1N7WA

Crystal structure of human serum transferrin, n-lobe l66w mutant
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGWVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin. A Structural Study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA01
1LAFE 1H76A 4G8MA 4GLIA 3U93A 1QUJA 1YCJA 3KN8A 1F9BA 2F7BA 2PMSA 1TT1A 1RYOA 3MZ1A 3I6VA 1URDA 3DELB 4FIMA 3OO6A 1MPDA 4HS7A 4QRZA 4Q8RA 4PFWA 2PT1A 3PUXE 4AB5A 1EZPA 2RINA 5H8NA 2G93A 1ZMGA 2QRYA 3F11A 3VVEA 1I6AA 1M5BA 3FJMA 2DQVA 1JW4A 3PPRA 3RPWA 3EHTA 1A99A 3C36A 3O97A 3TMGA 5A5XB 5KCJA 4ZEIA 4G8HA 3BFTA 5H8FB 4XKQA 3TELA 1SYHA 3P7IA 4QSCA 1LAGE 5BUUA 2HQ0A 3O28A 4KHZE 2B3BA 2I6EA 4OEUA 2A5SA 2XD3A 3IJOB 3PUZE 2O7IA 4EXLA 1N7WA 2WKYA 3KJ7A 4LZ5A 2P2AA 4GF8A 2F7AA 3IB1A 3H06B 3KGCA 2R71A 1MY4A 3Q25A 2Z8EA 3K6XA 3O66A 3R26A 5JTYA 4F1VA 4BLAA 2O51A 4G68B 1UTBB 1AMFA 1MDQA 1D9YA 5AA4A 3BKIB 3FXRA 1H43A 4OWDA 4GL0A 1JQFA 3CFXA 3TQLA 2OJTA 2PT2A 1MXXA 2RCBA 4BDRA 1SVXB 2UVIA 4IO4A 3RNNA 1CE2A 2B65A 1B05A 4NF6B 1P99A 2VD2A 3GXAA 2UVGA 2V3UA 3QIMA 2DYXA 2ZXTA 1Y1ZA 4GIZA 1SDXA 3K4UA 4R6YA 5FHMA 3PPQA 1MPCA 3JZJA 3FGSA 2QMWA 3MP1A 4NMYA 1B5JA 3TFLA 5IAIA 2F35A 3LR1A 4NF4B 2VGQA 3EQ1A 5HBCA 3IOVA 1PBQA 2R6GE 4EDPA 3VLUA 1ZLQA 3M3KA 2D21A 1H44A 1FTKA 1A8EA 3UGWA 2VOZA 4RPNA 3B6QA 2E0SA 1UIUA 3MJNA 3QAXA 5EYFA 2Y7PA 2LAOA 1USYE 1B5HA 3SERA 4POWA 1NNFA 1MM6A 4ZEKA 3TTKA 5CRYA 4QFLA 1CB6A 4IGTA 1LB8A 1AOVA 2ANJA 1LSTA 5M2VA 5FTHA 5DTBA 5DEXB 4NF5A 3O2AA 1MXVA 4XKRA 2X7QA 2V3QA 1FQBA 4OERA 4U21A 4GFRA 4RY1A 3LSLA 4X1BA 4Q0CA 3TCGA 1XVYA 5CBSA 3KEIA 3DLNA 3QSLA 1UQWA 2ZNUA 3GZGA 3IJXB 1ZKBA 1ZU0A 2FA7A 4M4GA 4N13A 4O3BA 1A54A 1QUKA 1NL5A 3EN3A 1JETA 4UA8A 4NWCA 4QHQA 3CSBA 3KOTA 3DP6A 5BWJA 1VE4A 2ZYMA 3OXNA 1BIYA 1MQGA 4JDFA 1VFEA 2ZNSA 2DVZA 2V84A 3TKDA 1MXYA 1QVSA 3GBAA 1UTBA 4BDNA 1IZ1A 3IX1A 4EXKA 3IOUA 3OO8A 1SI1A 4TLLB 3MVYA 4ZEBA 4IB2A 1ZTYA 4IO7A 3SEYA 3GBBA 3O6HA 4Q5TA 4PFUA 3UIFA 3U92A 4OMBA 2FNCA 4NF6A 5CM6A 4U1ZA 4GD5A 1HSJA 1JEUA 3W15C 5AA1A 4TLMB 2UXAA 1M5EA 5K2XA 1FTMA 4DXCA 3CG3A 3O29A 2XD2A 4MLVA 3U1OA 3FIRA 3RGYA 