1SW5A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in the ligand free form
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 97
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw5A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw5A02
2QS3A 3IX1A 1QKAA 3PPOA 3SEWA 1FCKA 3IR1A 5TP9B 1MM7A 3C34A 5I58B 4XXUA 2CZLA 2ZYMA 4GD5A 1EZPA 3IAZA 1FQAA 1O7TA 1A8FA 4ESXA 4OWDA 4NF4B 1GGGA 2NUVA 3RY3A 4U1ZA 3MZ9A 2LAOA 3C32A 3D4GA 1TFDA 5I2KB 5I2NB 4H65A 3TTKA 3FJGA 4H67A 1B3GA 3FIRA 2DE3A 3CSGA 3MJNA 3OO7A 2DSFA 1M5EA 4KYDA 3MW0A 2NWJA 1B3FA 1OQGA 1PBQA 2A5SA 5CBSA 4Q30B 3MZBA 5KCJA 3HO7A 4MF3A 4N13A 2A5TB 2DE4A 4H8IA 2QS4A 2O68A 3DP8A 4R2BA 1EU8A 3CRBA 2XXRA 3H6VA 4O3BA 3U1OA 4G4PA 1H45A 2QJEA 4PQJA 4M4GA 3MVYA 1BKAA 3H06B 2V93A 2E0SA 3WAEA 5I84A 3U72A 4C0RA 1VSOA 3HCQA 4XTCQ 5B70A 5DT6A 3ZKLA 1Y4CA 2H5YA 3FXRA 2DWIA 4H1XA 3BFTA 4F2QA 5TP9A 2RCAA 4YMBA 3U94A 4ELOA 5M2VA 5I58A 3GLBA 1NKXA 3HPIA 1B5IA 3G3KA 3DM0A 2XD3A 4P0GA 4JWXA 1CB6A 4RYAA 3LC8A 1ZU0A 4NF4A 1B6HA 1DPEA 3KGCA 4I62A 3FVGA 3H7MA 2QMWA 3K6UA 5AE4A 2UXAA 1N76A 1NNTA 3CFXA 1LBBA 1S9TA 1URGA 3C31A 2Q9TA 5I2KA 4KPTA 5I2NA 3KN8A 3ZSFA 4LZ8A 5ELVA 4UA8A 2Z8EA 4XKRA 5I59B 2I4CA 3G3GA 4Q0CA 1O64A 1B0HA 5TPAB 4R6KA 4R6HA 3ILTB 4ZZAA 1SYHA 1D3KA 3VE1B 1SW2A 2A5TA 2I6EA 2VP1A 1IIWA 3SERA 2RC8A 3PUWE 1JW5A 3PUYE 3N5LA 1ZJLA 1J1NA 1P99A 3M3LA 4P11A 3K00A 1I69A 1NH8A 4NE4A 1MH4A 2VD2A 4GXSB 1UTBB 3IOUA 5A5XB 1SW1A 2THIA 1PB7A 2Z23A 4R9GA 3W15C 2R6GE 2M8CA 4KD5A 4LONB 3KSJA 1B3HA 5LOMA 1B32A 4G68B 3U93A 3BFUA 4EF1A 4QRZA 2OK2A 2UVIA 4EF2A 4NWCA 3Q28A 4IO6A 5DVFA 1MQGA 2YLNA 1MXXA 1LAHE 5F7VA 2ONRA 3N26A 3S2VA 3QAXA 5H8SA 4YMAA 5H8QB 3VDFA 2D5WA 1YAEA 4N6PA 2FYIA 5KDTB 3IK6B 3CFLA 4ELRA 4JDFA 1WDNA 1VR5A 4HCYA 4AQ4A 5CC2A 4KR5A 1R1NA 4LZ7A 1FQFA 1XOCA 5I59A 1MM6A 4IO3A 4ZEKA 3TEPA 3UORA 4QSDA 4H5FA 1WODA 2IEEA 5TPAA 1TXFA 2DWHA 2DYXA 