1N76A

Crystal structure of human seminal lactoferrin at 3.4 a resolution
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
690
structure length
690
Chain Sequence
RRRSVQWCTVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNDAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of human seminal lactoferrin at 3.4A resolution
pubmed rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Antimicrobial protein
total genus 193
structure length 690
sequence length 690
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n76A03
3PUVE 3N6TA 4U2RA 3QXMA 2QMXA 2IA4A 2ONSA 3S4UA 1GTKA 1A40A 5I2NB 3GBBA 4MLQA 4ZZAA 3EHSA 4GOTA 2I3VA 4EXLA 3FXQA 4R6YA 1MPCA 3G3HA 1TFAA 3G3FA 4XKPA 4ZEBA 1POTA 3TCHA 3CVGA 4ZE8A 4R73A 4ECFA 2PBWA 4BDRA 1YAEA 3IOWA 3V83A 1XHYA 2HCAA 3LSLA 4DCXA 1DTZA 3E4RA 5IKBA 1R6ZA 2Z22A 3ECRA 2DVCA 4FORA 1FTJA 5AA2D 3IB0A 3IR1A 3DM0A 3M3FA 1R9QA 4DZ1A 1PB9A 3FASA 3OSRA 1B3LA 4H6DA 2HEUA 4R9GA 1B3GA 4U22A 3SETA 2D21A 1GGGA 3T22A 4ZZEA 2F7AA 1D3KA 3M8UA 4OESA 3RUMA 4HTGA 4LQ2A 3C31A 2RCBA 4R75A 3R7XA 3JZJA 2DOJA 1MQIA 2HXWA 3HHFA 1B58A 2X7PA 1B7HA 1Z7ME 2RF1A 5AA3A 4ELRA 2PVUA 2I6EA 4YB6A 3CIJA 2F7BA 2VP1A 3IB2A 4IB2A 1JVYA 1JW4A 3U72A 4OETA 1DPPA 3MZ9A 1JETA 4ZEFA 4TQUQ 5H8SA 2ONKE 2Y84A 1FTMA 3A3UA 3KSXA 4NF4A 2XXTA 3FJMA 2UXAA 4G8HA 1Y1ZA 3FVGA 3RTFB 2O68A 2O7IA 3QSLA 1TT1A 2GH9A 5K2XA 2H25A 3UA8A 1Q35A 5H8NB 4IO3A 3K01A 1MQDA 3R6UA 2AL4A 1O64A 1A99A 1ZU0A 2XXXA 3UGWA 4M1VA 4WEPA 1S9TA 2F6GA 2G93A 3TCFA 1OLAA 1B4ZA 3FVKA 2YPNA 4HCWA 1MXVA 4RPOA 4NEDA 3WAFA 3QUFA 1LB8A 4EF1A 2BJJX 3TELA 1TXFA 4POXA 2NVUB 3HPIA 3MVYA 3SESA 3Q26A 4X1BA 3M3LA 2FYIA 2WKYA 3S9NC 2ZNUA 2ONRA 3THIA 3TQLA 2XXQA 4YMAA 4Q30B 3MUQA 1H43A 1R9LA 2ZYNA 4MLVA 5DT6A 1VSOA 4YB5A 3A3CA 4NWCA 3LR1A 1RKMA 4RK2A 2VOZA 2UVGA 1ZLQA 2F35A 1Y3NA 4YMBA 3O2AA 2UVHA 1EZ9A 4F1UA 3UN6A 5CI5A 3O6HA 2UYEA 4FIMA 4RXLA 2PX1A 1ELJA 2IEEA 5I84A 1OMPA 2I49A 2ZYOA 3PPNA 3RQTA 1PDAA 