1NNKA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.85 a resolution. crystallization with zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA01
3I3VA 4POXA 5FHNA 4QFOA 2F7CA 1B5IA 1N7XA 4G8HA 4G8MA 4GQOA 1FTLA 1SW5A 4LUBA 1N7WA 3FV1A 2GHAA 2QJEA 5K2YA 1O64A 4U1OA 4KD5A 3VXCA 4KYDA 4PE5B 3VLWA 3T9HB 4OEUA 3KFMA 2CMOA 1OLAA 1VFEA 4OFJA 1M5CA 1DMBA 3K1PA 2Q89A 2AL4A 3EQ1A 4IY6A 3TPAA 4NF4A 1N3WA 4QF9A 4U23A 3EHUA 3Q27A 4QFLA 4OFOA 1Y4CA 5DEXB 3KOTA 2Q2CA 2D21A 1BLFA 1XVXA 4XKPA 2E1SA 4IO7A 4JWXA 3VLVA 1MQDA 4F3BA 4NWDA 3N5LA 3VVEA 4C1TA 5LOMA 4NF8A 1OQGA 2VP1A 3TZAA 2UYFA 4DXBA 1Z7ME 1XS5A 2ALUA 3H6TA 3GZGA 5I57B 1FQFA 1FTJA 4NEDA 1PDAA 1B7HA 1GTKA 3RY3A 3TCFA 3V5AA 3CG3A 2R9JA 2QS3A 1B51A 3MBPA 4FJPA 5AA2D 5KDTB 2ZYMA 5I59A 1H76A 1RKMA 3O28A 1P1UA 3O66A 3CFZA 3MVZA 1S7YA 3CFXA 5BWJA 3G3HA 2GRVA 2FNCA 4ISUA 4R75A 4L17A 3V89B 1MY3A 2Z23A 3P7IA 3MP6A 3UN6A 1B58A 4I8CA 5H8HA 1FQEA 1FTMA 1MXWA 3O9PA 4GD5A 4XTCQ 1B7ZA 1USYE 1Q35A 3MZ9A 4N13A 3K6UA 2FYIA 2I49A 1AIVA 2P2AA 1USYH 5AA4B 4I1DA 2XHDA 1M5BA 1HSEA 2NUVA 4NTLA 4U4XA 3FIRA 1R1NA 4F1UA 5DT6A 4HW8A 3R6UA 5I56B 5HPQA 1SI0A 4HS7A 2DWIA 1FW0A 1ZTYA 3T9XB 4F2QA 2UVIA 3E4RA 4UACA 4DDDA 1LB9A 1B3GA 4YICA 1DSNA 1Y4TA 3TCGA 2NWJA 2IEEA 3QUFA 3OEKA 1WVJA 2ZMBA 3MC2A 2OK2A 3H6WA 4FORA 4IO4A 5I2KB 1QUJA 1UTHA 1MG1A 1MH3A 1D9YA 4OETA 3MWBA 4YKJA 3H06B 3RNNA 1LFGA 4EF2A 1SQYA 4OMBA 2Y7RA 5DVFA 4U2RA 4UA8A 3VVFA 3VXBA 5TP9B 1A8EA 3IOVA 1NH7A 4X48A 3T93B 2QS4A 4GOTA 5FTIA 2QS1A 3LUYA 2G93A 4R6HA 3RT8A 3N6UA 2GHBA 1YTVA 3VFJA 3DM0A 3PUWE 2XXIA 3LSFB 2REJA 5FTHA 3WAFA 1P1NA 3PU5A 1XT8A 1BIYA 4H8IA 4POWA 2XX8A 4WEDA 4G8NA 1ZBMA 4LVQA 2I58A 5ICTA 3SEUA 3O29A 2V93A 3EHSA 2GH9A 2Q8JA 4X1BA 1D3KA 3Q28A 2O7IA 1SW4A 3FVNA 3FXQA 3HN0A 1B40A 2Y7PA 2O68A 5K2XA 2X7QA 3TTKA 2HXWA 3M8UA 5H8QA 1B7UA 4R9GA 3IJOB 3GBAA 2REGA 4TLLB 5FHOA 2O6AA 