1NMUA

Mbp-l30
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein/ribosome
source organism Escherichia coli
publication title Inherent Protein Structural Flexibility at the RNA-binding Interface of L30e
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose-binding periplasmic protein
total genus 122
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA01
3O9PA 2ZNTA 3CIJA 3MAMA 3SEUA 3ZS6A 1L5TA 1I6AA 1OQGA 2QSXA 4X1BA 1TFAA 1GR2A 3PUYE 3ZKLA 3H6WA 3LR1A 1FTMA 4IO7A 1B40A 2PT1A 3LBSA 3N6UA 3FVNA 4R2BA 3U8QA 4RPOA 4WEPA 1BIYA 4I1DA 4LP2B 2A5SA 3UA8A 2ZNUA 5FTHA 4G68B 2X7QA 1UIUA 2BJJX 3B6TA 3G3FA 2V3TA 4OEUA 2R6GE 3GBAA 4E0WA 4EQBA 2W7YA 2DXRA 3K1MA 1KWHA 1LAXA 3IOUA 4G4PA 1USYE 2V3QA 3TELA 1EZPA 1NH7A 3TQWA 4NF6B 5I59A 3HV1A 1ZIUA 1MXUA 1B3LA 4H8IA 3MBPA 4ISUA 5H8NA 1BP5A 1SW4A 4EXLA 3JV9A 3HHFA 2DWHA 3A09A 1NNTA 2E1SA 1LAFE 3TCFA 1FQAA 3DLNA 1F9BA 4IY6A 4KQPA 2VD2A 3RGYA 2H25A 4XKRA 4H5GA 2PX1A 3Q25A 3C4MA 4ESXA 1P1UA 2XXHA 2NOOA 4P11A 3W9WA 2DOJA 4F31B 5I57B 1Y1ZA 1B7ZA 2GFEA 3TMGA 1LAGE 1Z7ME 2QRYA 2DE2A 2XXWA 5ITOA 3O29A 5M2VA 1SVXB 4NTLA 4HS7A 1MY3A 4R75A 1WVJA 2XXUA 4TOZA 4GXSB 3M3FA 1B7UA 3P7IA 1CB6A 3G3HA 3IB2A 5I56B 3S2VA 4NF6A 3OO7A 3SESA 1MXZA 3FV2A 2OBGA 4IY5A 4OHNA 1Y3QA 1UTHB 3M3KA 5AA4A 3HN0A 4H8JA 1O7TA 3PPPA 4HTGA 1PC3A 4QSCA 5L8DA 4QSEA 4DXBA 4GVOA 4LQ2A 5HPQA 1BLFA 5AE4A 4IGRA 3MP1A 2O7UA 4U22A 3V89B 2Y7PA 1LCFA 3GBBA 2CMOA 4ONYA 5I57A 4ZEFA 4YAHX 2Q2CA 1HSEA 3PMXA 3TTRA 1LBCA 2Q8JA 1Y4TA 1NMUA 4F1VA 3KG2A 2NVUB 1NL5A 2ALUA 4OQOA 3LUYA 3OEKA 4XIGQ 5H8QA 1LCTA 1LB9A 4NF4A 2UVGA 4QF9A 5K2XA 2HEUA 4LATA 3S9LC 3G3JA 2H9BA 1JNFA 5I56A 1T0KA 1B0LA 2GHBA 5I58B 5CM6A 4DXUA 4H6DA 5IKBA 4QHQA 1FQBA 3CFXA 1UTHA 3CR9A 1MG1A 1B05A 1USYH 1POTA 1Q35A 4U4XA 1H3DA 3TODA 1POY1 2PBWA 1FCKA 2UYEA 3LC8A 1TXFA 5JTYB 3HO7A 3VXBA 1FTKA 1IITA 1SW1A 1PBQA 4R6HA 3SEWA 3VVEA 2VHAA 3O2AA 1XVYA 5A5XA 1OIBA 4GD5A 