1N84A

Human serum transferrin, n-lobe
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title THE POSITION OF ARGININE 124 CONTROLS THE RATE OF IRON RELEASE FROM THE N-LOBE OF HUMAN SERUM TRANSFERRIN. A STRUCTURAL STUDY
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n84A02
5FTHA 3EQ1A 3R7XA 1B52A 1IITA 5CMCA 2Y7RA 3FJ7A 4LATA 2RC9A 3TQWA 1L5TA 4PP0A 3U72A 1S9TA 3IJXB 3O6HA 1LAHE 4AB6A 3R6UA 4PFTA 2XHDA 1D3KA 3W15C 4IO7A 3DP4A 3FXUA 4FJPA 2Z8DA 3TTRA 1FTLA 4ONYA 4DCYA 4H0WA 3O28A 3QIMA 3IO4A 3UIFA 3UORA 4NF8B 2Z8FA 5JEIA 2YLNA 4NTLA 4Z7EA 5H8NB 4YU0A 1SW1A 4AB5A 3KSJA 3N6UA 2DWAA 1MXVA 2XXYA 3OO9A 1N84A 5CI5A 1HSEA 3T9XB 4R75A 4G68B 3O66A 4FEBA 3H3GA 3BFTA 4NF4A 3TAJA 4BDLA 3RT6B 1XVXA 3MVXA 1MG1A 4JSOA 5B70A 1VR5A 2FA7A 4F1VA 5DEXA 4DLDA 2I4BA 4R9FA 3RPWA 1B40A 5I58B 3CSGA 3G3JA 5AA2A 1T0KA 4H5FA 3I5OA 2I49A 5CMBA 3K02A 4GVOA 1USYH 3O97A 2ZNTA 1URGA 1Y3QA 4NF6B 4EXKA 3CFLA 1ZLQA 3KSXA 1Y3PA 5DTBA 3H06B 3OSRA 3QUFA 3LSFB 2QS1A 1I6QA 3O9PA 1B5IA 3OO6A 2I6EA 2XXIA 1M5DA 3OXNA 4XXUA 1Y20A 1JVYA 4Q8RA 4F18A 4ZEKA 1ANFA 5ITPA 1Y4CA 1B3FA 2O51A 4U1OA 3HHFA 4POWA 2VP1A 1FCKA 4FE8A 3MAMA 4OVJA 1H45A 2OWSA 3SEUA 2Y84A 5AA4B 4QSEA 3OELA 4GL0A 4GXAA 2ZMBA 3LSXA 3VVDA 4KYSA 2A5SA 1B3EA 1LGBC 4F2QA 2F6GA 1ZU0A 4GIZA 2ZYNA 3S9NC 2RF1A 4F3GA 3FZVA 4R73A 1QKBA 3OOAA 2UXAA 4ESXA 4KQPA 3MVWA 1ZBMA 1P1QA 1A40A 2P0SA 3VFJA 5CRYA 3OEMA 3TMGA 4R2BA 1J1NA 4TOZA 5EHSA 3EHUA 4I8CA 3A3CA 1MY3A 1ZMGA 4RPOA 3U8QA 4YKJA 3OEKA 5A5XA 1B32A 3SEWA 5AA2B 2IA4A 3R26A 3TZAA 2GH9A 4G77A 4TLLB 3PPOA 3FVGA 4GQOA 4OHNA 3W9VA 4P0IA 3JV9A 3O6IA 1N0TA 1BLFA 2DXYA 3C36A 1P1UA 1O7TA 2I4CA 1MH4A 4F3SA 2XD2A 5CBRA 3QK6A 1PBPA 