1OVTA

Refined crystallographic structure of hen ovotransferrin at 2.4 angstroms resolution
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
682
structure length
682
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of diferric hen ovotransferrin at 2.4 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
molecule tags Iron transport protein
total genus 203
structure length 682
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovtA03
2F6PA 2X7QA 2Q2CA 3B7DA 3PD9A 2AIXA 4KYEA 4RK2A 1ZBMA 3OSRA 2REJA 3QIMA 1B5HA 2HZKA 2R6GE 4KYDA 3K6WA 1PB9A 2I3VA 4U4SA 5H8HA 3CFLA 4EXLA 3GBAA 2CMOA 3FXRA 1LLSA 3MJNA 4WXJA 3CVGA 1FQEA 2Y84A 1AOVA 3MC2A 2UVGA 3CSGA 5HBCA 4RPNA 1M5DA 3ZSFA 5J1DA 1ZTYA 3UK4A 3QUFA 1R9QA 4U22A 4R72A 5L9OA 2DP8A 2XXPA 2UVHA 1B2HA 1XVXA 4H5FA 5I2NA 1TXFA 4YICA 3JV9A 1P99A 3UIFA 4H8IA 3EPEA 4DXCA 5IKBA 5K2XA 3C32A 4ELRA 2XX7A 3OO6A 1LAHE 5F1QA 1LAXA 1UQWA 3U1OA 1LBBA 4R6HA 3MQ9A 4IB2A 1PC3A 1H76A 2HAVA 1A8EA 1NL5A 5DEXB 2F7CA 1CE2A 3V83A 4E0WA 1QKBA 3O97A 3U92A 3E9XA 1B1XA 1MG1A 3OEKA 4EQBA 4XKRA 3TKDA 1FQBA 3MVXA 2O1MA 5JK4A 1SI0A 2F35A 4IY5A 2Z8EA 4LZ5A 4DE8A 3VXBA 3FGSA 1GR2A 4DIGA 3RQTA 4O3CA 3N6UA 3MPKA 4X9TA 4ZEKA 4R9FA 2D21A 1B0LA 2O1LA 3O66A 1VE4A 1LFHA 4ELPA 3RTWB 1UTBA 1XOCA 1A40A 3QAXA 4Q30B 1DSNA 1B9JA 1MQIA 3FV1A 1B1HA 3IB1A 3I5OA 4OFJA 3TCGA 3C34A 3O2AA 4KQPA 4QFKA 2ABHA 3PD8A 3KN3A 1FQDA 5HPQA 3S9LC 3K6UA 4U2RA 1FTKA 3ODBA 3TTLA 4IGTA 1BTJA 3V89B 4M1VA 3O28A 5KZTA 3C31A 3H03A 5TPAB 4DDDA 5ITPA 4OEUA 3R6UA 2OWSA 3MW0A 4L17A 3T66A 2G29A 4EUOA 2I48A 2Q9TA 2Y7KA 1GGGA 1Y4CA 1POTA 5I2NB 4WEDA 4NWCA 4C1UA 3CR9A 3VE1B 1Y3QA 4UACA 4F3GA 1MXUA 4ZEDA 4JB7A 1MQHA 3V5AA 4YMAA 3OEMA 2RC9A 5CC2A 4F1UA 3KSXA 1B51A 3M3FA 4R6YA 2UYFA 2Z22A 4NF4A 2XXYA 1MY4A 1B3HA 4OFLA 4WEPA 2PVUA 4XTCQ 1D3KA 2ZYOA 1Y3PA 3SESA 4ZEFA 1MXYA 3UGWA 4MF3A 3E4RA 4ZE9A 4U23A 2HZLA 1P1OA 2D5WA 4NE4A 4KI0E 2RCBA 3IJOB 2VP1A 4NWDA 1SYIA 