1OVBA

The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18kd nii-domain fragment at 2.3 angstroms resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
SYYAVAVVKKGTDFMIKDLRGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHREDIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDAKTKCLRNAPYSGYSGAFQCLKDGKGDVAFVKHTTVQENAPEEKDEYELLCLDGSRQPVDSYKTCNWARVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18 kDa NII-domain fragment from duck ovotransferrin at 2.3 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
molecule tags Iron transport protein
source organism Anas sp.
total genus 39
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-10-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovbA00
1PB9A 4JSDA 2LAOA 1SW1A 5EHSA 3PMXA 3CFZA 2NUVA 2HEUA 4KCDA 1N76A 3QAXA 2QS2A 1VR5A 2RC7A 2Q9TA 1MQHA 4LUBA 2DXRA 5JK4A 4GXAA 3VLWA 3IOTA 3QK6A 4ZS9A 3OXNA 1VFEA 3P7IA 4OVJA 4IO2A 3T22A 3MW0A 4KYEA 2DE3A 5AA2A 1LLSA 1D4NA 4LONB 4U1OA 3OD7A 3H06B 3ILTB 3T96B 5CMKA 2GHBA 2RF1A 3M8UA 5KDTB 5F1QA 1B52A 5B7DA 4LVQA 4NE4A 2XXQA 3BKIB 4C0RA 4GVOA 4WKMA 2ZNSA 2QS4A 5HBCA 1QULA 4H1XA 2VP1A 1JW5A 4ECFA 3CFLA 3O66A 3S4UA 3ZKKA 1Y20A 1MM6A 5IKBA 1FW0A 5AA2D 2R71A 5EYFA 2AIXA 3HHFA 2H9BA 5DVJA 1N0TA 3I5OA 1A7LA 2IA4A 4KHZE 1WDNA 5J1DA 1NNTA 4H8IA 5AA3A 1B6HA 2B65A 1S7YA 4IO6A 4H5FA 1NNPA 1XOCA 3FASA 4G8NA 3S2VA 3VXCA 4IO7A 1UQWA 1SVXB 3U72A 1YTVA 4KYDA 4Q8RA 3FATA 1UTBA 2XXTA 4OEVA 5H8HB 3PD9A 5KCJB 1QJMA 5DTBA 3B7DA 2O6AA 3T66A 2Y84A 2F5XA 2Z22A 1OVBA 4MLVA 4RYAA 1RYXA 4IY6A 3SEWA 3LC8A 2HQ0A 2UYEA 3CIJA 1RYOA 4JWOA 1Z7ME 3SEYA 1GTKA 2ZYNA 4C1UA 4OESA 1ANFA 3H6UA 1AH5A 3I6VA 1SQYA 3S9MC 3VV5A 3ILUB 1MXVA 4OENA 5A5XA 2XD3A 1XS5A 2Q8JA 1FQEA 4WEPA 5AA4B 1MY1A 3N6TA 2H4IA 4BDMA 2CMOA 4GL8A 5M2VA 4FEDA 3GZGA 4OFOA 4YMAA 3A09A 5L9SA 1DMBA 1B5JA 4P0IA 1B3FA 2OZZA 1GVCA 3JZJA 3RT6B 3PPQA 5AA4A 2YLNA 1SI1A 3EHTA 4UACA 5H8FA 2D21A 1IXIA 4YICA 4OYVA 2RC8A 4F2QA 3SDFA 4OEUA 4R6YA 4LA9A 1OVTA 