4EF2A 1A8EA 3EN3A 3IB2A 1MM6A 2FNCA 2ANJA 1QW0A 2B3FA 2QL3A 1BTJA 4O3AA 1NMUA 1FQEA 4ZEDA 1JETA 4WKMA 2F35A 1TT1A 5L9SA 5ICTA 1BIYA 5L9OA 2E1SA 2QPQA 1PDAA 4EXLA 1P99A 3SETA 2HQ0A 1IQ7A 1YTVA 2ZXTA 3QAXA 4DXUA 3PV0E 4LA9A 4OXVA 4NF5A 3TCHA 3TEPA 2XXVA 4YICA 5ICQA 3I6VA 2ONSA 1SI0A 3WAFA 2ABHA 4HS7A 1PB9A 1B3HA 3N94A 4JWYA 2KLFA 5CMKA 1FQAA 1FTOA 3B6QA 3G3HA 2B3BA 3PUWE 2GHBA 1A7LA 3BFUA 3OMBA 1KWHA 4GWOA 1QVSA 1OVBA 3IR1A 2NWJA 1DTGA 2NXOA 1PB8A 3GZGA 4IO3A 2DS9A 1B5HA 4NE4A 1H44A 5CC2A 4IO5A 1RYOA 3RTWB 1ZIUA 1MQIA 3IO6A 5TPAB 2H4IA 2DE2A 1B51A 1P1WA 2REGA 3C33A 1JQFA 4MBPA 1NL5A 3RUMA 5HM4B 3E3KA 4EQBA 2F7BA 2H25A 1XHYA 3FATA 2I3WA 3TELA 3MWBA 3OENA 1B4HA 1UTBA 3M8UA 3S9MC 1O64A 2D5WA 1B05A 1B7ZA 2DWHA 2QRYA 3K01A 3CRBA 3M3LA 1IXIA 1AH5A 4F31B 4QFOA 3H7MA 5JK4A 1ZKBA 3LSWA 1Y3NA 2A5TB 1R9LA 5ISUA 4YAHX 1IXCA 3TODA 3MP1A 4H5GA 4ELOA 1I69A 2NOOA 2QS2A 1ZJLA 2RC8A 4TLMB 1NKXA 1SD3A 1XVYA 3U93A 4QRZA 2QMXA 4G8NA 3LBSA 2F36A 1ATGA 3ILTB 2DE4A 4AQ4A 3VLWA 3CFXA 3FV2A 1OIBA 1TXFA 1LAGE 3MJNA 5FHNA 3WAEA 3LUYA 1F9BA 4HW8A 1GVCA 3B6TA 3C4MA 1FQBA 4IY5A 2OZZA 2HXWA 2PT1A 1Q1KA 4XKQA 1HSLA 3DELB 4C1UA 4U21A 2I0CA 1UQWA 5IAIA 1Z7NE 4U23A 3FUZA 5B7DA 3A09A 3TTKA 2XD3A 4R6HA 4RK2A 1TWYA 1MXZA 5BWJA 3PD9A 2O7IA 3RN8A 2AL5A 2HAVA 3PUXE 3RTFB 4RNSA 2OCUA 3SEVA 3FGSA 2WKYA 2DQVA 3IORA 1UIVA 1Y1MA 1JW5A 3DP8A 3CSBA 3EF7A 1DSNA 1AOVA 2HCAA 2PX1A 2UYFA 4YB6A 2I58A 5I57A 3Q27A 3U1OA 4IO4A 4LZ5A 2E0SA 3CI8A 2FYIA 4XKNA 1UTBB 5HPQA 2O6AA 5KCJA 4F19A 1SVXB 4JWXA 3A3UA 5KDTA 1N04A 3KOSA 4QSDA 4U2RA 3ZSFA 1NNKA 4KPTA 1B3GA 1LAXA 1SW5A 2OLBA 4E0XA 2PYYA 4OETA 3T93B 1I6BA 5ELVA 4JXIA 5JTYB 4H65A 3PPNA 1B1XA 3FXRA 