 4U1ZA 3VLUA 1F9BA 2AYSA 5K2YA 4XKPA 5DEXB 2F6PA 1M5DA 4I1DA 4F19A 1I6AA 2DWHA 3EPEA 1Z7ME 5ISUA 4EQ9A 4K3FA 4DCYA 3R6UA 4G77A 1OQHA 3T9XB 2VD3A 4Z0IA 1JEVA 2M8CA 3OELA 4N07A 4GF8A 2F34A 4G8MA 5KCJB 1MQGA 3PUVE 3ODBA 3PUZE 1B05A 1TWYA 3EF7A 3KBRA 5ELVA 1FQDA 3GLBA 3JV9A 4MH5A 3PPRA 3VE1B 1N3WA 1A55A 3C33A 1A8FA 2O51A 4PFYA 2I3VA 2P2AA 1LBCA 3FVKA 4F1VA 3HV1A 1VFEA 3KZGA 3U8QA 3EHTA 3SEUA 4XKQA 1JNFA 1MY4A 5CM6A 1PB7A 3S9LC 1GTKA 5JK4A 3FXRA 3MVYA 4BDOA 3VVEA 3D4CA 4UACA 4YAHX 1SYIA 4BLAA 2V3TA 2DE4A 2R9JA 1NNFA 2XHDA 4FEDA 3C35A 3LBSA 3VDFA 4KFQA 4DDDA 3RTWB 3QUJA 3PPQA 3O9PA 3TDJA 4EF2A 3RN8A 4KI0E 2HZLA 3IO4A 1UTBA 4NF5B 4G2ZA 4IY6A 2OBGA 1MXVA 3DM0A 5JEIA 4YB5A 3MVXA 2UYEA 3FJ7A 3SERA 4ELQA 3Q28A 1QJMA 1YCJA 3C36A 1S7YA 3G7WA 2QL3A 4BDLA 5I59A 2UVHA 4G8NA 3A3UA 4KCDA 2Z23A 2RC8A 5DEXA 1Y9UA 2ONKE 1QVSA 3K6WA 3RLFE 5F7VA 1O64A 1Y20A 2I4BA 4X1DA 4DCXA 3F11A 3LC8A 3OEMA 3IJOB 2VHAA 1DMBA 2D3IA 3G3FA 2ONSA 4OTEA 3MZ1A 1OVTA 3LSFB 3HHFA 4R2FA 1LFHA 3W15C 4ZEIA 5KCJA 5EHSA 2DP8A 3RY3A 4QFLA 2OLBA 1JVXA 3OO6A 1B0LA 3IOUA 1FTKA 5FTIA 4Q8RA 3MPLA 2Q2AA 4KHZE 3MUQA 4GWOA 3LSWA 1SW5A 4TLMB 1AOVA 3B6TA 3OO8A 2A5TA 4RK9A 1Z7NE 2UVGA 3M8UA 3B6QA 1RYOA 1YAEA 3OO9A 3I5OA 1A8EA 2YLNA 1SW4A 4Q5TA 3QAXA 3TAJA 3W9WA 2F7CA 5H8SA 1PC3A 1LFGA 1YPNA 3DLNA 5AA4B 2F97A 3MBPA 4KCCA 2I48A 1Y4TA 4H67A 3PUYE 2XXUA 3ECRA 2Q88A 4DXCA 1B1HA 2RC7A 2O6AA 4ZEBA 3PD9A 3CI8A 1JETA 3S9EA 2QS1A 1LB8A 1NFTA 2QJEA 1MH4A 3QUFA 4PFWA 4YKKA 1MS7A 3K02A 2O84X 1MRPA 1UTHB 3TEPA 1JW5A 2THIA 4YKIA 4LUBA 4NWCA 1EZPA 1Y4CA 3JYRA 4IO4A 2I58A 2Z8FA 3LSLA 3Q27A 1ATGA 3JZJA 3KN7A 3TCHA 1BIYA 5AE4A 2UVIA 4DE8A 3FJGA 1FTJA 3GBAA 3N26A 3PPOA 1BKAA 2DWIA 2BJJX 2H9BA 2F36A 2RKMA 3UORA 4BDNA 4FEBA 3ILUB 5H8QA 4GIZA 