1P99A

1.7a crystal structure of protein pg110 from staphylococcus aureus
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
KVTIGVASNDTKAWEKVKELAKKDDIDVEIKHFSDYNLPNKALNDGDIDMNAFQHFAFLDQYKKAHKGTKISALSTTVLAPLGIYSDKIKDVKKVKDGAKVVIPNDVSNQARALKLLEAAGLIKLKKDFGLAGTVKDITSNPKHLKITAVDAQQTARALSDVDIAVINNGVATKAGKDPKNDPIFLEKSNSDAVKPYINIVAVNDKDLDNKTYAKIVELYHSKEAQKALQEDVKDGEKPVNLSKDEIKAIETSLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
publication title The membrane-associated lipoprotein-9 GmpC from Staphylococcus aureus binds the dipeptide GlyMet via side chain interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein PG110
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A02
5JEIA 2W7YA 4YZZA 1I6QA 1IEJA 1XC1A 1LAHE 3FVOA 3ZKLA 5L9SA 2YLNA 4F18A 2QS1A 4MLQA 1ATGA 2HZKA 4NF4A 5I59A 1NH7A 1O64A 1PDAA 2V3QA 4FORA 1US4A 1FQAA 1OLCA 1ZJLA 2O51A 3PMWA 1MY4A 3OSRA 3M3FA 1A8EA 2E0SA 4OFOA 2R6GE 1IIWA 2V3UA 1OQGA 3KSXA 5CBRA 1A40A 4H67A 4R9GA 3RPWA 3C9HA 3SEWA 1SW4A 3K0VA 1B7UA 1ZTYA 4YKPA 3QXMA 4NF8B 3IK6B 5DTBA 3KJTA 3MW0A 1B05A 1MY2A 1Y1MA 1URSA 1LAGE 3KOTA 1D9VA 3FXQA 4TOZA 3LSLA 3OENA 2P0SA 4G8MA 4RPOA 1Y1ZA 3TTNA 1BTJA 3M8UA 4PFYA 3V8XB 4YU0A 2RINA 3FV1A 4U22A 1PC3A 3R7XA 5I59B 1SVXB 4HCWA 1L5TA 2QMWA 1DPPA 3PUXE 1MXVA 1HSLA 1MH4A 4U21A 4OHNA 3BKIB 3FD3A 4FJPA 4IO4A 3CG3A 3H7MA 3QSLA 3USDA 1Y3PA 1VFEA 4JSDA 5CC2A 1B3HA 3TAJA 4GF8A 4XKNA 5EHMA 4LVQA 3KSJA 2O7IA 3FIRA 4DZ1A 2O69A 2ZNTA 3TODA 4LQ5A 4R9FA 4NMYA 1B3EA 4OVJA 4RA1A 3H6WA 1ZLQA 5L9OA 4M4GA 1IUDA 4ELPA 2F5XA 3GZGA 1GGGA 4OESA 4BDOA 3KG2A 1AIVA 2UYFA 4YB6A 1SI1A 1AH5A 1EZOA 4QFKA 2UVJA 3TDJA 3ZSFA 4TQUQ 1JEUA 2CMOA 1NMUA 1UTHA 1SBPA 5DVFA 5FTHA 2YJPA 1QVSA 3OOAA 3PUVE 4U4SA 4ISUA 3UORA 4DXBA 3CFLA 3RTWB 1R1NA 