1TFAA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, apo form
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTVSSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
publication title Alternative structural state of transferrin. The crystallographic analysis of iron-loaded but domain-opened ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (OVOTRANSFERRIN)
total genus 100
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1tfaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1tfaA02
3W9WA 1B4HA 3MWBA 5H8HB 4FORA 2CMOA 4F39A 4YMBA 4QRZA 1QKAA 4RPNA 1GR2A 1M5DA 1YAEA 3T9VA 2DVCA 2ONSA 4OFJA 1B1HA 4YB7A 2QL3A 4ELQA 2F78A 1FTLA 5EYFA 4RJZA 2ZNTA 4NEDA 3OEKA 1XVXA 1N04A 3OSQA 2V3QA 3DP4A 1M5BA 2V93A 5LOMA 4OERA 1IEJA 3T22A 1NNFA 3DM0A 1QUIA 4LATA 1Y4CA 1AL3A 5ITOA 4WEDA 5KZTA 2PX1A 1XVYA 1ZMGA 3C36A 2Y7PA 4WXJA 1LSTA 4YZZA 2HQ0A 2FNCA 1NNPA 4Q8RA 1BTJA 4RNSA 4R6HA 3CFLA 1SQYA 4PFYA 4PFTA 3TEPA 3PGFA 5J1DA 4U4XA 4FEDA 4OEVA 3O28A 4EUOA 1Q1KA 1B3FA 1R6ZA 5AA4A 4G4PA 5L9OA 1OLCA 5I2NB 3FVOA 2VHAA 3CFZA 3MBPA 3PUXE 4EXLA 4AB6A 1AIVA 2G29A 2I48A 3MVZA 2D21A 1DTZA 2PBWA 2HXWA 3FJ7A 5B7DA 1B7UA 3KJ7A 3MC2A 3KGCA 3CI8A 2DP8A 3OO9A 3K0VA 4U1ZA 2I4BA 2F34A 2I4CA 4QF9A 5FTHA 4ELOA 2HFBA 3A3CA 1US4A 1Y9UA 3G3JA 3IB1A 4LP2B 3KBRA 4PP0A 1LB8A 3PV0E 1IUDA 2Q89A 1MY4A 2RKMA 3GBBA 4OZ9A 2DSFA 3CSGA 3KFMA 2HZKA 2QJEA 4H1XA 1M5EA 1R1NA 3U94A 5F7VA 3OO8A 3QAXA 4ZE8A 3FV2A 1JW1A 1D9YA 5K2YA 5L9MA 1GV8A 3FUZA 4GIZA 2VOZA 3H6UA 3LR1A 1FTMA 1B5JA 3PUVE 3KSXA 5I59A 1URSA 3IX1A 1Y1MA 3LBSA 3DELB 2UYEA 3GLBA 1MXXA 3B6WA 2I3VA 4MH5A 4FAJA 1SYHA 1S50A 3C4MA 4ELPA 2QMXA 2NUVA 5B70A 3K02A 2YLNA 5CMBA 1B2HA 5BWJA 2I0CA 3FXQA 5DVFA 3OSRA 1FW0A 1FTOA 