1SW2A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with glycine betaine
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw2A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw2A02
1SBPA 3U92A 3ILUB 4G8MA 3D4CA 2VOZA 5I56A 1LFHA 5TPAA 3G3JA 1JVXA 1B1XA 3PMVA 1PB8A 5LOMA 3H6WA 3WAEA 4U4SA 4Z7EA 3HN0A 5CMKA 4ZEFA 2Q88A 5I59A 2F78A 3G3KA 3L6GA 3O9PA 1MM6A 1AIVA 3CSGA 4OFLA 4X48A 3G3HA 5EHMA 3KG2A 3FVKA 3JZJA 2F36A 2HQ0A 5I57A 3M3LA 5F7VA 1ZIUA 2H4IA 5ITOA 3UORA 1OVTA 3S9LC 3G7WA 2UVJA 1H44A 3CG1A 4WXJA 5HBCA 3QUJA 1OMPA 4HW8A 2XX7A 1B4HA 3RUMA 1O7TA 3TELA 1A40A 2ONRA 3V5AA 5KZTA 4G4PA 4G77A 2RC8A 4ZS9A 1HSJA 5HPQA 1USYH 4OEUA 5BUUA 5DYHA 2H98A 4GRKA 3MP1A 3O6IA 3S9NC 3FVNA 4EF1A 3SESA 1LBCA 2CMOA 2DP8A 2A5TA 3MPLA 2Q89A 1NH8A 3TTRA 4U1OA 4PETA 3B6QA 3SEWA 5FHNA 3SEUA 5CI5A 5H8QB 3K1PA 1ZJLA 1SYIA 2RKMA 3PPPA 1JVYA 4G2ZA 2DE3A 2Q8JA 4R75A 4KCCA 1Y3NA 5IAIA 3LR1A 4E0XA 1EZPA 4R9GA 1TFDA 5K2XA 2IA4A 3V83A 2G29A 1D4NA 5DVJA 1OIBA 5CMBA 1B05A 4JWYA 4I8CA 4GWOA 4DCXA 3IJOB 3GBBA 1OQHA 3FASA 3PD8A 4PQJA 2W7YA 3K6VA 4IO4A 3G3FA 5H8NB 1IXIA 4I1DA 4BDLA 3K02A 3L6HA 3MP6A 1VFDA 1BP5A 4JDFA 1B5JA 1B3LA 5J1DA 2KLFA 3H06B 5H8FB 4LQ2A 4OZ9A 1SW1A 1I6BA 1I6AA 2I48A 4OESA 5JTYB 5ITPA 4FIMA 2HAVA 1FTLA 4NEDA 4F19A 5CBRA 4WKMA 2PYYA 4DLDA 2F97A 1SD3A 3W15C 4ECFA 3R6UA 4N07A 1MPBA 4GL0A 5CRYA 4MF3A 2XX9A 2I0BA 4IO3A 3A3CA 4H5GA 4OXVA 3VLVA 1MQIA 1N7WA 1GV8A 1FQBA 1YTVA 2YJPA 4R6HA 1ZBMA 3O6GA 3MZBA 3TTLA 1NL5A 4XXUA 1GTKA 1Y9UA 2XX8A 2UVGA 3IO4A 3KN7A 5CM6A 1N7XA 4RY1A 4WEPA 4YB5A 3ZS6A 4POWA 3OSQA 3K1MA 4PP0A 3FATA 1MY0A 1P1NA 3DP6A 3OEMA 2DSFA 4QSCA 2HZKA 1AH5A 1LFGA 4GLIA 4AQ4A 2PMSA 4LATA 3TCHA 4ZDMA 1MH3A 2QL3A 3C34A 1FTMA 1UTBA 3KJ7A 1GGGA 1OQGA 4N6PA 3TKDA 3PPNA 5H8QA 4H0WA 2DXYA 1BKAA 3VVEA 2OZZA 3FIRA 2ONSA 3PUZE 4LZ7A 3FD3A 2NUVA 3QUFA 3Q29A 1ZKBA 4FATA 4YMAA 3SERA 3LBSA 2QRYA 1N76A 1I69A 3IK6B 1EU8A 2I58A 5B7DA 3TUSA 3UGWA 3HO7A 3OO9A 4YKIA 5EYFA 2OBGA 3FV1A 1ATGA 2REJA 4ONYA 1SW5A 3TTKA 2Y84A 4I62A 3KSXA 3HHGA 2V25A 2XXIA 3PUVE 1T0KA 3LSWA 2DE2A 1B0LA 3MVXA 1B4ZA 