3K1MA 2H5YA 2DS9A 4DXUA 3O66A 3GBAA 1OLAA 4PFWA 5M2VA 3H4ZA 1UTBA 4Q5TA 1MPDA 3CVGA 4ND9A 1MQGA 1MQJA 3PUZE 2F97A 5I84A 3MUQA 3MVXA 2B3BA 4C1UA 3C34A 2LAOA 1FTKA 3OO8A 4QRZA 1POY1 1FTOA 1B0HA 4Z0IA 3VLUA 3FZVA 4F2OA 4POXA 4DLDA 3Q29A 4Q30B 1EU8A 1B3GA 4F31B 3K6UA 4BDMA 1BKAA 2Z8FA 4PFTA 1XHYA 4H5GA 3IJOB 3IO4A 2RKMA 3O6IA 3PGFA 5CMKA 3TQLA 4M1VA 2XX8A 1QW0A 4JDFA 1R9LA 5H8HA 3KN8A 3OEMA 4QSDA 4NWCA 1SQYA 1B0LA 1P1NA 1ZIUA 3G3FA 3RN8A 4IO3A 1B52A 1Y3QA 2HEUA 3OO6A 1Z7ME 3PUWE 1TXFA 1MQHA 2OZZA 3RTFB 4KQPA 4ELOA 4G4PA 2B65A 4IO5A 1VR5A 3E3KA 1P1WA 2PT2A 1LBBA 3S2VA 4IGTA 3M3LA 2XX9A 4F3GA 1A8FA 3VVEA 4NF5A 2RF1A 1DMBA 1M5DA 3IORA 3IAZA 1EZPA 2RCAA 2ABHA 3N5LA 1RYXA 2OCUA 3IOUA 1MXYA 3CFZA 4OETA 4KCDA 3JZJA 5AA4A 2KLFA 5HPQA 4WEPA 5H8SA 2O1LA 3VE1B 1M5BA 2ALUA 3CSBA 4I62A 5I56A 1O7TA 4KI0E 4KHZE 3U93A 4YKIA 3A3UA 1TFDA 5H8HB 3PV0E 3S9NC 4X1BA 4YMBA 3OSQA 2ONSA 2PVUA 2ANJA 4ZZAA 4LATA 4R6HA 5TPAB 5K2YA 4H0WA 3MJNA 4F1YA 3ZS6A 3IOVA 1B51A 3MZ9A 4FEDA 3T93B 2PT1A 1DTGA 1LCFA 1Y4TA 4OYVA 3H06B 4L17A 1B7HA 1JEVA 4NF5B 1FTLA 3SESA 3EHTA 2ZXTA 4H65A 2XD3A 2H98A 3VLWA 2RC7A 5I57A 4DCYA 2QJEA 4O3AA 1TT1A 2F8DA 3OO9A 4YICA 5AA4B 1UIVA 2F36A 1DPEA 1QUKA 5I56B 3SETA 4EQBA 2P1SA 1B4ZA 3PPPA 3D4GA 2XXRA 3IB1A 4GL0A 5ELVA 2DWIA 4E0XA 5EYFA 3KZGA 5CMCA 2IEEA 3TZAA 2IA4A 2XXPA 1I6AA 1IXGA 4RYAA 1P1QA 3Q26A 2HFBA 2ZNUA 1LCTA 1OMPA 2XX7A 2VP1A 1QUIA 1BP5A 2DE4A 5K2XA 3KN7A 4HTGA 5KCJA 5I57B 2OWSA 3PPRA 3TYHA 1S50A 4ESWA 3MPLA 5I2KA 4EQ7A 3C33A 4XTCQ 5F7VA 2NOOA 2XXVA 3HO7A 5F1QA 2NXOA 4GD5A 1B7ZA 3RQTA 4RK2A 4F19A 3IOWA 1Y20A 4HS7A 3K01A 4WXJA 4R2BA 2QS2A 3KGCA 4OFLA 4MFIA 4KYSA 4OZ9A 3T22A 3BBRA 4KD5A 3OMBA 3S9LC 1LGBC 1OIBA 3FASA 1H76A 2M8CA 1LFIA 1WODA 2D5WA 4JXIA 5KCJB 3GBBA 3LBSA 3N94A 