1HSJA 1HSEA 4F3SA 5JTYB 4G8MA 4EXLA 1MG1A 4KD5A 4LZ5A 4GWOA 5HM4B 2HFBA 3PPNA 2OJTA 2O1MA 1IITA 4X48A 3PUWE 2A5TB 1M5BA 3H6TA 4OHNA 1NMUA 1O63A 1IXHA 4K3FA 1A99A 4QF9A 3EHUA 2Z23A 3DM0A 1PBPA 1AIVA 2VOZA 4U4XA 2DVZA 1TXFA 3LSFB 3K6WA 4GXSB 3HHGA 1OQGA 4I1DA 4ZE8A 2PVUA 4ZEKA 2PT2A 3GBAA 1JW4A 1BIYA 1PEBA 2XXRA 2R9JA 1US4A 4GD5A 4FJPA 4ZEDA 3HCQA 1LCFA 2QPQA 4DCXA 4MFIA 3MVXA 1LBCA 3QUFA 3SEXA 4PETA 4ELOA 2PBWA 2XXIA 2GFEA 1LAHE 1B05A 1AL3A 3PD8A 1FTMA 2DWHA 4F22A 3Q27A 1NH8A 5ELVA 3E9XA 4R73A 1GGGA 3K6VA 1Y1MA 3ZKLA 4NF6B 1ELJA 4O3AA 4R75A 4YU0A 1D9VA 4GLIA 3S9LC 4C1TA 2I4CA 1GR2A 1ZKBA 4PP0A 3K02A 5DVFA 3EN3A 3GBBA 1FTJA 4EF1A 2O68A 3K1PA 3MP6A 3LSWA 4ONYA 2DE2A 2OCUA 3OMBA 4RK9A 4KFQA 1MQIA 3C9HA 3A3UA 3MZ9A 3M3KA 2XHDA 1WVJA 2RKMA 4DIGA 1B9JA 3B6WA 3M3FA 2B3BA 1JEVA 2G29A 1R1NA 4F39A 1H44A 2HZLA 2PYYA 3KOTA 4HCWA 4U1ZA 3TQLA 3QYTA 2PMSA 4AB6A 4GRKA 1M5CA 2ONKE 4G77A 4F18A 3VE1B 3MVWA 3H3GA 5IAIA 4ZZAA 3DLNA 3GLBA 3C31A 2XX9A 4F19A 3M3LA 4OMBA 3IJOB 2HXWA 1PBQA 1FTLA 1IXGA 4BDRA 5FHOA 4F3BA 3LSLA 3PPRA 3D4CA 3MP1A 4FEBA 3H6WA 4XKQA 3K01A 1UIUA 5H8SA 1LGBC 3CI8A 3TCFA 4FIMA 4F1UA 2O51A 3ONMA 3KBRA 3UK4A 3KSXA 1AOVA 2F78A 2P1SA 1MQJA 4QFNA 3VLUA 3UIFA 5ITPA 2V3QA 4Z7EA 1OQHA 3K6UA 3H4ZA 2VD3A 4XKPA 2OWTA 4YB5A 4G68B 4R9FA 4IO4A 2I0BA 4YKPA 4OZ9A 4ELPA 4O3BA 4TLLB 4XKNA 2P2AA 4QFPA 3H7MA 1SBPA 3EQ1A 3GXAA 2ALUA 1D3KA 1JEUA 4NWCA 2HCAA 1Y3QA 5I58B 1NFTA 2F35A 3FV1A 2Y7KA 2F97A 3C33A 3RLFE 3MBPA 3A3CA 3V5AA 1QVSA 3U93A 5CBRA 4YKJA 1DTGA 2F7CA 2ZYKA 4GQOA 4OETA 2R6GE 1N7WA 4IO3A 3KGCA 2F34A 3D4GA 2REJA 4OFLA 3O2AA 4ELRA 2O69A 4P0GA 3MAMA 1YCJA 3RTWB 1T0KA 5ISUA 3QXMA 1M5FA 3T9HB 1QUIA 3KN7A 1IUDA 3W9WA 3U94A 4ZDMA 4ZZEA 2GH9A 5KDTA 5H8NB 1J1NA 3MZ1A 4TOZA 3ECRA 1OLAA 4L17A 2DP8A 1XHYA 3MPKA 1B5IA 4NF4B 3BBRA 4I8CA 2PX1A 3UA8A 1MPDA 4N13A 1FTOA 3K6XA 3PUVE 2ABHA 5I84A 5TPAB 1FQCA 1LAGE 1B7UA 1N3XA 3TTMA 1I6QA 1BTJA 2Z8EA 3FGSA 3IOWA 2W7YA 3ZSFA 2E1SA 1QKAA 3TYHA 4RPNA 5H8NA 1MQGA 4KI0E 