1SW4A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with trimethyl ammonium
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw4A02
3SEWA 1N76A 1H3DA 4ESWA 3L6HA 1XC1A 3E13X 3UGWA 3L6GA 5TP9B 2I0BA 1HSLA 2IEEA 1N0TA 3TYHA 3A09A 1UQWA 4K3FA 3MBPA 4DCXA 1Y4TA 1IXHA 3TUSA 5L9SA 4TQUQ 2F36A 3R6UA 3MW0A 4YB7A 2CMOA 4NF6B 5ELVA 1EZ9A 4BDLA 2F7BA 1XS5A 5CRYA 1MXYA 4PFYA 4GF8A 4H8JA 4GL8A 2DYXA 3FD3A 3MQ9A 1JEUA 4GXAA 4JSOA 5JK4A 4OEUA 1FTKA 2DS9A 3MVXA 4PQJA 4F1UA 5CMCA 1ANFA 2O69A 2O6AA 3OEMA 1H43A 3MVWA 2Y7IA 2VD3A 3PPNA 5L9MA 1MPDA 1XVXA 3KBRA 3P7IA 1MQGA 4M4GA 4R6KA 1FQAA 2OWTA 4MFIA 2QS1A 2ZXTA 4ZECA 4NMYA 1PEBA 2QJEA 2FNCA 3FATA 3UK4A 1NNFA 4E0WA 3H6UA 1OLCA 1PBPA 1FTLA 1S9TA 3FUZA 3C33A 1B7UA 1GTKA 4PFTA 2F6GA 3EHTA 1PC3A 2I4CA 3C36A 3PPPA 2I58A 3O6GA 4NF6A 2ESNA 4R9GA 4GL0A 3OMBA 1GGGA 1ZU0A 5BWJA 4YKKA 1Z7NE 3I6VA 2XXPA 3OOAA 1LBBA 2F7AA 3WAEA 3QUJA 1R1NA 3TKDA 4TOZA 4XKNA 3IOVA 1B05A 4ONYA 3A3UA 2V93A 1LB8A 2G29A 1MS7A 4NE4A 3I5OA 3MVZA 2A5SA 4XKRA 3MP1A 1IZ1A 3SERA 4OESA 4G68C 1P1QA 4HCWA 4U4SA 3C34A 4ZZEA 1Y20A 4LVQA 4WKMA 1PDAA 3PPOA 2XD3A 4EDPA 1JVYA 3EF7A 1I6AA 2ZYOA 3D4CA 3HPIA 1B3HA 4F3GA 1T0KA 3PUXE 3H4ZA 3HO7A 2XXYA 2O1LA 3DM0A 3SEUA 2I0CA 3SESA 2Q2CA 1QKAA 2Z23A 4IO3A 4JSDA 2V3TA 3S2VA 3ODBA 3FVNA 4PETA 3K02A 4OMBA 4UA8A 2NXOA 3IB0A 1USYE 4RA1A 2HQ0A 3H6VA 3LSXA 1QULA 1F9BA 3LSWA 4YU0A 4FIMA 3G3HA 4QHQA 1L5TA 4IGTA 1SYHA 1B5JA 2F5XA 1JETA 1RYXA 2OCUA 3CI8A 3ILUB 4OQOA 2DE2A 2F8DA 1DTGA 5CBRA 4E0XA 3PMXA 3SKPA 2Z8EA 1YTVA 3CSGA 5I57B 4NF4B 2AYSA 2HEUA 3C4MA 3T9UA 3B6QA 1NNKA 3RT8A 3QXMA 1B51A 4H6DA 4XKQA 4FAJA 4ISUA 4R73A 4UACA 2DXRA 4U23A 1TT1A 1R9QA 2Q9TA 3KOSA 4KCDA 4NWCA 1FTJA 2NVUB 4R72A 1B7ZA 4XTCQ 4Z7EA 3FV1A 4XKPA 4JB7A 3FVOA 3LSLA 4RY1A 3RTWB 1Y4CA 1ATGA 5KZTA 3KN8A 4DCYA 1B9JA 3MUQA 4WEPA 4C1TA 1QVSA 1PBQA 3JYRA 4RPOA 1ZLQA 3Q26A 4YAHX 