4QFOA 1D3KA 1MDP1 1Y1ZA 2QMWA 3TKDA 4QSCA 1XT8A 5H8HB 2REJA 1MH3A 3T9UA 1JW1A 4OESA 2DOJA 4PP0A 2OCUA 4KR5A 4HCWA 3TCFA 4F3PA 1DPEA 4JSDA 1RKMA 3MP6A 3T93B 4MBPA 4RK2A 1URDA 3VV5A 1MDQA 1SD3A 4FAJA 2GFEA 3RUMA 4DLDA 3UK4A 4IO3A 2DWAA 5BUUA 4IO2A 4F3GA 3FASA 2FNCA 4QFKA 3U93A 4ND9A 5IKBA 3H6VA 5IAIA 2F6GA 1P1UA 3H6UA 3O6HA 3IOVA 3DP6A 2AL4A 2PVUA 2Y7PA 4F2QA 5FHMA 2E0SA 4ZDMA 1N7XA 1IQ7A 3S4UA 1LAXA 1GV8A 3B6WA 4DXBA 3S2VA 3C9HA 1SBPA 3AXFA 5FTHA 4OVJA 4N6PA 4ZE9A 5HPQA 2X7PA 3H7MA 4OERA 4OENA 1FTLA 3KSJA 4DZ1A 3R7XA 3KSXA 2GHAA 4RPNA 1USYH 1LGBC 5B70A 4YKPA 5TU0A 3A09A 1ANFA 3M3FA 5ITPA 3IOTA 3RGYA 4GQOA 1N0TA 4E0WA 1B7UA 1OIBA 1FQEA 4R6KA 3HN0A 3MJNA 4IO7A 1SVXB 3RT8A 3K1MA 1MPDA 1ZJLA 3UA8A 1ZMGA 4FJPA 1DOTA 3IJXB 4F1YA 4G68A 4LZ5A 1EZ9A 4EXLA 3QSLA 2QS3A 1MY3A 1XC1A 2I4CA 5JTYB 1IIWA 5M2VA 4ELPA 4PFTA 3EHUA 1VFDA 1B9JA 5I2NB 3FIRA 1AH5A 2VOZA 1B7ZA 5TP9B 3TTMA 4P0IA 4F2OA 4KYSA 1LAFE 2XXPA 1P1OA 3FD3A 3MQ9A 5L9SA 3L6HA 4FECA 1XVXA 2F35A 1O7TA 1O63A 3O6IA 3I6VA 1BLFA 4JB7A 3TELA 4WEDA 4OHNA 4F3SA 3TYHA 4RPOA 3N5LA 4X1BA 5EYFA 1QUKA 3IB2A 5FHNA 1HSEA 4ISUA 2ZYKA 2QSXA 4ESWA 2ALUA 2RCBA 1DTGA 1Y3PA 5H8FB 3EN3A 1JW4A 1AMFA 1R9LA 4QSEA 1LSTA 3SEWA 4R6HA 4ZEKA 2RCAA 1B3HA 1R1NA 3CSGA 1IXIA 2XXWA 3U94A 3ZSFA 5I58B 3MW0A 1UIVA 4GXSB 1I6QA 5I56A 4OFOA 2PX1A 2OWTA 1FQAA 1N04A 2X26A 4H6DA 1QW0A 1FQBA 3T22A 3IO6A 4F29A 1MPBA 3VXCA 1OLCA 4IGTA 4POWA 1N76A 4FORA 2V25A 3VVDA 4MFIA 2XXHA 3VXBA 1BTJA 3OO7A 2AL5A 3SEVA 4UA8A 4N13A 1P1QA 1PB8A 5CMBA 2KLFA 3U1OA 4Q0CA 2I6EA 1XHYA 5KDTB 1OMPA 1VE4A 1POY1 3H3GA 4AQ4A 2R71A 5ITOA 5CMKA 3CG1A 1AIVA 3ILTB 3ZKKA 4LONB 2ESNA 4F18A 1B6HA 4TQUQ 4RJZA 2F78A 1S9TA 1IXHA 1VR5A 1IXGA 2R6GE 4KYDA 5DVIA 5JTYA 4KD5A 3ONMA 3FV1A 4KPTA 1MQHA 