1SD3A 3G7WA 4F2QA 1B0HA 2QRYA 2Y7IA 4XIGQ 4F31B 4BDLA 3B6TA 4BDQA 2THIA 5KDTA 5FHNA 1UTBB 3RUMA 2YLNA 1Y4TA 3FD3A 1SBPA 1JNFA 4MLQA 4Q0CA 5AA3A 1MXXA 4KHZE 2M8CA 3IOVA 3VVEA 5BWJA 4YZZA 4HCYA 3T96B 4EF1A 2NVUB 3GBBA 1VFDA 4ECFA 1TWYA 3K0VA 3L6HA 2RINA 4GWOA 2DSFA 3HPIA 4TLMB 4OWDA 1B3GA 5I59A 4QSCA 4YB6A 3MUQA 2OWTA 2VD2A 3DP8A 4OMBA 2ONRA 3PV0E 1AH5A 1I69A 4NF6A 2X26A 3FASA 1MPCA 1MY3A 5I56A 1QULA 1IXGA 4RK9A 2I4BA 4JWXA 4ZZEA 4IO4A 1NH7A 1N7WA 2CZLA 3FUZA 4OHNA 4NF5B 3W9WA 1FTLA 1SW4A 4YU0A 4NF4B 2F7AA 2XX9A 4RXLA 4R75A 3DP4A 1XC1A 4DLDA 4ZDMA 4IO5A 3OO9A 3LUYA 3T9VA 5M2VA 3DM0A 3PUWE 4POXA 4NF8A 4PQJA 1B7HA 1MY1A 5DTBA 1US4A 4ZEIA 1IIWA 4OETA 3GZGA 5CI5A 1N04A 3TAJA 1QJMA 1H45A 3N26A 4MFIA 1WODA 1MH4A 1P1NA 2XXRA 2B3BA 2OJTA 1B4HA 1JW5A 1LSTA 3WAFA 2V93A 3PPQA 3H06B 4G8MA 2QS2A 1NKXA 1Y1MA 1L5TA 2P2AA 4OESA 3SETA 3K00A 5ICTA 4GQOA 3KN7A 2DWJA 4ELQA 4Q8RA 4YKKA 3SEUA 1FCKA 2PBWA 3TTKA 4YB7A 4GOTA 2UVIA 1DTGA 2YPNA 3M3KA 1N7XA 5FTHA 3T22A 4FE8A 2I49A 4XKPA 5FHMA 1SDXA 5L9SA 4GXAA 2H9BA 4Z7EA 4H6DA 3RN8A 5I56B 3MZ1A 3H3GA 3PMXA 1AIVA 1IXCA 2UVJA 4PP0A 4OTEA 4Q5TA 1A99A 3PGFA 3HHFA 1M5FA 2DYXA 1UIVA 3FVOA 3RPWA 3Q26A 1D9YA 1MM7A 2LAOA 3IL1B 4KD5A 1XVYA 3PUXE 4FJPA 3TODA 1A7LA 4G68B 4F18A 4FAJA 1QVSA 1YTVA 3JZJA 2HAUA 3K02A 1QUJA 4U1OA 2QS1A 3OENA 3TMGA 1GTKA 3K6XA 4X1DA 1OQHA 3KJTA 4F3PA 1B4ZA 1XHYA 1R9LA 3TELA 4GFRA 5A5XB 4ELOA 3IK6B 3L6GA 2H5YA 1QUKA 2PYYA 3KSJA 5TU0A 2REGA 5I57B 2D3IA 1WVJA 1LB9A 1LAGE 1M5BA 4QFPA 4QSDA 1QUIA 3K4UA 3EQ1A 3K1PA 3S9NC 5ELVA 3O9PA 3FJGA 4ONYA 3UN6A 2XXUA 4EQ7A 2E0SA 3LSLA 2R9JA 2A5TB 3CIJA 3TPAA 4P0IA 4N13A 3BFTA 2Q8JA 4XKQA 3RT8A 3FATA 2G93A 2Y7PA 4LQ2A 1R6ZA 3EN3A 2R71A 3O6HA 1WDNA 3Q28A 4POWA 3TFLA 3HN0A 4FEDA 4OFOA 5KCJB 1OLAA 1VSOA 3A09A 1FQCA 1JEUA 5L8DA 1ZU0A 3FJMA 3U94A 4DXUA 1CB6A 3TYHA 4HTGA 1SW1A 1YCJA 4MLVA 1BP5A 3RGYA 2XXWA 4F2OA 5CRYA 4PE5B 2DS9A 4JWOA 1FW0A 4H1XA 4I62A 5CMKA 