1SYHA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 1.85 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA02
3B6WA 4X48A 3T9XB 4R72A 4NEDA 4DXUA 1AL3A 5IKBA 4NF4A 1PB9A 4F2QA 2XXXA 4F19A 4X9TA 5FHNA 1N84A 1PDAA 4FATA 3FVGA 3K00A 3TMGA 1R9LA 1F9BA 1POY1 3MP6A 2Y7RA 1XOCA 1MM7A 3JZJA 5I56A 4YB5A 4ONYA 1USYE 2RKMA 2BJJX 4NTLA 3HO7A 1PBQA 3MW0A 4AB5A 3CSBA 4ZEIA 3VVEA 4POWA 4G68C 4PQJA 1H45A 1R1NA 4OXVA 4OVJA 3GBAA 4O3CA 1OIBA 3FXRA 3AXFA 1MXYA 4OTEA 1EU8A 3UN6A 3K2DA 1DTGA 4C1UA 3TZAA 5I57B 1LAGE 3TAJA 1N3WA 3TTRA 3IK6B 1LFGA 4LA9A 1NH8A 3P7IA 2DE2A 2P1SA 4LZ5A 1TWYA 3RQTA 5DTBA 1PC3A 3N26A 4OEUA 5ICQA 4U21A 3T93B 1A8EA 3VXBA 1I69A 4QFLA 1KWHA 3MVXA 4AQ4A 3C9HA 3KN7A 2DE3A 4YAHX 3N6TA 1FQBA 4LZ8A 3RGYA 4MLVA 1SYIA 1DPPA 3E13X 1VE4A 4I62A 1OLAA 5I58A 3MQ9A 1JVYA 1B7UA 1UTBB 2F6GA 4WXJA 1MH4A 3FZVA 4P0GA 1M5DA 5JTYA 4OERA 5ITOA 2O6AA 3VLUA 1GR2A 1I6BA 4FEDA 1FQCA 4MBPA 4KR5A 4XXUA 3TPAA 3IB0A 3TODA 3ZS6A 3RPWA 2ZNTA 4RNSA 1LAXA 2HFBA 3U72A 3K6XA 1A99A 1J1NA 2X7PA 2VGQA 4LATA 3O9PA 1O63A 3VVDA 2D3IA 5DVFA 2Z22A 5A5XB 1ZU0A 1URSA 3G3FA 2XX9A 3V8XB 2VP1A 3CI8A 1BP5A 2XXIA 1NFTA 1B32A 1YCJA 4P11A 4EQBA 4NF6A 2H9BA 3KSXA 3PPQA 3RY3A 2RC7A 1Q1KA 2ALUA 3I6VA 1JW1A 4OYVA 1H76A 1HSJA 4KI0E 3K1NA 3G3HA 3S2VA 4IGRA 2XD2A 2I48A 5CBSA 3FV1A 2ONRA 5KZTA 5ITPA 2XXYA 2UVGA 2V93A 4GL0A 3K6UA 2R71A 1M5BA 1Y3QA 2Y84A 4BDNA 4ELOA 2QSXA 4JWOA 5HPQA 4GF8A 5H8FA 2OCUA 3IOTA 4EDPA 1B2HA 1B46A 1MPBA 1SD3A 4YKJA 1MY3A 1UIVA 4KYSA 2AL5A 1LFHA 1JNFA 1T0KA 5I2KA 1B3LA 4GFRA 1IQ7A 1AIVA 2F6PA 2H99A 4ELPA 1NL5A 4Q30B 1ATGA 1LCFA 1B0LA 3H4ZA 2GHBA 1A7LA 4BLAA 1B5HA 5CRYA 2XXVA 4IY6A 2V25A 1LB9A 3S9MC 2O1LA 1H44A 4GXSB 1VSOA 4JBZA 2IA4A 2O51A 2XHDA 2F8DA 2KLFA 2QS3A 1B3GA 1IXGA 1DPEA 3LSLA 1NMUA 2YJPA 1NNTA 3SEVA 2PT1A 4OHNA 4FJPA 3O66A 1D9YA 1MM6A 2RINA 3H6UA 2XXTA 2RC8A 3OEKA 3HV1A 4RJZA 