4QSCA 1GV8A 5I2KB 1SW5A 2DYXA 3EHSA 1XS5A 1HSJA 3R6UA 5FTIA 2HAUA 3N26A 3QAXA 4I1DA 1KWHA 3S4UA 1JW5A 4FECA 1A7LA 3CSGA 4EF1A 5KDTA 3Q28A 4NWDA 3FJ7A 3ONMA 3TEPA 2O6AA 1CE2A 4NEDA 1Y3NA 2D3IA 4NE4A 3SEXA 3S9EA 2XXTA 4ZEBA 1DSNA 4EUOA 4IO6A 3K6WA 2QS3A 2AL5A 2O1MA 3T9VA 4X1DA 4NF4B 1LLSA 1P1OA 2A5SA 1UIUA 3B6QA 3U94A 1SW1A 3S9MC 1FCKA 5IAIA 3H6VA 1YPNA 4OXVA 1H43A 3EPEA 1N04A 3MPKA 2Z23A 3DLNA 2HAVA 2DP8A 3JV9A 5KDTB 2I4CA 4F1UA 2GH9A 4MLVA 4C1TA 4OEUA 5KZTA 3DM0A 3G3KA 1J1NA 1MQIA 1LSTA 4H6DA 3THIA 1B46A 4G8NA 3MBPA 4F22A 4R74A 3TQWA 4KYDA 4Q8RA 5EHSA 2QMXA 2XD2A 3WAFA 4HCYA 3FATA 1DTZA 1QUJA 3CIJA 4JSOA 2XHDA 2I6EA 4LA9A 2HQ0A 3HPIA 1B5HA 1VE4A 2NWJA 1VFDA 2Q9TA 4GQOA 2UYEA 4F29A 1USYE 1FTJA 4YKJA 3MP1A 5AA2A 1S9TA 1NNFA 1WDNA 4BDQA 4XXUA 3GLBA 3A09A 2NVUB 1MH3A 3G7WA 3VLVA 2RC9A 3C35A 3CG1A 3MQ9A 4F3SA 1MPCA 3O97A 5CRYA 4BDNA 1IQ7A 3KEIA 4IY5A 2ONRA 2PYYA 3UIFA 5AA2D 3P7IA 2VHAA 3A3CA 5IKBA 5HM4B 1N3XA 3TTKA 1I6BA 4KYEA 5I2NA 4DE8A 4YAHX 3TKDA 3E13X 2AL4A 3U92A 1AL3A 3PMXA 3MVWA 1IXCA 1MY1A 3N6UA 1OVTA 4BDRA 2DQVA 5DEXA 1UTHB 5A5XA 1BLFA 2V25A 5AA2B 3PPOA 3WAEA 1GVCA 2VD2A 5H8NA 4O3CA 3FJMA 2D21A 4EXLA 1FQDA 4MF3A 1JVXA 3E4RA 1SYHA 4XKPA 4DIGA 4JBZA 4R6YA 4ZEDA 1GTKA 1UTBB 1NL5A 4N13A 3K1NA 2Q88A 1LB9A 3MVZA 2I48A 4ZECA 4AQ4A 4YB5A 4FIMA 3MP8A 3SDFA 3T66A 5L9MA 5B70A 5CBSA 5DVIA 3I3VA 5I2NB 4WKMA 5ISUA 3UP9A 2UVGA 4OWDA 5TU0A 4GXAA 4Q0CA 1B58A 1JW4A 2FNCA 4EXKA 4GOTA 5DEXB 2B3FA 3OXNA 5A5XB 1MDQA 3U72A 1RKMA 2DWAA 1LAXA 2I0CA 4GRKA 4ZEKA 3SKPA 3TPAA 1PB8A 1SDXA 4PQJA 3B6WA 3EQ1A 2OWTA 1B3LA 2E1SA 1XVXA 5HBCA 3N6TA 4ESXA 1UQWA 1FTMA 1MDP1 4TLMB 4ZDMA 3H6TA 3RGYA 3TTMA 1JW1A 1Z7NE 2Q2AA 1O63A 4POWA 1B1XA 2Z8DA 1MG1A 3DP8A 1QULA 3RT6B 2Y7KA 1LFHA 2F7BA 4G8HA 3C31A 