3GBBA 5I2NA 1S50A 4X9TA 2DE3A 5TP9A 4YB7A 1TXFA 2A5SA 4NTLA 2Q9TA 4I62A 2V84A 3D4GA 4NMYA 4NF4B 5CMCA 3SETA 3K6UA 1US4A 3EQ1A 1LAHE 5TPAB 5EHMA 2O7UA 5F1QA 3KOSA 4G8HA 1H44A 1XVYA 2ZNSA 1B46A 1ZIUA 3MAMA 1SI1A 1N7WA 2HQ0A 4HCYA 4THIA 1T0KA 3VLWA 1LCFA 4R9GA 3SESA 2Y7KA 4EQBA 4H5GA 3U92A 5FHOA 2D21A 1MQJA 3WAFA 1POTA 5H8FA 5A5XB 1TFDA 2VD2A 4F3BA 3KN3A 1B7HA 3FXUA 4QRZA 3S9MC 1B5IA 4L17A 2YPNA 1FQCA 3HSTA 3OXNA 1JQFA 1SW1A 2P1SA 2PBWA 5KZTA 5I2KB 2G93A 4EF1A 1MG1A 1SYHA 2XXQA 4H1XA 1DSNA 3ZS6A 4ESXA 4H65A 3SKPA 3PV0E 2VGQA 3CSBA 1SW2A 1B5HA 2O7IA 3QYTA 3TFLA 4EDPA 1H43A 1MXWA 5CC2A 4F22A 3FVGA 3LR1A 1B51A 3E13X 1J1NA 3VFJA 5I57B 3K01A 3T66A 5KDTA 1N84A 4GXAA 3BFTA 1R6ZA 3PMWA 2H99A 3RQTA 1LLSA 4NF5A 1Q1KA 3IR1A 3FJMA 1US5A 2UVJA 5L9OA 3IORA 3MWBA 2FA7A 3G3IA 4R74A 4R9FA 3UIFA 1B4HA 4QSDA 1VSOA 2OK2A 2IA4A 4U23A 4LP2B 3N94A 1URGA 2UYFA 1M5EA 2H25A 5H8NB 1IUDA 1L5TA 2ZYNA 1M5FA 1P1WA 2NXOA 5B7DA 2I49A 4AB6A 1ZTYA 3CR9A 4LQ2A 4LATA 3KFMA 4GVOA 2O68A 3U72A 3IOWA 4F1UA 3SEXA 1FTMA 4NF4A 4OFJA 4JWXA 5DVJA 3FXQA 2ZYMA 3DP8A 1H76A 3O29A 3PPNA 4ZEFA 4YMBA 1MY0A 3BFUA 2XXXA 3PPPA 5HM4B 3HPIA 2F8DA 3QK6A 4TLLB 1UIUA 5K2XA 2ZNUA 1NNTA 4ELOA 4WEPA 3RNNA 3IB0A 2DWJA 3PGFA 3CVGA 1IITA 4ZECA 3KJ7A 1Y1MA 3EHSA 1QKBA 4P11A 5A5XA 3IAZA 3BBRA 4KQPA 2P0SA 4JXIA 3O6GA 4ZZEA 3CG3A 2QMXA 3H03A 1M5CA 2XXIA 1A40A 2Y7IA 3K1PA 3M3KA 1PEBA 3V89B 3T96B 2IEEA 3MPKA 4H0WA 5AA4A 1ELJA 5I2KA 4POXA 5DVFA 2Y7WA 3UP9A 2XXRA 4BDMA 2QPQA 1ZBMA 3G3KA 4XKRA 2DYXA 3E4RA 1ZU0A 4M1VA 4IY5A 3VVFA 1P99A 3K6VA 2DVZA 2ANJA 3CIJA 2O1MA 5CI5A 3LUYA 4XKNA 3PMXA 4EQ7A 2YJPA 1CE2A 2ZXTA 3TPAA 3RPWA 1UTHA 1LBBA 3Q26A 2PT2A 4RYAA 1UTBB 2B3BA 4O3AA 3O66A 4NEDA 4GOTA 2XX7A 5H8NA 1NH7A 3OOAA 4C0RA 1PBQA 4NF8B 