1URSA

X-ray structures of the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
molecule tags Maltose-binding protein
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
total genus 120
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA01
4QFNA 4U23A 1B3FA 4ND9A 1Y4CA 1SDXA 5TPAB 1HSJA 3S4UA 2D5WA 3IB1A 3OO8A 3PPOA 4ESXA 2V3TA 1LAFE 4IGRA 1YCJA 3PGFA 1P1NA 3K1MA 1YPNA 5CM6A 4YMAA 1MXYA 4KYEA 1LAHE 5DVIA 4C0RA 3CRBA 3K6VA 3OSQA 2OWSA 3K6WA 3WAEA 3PPQA 4EQBA 2G93A 4HCWA 4IGTA 3KFMA 4EQ9A 4DCYA 1US4A 3TTKA 1ZLQA 3QUJA 3B6WA 2B65A 1QUJA 3ECRA 4ZEFA 3LSWA 4Z0IA 1FTLA 2ZYKA 3I6VA 5HM4B 3FJ7A 1NH7A 1B3LA 2XX8A 1NFTA 3K6XA 3MW0A 2XXHA 2YJPA 1MPBA 3RTFB 5CC2A 1LCTA 4LVQA 1Y4TA 3SEVA 4E0XA 3LBSA 4DLDA 1A40A 3PU5A 4P0GA 3IOTA 4PFWA 4Q30B 3TTMA 1HSEA 2X7PA 2P2AA 4LQ2A 1N7WA 4F3BA 3SEYA 4DXUA 4QF9A 1H3DA 4GLIA 4MF3A 4KHZE 1LGBC 1B5HA 2XXRA 1D3KA 3DP6A 3MWBA 3TODA 1P1QA 4RJZA 4H1XA 1OMPA 3TTRA 4EXKA 2F5XA 3T9VA 3G3HA 2DXRA 1MPDA 2RKMA 4G2ZA 3IOVA 1LLSA 4RNSA 3OEMA 2ZNSA 1F9BA 1B58A 1ZBMA 5A5XA 3FUZA 2UYEA 4KCCA 3QIMA 4OHNA 1ANFA 4U1OA 3PD9A 3VE1B 1CE2A 4YMBA 2VP1A 3A09A 5L8DA 1CB6A 3LSFB 1BLFA 4TQUQ 1TFAA 2Y7PA 3LUYA 5JK4A 4LZ8A 4F22A 2O68A 1PEBA 5I56A 1BKAA 4JWOA 3O66A 2XD2A 3GBBA 4OFJA 4X1DA 3OO7A 4POWA 3MZBA 3VVFA 2R6GE 3AXFA 1A7LA 2Z8EA 3FD3A 1PC3A 5H8HB 4N07A 4DXCA 3PPRA 3WAFA 4YKPA 5I84A 5CBRA 4RA1A 4FJPA 4F1VA 4O3CA 1UTHB 5HBCA 2NVUB 3ONMA 4R74A 4U22A 2O69A 1L5TA 3IAZA 3EHSA 1FQCA 1FCKA 2UXAA 4TLLB 4BDNA 5I57A 2XXIA 3KN7A 1MXXA 4KPTA 4NF5B 1NNKA 2DOJA 2I58A 3N5LA 4M1VA 1B7HA 1WODA 3OXNA 2ZYOA 1ZMGA 2XHDA 4FAJA 4LZ7A 4NF8A 2DVZA 3HN0A 3Q28A 3QYTA 3EF7A 1GVCA 3UA8A 2G29A 3H4ZA 3L6GA 4XXUA 1SYIA 1KWHA 5B7DA 2FA7A 4IO5A 4NTLA 2VD2A 5BUUA 2XX9A 3KOTA 3MP8A 1M5BA 2GHAA 2AL5A 3EPEA 4RPOA 4LZ5A 