3IX1A 3OXNA 3I3VA 3MVWA 4KYSA 5H8SA 2O6AA 2NUVA 3BKIB 3FVNA 5H8HB 1LBCA 5EHMA 1NH8A 4BLAA 1HSJA 4OEVA 4TQUQ 4P11A 3LBSA 4YMBA 1ZMGA 2FA7A 2DVZA 1URDA 3CI8A 3MVYA 3IORA 3N6TA 1A8FA 3H4ZA 2DE2A 1MY2A 4ESWA 3TUSA 3GLBA 1B40A 1A54A 4ISUA 4LUBA 2RF1A 1EU8A 4LA9A 1MDP1 3VVDA 2F97A 3OOAA 1JETA 3H6UA 1B32A 1Y20A 4QSEA 4NMYA 2B65A 3C4MA 5AA2D 3UA8A 4R73A 1IUDA 1S7YA 1MXZA 3TDJA 2OBGA 3SKPA 2P1SA 2F34A 2QJEA 1EZPA 1O7TA 5H8FA 1SYHA 2W7YA 1ANFA 5H8NA 1OMPA 1IXHA 4X48A 4G77A 3SDFA 1LGBC 4X1BA 1MXWA 4JSOA 1DPEA 4PFWA 3FVGA 4ZE8A 4THIA 1RYOA 3PMVA 3KN8A 4RYAA 3GXAA 1I6AA 3DLNA 2DWIA 1PB7A 4YKJA 2F78A 5B70A 4K3FA 1KWHA 1NNTA 3UORA 4WKMA 1ATGA 1MXVA 5K2YA 5H8QA 3EHSA 3PPOA 5L9MA 3PPPA 1H44A 4IO2A 5I2KA 4LZ7A 2GFEA 3AXFA 4KFQA 1DPPA 3VVFA 2Z23A 5FHOA 3MAMA 3U8QA 1P1QA 4RA1A 1NMUA 3P7IA 2DE3A 3ILUB 3G3KA 1BIYA 1JQFA 3S2VA 1DMBA 5DT6A 3RTFB 1JW1A 3IAZA 1B3FA 1Y9UA 1OIBA 3MBPA 2A5SA 3CFZA 3C9HA 5EHSA 4U1ZA 2UXAA 2HEUA 3E3KA 3JYRA 4O3BA 3C36A 5AA4A 3EHTA 3FIRA 5CM6A 1TFDA 4ESXA 2Z8FA 3H6WA 3CG1A 1MRPA 5JTYA 2XXXA 1VFEA 1EZOA 2V25A 4F1VA 4KR5A 3FJ7A 1NNPA 5DVJA 1N3WA 1B52A 5AA2A 4PFUA 5AA1A 1SI1A 4LONB 1XT8A 2VD3A 2YJPA 2OZZA 2ZNUA 4FATA 2QL3A 2XD2A 3KBRA 2ZMBA 3TEPA 4MH5A 1MQJA 4JBZA 3K6VA 3T9UA 4ND9A 5H8FB 5TP9A 4E0XA 5I58A 5IAIA 2DWHA 3PMWA 2XXVA 3BFUA 4KCDA 4PFTA 2XHDA 1RYXA 1D9VA 5LOMA 2PMSA 3ILTB 4ZECA 4G8HA 2PT1A 4LQ5A 2H98A 2OLBA 1OVTA 2V3QA 2HXWA 3TQWA 2ESNA 4YB5A 1I6BA 3TQLA 1MDQA 5CMMA 1M5CA 3D4GA 4QFOA 3FXQA 3Q27A 5H8QB 5ISUA 5KDTB 1IQ7A 2XXHA 4DZ1A 3KFMA 3LC8A 2O7IA 3KEIA 4R2FA 1NNKA 2Y7WA 3K01A 4LZ8A 1MS7A 4OENA 2I0BA 4GF8A 3C33A 2O51A 4R74A 4KCCA 1NNFA 1Q35A 3SERA 4HS7A 1B7ZA 2H99A 1LB8A 2HFBA 1HSLA 3TCHA 3LSXA 5JTYB 5I59B 4F22A 3VFJA 1GV8A 5F7VA 3QK6A 3IOWA 2IA4A 4PFYA 4EQ9A 4IY6A 3VV5A 3HSTA 4NF6B 3S9MC 4R9GA 3VLWA 1QW0A 1B6HA 1MM6A 1LCFA 1XS5A 2ZYNA 3K1NA 3TTRA 2ALUA 3DP6A 5DEXA 2I58A 2VGQA 4P0GA 3K2DA 3CG3A 5AE4A 1H43A 1I6QA 2QS4A 