1S7YA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with glutamate at 1.75 a resolution orthorhombic form
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: Molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2 precursor
total genus 86
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s7yA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s7yA02
1XS5A 3FV1A 1MRPA 4E0XA 2FYIA 1MDQA 3VLUA 4DLDA 3Q25A 3PUWE 3SEVA 4AB6A 3OMBA 4ZDMA 3THIA 1B5JA 2I0BA 4P0IA 1UIVA 4Q0CA 4KHZE 4THIA 1AL3A 3O6GA 2OZZA 2R9JA 5CMKA 4EQ9A 2NXOA 5IAIA 2D3IA 2OJTA 2YLNA 4OFOA 4BDRA 2Y84A 1DMBA 1LFIA 2DE2A 3K4UA 4RXLA 2OBGA 1LFGA 3DM0A 3CFZA 1JEUA 4R2BA 4FATA 4H1XA 1O64A 3QK6A 3VXCA 3OEKA 1B51A 1WDNA 3EHTA 3VLVA 5I56A 2QMWA 3MC2A 3MUQA 1VE4A 2ZYMA 5I59A 3GBBA 1N7WA 3D4CA 4ND9A 3SEYA 1R6ZA 2QJEA 4NMYA 3FJMA 1I6AA 3U1OA 2Y7PA 4PETA 3IOUA 2ONRA 4U21A 1MXWA 3T22A 1D3KA 4ZECA 4PE5B 4IO6A 4X48A 2V25A 3N6UA 1USYE 3CI8A 4YB5A 2F35A 4QFNA 5FTHA 4EF2A 2R6GE 2V3TA 2YPNA 4RPNA 4JWYA 3TQWA 3S4UA 4G68C 1BLFA 1QW0A 1IZ1A 3QXMA 3UN6A 3T96B 1I6BA 1JEVA 4GFRA 2OWSA 1NNKA 4EXKA 1MQJA 2ALUA 5I2KB 2OK2A 3G7WA 2F78A 4MF3A 4I1DA 3RGYA 3VV5A 3FVOA 4NEDA 2O7IA 1B3HA 4PP0A 5CMCA 2PT2A 4I8CA 4F3PA 4NF4A 3TELA 4JWOA 3RTWB 1IQ7A 3MVYA 4P0GA 1Y4TA 2DE4A 4NF5A 4R9GA 3CIJA 5I2NB 3IO4A 1IIWA 4ESXA 4F3SA 1H76A 5H8FA 3MP8A 3VVEA 2DQVA 3HV1A 5L9MA 3VXBA 4XKQA 5I84A 2HAVA 2LAOA 1B3LA 4U4XA 1IXIA 3KEIA 2DWIA 4AB5A 1XHYA 1QUJA 1QULA 1NNFA 1WVJA 3FGSA 2RINA 2H98A 4HW8A 3FZVA 1ZU0A 1ANFA 2I3WA 1MXXA 4JSDA 3K1MA 3KZGA 3IORA 5FHNA 4RPOA 3ILTB 2ZYKA 3U72A 4OFJA 1RYOA 3O97A 3FVKA 4Q8RA 3CSGA 1MPBA 3I5OA 3TTMA 1PEBA 3B6WA 2RCAA 4PQJA 2XXIA 2Z22A 1AOVA 2DYXA 3M3FA 1OLAA 1PB9A 4PFTA 2I4BA 3S9NC 2DVZA 1P1NA 1XC1A 4F1VA 3OEMA 1MY2A 1Y3PA 4H8IA 3KFMA 1PDAA 5AA3A 2ZYOA 1SYHA 2RCBA 1PB7A 3OO8A 4ZEKA 4KCCA 1O63A 2DS9A 3K00A 3N5LA 3A09A 4G68A 3O9PA 4U23A 4ISUA 1B40A 3RY3A 4OENA 3OSQA 2B3FA 5I58B 4C1TA 2GFEA 3G3GA 1FCKA 4DXBA 2ZXTA 3KN7A 3TCHA 3V5AA 3HCQA 4RYAA 2G93A 3HHGA 4DXCA 5H8QB 3TTRA 2H99A 3T9VA 4Z0IA 1P1OA 1FQBA 1FTOA 2QRYA 4N13A 1YTVA 1JQFA 1URDA 3RT8A 4LQ5A 2UYFA 