1NL5A

Engineered high-affinity maltose-binding protein
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYGDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATAENAAKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS1 (7-10)TVIII1 (57-60)S2 (35-38)AH1 (17-30)TI1 (12-15)S6 (105-111)O1 (15-17)AH2 (43-52)AH3 (66-73)TI9 (267-270)TI2 (63-66)AH13 (315-326)AH14 (335-352)S5 (102-103)3H1 (85-87)S15 (301-302)AH4 (91-97)S4 (98-99)S16 (328-329)AH10 (272-284)TIV12 (299-302)S7 (114-118)O2 (240-242)TI3 (118-121)TI4 (119-122)AH8 (210-219)S11 (242-245)TIV5 (128-131)TIV11 (249-252)AH5 (131-139)AH7 (186-201)3H2 (140-142)TIV6 (150-153)3H3 (154-156)AH6 (157-162)S9 (181-182)TI5 (162-165)S8 (167-169)3H4 (170-174)AH15 (357-369)TI6 (177-180)TI7 (182-185)TVIII5 (353-356)TIV10 (202-205)TI8 (205-208)3H5 (229-231)TVIII4 (220-223)S10 (224-227)AH9 (232-238)AH11 (287-296)TIV13 (310-313)S12 (249-250)S13 (253-254)AH12 (305-310)TIV14 (311-314)TIV1 (3-6)TIV2 (40-43)S14 (258-266)S3 (59-63)TIV3 (82-85)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Insights into the Conformational Equilibria of Maltose-binding Protein by Analysis of High Affinity Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 119
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nl5A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nl5A01
4X9TA 1GGGA 1A7LA 4K3FA 5M2VA 2RC9A 1M5CA 1VR5A 1JETA 3PPPA 4U1ZA 3O9PA 3DM0A 3N6TA 2RCAA 2FNCA 3N26A 4BDLA 4QFKA 4JB7A 2DWIA 1LSTA 3EQ1A 1ZIUA 3TMGA 4XKRA 3VVEA 4POXA 3RTWB 4F29A 4FE8A 1SDXA 3DP4A 5B7DA 3TPAA 1TWYA 3TDJA 3K1NA 3VVFA 4GLIA 3SEWA 3FUZA 1P1WA 2Y7WA 1XC1A 1XS5A 1TFAA 4G8MA 2REJA 2RF1A 3BFUA 1B1HA 3IL1B 2RCBA 3IOUA 2OK2A 3OSQA 4C1UA 1P99A 3G3IA 1FTLA 1FTMA 3OELA 2Q8JA 1D3KA 4C0RA 1FQDA 2A5TA 1MXVA 3DLNA 4OFOA 1UQWA 4NMYA 3S9EA 2A5TB 1SW5A 3IAZA 3M8UA 2PYYA 2O51A 1B2HA 3K02A 1B4HA 5I2NA 