1OLCA 4DCXA 4XKNA 1UTHA 4OXVA 5I58B 3OMBA 2O68A 4DXBA 1LCTA 4H67A 4ZEBA 3A3CA 4QFNA 2O7UA 3EF7A 5DVFA 1S50A 3IB2A 2FYIA 3EHUA 3ONMA 4NF8B 2NXOA 4H5GA 3M8UA 3IO6A 3MVZA 4YAHX 1SQYA 4LATA 4NEDA 3KGCA 2QMXA 3OD7A 2I0CA 3U93A 1O63A 5I84A 4QHQA 4GL0A 2X7PA 2QPQA 3MP6A 4QRZA 2ZYKA 5TPAA 4YKIA 3RNNA 3MP8A 1UIUA 3H7MA 3IR1A 1US5A 1Z7ME 4G68C 3PUYE 4RJZA 4TOZA 4F3SA 2OCUA 4OZ9A 3OSQA 4G8NA 3S4UA 4ZS9A 4RY1A 4GRKA 3G3IA 3C35A 3OELA 1MPBA 5CMCA 1SW5A 3W9VA 4F19A 1ZIUA 2VOZA 1JVYA 2PT2A 3N5LA 3ECRA 1FTJA 1P1WA 1AL3A 3RLFE 4M4GA 1MQDA 3FVKA 1FTOA 2UYEA 3OO7A 1JW4A 3E13X 2KLFA 3H6VA 4GLIA 3G3HA 1B46A 4I8CA 3KG2A 4FORA 3PU5A 2ZXTA 4BDMA 1FQFA 2DOJA 1UTHB 3M3LA 1SW2A 4G2ZA 4OVJA 1FTMA 4LVQA 1O64A 3IOTA 4UA8A 3I6VA 3N94A 5ITOA 3T9HB 2F8DA 2RCAA 3VDFA 1AMFA 3ZS6A 1HSEA 2I3WA 3LSWA 1IXIA 2ONKE 4IGRA 1POY1 4BDNA 4XXUA 3KZGA 4N07A 4U4XA 3S9EA 3VLUA 4C0RA 3FV2A 3B6QA 3R26A 4F29A 2GH9A 4IO6A 3CRBA 1FQAA 1PB8A 2BJJX 4GXSB 3IJXB 1A55A 2ZNTA 4LP2B 2XD3A 2RC8A 4I1DA 1VR5A 4IO3A 3O29A 3VLVA 1IEJA 3HO7A 4JDFA 1ZLQA 2RC7A 2XXQA 5DVIA 3MPLA 2XXIA 3PPRA 3F11A 3T9XB 4G4PA 1N3XA 3ZKKA 1GVCA 1N84A 2Q88A 4H65A 1D4NA 1RKMA 1MH3A 3IOUA 3KJ7A 2GRVA 1N0TA 2FNCA 1LAFE 4GIZA 1PBPA 3K1MA 3PUZE 4NF5A 4DCYA 4H8JA 5DYHA 3HCQA 2P0SA 3HV1A 1B3EA 2B3FA 4YKPA 5FTIA 1II5A 1PEBA 4AQ4A 1J1NA 2WKYA 4RPOA 2O84X 1T0KA 1DTZA 1DOTA 4BDRA 1B5IA 4OERA 2QSXA 4KPTA 5JEIA 1QKAA 4O3AA 1LFIA 5CMBA 2GHAA 4AB6A 4EDPA 2VHAA 3QSLA 2F6GA 2F5XA 1URSA 3TTNA 3A3UA 4F3BA 5EYFA 2F36A 5B7DA 3OO8A 4ZZAA 3THIA 2IEEA 2O69A 1B58A 1JEVA 3U72A 3H6TA 4FIMA 2AL4A 1BLFA 4BDOA 3V8XB 2ONSA 3SEXA 2H25A 4NTLA 4FECA 3B6WA 2QMWA 1M5EA 2H4IA 2DXRA 1ZKBA 1F9BA 1PBQA 2E1SA 1ZJLA 2V3TA 3G3JA 3UP9A 4JXIA 2V3UA 1OVBA 2PX1A 4PETA 5HM4B 5BUUA 1B5JA 4QFLA 3ZKLA 4FEBA 1IZ1A 3FXUA 4OQOA 1YAEA 3Q25A 2DVCA 1USYH 3QYTA 2XXTA 3T93B 4R2BA 4U21A 3HHGA 1P1UA 4Z0IA 4EXKA 4EF2A 5H8NB 3IO4A 4IO7A 3O6GA 2NWJA 2F7BA 4H0WA 1Y1ZA 1IITA 4GL8A 