1SW1A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with proline betaine
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 93
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw1A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw1A02
2RF1A 4ECFA 4JSOA 1DOTA 5KCJB 1PC3A 4F3PA 2QMXA 3LBSA 3K1NA 4M1VA 1KWHA 2O7UA 5A5XB 4TQUQ 1USYH 3Q25A 4BLAA 3D4CA 3KN8A 3MQ9A 1B6HA 2DWHA 3V8XB 2PMSA 4UACA 4GOTA 4K3FA 3QIMA 2I48A 2XXYA 4YB5A 4I1DA 5KDTA 3KEIA 3V83A 2XXWA 1MPBA 2F34A 4RK9A 1DSNA 3E9XA 4FAJA 4R6HA 3QK6A 5CMMA 3LR1A 2VOZA 1ZMGA 3V5AA 1SW1A 2B3BA 3N26A 1JW5A 3EHSA 2GRVA 1FQAA 5AE4A 5H8SA 4QHQA 1TXFA 4OEUA 3VLWA 4PE5B 3RLFE 4ZEFA 1SYIA 1XHYA 3VV5A 3OO8A 1LFIA 3FVKA 5H8NA 2H99A 2OBGA 3E3KA 4GFRA 4MF3A 1LBBA 4EQ9A 1LGBC 4YZZA 1XS5A 3KGCA 5AA1A 2F6GA 1NNPA 3HPIA 1B5IA 4Q5TA 3EQ1A 2RCBA 5CMBA 1ZTYA 1DPEA 2Z8DA 3UIFA 4POXA 3MPKA 4F3GA 3H7MA 4R9GA 2F35A 3O9PA 1RYXA 3S4UA 3VE1B 1PB9A 1LCFA 3KSXA 4G68A 2O6AA 1Q1KA 1POTA 3FV2A 4QF9A 1NL5A 3L6HA 4XXUA 1YAEA 3HHFA 4JDFA 5A5XA 1IXHA 3N6TA 3PUXE 4U1ZA 2X7PA 4NF4A 3K6VA 3QXMA 1B3EA 3RTFB 5DT6A 5L9OA 1WODA 3RPWA 3MVXA 3GBAA 1JVXA 1B3FA 1MH4A 1MRPA 1B1XA 3O2AA 2XXPA 2H25A 3I5OA 1B9JA 4P0GA 3TTNA 5H8FB 1B58A 2ONKE 1PBQA 1IQ7A 1CE2A 1EZOA 2P2AA 3V89B 2A5TB 2P1SA 2XXRA 4H5FA 4GXAA 3RTWB 3OMBA 4XTCQ 3ZKLA 1ZJLA 5H8QA 4OERA 2F7AA 1B40A 3E13X 4RPOA 4JWOA 5TP9B 4O3BA 5AA2D 5AA2A 5F7VA 1IXIA 4U1OA 3EF7A 3K00A 4GL8A 3CG3A 3N94A 2DWIA 4LZ5A 3PMXA 4IGRA 4OEVA 1SW4A 1UTBB 4FJPA 4KFQA 1PDAA 1OQGA 3B6QA 3RT6B 3UK4A 4NTLA 4EXKA 1D9YA 2VP1A 3OSRA 1IEJA 1MY3A 3ECRA 3JYRA 3VVDA 3USDA 1Y3QA 2V93A 3MUQA 2FYIA 2QS3A 4JBZA 2ZYNA 2F8DA 3H6UA 2I4CA 1N76A 3H3GA 2CZLA 1QKAA 5J1DA 3VFJA 2G29A 4R6YA 1ATGA 4Q30B 4XKQA 5FHMA 4R73A 3VVFA 3U92A 4QFNA 1M5FA 5B70A 4DDDA 1MY0A 2DWJA 2HQ0A 2I6EA 1Y4TA 2A5TA 1FTMA 4LUBA 1IXGA 4Z7EA 2XX9A 5HPQA 4ZECA 1QUJA 3B6TA 3LSFB 3R26A 4F39A 1MXXA 2ZYKA 2R6GE 2H4IA 3FV1A 4OMBA 4C0RA 3MW0A 3KN7A 3MZBA 5CBRA 1UIUA 3PV0E 4QFKA 1I6QA 4RA1A 4C1TA 1YPNA 3IOUA 1SI1A 1FQDA 4ZS9A 3A3UA 3TELA 4YICA 4F1UA 4PFYA 2P0SA 4IO7A 5L8DA 1UTBA 3IK6B 