5TU0A 3PUYE 1MDP1 3RQTA 4FEDA 3I3VA 3TTLA 2F5XA 4ELPA 1MDQA 4ELRA 1IXGA 2P2AA 2O84X 5I84A 1IZ1A 4F39A 3T9HB 1EZPA 5AA2D 4E0WA 4GRKA 4OTEA 3N5LA 2F8DA 4PQJA 4G2ZA 2HEUA 1LLSA 3Q28A 3SEXA 2W7YA 4EF1A 1B7HA 2XXXA 3O2AA 5IKBA 4NEDA 4RK9A 3FJGA 1P1OA 2DVCA 1UTHA 2UVGA 1B0LA 3VLVA 4G4PA 2GHAA 4U22A 4YKIA 4OERA 5DVIA 4ZEIA 5H8QA 3ZKKA 3JZJA 4DCXA 1MPCA 4IO2A 3KOTA 3DLNA 3CR9A 3DP6A 3MZ1A 4QFNA 2X26A 4K3FA 2CMOA 1FQDA 1VFDA 5I59A 2RINA 4BDOA 4I9DA 4FAJA 2XX8A 5I57B 4OQOA 1PEBA 4OFOA 2Y7PA 5TP9A 3IOUA 3FJMA 2V3TA 3G3GA 5EYFA 2I3VA 3MW0A 3Q25A 5KCJB 3VVFA 2DOJA 4GD5A 2THIA 4WEDA 4JDFA 4GFRA 3MP6A 3F11A 3K6XA 4JWOA 2RCAA 4IGTA 5H8HA 2VD2A 3RNNA 1YCJA 3M3KA 3T66A 4FORA 2ONKE 1NH7A 4KHZE 3CFZA 1MPBA 1JW1A 1Z7ME 3UN6A 2AIXA 3G7WA 4NF4B 4YZZA 1EU8A 1ZTYA 3UA8A 4H6DA 3SESA 2ZYKA 4MLVA 2XXQA 2DVZA 1A99A 5BUUA 2UYEA 1FTJA 1B0HA 5I56A 3C9HA 5DEXB 4I62A 4O3BA 1B7UA 4KYDA 3ILUB 3IOTA 4EQ7A 5H8FA 3KFMA 4GF8A 5I2KA 1SYIA 1QUKA 1SW2A 4UACA 3N6TA 2ZNUA 3Q29A 3T22A 3IAZA 4RPNA 1MXXA 3L6GA 2ONRA 1LAFE 3HSTA 1BP5A 2F34A 4ELQA 1S50A 5H8QB 1CE2A 1HSJA 2XX9A 4ZZAA 3OO7A 2B65A 3TQLA 1JVXA 3TKDA 4QFLA 4H8IA 2DYXA 1ELJA 4DZ1A 1US5A 4U1ZA 5I59B 1S7YA 1RYXA 3BKIB 3KN3A 1MQGA 4OEUA 3TTNA 4M1VA 2ESNA 2PMSA 3VV5A 3VDFA 4KI0E 3K6WA 4ZE9A 4OMBA 2AYSA 3ECRA 2NUVA 1B5JA 4KYEA 1MY1A 3FXQA 1JNFA 4ZEFA 3RLFE 2DSFA 3MPKA 4OFJA 4PFYA 4OFLA 4P0GA 2AL4A 5FTIA 4THIA 1DOTA 4DXBA 2V3UA 2F7AA 3KG2A 4WXJA 1JEUA 3PMXA 4MFIA 4NMYA 2REJA 3TPAA 1LBBA 3IJOB 5LOMA 1LB9A 1FQFA 3E13X 1H43A 3H6WA 1CB6A 5DVJA 5A5XB 4I1DA 1VFEA 3S9EA 3AXFA 3O29A 3SEYA 4H1XA 1WDNA 1OQGA 2R71A 2O7UA 4DE8A 2Q8JA 4KD5A 4Q0CA 3H6TA 2QSXA 4DDDA 1XS5A 2QS4A 1QUIA 3MVZA 1A8FA 1NH8A 