1S9TA

Crystal structure of the glur6 ligand binding core in complex with quisqualate at 1.8a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the GluR5 and GluR6 ligand binding cores: molecular mechanisms underlying kainate receptor selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s9tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1s9tA02
2ONSA 4ECFA 2UYFA 3R6UA 4GD5A 4LZ8A 1WDNA 1JNFA 3OSQA 1MXVA 3KZGA 2RCAA 5H8NA 3UORA 5JTYA 3TCGA 2V84A 4IY6A 4XKPA 3RPWA 5HM4B 2F7AA 4H1XA 3H3GA 4NF5B 1A8EA 1ELJA 1LLSA 4KPTA 4TOZA 3HCQA 1ZU0A 5I59A 3QYTA 2QPQA 1L5TA 3VLWA 1P1UA 1NMUA 3VVDA 1H76A 2F6PA 4R73A 3SKPA 4QHQA 4NEDA 5FTHA 4ZZAA 3RTWB 2AL4A 5AA2B 4WEPA 3ILUB 3T66A 4QSDA 3RGYA 2V25A 3EHUA 2ZXTA 5DVJA 4HW8A 1ZTYA 2RF1A 3TQLA 3KBRA 2DSFA 1TT1A 1ZIUA 3V83A 2XXUA 5H8FB 4ZDMA 3S9MC 4NF4A 2I49A 5L9OA 1N76A 3G3IA 3O29A 3DELB 2I48A 3MC2A 2O69A 5J1DA 2QL3A 4OZ9A 3VVFA 3L6HA 3R7XA 5I58A 3OMBA 3PPPA 3KSJA 2P0SA 1SBPA 3EQ1A 1MH3A 3PPQA 3U94A 1M5BA 1UTBB 1H3DA 5TP9B 4NF8B 1N3WA 1XHYA 3H6UA 2HXWA 5TU0A 4GVOA 1SVXB 3GBBA 1A7LA 3TFLA 4OEUA 4X48A 3EF7A 2ZYOA 2ZYKA 2AL5A 3RTFB 3U1OA 4XKNA 1IXGA 2F34A 1D4NA 3T9VA 5HBCA 4ELPA 1D3KA 5ELVA 3MVWA 1N3XA 1XOCA 3TZAA 1PB8A 4BDLA 1B6HA 2F8DA 3TODA 3RT8A 2DXRA 1B2HA 4IO6A 4G8HA 4F1UA 2Q2CA 1LBCA 3FATA 5L9MA 4DDDA 3T9XB 5KZTA 3V8XB 1R9QA 3E13X 3H6TA 1CE2A 1TWYA 1B9JA 2VD2A 1JETA 1ATGA 4RJZA 3BFTA 1LAGE 3Q28A 2DP8A 4KR5A 3FV1A 4EXKA 4QFPA 3C9HA 1OQGA 5KCJB 4IO5A 4MBPA 3VDFA 4L17A 4GFRA 2VD3A 4NF5A 4DIGA 2UYEA 5BUUA 4BLAA 4R6YA 1F9BA 2OJTA 2R6GE 3E3KA 1FW0A 3DP4A 3CI8A 3MVXA 2Q88A 3WAFA 3KGCA 5AA2A 3LC8A 5JK4A 3WAEA 4YMAA 2E0SA 3CIJA 4ZEDA 4OVJA 3K6WA 3PGFA 5ITPA 3DP6A 3MW0A 