2UVGA 2B3BA 4MF3A 1H45A 3SEXA 3SEVA 2ZNTA 5I2NB 1HSEA 2ONKE 2ZXTA 2OJTA 4QHQA 1VE4A 4F1VA 2DYXA 3T66A 4JWOA 3D4GA 1IQ7A 4F1YA 1IEJA 4PFTA 3LR1A 4N07A 1I69A 4QFNA 3TTRA 1B5JA 4KYEA 1SW1A 1SD3A 1M5BA 3V83A 4U2RA 3RGYA 2F34A 3Q27A 4P0GA 4MH5A 5HM4B 4NF4A 3B6WA 4R2FA 5EYFA 2D3IA 4FEBA 4RJZA 4NF4B 3EHTA 4OMBA 1B7ZA 2Y84A 1QUKA 5H8QA 1YTVA 2DSFA 2M8CA 2XXUA 3MC2A 5FTHA 1JEUA 5H8QB 2CZLA 4OHNA 4E0WA 3VDFA 3TAJA 3MUQA 3FGSA 1NL5A 2WKYA 4Q0CA 4X1BA 1FQBA 4YMBA 3IOWA 3FATA 5H8FA 4O3CA 4ZEIA 5H8FB 5JTYA 4XKQA 4XKPA 2DS9A 4Q8RA 5CI5A 5JTYB 3Q25A 3IO6A 2RINA 5AA3A 4ISUA 2QJEA 4N13A 4NF5A 4LONB 1Y3NA 4G68C 4NF5B 3C31A 1TT1A 1URSA 3U93A 4WKMA 1B3GA 1MQHA 2H4IA 2Q2CA 3F11A 3TODA 2ZYKA 3DP6A 1B5IA 4YICA 4XKNA 4IO2A 4BDMA 4O3BA 4F1UA 4C1TA 4GXAA 4F39A 3VV5A 3IK6B 4QFLA 2V3TA 4F3GA 3MZ9A 1J1NA 4N6PA 5AA2D 3G3JA 3LC8A 4BDQA 2NVUB 1Y3QA 4LA9A 3MQ9A 3TQLA 1B32A 4ELPA 3K2DA 1NKXA 3TTNA 2XXPA 1BLFA 2ZYMA 3VLVA 3CIJA 2RKMA 2HZKA 4YMAA 3MBPA 1NMUA 1LB8A 4RK2A 3O29A 4EF2A 1M5DA 3H6VA 4JXIA 1PB9A 4GWOA 3K1MA 3HN0A 2G93A 1XOCA 3MZ1A 1MXUA 3GXAA 1EU8A 3MVYA 4NF6A 2BJJX 1B3FA 3CRBA 4LUBA 4NF6B 4GL0A 5ITOA 3TKDA 3LUYA 5J1DA 1MS7A 2QS4A 4YU0A 3G3FA 1POY1 1AL3A 2NUVA 1D9VA 3G7WA 2ZNSA 4GF8A 2ZNUA 5DVIA 5CRYA 3VLWA 5FHNA 1UIVA 3IJOB 1P1QA 4BLAA 3C32A 3KSJA 4UA8A 2HXWA 2DE4A 3PD9A 1CB6A 4FORA 3A3CA 2ZYOA 3T22A 3FJ7A 4DE8A 4MLQA 2B3FA 1GTKA 2Y7PA 3L6GA 1Q1KA 4F3SA 4M1VA 4KHZE 3FJMA 4KR5A 4H5FA 1EZOA 5DTBA 3KN7A 4RPNA 4EF1A 3ECRA 1MQDA 3C4MA 1BTJA 1I6BA 1MH4A 3LSWA 2REGA 5L9MA 4EQBA 3WAEA 5DVJA 4TQUQ 1EZPA 3UIFA 2H98A 3Q29A 1POTA 4PETA 4FATA 3VXCA 4UACA 4DCYA 2XX9A 2O7IA 1ZJLA 1B3HA 3EHUA 3JZJA 4OFJA 2XXVA 1LAXA 2OBGA 3RUMA 5ICQA 2V25A 1OQHA 1B7UA 1H3DA 4LATA 1DPPA 1B46A 4G8NA 4XXUA 2PBWA 4PFUA 1FTKA 4POWA 5ELVA 2XXRA 3E4RA 5BWJA 3C34A 4ONYA 1OMPA 3K0VA 2P0SA 4DXCA 3O97A 5CBRA 2QS3A 1TXFA 3TCHA 5ICTA 3TFLA 3MP8A 1B1XA 4NF8A 2F7BA 