1LLSA 5EHMA 4LONB 1ANFA 2Y84A 1AL3A 3DLNA 4N6PA 1IXIA 4P0GA 1M5EA 1PBPA 1R9LA 5JTYA 1SI1A 2P0SA 2RF1A 3OSRA 2H98A 1LAHE 2XXQA 1P1OA 1LBCA 1AOVA 1POTA 2RCBA 3IX1A 3V83A 5I2NA 3IR1A 1VSOA 1H45A 2UVGA 3IAZA 4IB2A 1L5TA 4QFKA 3M3LA 4DCXA 4RYAA 4FEDA 1RYOA 4GLIA 4F3PA 2RKMA 4KR5A 5H8NB 2RC9A 4YU0A 1FTKA 2HAVA 4H6DA 1HSLA 2VOZA 3IL1B 1MS7A 1POY1 1TFDA 2ABHA 3TMGA 1IXHA 1Y3PA 2XXHA 3R7XA 2ONSA 4LZ8A 3OENA 3K1MA 4Z0IA 2A5TB 4GFRA 3RUMA 4LP2B 3N94A 1PB8A 4F22A 1US5A 2F7AA 3IOWA 4RA1A 2ONRA 4I62A 2F34A 4M4GA 4FE8A 3CR9A 1MY4A 4XIGQ 3SERA 1URSA 1ZKBA 3ILTB 3I5OA 5L9SA 3KJTA 5L9OA 4BDQA 4ZEBA 4KPTA 4EF1A 1ZLQA 2H9BA 3T66A 1SW2A 4JWYA 1N3XA 2Z8DA 2G29A 2XXRA 5J1DA 2DQVA 1Y20A 5DEXA 2YPNA 2Y7WA 4GXAA 3FVOA 2DE3A 2PMSA 1OVBA 3HO7A 3S9NC 4YKKA 2OCUA 3RPWA 1XOCA 4H5FA 3EN3A 2H4IA 3DP4A 3QK6A 2F7BA 5HM4B 3IB2A 4GRKA 5I57A 4R73A 5ITPA 2QPQA 3LSXA 3Q26A 4LQ5A 2V25A 3ILUB 3SETA 2M8CA 3W15C 4OZ9A 3OO6A 4ZEKA 5L8DA 2AL5A 3QAXA 4H67A 5KDTA 2FA7A 2XXPA 3W9VA 4ZE8A 1LB8A 3A3UA 1Z7NE 1SVXB 4PFTA 3PUXE 1B2HA 2V84A 1B1XA 2PYYA 3B6TA 1QVSA 4DZ1A 1TFAA 1FTOA 2DP8A 2O7UA 4NF5B 3TFLA 3BBRA 1LGBC 3KG2A 2ZNSA 4YKIA 4BLAA 4JSDA 1FCKA 1MY0A 3CRBA 2XX9A 4U4SA 2NVUB 2OBGA 1DTGA 1FQBA 5IAIA 1LAFE 3N6TA 5AA4A 1SD3A 1BKAA 1LBBA 5L9MA 4OEVA 4DXCA 2QRYA 3D4GA 1MM6A 1B6HA 2OZZA 1B32A 3N26A 3FD3A 5I56A 5DTBA 3CI8A 2Y7IA 3IB0A 4GWOA 4JWOA 4YB6A 2GFEA 5B70A 2QMWA 2D5WA 3UORA 3TQWA 2XXUA 4OXVA 2I48A 2F5XA 3FV2A 3FATA 1LFIA 4Q8RA 1H44A 5JEIA 5I2KA 2AIXA 3OELA 1NNTA 4OYVA 3S9MC 4ZEIA 3AXFA 3PPPA 1FQCA 4MLVA 3CIJA 5BUUA 5TP9A 3CSBA 1UQWA 2DE2A 3TDJA 1CE2A 2PT1A 5CRYA 4KI0E 4BDOA 1GR2A 2XXVA 4WXJA 3SESA 2IA4A 3QYTA 3C36A 4ZE9A 1IIWA 3SEWA 4XKNA 1SDXA 4O3AA 3A09A 2QL3A 3S9EA 1A99A 4JXIA 2F78A 4NF4B 4YB5A 1SBPA 4TLMB 2Q88A 4EQBA 3O2AA 4O3CA 4LA9A 3KBRA 3UK4A 3V8XB 5AA2B 4ELRA 2RC8A 3SKPA 3RT6B 3H7MA 5F7VA 3C33A 3OD7A 1M5DA 