4HW8A 1XOCA 5I57A 2H9BA 4NF4A 1H44A 1P1UA 1O63A 3UP9A 3DP4A 1I6BA 4QFNA 2GFEA 1FCKA 1FQFA 1LCFA 5JTYB 4G8HA 4ZEFA 4R75A 2QSXA 1B4HA 4KFQA 2ZNUA 1N3XA 3G3GA 1MPBA 3K1PA 3IX1A 2HAVA 1LB9A 4LUBA 2VOZA 3FZVA 1MQDA 4BLAA 4GWOA 3VLVA 3CRBA 1H45A 1IQ7A 3ZKLA 3KG2A 4FJPA 4JXIA 2AL5A 1SYIA 5HPQA 3PD9A 4EXKA 5EHSA 4ZS9A 2ZNTA 4QSDA 1QJMA 3B6WA 3H3GA 5M2VA 2DSFA 4YMAA 4ELOA 2F7CA 2M8CA 1LAHE 4IO6A 2XXHA 3OO9A 2Q8JA 2HAUA 2REGA 3OSRA 4EXLA 5I2KB 3MZBA 4OTEA 3PUWE 1TWYA 2DXYA 1SVXB 4HTGA 4RPNA 1DSNA 2UVJA 1Y3PA 4GQOA 4ZEBA 5CBSA 2PX1A 1B58A 4RYAA 4BDMA 2PBWA 1Y3NA 1MY3A 5K2YA 3LUYA 5EYFA 2H98A 1TFAA 3N5LA 4F3PA 4DIGA 3W9VA 3BKIB 1JW1A 4F2OA 1M5CA 5DEXA 4X1DA 3SDFA 2QRYA 1D9VA 2RCBA 3QUFA 3G7WA 4O3CA 4OETA 4F3BA 3QYTA 1AL3A 4ELPA 4LZ7A 1M5BA 2P2AA 4AQ4A 3KN7A 4X9TA 2QS4A 3PD8A 5ISUA 3FVKA 3PV0E 2DWHA 3TELA 4I8CA 5K2XA 4QSEA 2RINA 2QMXA 1MH4A 2VGQA 1LFIA 5CI5A 4ZEDA 4ND9A 4QSCA 3ECRA 4YZZA 1OVBA 5I2KA 2XX7A 5I56A 5IKBA 4WXJA 3TCFA 4FATA 1MY2A 4PFUA 4FORA 1A54A 3VVEA 3MP6A 4JWOA 1PB9A 3IOWA 3V8XB 3FV2A 4P0IA 2R71A 3PPQA 5H8FB 1II5A 2I49A 5AA2A 2DWJA 2ZMBA 4KHZE 5HM4B 1A8EA 4YB5A 4DZ1A 2I6EA 2ONSA 1BLFA 1Q1KA 1YPNA 2V25A 2XX9A 1A7LA 4PE5B 3QAXA 1NKXA 1URDA 3B7DA 4FECA 2DWIA 1B5IA 1A40A 3N6TA 1OIBA 1NNPA 3VXBA 2DWAA 3KZGA 3RNNA 4TLMB 2RF1A 5AA1A 4AB5A 1XHYA 3TTLA 3PMWA 5A5XB 4LZ8A 2AL4A 1VFEA 2D3IA 1FW0A 5I2NA 3WAFA 2Y7KA 3PUZE 5KCJB 1FQDA 3DP8A 4RNSA 4BDNA 2Z22A 3U72A 3RLFE 5F1QA 1SQYA 3Q27A 1IXCA 4X48A 4YB6A 3VDFA 4YICA 4IO7A 5TP9A 3TQWA 3TDJA 2WKYA 3FVGA 3GZGA 5H8HB 4OHNA 1OVTA 3IJXB 3ILTB 2XXIA 3EHUA 4FEBA 3EPEA 5CM6A 4KCCA 1FTOA 1P1NA 1YAEA 3HHGA 4Q8RA 3OELA 4O3BA 5FTHA 1M5FA 3DLNA 3S9LC 3VLWA 2VD2A 1POY1 3PUYE 3T9XB 3QK6A 1SI0A 4OEVA 4Z0IA 5L8DA 4DDDA 3RGYA 4G2ZA 3MPKA 3FXUA 1B3EA 3TODA 3G3KA 3ZS6A 5HBCA 3U92A 2VHAA 2HZLA 3PPRA 2LAOA 5A5XA 4IY6A 3H6TA 1MXWA 2UVIA 4C0RA 2ONRA 