5H8FA 2GFEA 1EU8A 4POXA 1M5CA 4OHNA 3FASA 3G3FA 1US4A 3IL1B 1LAXA 4EDPA 2I3VA 3SEYA 1DTZA 1IXIA 1IIWA 3S4UA 2XXXA 1NNKA 1NH8A 4KCDA 1XVYA 3FVOA 1A54A 2XXWA 1M5DA 3K2DA 2B3BA 3VXCA 4P0IA 2V3UA 1UTBA 1B3GA 1LAFE 5TP9A 4IO4A 4NF8A 4I8CA 2X26A 4NWDA 1PB7A 1ANFA 4QSCA 1DPPA 3S9NC 3OSRA 3QXMA 1JVXA 2Y7RA 4DXBA 4DZ1A 4G68C 5L9SA 2PVUA 4OETA 2B65A 4RK9A 1B3EA 1OMPA 3MAMA 2HEUA 1B5HA 2DWHA 2ZNSA 1YTVA 2QS3A 1IXCA 1R1NA 2XXIA 4GIZA 3MVYA 1QULA 4QFLA 2QS2A 4PFTA 1MXUA 2XXHA 3K02A 3D4CA 3K00A 2Z8EA 5DTBA 4F2OA 1MXYA 5HPQA 2Y84A 2O6AA 2XXQA 1P1NA 4F29A 2UVGA 1FTMA 2FNCA 1RYOA 1DOTA 4FEDA 1P99A 3TCFA 2I3WA 1QUJA 2XXPA 5I2KB 4NWCA 5EHMA 2WKYA 4K3FA 1B40A 3PV0E 2QMXA 1Y1ZA 4IO2A 2PBWA 5DT6A 3V5AA 1QKBA 1UQWA 3FZVA 1Y9UA 3RQTA 5FHNA 3U8QA 2OLBA 3PMXA 3OOAA 1JQFA 4E0XA 1Y3NA 5DEXB 2OCUA 4C0RA 4G8MA 4EQ7A 1MQGA 4RXLA 1ZKBA 3VXBA 4NE4A 5DVIA 4RNSA 1P1OA 4LZ5A 2F36A 3TMGA 3TCHA 4BDOA 3VVEA 4P11A 4PQJA 3MJNA 2F6GA 3PUZE 2XXTA 5CBRA 1NH7A 4ZZEA 1POTA 3MPKA 2QS4A 4F31B 1B46A 4HCYA 4DE8A 1DPEA 3QUJA 2O1LA 1FQDA 4MLQA 4Z0IA 2V3QA 1SI0A 2H98A 2UVIA 4UACA 3G3GA 1UIUA 1S9TA 3CG1A 5ITOA 4MLVA 4EQ9A 1GGGA 3IX1A 3H06B 5B70A 2PYYA 3E4RA 3SEWA 2RKMA 3FJGA 1US5A 4GXAA 5I56B 4PFUA 3N5LA 3A3CA 1JW5A 2BJJX 4GOTA 1MXXA 3T9HB 1P1WA 3CFLA 4G2ZA 1Q35A 1N04A 3TPAA 1MG1A 5CRYA 5B7DA 2ONRA 1H45A 4HCWA 1AOVA 4TLMB 1AMFA 3PU5A 3TAJA 1O64A 5DYHA 1BKAA 2O1MA 3H03A 2HAVA 4AQ4A 3PMWA 3VLVA 3CG3A 3MBPA 4EUOA 1B5IA 1AIVA 1J1NA 3C34A 3K4UA 2NUVA 2A5TB 4ESWA 5I2KA 2DE3A 3DM0A 1B52A 1Y4CA 1QVSA 2HZKA 4H5GA 2VP1A 3QUFA 3K6XA 1Z7ME 4JDFA 3N94A 2Q9TA 4PETA 4ELQA 3I5OA 1PC3A 5DVFA 4XKQA 3ODBA 2QS1A 5ICTA 5CMMA 4X1DA 3QAXA 3O97A 4O3CA 4XXUA 4M1VA 5DEXA 1NFTA 2ZYNA 