4OENA 5HM4B 3PUVE 1MQHA 2DYXA 3IK6B 4ZE8A 5B7DA 3EHUA 4LUBA 4LZ5A 1VR5A 3PPOA 1PDAA 4F22A 4HCWA 4OVJA 5CMBA 4DDDA 2DE3A 3QUFA 1B52A 3S4UA 1II5A 1R1NA 3E13X 4F2QA 2AIXA 5I58A 3USDA 4QFLA 2O6AA 5KCJA 3UK4A 2DQVA 3EN3A 4YB7A 2OZZA 2PT2A 4BDRA 3FVGA 3T9HB 4KCDA 1JEVA 3W9VA 4JXIA 1UQWA 4LZ8A 5JTYA 1MXXA 1US4A 4QSDA 3MZ1A 3KEIA 3BFUA 1AIVA 3SEYA 4ZZEA 1GGGA 3SKPA 1A7LA 2H98A 4RY1A 2XXXA 3ONMA 3D4GA 3QYTA 2F36A 1D9VA 3TYHA 3O6GA 4KYSA 3C9HA 3K01A 1N7WA 3MZBA 4NWDA 3TQLA 4Q8RA 4YMBA 3KSXA 2GH9A 4R6YA 2I48A 2I4CA 3FIRA 1LSTA 5F1QA 1Y4CA 2LAOA 3HSTA 2XX7A 5ITPA 4IGTA 4PFWA 1OVTA 1ZLQA 3CVGA 1LAHE 4EF2A 4I62A 4OEVA 1UTBA 3OSRA 5I84A 2ZYMA 1DTZA 3K2DA 2B3FA 3IO4A 3G3IA 1MM6A 1JW1A 2XXIA 2HXWA 5J1DA 4DLDA 2XX9A 1DMBA 4EF1A 1AL3A 1NH8A 1YPNA 3T96B 4NF8B 4WKMA 3TCGA 4R72A 5H8SA 1NNPA 4XTCQ 2Q2AA 1IUDA 3FJGA 5L9MA 2O69A 3N6TA 1QUKA 3PV0E 3IAZA 1B9JA 3LSWA 2HAVA 4ECFA 1MQGA 1H45A 4F3SA 3CSBA 3CG3A 1TT1A 1PBPA 2ZNSA 3B7DA 1PB7A 4GF8A 2B3BA 3O97A 4IO3A 4X1DA 2I58A 3R7XA 3TZAA 1A8FA 1H44A 3TTKA 3K0VA 3SDFA 1MXVA 1QUJA 4Q30B 3GZGA 1Y9UA 4GLIA 4LZ7A 1MY1A 4NMYA 4TQUQ 2Y7WA 1IXHA 5CBSA 1Y20A 3VLWA 1AMFA 3KN3A 4U1ZA 4ELOA 4DZ1A 3FD3A 3IJOB 2ONRA 4GFRA 3MP8A 4NF8A 3JZJA 1MRPA 1YCJA 4YICA 4R73A 4ELPA 1B1XA 4IO5A 2YLNA 2XX8A 1IQ7A 1N7XA 3VVDA 5CMKA 4YU0A 4XKPA 3SERA 1SD3A 1Y1MA 4YB5A 3I3VA 1ELJA 4ZEBA 2RKMA 5DT6A 4POXA 4RJZA 4JBZA 2GRVA 3Q29A 3KJ7A 1B32A 3LSLA 5B70A 2RCBA 4PP0A 1P99A 1QKAA 1GTKA 2F8DA 4OZ9A 4RK9A 1A40A 2V84A 3QSLA 4RK2A 3RY3A 3TTMA 4N07A 3FGSA 1NFTA 4XKNA 2XXTA 1QUIA 4F3GA 3PGFA 4JSDA 3RUMA 2DXYA 2A5TB 1B58A 2F6GA 4P0IA 4QFNA 3IX1A 3OSQA 4EQ9A 2I6EA 1S50A 2ABHA 4FIMA 4R6KA 1EH3A 3HPIA 4WXJA 4F1YA 3B6WA 1LLSA 2O68A 4PQJA 4G68A 2M8CA 3C34A 5CMMA 1MY0A 5LOMA 1VSOA 3EHTA 3FXRA 4DXCA 2THIA 3SEXA 1MM7A 2HCAA 4FEDA 4FECA 3LSXA 1RYXA 3K6WA 2E0SA 4OERA 2F78A 2QMWA 3I6VA 1N76A 3IOWA 4GL8A 5IAIA 1PEBA 1SBPA 2F97A 4UACA 4GWOA 3OMBA 