1NNKA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.85 a resolution. crystallization with zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA01
1ANFA 1MS7A 2AL4A 2QS3A 3FV1A 4YB6A 1LCTA 3C32A 5A5XA 3OEMA 4X48A 4YKIA 5I58A 4KPTA 4PFTA 1MXZA 1UTBB 5K2YA 4XTCQ 2HCAA 3BBRA 1O63A 3RGYA 1WODA 3V83A 2PMSA 5I56A 1FTOA 3TFLA 4LP2B 1B5HA 1N04A 2PT1A 1A7LA 1S9TA 3H6UA 4LA9A 1SBPA 3MP1A 3T9UA 1UTHB 2X7PA 1MM7A 2Q89A 2D21A 1FQFA 3OELA 3O66A 2I58A 4R6YA 4KCCA 1MQHA 1JEUA 2YPNA 1N0TA 3FJ7A 3UORA 3MZ9A 4O3CA 1Z7ME 5I58B 3TPAA 1P1NA 3RLFE 2RC9A 4ONYA 3HHFA 3T9XB 3TZAA 2ALUA 3KN3A 2I3WA 4I9DA 3OENA 2AIXA 1MQGA 1IQ7A 1M5DA 3G3JA 3H03A 2PX1A 2Y7PA 4ELOA 2PBWA 3S9LC 2BJJX 3SEXA 3SEYA 1MQIA 4IY6A 3R26A 1B0LA 1QJMA 1NL5A 4PETA 5CMCA 5AA2A 3SETA 4N07A 5H8QA 3TCFA 4LZ8A 3A3CA 3KBRA 3PUYE 3LC8A 3SDFA 4OENA 5KCJA 2R9JA 4F39A 4F3BA 4H5FA 3O28A 2W7YA 2OBGA 1JW4A 4FATA 2RINA 5DVJA 4R2FA 2OCUA 1EH3A 2F7AA 1Y3NA 4PFYA 3Q27A 4PP0A 5ISUA 3TCGA 3CR9A 1OLCA 3FJGA 2O6AA 3FVNA 1ZTYA 2NOOA 3OOAA 4ECFA 2F8DA 1LFIA 3BKIB 4EQ9A 4GOTA 3S4UA 1MPDA 4GLIA 4F18A 4JWOA 4ESWA 4NF5A 4HTGA 5AA2B 2DOJA 3TTNA 4NF8B 1IEJA 1Y1ZA 2CMOA 1Y3QA 5H8HA 1MDQA 4G2ZA 1JETA 5CMKA 1M5FA 3Q29A 4RY1A 4F3PA 4LZ5A 2QSXA 2H5YA 3ZKKA 3RTFB 4JBZA 3GLBA 1N3XA 1Z7NE 2LAOA 4OTEA 1Q1KA 3CFXA 1B52A 3O6HA 2AL5A 4NEDA 3VLVA 2FYIA 5CBRA 1H44A 3K1PA 4G8NA 3U92A 4QSCA 2A5TA 4NF5B 1B46A 4ZEKA 4GXAA 1LCFA 3O97A 1AIVA 3FVKA 3H6TA 3LSXA 1PEBA 4HCWA 4KI0E 3QYTA 5ICQA 1NH7A 2E0SA 1A40A 2GFEA 5F1QA 5H8HB 2DE2A 1URDA 4RK2A 5HM4B 3MQ9A 1SVXB 1B5IA 4GVOA 4KQPA 1D9YA 3W9WA 4PQJA 1N84A 4MLVA 4ZEIA 3IOUA 2X26A 5CBSA 3FIRA 4BLAA 5FTHA 2UXAA 4H65A 2O84X 1AOVA 4FORA 3KN7A 3L6GA 3CIJA 3IX1A 1B4HA 5I2NA 4G68A 2YJPA 2DP8A 3N94A 4XKPA 5IAIA 2O1LA 2O69A 4EXLA 2HZLA 4F3SA 1P1UA 1TXFA 1MG1A 5BUUA 1MH4A 1US4A 2F6GA 2Z8EA 5L8DA 2V3QA 5AA4A 1OQHA 5I84A 4ND9A 3ZKLA 2F5XA 4YKKA 3N5LA 5M2VA 1DSNA 2I0CA 2THIA 4YMBA 3E3KA 3VVDA 2ZXTA 4F31B 1AL3A 5CI5A 4NF4B 4Z0IA 4TQUQ 5TPAA 1P1WA 4R72A 1ATGA 2XX7A 4RXLA 1IUDA 3IB0A 1R9LA 2VOZA 1M5BA 3EHSA 4Z7EA 3MPLA 