4TLLB 1TFAA 1I69A 3BFUA 2XD3A 1LAHE 4H5FA 3HO7A 2D5WA 2OBGA 1URSA 3M8UA 3GLBA 2F7BA 1B7UA 2DOJA 1Q1KA 2RC8A 4LQ5A 4IO3A 4OESA 4GL8A 4DXUA 3W9WA 5I84A 1MY3A 5M2VA 1B58A 1B7ZA 1PDAA 3H6VA 3OD7A 4ELOA 4LATA 2H4IA 1MQIA 3QK6A 1B5JA 3GZGA 3PUYE 3OO9A 1LFHA 4PP0A 1T0KA 5I56A 3Q27A 1IQ7A 2XXRA 2O68A 4FORA 3K1MA 2ANJA 3HV1A 3KSXA 1YAEA 3TTNA 1LCTA 2Z22A 1RKMA 3S9EA 5AA2D 4Q5TA 2O7IA 1XC1A 2ZMBA 5AA1A 5TPAA 2DE4A 4LP2B 4Q0CA 3Q25A 1VE4A 2Q2AA 4H67A 4Z7EA 1XVXA 1MM6A 4I1DA 3ONMA 5CC2A 4XIGQ 4H8JA 3VE1B 4YB6A 4ESXA 3MP8A 3IB2A 1BIYA 2UXAA 4KCCA 3CVGA 3FJ7A 1LFIA 4IO7A 1IITA 3MZBA 4PE5B 2F7CA 3FVNA 2OZZA 4OQOA 3OELA 4G8NA 4C1TA 2G93A 2H25A 2A5TA 1AH5A 5CMBA 1LFGA 3K6UA 4KD5A 1B3HA 2VGQA 1D9YA 1GVCA 4UA8A 2OWSA 2DYXA 3CFZA 1OVTA 2NOOA 4BDNA 5FTIA 2X7QA 3SESA 3IOVA 5FHOA 2ZNTA 2F35A 1A40A 2GRVA 3MWBA 3HHGA 2P1SA 4YMBA 4KYSA 4MFIA 4YKPA 4IGRA 2I58A 3K6VA 3K0VA 4HTGA 4QFNA 4G68B 4KYDA 4IGTA 3ZSFA 1MXWA 3OENA 2QSXA 1OVBA 2O7UA 5AA4B 4DCYA 4BDQA 3IO4A 4OXVA 3AXFA 1XT8A 4E0WA 2CMOA 4X1BA 4ELRA 3K1PA 3HHFA 3L6GA 5CBSA 1B32A 2P2AA 2XX8A 4U4XA 4X9TA 3PD8A 3FVGA 1NL5A 1MQDA 2XX9A 1USYH 1SDXA 2RC7A 1GR2A 4OTEA 1I6QA 1Z7NE 3RUMA 4JWYA 4RA1A 4U23A 4KFQA 3JZJA 3O6HA 2YJPA 3FGSA 3PD9A 4YZZA 5EHSA 1SW1A 1R9LA 2GHBA 1CB6A 3ILTB 3SDFA 3F11A 4F1YA 3LUYA 1IXHA 4JBZA 3UA8A 1H43A 5ICQA 1O63A 2XHDA 1URGA 3W15C 4KYEA 1USYE 1M5EA 3FXRA 1DSNA 3S2VA 1LCFA 1MM7A 4N6PA 4RK2A 5H8SA 1FCKA 1I6BA 1ZJLA 3KOSA 4ISUA 5FHMA 1JVYA 5KDTB 1RYXA 1Y3PA 3K01A 3IR1A 1TXFA 2PT2A 1B3FA 1LGBC 2HAUA 1B0LA 3PUVE 2QMWA 2FA7A 3TYHA 3C33A 1SQYA 1QKAA 2ZYMA 3U92A 4H8IA 3O28A 4FATA 3PPOA 2QRYA 3FUZA 5I2NB 4FAJA 3MZ1A 1N7XA 3IOTA 3IJOB 2XD2A 4U2RA 2KLFA 3LSWA 4GRKA 1MDP1 