1T0KA 1OLCA 3IOWA 3TYHA 2FA7A 2YJPA 3ILTB 1UTHB 2REJA 3MVYA 3AXFA 2RKMA 4DXBA 4YKKA 1IUDA 3SERA 1NNTA 3TDJA 4RXLA 3K6WA 2QJEA 4GL0A 4XIGQ 1D9VA 3I3VA 4FECA 5HM4B 2REGA 4Q8RA 4U21A 5IAIA 2V3TA 5DVFA 1GV8A 3HCQA 1FTJA 3G3GA 1B7ZA 2I0BA 1US4A 4OESA 5ITOA 4ONYA 1Q35A 2H5YA 3SKPA 3T22A 3GZGA 2ZNTA 1MQGA 1RKMA 1GGGA 1FQCA 4RY1A 3KN3A 1VSOA 4ND9A 1MQJA 5I56B 3SEWA 1MDQA 1USYE 5I57B 4XKRA 4QRZA 1B7UA 1JEUA 1A40A 3PMVA 1JW1A 4EUOA 1O63A 2YPNA 5TPAB 4G4PA 4P0IA 1MDP1 3TUSA 3KBRA 3UA8A 3Q28A 2QL3A 1QJMA 3TTRA 4F2QA 1R9LA 4F3BA 2OLBA 3ODBA 3S2VA 4NMYA 3CR9A 4YB7A 3N6UA 3R6UA 1MXVA 1H43A 5CBSA 1UTHA 1MXUA 4YMBA 3OO9A 4Z0IA 5K2YA 4LP2B 4ZZAA 3IO4A 2O84X 1A7LA 5LOMA 1R1NA 1DTZA 3BKIB 3ILUB 1MY2A 2Q89A 4AB6A 4KQPA 3H4ZA 4QSDA 4BDRA 2I3WA 3FVOA 3PPQA 1M5BA 3DP6A 4X48A 1SBPA 3L6GA 2F5XA 1FW0A 2FNCA 4M4GA 5EHSA 1A54A 4IO6A 2ZYMA 1IIWA 5I2KB 3OSQA 2VD2A 2BJJX 2ZMBA 1VE4A 2Q9TA 4X1BA 4DLDA 2Z8FA 4MBPA 3S9MC 2QPQA 4U2RA 1OIBA 1P1UA 1XT8A 4JXIA 3Q29A 1ZBMA 5CRYA 2E0SA 4KCDA 4I9DA 1NKXA 5ITPA 3TQLA 1LCTA 4ZEIA 4F31B 3W9VA 4TOZA 5TPAA 1GVCA 2QMWA 3OENA 4NF8B 2Y7RA 1AMFA 1EU8A 2ONRA 1A99A 2HFBA 2DOJA 2XXIA 5FTIA 3DELB 1B0HA 3W15C 1LAXA 1ZU0A 2VGQA 2R71A 4DIGA 4OTEA 3U1OA 4F18A 3KJ7A 3SETA 2DXRA 2GHBA 3H6TA 3JZJA 4N13A 2V25A 5JTYB 1JEVA 4G68C 4YKIA 1HSEA 2F97A 2AIXA 1MQIA 1F9BA 1B05A 1L5TA 2D21A 1NFTA 1N3WA 3RQTA 2B3FA 4KPTA 1MXZA 3KOTA 2ZXTA 3PUYE 5ICTA 3K1MA 1ANFA 3CFZA 3U8QA 4ZEBA 3F11A 5I2KA 3WAEA 3K4UA 4EXLA 5TU0A 3IB0A 1RYOA 5KCJA 1PBPA 5FHNA 3PD9A 2Z23A 3S9LC 3VVEA 4H6DA 4X9TA 2ANJA 4H8JA 3C9HA 4WEDA 4G77A 4WXJA 2HAUA 2XXTA 2UVIA 1JETA 3UGWA 2Y7PA 3CSBA 3GLBA 4C1UA 3N5LA 4F1YA 2OJTA 2UYFA 4LONB 4NF8A 4E0WA 1BKAA 4LQ2A 1Y3NA 3HSTA 1N3XA 1B32A 1AL3A 5H8HB 4YMAA 2LAOA 3SEYA 5I58B 1MQDA 2QS1A 5ICQA 2V3UA 3FVGA 4DXCA 4AQ4A 4OZ9A 4DXUA 1XC1A 3QUFA 4KYEA 1MPDA 3TMGA 1FTLA 3KFMA 3PD8A 4OFOA 1QW0A 3QUJA 3H6WA 5EYFA 3A3CA 1FCKA 2Y7WA 4MLQA 4NF6B 1M5EA 3IX1A 1US5A 5FTHA 4QFPA 4QSEA 3HHGA 1CB6A 3OO7A 3TZAA 4R72A 1LAFE 1MQHA 4O3AA 3E4RA 2QS2A 4R2BA 4O3CA 2XX8A 4BDOA 1OQHA 4I8CA 4THIA 1UIVA 4TLLB 4HCWA 2THIA 2AL5A 