1SYIA

X-ray structure of the y702f mutant of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 2.1 a resolution.
Total Genus 85

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
O1 (85-87)S1 (3-7)EMPTYS4 (48-52)S2 (15-16)TVIa1 (10-13)S5 (59-61)AH7 (171-180)AH1 (32-44)TIV1 (11-14)AH8 (191-198)3H1 (20-22)TIV2 (17-20)3H2 (25-28)S3 (29-30)AH2 (71-77)TI1 (53-56)AH3 (91-95)S6 (68-70)TI2 (63-66)TIV3 (62-65)TIV4 (78-81)TII2 (222-225)S8 (97-106)AH9 (227-241)S12 (205-208)S9 (108-113)O2 (116-118)TII1 (113-116)O3 (203-258)TI'1 (181-184)AH4 (121-126)TVIII2 (128-131)S10 (131-133)AH6 (150-160)TIV6 (135-138)S11 (185-190)S13 (215-222)TI3 (253-256)AH10 (243-253)TVIa2 (200-203)S7 (82-83)AH5 (139-146)TIV7 (162-165)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA02
4ESWA 4KHZE 1PC3A 4R73A 4GLIA 1OQHA 3UA8A 1QUJA 3Q25A 4Q5TA 4IO2A 1IITA 1R1NA 4GL8A 5F1QA 1B52A 5IAIA 1OMPA 5J1DA 2M8CA 2D5WA 5H8HB 5CBSA 4YB7A 4GRKA 3JZJA 4EQ7A 1MPDA 3N5LA 1B58A 3WAEA 2F8DA 1FQDA 1AMFA 5HM4B 1LAGE 3DLNA 2B3FA 4MLVA 4FECA 2Q9TA 1Q1KA 1MQJA 1A99A 1A8EA 3K6VA 1M5EA 2DVCA 3KOTA 1P1OA 3TCFA 3ODBA 3TDJA 4ZEKA 4GXAA 3QUJA 3TCGA 2Z8EA 1EZ9A 5CI5A 3MVXA 3HHGA 2Z8FA 2YPNA 5EHSA 5TP9A 2XXTA 4OESA 1B4ZA 5LOMA 3TQLA 5H8NB 5AA3A 4DCXA 4YMAA 2RC7A 1DTGA 4GIZA 1LGBC 1POTA 3TFLA 1NNPA 3C34A 3E13X 1J1NA 3FJ7A 1QVSA 4ZE8A 3G3KA 1FTKA 4GD5A 3VDFA 3IO4A 4LUBA 5H8HA 2V3UA 3RUMA 3HHFA 1Y1MA 1MPCA 3M3LA 1NNFA 1BP5A 3MW0A 1B51A 3Q28A 2HZLA 3I3VA 4OEVA 3S2VA 3MWBA 3C35A 1LFHA 3TELA 5CBRA 1FTJA 1A54A 2ANJA 2XX9A 3FIRA 2DE3A 4HW8A 4KR5A 4EF1A 1I6QA 1WVJA 1B5IA 2P2AA 5FTIA 3A3UA 1N7WA 2A5TB 4DE8A 3I6VA 5DYHA 4TOZA 2QMXA 1T0KA 2O84X 5H8NA 5CC2A 3TCHA 4YKIA 5HBCA 5I57B 2KLFA 1QULA 5DT6A 1R9QA 3MBPA 4MH5A 1EH3A 3FATA 2XXIA 1FTMA 2DYXA 3K00A 3FJMA 4G8MA 5IKBA 4OWDA 3VXCA 5DVFA 5B7DA 3KBRA 1JVXA 2AL4A 2R6GE 3UGWA 3IB2A 4U1OA 3PUXE 3T9XB 4ZDMA 5I56B 5K2YA 3GBAA 1UTBA 1JNFA 3T22A 3TQWA 1QJMA 3F11A 1DPEA 3C31A 4ZEFA 3PPOA 1JW5A 1MG1A 2A5TA 2O68A 4OQOA 