5H8FB 3EQ1A 3IO4A 4OESA 4G68B 3TUSA 3RN8A 1GTKA 3SEVA 3ILUB 2IEEA 4Q5TA 3IOVA 4U2RA 3T9VA 4JSDA 4QFNA 3KEIA 1B7ZA 2Q88A 1FQBA 3TMGA 4Q8RA 3EHUA 1I6AA 2REGA 1MDP1 5L9OA 4DXUA 4TLMB 3EF7A 4JWYA 1A99A 1ELJA 3ZS6A 2ZNUA 2DQVA 4KHZE 5AA3A 4OWDA 5FHMA 2QRYA 4POWA 3FD3A 2V93A 1JNFA 2GRVA 3LR1A 3QAXA 1SI0A 2RCBA 3TCHA 1FTKA 2B3BA 4C1UA 2I4CA 5DEXB 4LQ2A 3IB2A 4YB5A 1LAGE 1B58A 2I49A 1VR5A 1FTLA 5F7VA 1ZKBA 4FEBA 3H6VA 4EF2A 1T0KA 1I69A 1OMPA 3A09A 3IOWA 2VHAA 2G93A 3DELB 3I6VA 2RKMA 3TKDA 4POXA 4XXUA 1Y3PA 3N26A 4H8JA 4GF8A 2XD3A 4MH5A 1IXGA 3BFTA 3OO9A 4BDOA 1JW5A 2QS4A 1A54A 3EN3A 3E9XA 3PUZE 4ZDMA 3GBAA 4R6KA 4O3AA 3CFZA 3VVFA 4G8HA 3SKPA 2UVIA 1D4NA 2XXIA 4N13A 3BFUA 4DE8A 4RA1A 3S9NC 1POY1 3QIMA 1MY4A 4G8MA 1TT1A 4DZ1A 4H5GA 4ZECA 1B40A 4RPNA 4Q0CA 2NXOA 2DXRA 3LSWA 5ELVA 1SW5A 1QVSA 4DCYA 3TEPA 4NMYA 3P7IA 2F36A 1FQDA 3T93B 4IO3A 3PUVE 4P0IA 4QSDA 3B6TA 3USDA 3TODA 2HFBA 3C4MA 4QFOA 1YPNA 3FVOA 3TTLA 4LUBA 4WXJA 3LBSA 4R9FA 5CRYA 5KDTA 2A5SA 3HV1A 1MXXA 1Y1MA 4RK9A 3OD7A 4ZZAA 3QSLA 4BDLA 4OYVA 3PMVA 4H0WA 2KLFA 2V3TA 2NVUB 3CFLA 4XIGQ 1NNFA 3B6QA 1CE2A 1Y9UA 3FXUA 4MBPA 1F9BA 1SW2A 2HEUA 4GL8A 1QKAA 2Y7RA 1B4ZA 4IGTA 3JYRA 3G3IA 1B2HA 4RNSA 3VLWA 5A5XB 2O1MA 4DCXA 1R1NA 3C36A 1P1OA 1AMFA 4PFWA 3WAFA 1N3WA 1HSLA 4GRKA 3Q25A 3MAMA 3KSJA 4YMAA 2XXWA 4JDFA 1TFAA 3MUQA 3OO6A 5I56B 3GBBA 3PMXA 3PD8A 3QXMA 5I2KA 4F1VA 1XS5A 4KCDA 1B7HA 4H67A 2XXHA 2DS9A 2DE3A 1FQCA 5I59A 1VE4A 1PB9A 2QJEA 2GHAA 2H25A 1PB7A 1MY1A 1N7XA 1JQFA 4IGRA 1B1HA 1MQJA 3MP6A 2QPQA 1USYE 1MPBA 2Z22A 5EYFA 4F1YA 3VFJA 1A8EA 1BIYA 5KZTA 3IORA 3HPIA 3KGCA 3K01A 4XKRA 2V25A 3G7WA 2D5WA 3IR1A 2ZMBA 2ZYKA 2F34A 4KYSA 1NFTA 1PBPA 5I57A 1JVYA 2WKYA 3SEWA 1MH3A 3KSXA 1B0HA 4ZEBA 4IB2A 3RPWA 1SI1A 5H8QB 1US5A 5H8NA 2ONKE 4NTLA 5KCJB 4NF6A 4ZE9A 5DYHA 3UA8A 4U1OA 3VV5A 3O9PA 1O7TA 4KD5A 4YKPA 1VFEA 1J1NA 5CC2A 1O64A 4F1UA 3PV0E 1KWHA 3VXCA 3M8UA 3OSQA 1GR2A 1BLFA 3KJ7A 4C1TA 3IO6A 1USYH 1I6BA 2XXPA 2O7UA 2YLNA 3H7MA 2F7BA 1QULA 3PPRA 3TDJA 3LSFB 4F29A 2I4BA 5B7DA 3C33A 1FQEA 5CM6A 5H8SA 4HCYA 3O29A 4DDDA 