3FZVA 3PU5A 2OCUA 3QUJA 4RK2A 3TQWA 4GFRA 3KN3A 4ZEIA 1IITA 3JV9A 2YPNA 5ICTA 2CMOA 1P1QA 3PMXA 4LP2B 1EZOA 3MBPA 1WVJA 2I0BA 4EQBA 3K02A 1SI1A 2XXHA 3M8UA 1LBCA 2XX9A 3KEIA 3MP8A 4F1YA 3A09A 4ZEFA 1D4NA 3QIMA 1UTBA 4O3CA 5A5XA 5I57B 2F36A 2ONSA 3DP6A 4FECA 4THIA 3GBBA 3B6QA 2QRYA 4X48A 4OMBA 4JSOA 1LGBC 1ATGA 4G68A 4OESA 1SDXA 3PGFA 4MLQA 1Y20A 3RUMA 5L9SA 1MQIA 1QUJA 1Z7NE 4ISUA 1XT8A 2RINA 3G3HA 4RA1A 1OIBA 3K6WA 5DEXB 5B7DA 3A3CA 1JQFA 2F97A 2HZLA 1Y9UA 1FQEA 3CG1A 5AA2B 4YU0A 4FEDA 1OQHA 3MC2A 1USYE 5H8QA 1QJMA 1FTLA 3PD9A 2NOOA 3QYTA 5FTHA 4I1DA 2F7AA 5KDTA 3C4MA 2OZZA 2Y7KA 3WAFA 4F3PA 3DLNA 3RNNA 1PDAA 1PEBA 4Z0IA 4JXIA 2HFBA 1JVXA 4OFOA 2B3FA 4G2ZA 2HQ0A 3ILUB 2I3WA 5DTBA 3VLVA 3TQLA 3R26A 1VE4A 4NF6B 3T22A 1PBPA 2PBWA 4ZZEA 3TZAA 4LVQA 3RT6B 3TODA 2DWJA 4H5GA 2DOJA 4ZS9A 4IGTA 4YB5A 2Z22A 1PC3A 3TAJA 4HTGA 2AYSA 1N7XA 3EHSA 4FJPA 5CMCA 4OERA 1AH5A 1IXGA 3B6TA 2Q2AA 1QUIA 1MY3A 5I57A 3W9WA 1B2HA 3T96B 4YKPA 3FV2A 4DXCA 1SW4A 3G7WA 2NVUB 3RQTA 2F35A 3V5AA 3Q26A 3KFMA 4EQ7A 4LATA 2IA4A 4PFYA 1NNKA 4KI0E 4KCCA 4MBPA 5FHMA 4FATA 5DEXA 1DSNA 1N3XA 1B51A 1EH3A 4K3FA 3T9VA 2NXOA 4GQOA 5AA2A 2RC7A 1I6QA 3K1NA 3PPQA 3S9EA 4POXA 3T66A 1MDP1 5IKBA 3C9HA 1IXHA 3ODBA 2DVCA 4WKMA 1RYXA 4RNSA 3ONMA 3OO8A 3MP6A 4OTEA 4OEUA 1MH3A 3IB0A 1B52A 4QFPA 4G68C 4ELPA 2ZNSA 3UA8A 1FTKA 4OXVA 5CM6A 3SEYA 1N7WA 4IY6A 5CMMA 1JW1A 2X7PA 1HSJA 4ZE8A 4TQUQ 5FTIA 4NF6A 2QMXA 4LQ5A 1A99A 1LB8A 3TCFA 1LCTA 5CBRA 1B05A 2OJTA 2Z8FA 3M3FA 3FATA 1IEJA 3TELA 1MXUA 3R7XA 1DPPA 3VXCA 3GXAA 3H4ZA 2QSXA 5EHMA 2O1LA 4FE8A 2ZNTA 3VVEA 3N94A 4GF8A 3KJ7A 4PFUA 1IQ7A 1DMBA 4Z7EA 1S50A 1Y3NA 2UYFA 2Y7IA 4H6DA 1H76A 1CE2A 3S4UA 4MFIA 1UTHB 1FQDA 3TYHA 4HCWA 4ECFA 3RTFB 3VLWA 3FJ7A 1H3DA 4FAJA 4YKKA 1TFAA 1A54A 3KSXA 4IO2A 2PMSA 1A7LA 4PE5B 4DIGA 3LBSA 4WEPA 2AIXA 5EYFA 2HAVA 2XXQA 5AA3A 2XX8A 3V89B 2PVUA 5BWJA 3A3UA 3T9UA 2ALUA 