3ODBA 4ELOA 3M3KA 4F19A 5BWJA 2E0SA 4NTLA 1LAXA 3E13X 2Q88A 3MVXA 1A8EA 2QS4A 2OWTA 3TCFA 3KJTA 1A55A 3HPIA 4LUBA 1LAHE 4M1VA 2A5TA 3U93A 4ZZAA 3USDA 3T93B 1MXVA 1NH7A 1MG1A 3TTNA 3Q27A 1ELJA 3TODA 3MJNA 4OTEA 3IR1A 4YICA 1XT8A 3DP8A 3RPWA 3GLBA 1B5IA 5FHOA 1VSOA 1FTLA 4R6HA 1MPCA 4LZ7A 4NF6A 4ELPA 3OXNA 5H8NB 3K0VA 1JETA 1UIUA 1S7YA 1LFHA 1QUKA 1B3GA 4U22A 5K2XA 3U8QA 5TP9B 1SW4A 1MH3A 3JZJA 3OO6A 2KLFA 4KQPA 4EF1A 1RKMA 4POWA 4P11A 4O3BA 1XOCA 3I6VA 4TOZA 2ONKE 1N76A 2OLBA 1N3XA 3TZAA 3TTKA 4H8JA 2RF1A 3LSLA 4YB6A 3PV0E 3SEWA 3KSXA 4IO2A 3RNNA 2O1MA 1NNPA 2PT1A 3FXRA 4I62A 2XXTA 2O51A 2H9BA 4FEBA 4FECA 3M8UA 3C9HA 3PPRA 3K6WA 4X1BA 5H8HB 2O68A 3IOVA 2GH9A 1HSLA 4TLLB 1Y3QA 3T66A 4H5FA 1B3FA 3MVWA 4ZE9A 5CMBA 1Z7NE 4LZ8A 3O29A 4DIGA 3VFJA 5ITOA 4F18A 1N04A 3PPPA 2V3QA 4N6PA 1TT1A 2X7PA 4JXIA 3S2VA 5DEXB 4ELQA 2UVGA 1LAGE 1F9BA 3HHFA 3ZS6A 4G2ZA 3U94A 3T9XB 4OQOA 1JW4A 1O7TA 2HAUA 4LVQA 1J1NA 4WEPA 4KPTA 3Q26A 4PFWA 1AMFA 2XXUA 4G8MA 4ZEFA 2DOJA 2BJJX 4HCWA 4G77A 4AQ4A 3R26A 3C31A 1L5TA 1NNTA 3A3UA 5DVIA 1MM7A 2F7AA 1MQGA 5DTBA 1USYH 2DVCA 3TAJA 5KZTA 3H6TA 1NMUA 4NF8B 3W15C 1UTBA 3O6IA 3ONMA 3K6UA 3LSFB 3K6XA 3TDJA 2X26A 5J1DA 4F39A 2Z8FA 4H65A 3LC8A 4RNSA 1EZPA 4PFUA 3A3CA 1NFTA 4MLQA 2XXVA 3C4MA 1GV8A 1OQHA 2X7QA 3LSWA 1B32A 2HZLA 2ZYNA 4U1ZA 5H8NA 3S9EA 1TFAA 3BFUA 2DSFA 4QF9A 3C35A 1HSEA 4G8NA 3PPQA 2XD2A 3O28A 1D4NA 5H8SA 3OSRA 3P7IA 4BDMA 3KOTA 3LR1A 4E0WA 2F6PA 3IB0A 3C36A 4EXLA 1IEJA 2NOOA 5TPAB 1UTHA 5EHMA 2F34A 5F1QA 3OO7A 1VFDA 4JSOA 4WEDA 2XXYA 1B2HA 3TKDA 4IO3A 2ABHA 4YMBA 3VVDA 2W7YA 3FVNA 4MBPA 5F7VA 1XVYA 3SETA 3CG1A 5K2YA 3DP4A 3KJ7A 2QS2A 3S9MC 1B5HA 2H5YA 1BKAA 1SBPA 2H25A 1MY3A 3EHUA 4RK2A 1IXCA 3QUJA 3BKIB 4IGRA 5H8HA 2O69A 2O1LA 4KR5A 1A99A 3B6QA 4ZS9A 1B7ZA 4GL8A 5DYHA 2DXYA 1WODA 3UORA 1IUDA 4QFPA 3E4RA 2VGQA 2HCAA 4WKMA 3VE1B 3OENA 3MZ1A 5CI5A 2VP1A 4F2QA 3I3VA 2XXXA 4ZEIA 1FW0A 4U2RA 2P0SA 3IL1B 2H4IA 4LA9A 1OVTA 5HBCA 5L9SA 3HSTA 3N6TA 5KDTB 4KYSA 3IJOB 4PFYA 4QRZA 4DXUA 3FUZA 1Y9UA 1JVYA 4IO7A 4ESWA 1CE2A 2XXQA 3FJGA 3OOAA 4QSEA 3Q29A 1VR5A 1EU8A 3IK6B 3TPAA 4RY1A 3RT6B 4BDOA 