5J1DA 3K0VA 3TTLA 2XD3A 1MPCA 1QUJA 2XXVA 3K6XA 2NWJA 3B7DA 4I8CA 2AIXA 1NKXA 1FQFA 2DSFA 2HCAA 1JVYA 2Q2CA 1OQGA 3Q29A 3H4ZA 2VP1A 3K4UA 5I59B 3R26A 4H5FA 1FW0A 1MXYA 4NWDA 2I0CA 2W7YA 2F7AA 2B65A 2ZMBA 2I0BA 1KWHA 4MF3A 5H8HA 4YICA 3O97A 2NUVA 5ICTA 2Y84A 1RYXA 1XS5A 4X48A 1XOCA 1TT1A 1IEJA 2ZYOA 4IO5A 1B5JA 1IXCA 2HEUA 4FE8A 3TQWA 3FVOA 3P7IA 1P1NA 4WKMA 3IL1B 3N6TA 3MVWA 3LSXA 4OEVA 1OLAA 5L8DA 2NVUB 4R75A 2WKYA 1LAGE 4IO6A 1FCKA 4I9DA 1H45A 4G4PA 2D5WA 2Z8DA 1Q35A 1B2HA 2HAUA 4OFLA 3KOTA 2H4IA 2H5YA 3USDA 2QS4A 3TQLA 1MXXA 3V5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NL5A 5A5LA 2QVRA 1VDWA 1FTOA 2HFBA 2I3WA 5CRYA 2A5TB 3MP1A 4KYEA 3LV0A 1GGGA 2XX9A 1I6BA 3G3HA 3GYYA 3PMVA 4GL8A 1B4ZA 1M5BA 4I3EA 3MC2A 2G29A 2HHMA 1NUWA 2DVCA 1USYE 3PUWE 1LBVA 2VPOA 2O1LA 1MY1A 1B3GA 4P0GA 4AS5A 3FGSA 5L9MA 4IB2A 2HXWA 2XXTA 4U21A 3H06B 2GRVA 1NNKA 2GHBA 2XWIA 4N6DA 4QFPA 4EUOA 4PETA 1IZ1A 5IZ3B 2Z8EA 4IGRA 4LVQA 1MXUA 2DXRA 2GQ1A 2FYIA 2PMSA 4LZ8A 4GWUA 1I69A 1PB9A 1HSJA 1FPDA 2LAOA 1A7LA 1DTZA 3OEKA 5CMMA 5CBSA 1B3EA 3IK6B 1FBHA 1BP5A 4H8JA 4ONYA 3QMFA 1SI0A 2ABHA 3C31A 4JBZA 3G3GA 3DELB 4OVTA 4ECFA 4C1TA 2HAVA 1KA0A 4MLQA 3OMBA 2RC9A 4PC9A 3TTKA 4QHQA 4OA4A 3OSRA 3T9HB 4OYVA 1FTAA 4NF8A 4RY1A 4RA1A 3KN8A 3UGWA 3SDFA 1TFAA 1H3DA 3TMGA 5AA2B 2Z22A 3FBPA 4HS7A 4Z7EA 3TZAA 3C34A 2QRYA 4GRKA 4MLVA 2XA5A 4GLIA 4XIGQ 2OWSA 3SEYA 2CZKA 4LZ7A 1WDNA 2PFZA 3CFLA 1MQDA 4PAIA 1B58A 5H8QB 3MVZA 4PDDA 5AA3A 1QULA 2RF1A 1IMBA 3FVNA 4XXUA 3TTNA 4IR8A 4Q30B 4O8MA 1OVBA 2ZNTA 1NNPA 2CZHA 4LA9A 2UXAA 5AA2D 2RINA 4PFUA 2HZKA 4ZS9A 3KEIA 4QF9A 4R72A 4JWOA 3E78A 2Y7RA 4XEQA 3MZ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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