1N7WA

Crystal structure of human serum transferrin, n-lobe l66w mutant
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGWVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin. A Structural Study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA01
2F7AA 3OELA 4U4XA 2XD3A 3A3UA 4RY1A 4O3BA 2ZXTA 1TFDA 4GWOA 3IB2A 2O1MA 2XX7A 3K6XA 4GRKA 4ZEDA 5ITOA 3MVWA 2UVJA 2Z8EA 5I84A 3KSJA 2NUVA 5L9MA 3OXNA 4X1DA 1UIVA 1NNTA 3UA8A 2XX8A 2Z8DA 4U2RA 4F3SA 4NF4A 3IL1B 1QKAA 4EXKA 2Z22A 1FQDA 1R9LA 1IXCA 4LUBA 4DXUA 3C9HA 1OLAA 3IOWA 2XXUA 1ELJA 2VOZA 2F6PA 3K02A 5DT6A 1AIVA 2OBGA 1VSOA 5AA1A 3EQ1A 4EQ9A 1VR5A 1JW1A 4H1XA 3IORA 5H8SA 2B3BA 1MY3A 2I0CA 3O29A 3S9LC 1UIUA 1B4HA 1CE2A 1B46A 2I49A 1MY2A 3PPPA 2Q89A 1M5BA 1YCJA 1B6HA 5B7DA 3H6TA 2H9BA 4LZ5A 1MY4A 4QFPA 4KD5A 2DVCA 4KR5A 4KYDA 3R7XA 3QYTA 3C32A 4GL0A 1JEVA 3PUXE 2H98A 3UORA 3H6UA 3TODA 5DVIA 4I62A 4AB6A 3M3KA 2AL4A 4LATA 4G8NA 5AA3A 4BDRA 4IGTA 5AE4A 5DEXB 4OFLA 3FJMA 4YAHX 3AXFA 1LGBC 3KN8A 4NWCA 3BFUA 1P1NA 3RY3A 4X48A 1A55A 2AL5A 2DQVA 4Z7EA 1LAGE 4GIZA 3QUJA 1SVXB 4Q30B 5DEXA 1XVXA 4KYSA 3FASA 3CFXA 5H8FB 5CI5A 4ISUA 2ZNUA 5DVFA 2DWAA 2GHAA 4BDLA 4F3GA 5ICTA 3SEUA 1B5HA 1MRPA 3Q29A 4OVJA 3K1NA 3N6UA 5H8FA 1USYE 1O64A 3PD9A 4ELPA 4XXUA 1R6ZA 1H44A 1VFDA 2DYXA 1BKAA 2X7PA 4JSDA 4ZEKA 1NMUA 3S2VA 3I5OA 2UVGA 3O6IA 1PC3A 2UXAA 2Q9TA 3PD8A 4PFWA 1IXIA 3PV0E 2DSFA 3FVKA 3MPLA 1B3HA 4KHZE 3A3CA 4PFUA 3TAJA 3HSTA 1MXYA 1S50A 4YU0A 5HBCA 4ZECA 1PBQA 4YICA 2F78A 4IO7A 1II5A 2O1LA 3BBRA 4F2QA 4QFKA 1JW5A 1OVBA 4ZE8A 4EQBA 3RN8A 5CMBA 3BKIB 4H5GA 2XHDA 5AA2B 3TCHA 1MQGA 4F39A 1MY1A 4R75A 1B0LA 2DWJA 5I2KA 1D4NA 3ILTB 4G4PA 4I8CA 1IQ7A 4R2BA 3CIJA 4IO6A 1DPPA 2F7BA 2FNCA 3VFJA 1P99A 2Y7WA 1QUKA 1MS7A 4BLAA 4EQ7A 5JK4A 2ZYOA 2E1SA 2F97A 4ZEBA 3RTWB 4NE4A 3FVOA 3EPEA 4JSOA 3O9PA 1NH7A 3B7DA 2VP1A 4YKJA 1SYIA 3L6GA 1B3GA 3ONMA 3FGSA 1GVCA 4XTCQ 3MAMA 4U21A 4H65A 3DP4A 3EHUA 2Q8JA 1BIYA 4H8IA 3TTKA 2UVHA 4RPNA 4R72A 3MPKA 1OLCA 1GGGA 2YLNA 3OSRA 4R9FA 3VXBA 4P11A 3HO7A 1JVXA 2DWHA 4XKRA 4YB5A 4HS7A 5JEIA 1SD3A 4KQPA 2Y7RA 3IB1A 4YZZA 