1Y1ZA 2PT2A 3TCGA 1JNFA 5KCJA 3B6TA 1VR5A 4H1XA 2O1MA 4QFKA 5I59B 1NNTA 3V83A 4DXCA 1QW0A 3S4UA 1PB7A 3R7XA 1ZJLA 2UYEA 1MQHA 2GHBA 3LC8A 3BFUA 4WEDA 3T93B 5LOMA 1EU8A 1HSEA 1EZOA 1B2HA 1D9YA 4H0WA 2ZNSA 3U94A 2DOJA 3MJNA 3PGFA 2X7QA 1OMPA 2H25A 1ZIUA 3RT6B 3RPWA 4ZDMA 4N13A 3IOTA 4F1VA 3G3IA 1AMFA 1XT8A 3IOUA 1WDNA 1WVJA 1US4A 4GXSB 3THIA 1MM6A 5ICTA 5EHMA 4Q0CA 1A8FA 2B3BA 3O28A 4Q30B 4GVOA 4QFLA 3TMGA 1UIUA 1O7TA 1QUIA 1B6HA 5I59A 5FHNA 4F1YA 1BIYA 3OO6A 4EQBA 2Q88A 3A3CA 3TEPA 3K6XA 2I48A 1FTMA 4RJZA 5KDTB 2NOOA 4H65A 4PFWA 2OLBA 3O6HA 3TFLA 2D21A 1JW4A 1R9LA 1OQHA 1VSOA 4DLDA 1MQJA 4FE8A 4F2QA 3UIFA 2FYIA 4H67A 4RXLA 1RKMA 5B70A 2OWSA 5AA2D 1MY0A 2YLNA 4R2BA 3U8QA 3N26A 4YKJA 3V89B 3HV1A 2RC7A 1GR2A 1UIVA 4ZZAA 3RTFB 1MDQA 3M3LA 1YCJA 1AH5A 2FA7A 2F97A 2ZYKA 3FXRA 3IB1A 1H76A 3H6WA 3TTRA 2XXXA 3O29A 2HXWA 3O66A 5DTBA 3VV5A 5I58B 4GD5A 4F3SA 1ZBMA 3K01A 4MH5A 5FTIA 3K6WA 5BUUA 4KYDA 1PB8A 3UN6A 4EUOA 1M5EA 1VE4A 4P11A 1SD3A 3BBRA 3K6UA 1D3KA 1IXGA 4OWDA 3TPAA 3LR1A 3GBBA 1P99A 4OZ9A 1B1XA 4G4PA 5DVJA 4Q5TA 3O6IA 1UTBB 4NF5B 4H8IA 5J1DA 3GBAA 4MLVA 1S7YA 4QRZA 4AB6A 1VFDA 1IIWA 2AIXA 4ZEIA 1IITA 4I9DA 3PU5A 5H8QB 2ALUA 4M1VA 2D5WA 1B7HA 1MG1A 2VP1A 1FQEA 3D4GA 4LONB 3AXFA 4DXUA 2Y7RA 1OLAA 2YPNA 4NF8B 5I58A 3E4RA 2CZLA 3KN3A 4IB2A 4BDRA 4ZE9A 1MM7A 3Q25A 1MRPA 3GLBA 1B52A 3O2AA 1LCTA 3IORA 2P0SA 5JTYA 2RKMA 3DELB 4U22A 2DE3A 5TPAB 2B65A 2O84X 3K6VA 1MXXA 1SDXA 2F6PA 4FEDA 2GHAA 2W7YA 1USYH 3CSBA 1CE2A 2XXTA 1US5A 1POTA 4YKIA 3JZJA 4F31B 1GVCA 4IO2A 1M5DA 4NF5A 3OO7A 4QFOA 4KYEA 3E9XA 1O64A 3E3KA 1MPCA 3TTMA 3USDA 3O9PA 3VXCA 4F18A 1NL5A 4RK9A 3N6UA 2HZKA 4OFLA 2GRVA 2OK2A 2QMWA 2QS2A 4ZE8A 3SEVA 3CFZA 1NH7A 3O97A 3IB2A 4R2FA 4NF8A 3H06B 2XD2A 1AOVA 4NEDA 2ZYMA 4LATA 1B0LA 1S50A 3JV9A 4OENA 3TTKA 2OZZA 3CG1A 3T9HB 3C35A 3C31A 4BDQA 1B3GA 3OO8A 4JWXA 3EN3A 4JDFA 4F19A 