5AA4A 1OVBA 3RTFB 3G3KA 2B65A 2DWIA 4ZZEA 2I0CA 1PB7A 5KCJA 3FD3A 1A55A 1MQHA 2NWJA 4R6KA 1LAFE 1NNKA 3B6QA 4F18A 3FJMA 4O3AA 1BKAA 2PYYA 3UIFA 3L6GA 1B7HA 3TCFA 1JEVA 3DELB 1GV8A 1MH3A 4OMBA 4H5FA 1MY1A 3LSXA 3OD7A 1JW5A 4NF5B 2Q89A 3C32A 5JK4A 3OEMA 3JYRA 1B4HA 4ZZAA 4NWDA 3OO9A 2V3UA 3FGSA 4DLDA 3IJOB 1HSLA 1TT1A 1SVXB 4EF1A 1UTHA 4XKNA 4H5GA 4JDFA 4DZ1A 5EHSA 4OENA 3S4UA 5H8NB 2HZKA 4G8MA 1TXFA 4GWOA 4WEDA 3VV5A 3K01A 4RK9A 3MP1A 4QFPA 4PE5B 4JXIA 3H6WA 3O97A 4U4XA 3T22A 4F39A 4RA1A 5CMCA 2Y7KA 3EQ1A 5B7DA 4GVOA 3C36A 4QSDA 4OETA 1ZTYA 4MF3A 3S9NC 4YICA 1URDA 3A3CA 5DVJA 3RUMA 3WAEA 4NMYA 1N76A 3PGFA 4DXCA 4GD5A 1B7ZA 5TP9A 4LVQA 4F3PA 1MY0A 1B58A 5TU0A 1DMBA 4LP2B 3K6WA 4H1XA 1JEUA 2B3FA 2HAUA 2Q8JA 1EH3A 3IJXB 4F3GA 5AA1A 5DYHA 4BDQA 4QF9A 4YKPA 4GOTA 1A8FA 4DIGA 2W7YA 3KJTA 3O6IA 3Q25A 4OQOA 1Z7NE 1Y4TA 4E0XA 4U2RA 4H65A 1S50A 2QRYA 5L8DA 4KCCA 4TLLB 3TQWA 3DP8A 4NF8A 3C33A 1MXZA 2NXOA 1H3DA 1MXWA 1XS5A 3B6TA 1MQDA 4BDLA 3G3GA 2XXUA 4FORA 4ESXA 1I6AA 3FUZA 3PUXE 3Q27A 3PPOA 3MZBA 1LAHE 2THIA 4OZ9A 2LAOA 2XX7A 1A54A 4LONB 4DCXA 2YPNA 5EHMA 4G77A 3CIJA 3JV9A 1SBPA 3DP6A 3N94A 3PMVA 3EHUA 1WDNA 3FVOA 3PUYE 3DP4A 1NH7A 1BTJA 4TQUQ 4XIGQ 4XKRA 4IGTA 3SDFA 1AMFA 2XXRA 1H43A 3VFJA 3IOVA 1S9TA 3MP8A 2D5WA 1SYHA 4F22A 1TFDA 2ONKE 3PD8A 3PMXA 1TFAA 2ESNA 4ELQA 1LBBA 2I3WA 4GIZA 5BUUA 4G2ZA 5AA2D 5I59B 4G68A 2DP8A 1AH5A 3RTWB 4YB6A 3M8UA 3CVGA 4IO5A 3OOAA 4YZZA 3V83A 2Z23A 4HCWA 5I58B 1I6QA 4QFOA 2I3VA 1PBPA 1US5A 2R9JA 1ZMGA 4JB7A 2ZYMA 1D3KA 3D4GA 3LSFB 1NKXA 1UIUA 5JTYB 2RCAA 1QKBA 5CMMA 5I57A 1B0HA 4UACA 1P1OA 5FTIA 4PP0A 3PV0E 4R6HA 4LUBA 4EQ9A 3PD9A 3TTKA 1JVXA 1N7XA 4ZE8A 4U4SA 3M3LA 2OLBA 1CB6A 1US4A 3USDA 4Z7EA 3TTNA 3DM0A 2DS9A 2Q88A 3T66A 4Q0CA 1FQAA 3BKIB 3TDJA 2V84A 4OFOA 4DCYA 3FXUA 2XXQA 2FYIA 3PPRA 1MDQA 4PFTA 3PUWE 2WKYA 2H98A 3OSRA 1GTKA 3FIRA 4RXLA 