1Y1ZA 3M3FA 1GGGA 1A54A 1WVJA 4YB7A 3DM0A 3IOVA 4H8JA 1YPNA 4F1UA 2I48A 2VHAA 2Y7IA 4NF8A 4LUBA 5F7VA 1AMFA 2X7PA 5L9MA 3H03A 1B6HA 4XKRA 4ISUA 1SQYA 3FVOA 4RJZA 2XX7A 3C35A 4BDMA 3SERA 1IEJA 1SDXA 3PPPA 4TQUQ 4NF5B 3LC8A 1JW4A 2Z8EA 2Q9TA 3CG3A 4KFQA 3H6UA 4G68A 3N26A 3G3FA 2XXTA 2V25A 4JB7A 3GBBA 4G8HA 2PT2A 2HZLA 4QFKA 1MY2A 2RKMA 4EQ9A 4HCYA 1B1HA 4GL8A 1SI1A 3THIA 3G3KA 2DE3A 2HAUA 5L8DA 1Y9UA 4LP2B 1R6ZA 3KEIA 3CIJA 1LSTA 3UGWA 3K0VA 4NF6A 1OQHA 1WODA 1PBQA 4ZECA 1MM7A 2I0BA 1TFAA 3GBAA 3OO8A 3PD8A 5AA1A 4R2FA 3OSQA 3HPIA 2IEEA 3PGFA 3PUVE 4IY6A 1LFIA 1N3XA 4ZEBA 3MC2A 3GLBA 3FVNA 4FIMA 1II5A 4F1YA 3MQ9A 4X1DA 1MH3A 4L17A 4R6YA 1PC3A 1N7WA 1XOCA 1OMPA 2GFEA 4ZDMA 3T96B 5DVFA 1IXHA 1NNFA 5CBSA 3SDFA 2RC7A 2H5YA 1BKAA 2XXHA 5AA4A 4OEVA 2NVUB 3C32A 3E9XA 1D9VA 2XXRA 3SKPA 5DT6A 2Q88A 1M5CA 3S2VA 3V83A 2HZKA 4G68C 1POY1 5DYHA 2QJEA 4LVQA 4OESA 4KCDA 5J1DA 4LQ2A 2O1LA 3K1NA 3MVYA 3HO7A 3PPQA 1QKAA 4ECFA 2H9BA 1I6AA 4R6KA 1SBPA 1M5BA 4N13A 3TUSA 2F6PA 3TFLA 3TDJA 2Q2AA 2VD3A 3FASA 3KGCA 2DWIA 5FHOA 4DXCA 2D3IA 4PFUA 4BLAA 2V3QA 3QXMA 1QUJA 3HCQA 1DMBA 4R9GA 1MY4A 2LAOA 2DWJA 5F1QA 4Z0IA 1MY0A 3U94A 1N76A 3UK4A 4R72A 3CG1A 4YB5A 2O1MA 4MF3A 2ZYOA 2BJJX 3RGYA 3KN7A 2D21A 4YKKA 3V89B 2UVIA 3H4ZA 5HBCA 4QF9A 1JEVA 1SYHA 2VGQA 2Y7WA 1URDA 4YMBA 4MH5A 4KCCA 4X48A 4GXSB 2XXUA 3QYTA 3KN8A 4IB2A 1EZ9A 1M5FA 1MS7A 2XXWA 5I2NA 4R74A 4P11A 4RYAA 4HTGA 3S4UA 1B46A 1FW0A 4ZZEA 5KDTB 3L6HA 2DXRA 3IB0A 3HN0A 1OLAA 2OK2A 3P7IA 4F3BA 1OLCA 3MBPA 1B4ZA 2XXPA 5M2VA 4C1TA 3UP9A 2QS3A 5K2YA 3H6VA 2H98A 3LSLA 4JSDA 3T9VA 3T9UA 4NWCA 1MXWA 3EHSA 3IB1A 3CVGA 4X1BA 3TCGA 1LFGA 3B6WA 3MP8A 1FTKA 1LFHA 1LCFA 3FD3A 