3WAEA 2GFEA 1D9VA 3CFLA 4R74A 3K1NA 2Y7WA 5L9MA 1LBBA 3I3VA 3UIFA 3MZ1A 4JXIA 5H8FB 2I0BA 2Q2AA 2I3WA 3MC2A 5J1DA 4XKQA 2O7UA 5CC2A 3EPEA 3MWBA 3OEMA 2OBGA 1IIWA 4KYDA 1JEUA 4THIA 3U1OA 1ZTYA 3S9MC 2DE4A 1LLSA 1MY1A 2PT2A 4HCYA 4OZ9A 4QFNA 2I48A 4YKJA 4LZ5A 4F2QA 2B65A 1MS7A 3AXFA 3DP6A 3MVZA 4QHQA 5K2YA 3T96B 3A09A 4O3AA 4ISUA 3H6TA 3ZS6A 5H8NA 3V89B 1XS5A 2XXRA 3KN8A 4ZE9A 1XOCA 4BDMA 3MVWA 1H44A 2DS9A 1IQ7A 3SEVA 2Q88A 1I6BA 1FQFA 3E3KA 3CRBA 3ILUB 1AL3A 1LCTA 5AA2A 1MRPA 3VVEA 3JV9A 4G77A 2HQ0A 1H3DA 1FTOA 4AB5A 3S9EA 4Z7EA 2KLFA 1USYE 3IOTA 1B40A 2V93A 2X7QA 1OVTA 3PV0E 4WEDA 1B05A 4F3PA 3C36A 3OO9A 1LCFA 2H4IA 2I58A 4PP0A 5CBRA 3TCGA 3ODBA 1KWHA 2ZNSA 4N07A 2F7CA 1IXCA 2V3TA 4F22A 1B0LA 3KJ7A 4FEDA 3FD3A 4F2OA 2OWTA 3SEWA 1NNKA 2H5YA 1MDQA 3O6GA 4K3FA 1B0HA 5B7DA 4ZECA 1PBPA 2HAVA 3H03A 5A5XB 3F11A 1LGBC 2XXVA 2P1SA 3CG3A 3KG2A 1B46A 4Q0CA 2B3BA 4IO7A 4RY1A 2F78A 3IJXB 1SW5A 3FV1A 1URGA 5L8DA 3EN3A 1FQAA 3S2VA 5I2KB 2R71A 3QUJA 1AOVA 4F3GA 1N76A 3FVOA 1MPBA 1UTBB 1USYH 3H6UA 2DP8A 4QFOA 1POY1 3SEXA 4LP2B 4Z0IA 2QPQA 1A8FA 2P0SA 3B6TA 3Q25A 5CMMA 1SW1A 4H8JA 4AQ4A 4R6HA 1QW0A 3EHUA 4QRZA 5DVFA 2VHAA 1WVJA 4OENA 3VV5A 4KCDA 4YB7A 2AYSA 1B3HA 1QKBA 1CE2A 2DXYA 4KHZE 2ZXTA 3TODA 1UQWA 5ELVA 1EU8A 1NNPA 1NNTA 3PUXE 3VVFA 5L9SA 1LFHA 4JBZA 4Q8RA 5H8QB 2G29A 4R72A 1WDNA 2Z8EA 2QL3A 3H6VA 1Z7NE 3K2DA 3C9HA 3BKIB 4OYVA 3MVXA 3RY3A 4KFQA 1MM7A 1NKXA 1LAXA 5TPAB 4OTEA 1MY2A 5DYHA 3FZVA 3IAZA 2RKMA 4F19A 2VD2A 1NFTA 4XTCQ 3W9WA 3MAMA 4YAHX 1SW4A 1MM6A 2QRYA 3H6WA 4GLIA 1O63A 4FJPA 2H9BA 1MY3A 3HHGA 1FCKA 1NL5A 3OO8A 4IO2A 1BTJA 2Y7RA 4C1TA 4R2BA 1D4NA 3KJTA 2Q8JA 3B6WA 4FAJA 3H7MA 3BFTA 3P7IA 1F9BA 3GZGA 4H8IA 4BDOA 1H76A 3TEPA 4ELQA 1SYIA 3E13X 1XVYA 2E0SA 3RN8A 3DELB 3BBRA 1SD3A 2A5TA 2OCUA 1UTHB 4JWOA 4F29A 5I57B 5A5XA 4PETA 3FV2A 2NXOA 1I6QA 4U1ZA 2VGQA 1N7WA 4OXVA 5HBCA 4NWDA 5JTYB 3IB1A 4PQJA 1FQCA 4EQ9A 2XHDA 2D5WA 5CMBA 1QULA 2NWJA 1UTBA 4E0WA 