2PT1A 4KFQA 4IO2A 3V5AA 5DYHA 1BKAA 3M8UA 3S9EA 4GVOA 4U2RA 3TFLA 1PB8A 4RXLA 4OXVA 2QRYA 3KN7A 5CMMA 1I6QA 3OOAA 3N94A 3Q27A 2UXAA 2H5YA 3N6UA 5CBSA 1H76A 1NL5A 3CG3A 4OFOA 1MPBA 3USDA 4GXAA 4KD5A 2OLBA 3QUJA 4MF3A 4QFNA 2Q8JA 4X9TA 1ZIUA 1KWHA 2F7BA 3HCQA 5H8HA 2XXQA 5A5XA 3H06B 3L6HA 1TFAA 2ZXTA 4MFIA 3TCGA 3A09A 3O6GA 3OEMA 4F1VA 1PB7A 1FQEA 2XXUA 3U8QA 4F3PA 4KCCA 4OFLA 2ZYNA 1UTBB 1XOCA 1MQIA 5AA2D 3RT6B 4PFWA 1ANFA 1Z7NE 2R71A 2DOJA 2Y7RA 4XKQA 1O7TA 3VXBA 2M8CA 3K01A 5AA3A 2AIXA 5AA4B 1OVTA 3PMWA 4JWYA 1B7ZA 1QKBA 4YICA 4IO5A 4DXUA 1NNTA 5ELVA 3H6TA 3KG2A 3MVYA 4RYAA 4PE5B 4UA8A 1FTJA 1MH4A 3K6UA 3FD3A 1MDQA 2DXRA 4DE8A 2ALUA 3W15C 2O1MA 3H6WA 2Q9TA 1B5IA 5I2NA 2BJJX 4NMYA 4QSDA 1P1UA 3Q28A 4XKRA 4HTGA 1F9BA 3O66A 1JW5A 4QFKA 1M5CA 3V89B 2XXXA 3MPLA 1A54A 4X48A 2Z8EA 3HPIA 1VSOA 4U22A 1D4NA 4OTEA 3VE1B 1M5FA 4P11A 4ZEBA 1MQHA 3IO4A 4KHZE 3IJXB 2RCBA 3E4RA 3RLFE 2Y84A 4YB5A 1J1NA 3UGWA 3MJNA 2DE2A 1A99A 1MY0A 4PQJA 3IOUA 4DXBA 1AMFA 2GFEA 3PUZE 1MXVA 3QYTA 3KZGA 3SETA 4RK9A 5TP9B 4G8NA 4C0RA 3UN6A 3RUMA 3MPKA 4JDFA 3KSJA 1Y3PA 1UQWA 5I59B 5TPAA 5L9SA 4DCYA 2QS1A 1ZLQA 1XS5A 2YJPA 2VD2A 3OXNA 1URGA 3MZ1A 1USYH 3AXFA 4R6YA 5JK4A 1OMPA 3E9XA 3B6QA 4R9FA 4LZ7A 4EQ9A 4QFOA 1JNFA 4NF8B 4TLMB 4RK2A 3B7DA 2LAOA 2O84X 4OETA 3I5OA 3LC8A 2DWJA 5H8FB 4Z7EA 3ILUB 5I2KA 1Y1ZA 3FXUA 1MM7A 3IB2A 1VE4A 2F8DA 1T0KA 3S4UA 4POWA 1B9JA 2IEEA 2H98A 1B4ZA 2THIA 3MAMA 3PMXA 3C35A 3KOTA 3EN3A 4H6DA 3TELA 1JVYA 3BKIB 1IQ7A 1JEUA 3TKDA 2V3UA 4R2FA 3QIMA 5F1QA 5A5XB 5L8DA 3TYHA 2I6EA 3VXCA 1HSLA 1CB6A 1D3KA 3ZKLA 2V25A 2Y7KA 1ATGA 1N7WA 5KCJB 4O3AA 3S9NC 3IJOB 4H67A 3TPAA 2DQVA 3IB0A 2E1SA 3IOTA 1Y20A 3E13X 4HCWA 2ZNSA 1WODA 1NFTA 1NH8A 2F7AA 1UTHB 3C9HA 