1P1UA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) l650t mutant in complex with ampa (ammonium sulfate crystal form)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1uA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1uA01
2PBWA 4H5GA 2REJA 2Y7IA 2AIXA 1AL3A 2ONKE 3EPEA 2Q9TA 2NXOA 5HPQA 2ESNA 4WEDA 2XD3A 3MQ9A 3B6QA 3S9EA 3IOWA 4JB7A 3CG3A 2RCAA 4NF6B 1M5EA 3H06B 5M2VA 1L5TA 1XT8A 4I1DA 4POWA 2OK2A 2H9BA 4TOZA 3M3LA 4YKJA 2F7CA 4LQ5A 3N6TA 4O3BA 2QS3A 2H98A 1OIBA 2HQ0A 4RJZA 4IY5A 4IGTA 4NF6A 3MZ9A 1PDAA 1EZPA 3RNNA 4RPOA 1B58A 2X26A 3GZGA 1ZMGA 2XX7A 2ZYOA 2DE3A 3K02A 4OWDA 4OVJA 3VV5A 4RK2A 2XX9A 2O69A 4U21A 1F9BA 3PUYE 3BFUA 2ALUA 2QS4A 3TAJA 5FTHA 2XXIA 4ZECA 2XXUA 3MP6A 1OVBA 3QAXA 3JZJA 3CSGA 4Q0CA 3IB2A 4U4XA 2DS9A 3VE1B 3IJXB 3Q27A 4YKIA 1QUJA 3MPKA 3RUMA 5DEXB 1B0HA 4H67A 1AIVA 4ELQA 4JXIA 3U94A 1NKXA 1MH3A 1YCJA 3MVWA 4TLMB 4F18A 3T9UA 4LVQA 3FVGA 5TU0A 1LBBA 3MP8A 4I8CA 1SQYA 1USYH 3I5OA 5DEXA 1MM7A 1CE2A 3L6GA 4H1XA 3CI8A 1JVXA 3FVKA 2HCAA 3PMXA 1TFAA 1HSLA 4JDFA 4U2RA 4NF4B 4TQUQ 3BFTA 2OJTA 4ZEBA 1M5BA 3KJTA 1B5HA 3JV9A 3MVZA 3OD7A 4PFWA 3TODA 4GL0A 3U1OA 4DXCA 3B6WA 3EHUA 1FTLA 2P0SA 3IAZA 3G3FA 3V83A 3IB0A 1RYOA 3LSLA 3PUXE 4NF4A 4OEVA 1LAFE 1AMFA 2O84X 2D21A 3MW0A 1MPBA 5DVFA 4MLQA 3ILUB 4F3GA 3H6UA 5AA1A 4IO3A 1B7ZA 2F34A 3BBRA 2DE4A 2VGQA 4IO2A 4IO5A 4PFTA 1D9VA 2VOZA 2F8DA 4GOTA 1OMPA 3VVEA 3PD8A 3DP8A 3IO6A 3B7DA 1B6HA 4YKKA 4F31B 4H6DA 3LSWA 3Q25A 3I3VA 2VD2A 1OQHA 1LFIA 1XHYA 3KJ7A 4X1BA 1B3LA 3KOTA 3KN8A 4OENA 1QKAA 2RINA 3TQLA 4OFOA 2VD3A 2R71A 3N5LA 5DVJA 3MJNA 1ELJA 4OESA 4F1VA 5H8FB 4R73A 4OERA 5ITOA 3M8UA 4DCXA 2O7UA 1D3KA 4GVOA 2DE2A 2P2AA 5B70A 3RTWB 3CR9A 3A3UA 4GD5A 4OZ9A 5CI5A 2A5SA 3JYRA 3K6UA 4ELOA 5H8FA 1ZU0A 1QW0A 1B3FA 1R9LA 2D5WA 3KSXA 1KWHA 2XXWA 3T93B 1HSEA 1XVYA 3IJOB 1ZTYA 3K01A 1FTKA 2UYFA 2HEUA 4X48A 4G8MA 4POXA 4M4GA 4HCYA 5HBCA 5I57B 3TKDA 1MXXA 5H8QB 3N26A 3CIJA 4YB6A 4RK9A 2CMOA 1Y3QA 1DMBA 1PB9A 3S2VA 2XXTA 1JEVA 2QRYA 1LGBC 3H3GA 3R7XA 4GXAA 2Y7RA 2GHAA 4C0RA 2XXHA 3P7IA 2QS2A 3PPPA 5CBSA 5I57A 1XOCA 1YAEA 