3K2DA 1QKAA 3U72A 1JNFA 3TTLA 4JB7A 3VLUA 1EZ9A 3RLFE 4EQ9A 2VD3A 3L6HA 4ELOA 4MH5A 1S50A 4R2BA 3TCHA 3RTFB 3SEVA 3IK6B 1FQAA 4U21A 2I4CA 2B65A 4OWDA 3O6IA 3W9WA 3H6UA 5KCJB 2DYXA 1PB7A 2QMXA 2THIA 1MPCA 4ZZEA 1OVTA 3GXAA 1BTJA 1MDQA 1N76A 4NF6B 4BDLA 4F18A 5CBSA 4F39A 3VVDA 4EDPA 1MQHA 4KCCA 1MXVA 5I59B 3IO6A 3U93A 4R6YA 4XXUA 5I58B 4P0IA 1B46A 4GIZA 4QSCA 3G3FA 2XX7A 2QSXA 4ONYA 5CC2A 1WDNA 4RY1A 4MLQA 3IOTA 4WKMA 1MXXA 4JDFA 3RQTA 5H8NA 4YMBA 1DPEA 4C0RA 3RN8A 1SW1A 4QSDA 1D9VA 3E3KA 3IO4A 4DLDA 1MM7A 4EUOA 3H6VA 1VE4A 2P1SA 4FAJA 1PEBA 4QHQA 4WEPA 4I9DA 1I69A 3PMWA 1Y1MA 3FJGA 3EPEA 3BFUA 2A5TA 3PUZE 4G4PA 4OHNA 4R74A 1LCTA 4K3FA 3RTWB 1B9JA 3KSJA 1OQHA 4ELPA 1II5A 3K02A 1MRPA 3HHFA 4HTGA 1I6BA 1OIBA 5CMCA 5EHSA 2V3UA 3E13X 3G7WA 3OMBA 3WAEA 2F97A 2DWHA 4AQ4A 1B4ZA 2Y7KA 5M2VA 3C35A 2I4BA 3K01A 3O97A 3TTMA 1JW1A 4IO6A 1EU8A 4F1YA 3K6XA 3DP6A 1A40A 3MPKA 4F19A 1P1QA 3HHGA 2XXWA 2XD2A 2ZNTA 2O1MA 3I6VA 3C34A 1NL5A 1ZIUA 3FVGA 3TKDA 4F29A 2UXAA 1ZJLA 2I6EA 2OLBA 2AYSA 1IXGA 3G3IA 4F3SA 4OTEA 3FGSA 2WKYA 3L6GA 1PC3A 4F3GA 3M3FA 2R71A 1B3FA 3TQLA 4ZZAA 3H3GA 1OMPA 4QRZA 1IEJA 3PMXA 3MVYA 1DTZA 3GBBA 2ONKE 4Q30B 1EZPA 3MAMA 3MJNA 5CMMA 2BJJX 1S9TA 2RCAA 3ONMA 5TPAB 1B05A 2XD3A 5H8FB 3LC8A 3MVXA 4BDNA 1N0TA 4OQOA 3B6QA 2CZLA 2YJPA 3UP9A 1MQGA 3T9UA 1ELJA 2ESNA 2E0SA 4R6KA 2DXRA 3S4UA 4DXUA 3MZBA 1GVCA 3K00A 3FJ7A 3PUYE 5DVIA 3LR1A 3PUVE 4NF5A 2W7YA 5TU0A 4IGRA 3SEYA 4GXSB 2Z8FA 4JBZA 1Q1KA 1A54A 3MZ1A 4ECFA 5AE4A 1MXUA 5DVJA 2VD2A 2DS9A 2O51A 4OFLA 1JEUA 3TYHA 1UTBB 1IUDA 1URGA 4ELQA 4R72A 5CBRA 1UIVA 4DCYA 1B1HA 4H8JA 1PB9A 4AB5A 1NNPA 3JYRA 5A5XB 3PPOA 3LSWA 4KCDA 3PPQA 3PPRA 2ZYNA 4ND9A 1F9BA 1NFTA 4U22A 3HV1A 1JQFA 4P11A 4AB6A 3C4MA 4OERA 1NH8A 4QSEA 3U94A 1QKBA 3Q29A 5CM6A 4NE4A 4ESWA 3CFLA 2Q9TA 3A3CA 2PVUA 2D3IA 4QFPA 3HCQA 1D4NA 3T22A 1RYXA 4FIMA 1Y9UA 3LSLA 2O1LA 