2Z8EA 3MP1A 4DCXA 1TFDA 1MXZA 3LSXA 1LBCA 5L8DA 1B05A 3CRBA 1PC3A 1M5BA 3R6UA 4M4GA 4XKPA 1SW1A 3O66A 4GOTA 1UQWA 2OCUA 2AL4A 3KG2A 1B3EA 3PU5A 2Y7WA 4R74A 1S9TA 1II5A 3FASA 2HZKA 1Y3NA 5HM4B 1BIYA 1LCFA 2D21A 1MDP1 1MQIA 4KFQA 3SEXA 1OLCA 3FXQA 3OELA 3IB2A 4G4PA 4UACA 1SW2A 1GTKA 4TLMB 5TPAA 2RC9A 4X1DA 3VDFA 3V83A 1MM6A 4JBZA 3N26A 1P1QA 3UIFA 3O2AA 5I2KA 4H0WA 2PBWA 4LQ2A 3ZSFA 4F31B 3H6UA 2UVHA 2I6EA 3IOWA 1LAFE 4FJPA 3TYHA 3T9HB 1B52A 4XTCQ 5AA2D 3EQ1A 2FNCA 5KCJB 1ZLQA 1NKXA 3H6VA 2B65A 5CBRA 5I2NA 3W9WA 2QMXA 4NE4A 3SDFA 1MXYA 2CMOA 3JYRA 1H45A 1N3WA 4BDLA 4QSCA 1B7HA 3RLFE 2A5SA 5CM6A 3CVGA 4OMBA 3ZKKA 1B58A 2Y7RA 4G8HA 5B70A 3PMXA 3MPLA 4BLAA 3ILUB 4IY5A 3TCGA 1YAEA 2F5XA 1OVBA 4U1OA 1Y1ZA 2ONSA 2QPQA 5FTIA 3TTLA 2XXPA 5CRYA 4TQUQ 1P1UA 2Q2AA 3FXUA 3AXFA 1MQDA 2P1SA 2E1SA 3IJXB 3ZKLA 4XXUA 3LUYA 3KSJA 1LLSA 1YCJA 3SKPA 4BDNA 5A5XB 4X9TA 1ZKBA 1I6QA 4OVJA 1FQEA 2I58A 3UP9A 3O6HA 4R6YA 4R9FA 1MY1A 3UGWA 3OD7A 4C1UA 3GXAA 1M5CA 4NWCA 5AE4A 3JV9A 3E9XA 4FE8A 4DZ1A 1NH8A 3K01A 4U4SA 4GF8A 3RN8A 4NF4B 4FAJA 2GHAA 3MWBA 1MXUA 3PD8A 3LBSA 5JTYB 2I49A 3H03A 3Q28A 2XXRA 3MVZA 4NF5B 1POTA 3H4ZA 2VD3A 1SDXA 5DT6A 5I58A 4ZE8A 1A40A 2DP8A 2QS3A 1MH4A 5H8FB 4LATA 4OYVA 2Q8JA 3G3IA 1LCTA 3PPNA 1SVXB 4OZ9A 1ZIUA 2F8DA 3DP6A 5H8QA 4KYDA 4UA8A 2RKMA 1PBQA 4N07A 4RJZA 4MLVA 1QUIA 5TU0A 3CR9A 2O7UA 2B3BA 4JB7A 1DPEA 4R73A 4Q30B 2UXAA 4F1UA 4KYEA 4YB7A 4ELRA 4GRKA 1Q35A 1Y1MA 1ZJLA 4XIGQ 5AA2B 4YKKA 3TFLA 2DXRA 4GLIA 3BFTA 1ZBMA 2CZLA 4GQOA 3FD3A 1OIBA 1B46A 1JVXA 5KCJA 1GGGA 4GXAA 1FQCA 3PGFA 4GVOA 3IX1A 3L6HA 3RTFB 1B4HA 4EQBA 2HXWA 1D9YA 1FTJA 5DVFA 1LBBA 2XX7A 4HTGA 1P99A 3EF7A 3KGCA 5ISUA 3C33A 3EPEA 4H6DA 4MFIA 3QIMA 2Y7IA 1M5FA 3MQ9A 4OHNA 2HFBA 3K6VA 1EZ9A 3PPOA 2M8CA 4G68B 4KCDA 1Z7ME 5AA4B 1SD3A 5TP9A 3KN3A 1IXGA 1DOTA 1R9LA 3PUYE 4LP2B 5I57B 1B1XA 1N7XA 4DCYA 2AL5A 3M3LA 3TQLA 2IEEA 1SQYA 3TMGA 3KN8A 5BUUA 1US4A 3TEPA 3PUZE 5JK4A 4QFLA 1OQGA 5FHMA 1RYXA 2HQ0A 4HCYA 3IB1A 1FQAA 3G3HA 1IITA 3QYTA 3V8XB 4RK9A 5A5XA 4EUOA 2VHAA 3VLWA 1S50A 1SYIA 4GXSB 3DLNA 3MBPA 3PUVE 3KOSA 2HEUA 3ECRA 2VOZA 2ZNSA 3QAXA 4OFLA 