2CZLA 5H8NB 1JEVA 2QS2A 4ZZEA 2UYEA 3PUXE 3RTWB 3IL1B 3K2DA 1DMBA 4LVQA 4GXSB 3R7XA 2Z8DA 2QMXA 3TQLA 2DYXA 4JWXA 4XKNA 1LGBC 3CRBA 3TQWA 4OFJA 4IY5A 4OXVA 2O7IA 4Q30B 1QUJA 4YB7A 4OVJA 2A5TB 2PVUA 3RY3A 3AXFA 4R9GA 2F6PA 3U1OA 4X9TA 3U93A 5JTYA 4RYAA 5B70A 2P2AA 2RC8A 4RJZA 4OERA 1B6HA 3PPQA 4C0RA 4R2BA 4TLLB 4QFKA 1OIBA 1IXHA 1XC1A 2O68A 2XXQA 3MW0A 4HW8A 3HCQA 5DVIA 5FTIA 2VD3A 4MLQA 1JW1A 3K6UA 3PGFA 3MVZA 3H6WA 4EUOA 3RNNA 3IAZA 5I2NB 1LAHE 3FXQA 5TP9A 3PU5A 3DP4A 1OVBA 2P0SA 1B7UA 5CMBA 3K6WA 1SW1A 1UIUA 4IO2A 5AA4B 3RUMA 4L17A 1Y4TA 3M3FA 3TAJA 2OJTA 1MXWA 1Y4CA 3VXBA 1H76A 1LBBA 3MP8A 5TPAB 2RF1A 3A3UA 3ZSFA 3W15C 3UIFA 2I6EA 2AYSA 1LB8A 3CVGA 1OVTA 1P99A 4THIA 4HS7A 3KJTA 1H3DA 2I48A 2M8CA 3U8QA 5JK4A 2H98A 4MFIA 4M1VA 1M5EA 2B65A 1PC3A 3LSLA 2XX8A 4EXKA 2DVZA 1TWYA 2V3UA 4OMBA 3E4RA 4X1DA 1DTZA 1ZIUA 1S50A 1MXUA 2DWAA 2ONSA 4F22A 3FXRA 3N6UA 4OQOA 2XXVA 2HZKA 2HAUA 4ZEDA 4FEDA 2XXXA 3T66A 2OZZA 4YU0A 4OFLA 5L9SA 3U94A 1SYIA 4WEDA 2ESNA 1QUKA 1LLSA 4GWOA 1BTJA 3PMWA 3FJMA 5AA1A 4E0XA 1DPPA 2XHDA 1GVCA 2XXYA 4ZE8A 1UTBA 2Z8FA 4LQ5A 2GHBA 2ZYNA 3DP8A 1ZJLA 4H6DA 3OXNA 4BDNA 1B3GA 4OEVA 3OO8A 2IA4A 3K1MA 1B3EA 3QUFA 2V84A 1UTHA 3I5OA 4I1DA 2NWJA 5FHNA 4GL0A 1IIWA 3G3GA 4PFUA 1YTVA 3RQTA 1GV8A 3O6GA 5ITOA 4ELRA 1MXYA 1WVJA 1B3FA 1B1XA 1URGA 4O3BA 1FTMA 3RT6B 1ZMGA 5HPQA 1NNPA 3CG3A 1EU8A 1EZOA 3PPOA 1SW4A 2P1SA 2UVGA 4KYEA 5JEIA 3KN8A 4JXIA 4R6HA 1AH5A 2F97A 5DTBA 2Y7WA 3FV2A 1DPEA 1NH8A 3U72A 3ILTB 1RKMA 1PB8A 3VLUA 3FASA 1A55A 4BDMA 3K0VA 3G3KA 1MY0A 2NUVA 1DTGA 2VD2A 5DT6A 1BKAA 1PDAA 2XD2A 4M4GA 2X7QA 4R75A 5KDTB 4P11A 4UACA 3FVGA 2UYFA 1FCKA 4ELPA 1H45A 5L9MA 2F78A 3S9EA 3UP9A 4QRZA 3MC2A 3VVEA 2HXWA 4JSOA 3HSTA 3DM0A 3K4UA 4F19A 3TTKA 2ZNSA 2QL3A 2XX9A 4EF1A 1LAFE 3HN0A 5ICTA 3SERA 4AB5A 3MPKA 3PPNA 2G29A 1VSOA 2GH9A 2ANJA 4WKMA 1XOCA 3SESA 3O6IA 3MJNA 4QSEA 1XVYA 1WDNA 1MY2A 1QKBA 5LOMA 1N76A 3MVWA 2PT2A 5DVFA 3K00A 4WEPA 4JB7A 1IXCA 4NF8A 3TYHA 3T9HB 1NNKA 1MRPA 2OLBA 4IO7A 1FW0A 1HSEA 3H3GA 2HQ0A 3ODBA 4BDRA 1LB9A 3S9MC 2DSFA 2ZYMA 4QF9A 