1LAXA 3I5OA 2HXWA 2ABHA 4KHZE 4EXKA 2QS1A 1IUDA 4R75A 3IOTA 3O66A 4GOTA 3KZGA 2I0CA 1B1XA 2UVGA 1ZKBA 1HSLA 1OVTA 3M3KA 1P1NA 1N0TA 3OSQA 4Q5TA 1B0LA 2V3UA 3U8QA 4MH5A 5L9MA 5K2YA 4P0IA 3VV5A 4KQPA 2YJPA 3T9HB 1DTGA 4NF5B 3USDA 1SVXB 4F2OA 2X7QA 4M1VA 2P1SA 4F3GA 1O63A 4TLMB 1T0KA 1A55A 2HEUA 2DWAA 3CG3A 1JEUA 3FVOA 3RT8A 1B7UA 2H98A 1LAGE 3S9LC 4IB2A 1MXZA 2Q2CA 2Y7PA 2G29A 4POWA 3OOAA 4U21A 2F7CA 4BDRA 4EUOA 5ICQA 2ZMBA 3TTNA 2ZYOA 2HCAA 1UTHA 4IO7A 3SEXA 4F1VA 4ELQA 1MRPA 4QFLA 1Z7ME 3PMWA 4ZEDA 1PB9A 2ANJA 4DE8A 3EF7A 1M5DA 3CFZA 4U22A 3CVGA 4F22A 2F78A 4OYVA 4R9FA 1GVCA 3O2AA 3O6GA 5H8FB 3VFJA 3V83A 1FTMA 4OETA 3FVNA 4TOZA 2XHDA 3H03A 4N07A 3I6VA 2F8DA 3LUYA 3IL1B 1JNFA 3PD8A 2ZXTA 1ZIUA 2H25A 3IB1A 2O51A 2FA7A 2V25A 2V3TA 3JYRA 4PP0A 5JEIA 2XXUA 1IXIA 3OEMA 4NF5A 1Y3QA 2XXIA 4XKPA 4ND9A 3S9NC 1PB8A 5BUUA 2X26A 4QF9A 4U2RA 5H8NB 3MZ1A 2B65A 2O7IA 4OZ9A 3PPRA 1POTA 4IO5A 3AXFA 2XXPA 3LSLA 1GV8A 1B4ZA 1B58A 4F3BA 4OVJA 5ITOA 3LSXA 4GRKA 3EHTA 5I56B 1A8EA 2HAUA 3OENA 3RN8A 2ONKE 4QFNA 4WXJA 4JWYA 5DYHA 1VFDA 1MQDA 4FIMA 1A40A 4F18A 4X9TA 1XC1A 4YICA 4YZZA 5CMKA 4XKNA 2P2AA 3K0VA 1MXWA 3S9MC 2PX1A 3OELA 3PPPA 5H8FA 3DP4A 4QSCA 1B9JA 1M5FA 2I49A 1AL3A 4G77A 1DTZA 3L6GA 1QVSA 1URDA 2DE2A 1SW5A 2REJA 1D9VA 2R9JA 4OFJA 4AB6A 2F34A 4KFQA 1JW4A 2DVZA 1YCJA 4RJZA 4WEDA 2GRVA 3OMBA 4R72A 1XVYA 1Q35A 1MY4A 1BTJA 4H8JA 4BDQA 3E4RA 1Y3PA 4EXLA 1OMPA 1N84A 3HHFA 1B4HA 2F5XA 4F19A 1B3LA 1B40A 3MQ9A 3B7DA 3G3FA 4BDOA 2V3QA 1FQCA 1BP5A 3C36A 3MP1A 5H8NA 3GZGA 3ZS6A 2RC9A 1NMUA 4TLLB 2ZYKA 1MY0A 3FASA 4ONYA 2Y84A 4YKIA 2ZYNA 4IO4A 2XXTA 5IAIA 1H44A 4BDLA 2DXRA 5I56A 3IORA 4U4SA 1M5BA 4MLVA 3KN7A 3BBRA 5DVIA 3MUQA 3K6XA 3OO6A 4DDDA 1R6ZA 3EQ1A 1I6BA 3KOTA 4R2FA 4YAHX 3OXNA 1UIUA 2D21A 3TTRA 4AB5A 5HM4B 3SEUA 3W9VA 1DOTA 1US4A 1LFHA 2DXYA 3K1MA 1ZLQA 3T93B 3VVFA 1MS7A 3IJXB 2UVJA 3H6UA 3UIFA 1FW0A 1GTKA 