1QVSA 3TYHA 4JSDA 5FHMA 3Q27A 2ZYKA 1SVXB 1LFIA 3TFLA 1SBPA 3QK6A 3C4MA 2M8CA 3K1PA 3PU5A 4JB7A 4EQ7A 4WKMA 1BKAA 1RYXA 1FQEA 3HV1A 3KOSA 2QMWA 1DPEA 1RYOA 1DOTA 2F36A 1VFDA 1BIYA 3MZBA 4GVOA 3U93A 2PMSA 3PGFA 4H5GA 2YLNA 3PMVA 3LSFB 4IO6A 2XX7A 2PT1A 1MH4A 5H8QA 3JYRA 4LZ8A 3GBAA 4H65A 5I2NA 1AMFA 4F39A 4XXUA 1LBCA 3T9UA 3MP1A 2ABHA 5DEXB 1Q1KA 3OMBA 4YKKA 3RTWB 3MP6A 3L6HA 5BUUA 3T66A 3RNNA 3B7DA 3KOTA 1N0TA 4QSDA 2DWHA 3K6VA 5HM4B 1M5FA 3R26A 5EYFA 3QAXA 4ZEKA 3T9XB 3IX1A 3KBRA 1OIBA 3IK6B 3K00A 4BLAA 1YTVA 3FVNA 3N5LA 1JVXA 4NF5B 1N3WA 5ITOA 4G8MA 4GRKA 4QSEA 4F3SA 2Z8FA 1PB8A 1B1XA 3DLNA 3D4CA 4ELOA 4DCYA 2QJEA 4QSCA 1JNFA 3OOAA 4EDPA 1MDP1 1XC1A 1JQFA 3U8QA 1A55A 1OQHA 4MBPA 4XKNA 1ATGA 2H99A 3OELA 3TPAA 3K6UA 1B4HA 4P0GA 4N13A 2XXWA 2F34A 3MQ9A 2V3QA 4OFLA 3VLWA 3PD8A 1HSLA 2GHBA 4G2ZA 1IXGA 4E0XA 5JTYA 3KSJA 3D4GA 2XD3A 3IO4A 3PUYE 4ZEDA 2D3IA 5ISUA 2DWIA 1UIUA 1B2HA 3KZGA 1ANFA 3PMWA 2F8DA 4G4PA 4OEVA 1ZIUA 4G68B 2I4CA 3HN0A 4PFYA 2AIXA 1P1OA 1LAHE 5ICQA 1TFDA 2W7YA 3IOVA 3PD9A 5CRYA 1EH3A 5B70A 4ONYA 3EF7A 2R9JA 5CM6A 2DSFA 3K4UA 2Z23A 2XX9A 3IO6A 1N3XA 5CBSA 4OQOA 1P1WA 3KFMA 4UACA 1PEBA 5DEXA 2XXPA 5ICTA 4U4SA 1JW5A 1T0KA 3HCQA 3IL1B 3K6XA 1B1HA 3CR9A 4KYEA 1Y3PA 4LONB 4PFUA 4RYAA 1A8EA 3ONMA 2H98A 4POWA 4F31B 4EXKA 1DTGA 3N6UA 1Y20A 4KI0E 1SW2A 4GXAA 4ZS9A 3TTKA 3PUWE 4HS7A 4ZDMA 3O97A 3C32A 4QFLA 1J1NA 1QKAA 1PC3A 3H4ZA 4JWXA 3GXAA 3TTLA 3T93B 2V84A 2Y7KA 4AB6A 4NF5A 2HAUA 4H67A 4PFTA 1QJMA 1B5IA 3VLVA 2DQVA 3TTMA 1B5JA 1S7YA 3SEYA 5FHNA 3ZKLA 3QIMA 1DSNA 4ESWA 1Y9UA 2R6GE 2HZLA 2V3UA 4F3BA 4IY5A 3VFJA 1M5DA 4I9DA 4X48A 1FTLA 4OWDA 2DVZA 1IUDA 4OHNA 4GWOA 4L17A 4OERA 1US5A 3M3KA 4LA9A 4TLMB 5H8FA 1FQDA 4YZZA 3PPQA 2XXUA 4WXJA 2UVIA 3MP8A 4JDFA 3N26A 1B52A 3LBSA 4BDLA 1SDXA 4JSOA 5DVJA 4U23A 2OWSA 4OVJA 4YKIA 4DXUA 1LAFE 3LSXA 4TLLB 4KCCA 4ELPA 3O6IA 2XXHA 3MPLA 4EUOA 3CI8A 1MQJA 3B6QA 5IAIA 2GRVA 1JEVA 1P1QA 3MJNA 4R9FA 5EHSA 