4IO6A 1I6AA 3H4ZA 2R9JA 4LONB 1UTBA 2B3BA 1MXWA 2DWHA 2XXWA 3M3KA 3OO7A 4DDDA 2H99A 1FQBA 3IOWA 3FATA 3EHSA 1A55A 2Z23A 4ZDMA 3UP9A 4Q30B 4OQOA 4KYEA 1QJMA 2PT2A 1P1OA 2FA7A 4C1UA 1NMUA 3K1MA 3I3VA 2E0SA 3V8XB 2QS3A 3K00A 3SEYA 1SW1A 2QS4A 1MPCA 5HBCA 3MVWA 4R6KA 4NF6A 2P0SA 1R9LA 1P99A 3CFXA 4OEUA 1EU8A 4OWDA 3N5LA 1FQDA 4PFUA 2F5XA 5FHNA 1MH3A 4G68C 2DYXA 1H45A 1P1QA 3H3GA 3TODA 1LCFA 4XXUA 4ZEKA 3R6UA 2VP1A 1LAFE 1GTKA 4YMAA 1MG1A 2WKYA 4LQ2A 1TWYA 4ZZEA 2Q88A 3C34A 1B3HA 2XXRA 3TUSA 2Y7IA 1NNKA 5TPAB 3T9XB 2ZMBA 4KPTA 3EF7A 4MLQA 4ESXA 1YCJA 4FJPA 1A8EA 5AA1A 1BP5A 5TP9A 1VR5A 4GQOA 5AA2B 3VDFA 3TQLA 3OMBA 1MDP1 2I3WA 2F6GA 2HCAA 5CRYA 1MPDA 1BLFA 4F3BA 4OMBA 4NF4B 2ABHA 1DSNA 5I2KB 3PPOA 4IB2A 4LQ5A 4NF5A 3ZSFA 1MM6A 2OZZA 3K1NA 3N26A 5DVJA 2IA4A 4H5GA 4NF8A 2O7UA 1HSEA 3G3KA 3LSXA 3MP1A 5H8FA 2I49A 1PB9A 2QMWA 2ONRA 3U92A 4Q0CA 1Y4TA 3K6WA 3TTNA 4UACA 3LSWA 1ZJLA 3C33A 2NXOA 1AH5A 1B46A 3VVFA 1FQAA 3RGYA 4BDQA 1LAXA 1FQCA 4C1TA 1MXZA 3ECRA 1UIVA 3I6VA 4G2ZA 4M4GA 4HCYA 3HSTA 4JBZA 1TFDA 5FHOA 1N3XA 2GHAA 3K2DA 3IAZA 4TOZA 3SKPA 1MS7A 1Y3QA 4F2OA 2XXHA 3G3HA 5JTYA 2XXTA 4ZEDA 2UVIA 3PPPA 2RF1A 3JYRA 3T93B 5KCJA 4I1DA 4DXCA 4HS7A 4LVQA 3RTWB 3RY3A 1LAGE 4ELRA 2DS9A 1B5HA 1UIUA 4FECA 2DE3A 3DP8A 4U23A 3EHUA 5H8NA 1UTHA 2QSXA 3T9UA 1B1XA 1SD3A 3KOSA 3BFUA 1SI1A 3CSBA 4I9DA 3MP6A 2OWTA 3CRBA 3IL1B 4NF6B 2XXIA 3FIRA 4XKPA 4WKMA 4R75A 2P1SA 4GWOA 1N7XA 3VLVA 2AL5A 3K4UA 4IO3A 1PBPA 4F3GA 3DLNA 4BDNA 4I62A 3Q29A 3O6HA 1SVXB 3V83A 1BIYA 4O3CA 1OQHA 3G7WA 1XHYA 3R7XA 4G8HA 1N3WA 1B32A 2XX9A 2Z8FA 1A8FA 5I56A 1VFDA 4ND9A 1DOTA 4NE4A 1POY1 3CIJA 3WAFA 3SDFA 1LBCA 4QHQA 3TQWA 4GLIA 3OD7A 2DXYA 3W9VA 4M1VA 1S7YA 3MZBA 2XX8A 1N84A 2CZLA 1NH7A 