3EF7A 1HSEA 5ICQA 2OLBA 1NH8A 3O9PA 3W15C 4H5FA 4RJZA 3I5OA 2DOJA 1NNTA 2VGQA 4JWYA 1Q35A 2GHBA 3IJXB 4JWXA 3FXRA 2QPQA 4F3BA 4OENA 4THIA 2V84A 2ESNA 1YCJA 4R75A 2OJTA 1POTA 2ZNSA 3KFMA 1EZ9A 2Q2CA 3SEYA 3VV5A 1MXUA 2F34A 3FXUA 3OD7A 4FE8A 4GIZA 4ZEIA 1N84A 4X9TA 1PBQA 1M5FA 1ANFA 3KOSA 4R6KA 4U1OA 3PD8A 4F1VA 4RY1A 5ITPA 2Y84A 3W9VA 4QSEA 1R9QA 3KN3A 2DE3A 4KCCA 2PBWA 4RXLA 5TP9A 1Y9UA 3VFJA 3LSWA 1N0TA 5CI5A 3MWBA 4PFUA 4BLAA 3IB0A 5DVJA 3T9HB 4FATA 2REJA 4OMBA 4LQ2A 1USYH 3VDFA 1IXHA 2ZMBA 3RY3A 5JK4A 4NTLA 4H8IA 4R72A 1MQDA 4MBPA 2HXWA 1XOCA 4QFNA 2UVIA 3RUMA 3UGWA 2XXUA 3ECRA 1NKXA 2HCAA 2GHAA 4RNSA 3LUYA 5J1DA 3CFXA 4RPNA 3E9XA 3PU5A 3HCQA 3DELB 3G3GA 5H8FA 3VXCA 1N7WA 3KBRA 2AIXA 3PPQA 2AYSA 3TUSA 3ZKKA 5TP9B 3G3JA 4ELQA 1D3KA 3FJGA 3VXBA 2QS4A 3IX1A 2Y7IA 5BUUA 2BJJX 1TWYA 5I58A 5FHNA 3TELA 3MZBA 3RLFE 4PP0A 1B2HA 4GVOA 3FUZA 1MPBA 3FVGA 1URDA 3O2AA 1MXXA 3O29A 4YB7A 4P11A 2H25A 1MXZA 4JB7A 3LSFB 4LONB 2UVHA 1BIYA 3K4UA 4U2RA 1QKAA 1H3DA 3TTRA 3QUJA 1FQEA 2Q8JA 2Y7RA 3D4CA 2WKYA 4KPTA 4Z7EA 2G29A 2THIA 3MP6A 1IZ1A 3I6VA 1US5A 2O84X 3G3IA 2I3WA 3CR9A 4OFJA 4OEVA 5DT6A 2XXHA 2F7CA 1Q1KA 4LUBA 2I4BA 3PUYE 5H8FB 3LSXA 3FV2A 3SEVA 1N76A 3QYTA 4FEBA 1PEBA 3PPNA 4F2QA 2I0BA 1SW2A 4QFLA 5CMBA 4AB5A 4P0IA 1LB8A 5I58B 2I3VA 5FHMA 3B7DA 4MH5A 1GR2A 3BFUA 4N07A 4UACA 4I9DA 3K6XA 2UXAA 1PBPA 1D4NA 3HSTA 2G93A 2DE2A 3V89B 3G3HA 1ZMGA 2DXYA 3M3KA 4KR5A 3RT8A 1FQCA 4ZE8A 3SEUA 3TMGA 1JETA 3GXAA 1R6ZA 4GFRA 1ELJA 4F39A 3LR1A 5FHOA 2F6PA 4U1ZA 3OEKA 1CB6A 2X26A 2YPNA 5B7DA 3QK6A 1ZBMA 4U4XA 5AA1A 3EHUA 4H8JA 3T9XB 2NUVA 4JWOA 3C4MA 3IL1B 2DVZA 2Q89A 3QUFA 4H1XA 2P2AA 2XXQA 2DSFA 5JTYA 4LZ5A 1LFGA 3K2DA 3T9UA 2Y7PA 4OERA 4IO7A 2I58A 5DYHA 3UN6A 4QF9A 1B4HA 3O6GA 4ONYA 4YKKA 3UA8A 