1EZPA 4NF8B 2RC9A 4MH5A 1MG1A 1N7XA 4G68A 3OD7A 2ANJA 3VXBA 3VXCA 3PUZE 1TWYA 4O3CA 5I59B 3G3GA 3TZAA 1M5BA 3C33A 3FJ7A 3TDJA 5KZTA 2RINA 2ZNTA 4KPTA 2P2AA 1B7UA 4G8NA 5JEIA 1UIVA 3RPWA 3S9LC 5H8HB 1Y1MA 4KR5A 4LZ7A 5I58B 4FE8A 4EQBA 1YCJA 4IGTA 2ZMBA 3H3GA 3SEUA 1IEJA 3QYTA 3SDFA 4GQOA 1OQGA 4NMYA 5FHOA 2ALUA 2O84X 4I1DA 3OSQA 1PBQA 3KGCA 5AA4B 4DE8A 1A54A 3EQ1A 1DMBA 1URDA 3CFZA 5AE4A 1FTKA 4BDQA 1MQHA 1B3EA 3IJOB 5FTHA 4GFRA 2UYFA 4IY6A 2OJTA 4F1VA 2Y7PA 2RC8A 1MQGA 4OFOA 5CMCA 4N6PA 4KD5A 3TTRA 1LFGA 2ZYMA 1IXHA 3O28A 3OXNA 3MPKA 2QS1A 2CMOA 4XIGQ 4GF8A 4C0RA 1YPNA 4C1UA 3C34A 3TQWA 1MXZA 4MF3A 5AA1A 5I56B 2FA7A 1B3FA 4DIGA 3MBPA 1FW0A 1OVBA 4OEUA 3OENA 3GLBA 3LSWA 1H45A 2RC7A 4ZEIA 1XVXA 5I2KA 3K1MA 1QUIA 3USDA 4I62A 2QS2A 1HSEA 1NMUA 2Q2CA 3TAJA 1MXYA 4ESXA 1HSJA 3KN3A 4X1DA 4F18A 3RGYA 1ZJLA 3O66A 2XX8A 4UA8A 4KQPA 2QS4A 3Q28A 1I69A 3SERA 2A5SA 1L5TA 1O7TA 1D9YA 2DXRA 5ITPA 3T9HB 4IGRA 4DLDA 3C35A 4GD5A 4I8CA 3TTNA 3U92A 5M2VA 4P11A 1QUJA 1P99A 4RPNA 4EF2A 4ND9A 4NF8A 4M4GA 5AA2B 2LAOA 3V8XB 4DXBA 5HPQA 4G68C 4LQ5A 3UP9A 3ZSFA 5I59A 1MY4A 3PPRA 4RK9A 3H06B 3VE1B 5TPAA 5EHMA 1OLCA 4OFJA 2XD2A 2Y7IA 3PPOA 1Y4TA 2F5XA 4LUBA 5KCJB 1AIVA 1VE4A 3ZKKA 4LVQA 1GVCA 2QS3A 5H8HA 3UK4A 5I58A 5BWJA 3FUZA 2F6PA 3CSGA 4IO4A 3PPPA 3I5OA 4O3BA 4F1YA 4GL0A 1MXWA 4NTLA 3FGSA 2O6AA 2NUVA 1M5EA 3Q29A 2XXIA 4U1OA 5AA4A 4P0IA 3RT8A 2REJA 3BFUA 3VVDA 5TP9B 1CB6A 2VD3A 1SI0A 4NF6B 1Y3QA 4X9TA 1B5HA 5JK4A 1GR2A 1SQYA 3DP4A 2ESNA 5F1QA 1LB9A 1MY0A 3KN7A 3L6GA 4HW8A 1UTHA 3FATA 4GXSB 2B3FA 2F97A 2HFBA 5I57A 1IZ1A 4RNSA 3OO7A 5DVIA 3K02A 5I56A 1Y4CA 3PMXA 3RLFE 3N94A 1B9JA 1B32A 1P1UA 4DXCA 3VLUA 3I6VA 2YJPA 1MXUA 2DWAA 2XXYA 2OK2A 2THIA 1GV8A 4TOZA 1QUKA 3W9VA 2HZKA 2I4BA 1FQBA 4JWYA 2QSXA 5KDTB 4LATA 1WODA 2AL5A 1LAGE 5FTIA 4GIZA 4R6KA 4DDDA 1IXIA 3T9VA 1II5A 3HO7A 3HSTA 4PFWA 1R1NA 5DTBA 2O51A 1N04A 3ILTB 3DP8A 4Q5TA 2Z8DA 3OEKA 5LOMA 2I0CA 2O1LA 2NOOA 3IOUA 2DWJA 