3DM0A 5H8QA 1Y1ZA 2PVUA 2O51A 2QMXA 3QK6A 3T96B 3VLUA 3RLFE 1MXWA 1ZLQA 3SEUA 1IXCA 3HSTA 4BDMA 3TTMA 3FUZA 5L9MA 1SYHA 1NNPA 3C35A 3WAFA 4HCWA 1LAXA 1N3WA 3TCFA 4OHNA 3EHSA 4IB2A 1MY3A 1BTJA 3QYTA 2OCUA 3FIRA 4G77A 4DIGA 2RCBA 1B32A 2D3IA 3H6VA 4FE8A 1UIVA 2DYXA 4BLAA 2E1SA 3BKIB 1MXUA 4IO6A 1B46A 3MPLA 3KN7A 1FTOA 3TEPA 4R9FA 3MVYA 2O1LA 2UVJA 4ZEFA 2DOJA 5TPAB 4AQ4A 1NL5A 3T9XB 2NWJA 2ZYNA 3TYHA 1URSA 3TDJA 1SW1A 3MP1A 1URGA 3FVNA 3O29A 4XKPA 2YPNA 5TPAA 1NH8A 3VLWA 3EF7A 3C36A 2ZXTA 3U8QA 2Z8EA 3LUYA 1PB7A 4P0GA 1SW2A 2DWIA 3I6VA 1USYE 2E0SA 4LZ8A 4BDLA 2I49A 4UACA 1IUDA 3MZBA 1VFEA 3SERA 4R6KA 3TQWA 1XC1A 2XXRA 1SBPA 2F35A 3FZVA 2DXYA 5CM6A 4NEDA 3Q29A 4HW8A 4JSDA 4F3SA 3M3KA 4GL8A 1B05A 2O7IA 3CFLA 4KFQA 3TTLA 4KI0E 3FASA 1B2HA 4EQ9A 3K4UA 2V25A 1H76A 3FJMA 4R72A 1RYXA 3EN3A 1US5A 1IIWA 4Z0IA 4R2BA 3FVOA 3PPOA 2IA4A 5F1QA 1MY0A 5A5XB 3HCQA 4BDRA 4M1VA 1A54A 3IL1B 3MZ1A 2THIA 3TTNA 3LSFB 4Q8RA 3O97A 3KEIA 1QUIA 2QPQA 3HHFA 1LAGE 4XKNA 3UGWA 2QSXA 3GBAA 2HZLA 2HAVA 5KCJB 3EHTA 1H45A 3ZKKA 4F2QA 1MY2A 5A5XA 5TP9B 2DWHA 1H3DA 4GQOA 1XS5A 3O6GA 1T0KA 1VE4A 2NUVA 2ONSA 3UIFA 2OWSA 4IO7A 1OLCA 4OEUA 1N84A 2AYSA 5KCJA 4ISUA 4LP2B 3FXRA 2Y7PA 4H8IA 4PE5B 1DPPA 5TP9A 3MBPA 4ZDMA 1N7XA 3FGSA 1MPCA 4DXUA 4H8JA 3OO6A 4C1TA 4X1DA 3GBBA 3OENA 3H03A 4RA1A 1B3GA 2HAUA 4FORA 3OSRA 3PUZE 1A40A 3PGFA 1IQ7A 3K1MA 1POY1 3K6XA 2OWTA 3PU5A 3PD9A 2UYEA 4QHQA 4N13A 3G3KA 1PB8A 2F6PA 4P11A 3ZKLA 3H6WA 2XXYA 3FJGA 4BDOA 4X9TA 1IZ1A 3W15C 1BLFA 1SI0A 3LBSA 3SEWA 3S9NC 2B3FA 2PT2A 1MDP1 3TTKA 1AH5A 4KYDA 5DVIA 1WVJA 3C33A 1N3XA 1PBPA 3SEVA 1QUKA 4LUBA 4EF2A 4GIZA 2Q89A 1FQEA 2Q88A 1N04A 4PFUA 1Q1KA 2Z8FA 3PPRA 1MG1A 3V89B 1QVSA 3OO9A 4OETA 2G93A 1P1QA 2GHBA 1ANFA 1O63A 2WKYA 4WKMA 3ONMA 2I3WA 5EHMA 4LZ5A 1LLSA 2R6GE 5K2XA 5CC2A 1LFHA 2P1SA 3QXMA 1Y4CA 3SESA 3SEYA 3OEMA 3KSJA 4TLLB 1B4ZA 2R9JA 3EQ1A 1N0TA 1QKBA 4DCYA 3FXUA 2RC7A 4PQJA 2ZNSA 4OFLA 4NF5B 4U22A 5ITPA 3K2DA 3IK6B 4KYEA 4EF1A 4ONYA 1MQDA 3E13X 4OQOA 4RNSA 4ECFA 3UN6A 3S9MC 3FD3A 4LA9A 2RC8A 3HV1A 3RGYA 2ONRA 3RPWA 3O9PA 4R74A 1MXYA 1NNKA 