5FHNA 3PU5A 4NMYA 1ZLQA 3PGFA 4U23A 2V3UA 3RUMA 1ATGA 3IO4A 4ZEIA 3FUZA 3MP8A 4HW8A 3L6GA 4MF3A 3C35A 3W15C 1MY0A 3USDA 1LAFE 4Z0IA 4JB7A 3TTKA 4M4GA 3V89B 3R7XA 4DDDA 1SDXA 2UVHA 1VSOA 3KG2A 3ODBA 2XXPA 4OWDA 1EH3A 1B1HA 2D5WA 2XXVA 1I6AA 1Y9UA 3N6UA 1MQDA 2Y7IA 3MWBA 3RTFB 3T9UA 5H8HA 4ESXA 4FECA 5KCJA 4YB6A 1UIVA 4YZZA 1ZIUA 2THIA 1MS7A 3OOAA 5CBSA 1M5DA 2H99A 3TMGA 1IIWA 2OK2A 4LZ7A 4F2OA 4ND9A 1MPCA 2I3VA 2O84X 1B58A 2F8DA 3FIRA 2A5SA 3JV9A 2F36A 3H6VA 4IGRA 4DXBA 5BUUA 3CG3A 2IEEA 2NWJA 2X7QA 2F6GA 3MVYA 2DWAA 1B51A 4F3PA 1DOTA 4FORA 3KFMA 1SW2A 4GIZA 3FVNA 4I62A 2UVGA 3HSTA 4RA1A 3G3IA 4MBPA 1ZU0A 2I49A 1A40A 1R9QA 3TZAA 2DQVA 3Q29A 4THIA 3B6QA 4E0WA 4TLMB 4XTCQ 2OLBA 3TCHA 2VHAA 3TAJA 3PMWA 3RPWA 1SI0A 3E4RA 5AA1A 1Y1ZA 1FQFA 5I57B 4JDFA 5L9OA 1P1OA 1IXCA 1DSNA 3QUJA 4QFKA 5B70A 2O7UA 1HSLA 1ZTYA 2UXAA 1FTKA 3IB2A 3KSJA 3OO6A 5ICQA 3SETA 2PT1A 3N94A 2Y7PA 3AXFA 5JTYA 1UTHB 3V83A 3KOSA 1LBBA 4PFYA 1BLFA 3IOVA 4P11A 1TFAA 1LAXA 3CRBA 4NF5B 3CSGA 5JEIA 2A5TA 2AYSA 1Y4TA 2Z8FA 3TQWA 1MM7A 1LCTA 2I4BA 3OO8A 2YPNA 1PDAA 1MPBA 3MVZA 1S50A 3O28A 2ONSA 3G7WA 2ZXTA 3MPLA 2OWSA 3PMVA 4NF8B 5I59B 1EZOA 2ANJA 3O6HA 2ZYMA 2V93A 2HAVA 2XXYA 2DS9A 3Q25A 4U4SA 3MC2A 1Q35A 2DVCA 3VVFA 3CR9A 3JYRA 4IB2A 2XX8A 4H67A 4KCCA 3RY3A 2WKYA 4ZEFA 3IL1B 1O7TA 4KPTA 1MH3A 3MQ9A 4X9TA 5DEXB 1NNKA 3OEKA 3KN8A 3UGWA 2ZNTA 1RKMA 1JVXA 4R9GA 3DP4A 5I2NB 1IZ1A 1SW5A 3TFLA 3I3VA 1N3WA 2YJPA 2DE4A 2H98A 4F3GA 4NF6A 2H25A 3IR1A 4H6DA 2F6PA 2QS3A 2FYIA 1ZJLA 3N5LA 1Z7NE 5I2KB 4N07A 4GL0A 4DCYA 2I48A 4POWA 4QHQA 3FXQA 1VFDA 1L5TA 3V8XB 2XXWA 3FJMA 5HPQA 1A55A 3IK6B 1MXYA 2G93A 3IO6A 3RT8A 1B40A 2RINA 4GOTA 3PUZE 4R6KA 1JNFA 3SKPA 5CRYA 3TCGA 4KYSA 5CC2A 1S9TA 1QUKA 5K2XA 1OMPA 1TWYA 1LB8A 1OIBA 3PUYE 2X7PA 2UVIA 3H03A 3SERA 4ESWA 1OLCA 4GF8A 3OENA 4XXUA 4MLQA 4U22A 3LUYA 2QJEA 5CI5A 2NXOA 1B3EA 2B3FA 1B7ZA 1B3GA 1DPPA 3WAEA 3OSQA 4EQ7A 1TT1A 2XXXA 3E13X 1WODA 5DVIA 3CG1A 1MDP1 2Z8DA 3IJXB 1N7XA 4JWXA 1GV8A 4AQ4A 