1LCTA 3E9XA 4H6DA 4NF8B 1ZKBA 3FXQA 3SDFA 4HTGA 2OWTA 1IIWA 2Y7IA 2UVHA 3IOTA 1OVBA 3KOSA 4BDOA 3FASA 4P11A 5EHSA 4IY6A 5L9OA 4OERA 3H4ZA 1R9QA 4ZEDA 4LP2B 3A09A 4AB5A 3KJTA 1UIUA 3CFXA 4H5GA 3C35A 4KFQA 4PFYA 3N5LA 4GXSB 3H7MA 1US5A 1ATGA 4QRZA 4OVJA 4OEUA 3FV2A 2GFEA 5JEIA 1MXWA 3PUXE 2I48A 3K1PA 4AQ4A 1XHYA 2DWAA 4EDPA 4IO5A 2O68A 1PB8A 1MY0A 1PDAA 2F6GA 2V3QA 3P7IA 3CSBA 4MBPA 3O2AA 3QXMA 1LFGA 4OFLA 5I2KA 1SI1A 3G3HA 4KCCA 1NNFA 3PUZE 1LAGE 5I2KB 3CVGA 2V3UA 1LAHE 3IO4A 4QSDA 1RYXA 3TTLA 3ILUB 4R74A 3VVDA 1II5A 2UYFA 3GLBA 3OEKA 3T96B 4YKJA 4KYDA 4U1OA 5H8NA 3TTMA 3WAFA 5AE4A 4F31B 5H8NB 3L6HA 3D4CA 2IA4A 2G29A 2DXYA 5DEXA 1KWHA 2Q9TA 4G77A 4ESXA 5DEXB 2GHBA 5KCJA 4X1DA 4QFPA 1GVCA 3MPLA 1MQIA 1MXZA 5KCJB 1WDNA 3H6WA 3HCQA 2HAUA 4YB5A 3BKIB 1PC3A 1WODA 2VHAA 3OO9A 5I56A 3PMXA 2Z8EA 4GD5A 2QPQA 4LZ7A 5I56B 1Y4TA 2R71A 2F36A 2O69A 1DMBA 5ISUA 1R9LA 2D21A 4OQOA 4GFRA 3ODBA 1OQGA 2H25A 3RQTA 5DVFA 3JV9A 1LFHA 2XX8A 1YAEA 2V84A 2YPNA 1ZMGA 2QL3A 2I4BA 4F2OA 1SI0A 4IY5A 4GL8A 4OWDA 1FQAA 3LSFB 4DCXA 2PT2A 2DWJA 2PX1A 2Q2AA 4ECFA 2XD3A 2Q88A 1A99A 3IB0A 3QUFA 1I6QA 1LFIA 1B0HA 1MY3A 4OZ9A 4JWYA 4H8IA 4LZ5A 3EPEA 4U4SA 3M3LA 3QAXA 4R73A 2P2AA 3S4UA 4DXUA 3I6VA 4ND9A 3R6UA 2XXTA 3PPRA 1ZTYA 1B05A 3RPWA 4KI0E 1HSJA 3PD8A 1SW4A 4Q5TA 2VD3A 1FTOA 1JQFA 3SERA 1GV8A 4U23A 5FTIA 3VXBA 1MDP1 4M4GA 1SVXB 3MP6A 2B65A 1MQJA 4EXLA 5KZTA 1MPCA 3O6GA 1LB9A 3EHSA 2DP8A 1B58A 2I6EA 4E0XA 3OMBA 1B6HA 3N6UA 4JWXA 1N84A 3KGCA 2F8DA 1VSOA 3A3UA 4R6KA 4G2ZA 2P1SA 3B6TA 5AA1A 3O28A 4MFIA 5ITPA 4ZS9A 3PGFA 1AOVA 3TYHA 1QW0A 3W9WA 4F2QA 2ZMBA 1TFDA 4IGTA 4PQJA 1DSNA 4YB7A 3K6VA 1FQEA 2AL4A 3MJNA 3OOAA 3H6TA 3RY3A 1N76A 2Z8FA 1N3XA 1S7YA 3IOVA 4DIGA 1UTBA 5L9SA 1GR2A 1SYIA 2LAOA 2GRVA 1UTBB 4HS7A 1B0LA 5I59A 5LOMA 1QJMA 4OYVA 1Y1ZA 5TU0A 2H99A 4F19A 5I59B 4O3AA 2DWHA 2O1MA 3TTKA 3BBRA 3PUWE 2QS2A 3I5OA 1USYE 5TPAA 2W7YA 