1DTGA 4EXKA 2IEEA 1R6ZA 4NF5A 2HFBA 2O1MA 2REGA 3VXCA 3O66A 3U72A 3CFZA 4H5FA 2I6EA 1SDXA 2DP8A 5CMKA 1ZIUA 2W7YA 5CRYA 1CB6A 5DT6A 3K6WA 1EH3A 1FTMA 4EDPA 1GR2A 1H43A 2O68A 3W9WA 4IY6A 1B1XA 2XXQA 2I4CA 3DLNA 4GFRA 3R6UA 1NH7A 4O3CA 3IORA 3GXAA 1JW4A 4Q30B 3MC2A 1JW1A 1UIUA 3H6TA 2X7PA 1S50A 1FQBA 2V84A 3UA8A 3C9HA 1Z7NE 5L9OA 3FJ7A 5EYFA 1UQWA 4L17A 1ZKBA 5F7VA 3ODBA 4R2FA 1EZ9A 3S9LC 4ND9A 5EHSA 2F6GA 1B9JA 4FIMA 1GGGA 2KLFA 1JEUA 1PC3A 1IITA 1I6AA 5K2YA 2DQVA 1BP5A 3H4ZA 4GRKA 4EQ7A 4YMAA 2I0CA 3RT6B 3E9XA 4F1YA 4RY1A 1B7HA 2Y84A 4BDNA 1P1WA 2M8CA 3C32A 1A8EA 3PMWA 3RTFB 4WXJA 3VVDA 4PETA 4QRZA 3HO7A 4JSOA 1O64A 1EZOA 1S7YA 3MUQA 1JVYA 1IXIA 4FEBA 5I2NB 3OEKA 4H0WA 3O2AA 1Y1MA 5IKBA 1FQFA 3RY3A 2V93A 4ZS9A 2DWJA 4PP0A 5L8DA 1MS7A 1N76A 5CMMA 4C1UA 2PMSA 3OO8A 4EXLA 2ABHA 2V3TA 2F78A 4THIA 3OMBA 4U4SA 4NWCA 3C34A 4AB5A 1A8FA 1OVTA 2PYYA 5I2NA 4ELPA 4OYVA 1I69A 4MF3A 1GTKA 2H4IA 3SDFA 3TUSA 3HN0A 1P1NA 2UXAA 4FJPA 3TPAA 5I56B 4JWYA 5FHOA 2CZLA 4KCCA 1PEBA 4OFJA 1MQIA 4MFIA 3KZGA 4R75A 1IXHA 3Q26A 1TWYA 3M3FA 4YU0A 5AE4A 2GH9A 3IO4A 3TMGA 2NVUB 3B6TA 2BJJX 2H99A 4KD5A 3E4RA 5JTYB 4YKPA 1PBQA 2HZKA 3KFMA 1B1HA 4E0WA 4QFPA 2I0BA 5I56A 1MQHA 1UTBB 1EU8A 2I58A 1VSOA 2RF1A 2V3UA 1POTA 2A5TB 1NMUA 4ZE8A 4PFYA 5JTYA 3K00A 3O6HA 1A7LA 2VP1A 3A3CA 2ZMBA 1SD3A 1B3EA 4DZ1A 1A55A 1WDNA 1B51A 4R6HA 1UTBA 3A09A 3RT8A 1VR5A 3HHGA 1B40A 2VHAA 3DELB 3R26A 3IX1A 3PUWE 1MXVA 4K3FA 3VFJA 2A5TA 4NMYA 4P0IA 3ZSFA 4WEPA 3CG1A 1A99A 4JBZA 4QFOA 1TXFA 4F3PA 3C4MA 2B3BA 2UVHA 4DLDA 1DOTA 3SKPA 3U93A 1ZJLA 3OXNA 1FQCA 3O28A 4FATA 4QSDA 4G2ZA 4DXBA 3G3HA 3TCGA 4U1OA 2G29A 1D4NA 1Z7ME 2AL5A 2XX8A 1SW5A 5ICTA 1NFTA 1H44A 2ZNUA 2XHDA 4HTGA 3N6UA 5ELVA 2B65A 4XTCQ 3E3KA 2I4BA 3TELA 3U92A 2YLNA 1URDA 2XD2A 1WODA 1NNTA 1UTHB 4KR5A 3GLBA 4IGRA 1MXZA 4DE8A 4F1UA 4ESXA 5CMBA 3SEXA 1SW4A 4U1ZA 3UORA 1TFDA 1UTHA 3CFXA 4ZZAA 1Y4TA 2H25A 1NNFA 3PUVE 4G68C 1J1NA 2QL3A 4ZE9A 2RC9A 3OOAA 3FV1A 3C31A 5JK4A 1Y9UA 1GV8A 1DSNA 4FEDA 1MQJA 5I58B 5AA3A 4N07A 4DDDA 4KPTA 4FECA 3MVXA 1LB9A 4HS7A 4G8NA 1FTJA 1B52A 1S9TA 