4GL0A 4KYEA 3IB1A 1IQ7A 1A55A 3C31A 1IITA 1Y3NA 1B4HA 4E0WA 4ZEDA 4PETA 3MW0A 1A8FA 3ODBA 4JSOA 1JETA 1GGGA 2RINA 1DPPA 3C9HA 3OOAA 4ZS9A 4OESA 3ZKLA 3MQ9A 3U92A 2F6GA 3ECRA 5ICQA 4YKPA 2OWTA 4BDRA 4DIGA 1R9QA 2V3QA 1NNFA 2NOOA 4ZEFA 4GF8A 1AH5A 5ISUA 1JVYA 3IJXB 4RPOA 1EZOA 3DP8A 1AMFA 3PD9A 1OLCA 4XKRA 5AA2A 2DWJA 1O63A 1VR5A 2F6PA 1MDP1 3B7DA 1QJMA 4GL8A 1TT1A 1LSTA 1QUKA 4G68B 4YB7A 1B0LA 4G2ZA 3TODA 1YPNA 3TELA 1US4A 4LATA 3UA8A 1NNKA 2F36A 1B5HA 3KGCA 3BKIB 4O3BA 1MPDA 5ITOA 2DOJA 1UIUA 3T9VA 2ANJA 5KCJA 1ATGA 3E9XA 3OO9A 1JW5A 1H3DA 5KZTA 4PQJA 4KHZE 4NF6A 3FJMA 5JK4A 2ZYKA 3TTRA 3O6GA 5I58A 2PX1A 3HSTA 3MPLA 2X7PA 2I0BA 1ZMGA 4G77A 5B7DA 3ZS6A 5EYFA 3UIFA 1XC1A 4LQ2A 1QW0A 2A5SA 3CVGA 3D4CA 2O84X 1YCJA 4H1XA 3QXMA 4MFIA 4ESXA 4HCWA 2ZXTA 4X1DA 2QS2A 4NWCA 3OSQA 1MY1A 3QSLA 4F1VA 4KYSA 3MVWA 3PPNA 2DVCA 4LZ7A 3OEMA 1I6QA 1N04A 3KEIA 1B5JA 1JW4A 5CMKA 3ZKKA 4HCYA 3QIMA 2X26A 4TOZA 1A7LA 4QFNA 3THIA 1QUIA 4NF8B 3CG1A 3KN7A 4ZDMA 2DSFA 1J1NA 1H43A 4C1UA 1KWHA 1MPBA 4G68C 5HBCA 2I3VA 4H5GA 4Q0CA 4XKQA 1LAXA 4M1VA 3RGYA 4EQ7A 3Q25A 4IO3A 4NMYA 3H03A 3MP8A 4RXLA 1XVYA 2B3BA 5I84A 2VHAA 1XHYA 2DVZA 1URDA 1JVXA 2H25A 3CSGA 2ZNUA 4EXKA 2PBWA 4R9FA 3H4ZA 4KFQA 5CMBA 3BFTA 3U8QA 1TXFA 1SYHA 1QULA 3FZVA 1T0KA 3KSXA 4TQUQ 4R2FA 2OWSA 3HPIA 2UVHA 1M5FA 4X9TA 4F31B 1NKXA 4YZZA 2UVJA 3TUSA 3FVKA 5H8HB 1ZU0A 4MBPA 4RJZA 2V3TA 1MY2A 4GVOA 3IOUA 2NXOA 3M3KA 1CB6A 2Z8EA 3K6WA 1B3EA 5TPAA 4RK9A 4IGTA 3OO8A 1VFDA 3K4UA 5H8FA 1N84A 3OO7A 4YMAA 3VDFA 3FASA 4FEBA 4FECA 4IO2A 1B3HA 3K1NA 1LFHA 3FXUA 5AA1A 3TAJA 4YAHX 2O69A 3UGWA 2F35A 3K6VA 2HZLA 1FQDA 4OENA 3G3KA 3PV0E 5DYHA 3EF7A 5CI5A 3IORA 2OJTA 2KLFA 3JZJA 4RK2A 1B3LA 1YAEA 3PGFA 4RNSA 3KN3A 3PD8A 1UTHB 2YLNA 3ZSFA 3VV5A 2HAUA 2LAOA 4IY5A 4OVJA 3C32A 3TEPA 1MQIA 3S9LC 1UTBA 4H0WA 4PFUA 3SEXA 3MP1A 3FXRA 3GLBA 4RPNA 5A5XA 4THIA 