1XS5A 5EHMA 1DOTA 2X7PA 4Z0IA 4KCCA 4M1VA 3RT6B 1SW2A 3TTNA 4OFLA 1A54A 4Z7EA 3OO9A 4G8MA 4F29A 2F35A 4U2RA 2XD2A 2O84X 3U1OA 4RNSA 3RTWB 4PFYA 4MFIA 2Z23A 5ELVA 2NUVA 1IIWA 4IO6A 4C0RA 2A5TA 1EZ9A 3FJ7A 2IEEA 1MS7A 2ZYKA 3S9MC 2DSFA 1B5IA 1RKMA 2RC7A 2VGQA 1P1OA 2DWAA 1B3HA 4H1XA 3IR1A 1Q1KA 1JVYA 3Q26A 1XHYA 3MUQA 1N84A 4PE5B 3T93B 4LQ5A 1SQYA 4ZEKA 1YAEA 4HCYA 2Z8EA 1OMPA 4DCYA 5TPAB 1B51A 3RQTA 1SDXA 1QULA 4EQ7A 1LGBC 1MXYA 2DS9A 3HHGA 4DIGA 4MLQA 4G77A 1US5A 1A99A 3OOAA 3IJXB 5AA2B 1ZKBA 3CG1A 2QS3A 2Z8FA 2AYSA 3FUZA 4YKIA 4O3AA 2QMXA 5AA3A 3OO8A 3H06B 4RXLA 1MY4A 4IB2A 2QL3A 4MBPA 2FYIA 2Y7RA 2R71A 2OWSA 1DPPA 4H5FA 1MPDA 5EHSA 3CFLA 3V83A 4H65A 4OWDA 3S9NC 2QS1A 3FZVA 5DVJA 4OYVA 5FTIA 1MDP1 2RF1A 4Q5TA 2HZKA 2QJEA 3PPNA 1SI0A 4C1UA 4ZDMA 4ZECA 4RA1A 2DVZA 1M5CA 2D21A 3O28A 4KYEA 1OVBA 5FHNA 4RYAA 2VOZA 2IA4A 4G8HA 2RINA 5TPAA 3DM0A 1I6BA 2AL5A 2Q89A 4R74A 1DPEA 1JETA 4TLLB 1PB9A 5AA2A 1M5DA 4IO2A 4BDLA 1I69A 2Q9TA 1AH5A 4PFUA 3K02A 3U93A 4E0XA 1H43A 1BTJA 4P0GA 1B3FA 4L17A 4TLMB 2RC9A 2OLBA 3R26A 4QFKA 1MQDA 3VLUA 4ND9A 2I0CA 2Y7KA 2O51A 3DP6A 1MH3A 2ESNA 3PUZE 3MPKA 2I0BA 1MDQA 3L6GA 1B1HA 4U1OA 1TWYA 4YKKA 5DVIA 4GXAA 1N3XA 4ESWA 4WEDA 2ZYNA 3OELA 5DEXB 4GL0A 2H99A 4YKPA 3THIA 2OK2A 5BUUA 3RNNA 1OLCA 5CC2A 1D3KA 3OEMA 2I3VA 3K6UA 1S9TA 1Z7NE 3DELB 2CZLA 4F39A 3BFTA 4UA8A 4LVQA 3IORA 4EDPA 2ZMBA 3L6HA 5ICTA 1XOCA 4H67A 4F1UA 5KZTA 1WDNA 3MWBA 3BBRA 3TUSA 2UVHA 3OD7A 1H76A 2VD3A 2UYFA 4BDNA 3TDJA 3TKDA 4G2ZA 3PUWE 1TFDA 2XXQA 4FATA 1A55A 2REJA 1MY2A 1Y3NA 3H4ZA 5L9OA 2V25A 2HAUA 1M5EA 4NEDA 3VXCA 1FTJA 3MVZA 3VDFA 3K6VA 3T9XB 4HW8A 3MVXA 4R9GA 1B3GA 1MPCA 1MXWA 1R9LA 3K1NA 3KBRA 4QFPA 4KPTA 1A8EA 3IOTA 5H8NB 1B7HA 3MQ9A 2O1MA 1SW5A 1IXGA 4R9FA 3S9EA 4YKJA 2VP1A 1IXIA 1B2HA 4KI0E 3FATA 3ECRA 4AB6A 3KJTA 4QRZA 1XVXA 1O64A 1R6ZA 3VLVA 1LFHA 3N94A 4YZZA 1ZBMA 3CFZA 2ONKE 3FXUA 4GIZA 2I3WA 3U92A 4RPNA 2FA7A 