2GH9A 3KN7A 2CZLA 4P0GA 4I62A 4H0WA 3C35A 1QUIA 3EHSA 4H65A 4N13A 1JEVA 4O3AA 3N6UA 3ZKLA 1A8FA 3RLFE 3IOWA 4RPOA 4G68A 2YPNA 2ZNUA 3GXAA 4QF9A 3N6TA 5AA4A 2I0BA 2IA4A 1XS5A 2UVHA 2H9BA 4QFOA 3VFJA 3KOTA 2DE2A 3FD3A 3Q26A 4DXCA 3RY3A 4FIMA 1GTKA 1UTHB 3TTLA 5AE4A 4ZEBA 4GF8A 1FQCA 3MP1A 1LB9A 4R9FA 3UGWA 2I0CA 2F78A 3SETA 3IB1A 4F2QA 5CM6A 3C36A 4F22A 4M4GA 1MY2A 4OENA 4ZEIA 2W7YA 2Q89A 5F1QA 3RT6B 4RY1A 1B51A 4H6DA 1B1XA 5TPAB 3MQ9A 1R6ZA 1B4HA 3U93A 3PPNA 1Y20A 3DLNA 3OEKA 3OO8A 1S7YA 4F3SA 2LAOA 5IKBA 1HSEA 4AB6A 1B7HA 3PMVA 4ZE9A 3G7WA 4OEVA 3H7MA 4YB7A 1JW1A 2H5YA 2M8CA 4OERA 3SEXA 4OYVA 3TEPA 5LOMA 3I6VA 2ALUA 3C31A 5KDTA 3M3KA 3MPLA 5L8DA 1BLFA 4EQBA 4OMBA 3O6IA 3LSXA 1OLCA 4F18A 4F19A 3JYRA 3ZKKA 2AYSA 2ESNA 3FV2A 3MUQA 5JEIA 1SYHA 3PPRA 4ZECA 4XKRA 3EHTA 4PFWA 3R26A 3QSLA 3BKIB 3IK6B 5I2NA 1H44A 3A3UA 1N84A 4G77A 4I9DA 2FYIA 4FJPA 3FVKA 3LR1A 1VFDA 1UIVA 4GQOA 3FXUA 4LONB 1PBQA 4OFLA 3T22A 1BP5A 3T93B 3GBAA 3USDA 1VR5A 3M3FA 3OO6A 1ZLQA 4THIA 3MP6A 4YKJA 3CSBA 4LVQA 1BTJA 4C1UA 3O66A 2NXOA 4EF1A 4FEBA 2Z8DA 2Z23A 1UTHA 2DS9A 4IB2A 1N7WA 5A5XB 1FQFA 5BWJA 2O51A 3TQWA 2HCAA 2DXYA 3JV9A 5F7VA 4LA9A 4FECA 4ZEKA 3UN6A 3SEUA 3PUWE 3IOUA 3VLUA 4NF6B 4O3BA 1MRPA 2IEEA 3DP8A 3O6GA 3K1NA 1Y1MA 1WODA 3I3VA 2DWAA 3HN0A 5H8HA 3H6WA 2NVUB 4KHZE 4ZEFA 1POY1 4WXJA 1MH4A 1B05A 4FE8A 4F3BA 5CMKA 3VV5A 3B6TA 4YU0A 2Y7IA 1NNFA 3B7DA 2DVZA 3OXNA 2I6EA 2E1SA 2AIXA 3EPEA 2PMSA 1NNPA 2VOZA 1MY1A 2Q8JA 3TELA 1MY4A 3IB0A 1LB8A 4LQ2A 1SW2A 4YAHX 1LSTA 3MZ9A 4RPNA 3G3KA 3FIRA 2X7PA 2PX1A 2V93A 3SERA 4GXSB 3CR9A 4U4SA 1FQAA 2Y7KA 4MH5A 1B1HA 1WVJA 2DQVA 3LSLA 1OLAA 3KJTA 3TTKA 4QSEA 2A5SA 4Q30B 1QJMA 3IJXB 2G29A 2ONKE 