4Z7EA 2F35A 1BIYA 1A8FA 5FHMA 3HSTA 3PMVA 3GBBA 5TPAB 4HW8A 3T9XB 1QULA 1A40A 1ZLQA 4ZZEA 3VFJA 2ESNA 3MZBA 2QMWA 4ZEBA 1R6ZA 3JYRA 3SESA 2VD2A 4P0IA 1MXXA 3CG1A 4RPOA 2GH9A 5IKBA 1IXCA 1O64A 1SYHA 3BFTA 4THIA 3E3KA 2VGQA 3UORA 3MWBA 1JW1A 3FJGA 1MM7A 5F7VA 2X7QA 3W9VA 4TLMB 3LSLA 1VFEA 3V89B 1B4ZA 1OVTA 3PPOA 4H65A 1B52A 4XTCQ 1O63A 5DT6A 1Z7ME 3PUYE 1B7HA 5B70A 3HHGA 2XXQA 4ESWA 4NE4A 1A54A 3OXNA 3ZKLA 5HPQA 5FHOA 5L8DA 3SEYA 2UXAA 3OO6A 3MVZA 2I58A 1PEBA 4ELQA 3S9NC 2YJPA 3TELA 3G3KA 2OCUA 4EUOA 3RLFE 4DXBA 3FVGA 2I3VA 1S9TA 1LBCA 3GZGA 3CSGA 3FV1A 3V5AA 3KEIA 1AMFA 3OO7A 2F7CA 5CMCA 4ELOA 1H43A 1B40A 1LBBA 3FVOA 3TQWA 4ZZAA 1DTGA 3H6UA 3ZS6A 1MY4A 3R26A 1D4NA 4R6HA 2UVJA 3U72A 1MPBA 3B7DA 4U21A 2HQ0A 2ZYNA 4ZECA 1NNPA 3UK4A 2PMSA 3Q28A 2ALUA 4EQ9A 4NWDA 3B6QA 4WEPA 3U92A 1S50A 2HFBA 4AB6A 2GHAA 4H1XA 1LCFA 5CMMA 2Z8DA 4EQ7A 3VLUA 3ZKKA 1MQGA 3T9UA 4G68A 1VFDA 4I8CA 2HZLA 4G68B 3N94A 3PPQA 3H06B 4R6YA 3KZGA 4GQOA 4JSOA 3HV1A 2KLFA 2Z22A 4KQPA 5I84A 3QYTA 2AYSA 3MW0A 5K2YA 3OENA 3V8XB 3PUVE 4QSEA 4KPTA 1HSLA 2RC7A 4H67A 2I0BA 4R72A 3PV0E 4RNSA 1A55A 3LSXA 3TCGA 2R6GE 1M5EA 1IXIA 3T9VA 4PFWA 4IO4A 1YPNA 2ONSA 4BDRA 3KN3A 2D5WA 3MP1A 3G3GA 1Y3PA 2AL5A 1SW2A 2ABHA 3FXUA 3UP9A 4DLDA 2I49A 2QSXA 2F7AA 4PE5B 4IO3A 3DP8A 1EH3A 1MY1A 4KD5A 4NEDA 2I4CA 2OLBA 2I0CA 4OEVA 3RNNA 1QUIA 1ZBMA 1NNKA 4JBZA 1LAFE 1WVJA 4R9FA 5DYHA 4GVOA 4PP0A 2IEEA 3C9HA 2HCAA 1IUDA 2DVCA 4LQ2A 3H03A 3T93B 4U22A 3TUSA 4G8HA 4Z0IA 2XD2A 3HPIA 4YAHX 1B51A 1DOTA 1LGBC 2DQVA 2AIXA 1JW5A 2DXRA 3KSXA 3C33A 4DZ1A 4LQ5A 4F3PA 3PMWA 3SEUA 1PBPA 3IJXB 5H8HA 1OLAA 3S9LC 4DDDA 3MPKA 3KN8A 3RTFB 4RYAA 5H8HB 3M3KA 1BP5A 2QMXA 3K6XA 4ELRA 3K00A 2HAVA 2Z23A 5TP9A 4FIMA 1MM6A 3EF7A 1MH3A 5TP9B 5KDTA 3MAMA 1FQCA 3FXRA 1N7XA 5KDTB 3QIMA 1OIBA 1NH8A 1O7TA 3QUJA 1URGA 4ZE8A 4QFOA 1FW0A 1MDQA 4OENA 2RC8A 1ANFA 1UTHA 4KCDA 5CMBA 4I9DA 1BKAA 3CFLA 