3THIA 1B3EA 3R6UA 1B52A 3IX1A 2QS1A 5DVJA 3UK4A 3OD7A 1SW5A 4TQUQ 4YMAA 3SERA 4MLVA 3O97A 1Y3PA 2ZYNA 3MVZA 3FZVA 4G8MA 1HSLA 2GHBA 2V3QA 4GLIA 1H43A 4IO3A 2HQ0A 1FTOA 1MQDA 4RJZA 3USDA 3DP6A 2D21A 2ABHA 3ZKKA 1T0KA 1GR2A 4OENA 4HCYA 2R9JA 3MW0A 1MPCA 1DOTA 2D5WA 3ECRA 3O2AA 5F1QA 4F3PA 4O3CA 1ZMGA 4OEVA 3B6TA 3HHFA 4NF5A 5ISUA 4R9GA 3RNNA 4U1OA 3TTNA 3LC8A 4OESA 3SESA 3IOTA 2FA7A 1B9JA 2LAOA 4G8HA 4QSCA 4I1DA 2OK2A 3H06B 3TTRA 3SEYA 1MG1A 3SETA 3U93A 3OOAA 2ESNA 3QAXA 1PDAA 2F7CA 3OEMA 2HZLA 1DSNA 3FVGA 3KG2A 1ZU0A 4DLDA 3CSBA 4WEPA 4I9DA 1UTHB 3U1OA 1KWHA 1P1OA 1AL3A 3V83A 3V8XB 4XKQA 3KOSA 3TZAA 5DYHA 4U23A 1WODA 5EHSA 2RC8A 1JW4A 5CRYA 1UTHA 3T22A 4XIGQ 4YKKA 2PVUA 2O6AA 3M8UA 5CMCA 1LAXA 3VXCA 3K6WA 4YMBA 4LZ7A 3FV2A 5TPAB 4MH5A 4ESXA 1FQAA 4BDMA 4EF2A 2O68A 2A5TB 1UTBB 4P0IA 1TXFA 3JYRA 3C36A 5LOMA 1NH8A 1Z7NE 4O3AA 4OEUA 1LAFE 4KFQA 3T9XB 4AB5A 3LUYA 3HN0A 3JZJA 2OJTA 4R6HA 2YPNA 4LZ8A 3EHSA 3TQLA 3UIFA 5EYFA 3FXQA 2ONRA 1JNFA 1B1HA 1NNKA 3TFLA 5TP9B 1UTBA 3QSLA 4GL8A 4HW8A 3UGWA 1DTGA 3G3GA 1F9BA 1MH3A 3W9VA 4JWYA 3G3HA 3V89B 2QS3A 2F8DA 4Q8RA 2XXVA 4E0XA 4Z0IA 1US4A 2QPQA 4JWXA 4YKPA 4L17A 3OO7A 3K2DA 4ZZAA 1I6QA 1LLSA 4RK9A 3Q27A 1FQBA 4POWA 4F22A 5L8DA 3OO6A 3HCQA 1AOVA 3VLUA 4JBZA 4RPOA 5CBSA 3E9XA 4KYEA 3MC2A 2XXWA 3KSXA 4OZ9A 2HEUA 1POY1 1FQFA 2RKMA 1MDP1 1JQFA 5TU0A 4ZEFA 3B6QA 1QUIA 2HCAA 4JB7A 1B7UA 5ICQA 4ZDMA 2BJJX 5FTHA 3CG1A 1USYH 3ZKLA 3KOTA 1EZOA 1A7LA 5KDTB 4HCWA 3T96B 2ANJA 1URSA 1IITA 1WVJA 2XXYA 3VV5A 4E0WA 3QUFA 3PPRA 3QK6A 4N07A 2YJPA 2A5SA 3S4UA 4PFYA 1YAEA 1OIBA 2PYYA 1I69A 5ELVA 5KDTA 4DCXA 4M1VA 4F1UA 4BDNA 3Q26A 3IJXB 3MZ1A 1Y3NA 3GZGA 1SW4A 1ANFA 2QL3A 4KCCA 3E4RA 3IAZA 3RGYA 1QW0A 3G3FA 1EU8A 1Q35A 3KJTA 2OZZA 4THIA 3CSGA 3K6VA 5H8QB 3QXMA 1QVSA 1ZIUA 4DXBA 1DPEA 3RUMA 3TCFA 3CG3A 3FUZA 2H25A 4F31B 4NF6B 3I3VA 1QJMA 3RPWA 1B7ZA 2NOOA 2DS9A 4M4GA 3CRBA 1H76A 2D3IA 4FATA 1Y1MA 2PT1A 4H8JA 1N04A 4GXAA 2CMOA 3TDJA 2UVIA 4HTGA 5KCJB 3K1MA 2DE2A 1M5CA 2GH9A 3RLFE 4DDDA 3S9NC 1URGA 4C1UA 3CVGA 2ZYMA 2O84X 4QRZA 5I59B 4KPTA 3FXRA 3K00A 4U4SA 3B6WA 3T66A 