1MXVA 1QUKA 4LQ2A 3CR9A 3IJOB 3TKDA 1SD3A 1Y4TA 1LCFA 4LUBA 3I3VA 1ZMGA 1POY1 3Q27A 4BDNA 1VFEA 3TUSA 3PPNA 1MPCA 4C1UA 4F29A 3RGYA 3VXBA 4RK9A 3B6WA 1N3WA 2PYYA 4L17A 3E13X 2FNCA 3FXQA 1P1OA 5AA1A 4DXUA 4PFTA 1MXYA 1L5TA 4I8CA 1B7HA 3Q29A 3MAMA 5JTYB 3JZJA 3IOVA 5FHOA 1B5HA 4OFLA 1TT1A 1XS5A 3HHGA 4ESWA 4YB7A 1B1HA 4UACA 3FUZA 4O3AA 3PUXE 2B3BA 4R6YA 3H3GA 2REGA 3IB2A 3PUVE 4DCYA 4BLAA 1LB9A 3OEKA 3SETA 1IZ1A 2AL4A 4GWOA 2V84A 5L8DA 5L9OA 2RCBA 4NF8B 1B5JA 3FVKA 1MY1A 3ECRA 1RKMA 3UN6A 3LSWA 4PFWA 4FORA 5CRYA 3CI8A 2Z8DA 3C35A 1AOVA 3TCHA 3QUFA 3LR1A 4GIZA 1IXCA 2BJJX 1USYH 2UYEA 2I4BA 1LLSA 1RYOA 2AL5A 1NL5A 1GR2A 3UK4A 3KOSA 4H0WA 5AA4B 3CIJA 4XIGQ 3TDJA 1XVXA 3SKPA 2F6PA 4RXLA 4NEDA 4NMYA 3FXUA 4KYEA 3MVXA 1MY2A 3KJTA 1S7YA 2H9BA 3KG2A 3MPLA 1MQJA 3E3KA 4U23A 1JVYA 4F3SA 2UVHA 5JTYA 4LA9A 1XHYA 1SQYA 4R74A 2QPQA 1MDQA 1F9BA 2VOZA 4EQ9A 2Y7WA 1SI0A 1P1WA 4ZEBA 4ZDMA 2F6GA 3QSLA 2O6AA 1JEVA 3P7IA 3FD3A 3C33A 4DXBA 1ANFA 2VD3A 4NF8A 2GFEA 4OENA 3K1PA 5H8HB 5F1QA 2ZNUA 4NWDA 3MVZA 4ZECA 5EHSA 2KLFA 1R9QA 2DS9A 4OEVA 1TWYA 1B3EA 2VHAA 3N6UA 1JETA 1LFGA 2GHBA 4RPOA 4QHQA 4DZ1A 2HZKA 1Q1KA 3RLFE 3CSBA 1I6AA 2XXXA 1KWHA 4OHNA 5J1DA 4GVOA 1MPDA 5JK4A 5AA4A 4G8NA 3THIA 1NNFA 2XXVA 1N04A 3DELB 5K2XA 2XX7A 3E9XA 3FGSA 1AMFA 2VGQA 4GL0A 5ITPA 3TPAA 3O29A 4QFKA 2ESNA 2OBGA 1MQHA 3FV1A 4BDMA 3BKIB 4IY5A 2O69A 1US5A 2OWTA 3IO6A 4GLIA 4RPNA 3HV1A 2R71A 1EZ9A 3U92A 3TCGA 5KZTA 4QSEA 4Q8RA 4E0WA 2F7BA 3VLUA 4NTLA 1BLFA 4U4XA 1ZTYA 1Y1ZA 4EDPA 2OWSA 4KYSA 4F1UA 3EPEA 5FHNA 3O28A 2D3IA 1YTVA 3H6WA 4IGRA 1BIYA 2DP8A 1Y1MA 1AIVA 2GHAA 1M5CA 4X1DA 4E0XA 5CMBA 5H8HA 4JSDA 2RF1A 1B46A 4F31B 1ELJA 2O1MA 3FJMA 4DCXA 3RPWA 3K4UA 4GL8A 1LFIA 4XKQA 3SDFA 3V8XB 1II5A 3O97A 2E1SA 3MWBA 3D4CA 1H43A 1SYIA 3F11A 3G3IA 3K01A 3HSTA 2O7UA 3RTWB 1ZBMA 4F39A 2H99A 3LSFB 1NFTA 2H4IA 3K6VA 5HBCA 3TTMA 3R6UA 4I9DA 1NNPA 2RKMA 