3G7WA 1P1NA 4H0WA 3FIRA 1URSA 1VFEA 1SYHA 3IORA 4H5FA 1N84A 1PB7A 1AH5A 4BDNA 1NH8A 3LC8A 4H1XA 1VR5A 1MXXA 2Q9TA 3UORA 2REGA 5F7VA 5KCJA 4YKPA 1S50A 1LSTA 3W15C 1BLFA 4RJZA 1B51A 3EHTA 5CMKA 3SKPA 1BP5A 1MPDA 1M5CA 2FNCA 3CSBA 4U21A 1NH7A 3RT6B 2O69A 4IO5A 3TMGA 4QFPA 3G3IA 5L9OA 4FECA 1NNFA 2PYYA 3K0VA 2OZZA 4FEBA 2DE3A 1ZBMA 1SI1A 4OMBA 4U4XA 1B7ZA 5TP9A 2GHAA 4NF6A 2RCAA 3VDFA 1JW1A 2A5TB 4QFKA 1I6AA 2DE2A 2O1MA 3E9XA 3FXUA 2X26A 3MW0A 4PE5B 4YICA 3O9PA 3V5AA 2Q89A 4NF4B 4MFIA 3LUYA 1XT8A 3CFXA 4QF9A 3U94A 4GL8A 2DYXA 1US4A 3TKDA 1EZOA 4KYSA 4XKRA 3OO6A 3G3JA 3G3KA 3TUSA 1IITA 2UVJA 4R2FA 2OLBA 3FJGA 3FXRA 1MH3A 2E1SA 5KDTA 4YU0A 1ZKBA 2CZLA 3O29A 4FATA 4RA1A 5TU0A 1A7LA 2V25A 3K6WA 3CG1A 1ZMGA 4NE4A 3KEIA 1B6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PUVE 3N6TA 4U2RA 3QXMA 2QMXA 2IA4A 2ONSA 3S4UA 1GTKA 1A40A 5I2NB 3GBBA 4MLQA 4ZZAA 3EHSA 4GOTA 2I3VA 4EXLA 1EYIA 3FXQA 4R6YA 1MPCA 3G3HA 1TFAA 4HE1A 1G0HA 3G3FA 4O7IA 3BIHA 4XKPA 4ZEBA 1POTA 3TCHA 3CVGA 4ZE8A 4R73A 4ECFA 2PBWA 4BDRA 1YAEA 3IOWA 3V83A 1XHYA 2HCAA 3LSLA 4DCXA 1DTZA 3E4RA 5IKBA 1R6ZA 2Z22A 3ECRA 2DVCA 4FORA 1FPJA 1FTJA 5AA2D 3IB0A 1NUWA 3IR1A 3DM0A 3M3FA 1R9QA 4DZ1A 2FIXA 1PB9A 4PGPA 3FASA 3OSRA 1B3LA 4H6DA 2WYKA 2HEUA 4R9GA 1FRPA 1B3GA 4U22A 3SETA 2D21A 1GGGA 3T22A 4ZZEA 2F7AA 1D3KA 3M8UA 4OESA 3RUMA 4HTGA 4LQ2A 3C31A 2RCBA 4X8RA 4R75A 3R7XA 3JZJA 2DOJA 1MQIA 2HXWA 3HHFA 2QVRA 1B58A 2X7PA 1B7HA 3LUZA 1Z7ME 2RF1A 5AA3A 4ELRA 2PVUA 2I6EA 4YB6A 3CIJA 2F7BA 2VP1A 4H46A 3IB2A 4IB2A 1JVYA 1INPA 1JW4A 2GQ1A 3U72A 4OETA 1DPPA 3MZ9A 1JETA 4ZEFA 4TQUQ 5H8SA 2ONKE 5LDZA 2Y84A 1FTMA 3A3UA 3KSXA 4NF4A 2XXTA 3FJMA 2UXAA 1FPGA 4G8HA 5A5LA 1Y1ZA 4NF0A 4PBHA 5F24A 3FVGA 3RTFB 2O68A 2O7IA 3QSLA 1TT1A 5J16A 2GH9A 5K2XA 2H25A 4MMPA 3UA8A 1Q35A 5H8NB 4IO3A 3K01A 1MQDA 4XFEA 4MIJA 1RDZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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