1TT1A 1EZPA 1OIBA 4POXA 1JQFA 4QFOA 4NWDA 3QIMA 1B7HA 1Y4CA 1QKAA 2RC8A 4ONYA 2FYIA 4KYDA 3T9UA 4G4PA 5A5XB 5DEXA 1B3LA 5ICTA 4FEDA 4NF4A 5JK4A 4IO5A 4PE5B 4ZECA 4FAJA 2XXWA 3ZKLA 2Q88A 1ZIUA 1DSNA 1IIWA 4JSDA 3CIJA 4O3CA 1ZU0A 1DTZA 3S9LC 1SYIA 3IOTA 4BDQA 3IORA 3H6TA 3EPEA 3G3FA 4G2ZA 3DP8A 3LSWA 4C1UA 2I0CA 4ESXA 2Y84A 4F2QA 4QRZA 3LSFB 2V3TA 1H45A 2X7PA 1BIYA 1IXGA 4XKRA 1EZOA 1JW1A 4THIA 2OCUA 3HV1A 1MY4A 2Q2CA 3OENA 1IEJA 3KN8A 4ZEIA 4HTGA 3O97A 3DP6A 4F3SA 5A5XA 4OYVA 3S9EA 3HPIA 3SEYA 2V84A 3FD3A 4JSOA 4GFRA 2QSXA 4WEDA 1SVXB 2H9BA 2DS9A 1MDQA 3G3IA 5JEIA 3K02A 4ELOA 4GXSB 4F3BA 4BDRA 3ILTB 4KFQA 2PYYA 3TTMA 2F7AA 2XXHA 2XX8A 4NF5B 4GVOA 5DTBA 3EHTA 1Q35A 4O3BA 4F39A 3O29A 3LSLA 3K0VA 2F97A 4DXUA 1FW0A 1B5HA 4IO6A 1JEUA 1MXXA 1B3HA 2QRYA 4G68A 1GR2A 3IX1A 1H43A 2DWAA 3K1MA 1H76A 4YICA 1MPBA 5AE4A 5DVIA 4BLAA 3MZ1A 2PVUA 3GZGA 4KCDA 1NNTA 1F9BA 3FZVA 4F1VA 3K2DA 3KEIA 4ZZAA 1N7XA 1RYXA 4PFUA 4G8NA 4EQBA 2ZNTA 5H8FB 3VVDA 2GFEA 4AQ4A 3IB1A 1I69A 3M3KA 1ANFA 3CSBA 3RQTA 4JWOA 4NF5A 2DWHA 3PV0E 3RGYA 5JTYA 3RTFB 1MXVA 2D21A 3MP8A 3IOWA 4XXUA 2DE2A 4GOTA 3RT6B 3KSXA 3HN0A 3TTNA 1TWYA 3LC8A 3THIA 2F36A 2RF1A 1DPPA 2REGA 1JEVA 1A40A 5BWJA 5KZTA 1FQEA 2ZYNA 2HEUA 3CFZA 3EQ1A 4LP2B 4JBZA 1IZ1A 4ELRA 3FVNA 5H8FA 4EXKA 2ABHA 2X26A 4E0XA 3C4MA 4KQPA 4ND9A 3N6TA 4U23A 4DCYA 4IO7A 3K6XA 2UYEA 5L8DA 4NF6A 1B32A 3FASA 1NMUA 4BDMA 1H44A 1S9TA 1MY0A 2LAOA 1DMBA 1B3FA 1VSOA 5FHNA 3T93B 3VE1B 3FV1A 1N84A 1FCKA 3RY3A 3PUWE 3WAFA 2ZYKA 5CMMA 1YTVA 1URSA 1MY2A 3VLUA 3FJGA 4F3PA 2XXQA 2QPQA 1ZTYA 4R2FA 4LONB 1P1NA 3TTKA 3DM0A 1I6BA 4I9DA 3UP9A 4GF8A 1AH5A 4IGRA 3GLBA 5TPAA 4I8CA 1MDP1 3MVYA 2OK2A 3Q26A 4FATA 1PB8A 2O51A 4R74A 3PPNA 4I1DA 4Q30B 4KI0E 2UYFA 5FHOA 1GTKA 4MF3A 1FTOA 4H67A 2ZYOA 1O63A 3PMXA 3H03A 1PEBA 1JW4A 2YLNA 4M1VA 3C36A 3TEPA 4GL0A 3V83A 3RN8A 5CRYA 3OO6A 4IGTA 4OHNA 4F1UA 3TMGA 3PMVA 3G7WA 1P1UA 2IEEA 4FORA 2Z8DA 2F6PA 1S7YA 1R6ZA 3H6VA 1FTLA 3OO8A 3TZAA 3E3KA 3TPAA 2F6GA 2DWIA 4NMYA 