4NF8B 4NF4A 4EXLA 1MPCA 3ILTB 1B7ZA 3H6VA 3N6UA 1UQWA 5DTBA 5CRYA 3TCGA 3FVNA 2Y7WA 3Q25A 3T9XB 5DT6A 2O1MA 3R26A 2F7BA 1JNFA 2Q2CA 3ZKLA 4PE5B 4MBPA 3IO4A 1B05A 2LAOA 3T96B 4ELOA 3K1PA 3I5OA 2H25A 1POY1 3QSLA 2VHAA 3FJMA 1MDP1 3SETA 1JW5A 5CI5A 3VXBA 1TFDA 3T9HB 4U1ZA 3TCFA 4NWDA 3U93A 4BDMA 4ZEIA 3KJ7A 3TPAA 2O84X 2ZMBA 4GVOA 1H43A 1B40A 3HV1A 4POXA 1DPPA 1O64A 2XXQA 1LAXA 2OZZA 5CBSA 3G3JA 3GLBA 1MY1A 3FV2A 4G8NA 1MY0A 2P1SA 5M2VA 1DTZA 2E1SA 4LUBA 4UACA 1B9JA 3Q27A 5DVFA 2I4CA 1IXCA 2F35A 2WKYA 3UIFA 4FEBA 3FVKA 3FASA 3VXCA 1N04A 2HZKA 3O6HA 3HHGA 2O51A 2THIA 3RY3A 2V93A 4GL8A 1EU8A 3LSLA 3W9VA 1B1HA 4QFOA 3SESA 2DP8A 2DWJA 3O6GA 1SW2A 2DYXA 4OEUA 5I2NB 2RC7A 4GF8A 3FVGA 4BLAA 1AIVA 2GH9A 4NF6B 1R6ZA 4BDLA 1H45A 1LSTA 3EHTA 4ZEBA 2QMXA 3HCQA 4PQJA 1EZPA 3PUWE 2AL4A 5AA4A 3H6WA 3EN3A 5H8FB 5CMMA 3H06B 3V83A 3C32A 3FXQA 4GFRA 3C33A 3TTNA 3RT8A 4BDRA 2NOOA 2I49A 1MXWA 3K6UA 1GTKA 3BFUA 4KI0E 1R9LA 2PYYA 2ABHA 5ICTA 5I58B 2R71A 3IO6A 1QJMA 2YLNA 3BKIB 1XVYA 4I9DA 4U4SA 1I6AA 2ESNA 4UA8A 5TPAA 1MY4A 1MM7A 2UYFA 1NNPA 4GQOA 1QULA 2Q88A 2XXYA 4ISUA 3GBAA 4O3BA 3VVEA 1XS5A 4G8HA 5AE4A 1M5FA 3EHUA 1A8EA 5JTYB 5ELVA 2W7YA 1SI1A 4N6PA 3DP4A 1B7UA 4DE8A 4C1UA 3CR9A 2UVIA 3K00A 4MLQA 5IAIA 1XOCA 1B51A 3CVGA 2I4BA 4MH5A 4GOTA 1Y9UA 1SYHA 3CFZA 3RT6B 3USDA 1B0HA 1LCFA 1Y3PA 1A54A 4E0WA 4QSCA 3RNNA 3V5AA 3KOSA 2Q9TA 3PPNA 4R6HA 4JWYA 3MBPA 4R6KA 4YICA 3UP9A 3VLWA 1S50A 2HQ0A 1R9QA 3HPIA 1SVXB 3U94A 3KN3A 5KDTB 4I62A 2QS1A 2HEUA 2DE2A 2NXOA 4ZE8A 3KSJA 3K01A 5F7VA 2DWAA 1JVXA 3CIJA 3K02A 4EQ7A 3KJTA 4WEPA 1B3HA 2HCAA 1P1UA 1MXZA 2F7AA 1XT8A 4YAHX 1MG1A 1P1OA 1H76A 4ZEDA 4JXIA 2O1LA 2CMOA 1YTVA 4P11A 1URDA 1PB8A 4ESWA 5FHNA 2DWIA 3C9HA 1QVSA 2UVJA 4H6DA 3SDFA 4H65A 3FXUA 5I2KB 4XKNA 2OCUA 1PB7A 4THIA 