1NNPA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.9 a resolution. crystallization without zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnpA02
2I49A 5I2KA 2DE4A 2XHDA 4OERA 3QSLA 2F6GA 4U4SA 4ZS9A 4LZ5A 4NE4A 5L9OA 3T9XB 4N6PA 1R1NA 4MLQA 3W9WA 4OHNA 4MH5A 1N7WA 3PPPA 1D3KA 3D4GA 1PB7A 1QULA 3RLFE 2RCBA 2QS4A 4U1ZA 2UVJA 1N7XA 4IO3A 3FATA 1Z7NE 2DWJA 3K1MA 4KCDA 5CC2A 1S50A 4F1VA 5B70A 3N6TA 1LGBC 3C35A 1ZLQA 3RUMA 4TOZA 1ZIUA 3V89B 4X1DA 3ZKKA 5I2NA 2PT1A 2Q88A 1M5DA 3R26A 1LBBA 3G7WA 2XXTA 4RK2A 4HCWA 2I58A 4P0IA 3TTMA 4GIZA 1N76A 4P11A 1FQCA 3UORA 1XOCA 2UXAA 2O69A 4DCXA 3IB1A 4OWDA 2O68A 3JV9A 5K2XA 3LSLA 4BDMA 3TUSA 4DXBA 1TFDA 3TQWA 1ZTYA 1A99A 3U1OA 3KOTA 2E1SA 2ZXTA 4ZEKA 4KHZE 3PUVE 1DTGA 4KPTA 4ZE8A 1MRPA 2DVCA 2Q2CA 2W7YA 3JZJA 3T66A 3GBBA 3MJNA 3B6QA 3SERA 1I6BA 4FEBA 2ONSA 3OO7A 1PDAA 4Q0CA 3R7XA 2DWAA 4NF8B 3TODA 4RA1A 4F29A 1Y1ZA 1WODA 4C1UA 1B05A 2ZYKA 1TT1A 3D4CA 2CZLA 5CBRA 3IORA 1IXCA 1ZJLA 5ICQA 1B3FA 3QK6A 2B3FA 1HSLA 2AL5A 1B4ZA 4WEDA 3K2DA 1JEVA 4NMYA 4THIA 2HFBA 4O3AA 2V93A 3T93B 4E0XA 4R74A 5EYFA 3OEMA 4X48A 1MDP1 5H8NA 4ESXA 3CFZA 2A5SA 3U94A 4TQUQ 4PQJA 3K1NA 3RNNA 2Z22A 1MM6A 4NWCA 3K4UA 1NMUA 4I1DA 4OMBA 4GL8A 2GHBA 4U1OA 1B58A 4IY5A 3KEIA 3LR1A 4NF8A 1MY0A 3TELA 3RT8A 4YAHX 4F39A 1KWHA 5K2YA 3IB2A 4YZZA 3PD8A 4AQ4A 3CSBA 1T0KA 5I57A 1A40A 3ECRA 2XXHA 4ELQA 1ZMGA 3HPIA 4KD5A 3TQLA 1TWYA 4MLVA 3MPLA 3CIJA 2QSXA 1Y3NA 5H8FA 1H43A 4OXVA 4QFLA 1DPPA 2RC8A 4R2FA 2ZMBA 4WKMA 2REGA 1P1NA 4ZEDA 3IJOB 2FYIA 1IZ1A 3KZGA 2THIA 4ZZAA 3PUZE 1B52A 3PMWA 3RPWA 5I56B 1BIYA 4KCCA 5KDTB 5CMCA 3TTRA 4IY6A 1XVYA 3KSJA 1URGA 1P1WA 4YB5A 4ZZEA 1RYOA 4UACA 4OETA 1TFAA 3MVZA 2YJPA 3MW0A 3E3KA 5TPAA 4R75A 2ZNSA 4ECFA 5DEXB 4FJPA 5AA4B 4F18A 2XX9A 2RC9A 3B6TA 1NNFA 1M5BA 1M5EA 1B7HA 3KJ7A 1LAFE 3OXNA 4HW8A 4YKPA 1JW1A 4ESWA 1MXZA 5FTHA 2P2AA 4MFIA 1OQGA 3VLUA 1JQFA 3I6VA 3H6WA 2XXVA 1QUKA 1CE2A 2DE2A 5CMMA 5H8HB 4QHQA 1LB8A 4KYDA 1I69A 5KDTA 3FXRA 5CMBA 5FTIA 1WDNA 1OLCA 3UK4A 1XC1A 1O63A 5EHMA 2NOOA 1MY3A 2KLFA 4QFNA 3DM0A 4I9DA 2I0CA 