1B5JA 4H65A 3K02A 3PPPA 1XOCA 3OEMA 3K6XA 3MWBA 1LB9A 4ELOA 4IO2A 1GR2A 1XVXA 3MZ9A 4QFLA 3EHTA 3LUYA 1PB8A 4PFTA 1FQEA 4YKJA 1B3HA 4YAHX 3K2DA 4U4SA 3I6VA 1QKBA 1AH5A 3CRBA 3VXBA 5I59B 5I58A 5H8FA 3C31A 1SVXB 3IOVA 3FZVA 4F2OA 1MH3A 1MG1A 1OVBA 1OVTA 4ELPA 3TKDA 4G2ZA 3FIRA 2XHDA 3UORA 4RK2A 1B1HA 4PP0A 4R74A 4IO4A 3SESA 1AOVA 1DMBA 4F1VA 3JV9A 5TP9A 4LATA 3TEPA 2HZKA 2OWSA 1BIYA 1A8EA 3O28A 3MAMA 5DEXB 3IL1B 3SEXA 4QSCA 2DWAA 1Y3PA 2RINA 1TWYA 2E1SA 2DQVA 3BBRA 1VR5A 1NH7A 2CMOA 3T9VA 4LQ5A 1LAHE 3K6UA 3C32A 3DM0A 1JVYA 1URSA 3TQWA 3THIA 2Q88A 1Y1ZA 2PT2A 2VD3A 4GRKA 4R6KA 4N6PA 3FVNA 3PPOA 1P99A 4ESWA 4YKPA 2Y7KA 2I4BA 2D3IA 1YTVA 3EPEA 1M5CA 4GWOA 4WKMA 2V84A 2DE3A 3C34A 3M3KA 2UYEA 1MY4A 2H9BA 2Z8EA 5KZTA 4MLVA 1ZLQA 3PUVE 2XXUA 3TFLA 4IO5A 3G3IA 1NNFA 4LZ7A 2IEEA 4UA8A 4OFJA 5CMKA 2GFEA 3O6HA 5BUUA 3ZS6A 2QRYA 3EN3A 3T66A 1SW5A 2H98A 1SI0A 3OOAA 2Q2CA 1EZ9A 3HO7A 3Q26A 3IB2A 4E0XA 2Y7IA 4TLMB 1I6AA 3DP8A 1LBCA 3G3HA 4RPNA 1XVYA 4RYAA 2GH9A 3ZSFA 5DTBA 2ZYOA 5JK4A 3DLNA 4YU0A 3G3JA 2DVCA 4ISUA 5CM6A 5FHOA 1TFDA 3H6VA 3O6IA 1S50A 3GXAA 1NMUA 3CG1A 2M8CA 3TTMA 2DS9A 5KDTB 3CFLA 1B2HA 5F1QA 3T9HB 3MC2A 1D3KA 2V3QA 2OWTA 3QYTA 1SQYA 4EF1A 4F29A 1MY1A 5IKBA 1B5HA 3G7WA 1FTOA 1I69A 2RC7A 1B51A 3G3FA 4GQOA 4HTGA 3PU5A 3TAJA 1P1QA 2HZLA 1GTKA 1JQFA 4OWDA 1P1WA 3U72A 2I3VA 3P7IA 3PGFA 3K1PA 1R9QA 2ZNSA 4X1DA 4OYVA 4ESXA 3FD3A 5I56A 1YCJA 2KLFA 3C4MA 3MZ1A 1II5A 4NF5B 5I57A 4GVOA 2ESNA 1ZIUA 3TTKA 5K2XA 1ZKBA 1I6BA 3FJMA 4G68B 1LLSA 2NVUB 5CMCA 3VLVA 3SEUA 3RT8A 4XKNA 4KCCA 2D5WA 1B4HA 3FUZA 2DE4A 1EH3A 1B4ZA 4HCYA 3RGYA 5L9SA 4U4XA 3U94A 4NF4B 4LZ8A 3CSGA 4I62A 4IB2A 5B7DA 1FTKA 3FJ7A 3KSJA 1B7HA 4OENA 4DZ1A 5BWJA 2O1LA 4MH5A 3B7DA 3KOSA 4G8MA 1LSTA 3A09A 3CIJA 3SEVA 4IGTA 4NWCA 3BFUA 1B46A 4ZEKA 5ELVA 3TPAA 5I2NB 3WAFA 3IR1A 4LVQA 3T9UA 3MJNA 4KYDA 1FQBA 2PYYA 2F78A 2HEUA 5H8QB 3K0VA 1A8FA 1Y4CA 1M5DA 3C36A 4IO3A 2HAVA 4GLIA 5I84A 2OZZA 3FXRA 4POWA 4JWXA 4R75A 5AA2B 3IORA 1NNKA 2ALUA 3MPLA 2ZNUA 4DCXA 3OXNA 1PEBA 1O64A 4RNSA 5DVJA 1SYHA 3G3KA 3PUZE 2UXAA 1MM6A 4PETA 3T93B 3U93A 