4QFKA 4AB6A 2QMWA 3QIMA 1BIYA 1Y20A 4BDQA 2DVZA 2PX1A 1B5JA 3G7WA 3ECRA 4OMBA 3UP9A 5I59B 2DVCA 3K1PA 1AOVA 4MBPA 4MLVA 3HPIA 1MY1A 1D9YA 3G3GA 3VDFA 2F36A 2F5XA 1JW5A 1IXGA 1FQAA 5I58A 3QUFA 2X7QA 1P1UA 2QS1A 3USDA 1LSTA 1Y3NA 3S4UA 1R9QA 4F29A 2ANJA 2Z23A 2YJPA 4XXUA 4ZEKA 4QSEA 4F3BA 1FQDA 1B7UA 5H8NB 5I59A 1P99A 5FHMA 1M5CA 3KBRA 5IAIA 4Z7EA 4QSCA 1MRPA 4KYSA 4XIGQ 1JNFA 3G3JA 5AA2B 2AL4A 3N94A 2XXXA 5KDTB 2V3QA 1LB8A 1M5FA 3K6VA 4F2OA 4H65A 4QFNA 1DTZA 3KN3A 4RPNA 2QJEA 5H8NA 2F97A 3FXQA 1DPEA 1JETA 4ESWA 4XKQA 4Q5TA 3IB1A 1LCTA 5AA2A 5KDTA 3T22A 1FCKA 3ILTB 5B7DA 4QFLA 1B3HA 3QUJA 1B5IA 3TZAA 2H5YA 4LQ2A 3MAMA 2Y7KA 4G4PA 4YAHX 4E0XA 3T9HB 1ATGA 5FHNA 5DYHA 3PPQA 4F39A 5KZTA 4LZ7A 2Q2AA 5H8HB 3IOVA 3IR1A 3KOSA 1MDQA 2F7BA 1QJMA 1I6QA 4N6PA 2Q2CA 1I6BA 3KGCA 2FYIA 3D4GA 3CVGA 1MY4A 5I2KB 1Q35A 2DXRA 4F19A 3D4CA 4YB7A 1QULA 2DWAA 4G68B 5BWJA 1TT1A 5AA4B 1GVCA 5H8HA 4MH5A 5H8SA 3VVFA 4G8HA 1RKMA 2OZZA 5JEIA 2Z8DA 4XKRA 3WAEA 3CSBA 4YICA 3V8XB 2DSFA 2FNCA 2UVIA 2XXVA 4EUOA 5ISUA 4NF8B 1OLAA 4F22A 5I2KA 1OQGA 3PV0E 1JQFA 3QSLA 4G68A 1LBCA 3IOUA 3ZS6A 5AA4A 3H7MA 2I3VA 4ZEDA 4RYAA 4IO4A 3DP6A 3W9VA 5I84A 4NTLA 2Z22A 4LONB 3Q28A 1B4HA 5HM4B 4NF8A 2NOOA 1HSJA 2PT1A 1SVXB 1O7TA 1YPNA 5FTIA 3T9VA 3TCHA 2ZYKA 3DP4A 5LOMA 3F11A 1BKAA 3T66A 2I48A 4KCDA 4YMBA 2O6AA 1YTVA 2OLBA 2Q8JA 4YZZA 3FV2A 2GFEA 1LAHE 4ELRA 4ZZEA 1R1NA 3VLVA 5J1DA 1MPDA 3L6HA 3PPNA 4KQPA 2FA7A 4EQBA 3OELA 4NE4A 1SYIA 4OXVA 2RKMA 4GWOA 2ZYMA 4JWXA 3G3IA 3AXFA 4U23A 2LAOA 1SI1A 4R6YA 5ICQA 4FAJA 4ZEIA 3SETA 4O3AA 3VXBA 2UVGA 2HXWA 3KG2A 4R9GA 4OTEA 1LCFA 3MWBA 3O6IA 3LSXA 1MM6A 4JWOA 1MH4A 4UA8A 3RQTA 5CBRA 1ZBMA 1II5A 3IOTA 3OO7A 5AA2D 4NWDA 3TTRA 4GF8A 1MQGA 2F7AA 3FATA 3LR1A 3OSQA 1B0LA 3TFLA 4GXSB 4QF9A 1M5DA 4KHZE 4YB5A 1Y3PA 3K1NA 3THIA 1VFDA 2Y7WA 1N7WA 1P1OA 1FW0A 5CMCA 2OBGA 1XVXA 3V5AA 5L9SA 5BUUA 4I62A 1LFGA 1US4A 4LATA 3CRBA 3K0VA 3LC8A 3UK4A 2XXPA 3PMVA 3RN8A 2ZNTA 2GRVA 4RXLA 4I9DA 5DTBA 4GLIA 1IEJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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