5CM6A 1UTHB 2R9JA 4G4PA 4R2BA 3UN6A 3MVXA 1PBQA 2XXWA 5CMKA 2THIA 5A5XA 3SETA 5A5XB 1M5FA 4FECA 3U94A 2DOJA 3K01A 4H8JA 3ILTB 1SQYA 2PT1A 3TEPA 2O6AA 3HO7A 3O6IA 3Q26A 4IO7A 2FYIA 3S2VA 2XXIA 1A8EA 4XIGQ 1NFTA 3LBSA 4YKIA 1F9BA 3EN3A 1RYOA 2Y7KA 3O66A 3M3FA 3C36A 4NWCA 1NNTA 4IGRA 5AA4A 3S9MC 3THIA 3VE1B 3H3GA 1JNFA 5AA4B 1Y1MA 5BUUA 2XHDA 1FQFA 2OZZA 1QKBA 2XXXA 2F97A 1IZ1A 4OESA 3PPNA 4OETA 5I58A 1JVYA 3SKPA 1I6AA 2HEUA 5I58B 2UYEA 1B9JA 2ANJA 3T9HB 5F1QA 4JSDA 3TZAA 1N0TA 2YLNA 4QSCA 3MVWA 3I3VA 4GOTA 2F6PA 2FA7A 2V93A 5AA2A 4YKKA 2O7UA 3FD3A 4OTEA 4RA1A 3USDA 5AA2B 1B3LA 2E0SA 3KG2A 3UGWA 1T0KA 1QUJA 1R1NA 4ZEFA 1JW4A 3FZVA 2O84X 4TLLB 2DE2A 3CI8A 4GRKA 1P1NA 3U1OA 4BDNA 1Z7NE 3QSLA 4HCYA 3CFZA 2DE3A 3UA8A 1XVXA 5I57A 4RY1A 3IB2A 3RT8A 1D9YA 5I57B 2QRYA 3K6UA 1Y9UA 3IX1A 3ONMA 1FCKA 4Q30B 1B3EA 3AXFA 4F18A 2VP1A 4GIZA 4H0WA 1P1OA 2XX7A 4QF9A 3HHFA 5CBSA 3IR1A 1Y4CA 1N3WA 2I3WA 1H44A 2VOZA 1ZU0A 3FVNA 1MG1A 3IB1A 3KBRA 2UVIA 1JEVA 1MXYA 2NOOA 1Y20A 1RKMA 3FIRA 2XXYA 5K2XA 4FEDA 4WEDA 2Q89A 2X26A 1FTJA 4YKPA 1B5HA 5IAIA 1H76A 1SBPA 4LVQA 2X7PA 1CE2A 4JDFA 3ZSFA 3OEMA 2E1SA 1DTZA 4ZDMA 1Q35A 3TCFA 5EHMA 1DPEA 4OXVA 1YCJA 3DELB 4MLVA 3KJ7A 4FAJA 2A5SA 3U8QA 2F5XA 3KFMA 3OSRA 1US4A 1JVXA 2NXOA 4R9GA 4U4XA 3CR9A 1MPDA 4L17A 1IITA 1URDA 3W15C 4HCWA 3CG3A 1ELJA 3KOTA 4KYSA 4ZEKA 1LLSA 3PU5A 1N7WA 3RT6B 5HBCA 3GBAA 2OWSA 2H9BA 3OO8A 1P1UA 2ONRA 1AH5A 1XVYA 4R75A 1EZ9A 1IXHA 2F78A 2XXHA 4IB2A 4F22A 4FJPA 4X48A 3QK6A 2CMOA 5H8SA 1MY2A 1QKAA 4TOZA 4YB6A 1N04A 4I1DA 5CC2A 2DVZA 1AIVA 2Y7RA 2PVUA 1L5TA 4YZZA 1USYH 2O1LA 5JK4A 3RN8A 3K4UA 4F3BA 1QVSA 3OD7A 2H5YA 4RK9A 4WXJA 3O6HA 4LZ8A 4I62A 2QS1A 3IORA 4NTLA 1IXGA 4IO6A 1MRPA 3E13X 4ZE9A 1PB7A 3K6WA 2NWJA 1OLCA 3FVKA 4RXLA 4EXKA 1XT8A 3R7XA 1NH7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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