2X7QA 2GRVA 3H6UA 1IITA 4ZZEA 2A5TA 2FYIA 1MY0A 2F6GA 2ZYOA 4BDLA 4HW8A 3VVFA 1F9BA 3RNNA 3IO6A 4ELRA 2GFEA 2R9JA 3B6TA 3PMVA 3CI8A 2Z22A 5AE4A 4PETA 3CRBA 3K1PA 2XXIA 1XVYA 2XXWA 1AMFA 5JTYB 3R26A 4LZ7A 4QHQA 1B40A 1B5IA 2O7UA 5H8QA 1MXWA 3AXFA 1M5EA 4DDDA 2RCBA 3PD9A 1FQFA 1JVYA 2ZYNA 3SERA 4GWOA 2A5TB 4P0GA 4IY6A 4XKRA 5CMMA 2H9BA 4KFQA 3K02A 3ILUB 3EN3A 2QRYA 4G68A 1EH3A 3DP6A 1FW0A 4LZ8A 3UK4A 1I69A 4OTEA 4F3PA 2XXXA 3K00A 1SI0A 4NF6A 1QJMA 1D9YA 1JNFA 3IR1A 3LC8A 1II5A 3IB2A 3JYRA 5AA3A 3K6VA 3OELA 4YMAA 3ILTB 5TPAA 1PB7A 2DVCA 1MY3A 2PMSA 1SYIA 5H8QB 4QFPA 2F35A 1WVJA 2F78A 3F11A 3HHFA 4E0WA 5H8NB 4G68C 2Y7WA 4U23A 3TCHA 5ICTA 1M5CA 3L6HA 1A99A 2V3TA 3TTLA 1DOTA 3U1OA 4RK9A 1NFTA 4TLLB 1IXIA 4EQ9A 2XXYA 4GLIA 2R71A 3HN0A 4X48A 3TCGA 1B6HA 1B32A 1MRPA 2RC8A 4G68B 3MZ1A 2X7PA 1ZKBA 4PE5B 2FA7A 4IGRA 1A54A 4NF6B 1YAEA 3Q27A 4QFOA 4C0RA 3DP4A 5BWJA 3MAMA 5ITOA 3U8QA 2CZLA 1AOVA 3MC2A 3C32A 2DWHA 2V93A 5L8DA 2VD3A 4ZEFA 1XT8A 3V5AA 2DWJA 3ODBA 2H99A 2ZYKA 4FAJA 4ZE9A 4GXSB 2F7AA 4R73A 2OBGA 3IOTA 3Q25A 1OQHA 1N7XA 2VOZA 4OQOA 4R2FA 4ECFA 4EF2A 4DXCA 1JQFA 4N6PA 2ONKE 1URGA 3L6GA 3O28A 1PB9A 3T96B 3TFLA 4UA8A 4G77A 2QSXA 1YTVA 1FQBA 4I8CA 3KJ7A 2DXRA 1A55A 1RYOA 3QIMA 1OVBA 3C36A 4WEDA 1N3WA 2Z8EA 2REGA 3FVKA 4XKQA 1MS7A 4G2ZA 2HZLA 1B5JA 4IO2A 2ZYMA 1S7YA 4EDPA 1P1UA 4GL8A 4XIGQ 3MVYA 5CM6A 1H45A 3O6HA 4AB6A 4DCXA 1Y4CA 4O3BA 1MM6A 2QL3A 3H03A 1QKBA 1NNKA 3H3GA 1ZU0A 4IB2A 4K3FA 3OO7A 3HHGA 1SD3A 2I49A 1NNPA 1H44A 3TCFA 3BFTA 1TFAA 1LBCA 2H4IA 2OK2A 1VSOA 3HV1A 1P99A 3FGSA 1T0KA 1B9JA 1LAFE 1MM7A 2PX1A 4LP2B 3W9WA 3VVDA 5LOMA 3FVNA 4NF8A 2O68A 1B3FA 3V83A 1B1HA 4ZS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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