3A3UA 5JTYA 2Z8DA 3S4UA 3FJ7A 1P1UA 2HAUA 4QF9A 4LUBA 3RT8A 3THIA 4EUOA 1MXYA 2O68A 1B5HA 1S7YA 2LAOA 4JBZA 4YICA 4OVJA 3TMGA 1PB7A 2ESNA 1Y3PA 3N6TA 3VVDA 4YKKA 1UTHB 4IO2A 4I9DA 3PD9A 4U21A 4ZZEA 1B9JA 1QKAA 1AOVA 1Y4CA 2Y7PA 1P1QA 3T22A 2ZYMA 2VGQA 4M1VA 1M5EA 3MQ9A 3IJXB 1JEUA 4GXAA 1A54A 3V89B 4HS7A 3IOVA 3K0VA 3CIJA 1GVCA 1JETA 3KBRA 2Z8FA 2QMXA 3M8UA 4HCWA 3E9XA 1R1NA 5DVFA 1SW2A 3G3IA 2PT2A 3JYRA 3VXCA 5I2NB 3H3GA 1FQEA 4RJZA 1OLCA 2GH9A 1NNTA 4F3GA 4ZE8A 4Z0IA 4IB2A 5BWJA 4C1UA 3K6WA 4P0GA 1F9BA 4ZEBA 4ELPA 4OENA 3LSLA 3PPOA 2B3BA 4KD5A 1MY4A 3TTMA 3IX1A 2F6GA 2P0SA 1MPDA 4KHZE 1J1NA 2F5XA 1XT8A 2R6GE 3QXMA 4LA9A 5K2YA 2O1MA 2YPNA 3EN3A 1VE4A 4IGTA 4F1VA 4XTCQ 3RTFB 2OLBA 5L9SA 2GFEA 3UA8A 4GL8A 4IO7A 4ELRA 3SEVA 3C32A 1MQJA 2Y7WA 3EHUA 4JWXA 4EDPA 1ELJA 1M5DA 3U8QA 5DEXA 2AIXA 2Q2AA 4XKRA 4QFLA 4E0WA 2RCBA 2Z23A 2X26A 2XXTA 4GOTA 3QYTA 4NF8B 1A55A 4ND9A 1PB9A 5AA3A 3K00A 3ODBA 2HXWA 3MPKA 3OO7A 3P7IA 1B32A 3EQ1A 2F6PA 2I3VA 2XD3A 2IEEA 3B6TA 3B6WA 3C36A 4G68C 4XKNA 3SEYA 3IL1B 3USDA 1B5IA 2XXYA 4GVOA 4KYSA 4BDRA 2O1LA 2Q9TA 4GD5A 3ZKLA 1QUJA 2WKYA 1YPNA 1MY2A 2AYSA 1MY3A 1USYE 1XHYA 4NF5B 3N6UA 5I2KB 2FYIA 3HCQA 3KJTA 3CFXA 4NF4A 4FJPA 1FW0A 3KSJA 3K2DA 4U22A 4H65A 2QS2A 4XKQA 1R9QA 3MP8A 3FXUA 3IOTA 5KDTB 3MVYA 4RPOA 1Y4TA 3TPAA 3FV2A 5CBSA 4Q30B 3FZVA 1Q1KA 5I2NA 3MC2A 2AL4A 3K6UA 2REGA 3K1NA 5HM4B 1B6HA 4JXIA 4DIGA 4M4GA 4U4XA 1PDAA 3DELB 3PUXE 3C33A 5KCJB 1B7HA 3AXFA 3GBAA 5IKBA 3WAFA 1O63A 4QRZA 1EZ9A 2PT1A 1LAFE 4UA8A 1DPPA 3TCGA 4F18A 1S9TA 5DT6A 1L5TA 4YMBA 4RNSA 3O97A 1NH7A 2QPQA 4LQ5A 1D9YA 1MQDA 4G8HA 2NVUB 1IXHA 2HEUA 1QKBA 1OVBA 1B1HA 3ONMA 4IY5A 5L9MA 1M5FA 4U23A 4C0RA 4FEBA 4AB6A 1NKXA 3H03A 3VVFA 1LAHE 1M5CA 2CZLA 3T93B 4GXSB 3O2AA 1URDA 5FTHA 2RC9A 3K01A 2NXOA 4DCYA 4F2OA 3Q26A 4JSOA 3VLUA 4KQPA 2OCUA 4YZZA 1POTA 4DZ1A 5AA2B 3TEPA 1IITA 3HPIA 2A5SA 3GLBA 1URSA 3FXRA 5EHSA 2Y7IA 3CVGA 3OXNA 3EHSA 1B51A 1HSEA 3H4ZA 1CE2A 5ICQA 4YKPA 3O66A 1YAEA 4NWCA 1B3EA 4O3AA 3H6TA 1POY1 1MXVA 4TOZA 3N94A 3SDFA 2THIA 2ZYOA 3MJNA 4F2QA 3B7DA 3TYHA 