2AL5A 3DP6A 3IB1A 2RCBA 1P99A 1FQDA 3FVOA 3UP9A 1BP5A 1URGA 3O29A 2VD2A 5CMMA 1QW0A 3OSRA 3SEVA 1B32A 1O64A 2FNCA 4QFOA 1SW4A 1F9BA 4YAHX 3G3HA 5AA2B 3TTRA 1TFDA 4LP2B 3B6TA 2GHAA 3CVGA 2Q89A 4POXA 5I56B 2ESNA 3IOUA 1H3DA 1H43A 4G68A 5AE4A 5H8QB 4LATA 4N6PA 3TTLA 3IAZA 4G4PA 2NOOA 1PC3A 4PQJA 5CM6A 4JBZA 1CB6A 4H8JA 5I58A 1US5A 1MXZA 4X1DA 5I56A 1I69A 3IORA 4YKIA 5H8QA 1CE2A 1B4HA 4Q30B 3UORA 4DZ1A 4MH5A 1VE4A 4R6HA 1Q1KA 2Q88A 3FXUA 5F7VA 4KQPA 5TU0A 3S9NC 1USYH 5KZTA 3VVDA 3R6UA 1NL5A 3RQTA 4OFJA 4R72A 5FHMA 1SYIA 4QRZA 4ISUA 1BKAA 3MJNA 4U2RA 1MH4A 1UTBB 3KJTA 4OQOA 3PPPA 3C36A 4NF4A 1MRPA 1LFGA 4H65A 4G2ZA 4WEDA 5TPAA 3KJ7A 4H5GA 4LQ2A 1B0HA 3FJ7A 1P1NA 5DYHA 1IQ7A 2I3WA 1USYE 3TKDA 4JXIA 2DSFA 1M5EA 4RXLA 5LOMA 3O9PA 2V84A 1DTZA 3CFXA 1MDQA 3R26A 5CMCA 4BLAA 1ZMGA 4F1YA 4E0XA 3WAFA 3FZVA 3KEIA 1JETA 1LFHA 1B46A 4GFRA 4RPOA 5A5XB 2DYXA 1NH7A 3K00A 4EDPA 3DP8A 4HTGA 5BWJA 4XKRA 2Q2AA 1ZBMA 2D3IA 4PFUA 4Q0CA 4M1VA 3G3JA 4EUOA 3OO7A 4RY1A 1NKXA 4H0WA 4IO5A 1MY2A 2ZYOA 3HO7A 2REGA 2ONRA 3VDFA 2E0SA 2Y7RA 4PE5B 3O97A 3RNNA 4R2FA 1QKBA 5H8FB 1JW1A 3K2DA 4FAJA 3EF7A 1AMFA 1A54A 1B3HA 2DXYA 2QS1A 1SD3A 4XIGQ 1LB9A 2XXHA 1Y3PA 4EQBA 3C4MA 3SEUA 2BJJX 3EPEA 1B4ZA 3BFTA 2V3TA 4RK2A 3KZGA 4ZECA 1H45A 3K1MA 3VFJA 4HS7A 3IX1A 3F11A 4NWDA 1JVYA 4QSDA 1R6ZA 4ZE9A 1YPNA 2FA7A 1EZPA 3L6HA 4QFLA 3FJGA 3UN6A 3EHSA 1XVXA 4IY5A 4OTEA 4WXJA 3CSBA 3FVKA 1MY4A 1B2HA 2QSXA 4BDLA 4JWYA 2F7AA 1A8EA 4DXUA 5K2YA 3FV2A 1LSTA 1LFIA 3TODA 4I9DA 4BDNA 5I57A 1B7HA 1FCKA 3MZBA 4F29A 3T9XB 3MUQA 4F1VA 4KR5A 3VLVA 4YMBA 3TUSA 4HCYA 3RN8A 4G68C 1N04A 1POY1 3T9VA 4Q5TA 1N84A 2DWJA 1D9YA 4QSEA 4LZ8A 4FATA 2H5YA 1UTHA 2O7IA 3C32A 3TTNA 1JQFA 2GRVA 2ZNUA 2RC9A 2QMXA 5L9MA 4IGTA 4F31B 2O1LA 2QMWA 2QRYA 4NF5A 4OXVA 3LR1A 1NNFA 2DOJA 3Q26A 2RCAA 3LSXA 4JSOA 4NEDA 4RNSA 4DE8A 3PPOA 2X26A 3K4UA 1H76A 4YB7A 2VGQA 3E3KA 3SESA 3VXBA 1MY3A 3N26A 5I59A 4NF8A 2AL4A 3S9EA 4R74A 3G3GA 3FXRA 2HAUA 1POTA 2V25A 3U92A 4BDOA 3PV0E 3QIMA 