2ZYKA 2O51A 3TAJA 3LSLA 3RPWA 4LUBA 1JETA 4BDMA 4JWXA 1R9QA 2QS2A 3VV5A 2RINA 5DTBA 3S2VA 4BLAA 1H3DA 1B58A 1LFGA 1Z7ME 2F6PA 4KI0E 3TZAA 4BDLA 4JWOA 3HV1A 3K1PA 2ESNA 1QW0A 4ISUA 1SW4A 3O29A 2OJTA 4XIGQ 4R73A 3H03A 5AA2A 4POXA 3EHTA 1B7HA 1MXUA 4H8JA 5CC2A 4H8IA 1ZKBA 3O97A 4NF5B 1A7LA 4ZZAA 4F1YA 4R74A 4NF4A 5H8SA 4F2QA 2GRVA 1PEBA 3VFJA 3A3UA 1PDAA 3H7MA 3GZGA 2O68A 1MQDA 1O63A 1MY1A 1IITA 2ANJA 3GBAA 2O6AA 3SEUA 4R9GA 3FV1A 1SYIA 5IKBA 2XXPA 4Z0IA 1IXHA 4F29A 2H25A 4LZ5A 2QPQA 2B3FA 1B6HA 2P2AA 3DP6A 3IO6A 5AE4A 4GRKA 1TXFA 1RKMA 3B6TA 4BDRA 1MY2A 4YKPA 4ECFA 5JTYB 3FVKA 1IXIA 1LFHA 4F18A 5BUUA 3TMGA 3SEVA 4QFLA 1IXCA 4FIMA 4U4SA 2XXYA 2I0BA 2OWSA 3GXAA 2F35A 4NWDA 1N76A 2HAUA 3TTRA 4KQPA 3ODBA 1Y3NA 3PPQA 5CBRA 2O7IA 3K6VA 4YB6A 3E3KA 3L6GA 4E0XA 5H8NB 4JB7A 3PUYE 3LSFB 3THIA 2KLFA 3KN8A 4IGTA 2F36A 3VVEA 5H8QB 3ZKKA 1B0LA 2Z22A 2A5TB 4PETA 1QVSA 4NWCA 3RNNA 3UK4A 3TTLA 5KDTB 2GH9A 5TU0A 1B40A 2HEUA 1QUJA 1DMBA 5DEXA 3P7IA 2OBGA 1MQGA 4ONYA 3S9MC 1DTGA 3TCHA 3WAEA 4RPOA 2F97A 4EXKA 3OELA 3Q25A 4ZS9A 3G3GA 1I69A 2O69A 3D4CA 3T96B 5I57B 4N07A 4XTCQ 4U1OA 5I56B 2YPNA 3FVGA 4EDPA 4KR5A 3TCFA 2XXVA 4EF2A 1AOVA 3S9LC 1O64A 4GOTA 4N6PA 1ELJA 3FASA 2Q2CA 2FYIA 1B52A 5CMCA 2DWAA 2I58A 3QSLA 2AYSA 2D3IA 1B05A 3U72A 1LLSA 4AQ4A 3SERA 4GL8A 4OENA 1EZOA 2Y7WA 1SW2A 5HM4B 1QUKA 4O3BA 1P1NA 4AB5A 3UA8A 3FVNA 2D5WA 3R26A 4F3SA 5EHMA 3KEIA 1DPEA 1SDXA 3RT8A 1FCKA 2Q2AA 3D4GA 1ZTYA 4YU0A 3QUFA 2A5SA 4QFPA 5ITPA 3T9HB 1VFEA 3FXRA 4OHNA 4G68A 4JXIA 4BDOA 3HO7A 3RN8A 2ZYOA 2B65A 3PD9A 1GVCA 2V3TA 2REJA 3G3FA 1EZPA 4YKIA 3SESA 1IXGA 3ZS6A 2X26A 4JSOA 4F19A 3MQ9A 4EQBA 3ILTB 1YTVA 4HW8A 3G3IA 4FATA 1B0HA 3JV9A 3ONMA 4R2BA 3KN3A 4R72A 2OK2A 1I6BA 