1DMBA 3JV9A 3FATA 4XKPA 4NEDA 1N3WA 2I4BA 3IK6B 4OWDA 1SBPA 2V3TA 3IOVA 2ALUA 5I59A 3F11A 3N94A 1D9YA 4FE8A 3WAFA 5AA2A 3RTFB 1A8FA 3KBRA 4OMBA 3PPOA 4WKMA 2F35A 1BLFA 4LVQA 2VD2A 3K6UA 2P0SA 1QULA 1GTKA 3VVEA 1HSEA 1IZ1A 5J1DA 1A99A 1UQWA 2E0SA 4NWDA 2I3VA 1LFGA 3C33A 4H6DA 2HAVA 4IO5A 2ZNSA 1M5DA 3KGCA 3O6GA 1MM6A 4MF3A 2DE4A 3VLVA 1DTZA 4R6YA 4X9TA 1US5A 4ELOA 1AH5A 1IEJA 4DE8A 2QSXA 3TMGA 4GQOA 4GXSB 4X1BA 5FHMA 3RQTA 1MXXA 2NXOA 2THIA 2NVUB 1FTJA 3VVDA 5IAIA 4OXVA 2H5YA 3EN3A 3R26A 2O69A 4ZE9A 5CBRA 3IB0A 4IY5A 3W9WA 2PMSA 1ZLQA 1OQHA 4C0RA 1LCTA 1FTMA 2Q2CA 4AQ4A 1MXWA 1NKXA 3T9HB 2DOJA 1M5EA 1TWYA 4POXA 2HZKA 4GFRA 2QJEA 3PMXA 4LQ5A 4R74A 3KZGA 3TQWA 2X26A 2UYEA 3K4UA 1NNPA 3N6TA 3KEIA 5I56B 5A5XB 2OWSA 5FHNA 3H03A 3GXAA 2H4IA 4PQJA 1PEBA 3HV1A 2IA4A 3H6WA 3S9EA 3TYHA 1Q1KA 3BFTA 2XD2A 2XXPA 4FJPA 4H0WA 5I2NB 1TFAA 2QMXA 3PPNA 4R73A 4OERA 1FCKA 4QFNA 3FV1A 2RCAA 2HXWA 1XS5A 4ZS9A 1B51A 1MXZA 3H3GA 4QFOA 2RCBA 1J1NA 4PETA 1IXGA 1B7HA 4FEBA 4UACA 2QS4A 3FJ7A 2Y84A 1POTA 3U94A 1ZBMA 3L6HA 3ILUB 4JXIA 4FECA 3FXUA 1B4ZA 2Y7PA 5DTBA 2H99A 5BUUA 1Y3QA 3K01A 4LONB 1LFIA 1RYOA 4WXJA 2I3WA 2Q88A 2XXQA 3KN3A 3MP1A 4FORA 3OO8A 3C4MA 2DE3A 1VE4A 2I6EA 4YB6A 5I57B 1XC1A 4N6PA 2RC7A 1N7WA 3M3FA 3UP9A 2GFEA 2P1SA 2Y7KA 3SEWA 3ZS6A 1B1XA 1A8EA 3MQ9A 2RC9A 3IOUA 2I48A 5H8NB 5I58B 2F5XA 4EDPA 1YPNA 4DIGA 1MDQA 2O7UA 2ZNTA 4PE5B 3MUQA 3N5LA 5CC2A 4MLQA 2CZLA 2M8CA 1Y9UA 1ZJLA 5TPAA 2Z23A 1M5FA 2G93A 4RXLA 3H6VA 5I58A 2PBWA 2A5TA 5JTYB 4NF4B 3FIRA 4GOTA 3OSQA 4ND9A 1FQCA 1HSJA 3PMWA 1H45A 5JTYA 5TP9A 1N76A 1LB8A 4KCDA 1B32A 4ESWA 3P7IA 4JDFA 4ELQA 1B5IA 3LSWA 1PB9A 4G77A 1ZTYA 1B2HA 4RA1A 2VHAA 3DLNA 1XVYA 2I0BA 1SI0A 3LSFB 4EUOA 4H5FA 4IGRA 1NNFA 1B05A 2DWIA 3MBPA 1TT1A 3OEKA 4KI0E 2KLFA 2V3UA 2V84A 3MZ9A 1MQJA 4NMYA 1QUJA 1P1QA 1RYXA 2FYIA 3VVFA 3MVXA 2Q2AA 3VDFA 2REJA 3H7MA 4ZZEA 2NWJA 4QSDA 4OHNA 1IUDA 2QRYA 4F3BA 1AMFA 3GBAA 4RYAA 3TELA 1Z7ME 4XKNA 5M2VA 3VLWA 3G3JA 2V93A 4OFJA 1RKMA 1N3XA 2UYFA 3O28A 1B58A 4DZ1A 1D9VA 1LCFA 3OENA 2DXRA 3CFZA 3I6VA 1QKBA 5ITPA 1IXHA 4EXLA 3O6HA 2O7IA 3E3KA 