3VVDA 1FTOA 2GH9A 3QK6A 3OSRA 4GXAA 3EN3A 2W7YA 3G3JA 3IO4A 4HS7A 1LAFE 3SESA 4JWOA 1FTJA 4YB6A 4X1BA 1UIVA 2QL3A 2DQVA 5AA2D 4KCDA 3ZKKA 3Q25A 5DVJA 4RY1A 1SBPA 4FEBA 2PT1A 4U1OA 2P0SA 1R9LA 3TFLA 2I48A 3T9XB 1OLAA 1QULA 3PV0E 2Q89A 2QS2A 3TTLA 1QKBA 4JB7A 3PMVA 3SEVA 1NH7A 1QW0A 5TU0A 3UGWA 3MPKA 4R73A 1D9YA 1UQWA 4DLDA 3IOWA 4C1TA 2I58A 4G8HA 5ISUA 2XXWA 1P1UA 1FQBA 2OLBA 2O84X 5HPQA 4LZ5A 1OVBA 1YPNA 3O6IA 3UP9A 2Y7RA 1OLCA 2WKYA 4JBZA 3KBRA 5KCJB 3PUZE 3MVWA 3TMGA 3H6TA 3OD7A 1B7ZA 3GBAA 3O6HA 1HSEA 3QXMA 2Q8JA 4PETA 3HN0A 1URSA 3K2DA 1LSTA 2G93A 2PT2A 4HW8A 2I3VA 1MG1A 4OQOA 4YKJA 3L6HA 2XD2A 2XXYA 3OO9A 5CI5A 3N6TA 2Q88A 4ZE9A 3O9PA 4QFOA 1MPBA 4G8MA 3EHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QS3A 5ET5A 3PTYA 3IX1A 1QKAA 3PPOA 3SEWA 1FCKA 3IR1A 5TP9B 1MM7A 3C34A 2OWZA 5I58B 4XXUA 2CZLA 2ZYMA 4GD5A 1EZPA 3IAZA 1FQAA 1O7TA 1FPFA 1A8FA 4ESXA 4OWDA 4NF4B 1GGGA 2NUVA 3RY3A 4U1ZA 3MZ9A 2LAOA 3C32A 1KA0A 3D4GA 1TFDA 5I2KB 5I2NB 4H65A 3TTKA 3FJGA 2FIEA 4H67A 1NV5A 1B3GA 3FIRA 2DE3A 3CSGA 3MJNA 3OO7A 2DSFA 1M5EA 1FJ9A 4KYDA 3MW0A 2NWJA 1B3FA 1OQGA 1PBQA 2A5SA 5ET6A 1RDXA 5CBSA 4Q30B 3MZBA 5KCJA 3HO7A 4XFEA 4MF3A 4N13A 2A5TB 2DE4A 4H8IA 2QS4A 2O68A 3DP8A 4R2BA 1EU8A 5I3SA 3CRBA 2XXRA 3H6VA 4O3BA 3U1OA 2R8TA 4G4PA 1H45A 2QJEA 4PQJA 4M4GA 3MVYA 1DBZA 1BKAA 3H06B 5IZ3A 2V93A 3EKIA 2E0SA 3WAEA 4JVCA 5I84A 3U72A 4C0RA 1VSOA 3HCQA 4XTCQ 5B70A 5DT6A 3ZKLA 1Y4CA 5IM2A 4GBVA 2H5YA 3FXRA 2DWIA 4H1XA 3BFTA 4F2QA 5TP9A 2RCAA 4YMBA 3U94A 4ELOA 5M2VA 2Q8MA 5I58A 3GLBA 1NKXA 3HPIA 1B5IA 3G3KA 3DM0A 2XD3A 4P0GA 4JWXA 1CB6A 3MSTA 4RYAA 3LC8A 1ZU0A 4NF4A 1B6HA 1DPEA 3KGCA 4I62A 3FVGA 3H7MA 2QMWA 3K6UA 5AE4A 3T1BA 2UXAA 1N76A 1NNTA 3CFXA 1LBBA 1S9TA 1URGA 3C31A 2Q9TA 5I2KA 4KPTA 5I2NA 2PCRA 3KN8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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