1D9VA 2AL4A 2UVJA 4H5FA 2VGQA 4RA1A 1MY3A 4THIA 3EPEA 3QXMA 4ZE9A 5ISUA 5FHMA 3RQTA 1OVBA 4OVJA 5I58A 4F1UA 1Q35A 3MVXA 3CR9A 5I84A 1A40A 4P0IA 4GF8A 4TQUQ 1MQJA 2G93A 1XC1A 1EZ9A 4I8CA 1SI0A 2ZNUA 2R6GE 1FTKA 1ZU0A 1RYXA 1SW5A 5M2VA 1EH3A 4X1BA 1P1WA 1H43A 4WEPA 1JEVA 1B3LA 3FJGA 4OESA 3F11A 5ICTA 3PU5A 4EQ7A 1N0TA 3PPNA 4Q5TA 4DLDA 2XHDA 1URDA 2W7YA 4DIGA 3O6IA 4XKNA 1TT1A 3IOVA 4KYDA 4DZ1A 3O2AA 2HZLA 1US5A 3IR1A 4QSEA 4GL0A 3PMVA 2HAVA 1FQFA 1LCTA 1ZBMA 1OLAA 4IO4A 4P0GA 4K3FA 5DEXB 4NTLA 2UYFA 3PD8A 1B3EA 3KJTA 1WVJA 5H8QA 4MBPA 4RY1A 3TTMA 3MP8A 2A5TA 4ZEFA 2UVGA 4GD5A 5KDTA 3N6TA 4H65A 4ZECA 1JW4A 4QSCA 4DCXA 1LFIA 5DT6A 4IO7A 4JSDA 1POTA 4G8MA 3UIFA 3JZJA 3SEWA 2PYYA 2XD3A 3QK6A 4N13A 3TDJA 3U1OA 3Q26A 2OCUA 1PBQA 4YAHX 2V84A 3TTKA 2PMSA 4U21A 4GXSB 3FZVA 5I57A 2DE4A 1S9TA 3RTFB 4EF1A 4OYVA 2NVUB 1PC3A 1B51A 2DVZA 2RC9A 3PUWE 3UORA 1L5TA 3M3LA 2H9BA 1DPPA 2Z8DA 1CE2A 5DVIA 4G77A 4F31B 4YKJA 4FEBA 4MLVA 5K2XA 5CM6A 3BFTA 4FE8A 4KCDA 1IIWA 1LAHE 4LZ8A 3CVGA 4KYSA 3C31A 3MW0A 2NOOA 4E0WA 4G68B 4GFRA 5JEIA 2XD2A 2F7CA 2VD3A 4IY5A 4ESWA 1QULA 4IY6A 4LA9A 5ICQA 3C32A 2X7PA 2REGA 1GGGA 5IAIA 3IK6B 4L17A 1B3GA 3M3FA 3BBRA 3K6XA 3T66A 3VVDA 3U93A 1LB9A 4ZEIA 2GHBA 1LBBA 4X1DA 1MXYA 3IORA 3CG1A 1RYOA 1WDNA 1JVXA 2X7QA 4F22A 3HHFA 3HHGA 4YKKA 1JQFA 2NWJA 2RCAA 1LGBC 5I58B 2RC7A 1XT8A 1II5A 2ONKE 3FJMA 3FGSA 1IZ1A 5CMKA 3MZ9A 1NKXA 4TLLB 1MRPA 3OO6A 3LUYA 4IGRA 1YPNA 2H4IA 2RC8A 2DWIA 1SBPA 1HSJA 3MUQA 3PPRA 1OQGA 2UVHA 5EHSA 2PVUA 4H0WA 1H44A 3VLUA 3O9PA 5FTIA 2ZYMA 1USYE 1OIBA 5HPQA 3H6VA 3EQ1A 3SEXA 2XX7A 2O1LA 5CI5A 3OENA 3HN0A 3VLWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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