2Z8FA 4C1TA 1PB7A 4RNSA 3MP8A 4BDOA 1NL5A 2P2AA 1MXUA 3LSXA 2F36A 5FTIA 3FVNA 3TTLA 3T93B 3TPAA 1D3KA 4TOZA 4ZEIA 1JEUA 3RT6B 1L5TA 1BTJA 4IO2A 2OCUA 3SEXA 4G2ZA 1MPBA 1B3LA 2O51A 4YB7A 3FD3A 3CFLA 2OLBA 2WKYA 2X7QA 3PUVE 3M3LA 2ZMBA 4ONYA 3FJGA 1O63A 1EZPA 5H8QA 3H4ZA 4FIMA 3Q25A 2IEEA 4DXCA 5F7VA 3PUYE 1MH4A 2VD3A 3T9UA 2RF1A 4GD5A 1EH3A 4NF6A 4OQOA 5CMKA 3E13X 3ZSFA 5EHMA 4ECFA 3K1PA 3U92A 1O7TA 2F34A 2I58A 2DVZA 4UA8A 1MXVA 1XT8A 3C31A 3S9MC 3MP6A 5K2YA 3RT8A 1FTKA 5H8HB 1IIWA 3OMBA 1OQGA 2DP8A 3KFMA 5KCJA 2QMWA 2REGA 2HFBA 1N84A 5I2KB 4F18A 3N26A 4MFIA 5H8HA 4IB2A 1P1UA 4N13A 1LB9A 1ATGA 3D4GA 4YKIA 3ODBA 4OETA 3DELB 3PUZE 5L9SA 1S9TA 3IO6A 4JWOA 4LP2B 4QFLA 4DCYA 1B3FA 5AA2D 1LBCA 2AIXA 1SQYA 2HAUA 1OMPA 4OYVA 3LSLA 4GVOA 4GF8A 3PPQA 3QIMA 3MVYA 1FQEA 4F2OA 3TUSA 1PB8A 4FEDA 5B70A 2AYSA 3MJNA 2XXTA 2B65A 1WDNA 2OWTA 4NF8B 5KZTA 1ZKBA 2W7YA 1P1WA 4Q5TA 4U22A 2DXYA 3IO4A 3VE1B 5L9OA 3SDFA 3SEVA 2R6GE 3MWBA 3KJ7A 2ONKE 2ZYKA 2G29A 3U72A 1LSTA 3TEPA 2I4CA 4NF8A 1SW1A 4TLLB 5K2XA 5BWJA 3KN7A 1B40A 4NTLA 4EF1A 1MM7A 2ONSA 2RINA 2PX1A 1BP5A 3SKPA 3WAEA 4F1VA 4G68C 2B3FA 1YTVA 1XHYA 4F19A 4MBPA 3TTMA 1LBBA 4BDQA 3O66A 4K3FA 1SW2A 4TLMB 1CB6A 3GLBA 2GRVA 2R71A 1A40A 1SI1A 2F6GA 3IJOB 4U1ZA 2XXIA 4PFTA 4G68B 4IO4A 3DM0A 4LQ2A 1MQIA 1LAHE 4NF5B 1URDA 1MPDA 2XXHA 4QSEA 4RK2A 4OFOA 4QF9A 1R9QA 4OTEA 5I56A 3UN6A 5AA4B 4QHQA 5A5XA 1VFEA 3OO9A 2VGQA 4G68A 1MQHA 4R6KA 1JETA 1R1NA 4LA9A 3A09A 3DP8A 3CI8A 5FHOA 1LFHA 4ELRA 1EZ9A 1I6AA 5CMMA 1N7XA 5I2NA 5HPQA 3MZBA 3PUWE 1SDXA 3G3IA 5AA4A 1Y4CA 3K0VA 1XOCA 3C34A 4IY6A 3EF7A 3TKDA 4F29A 1N0TA 3CR9A 1NFTA 5HM4B 1PBPA 4Q0CA 1OVTA 4P0GA 2XX9A 3W15C 3U8QA 1Y4TA 3PGFA 4FAJA 1JVYA 3G3KA 5IKBA 1H3DA 3D4CA 1B0HA 3TCGA 3T9VA 3HHGA 4F1YA 1Y1ZA 1FTLA 2PT2A 4H67A 1FW0A 1I6BA 2Y7IA 3Q28A 3EHTA 3PU5A 2XXXA 4PP0A 1B5JA 1MY0A 1Y20A 3C35A 4R2FA 3GBBA 3G7WA 5I57A 5CM6A 3LR1A 1SYHA 1S7YA 2XXRA 3HPIA 3PMVA 1A54A 3IR1A 3V5AA 1GV8A 3LBSA 2QS2A 4WEDA 5H8NA 2V25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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