4NF6B 5H8HA 4Z0IA 3R26A 4FIMA 3QSLA 2UYFA 1QULA 4RYAA 3OO7A 1UTBA 1QUIA 3PUZE 3H03A 2F7BA 3CRBA 5AA2B 1LLSA 4KPTA 3ZKLA 3PPPA 3SERA 4U1OA 2PX1A 3I3VA 1N7WA 4I8CA 4RK2A 5LOMA 1NNFA 3VLWA 3VDFA 4YKIA 2AL4A 3WAFA 1LSTA 4F3BA 2QS2A 4G4PA 4OFJA 1P99A 3OENA 5I2KB 2UVIA 4C1TA 3FV2A 4I9DA 4N13A 3H6VA 5AE4A 3KSJA 4I1DA 3T9HB 5IAIA 1B1HA 4OEVA 4G8NA 4ZE9A 2F36A 4WEPA 2A5TB 1B05A 3THIA 3UK4A 3O6HA 3ZSFA 3TTLA 1RYOA 1B3FA 1B6HA 1CE2A 3C35A 4F1VA 1P1QA 2V3TA 1Q35A 2PBWA 4YU0A 5AA3A 5DT6A 1PEBA 2XX8A 2OK2A 2DWAA 3K1MA 3HN0A 2F5XA 4L17A 4Q5TA 2Y7WA 4OWDA 3SEUA 1EZPA 5CMKA 1SW2A 4JWYA 3QUFA 3ILTB 1D4NA 1MY2A 4ZECA 5ELVA 4ZEBA 3KZGA 4YKKA 3SEWA 3CSGA 1XT8A 1QJMA 3MWBA 3HHFA 3C4MA 4FECA 3R7XA 3GLBA 3HHGA 1VFDA 2ANJA 5K2XA 2NUVA 2HZLA 1YTVA 4KHZE 3O6GA 3T9UA 3SETA 5JEIA 2OBGA 3B7DA 3U8QA 1QKAA 4P0IA 5FHMA 3CG3A 2B3BA 2O7UA 4ZEDA 1FQFA 1OLCA 2NVUB 2QS1A 5CBRA 1YPNA 3SEXA 4H0WA 3Q28A 3E3KA 1B1XA 3FVKA 3OMBA 4RPOA 5DEXB 2DE4A 4E0WA 3SKPA 1QUKA 4JSDA 3TKDA 4ELRA 4QFKA 4ZDMA 3MC2A 5TPAA 3L6HA 4ZEKA 3PMWA 3K4UA 4U1ZA 3T9VA 4X1BA 3K1PA 4F1YA 3SEYA 3IB1A 1N04A 1BIYA 2VD2A 2XXWA 1B5JA 1Y3NA 1GVCA 3C34A 1LB8A 4PETA 3CG1A 3K02A 5TP9B 2I0BA 3UORA 1A40A 2H25A 2ZYNA 4POXA 1MDP1 1HSEA 1SW4A 3RLFE 3PPNA 2O68A 3BFUA 2QMWA 3CFXA 4M4GA 2DWHA 3G3JA 4R75A 3FJGA 2GFEA 4ISUA 2E1SA 4OESA 5H8NA 3LC8A 3K6VA 2I58A 3EN3A 1LFIA 4EQ7A 1BLFA 1MRPA 1MY4A 2REJA 3MZ1A 5BWJA 1B40A 1XHYA 4GXAA 1YAEA 3FVNA 2DSFA 1DOTA 3A09A 3TTMA 4F3SA 3IR1A 3MVWA 1B4ZA 2HQ0A 1P1NA 5I2NA 4NF4B 1AOVA 2F35A 4EUOA 2Z8FA 3CFZA 5CC2A 3QYTA 1M5CA 2F78A 2GRVA 4H8IA 4KQPA 3MVZA 3HCQA 2HXWA 3GBBA 4JSOA 1JW4A 3TCHA 3H3GA 4LQ2A 4R6YA 4KYDA 5I56B 1O7TA 3MVYA 1FTLA 2HAVA 3O29A 3MZ9A 4KD5A 1B9JA 4EF2A 2AIXA 5I84A 4QSEA 1ANFA 1IITA 1IXCA 2F7CA 3ODBA 4IB2A 5H8QA 2REGA 2E0SA 4XKPA 3BBRA 1M5EA 4HCYA 4WKMA 1LCTA 4ZS9A 5L9MA 1OQHA 3UA8A 4BDMA 2DXRA 