4OERA 4U1ZA 3EHTA 5DVIA 3ZKKA 5AA2D 1A99A 1SW4A 2ZYNA 1VFEA 4GFRA 4QFPA 3SETA 5I2KA 4ZEKA 3ECRA 1ANFA 4R6YA 4F3BA 5KDTA 1LBBA 2RCAA 3S9MC 4HCYA 1FQDA 2I0CA 5AA4B 4JWOA 2B3FA 3MVZA 2Y7KA 2XD2A 3LC8A 1EZOA 2PX1A 4R2FA 3CFZA 3M3FA 3T9HB 4WEDA 5I84A 3PMWA 3PV0E 4PFUA 3VDFA 4XIGQ 3TCFA 1SI0A 3O28A 1MY1A 2XXUA 4EQ7A 4FEDA 4RXLA 4FAJA 1XVXA 1CB6A 3U1OA 3E4RA 3BKIB 5KCJA 3GXAA 2B65A 1XOCA 5I56B 4MLQA 5TPAB 5H8HB 5H8NA 2FNCA 4UACA 3W9VA 4IO5A 1B3FA 2DOJA 1WVJA 2DXRA 3DM0A 4U2RA 2O7IA 3VE1B 3I3VA 1UIUA 3E13X 3PPRA 3QIMA 3H7MA 4NTLA 4TLLB 3BFUA 5H8FA 1IUDA 5AA1A 4G8NA 5ISUA 3SKPA 1YCJA 1IQ7A 4YKJA 4OMBA 3IOWA 1WODA 3CFLA 3GZGA 4MFIA 5FTIA 3CR9A 1NNPA 1Q35A 1GR2A 4FORA 1IXCA 4JB7A 4EQBA 3UN6A 4H5FA 5I57B 3T66A 3QSLA 2UVIA 3I5OA 4H1XA 3LSFB 2V3QA 1DTGA 3UK4A 2DVZA 4DXUA 1LCFA 1H45A 2Z8EA 3KZGA 5CMMA 2OK2A 3RPWA 4RA1A 1IIWA 3S2VA 2F7BA 2Q2CA 1N84A 4OHNA 3OEKA 1ZTYA 1VSOA 2H5YA 2XXXA 4LVQA 3C31A 4LONB 4DE8A 3T9UA 2P1SA 1XS5A 3OO6A 1LAGE 4YAHX 3G3GA 1B40A 2ZNUA 3FVGA 2XXPA 4DDDA 4F1UA 3U72A 1JEVA 3MUQA 2M8CA 2DVCA 3R26A 4O3CA 3O29A 1FTKA 4P0IA 4N13A 3TZAA 2ZYKA 3OMBA 5I58B 1SVXB 3IO6A 2XXRA 1FQCA 2ZXTA 3BFTA 3T96B 1VR5A 3HV1A 1B0HA 2X7QA 1FQFA 1TXFA 2HCAA 1IXGA 4KYDA 2XXHA 2GHAA 1RYXA 3RQTA 4Q5TA 1NFTA 4R2BA 3I6VA 4ZEIA 1OLAA 3PGFA 4ELOA 2NOOA 1AL3A 4EF2A 3CI8A 1H43A 2Z22A 4QSDA 3LUYA 2H99A 3C4MA 3D4GA 3HHFA 5H8SA 1B58A 3QK6A 3OSRA 1XC1A 4X9TA 4OYVA 5H8HA 3U93A 3TQWA 2VP1A 3W9WA 3C35A 1BLFA 2D3IA 5CC2A 3OO8A 3DLNA 2F8DA 1FTJA 1II5A 3RLFE 3MWBA 3IB0A 4BDNA 4P11A 4F29A 1DMBA 4R6KA 1N3WA 2D5WA 4FECA 4F1YA 1Z7ME 4ESWA 2AL5A 3DP8A 4R74A 3TODA 4GIZA 3T9VA 1QVSA 1DPEA 3F11A 1NNFA 2V3TA 1KWHA 2I49A 1UTHA 3IORA 1D9VA 3RGYA 2O69A 5JEIA 4GF8A 1A7LA 1IEJA 4POXA 3PUYE 1TWYA 4OFJA 3BBRA 3U94A 5L9OA 3MZ9A 3KOTA 1P1OA 3FGSA 1RKMA 4BDMA 2DS9A 2UXAA 1US4A 2QS1A 3R7XA 4X1DA 4H6DA 4KI0E 4ZZAA 3VV5A 3Q25A 2RC7A 1MS7A 2E0SA 2DWIA 2R9JA 4NE4A 1UTBB 3MBPA 3TAJA 3IB2A 3IAZA 3VFJA 2E1SA 4EXKA 1FTOA 4QFKA 3A09A 3IR1A 2ZNSA 1MXXA 5F1QA 3K4UA 4DXBA 4OETA 3FVOA 3C9HA 1XVYA 2XHDA 1MPCA 4XKPA 4NWDA 4KR5A 4RK9A 