3QUJA 2NOOA 2DE4A 3G3GA 1Z7NE 2V84A 5CBSA 4RNSA 4HW8A 2GHBA 3W15C 4G68A 4HCWA 3CFXA 2DQVA 4AB5A 2Q2AA 2AL5A 3D4CA 3MZ9A 4OYVA 1TT1A 1R1NA 3LSFB 1SVXB 4C1TA 3IB0A 2I4CA 5I2KB 1N76A 1MPDA 1JVXA 2AYSA 5A5XA 2DWAA 3KOSA 1B7UA 1USYE 3LR1A 5I57A 3MP1A 1MY0A 3SEYA 1NFTA 4N6PA 3MWBA 3TCFA 5AA4B 2HCAA 3QXMA 4F39A 2QS3A 2OK2A 3BBRA 2Z8DA 2I6EA 4I9DA 1YPNA 1B05A 1EZ9A 3RY3A 3SEVA 4R6KA 2ZYMA 4MBPA 1MQGA 1URGA 2A5TA 3MZBA 3VXCA 4F1YA 2ANJA 1BKAA 3TZAA 5CBRA 3FZVA 3USDA 1TFAA 4JWYA 4JSDA 5AA2B 3WAEA 3PPNA 3SEWA 1OQGA 1Y3NA 1LFGA 3O6IA 2ZNSA 5KCJA 1EH3A 2XX8A 3CSBA 3DELB 4TLLB 3R7XA 1B3LA 2DXYA 2Q89A 2HQ0A 4GVOA 3G3FA 5TP9B 4GD5A 3KOTA 2RKMA 5ICQA 3Q29A 4QF9A 1Q1KA 1ELJA 3PUVE 3RT6B 1H3DA 1S9TA 1PDAA 2Y7RA 3TTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F6PA 2X7QA 2Q2CA 3B7DA 3PD9A 5I5PA 2AIXA 4KYEA 4RK2A 1ZBMA 3OSRA 2REJA 3QIMA 1B5HA 2HZKA 2R6GE 4KYDA 3K6WA 3T1BA 1PB9A 1SPIA 2I3VA 4U4SA 5H8HA 3B50A 3CFLA 4PTKA 2XWVA 4EXLA 3GBAA 2CMOA 3FXRA 1LLSA 3MJNA 4WXJA 3CVGA 1FQEA 2Y84A 1AOVA 3MC2A 2UVGA 2B4MA 3CSGA 5HBCA 1FPEA 3B8BA 4RPNA 1M5DA 3ZSFA 5J1DA 4QXDA 1ZTYA 3UK4A 3QUFA 5ESYA 1R9QA 4U22A 4R72A 5L9OA 2DP8A 4MHFA 2XXPA 2UVHA 1B2HA 1XVXA 4H5FA 5I2NA 1TXFA 4YICA 1G0HA 3JV9A 1P99A 3UIFA 4H8IA 3EPEA 4DXCA 5IKBA 5K2XA 1FBHA 3C32A 2KR0A 4ELRA 2XX7A 4MX6A 1IMFA 3OO6A 1LAHE 5F1QA 1LAXA 1UQWA 4XF5A 1LBBA 4R6HA 3U1OA 3MQ9A 4MNCA 4IB2A 1DBZA 1PC3A 1H76A 4FBPA 2PCRA 2HAVA 1A8EA 2Y5LA 2HXRA 1NL5A 5DEXB 2F7CA 1CE2A 3V83A 4E0WA 1QKBA 3O97A 5I7IA 3U92A 3E9XA 4GWWA 4KXPA 1B1XA 1MG1A 3OEKA 4EQBA 4XKRA 3TKDA 1FQBA 3MVXA 2O1MA 5JK4A 3KC0A 1SI0A 4PCDA 2WBDA 2F35A 4IY5A 1NUXA 2Z8EA 4LZ5A 2CZKA 4DE8A 1FBDA 4GWUA 3VXBA 1NUWA 3FGSA 1GR2A 4DIGA 3RQTA 4O3CA 3N6UA 3MPKA 4X9TA 4PGNA 4ZEKA 4R9FA 5I3SA 2D21A 1B0LA 3IFAA 2O1LA 3O66A 1VE4A 1LFHA 4ELPA 3RTWB 4GX6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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