3K0VA 4FE8A 1P1WA 1B5HA 2CZLA 3QSLA 1R9LA 2XXUA 4EXKA 4TQUQ 4DXCA 3OEMA 3DELB 4U21A 1P1UA 2KLFA 4O3CA 2I58A 1DPEA 4EQ9A 1QUJA 2M8CA 3OELA 5DEXA 3BFUA 3O6IA 3FD3A 4ZEBA 1B1XA 5ITOA 1KWHA 4UA8A 4LQ5A 5I2NA 1B0LA 3K1NA 3Q28A 1FQAA 1URSA 1I6BA 4NTLA 2XX7A 3HN0A 3KN3A 4DLDA 1MXWA 1PB7A 1FQBA 1Y4CA 5CMBA 2I6EA 1XT8A 5TP9B 3HV1A 5DT6A 1P1QA 1EU8A 4G8HA 2NVUB 5I2KA 3RGYA 5FTIA 1YAEA 3FVGA 3TELA 1Y3NA 4RJZA 3G3KA 1MXUA 1MXXA 3OO9A 2F7BA 5TP9A 3ZS6A 1IEJA 3O6GA 4BDQA 3T93B 3G3FA 1A8FA 2ZMBA 2QL3A 4AB5A 1II5A 4PFTA 2XD2A 3THIA 1B3LA 2UVJA 1XC1A 2UYFA 1PB8A 2OBGA 2Q2CA 4QSCA 3TDJA 3TEPA 3C34A 4R2BA 4ELQA 2Y7WA 3PUXE 3U1OA 1XVYA 1EZ9A 3IB0A 4PFWA 5EHMA 2HZKA 3TPAA 3U8QA 3LBSA 1URDA 4OERA 2DWIA 4EF2A 5ICTA 5FTHA 4YKKA 5L8DA 1SYHA 3VVEA 4X1BA 2I0CA 3HPIA 2P0SA 3W9VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1AH5A 3I6VA 1SQYA 3S9MC 5ET5A 3VV5A 3ILUB 1MXVA 4OENA 5A5XA 2XD3A 2Y5LA 4X04A 1XS5A 2Q8JA 1FQEA 4WEPA 5AA4B 1MY1A 3N6TA 2H4IA 4BDMA 2CMOA 4GL8A 5M2VA 4FEDA 3GZGA 4OFOA 4YMAA 3A09A 5L9SA 1EYKA 1DMBA 1NV0A 1B5JA 1IMAA 4P0IA 1YXIA 4G61A 1B3FA 2OZZA 1GVCA 3JZJA 3RT6B 3PPQA 5AA4A 2YLNA 1SI1A 2KR0A 3EHTA 4JVDA 4UACA 5H8FA 2D21A 1IXIA 4YICA 4OYVA 2RC8A 4F2QA 3SDFA 5LTCA 4OANA 4OEUA 4R6YA 4LA9A 4MHFA 1OVTA 3QMFA 1HSJA 1HSEA 5JTYB 4F3SA 4G8MA 4O94A 2P3VA 4EXLA 1MG1A 4KD5A 4LZ5A 4GWOA 5IGAA 1NUYA 5HM4B 2HFBA 3PPNA 2OJTA 2O1MA 1IITA 4X48A 3PUWE 2A5TB 1M5BA 3H6TA 3KC1A 4OHNA 1INPA 1NMUA 1O63A 1IXHA 4K3FA 1A99A 4QF9A 3EHUA 2Z23A 3DM0A 1PBPA 1AIVA 2VOZA 4U4XA 2DVZA 1TXFA 4PAFA 4P3LA 5IM2A 2ZZVA 3LSFB 1NV1A 3K6WA 4GXSB 3HHGA 1OQGA 3U65A 4I1DA 4ZE8A 2PVUA 4ZEKA 2PT2A 3GBAA 1JW4A 1BIYA 1PEBA 2XXRA 4AS4A 2R9JA 1US4A 4GD5A 4FJPA 4ZEDA 2WBDA 3HCQA 1LCFA 2QPQA 4DCXA 4MFIA 3MVXA 1LBCA 3QUFA 3SEXA 4PETA 2FIXA 4ELOA 2PBWA 5F24A 2XXIA 2GFEA 4PFIA 3NOHA 1LAHE 2FIEA 1B05A 1AL3A 3PD8A 1FTMA 2DWHA 4F22A 1IMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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