1DTZA 3GXAA 2I4CA 1QW0A 4G68B 1N0TA 3VVFA 4K3FA 1IEJA 4QRZA 1NNPA 2QS4A 2DYXA 5KDTA 1Y3PA 2Q2AA 2Y7IA 5CI5A 1MXUA 3OXNA 5F7VA 5ISUA 1N3XA 1MPDA 3KOSA 5FHOA 2VOZA 1B5IA 1GGGA 3MBPA 3CR9A 2D21A 2I6EA 3U1OA 2O84X 2UXAA 3QIMA 3IAZA 1IUDA 1POTA 1MXXA 1M5FA 1MS7A 1QUJA 1ZBMA 5HBCA 4G8HA 2PVUA 1LGBC 3KEIA 4ZEFA 1P1UA 4TLMB 3W9WA 1FTKA 3CFLA 3OO8A 4QFNA 1FQDA 3W9VA 3N5LA 2DVCA 1VFEA 3A3UA 1O64A 2PMSA 3S9EA 2A5SA 2FA7A 3OO6A 4R2FA 2QMXA 4THIA 3BFTA 2G93A 4F2OA 4R74A 1JETA 4F1UA 2Z8EA 5I59A 2DOJA 4KFQA 1L5TA 3I5OA 2M8CA 3PUVE 2DXYA 4O3BA 5H8HB 3TELA 4PFUA 1IIWA 4PFWA 2OWTA 4QSCA 1XVXA 4FAJA 2P0SA 2Z8DA 4R9FA 3FXQA 3HPIA 1D9VA 1MQGA 2O1MA 3SESA 1SW5A 1OMPA 1B52A 1ZLQA 1IXIA 1SI1A 4H6DA 1MQIA 1B3HA 1UQWA 1Z7ME 4MFIA 3K0VA 2QPQA 1OVTA 5CMBA 3OSQA 2RF1A 5K2YA 2F34A 2DQVA 3FJ7A 2X26A 3PU5A 3KN8A 1PB8A 2XXPA 2ONSA 3RN8A 1WVJA 2VHAA 1SI0A 1QVSA 3IOUA 3ILUB 1S7YA 3H7MA 3IL1B 5H8FB 4FEBA 3KG2A 1ZIUA 4N6PA 4AB6A 3M3FA 1URGA 3M3KA 1EZ9A 3FASA 3OELA 2ABHA 4DE8A 4IO4A 1Y20A 4BDRA 1SQYA 2I4BA 1FQEA 3Q29A 3QAXA 3ONMA 3U92A 5H8SA 5A5XA 4FE8A 4MLQA 3IB2A 2X7QA 4LQ5A 4M1VA 3T96B 3GZGA 5AA2A 1USYH 5FTHA 4IO2A 4LZ7A 4DDDA 4HTGA 4IO6A 3TEPA 4F29A 3MAMA 1Y1ZA 4HS7A 3IO6A 2ZMBA 3EF7A 2HEUA 2RCBA 5AA4B 3G3IA 2CZLA 2IEEA 3MPKA 1R6ZA 4RPNA 1FTMA 1RYXA 2O69A 3TUSA 2DVZA 4X1DA 4GL8A 1IZ1A 2RC9A 4IO7A 2A5TA 5KCJB 5DVIA 3VLVA 1ZJLA 2OWSA 4KCDA 2Y7PA 3U93A 3UP9A 3MUQA 4U23A 4BDOA 4ECFA 1Y1MA 2YLNA 1SDXA 1WODA 4JWXA 1FTOA 3QXMA 4U22A 1MG1A 1MXVA 3KFMA 4C0RA 5EYFA 4UA8A 5J1DA 3Q26A 4XTCQ 4N07A 1Y9UA 5TPAB 3KBRA 4R73A 3UGWA 4DXBA 2CMOA 3LR1A 4H8JA 2V3QA 3KOTA 5F1QA 4YMBA 4MH5A 4HW8A 3QK6A 2ZXTA 2H4IA 4EXKA 1UTHB 2NOOA 4YMAA 3H06B 2OJTA 4IO3A 4GRKA 3R6UA 4R2BA 1MQJA 3MJNA 3TFLA 1DSNA 3TCGA 5CM6A 2DWJA 3V5AA 1FTJA 3S9LC 3O28A 2QJEA 2ZNSA 2H5YA 2GHAA 2XXHA 5HM4B 1Y4CA 3ECRA 2I49A 1JQFA 4RY1A 2QL3A 3W15C 3D4CA 