1FQAA 3ODBA 1Z7ME 2UYFA 1IXIA 3MZ9A 4DDDA 1B3EA 1FQCA 1LBCA 2IA4A 4L17A 4WKMA 3MBPA 3S2VA 5KCJB 2O68A 1NH7A 1XVXA 4XKPA 3FZVA 4P11A 2A5TA 3HCQA 4KD5A 4G68C 3MWBA 3E3KA 2I4CA 4F31B 1FTOA 3RN8A 2YPNA 2VP1A 4YKPA 1Y4CA 4OVJA 1NMUA 3R7XA 5F7VA 1B7ZA 3FXQA 2H98A 3TEPA 5JTYB 1S7YA 3FXUA 5DEXA 1B32A 4KCCA 1B4HA 2PYYA 4RXLA 1ZBMA 5AA4B 1B7UA 4FEBA 3FJGA 3K1MA 1ATGA 2P0SA 3W9VA 4I62A 2Y84A 4PFTA 1EH3A 2H5YA 3KZGA 4JSDA 3EHUA 4ISUA 4PFYA 3RTFB 2P1SA 1B7HA 4QFPA 3H6VA 1Y20A 4JWYA 3FD3A 3KOSA 3PMWA 4IY5A 1IEJA 3UN6A 3S9NC 4GXSB 1B3GA 4U23A 5KDTA 4XIGQ 2RKMA 3K6VA 5DVFA 2YLNA 3V83A 3Q28A 5I59A 3SESA 3TCHA 2QS4A 1NNKA 5HM4B 1R1NA 1Y3PA 1JNFA 4F3GA 5AE4A 3K0VA 2O84X 5ELVA 5AA2A 4EF2A 1JW5A 5AA3A 3VFJA 1MQJA 1IXHA 3TTRA 2Q88A 3MZBA 2AL5A 1O63A 3TDJA 5ICQA 4R74A 3C33A 3A3CA 5I2NB 1A8FA 4OFLA 1TFAA 3PUWE 3T93B 3C31A 3OO7A 4I1DA 1N3WA 1N7XA 5I57B 3C35A 4ND9A 4UACA 1M5DA 3MUQA 2DXRA 4OFJA 5CI5A 3T66A 1SW5A 4F22A 1XOCA 4MLQA 1EZ9A 1YAEA 2ZYOA 4NF5B 3T9UA 4PQJA 1MY1A 5CMBA 3PD9A 1Y3NA 4LZ7A 2F5XA 3WAEA 4Z0IA 5ICTA 3PPOA 3MQ9A 4GXAA 3ZKLA 3DP8A 3G3JA 2PVUA 1FCKA 3RY3A 2AYSA 1M5CA 4YMAA 4NE4A 1BKAA 4ONYA 3PV0E 1QKAA 2O7UA 3VVFA 1ELJA 4NF8A 2G29A 3ONMA 1MY3A 3TCFA 3RT6B 2UVJA 4ECFA 4RJZA 3JV9A 3C9HA 3UORA 1AH5A 1XS5A 1LFHA 4DCYA 4F2QA 1Q1KA 2XXIA 4FATA 4F18A 3K1NA 3V8XB 2QS1A 3EF7A 4G77A 4G4PA 4EQ9A 4ZZAA 3VLWA 1S9TA 4RPOA 1POY1 1LAHE 3PD8A 3H4ZA 2PBWA 1PB8A 3FJ7A 2UVHA 3HHFA 3IORA 4I9DA 2DOJA 3OD7A 1PC3A 3H6WA 1SW1A 4QFOA 3HV1A 4DLDA 1A7LA 3FVKA 4EQ7A 3FVGA 4R6HA 2ONRA 1DPEA 3MW0A 3SEUA 1IIWA 1R9LA 4JB7A 1POTA 4DCXA 5CMMA 1QJMA 3S9LC 3G3FA 3CRBA 3MAMA 2OLBA 2Q2CA 1OIBA 2XXUA 4JSOA 2HEUA 1B2HA 4N6PA 1LGBC 2DWIA 1FW0A 1B3FA 2I49A 4YAHX 3TAJA 4ZEFA 3HO7A 1B58A 1Y9UA 5FHNA 1P1UA 1URSA 3LBSA 1R9QA 2A5TB 5I2NA 1GGGA 2Y7WA 3K01A 4E0WA 5TPAB 1JVXA 1FTJA 4RK9A 4OXVA 4ELOA 4FAJA 2O6AA 2Y7IA 1MQHA 1US5A 2NUVA 4LZ8A 1GVCA 3AXFA 4ZECA 1WDNA 5I57A 4H67A 1PDAA 3FVNA 2M8CA 4R72A 3T9XB 3EHSA 3VXCA 1B5IA 3ILUB 3E13X 2B3FA 4QFNA 1H45A 3EPEA 1KWHA 3H6UA 2F8DA 4FORA 4QSDA 5K2YA 4EUOA 1I6BA 1EU8A 1PB9A 1B9JA 2F6PA 4BDMA 3M3LA 