3K6VA 1SYHA 4NF4A 1SVXB 1J1NA 5DEXA 5AA4A 1POY1 1FQAA 5L8DA 4FORA 2OK2A 4GOTA 3S9EA 4DZ1A 3N6UA 4OFJA 3BKIB 3VFJA 2P1SA 3PPRA 3VLWA 2ANJA 4JWXA 1B5JA 2I4BA 5DVFA 5H8HA 1MQIA 1S9TA 1NNTA 1A7LA 3C31A 3OO6A 2P0SA 3LSWA 2H4IA 3H7MA 4LVQA 5AE4A 3AXFA 2REJA 4QRZA 3OELA 1B9JA 4HCYA 1PBPA 3CSGA 2ESNA 2Z8DA 3O28A 4BDOA 1Q35A 3I5OA 3S2VA 1XVXA 2HZKA 4RY1A 2Y7WA 3CI8A 3FVNA 4PFUA 3H6TA 4DXCA 2OZZA 1YTVA 5IAIA 1IIWA 3IJXB 1MXUA 1M5CA 4BDLA 4ISUA 1VSOA 1H76A 1FQBA 4NEDA 4R9FA 4JDFA 3T9UA 4F3BA 3QUJA 3LUYA 4KFQA 1VFEA 4LA9A 4RJZA 1LFIA 3H6VA 3M8UA 2F35A 1USYE 2V25A 4JB7A 1QJMA 3CRBA 2X26A 2XXQA 1MH3A 2F36A 4RYAA 3N5LA 1DPEA 2HXWA 2Z23A 4BDNA 3S9LC 3DP6A 2LAOA 2OWTA 1B0HA 2PBWA 5KZTA 2X7QA 1EZPA 5ITOA 1PB8A 3S9MC 4H5GA 3I3VA 3O29A 3IOTA 4EF1A 2GRVA 4TLLB 2QJEA 5AA3A 3MZ9A 3IR1A 1B32A 4XKRA 4EXKA 5FHOA 3B6WA 4GRKA 4OFOA 2UVGA 2QS2A 3TAJA 1D4NA 3O6IA 4YKKA 3UIFA 4RNSA 3T9HB 3HO7A 4GL0A 3S4UA 4DDDA 1A8FA 1MPBA 3MPKA 4XIGQ 3C4MA 3O97A 3HV1A 3WAEA 1B40A 3TCFA 4RK9A 4KYEA 1HSEA 2XXYA 4GXSB 2HZLA 1DMBA 2XXUA 1NFTA 1H44A 4U4XA 3HHGA 3LBSA 3KN7A 2I48A 4IO5A 3GLBA 4AB5A 3UP9A 1DSNA 3PGFA 2V84A 4ELPA 3FJ7A 4XKNA 2PX1A 1SQYA 1LFGA 3DELB 3FASA 3MBPA 4PFWA 1NKXA 4H8JA 4Z7EA 2Y7PA 2QRYA 5FHMA 2I6EA 1R9LA 3LSXA 1IXHA 2AYSA 3M3KA 2I0BA 4ZE9A 3H6UA 2PVUA 2ZNUA 3DP8A 1B51A 1SBPA 4NF6B 3FJMA 3FVKA 1OVTA 1A55A 3THIA 3IAZA 4R72A 3RT6B 2GH9A 5B7DA 4N13A 4EQBA 5JTYB 1AL3A 3MVWA 3EPEA 5H8QB 2NXOA 1P1UA 3K6UA 2O6AA 1GGGA 4LUBA 3MP1A 5ELVA 3K01A 4ELOA 2HQ0A 5CBSA 3CVGA 2CMOA 4MBPA 1OVBA 4HS7A 4FIMA 3VVDA 5TP9B 4F1UA 2VGQA 2DXRA 1NL5A 3TMGA 3FVOA 4FE8A 3MC2A 2NVUB 2DYXA 3EHSA 3C33A 1ZBMA 1RKMA 3MVXA 3CFXA 1B0LA 3WAFA 2QS1A 3TPAA 2QS3A 1Q1KA 4H67A 3JYRA 4Z0IA 3T22A 4WXJA 3C34A 1N04A 1MY1A 1MXVA 1XT8A 4ZEIA 3HCQA 3SESA 3VXBA 2F78A 4LZ7A 3MVYA 3RQTA 4TLMB 5JTYA 4R73A 2F5XA 2Z8EA 4EDPA 4XXUA 5H8QA 4LQ5A 2ALUA 1AIVA 2B65A 2DP8A 3OO8A 2BJJX 1UTBB 4OFLA 1LCFA 4P0GA 1Y1MA 4F22A 1D9YA 3TCHA 3G3GA 1LSTA 1B46A 5TP9A 1ZU0A 4O3BA 1PBQA 3GBAA 3IOUA 3KBRA 4GQOA 1RYXA 2H9BA 1HSJA 4BDQA 1SD3A 1MS7A 4EUOA 5LOMA 