2QS3A 5I58A 3QAXA 1B3HA 3LSXA 3FJMA 1LSTA 1MQHA 1Y1MA 1MXWA 3DP4A 3N5LA 4ELQA 3ILTB 4THIA 1O64A 5TP9B 3TDJA 1QUKA 4OFOA 3PPQA 4Q0CA 1N3XA 2VD2A 3FUZA 2PBWA 4PFYA 2F35A 1A8FA 2RINA 2QS4A 4LZ8A 4H67A 2NWJA 4KPTA 2VHAA 1JQFA 1R6ZA 2OWSA 1LLSA 4YB7A 2D21A 1MXZA 3K6XA 1LFIA 4R73A 1UIVA 1ZU0A 3KOSA 2O84X 2DE4A 4KYEA 1MRPA 3UP9A 3FJGA 3H6UA 3VLWA 1JW1A 1MDP1 5FHOA 4EXLA 4NF8A 2P2AA 4R72A 4OQOA 1H76A 4ZECA 1TT1A 1FCKA 1PBPA 1BTJA 1FQAA 4ISUA 3SEXA 3MVWA 2FA7A 4QFOA 3PU5A 2XXWA 1US5A 1D3KA 4O3BA 3TQLA 3PMXA 4F22A 2O6AA 2V84A 3MW0A 4BLAA 4HTGA 4TLMB 3CRBA 1PEBA 2I6EA 4BDOA 3EPEA 1N04A 4IO6A 3OENA 1PBQA 3M3KA 4AB5A 1H3DA 4K3FA 1SQYA 5A5XB 2QSXA 2XXVA 4NF5A 2I4BA 1IZ1A 4BDQA 2ABHA 1M5BA 1AMFA 2RF1A 4MH5A 2DYXA 3IOUA 1B46A 1LB9A 4EQ9A 1MM7A 1Z7NE 1QULA 1MQGA 1BIYA 1ZMGA 2O7UA 2DQVA 4F31B 4FE8A 2DWJA 1B2HA 2UYEA 1QUIA 4OEVA 1EH3A 1S50A 4ZEDA 4RPNA 3TTNA 3HSTA 4NF6B 2H9BA 4IGRA 2YLNA 4G68B 4DXCA 5ELVA 1MG1A 1QW0A 1JNFA 4GQOA 1B7UA 2I3WA 1QJMA 4PE5B 2Y7RA 4MBPA 4ZE9A 1NNKA 5CMCA 2F34A 2H25A 3UIFA 2OJTA 2HZLA 3CSBA 1MH4A 4LZ5A 3H6VA 1MDQA 1SDXA 3N26A 4ESXA 1PC3A 3E3KA 2HFBA 1JW4A 4RK2A 4QHQA 2QMWA 5ICTA 1P99A 1N0TA 4IY6A 5M2VA 4H8IA 1TFAA 1HSLA 5DEXB 3T9XB 5TP9A 5I59B 3Q27A 1LGBC 2DWAA 5AE4A 4RYAA 1I6QA 3KN3A 4LP2B 2ZNTA 2BJJX 2O51A 2I4CA 1Y3QA 3PUWE 4YB6A 4NMYA 3RT6B 3CG3A 5L8DA 4H8JA 4F3PA 1SI1A 1B7ZA 2DWHA 1SYHA 3OELA 1B52A 3OOAA 2F7AA 3MAMA 4PFWA 5AA2A 2V93A 3KGCA 1ZLQA 3KN8A 3RNNA 5DTBA 4TQUQ 2UYFA 3IB1A 1DOTA 2ALUA 5FHMA 4KFQA 4X1BA 1LCTA 4NF4B 5B70A 2A5TB 2UVHA 1MXUA 4OTEA 2GRVA 3EF7A 2XXQA 3RTWB 4R9FA 2ONKE 1LAXA 4F3SA 4JSDA 3RN8A 3O6HA 1Y20A 1A8EA 2GHBA 1NMUA 1DTZA 2R71A 3V8XB 1Y1ZA 4L17A 1WDNA 3S9EA 1URGA 2G93A 5A5XA 1RYOA 3JV9A 1B3GA 3TFLA 3KEIA 1R9LA 4Q8RA 4PFTA 3MZ1A 3FXQA 4C1TA 2X7PA 5JK4A 5AA4A 3OD7A 2ANJA 4F39A 3ZSFA 1DSNA 3VXBA 3RY3A 1JW5A 2ZMBA 1LB8A 4KCDA 3Q28A 2VD3A 2OWTA 2F7CA 4QSEA 2V3UA 1P1WA 4QFNA 5TU0A 2PVUA 4YU0A 4NF6A 2QJEA 1UQWA 4G68A 4OWDA 3KFMA 4MLVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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