3QYTA 2Q2AA 1LB9A 4KQPA 3M8UA 5H8QA 2RC8A 1BTJA 1D3KA 2AIXA 4AQ4A 3O9PA 3SETA 1ANFA 3RQTA 2VD3A 1EZOA 1ZJLA 1TWYA 3FV2A 4R9FA 3C34A 2THIA 5KDTB 2ZMBA 2I58A 3KN7A 1MXZA 1D9VA 5I59B 3D4CA 3HHGA 3CG1A 3TQWA 3OEKA 3HPIA 2W7YA 3MPKA 3O6GA 3MVXA 4H5FA 5IKBA 3FVOA 4KYDA 3U94A 2HAUA 4JXIA 3D4GA 5AA2B 1ZIUA 3PMXA 1JEVA 2Y7RA 1GV8A 1NH8A 1B1XA 2H9BA 2GHBA 2QMXA 3SEWA 4YB7A 1B40A 5CBRA 4KI0E 5JEIA 4DIGA 3N94A 3VVDA 4LP2B 4OETA 3V5AA 4YB6A 4GWOA 5ITPA 3RUMA 3OENA 3C4MA 4OEVA 3HSTA 4IO5A 1PBPA 3MVWA 2QS2A 4NEDA 4GQOA 1Z7NE 2QL3A 3B7DA 3K2DA 1LLSA 4H8JA 4H0WA 2F36A 1VSOA 4TQUQ 1H3DA 4DE8A 5F1QA 1QW0A 1IITA 3JYRA 4QSEA 4LUBA 4R9GA 2XXYA 2REGA 1WODA 2ZYKA 3M3FA 1B3HA 2RC7A 4P0GA 4ELQA 3LSFB 1SW4A 3SEVA 4YZZA 2HCAA 3IR1A 2I0CA 3OSRA 4U2RA 2DSFA 1VR5A 1B0LA 5TPAA 1DOTA 3FUZA 4NF8B 2V3TA 2H25A 4NWDA 3QUFA 3PU5A 2DP8A 1DTGA 1B4ZA 1GR2A 3K00A 4JWXA 2OWSA 3S4UA 4IO6A 3OSQA 1B51A 3VXBA 1RYXA 3CSGA 1UTHB 3G3KA 4G2ZA 3TODA 4YB5A 1OVTA 4BDLA 3MVZA 3FATA 2XX7A 2DWAA 3TTMA 3BBRA 3ZS6A 4FECA 4X9TA 2XX9A 3CFLA 4F39A 3N6TA 4F29A 1MXWA 1SYIA 5I58B 4DXUA 3ECRA 1Y1MA 4H6DA 2V25A 3PUYE 1MM7A 4GL8A 1MH3A 1N3XA 1QKBA 3TPAA 2Q9TA 2HXWA 3VE1B 4IY6A 4H5GA 3KSXA 2E1SA 4X1DA 4FEDA 2X26A 2Y7KA 5DVJA 4OFOA 1MRPA 3TZAA 4R2BA 4KPTA 3CFZA 2H4IA 4KYEA 4ELPA 2UYEA 2XXQA 4MF3A 5H8HA 3H6TA 4PE5B 1LFIA 4DZ1A 3A09A 3IL1B 2PX1A 4BDQA 1BLFA 2XXTA 3LC8A 1US4A 5DT6A 2Z22A 1P1WA 4OQOA 4OHNA 3I5OA 3MC2A 4R2FA 1OQGA 1NFTA 2ZNTA 1SI0A 4O3AA 3UP9A 3IOTA 4OESA 3VLVA 1YPNA 1FQFA 4R6KA 1DSNA 4X48A 4NTLA 2F97A 5DYHA 3PPPA 4AB6A 2XHDA 2HFBA 4PETA 1VFDA 1HSLA 1A55A 1B3LA 4RNSA 3CI8A 4RA1A 2HZKA 2XXPA 2Z23A 4G8NA 3G3IA 1SD3A 5CMCA 3Q27A 5I2KA 2DWHA 4F3SA 5L9SA 1OMPA 4BDOA 4RYAA 5H8QB 2NXOA 3SEXA 1NKXA 4OENA 3PUVE 4HCWA 3I3VA 5TP9A 1JW1A 4Z7EA 3KSJA 3DP4A 1QULA 5L9MA 3OOAA 3LSWA 1HSEA 3IB2A 1XT8A 1YTVA 3C32A 3PPNA 4R73A 4YKIA 4ELRA 4I8CA 4OZ9A 3U8QA 3G7WA 3QXMA 1O64A 1MS7A 3IO6A 1B6HA 1UTHA 2DE2A 4LATA 2I48A 3CVGA 2GFEA 1MXUA 1PB7A 3PGFA 4ZEDA 3R6UA 3TTNA 1N04A 3TUSA 1DPPA 3KJTA 2OBGA 3H3GA 4IO3A 2DS9A 1M5FA 3H7MA 4EQBA 4MFIA 5I56A 2DVCA 1MPBA 5CMKA 