4JSOA 1LB8A 1QVSA 4JB7A 3DP8A 4KHZE 1MH4A 3RTFB 4YMAA 3RLFE 2ONSA 5AA1A 4FEBA 5H8HB 2HFBA 2UVJA 2Z8DA 3RT8A 3FXQA 2DVCA 1B5HA 2GHAA 4XXUA 3MVWA 4BDMA 4FE8A 2P0SA 4MF3A 4KYDA 1XC1A 2G29A 1IXCA 2FNCA 3H7MA 3CI8A 3H6VA 5TP9B 4GQOA 1FQCA 2QPQA 5AA4B 1SYHA 5EYFA 4PFTA 4F19A 2H4IA 2Z22A 3C32A 1FW0A 2D3IA 1VE4A 1B46A 2YPNA 2H5YA 4OESA 2XXVA 3LSFB 1JW4A 5I2KB 1JVXA 3VVFA 3MC2A 1URGA 3EHSA 2OJTA 1B6HA 4G68C 2PYYA 4OFJA 1M5FA 1O63A 5F7VA 3RN8A 3C36A 1QJMA 1XT8A 2XHDA 1ATGA 2Y84A 1ZTYA 2F7BA 3G7WA 1NKXA 1J1NA 3BKIB 3VFJA 5ICQA 1FQEA 3H3GA 3OENA 1URDA 2ZXTA 5H8HA 1IZ1A 5K2YA 3M8UA 2R9JA 2OCUA 1P1QA 3U94A 3K6XA 4JDFA 5H8QB 2V3UA 3SEVA 3T22A 3EQ1A 4NF4B 1QW0A 1ZU0A 3PMVA 3TCHA 3DP4A 1IEJA 3T66A 4EUOA 4U21A 1Y3PA 1SYIA 5JEIA 3C31A 2O1LA 2G93A 3WAEA 2P1SA 5TU0A 4YB6A 3HCQA 3RPWA 5TP9A 4LA9A 4O3CA 5L9SA 4U23A 3ZSFA 3VV5A 1N3WA 4C1TA 3JYRA 2O7IA 3C33A 5I2KA 2RCAA 3OO6A 1VFDA 4Q0CA 3E4RA 1GVCA 5A5XB 4NWCA 4IO4A 2D5WA 3ILUB 3TTLA 4MLVA 1QKBA 3KN7A 5DYHA 3FV1A 1RYOA 4ZEDA 4NF5B 4O3BA 3IO6A 4LONB 2HZLA 2UVIA 1FTLA 2UXAA 3KZGA 4U4SA 4X48A 1P1WA 3O6IA 1WODA 2DE4A 2F7AA 1JEUA 4THIA 4N13A 4OETA 4AQ4A 5BWJA 4N6PA 1AOVA 1ZJLA 3TEPA 1FQFA 4JWYA 3PU5A 3UORA 2Q88A 5I2NB 4BDQA 3GLBA 4R2FA 3QXMA 3PPQA 4NE4A 5CRYA 2XXPA 4H0WA 5KCJB 2DWJA 5H8FB 4XKQA 4F2OA 2YJPA 3KN8A 1OLAA 2F7CA 3EF7A 3IB1A 1MQIA 4OXVA 4OFOA 4G8NA 3E9XA 3QIMA 3T9UA 3PUXE 2F6PA 4ZZAA 1VFEA 1MPBA 3F11A 5DVFA 4ZEIA 3FVOA 1I6QA 5CBRA 3SETA 1B3EA 3K1PA 3PD9A 1HSJA 1D4NA 1B4HA 3EPEA 3CRBA 1B0HA 4JWOA 1UIVA 4NF5A 1LFGA 3TFLA 5DTBA 3ODBA 3OXNA 3B6QA 1NNKA 2DP8A 3MW0A 4X9TA 1SI1A 3IOVA 2WKYA 1JQFA 2I4BA 5HBCA 4GRKA 2AL4A 4DCXA 2ANJA 5I2NA 5CI5A 3H03A 1M5BA 3TPAA 1UTBB 4JWXA 3W15C 5H8FA 2XD3A 2V93A 2I49A 4BLAA 1HSLA 3MVYA 3GXAA 1YTVA 3AXFA 4EXKA 5CMCA 1MQJA 2ZYOA 2X26A 4K3FA 2QS2A 3CSGA 4OTEA 1EZOA 2B65A 3KFMA 2F34A 1FQDA 4GOTA 4F3PA 1DTGA 1BKAA 3K00A 4MH5A 2QS4A 3D4CA 2XXRA 5KDTB 3A3UA 