3IK6B 1QULA 3RY3A 3TYHA 3KJ7A 4BDQA 2Q2CA 1XT8A 3ZKLA 1GR2A 4LONB 4N07A 3IX1A 1O63A 4YKPA 2CZLA 3OD7A 5K2XA 5AA3A 2H99A 2X7QA 4N6PA 2YPNA 1B3LA 4EUOA 4IO6A 1MQJA 3C31A 2OBGA 3U92A 1NNPA 1D9YA 3ZS6A 4O3CA 3FIRA 1B9JA 1B58A 5AE4A 1UTHB 4Q30B 3JYRA 4RXLA 3HHGA 5TPAA 3TCFA 3PUZE 3MPLA 3PMVA 1MQDA 4ESWA 3VE1B 3EPEA 1LB8A 4GLIA 3TTMA 1VE4A 1MXYA 2F78A 1OVTA 3MZBA 4YMAA 4QHQA 4FATA 1GTKA 3S9LC 2F7CA 2P1SA 3K2DA 3K1PA 1H3DA 4UA8A 1FTMA 3USDA 5TP9B 2G29A 4G8MA 2Q89A 4BDRA 4NWDA 5I2NB 2PVUA 2A5TA 5ITOA 2HFBA 1DTZA 1IUDA 3GXAA 3KBRA 3PMWA 4KR5A 3K6UA 4LZ7A 3PU5A 4BDNA 4WEPA 4F22A 2OJTA 3ONMA 4F3PA 4ND9A 1B2HA 3BBRA 3K6VA 3VXCA 1EZOA 5H8HB 3KZGA 4XIGQ 1UIUA 4F29A 1R9QA 3K00A 3IL1B 2UVHA 3W9WA 2F97A 1US4A 1USYE 2V93A 2DP8A 3FVKA 4U4SA 3FV1A 4RA1A 1Y4TA 2RCBA 2ZNSA 2OWTA 2R6GE 3IOWA 5EHMA 1P1NA 5I56B 3EHTA 2R9JA 2ALUA 4LQ5A 1DPEA 3C34A 1DPPA 3G3IA 5H8FB 2PBWA 5I2KB 3QSLA 3V8XB 3QUJA 4XKPA 1PB7A 2UVJA 4QSCA 3O6GA 3RT8A 4X9TA 3VLUA 1QJMA 2Z23A 4OWDA 1SW4A 3D4CA 1GV8A 3LR1A 3VXBA 2M8CA 3VVEA 4XTCQ 1TFDA 5KZTA 3K4UA 3E4RA 1VSOA 4IGRA 4RY1A 2ZYMA 3PPRA 4OYVA 4EDPA 1EH3A 4GOTA 2O68A 3B7DA 4POXA 3HV1A 1FQCA 5CMMA 4C0RA 3ODBA 1Q35A 1URSA 1NFTA 5H8NA 4DIGA 2Y7KA 1N7XA 4FECA 5FHMA 4PETA 2V84A 1MRPA 1AL3A 1D4NA 4Q5TA 4M4GA 4PFWA 5JTYA 1M5EA 1IIWA 4HCWA 4MLQA 2YJPA 4OENA 4JBZA 4ZS9A 1R1NA 4F2OA 1RKMA 4H67A 4U4XA 3D4GA 4OZ9A 1MPDA 2VOZA 1YAEA 1H76A 5CM6A 2GRVA 3Q26A 2Z22A 5I58A 4ZE8A 1MXUA 1NNTA 3MUQA 5H8SA 2QMWA 1MQHA 1AIVA 1LCTA 2O69A 4PE5B 1N3WA 1LBCA 1POTA 3KJTA 3MZ9A 3V5AA 4LZ8A 4QFPA 1A55A 3K1MA 1XC1A 2G93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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