2RF1A 5I58A 1FTLA 3V89B 3QK6A 2V93A 4K3FA 3B6TA 5EHSA 4DXBA 4ZZEA 3USDA 1URGA 4Q30B 3RTWB 4ZS9A 4GOTA 4JBZA 4N07A 3TTLA 3ZSFA 2HAVA 1P1NA 2IEEA 2OZZA 2NVUB 2O1MA 4YICA 1OQHA 5JK4A 1R6ZA 1I6QA 2QJEA 5TU0A 2O69A 4WEPA 2RC9A 4POXA 1MH4A 2OCUA 2ZYNA 5AA2D 2VHAA 4HW8A 2ONSA 3T9HB 4C1UA 2ESNA 2QSXA 2OK2A 2F7CA 4H65A 4LQ5A 2YJPA 4XTCQ 3ZKKA 4C1TA 4GVOA 4F3PA 4MH5A 4YKJA 4H1XA 1AIVA 4F2OA 1IUDA 3E4RA 3GLBA 2DXYA 2ABHA 1I69A 2CZLA 1MY2A 4ZDMA 3S9EA 2RCAA 1MQIA 2ALUA 3QUJA 3IB0A 1OVBA 4RK2A 3IO4A 4IGRA 3K1PA 3T9VA 1OLCA 4U4SA 3T22A 3K02A 3UK4A 2NOOA 2I3VA 5EHMA 5J1DA 5KZTA 4WEDA 4E0XA 2Z8FA 2Z8DA 3RLFE 1PEBA 3DM0A 3IK6B 4F19A 2CMOA 4XKNA 1XC1A 2REJA 1IXCA 3HN0A 4C0RA 3L6GA 1IQ7A 2XXVA 1SQYA 5DVIA 3U72A 2DWJA 4JWOA 2Q89A 5A5XA 5CC2A 3T96B 5H8FA 1SBPA 1OLAA 2D3IA 1BP5A 1FQEA 2XXWA 2D5WA 4HTGA 5H8HB 4QFKA 5I84A 3KG2A 4QF9A 1FQDA 1S50A 1O7TA 2GRVA 3MP6A 4THIA 4KCDA 3L6HA 4F3BA 4OYVA 3S9MC 2KLFA 5FTIA 3O6IA 2H99A 1Y3QA 1N76A 4G68A 4FE8A 3N5LA 3FV1A 2Q8JA 3KN3A 4KFQA 1SW2A 2I3WA 4F1YA 4PP0A 4IO2A 4EF1A 3B6WA 4XXUA 3KBRA 5HPQA 4ZE8A 1B52A 1J1NA 4TOZA 5ISUA 2F6GA 2QS3A 3SKPA 3FASA 1N0TA 1N84A 2X7PA 3OO9A 2I0BA 2XX8A 1B0HA 2FYIA 1LAXA 5I2KB 5L8DA 4R75A 2HZLA 3IAZA 4YU0A 3Q26A 2F78A 4F1UA 1MY0A 3VDFA 1B1HA 4LA9A 4ZE9A 3SDFA 3ILTB 3VV5A 2F34A 4OTEA 2GHAA 2OWTA 4NF4A 5TP9B 5H8NB 1LBBA 1XHYA 3TYHA 2QPQA 2NWJA 3CIJA 3UA8A 1MQDA 1MG1A 4LONB 3CR9A 1A40A 4P0IA 2XXRA 3G3GA 4H8IA 1AL3A 1TFDA 3KFMA 2XXHA 4ESWA 1QUIA 4YMBA 3WAFA 4YKKA 3LUYA 3MP8A 4ESXA 1NNPA 2ONKE 3G3HA 4O3CA 2XXXA 1L5TA 3MPLA 1DTZA 5B70A 4LVQA 3K6WA 5B7DA 3N26A 3OELA 2GH9A 1USYH 4KYSA 1NNTA 5I56B 1D4NA 2I4BA 4FJPA 5FHOA 4HCYA 3A3UA 3H03A 5H8SA 1TXFA 3IOWA 1Q35A 3PMVA 1P1QA 3RT8A 3N6UA 5L9OA 4MBPA 5LOMA 1LFGA 3Q29A 2DE4A 5ITOA 2BJJX 1LCTA 1T0KA 3LSXA 1Y4TA 1RKMA 4M1VA 1GTKA 4GRKA 1LCFA 4U4XA 1WVJA 1II5A 3OMBA 2DE3A 1P1OA 2AL4A 4U22A 4LQ2A 3OEMA 3BFUA 3W9WA 3THIA 2R9JA 4KR5A 3K6UA 1DMBA 1IXGA 1UIVA 1JVYA 1MDP1 4U1OA 3E9XA 4WXJA 1B46A 2O1LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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