3VXCA 5AA2D 1SW5A 4JBZA 4K3FA 4OEUA 2O7IA 3HSTA 3OEKA 4LP2B 1QKBA 4R6YA 1VE4A 4XKQA 5EHSA 3L6GA 2WKYA 2M8CA 3RTWB 1B7ZA 2YPNA 2ZYOA 3PMXA 5IKBA 3PPQA 1S7YA 3OSRA 2VD2A 3C32A 5DT6A 4U2RA 3LC8A 3K0VA 3EHTA 3RY3A 2Y7KA 2D21A 1XHYA 3MP8A 4EXLA 3HHFA 3EF7A 3BFTA 1URDA 3KGCA 3BBRA 3MQ9A 4ND9A 1YPNA 1P1OA 3T9VA 2DVZA 1EU8A 3TKDA 3TFLA 3ODBA 4Q5TA 1EH3A 1MQGA 5ICTA 1F9BA 3R6UA 4X9TA 3K1PA 2HEUA 4KQPA 2V3QA 3U72A 4C1TA 5H8SA 3H4ZA 1JW5A 1MQDA 3FXUA 3SEVA 1EZOA 1SW1A 4GVOA 2RKMA 4DCYA 5I56A 1O64A 3TTKA 3M3FA 3DP4A 2QMXA 2XD3A 1MXWA 1MDQA 3BFUA 1IEJA 5TU0A 1UTHB 1JVYA 2PMSA 5CM6A 3HN0A 2I3VA 4LZ8A 1BKAA 3ONMA 1ELJA 1B4HA 4YB6A 1FCKA 1MY4A 3CFLA 3OO9A 4QFPA 4LONB 4DXUA 3Q28A 4G8MA 1AH5A 2DSFA 3FV2A 3K6XA 3VVFA 1MQJA 1QUJA 3PUYE 4DLDA 4KR5A 2X7PA 2G93A 3PD9A 1OMPA 2DE3A 3V8XB 1Y3PA 2OWSA 1Y4TA 2F8DA 4WEPA 5AA2B 4H1XA 1N3XA 4G4PA 1CB6A 5BUUA 3EQ1A 4PETA 1IXGA 1B3GA 1MQHA 2ZYNA 4G2ZA 5F7VA 4G68B 2FA7A 2IA4A 1B7UA 1UTHA 2V3UA 3ZSFA 2H98A 4PFYA 3PU5A 4M4GA 2O1LA 3QXMA 3TEPA 4R6KA 2OJTA 3PUXE 1D9VA 4FEDA 5M2VA 3TTLA 1WVJA 3O66A 2R6GE 4H5FA 1IITA 4O3CA 2ZYMA 1SW4A 3KN8A 4IO7A 5JK4A 4GXAA 1MM7A 4U23A 3QAXA 4IO4A 1NNKA 4QFOA 3IO4A 2Y7IA 4QSEA 3OENA 3OMBA 3TYHA 3FXQA 1I6AA 5AA2A 4GF8A 5I2KB 1QKAA 2NWJA 2R9JA 4G8HA 4NWDA 4OEVA 1NH8A 4G68A 1FTOA 3MAMA 2Q8JA 2QPQA 3EN3A 1FW0A 1H45A 4FECA 4G8NA 3F11A 2F7BA 3SETA 2QL3A 2O84X 2Q89A 2UYFA 4R6HA 2DOJA 3OOAA 3USDA 2VHAA 4OYVA 3ILTB 3IX1A 4JSOA 4F31B 5CI5A 2PYYA 3FJGA 1YCJA 3G3KA 3C9HA 4FAJA 3MWBA 4R9GA 4QF9A 3E13X 1MXYA 4GWOA 1P1QA 4PE5B 1IXIA 3V83A 4YMAA 3O6GA 1UIVA 1UQWA 4MF3A 2GHAA 3SEYA 5I59B 2UVIA 3KN3A 2DS9A 2H25A 4GFRA 2D3IA 2ONRA 4C0RA 3VLVA 2ONKE 2OCUA 3UA8A 5DYHA 3Q27A 3E4RA 2IEEA 4LQ2A 4NF5B 1SDXA 1MPCA 2F97A 1A54A 1LLSA 2HAUA 4H6DA 3ZKLA 3IO6A 4U22A 2I3WA 3MZ1A 3QUFA 2XXIA 5F1QA 2Z8FA 3SEXA 4OZ9A 4POWA 5I59A 3FVGA 2AIXA 3C36A 3IOWA 4XKPA 3PV0E 4IGTA 2Y7RA 2F6PA 4KI0E 5H8NB 4F19A 1R6ZA 1FTMA 1Y4CA 3PPNA 1BLFA 3SKPA 3Q25A 2O7UA 4I62A 2DXYA 3SEWA 3FD3A 5HBCA 4JWOA 2XXWA 2VD3A 4NF5A 1MY2A 4OTEA 1IUDA 1PEBA 1N84A 3RGYA 1MPDA 3OSQA 