5AA2D 1PB8A 3UP9A 2REGA 4ZE9A 4FORA 3PMWA 4ELQA 3I5OA 1N0TA 1DSNA 3WAFA 3Q28A 1LBBA 3TAJA 2HQ0A 1S7YA 3KOSA 4F3BA 3K4UA 1B5JA 3QK6A 1D9YA 4KFQA 3KGCA 3V5AA 4FJPA 2NXOA 4KR5A 1OQHA 3O66A 3ZKKA 3H6TA 3MP6A 1LFIA 3G3GA 2RC8A 3T9VA 3UGWA 3IL1B 3FASA 2Y7IA 3M3LA 4BDOA 1ZMGA 3FJMA 3IB0A 3A3CA 4FAJA 1URSA 2P2AA 4M4GA 3G3KA 4ZS9A 4AB5A 4I9DA 1EU8A 1ANFA 1CE2A 1NNFA 1GV8A 4F18A 5JK4A 4OMBA 1R9QA 3UN6A 2KLFA 3N26A 3KOTA 3Q27A 3PPRA 3E3KA 2F5XA 3ILTB 3UIFA 1P1NA 4I8CA 2XXYA 3MJNA 3MPLA 5KDTA 3H6UA 3O6HA 4PETA 3MZ9A 3C35A 5ISUA 2PVUA 1JW5A 2NWJA 3PD8A 3V8XB 1B4ZA 4DE8A 4KD5A 1FTOA 5I59B 1N04A 3QAXA 2OWTA 5DEXA 3U72A 3KSJA 3R6UA 3VE1B 3N5LA 2PMSA 2DWIA 3QUJA 3FVKA 4ELRA 4POWA 4QFOA 5FHMA 5FHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FPJA 2ZZXA 3O9PA 2Y5KA 2ZNTA 3CIJA 4N6KA 3MAMA 3SEUA 3ZS6A 1L5TA 1I6AA 1OQGA 2QSXA 4X1BA 1TFAA 1FBCA 1GR2A 3PUYE 1YXIA 3ZKLA 3H6WA 3LR1A 1FTMA 5I7IA 4IO7A 3B8BA 1B40A 2PT1A 3LBSA 3N6UA 3FVNA 1NI9A 4R2BA 3U8QA 4RPOA 4WEPA 1NUYA 1BIYA 4I1DA 4LP2B 2A5SA 3UA8A 2ZNUA 4NG7A 5FTHA 4G68B 2X7QA 1UIUA 2BJJX 4GWSA 1JP4A 3B6TA 3G3FA 2V3TA 4OEUA 2R6GE 1DCUA 3GBAA 4E0WA 4EQBA 2W7YA 2DXRA 3K1MA 1KWHA 1LAXA 3IOUA 4G4PA 1USYE 2PCRA 2V3QA 3TELA 1EZPA 2WEFA 1NH7A 3TQWA 4NF6B 5I59A 2CZIA 3HV1A 1ZIUA 1MXUA 1B3LA 1FBEA 4H8IA 3MBPA 4ISUA 5H8NA 1BP5A 5IZ3A 1SW4A 2HHMA 4EXLA 3JV9A 3HHFA 2DWHA 2WBBA 3A09A 2OWZA 1NNTA 2E1SA 1LAFE 3TCFA 1FQAA 3DLNA 1F9BA 4IY6A 4KQPA 2VD2A 3RGYA 2H25A 4XKRA 4H5GA 2PX1A 3Q25A 1RDYA 3C4MA 4ESXA 1P1UA 2XXHA 2NOOA 1FJ6A 4P11A 3W9WA 4NX1A 2DOJA 4F31B 2QVVA 5I57B 1Y1ZA 1B7ZA 2GFEA 3TMGA 1LAGE 1Z7ME 2QRYA 5I5PA 2DE2A 1IMAA 2FHYA 2XXWA 3BIGA 5ITOA 3O29A 5M2VA 1SVXB 4NTLA 4G61A 4HS7A 1MY3A 4R75A 1WVJA 2XXUA 5EYHA 4TOZA 4GXSB 3M3FA 1B7UA 3P7IA 1CB6A 3G3HA 3IB2A 5I56B 4JVCA 3S2VA 4NF6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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