2XXUA 3PU5A 5TU0A 1LAFE 3SETA 2YJPA 1NKXA 3CVGA 2I0BA 3PUZE 1UTBB 4QHQA 3LSXA 3T9VA 4O3AA 2H5YA 1N04A 2GH9A 3CI8A 2DVZA 4P0GA 3PUYE 4DXBA 3UK4A 2NXOA 2UVIA 3N94A 4H1XA 3LBSA 4RK2A 3KN7A 2ONSA 2VD3A 4H5GA 1QUKA 3IJOB 3DELB 4U22A 3VVFA 4XKQA 3I5OA 1RKMA 1TFAA 3E9XA 2E1SA 4BDNA 5DEXB 3QYTA 4TQUQ 1O7TA 4JB7A 4NF4B 2FNCA 3FVOA 3O6GA 4NE4A 1XC1A 2Y7RA 4X9TA 4PETA 1HSJA 3H6UA 4YB5A 4AB6A 1P1WA 3FUZA 1B5JA 4WXJA 1XS5A 2I6EA 2THIA 1UTHB 2DXYA 3MVWA 5L9MA 4XKPA 2PT1A 4KCCA 2ZNSA 2PT2A 4QF9A 3PUVE 1SW4A 1NFTA 1DOTA 2I4BA 3EN3A 4R72A 4RJZA 4EF2A 3OD7A 3VXBA 2O1LA 3KG2A 1MXWA 1MXUA 4TLMB 1B7UA 4DZ1A 1IXHA 3QUFA 4ZZEA 4R6KA 5KDTB 3KOSA 1AIVA 2VP1A 1B1XA 3HSTA 2GHBA 1QKBA 1M5CA 1BTJA 1LB8A 3MZ9A 2V3QA 1PBQA 1YPNA 2H98A 1SD3A 2I58A 5CMKA 2UVHA 2XHDA 3MJNA 3MZBA 2D3IA 1UTHA 1IXIA 2UVJA 2AYSA 4WKMA 1II5A 3OOAA 1Z7NE 2ZXTA 3RLFE 4QSCA 2UVGA 2NVUB 3KZGA 1M5FA 3MVZA 4N07A 3VLVA 2XD2A 3KFMA 3O9PA 2R9JA 3K6UA 3FVGA 5K2XA 1URDA 1D9VA 2REJA 3K4UA 2AL5A 1IQ7A 3VFJA 4U4SA 4YAHX 4F1YA 1SI1A 5KDTA 2Y7PA 5H8QB 4DIGA 1P1QA 1BKAA 3SKPA 1MXYA 2G29A 3P7IA 4U1ZA 2HZKA 5CM6A 4G68B 1H3DA 5B70A 2BJJX 3C32A 3OXNA 4PFYA 5I84A 5I2NA 3C9HA 4X1DA 2RCAA 1LB9A 4OTEA 4RXLA 1PBPA 4OFLA 4YMBA 1FQBA 4QFPA 3EF7A 3OMBA 4Z7EA 3H06B 4U4XA 4EDPA 5KCJA 4BDLA 5FTHA 1LCTA 3H3GA 3G3GA 4LZ7A 3O6IA 4R2BA 2VGQA 4JXIA 2HQ0A 3B6TA 1IXCA 1MRPA 1POY1 3W9VA 5JTYB 2XXVA 3B6WA 1AOVA 1XOCA 4K3FA 4KD5A 1LFGA 2E0SA 4C1TA 5H8QA 3OEMA 3IOUA 1N3XA 4ELQA 4NF8B 4LATA 2VD2A 2V25A 3TTRA 1LFIA 4MLQA 1L5TA 5I58A 1MQIA 4UACA 3SEXA 1VE4A 4MFIA 1MS7A 1Y3PA 5ICQA 2I3WA 4FIMA 1LCFA 1XHYA 4F18A 3M3FA 4LVQA 3CRBA 3KN3A 1I6AA 3B7DA 2ONRA 3T96B 4FEBA 2OZZA 4UA8A 3VLWA 2G93A 2F7BA 4F3GA 3HCQA 3D4CA 2I48A 3CG1A 3OO7A 1M5BA 1FQAA 3Q27A 1NNKA 3UN6A 2X7QA 3KJ7A 5ITPA 4LQ5A 4OMBA 4OFOA 4OFJA 1LSTA 3MP6A 4JWXA 1QUIA 1SBPA 3SESA 2Y7KA 4QFKA 3N6UA 2HAVA 4OXVA 3CSGA 4NF6B 1GV8A 1MH3A 4GWOA 4NF8A 2QL3A 5HPQA 4EQ9A 3TAJA 3B6QA 3FV2A 5ITOA 3BKIB 4XIGQ 2QS4A 2R71A 1CB6A 4RY1A 1JETA 3QXMA 3ZSFA 