3LSFB 1A8EA 5I57B 1ZKBA 2XXPA 1US5A 4XTCQ 2UVHA 1FQDA 3A3CA 4NF6A 2QMWA 2RC7A 2RCAA 5H8FB 1AMFA 3U92A 3GXAA 2RF1A 3ILUB 3VDFA 1B3LA 1BP5A 2OLBA 1LAGE 3TZAA 3OD7A 2PT2A 1ATGA 4EQ7A 4H8IA 1VR5A 1O7TA 4DE8A 4ZEFA 4YU0A 4M1VA 3IOVA 3A09A 3KFMA 4OESA 3VE1B 1XS5A 3UGWA 2I4CA 1BTJA 1H3DA 1US4A 3TCGA 1FQEA 3MP6A 5ISUA 5TPAB 1MG1A 5FHNA 3ZS6A 4ZEBA 1LBCA 1IQ7A 1AOVA 4IB2A 1Y20A 2Q9TA 3CR9A 1PB9A 1NNPA 1OIBA 3CG3A 3N26A 1TXFA 2D5WA 4IGRA 4QSDA 1MH4A 3H06B 3CG1A 3SEUA 2B3BA 1II5A 4F3SA 2ABHA 1QVSA 3K6WA 2V3TA 3SDFA 1VFDA 5HM4B 5JEIA 1JVXA 1ANFA 4YICA 1GTKA 4YKJA 4EF2A 2HCAA 3KOSA 1UTBA 2DWHA 3KJTA 1B6HA 3PMVA 5HPQA 5DVIA 4FATA 1DOTA 2DQVA 4H0WA 1GR2A 1B5HA 1UIUA 2VP1A 2F7CA 2GFEA 5I84A 1JW4A 3MZBA 2Y84A 3M3LA 3T96B 2VOZA 3O9PA 4NF4B 3IK6B 4BLAA 4JSDA 1B3EA 1LAHE 1LAXA 1L5TA 3U8QA 3S9NC 3FIRA 1SW2A 4N07A 4RPNA 5A5XB 3L6HA 2XX8A 3G3HA 5I58B 5CMKA 1QW0A 4OENA 2NUVA 1LCTA 3A3UA 3QYTA 1I6QA 1JEUA 1QUIA 1LFHA 4Q30B 4F3GA 5KCJB 3RN8A 3FV1A 1NH7A 3H3GA 4PP0A 2R71A 3K02A 3IB0A 2XXXA 3UN6A 3VVEA 4Q8RA 3V5AA 1FTJA 3O6HA 3Q26A 4IO2A 1POTA 2UYEA 4QFKA 2XX7A 4ZDMA 1GVCA 1R9QA 1P99A 3E9XA 1N0TA 4I8CA 4EQ9A 3RTFB 2HAVA 4ZECA 1Z7ME 5CRYA 3VV5A 2A5TB 3FGSA 4F3PA 4IO6A 3GZGA 4HTGA 3FZVA 3P7IA 5A5XA 4E0WA 2YLNA 4YMBA 2ZNTA 5I58A 1JNFA 5DTBA 4X1BA 4POXA 3MUQA 1EZ9A 1OLAA 3FUZA 5L9SA 5J1DA 5KCJA 1FTLA 5AA1A 1USYH 1PC3A 2E0SA 4ONYA 3PUWE 5ITPA 4AB6A 2F34A 4OVJA 4DIGA 3PPOA 1DTZA 1URSA 2F7AA 3TTNA 4PFTA 2G29A 3N94A 3W15C 5DVJA 4JWYA 4R2BA 1B2HA 2Q2AA 2RINA 3Q29A 3O2AA 4BDRA 3G3IA 4G68C 1JETA 1M5FA 4YB7A 4LATA 2A5TA 4GLIA 1Y3QA 2H99A 1Y9UA 1LB9A 1YAEA 1SI1A 4JXIA 3IL1B 3DLNA 3G3JA 2O1MA 4H65A 3H03A 3KSXA 5BWJA 4U21A 4UA8A 5L9MA 4ELRA 1B1HA 3W9VA 3EHUA 1SI0A 4QSCA 3U93A 4G77A 1B1XA 1N3WA 4L17A 2H5YA 2DWIA 1B5IA 1SYIA 3G3FA 4GD5A 4RXLA 1FTKA 4F2QA 4KYSA 4OQOA 2AL4A 4YKIA 4F2OA 3TDJA 3K00A 2XXRA 5I2NB 4NTLA 2FNCA 2XD2A 3B7DA 1MXXA 2OBGA 1B3HA 3KG2A 1GV8A 1FQFA 3QIMA 4F1YA 1OQHA 2O51A 4RPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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