3RN8A 4BDOA 5DYHA 1BKAA 5CMMA 4GFRA 2R6GE 1ZKBA 2P1SA 3C9HA 3FXQA 2UVGA 5I84A 3IO4A 1Y3QA 2XXUA 4DE8A 3F11A 1ZTYA 3CFLA 3TAJA 3V5AA 3VVFA 5F7VA 4U1OA 1LBCA 1MXZA 5L9OA 4POXA 4KQPA 1LAGE 3K0VA 3S9NC 3HCQA 1J1NA 4ELQA 3C32A 1B3LA 3EQ1A 2BJJX 5DVIA 4DXBA 4OERA 2HCAA 1BTJA 1SW1A 1DOTA 4OYVA 1HSJA 5ITPA 3MP8A 1DTZA 3MZ1A 4THIA 4GIZA 3MPLA 4LZ5A 1N7XA 3M8UA 1SI1A 1UTHB 4I62A 1FQCA 1LLSA 3OD7A 3SEYA 1B4ZA 2YJPA 4U21A 5CMKA 3ONMA 4IY5A 1QKBA 3PUVE 1B46A 3H7MA 3CR9A 5H8FA 4EF1A 5FHOA 1A55A 3SETA 2NWJA 4OXVA 4JWYA 1SW5A 3HSTA 3G3FA 3W9WA 3S9MC 3VFJA 2UVHA 4OVJA 2O7UA 1MY1A 2PYYA 3TCHA 2XXWA 5AA4B 4QFPA 2OJTA 2NUVA 2IA4A 2Q89A 2H4IA 4L17A 4XXUA 1AIVA 3FGSA 1JVXA 4RK2A 3FJ7A 3RUMA 3MZ9A 3FIRA 4IGRA 3T96B 4ELRA 3HHFA 4JBZA 1DPEA 5ICQA 1DPPA 4X1BA 3IL1B 1UTHA 2ONKE 3SEXA 3VLUA 4G8NA 2THIA 2Y7PA 1GV8A 5AA3A 1R6ZA 4LA9A 1WODA 4F29A 4LP2B 4IO4A 2V3QA 1IEJA 5H8HA 3TZAA 3K1NA 3QIMA 5DVFA 2QPQA 1Y1MA 4LQ2A 4U4XA 1LFHA 3H03A 3PMVA 5ITOA 2GH9A 4NTLA 4G77A 5TU0A 2A5TB 4U1ZA 4YKPA 3M3KA 3Q28A 1N84A 3KFMA 2Z8FA 1CB6A 2V84A 2E0SA 5AA4A 4HS7A 4KD5A 3MAMA 1B1HA 2XHDA 3KGCA 1XVYA 3FJGA 4ZEKA 1SW4A 4N07A 1N7WA 1FQBA 2PVUA 2O51A 4F39A 1Z7ME 1EZPA 3U1OA 2KLFA 5JEIA 1URGA 1NMUA 4HCYA 3KOTA 3S9EA 1IUDA 3W15C 2HFBA 4R6YA 5AE4A 1P1WA 3FJMA 2XXVA 2X26A 2PT1A 4MF3A 2I4BA 3OENA 1Y9UA 2QL3A 2A5TA 3M3FA 1RYOA 3MVYA 2DE4A 1B0HA 3ZSFA 2O68A 2I3VA 3TQLA 4POWA 1N3WA 1JW5A 4H5GA 3MC2A 4GRKA 2RC9A 1URSA 1I69A 2E1SA 3IO6A 4H5FA 1LGBC 1LAXA 3IR1A 3EHSA 1A99A 2PMSA 3MWBA 4U2RA 2H5YA 2G93A 3LSFB 3QSLA 1NH8A 3IJOB 1MH3A 1ZMGA 2X7PA 1TFDA 4KI0E 4TLLB 5H8NB 1Q35A 3CG3A 5DT6A 2F34A 1DMBA 1MQIA 4G68B 2XXQA 4MLQA 4KYSA 4ESXA 4F22A 1SW2A 3IK6B 2REJA 4I1DA 5KDTA 3UORA 2DVZA 4LQ5A 3CFXA 4EQ9A 2V3UA 2OBGA 3CVGA 2XXRA 3KSXA 4O3AA 3G3JA 1MXVA 2R9JA 3KJ7A 3GXAA 3K4UA 2ANJA 4G8MA 4R6HA 1IXIA 5IAIA 2H99A 3HN0A 3T9VA 1B32A 3DP6A 