1MY1A 1OVTA 4IO3A 4PP0A 5AA2D 1B4HA 1LAXA 2RC9A 2O7IA 4FJPA 1MQDA 3G3HA 4Z0IA 2Y7WA 3QSLA 4KPTA 4RNSA 3O66A 2RCBA 2ESNA 4POWA 5TPAB 4RYAA 1MQHA 3IK6B 3TUSA 3CFLA 4NWCA 3V5AA 1VR5A 2H25A 4FE8A 4LQ2A 3GBBA 4HS7A 4PQJA 1A55A 2NOOA 2O69A 1Y3QA 1OVBA 4F29A 2DXRA 3FGSA 4EXLA 5ISUA 4OERA 4PFWA 1Y4TA 3H7MA 1PB9A 3PD8A 1HSEA 3SDFA 2QS2A 3Q29A 3IAZA 4H0WA 1B3EA 1OLAA 4PFTA 1TFDA 2XXPA 4M4GA 3U8QA 3MUQA 4YKKA 1B0HA 1ELJA 3S9NC 4X48A 1B6HA 5AA4A 3G3JA 1ZMGA 2P0SA 2F7CA 3OELA 4P11A 3SERA 4YU0A 2OJTA 4G68C 2QS3A 4OEUA 3S9MC 3O6HA 2OBGA 1LAHE 3ONMA 1EU8A 1FQFA 3GXAA 2Q8JA 4L17A 1ZBMA 4U21A 4IO4A 3BBRA 5EHMA 5AA2A 3LR1A 1GGGA 2XXRA 2ALUA 1RYOA 1B40A 2F34A 1ZKBA 2NWJA 1WODA 2AIXA 3IL1B 3AXFA 1B7ZA 3K01A 4F2OA 1B0LA 2XD3A 4KYSA 1AL3A 3ECRA 4Q0CA 1Y9UA 3QK6A 2WKYA 5FHMA 3OSQA 4XTCQ 3OO9A 4IY5A 4QSDA 4JWYA 3RTWB 1B1HA 1MXZA 1UIVA 2XXYA 2F78A 4YZZA 2W7YA 1CE2A 1BLFA 4DLDA 3M8UA 4R9FA 5I2KB 4OZ9A 4DDDA 2RKMA 1B05A 4G77A 1NH7A 1WDNA 3V8XB 4OVJA 4NTLA 3MC2A 3CFXA 1SW2A 2Z23A 2QMWA 4ZS9A 1Y3NA 1Y1ZA 4QFNA 1LLSA 5M2VA 3DP4A 1VFDA 4RPOA 5I59B 3CR9A 3TKDA 2DOJA 5L9SA 4R9GA 1ZLQA 2I3VA 4GQOA 3U94A 1B9JA 2H4IA 2GRVA 1HSLA 3EHUA 3IOVA 1MM6A 5BUUA 3TYHA 2O7UA 4LZ5A 2B3BA 3EHSA 3PD9A 2DQVA 5I2KA 2RINA 1S50A 3MQ9A 3KSJA 4IB2A 1B2HA 3L6GA 2PX1A 1R9LA 1MY3A 4H5FA 4RPNA 3PPQA 1M5DA 1UQWA 4XKNA 4E0WA 3TTLA 4WEPA 3S4UA 2OWSA 1TXFA 3U93A 2DE4A 5I59A 1XVYA 2DP8A 5I2NB 4U2RA 5CMCA 1LBCA 4LZ8A 3V89B 5AA1A 2OWTA 5I57A 3BFTA 1SW1A 3A09A 2OLBA 4ZEBA 2F5XA 1GVCA 5KCJB 2ZYMA 4R75A 4ZE9A 3FXQA 1KWHA 4RA1A 1UIUA 1OQGA 3N26A 3PGFA 3VV5A 3W15C 2F35A 3MPLA 2O6AA 3OSRA 1D3KA 4YKPA 5I56A 4H8IA 1OLCA 3MAMA 2Q2AA 4ELPA 3U1OA 2ZNUA 2UXAA 2DWJA 3JYRA 1B46A 5I58B 2Z22A 3D4GA 4I62A 3SEWA 3K1NA 5L9OA 2O1MA 1A7LA 2Y7IA 3ZKKA 1SYHA 4BDOA 2V93A 4H8JA 3TODA 3PPPA 3HO7A 3QAXA 1PDAA 3SEUA 4NEDA 1N3WA 1URGA 2QS1A 2Q89A 2I49A 1XVXA 3JV9A 2P1SA 3LUYA 3UIFA 1SW5A 3U72A 3IR1A 3A3CA 4N13A 1SI0A 1USYH 3CG3A 3R6UA 4QSEA 2ONKE 2A5SA 4YKJA 2CMOA 4JDFA 4N6PA 2NUVA 