1P1WA 3E4RA 3LBSA 1II5A 3EHTA 2UYEA 3KN3A 1B3EA 2ZYKA 3ZKKA 5DEXA 1SW1A 3KJ7A 4NF5A 1FCKA 4QHQA 2F7AA 3G7WA 3U94A 3LSWA 2AYSA 4Q8RA 2VD3A 3N6UA 3TYHA 4PFYA 5ICTA 2O7IA 4EXLA 4H67A 3C31A 1ZKBA 4GLIA 2FNCA 3O2AA 3LUYA 1R9QA 2OZZA 3IX1A 3MPLA 3IORA 3V89B 4OFLA 5I2NB 1LBCA 2HCAA 2Q9TA 4NWCA 1ELJA 4F31B 3EPEA 2ZYOA 4ESWA 2GH9A 3E9XA 2UVHA 3IO4A 4NF8B 2UVJA 4KYEA 5L9SA 4IY5A 5B70A 3FATA 2F97A 4GQOA 4ND9A 1IXHA 3RT8A 3TQLA 1XVYA 3HSTA 3H6TA 3QUJA 3IOWA 4R9GA 2ZNUA 5H8QB 1MPCA 4YB7A 4NE4A 2PT2A 5L9OA 3KGCA 1VR5A 2G29A 1RKMA 1XC1A 1OQGA 2P2AA 3RT6B 3F11A 2XD3A 3VE1B 3VXCA 1EZOA 1FW0A 3RNNA 3EHSA 4TOZA 4XKQA 5M2VA 2Q2CA 5KDTB 2R6GE 3DLNA 1B51A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1LAXA 2HFBA 1FPDA 4JVDA 4PDHA 3K6XA 3U72A 1A99A 2CZIA 1INPA 1J1NA 3HFUA 1FPJA 2X7PA 2VGQA 4LATA 3O9PA 1O63A 3VVDA 2D3IA 5DVFA 2Z22A 5A5XB 1ZU0A 3KC1A 1URSA 3G3FA 2XX9A 3V8XB 2VP1A 3CI8A 1BP5A 2XXIA 1IMCA 1NFTA 2FHYA 1B32A 1YCJA 4P11A 4MMPA 4GX4A 4EQBA 4NF6A 5I7IA 2H9BA 3KSXA 4N6KA 3PPQA 3RY3A 2RC7A 1Q1KA 2ALUA 3I6VA 1JW1A 5IM2A 4OYVA 1H76A 1HSJA 4KI0E 3K1NA 3G3HA 3S2VA 4IGRA 2XD2A 2I48A 5CBSA 3FV1A 2ONRA 5KZTA 4H46A 2WBDA 4NHBA 2XXYA 5ITPA 2UVGA 2V93A 1FPBA 4GL0A 3K6UA 2R71A 1M5BA 1Y3QA 2Y84A 4BDNA 4ELOA 2QSXA 3E79A 2CZHA 4JWOA 5HPQA 1NV5A 4GF8A 5H8FA 2OCUA 3IOTA 4EDPA 4PFBA 1B2HA 1B46A 1MPBA 1SD3A 4YKJA 1MY3A 1UIVA 4KYSA 2AL5A 1LFHA 2XWKA 1JNFA 2ZZXA 1T0KA 1NV7A 5I2KA 1B3LA 4GFRA 1IQ7A 1AIVA 2F6PA 2H99A 4ELPA 3RYDA 1NL5A 4Q30B 1ATGA 1LCFA 1B0LA 3H4ZA 2GHBA 4N6DA 1A7LA 4BLAA 1B5HA 1NV3A 5CRYA 2XXVA 2FBPA 4IY6A 4QBAA 2V25A 1LB9A 3S9MC 2O1LA 1H44A 4GXSB 1VSOA 4JBZA 2IA4A 2O51A 2XHDA 2F8DA 2KLFA 2QS3A 1B3GA 1IXGA 3MYUA 1DPEA 3LSLA 1NMUA 2YJPA 1NNTA 3SEVA 2PT1A 4OHNA 4FJPA 4MJOA 3O66A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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