1Y3QA 1P1WA 1B0HA 4KQPA 2I3WA 1B52A 4Q5TA 2H5YA 2VGQA 2HFBA 2HEUA 1TWYA 2DXYA 4N07A 3U1OA 4PFYA 2F8DA 1LAGE 1MXZA 2PT2A 3K0VA 2XXTA 2XXYA 1GV8A 1BP5A 5FHMA 3B6WA 3DELB 2HZKA 2Q2AA 3TTNA 1I6AA 2HCAA 2H99A 3OXNA 5H8SA 4PFWA 3R26A 3KN8A 2DWAA 4FATA 4IO5A 1MH4A 5F1QA 3S2VA 1IXCA 3O6HA 4E0XA 2R6GE 5H8QB 4PP0A 3FUZA 2RC7A 1EH3A 3USDA 4EXLA 1P99A 1MQJA 1PBQA 3VE1B 3LBSA 2XXXA 4MF3A 3EHTA 1R6ZA 1SYIA 1HSJA 5JTYB 3F11A 2HQ0A 3T96B 4BDMA 3KZGA 5AA3A 1IZ1A 2DE4A 5IKBA 2UYEA 2Z22A 3QUJA 1DOTA 3G3JA 3MUQA 1Y1ZA 3PMVA 1NMUA 2ZYOA 3G3GA 3JV9A 3KJ7A 5I2NB 3KOSA 4F2OA 4LZ5A 4G68A 3SDFA 1JEVA 4Z7EA 4H65A 1WODA 1O7TA 4DE8A 2I0CA 4ZECA 4U1ZA 5ELVA 2B3FA 1LCFA 1MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PGPA 3I3VA 4PF6A 4OVPA 4POXA 5FHNA 4QFOA 2DDKA 2F7CA 1B5IA 1N7XA 4G8HA 4G8MA 4GQOA 1FTLA 1SW5A 4LUBA 4MCOA 1N7WA 3FV1A 5ET5A 2GHAA 2QJEA 1EYJA 5K2YA 1O64A 4U1OA 4KD5A 3VXCA 4KYDA 3RPLA 4PE5B 3U65A 3VLWA 3T9HB 4OEUA 3KFMA 4XF5A 2CMOA 1OLAA 1VFEA 4OFJA 1M5CA 1DMBA 3K1PA 2Q89A 2AL4A 3EQ1A 4IY6A 3TPAA 4NF4A 1N3WA 4QF9A 4U23A 1FRPA 3EHUA 3Q27A 3GYYA 4KXPA 4QFLA 4OFOA 4UABA 1Y4CA 2VPOA 5DEXB 4GWWA 3KOTA 4IR8A 2Q2CA 2D21A 1BLFA 1XVXA 4XKPA 2E1SA 4IO7A 4JWXA 3VLVA 1MQDA 4F3BA 4NWDA 4GX6A 3N5LA 3VVEA 1EYKA 4C1TA 5LOMA 4NF8A 1OQGA 2VP1A 4H45A 4GWSA 3TZAA 2UYFA 4DXBA 1Z7ME 1XS5A 2QFLA 2ALUA 3H6TA 3GZGA 5I57B 1FQFA 1FTJA 4NEDA 1PDAA 1B7HA 1GTKA 1FPGA 2JJKA 1IMEA 3RY3A 3TCFA 3V5AA 3CG3A 2R9JA 2QS3A 1B51A 1FPEA 3MBPA 4FJPA 5AA2D 5KDTB 2ZYMA 5I59A 1H76A 1RKMA 3O28A 3LV0A 1P1UA 1FPLA 2KQZA 4N8GA 3O66A 3CFZA 3MVZA 1S7YA 3CFXA 5BWJA 3G3HA 4MHFA 2GRVA 2FNCA 4ISUA 5EQAA 2FBPA 4R75A 4L17A 3V89B 1MY3A 2Z23A 3P7IA 3MP6A 3UN6A 1B58A 4I8CA 2XWOA 5H8HA 1FQEA 1FTMA 1MXWA 3O9PA 4GD5A 4XTCQ 1B7ZA 2ZZXA 4PAIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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