3EHSA 1ZMGA 1PBPA 1MPDA 2DWHA 1H44A 3OO9A 4OEVA 5ICQA 1MY0A 4ZEDA 2G29A 4BDQA 1A54A 3K1NA 3PMWA 1TWYA 5L9OA 2A5TB 1LSTA 2NWJA 3UA8A 4R72A 3RQTA 4ECFA 2XXWA 1POY1 4YKJA 3U92A 4F3GA 2NVUB 5AA1A 2I48A 3B6TA 2F97A 3C34A 5JTYA 4QSDA 2VD2A 1ZTYA 1B9JA 3TUSA 1ATGA 1A8FA 2QL3A 1LB8A 4QFOA 1B4ZA 1YPNA 4RA1A 4R75A 5DEXA 1Y20A 4XKNA 1HSJA 5DVJA 3RUMA 1DSNA 1N0TA 4EQ7A 4NWDA 4OEUA 1H3DA 1JW5A 3FVGA 2I3VA 1FQDA 3IO6A 4NF6B 1US5A 4FORA 3FV2A 3S9LC 3H6WA 2PVUA 2V84A 4ZEBA 4L17A 4LZ5A 3MP6A 1BP5A 2F36A 3QSLA 4GWOA 4IO5A 1MQHA 4R2FA 1URGA 2UVIA 5AA2A 3WAEA 2AYSA 4OXVA 1BTJA 2PYYA 2D5WA 2Y7KA 3HO7A 1GR2A 1FTMA 1OMPA 4NF8A 3K1PA 4DDDA 2QS1A 3K02A 2ZNTA 3G3JA 1KWHA 3G3FA 4IY6A 2GRVA 3WAFA 3G3KA 2O84X 2Q2CA 1P1WA 4YKPA 3PMVA 5IKBA 1B6HA 3MPKA 2WKYA 1URSA 3FATA 4YZZA 4C0RA 2FA7A 1B0HA 2Q9TA 3FIRA 3SERA 2I0CA 4GD5A 2XX8A 4XKRA 1XVXA 1AH5A 4IO4A 2O6AA 1AIVA 2NUVA 2PX1A 1DTZA 1EH3A 4GL0A 1DPPA 4JWXA 5AA4A 1M5EA 2V93A 3H06B 4POXA 2REJA 2V3UA 5LOMA 1MY4A 4O3AA 5I57A 4EDPA 1B1HA 3MZ9A 5ITPA 3QUFA 1QKAA 3PD9A 3V89B 4KD5A 1MS7A 2ESNA 4YKIA 3GZGA 3D4GA 4F2OA 4OERA 2PMSA 4KI0E 1JNFA 2AIXA 2Q89A 2XXHA 3VVFA 3SESA 3IAZA 1LGBC 3IOTA 4DE8A 5M2VA 1B0LA 2Z8DA 1PB8A 2DE3A 1IXHA 3GBAA 4Q5TA 1SI0A 2QSXA 3MW0A 2IA4A 4GIZA 3HN0A 3K2DA 2GHBA 2XHDA 1I69A 5EYFA 1R1NA 4FEDA 4H67A 1D9VA 3SEUA 4F3BA 2ANJA 3W9VA 1UTBB 1Y4CA 5B7DA 1FQFA 4H5GA 3L6GA 4OESA 4JDFA 5I56B 4Z7EA 3FJ7A 2R71A 1SW5A 1CB6A 1DTGA 1N84A 4F29A 5CMMA 3F11A 4OWDA 2Z23A 1TXFA 5I59B 5EHSA 2RC8A 4QHQA 3CFXA 3T9UA 1QVSA 4R6KA 1FTKA 3H7MA 3E3KA 1EZOA 3EN3A 2DWAA 5KDTA 3CFLA 4ONYA 1QJMA 1QKBA 4YU0A 2ZNUA 2REGA 1JW1A 1B7UA 3H3GA 3CG3A 4IGTA 5ICTA 2ZMBA 4OETA 1T0KA 1LB9A 3UK4A 1GVCA 1UTHB 4HS7A 2P2AA 2XD3A 4K3FA 3BBRA 3B7DA 4WXJA 2F7CA 3MAMA 1M5DA 2F7BA 4YMAA 3N94A 1R9QA 2DWJA 5JEIA 3C32A 3DELB 4MH5A 1SI1A 1VFEA 5CC2A 5ELVA 5HPQA 2THIA 1H43A 4I9DA 4LONB 1Q1KA 1A7LA 4O3CA 2UVJA 1NL5A 4F22A 2F6GA 2I4CA 4F1YA 3PUXE 3KBRA 3CSBA 4IB2A 4ZZEA 4QFKA 3MZBA 2UYEA 4YAHX 5CBSA 3R7XA 2XX9A 2RC7A 4FIMA 2YJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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