4R2BA 3E9XA 4JSOA 2NWJA 3IAZA 3KJ7A 4F1VA 3SEVA 1KWHA 2GHAA 4U1OA 5K2XA 1PEBA 1ZMGA 2ABHA 1GV8A 4HS7A 4ND9A 2OWTA 1MPCA 4BDRA 4RYAA 3KG2A 4U21A 3CSGA 1SW4A 3G3HA 4R6HA 3ECRA 3HPIA 1Y3QA 1N0TA 3EN3A 5H8QB 5EYFA 4PFYA 4F3PA 1SW5A 2D3IA 3V89B 3KN3A 3LBSA 3LSFB 2RINA 4R2FA 2RCBA 2I4BA 4NTLA 1PBPA 1I6AA 4GLIA 3OO7A 1II5A 4LZ7A 4BDMA 5A5XA 4YKIA 1JW4A 4TQUQ 3T9UA 1B3LA 1TFDA 1VSOA 2F5XA 3FXQA 1QUKA 4OWDA 4QFKA 1QW0A 1D9VA 5I57B 4NF6A 2Z8FA 4U22A 2R71A 3BBRA 5K2YA 3CFXA 3UK4A 2REJA 1HSJA 1MPDA 2F97A 4JSDA 2XX7A 3Q29A 3P7IA 2Y7WA 4NMYA 2R9JA 4YKKA 3RNNA 3TKDA 1SI1A 2DWIA 1PB9A 2PT1A 2XXVA 3KN8A 4JWXA 1FTOA 2DVCA 1MQJA 1MQHA 1FTKA 3THIA 1FTLA 4G4PA 4KQPA 4YB5A 3O9PA 5H8NB 5JTYB 3N26A 2HZLA 4N07A 4GL0A 2I4CA 1MXZA 1LBBA 2THIA 4QRZA 1JEUA 2QJEA 1EH3A 4DCXA 5KCJA 3CRBA 1URDA 1MS7A 3QIMA 1ZBMA 5I59B 2O84X 4F39A 1OIBA 1B0HA 4R9GA 3OEMA 3A09A 4ONYA 3B6WA 4Q8RA 3H4ZA 3B6QA 3TDJA 1FTJA 3C4MA 4F3GA 2REGA 4ZE8A 4DLDA 2XXYA 4JWOA 5CMCA 1DTGA 4XTCQ 2OK2A 2Y7PA 3D4GA 1SYIA 1DMBA 3RN8A 1NNTA 3TTMA 1EZOA 4U1ZA 2DWJA 3M3LA 4EF2A 2V3TA 4KI0E 1IUDA 4NF4B 2H99A 3HSTA 3U72A 1A55A 1VFEA 3C32A 1NKXA 1IZ1A 3ZS6A 4WEDA 2D21A 2HFBA 4MF3A 4LUBA 4R72A 5ISUA 5CI5A 4OFJA 4ZS9A 1YCJA 2HQ0A 5I58B 1FQEA 3G3JA 4JB7A 1MPBA 1B4ZA 5H8QA 1OQHA 3UP9A 3TUSA 4AB5A 2B3FA 2YLNA 4YICA 4WKMA 3PUXE 1O7TA 2VHAA 4OFOA 2UVJA 3MVZA 4POWA 3KEIA 1M5FA 4IY5A 1YPNA 5IAIA 1MY0A 3FJMA 3IORA 3S9LC 1HSLA 4R6KA 1S50A 4R74A 5I57A 1IEJA 1EZPA 5H8HB 2RC9A 3UIFA 4EXLA 3O2AA 3IO6A 5AA3A 1SD3A 4GWOA 1A99A 1AL3A 3W9VA 3T96B 1Y4TA 3KFMA 1MDQA 1EZ9A 4JXIA 4R75A 1FQBA 3TTRA 1P1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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