1P1OA 1JEVA 1LAFE 2Q2AA 5DEXB 4R9FA 1BP5A 1SBPA 3VVDA 1TXFA 3OEKA 4EQ7A 4QF9A 1B40A 1B3FA 2DVCA 1KWHA 1QUJA 2QS3A 1I6QA 4ECFA 2I3WA 3OXNA 2XX8A 5B7DA 2RCAA 3LBSA 5H8NA 3KSJA 4N6PA 4OFJA 1MDP1 4P0GA 4MBPA 4G68A 4R74A 1ELJA 5H8SA 1D4NA 5I56B 3RQTA 4NWDA 3K00A 3CIJA 1MY4A 3TTNA 2RC8A 1NFTA 3KEIA 1QUKA 2B3FA 1LFGA 1JQFA 4PP0A 5CMBA 1UTBA 3Q29A 1OQGA 4YMBA 3VE1B 3T66A 3RY3A 3KJTA 5AA2B 1MXUA 1EH3A 3U93A 4OFOA 3K1MA 5H8QA 2DP8A 3R26A 4KPTA 3FASA 2Z8DA 3BFTA 2O7IA 1LSTA 3I3VA 2UYFA 2UXAA 2Y7WA 3UA8A 2ABHA 3T22A 1B5HA 3OSQA 4GLIA 5FHMA 1N04A 4KR5A 3IAZA 4C1UA 2ZYNA 3ZKKA 4XIGQ 2Y84A 3N94A 2F35A 4GOTA 4EF2A 3K2DA 2DQVA 2F78A 4IO5A 5TPAA 5CC2A 5I2NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SEWA 1N76A 1H3DA 4PC9A 4ESWA 3L6HA 1XC1A 3E13X 4PDDA 3UGWA 1FPKA 3L6GA 5TP9B 2I0BA 1HSLA 2IEEA 1N0TA 3TYHA 4N91A 3A09A 1UQWA 3E78A 4K3FA 3MBPA 2VPOA 4DCXA 1Y4TA 1IXHA 1FPGA 3TUSA 5L9SA 4TQUQ 2F36A 3R6UA 3MW0A 2R8TA 4PGNA 4YB7A 2CMOA 4NF6B 5ELVA 1EZ9A 4BDLA 2F7BA 1XS5A 4GX3A 5CRYA 1MXYA 4PFYA 4GF8A 4LN5A 4H8JA 4GL8A 2DYXA 3FD3A 1LBXA 3MQ9A 1JEUA 2XA5A 4GXAA 4JSOA 5JK4A 4PAKA 4DI4B 4OEUA 1FTKA 2DS9A 3MVXA 4PQJA 4F1UA 1SPIA 5CMCA 1ANFA 2O69A 2O6AA 1IMFA 3OEMA 1H43A 3MVWA 2Y7IA 2VD3A 4AS4A 3PPNA 5L9MA 1MPDA 1XVXA 5IGAA 5IZ3B 1NV6A 3KBRA 3LV0A 3P7IA 1MQGA 4M4GA 4MNPA 4R6KA 1FQAA 2OWTA 4MFIA 2PCRA 2QS1A 2ZXTA 4ZECA 4NMYA 1Q9DA 1PEBA 1NI9A 2FHYA 2QJEA 2FNCA 3FATA 3UK4A 1NNFA 4E0WA 3H6UA 1OLCA 1PBPA 4JVIA 1FTLA 1S9TA 3FUZA 3C33A 1B7UA 1GTKA 4PFTA 2F6GA 3EHTA 1PC3A 2I4CA 3C36A 3PPPA 2I58A 3O6GA 4NF6A 2XWVA 2ESNA 4NGUA 4R9GA 1YXIA 4GL0A 3OMBA 1LBZA 1G0IA 1GGGA 1ZU0A 5BWJA 4YKKA 1Z7NE 4N8GA 4GBVA 3I6VA 2XXPA 3OOAA 1LBBA 2F7AA 4P47A 3WAEA 3QUJA 4PBQA 1R1NA 3TKDA 4P56A 4TOZA 4XKNA 5ESYA 3IOVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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