5ELVA 2H99A 2XXXA 4ISUA 4ZEDA 1MQGA 3FVKA 4F19A 1SDXA 3K6WA 4X1BA 3KJTA 4OETA 1P99A 2GHAA 2FA7A 4H65A 4IY6A 3R7XA 1MH4A 4YB6A 3RNNA 2XX7A 4OENA 4C0RA 3BFUA 4DXCA 4TLLB 1YAEA 3RT8A 1B3GA 3MP1A 4AB5A 3MPKA 4KYEA 3OEKA 4G8HA 3ILUB 1US4A 5DVJA 3W9WA 5EYFA 5H8SA 3T9HB 3RPWA 1Y20A 1A8FA 3ZS6A 1US5A 1ZJLA 3K1PA 2HCAA 3O2AA 3USDA 2PBWA 3O28A 1D9YA 4Q8RA 2CZLA 1FQCA 4ECFA 1LBBA 3L6HA 3IO6A 4F22A 1JVYA 1Z7ME 3FXRA 2B65A 2HAUA 3VVEA 4LA9A 1O64A 4R6YA 4HCWA 1D4NA 3T66A 2VHAA 1YCJA 2VOZA 1NH8A 5AA4B 1SQYA 1VFEA 1MM7A 4F31B 3U92A 2I4CA 2DSFA 3FXUA 4RK9A 3E4RA 2ZMBA 4P0IA 3UORA 1PB7A 1USYE 4QFLA 1XT8A 3IJXB 1N76A 5AA2B 5F7VA 3H4ZA 2HFBA 3IB0A 1ATGA 2QJEA 3R26A 3H6WA 4MBPA 2HXWA 1NL5A 1N0TA 5CMBA 4EUOA 4R6HA 2PMSA 1IUDA 3SEVA 4HCYA 2IA4A 3PPRA 4H6DA 3PMWA 3C33A 1QW0A 5TP9B 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ESWA 1LBZA 4KHZE 1PC3A 4R73A 4GLIA 1OQHA 5I3SA 3UA8A 1QUJA 2FHYA 3Q25A 4Q5TA 4IO2A 1IITA 1R1NA 4GL8A 5F1QA 1B52A 5IAIA 1OMPA 5J1DA 4I3YA 2M8CA 2D5WA 5H8HB 5CBSA 4YB7A 4GRKA 3JZJA 4EQ7A 4XF5A 1MPDA 3N5LA 1B58A 3WAEA 2F8DA 1FQDA 1AMFA 5HM4B 4N8GA 1LAGE 1LBYA 3DLNA 2B3FA 2MKZA 4MLVA 4FECA 2Q9TA 1Q1KA 1MQJA 1A99A 1A8EA 3K6VA 1M5EA 2DVCA 3KOTA 1P1OA 3TCFA 3ODBA 3TDJA 4ZEKA 4GXAA 3QUJA 3TCGA 1NI9A 2Z8EA 1EZ9A 5CI5A 3MVXA 3HHGA 4HE0A 2Z8FA 2YPNA 5EHSA 1IMCA 2PCRA 5TP9A 2XXTA 4OESA 1B4ZA 1NUZA 5LOMA 3TQLA 5H8NB 5AA3A 4DCXA 4YMAA 2B4LA 2RC7A 1DTGA 4GIZA 1LGBC 1POTA 3TFLA 1NNPA 3C34A 3E13X 1J1NA 1FJ6A 3FJ7A 1QVSA 2CZIA 1YZ0A 4ZE8A 3G3KA 4PF8A 1FTKA 4GD5A 3VDFA 3IO4A 4LUBA 1FPDA 5H8HA 2V3UA 3RUMA 3HHFA 4PGNA 1Y1MA 4N4UA 1LBXA 1MPCA 3M3LA 1NNFA 1BP5A 3MW0A 1B51A 4H45A 3Q28A 2HZLA 3I3VA 4GBVA 4OEVA 3S2VA 3MWBA 3C35A 1LFHA 3TELA 5CBRA 1FTJA 1A54A 2ANJA 2XX9A 3FIRA 2DE3A 4HW8A 4KR5A 4EF1A 3PTYA 1VDWA 1I6QA 1WVJA 1B5IA 2P2AA 5FTIA 3A3UA 1N7WA 2A5TB 4DE8A 3I6VA 4P56A 5DYHA 4TOZA 2QMXA 1T0KA 2O84X 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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