4NF5A 3HV1A 3PPNA 2NWJA 3R7XA 1H76A 1S7YA 4F19A 4RJZA 2XD3A 5HBCA 3IJOB 3LSWA 2G93A 2A5SA 1OMPA 2XXVA 4FEDA 3CI8A 3SDFA 3PPRA 4P11A 3ONMA 4ZE8A 4GXSB 4OFLA 1JNFA 3KZGA 2DXYA 1BP5A 3LSLA 3O29A 3M8UA 2XX7A 4PFWA 1OLAA 5AA3A 3UN6A 3W9WA 3CFXA 2X7QA 5ISUA 3C33A 3H06B 1DTGA 2NUVA 4FEBA 4G8NA 1Z7ME 2RC9A 3FXUA 3PMWA 2UVGA 4NE4A 3M3FA 1ELJA 5JTYA 1H45A 5M2VA 3IO6A 3MP1A 2B65A 3MP8A 1BLFA 4KR5A 5I2NA 3D4GA 4ZEDA 1IXCA 1A55A 1TT1A 1HSJA 2F7BA 1NH8A 1JW4A 3QAXA 2AYSA 3FATA 2Z22A 2NOOA 3KG2A 2GHAA 4N07A 4G8HA 2DE2A 4HW8A 1PB7A 4GIZA 5AA4B 4FATA 1Y9UA 4FORA 3VLUA 3IJXB 2O69A 4GF8A 2ONSA 3DP4A 1QULA 1AIVA 4EDPA 2UVJA 4NWDA 4LA9A 2WKYA 4FIMA 1P1OA 2PVUA 1VFDA 1LAGE 4DCYA 4H5GA 2RC8A 4IY6A 1R6ZA 1MM7A 3T96B 1S9TA 3O6GA 3IAZA 4ZE9A 4EF2A 1BTJA 3GBBA 1QUIA 4BDMA 4HS7A 5H8HA 4EQBA 3FXQA 4F22A 2PX1A 3EHUA 4AB5A 1N7XA 2UVHA 2I49A 1N0TA 2RCAA 2R9JA 2QS4A 3QSLA 3FASA 3C35A 3RY3A 2XXQA 1QVSA 4OQOA 1B52A 3TTLA 3MVWA 4NF6A 1MS7A 1LB8A 2O68A 2Q8JA 3RNNA 1IITA 4U23A 2Y84A 3M3LA 4BDLA 4Q0CA 1UQWA 3RUMA 4R9FA 3FJGA 1P1NA 3OO6A 1LFHA 2XXXA 3BFTA 1J1NA 3O97A 3K01A 5L9MA 3T9XB 2PBWA 4GD5A 4IY5A 4OVJA 1DPPA 2W7YA 5AA4A 1SDXA 3S9EA 4KD5A 4FE8A 1B3LA 2O51A 2HCAA 3RN8A 1O7TA 4L17A 4ZDMA 3OEKA 2AL4A 1URDA 3TODA 1TFAA 2O1MA 4ELQA 4ELRA 1LFGA 1N84A 1SD3A 4JSDA 2OK2A 1Y1MA 4YB6A 3TCGA 1URGA 4H67A 3TCHA 5I59A 2ABHA 2IA4A 3UP9A 4DE8A 2I58A 4OXVA 3IB1A 3MVZA 3OELA 5DYHA 3CVGA 2X26A 4QFOA 2F36A 4NEDA 4H1XA 2HXWA 2QSXA 3O66A 5CC2A 3LC8A 2DSFA 4H8IA 3B6WA 5JEIA 1HSLA 1VFEA 1SW2A 4PQJA 4BDQA 1Y20A 1B0LA 4MFIA 1WVJA 5DVIA 5DEXA 4BDNA 2YLNA 1D4NA 1MXWA 3MP6A 5EHMA 2XD2A 3TCFA 1B3GA 4ZZEA 4JWYA 3PUWE 1N04A 4U22A 2DYXA 4XKPA 4KI0E 2F7CA 1FQFA 3MBPA 1EZPA 4OETA 2DP8A 3LSXA 3Q27A 4H0WA 1H3DA 3S9NC 4OHNA 1MXYA 2XXHA 4EQ7A 3FGSA 1WDNA 3ZKKA 1Z7NE 2I0CA 1QUKA 2OCUA 2O7IA 3KJTA 2F6PA 3VXCA 1MPCA 4F3SA 4WEPA 4KYSA 3VDFA 5H8NB 2DVZA 2Q2AA 5CI5A 3H03A 4PFUA 3HN0A 3OD7A 2VHAA 4KHZE 4JB7A 2NXOA 1POY1 3IOTA 1IZ1A 2PT1A 1H44A 1N7WA 4R2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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