3MVXA 1NKXA 4U4SA 3FGSA 3JV9A 3IB1A 1B5JA 5I2KB 3D4CA 4G68C 3PD9A 3N6TA 4K3FA 1IZ1A 2B3FA 1UIVA 4XKQA 3QUJA 2QMWA 1D3KA 4U23A 4G4PA 3FZVA 2UVJA 1IITA 5I59B 4ZEFA 3V8XB 3KOSA 4GFRA 3KZGA 1SQYA 5TU0A 5BWJA 1B3LA 3C9HA 2OWTA 4IO5A 2Q9TA 3OEKA 2QS1A 4ZS9A 4RPOA 1N7WA 4OHNA 4YKJA 2R6GE 2I3VA 3PPPA 3KG2A 4KR5A 2Q8JA 1YCJA 4YICA 1B51A 3DLNA 4KYDA 2ABHA 3V89B 3H4ZA 3SEUA 1R9QA 3ONMA 3G3FA 1YAEA 1CB6A 1ZLQA 1MQDA 5I57B 4OEUA 1HSJA 2ZNTA 4OFOA 3D4GA 3C35A 2I0BA 3ECRA 3M3LA 4H1XA 2REJA 4DLDA 1EZ9A 3MVYA 1XHYA 4QFPA 4NF6B 4U22A 5FHOA 1JVXA 4BDQA 3PUWE 3L6HA 4ISUA 1LFGA 2R71A 1A8FA 3K6XA 1ZU0A 3G3HA 4NE4A 4QFLA 3IK6B 4NWCA 3K6VA 2OWSA 1LAXA 4EQ7A 4DXBA 3JZJA 4GD5A 3C31A 1II5A 2DE4A 2PYYA 4NF4A 1B3HA 3M3KA 3CSGA 2D3IA 3F11A 3T22A 1MPCA 5CMMA 4OETA 2F35A 5IKBA 1IXIA 4R74A 3GXAA 4AQ4A 3IJXB 5H8FA 3RT8A 4U1ZA 2FNCA 1M5CA 2E1SA 3Q26A 2DVCA 4ESXA 3THIA 4EQBA 2XXUA 3V5AA 2DXYA 4YAHX 3W9VA 1SYHA 4YZZA 3K1NA 4KFQA 2VGQA 4NWDA 2Y7KA 4AB6A 1TFDA 3E13X 1DOTA 3WAEA 3QK6A 3T96B 1NMUA 1I6QA 4DIGA 3C34A 5EHMA 1MM6A 2VP1A 3MZ1A 4EDPA 4FECA 4GIZA 5JTYB 3CI8A 5DEXA 3OO7A 4FE8A 2HAVA 4UA8A 4OZ9A 3B6WA 2OK2A 1ZBMA 1NNTA 4I8CA 4ELQA 3UK4A 2Y84A 3IJOB 3MWBA 3B7DA 2FA7A 3IOTA 2Z23A 3VE1B 4LATA 1RYOA 3H06B 5TP9B 1L5TA 2F7CA 3O2AA 4LZ7A 1RYXA 4F2OA 3DP6A 1MXVA 3VDFA 4TOZA 1QUIA 3GZGA 4R73A 1UQWA 4FJPA 4QHQA 3Q28A 4LONB 3UN6A 1Y20A 1B32A 3LUYA 4N6PA 3MZBA 2ONRA 3HO7A 3CSBA 1FTJA 1R6ZA 1URSA 1OQGA 4U4XA 3EHTA 3EPEA 1QW0A 3OSRA 4MF3A 2DWIA 2UVHA 4IO4A 1BP5A 1LBCA 3FUZA 1LSTA 4X1BA 5AA2D 3UGWA 4F2QA 2Q2CA 5EHSA 3S2VA 2DWJA 1B9JA 2Y7IA 1EZPA 3MBPA 3KFMA 2ZYOA 5AE4A 4H8IA 3OMBA 1MY3A 3R6UA 2RC7A 1SDXA 4FIMA 2DWHA 2Q2AA 3TTRA 1XVXA 2H99A 2O51A 4E0WA 1XT8A 1FQAA 1SD3A 2XXTA 1PBQA 5J1DA 4GQOA 3TELA 2H4IA 1H43A 4U21A 1B05A 5ITPA 2H9BA 2RCAA 4DXCA 1OLAA 4F3GA 3TTMA 1GGGA 4I62A 3KOTA 3FATA 1Q35A 4PE5B 1VFDA 1P1QA 4G77A 1POTA 1D9VA 3I3VA 5HBCA 3K02A 3HHGA 4P0GA 2XXRA 4IO6A 5K2XA 1LFHA 1S7YA 3CG1A 4FAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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