3BBRA 2RCAA 1MDQA 3K2DA 1B3EA 3CG3A 1DTGA 5K2YA 2NUVA 4F3SA 4OENA 4QFKA 1FQDA 3TCHA 5FTHA 2P0SA 3H03A 5B70A 4I8CA 1MQGA 4F31B 2Y84A 2RC9A 3KSXA 3QK6A 3SEWA 1N3XA 1SBPA 1A99A 2AYSA 2QMWA 4KFQA 5AA1A 5H8NB 3FV1A 4NE4A 4KYDA 4HTGA 2PT2A 2XXTA 3O9PA 1LB8A 2HFBA 4H5FA 4P0IA 1QKBA 5TP9B 4GXSB 3RUMA 2HAUA 2ONKE 1R1NA 3D4GA 1SD3A 3DELB 1DPEA 5H8HA 4XIGQ 4TOZA 2I3VA 4IB2A 4G77A 5ICQA 2VD3A 1LFGA 1S9TA 4PFTA 2Y7IA 1UTHA 4ONYA 3P7IA 3ZS6A 4Z7EA 4EUOA 4IO3A 4OFOA 4OEVA 3HSTA 5I59B 5K2XA 1FQAA 1P1WA 2PMSA 3FZVA 3MAMA 2E0SA 3N26A 4NF5A 4DZ1A 3THIA 4OXVA 1M5EA 3KN8A 4YB5A 2QRYA 3OEKA 4Q8RA 4QFPA 3S9MC 3KG2A 3E4RA 2QJEA 1Q35A 1IXHA 2F34A 3TUSA 1N76A 5EHMA 5AA2B 3S9LC 4KR5A 5ISUA 3VDFA 4DDDA 3CI8A 3QXMA 3OELA 5LOMA 5FHMA 1IITA 3L6HA 4OQOA 2ZNTA 4DXBA 4U2RA 3PUZE 3H3GA 2ONSA 4HS7A 1Y3NA 1NNTA 2I0BA 3OO6A 4GIZA 2FNCA 1LFHA 4KQPA 2RC8A 2ALUA 5DEXB 3K0VA 3B6TA 3W15C 4ZE9A 4F3PA 5L9SA 4FECA 3MQ9A 3MUQA 3S9EA 2DS9A 3G3GA 3HO7A 1POTA 4R75A 3ZSFA 1ZTYA 1XVXA 3G7WA 1LBCA 3CSBA 4F1UA 1B5JA 1B6HA 3GXAA 3FXRA 1P99A 1AL3A 3BFTA 1D4NA 4ECFA 2H4IA 2ZNUA 4R2BA 4PETA 3OOAA 3N94A 4IO2A 1N3WA 3T93B 3H7MA 3UN6A 4PP0A 2O6AA 4M4GA 1VE4A 3PUYE 1B0LA 1I6QA 4H8JA 2X26A 2A5SA 5TU0A 1VFEA 1FW0A 3TELA 2ZYMA 1SI0A 3IOWA 2Z22A 2I48A 3TDJA 4H0WA 3FGSA 3R6UA 3A3CA 3UORA 4F1YA 3TAJA 4IY6A 4R73A 1QUIA 4U4XA 1D9VA 2Q8JA 5I2NA 3LC8A 5J1DA 4LONB 1UIUA 4XKPA 1AOVA 2OJTA 3G3IA 4NF6A 4AB6A 4IO7A 1FTMA 1IXGA 1A8FA 3U1OA 3TYHA 2F97A 2O7IA 3PD8A 4QHQA 1QUKA 4C1TA 3U8QA 4FE8A 5H8FA 3DP8A 1Q1KA 2M8CA 4OESA 3IL1B 2PBWA 2XXPA 1LBBA 2RF1A 3MPLA 3RTWB 3VLVA 2REJA 3VVDA 3FIRA 1ZU0A 3MVWA 5ITPA 1EH3A 2AIXA 3GZGA 1MQDA 1Z7NE 2XXUA 5I58A 4KD5A 2O7UA 2YPNA 1ZKBA 1B4HA 1JEVA 1JVYA 3PPPA 1MH4A 3B6QA 1UTBB 4G68C 3M3KA 4DIGA 1MQHA 4RY1A 5CMKA 5CMCA 1M5CA 1PDAA 3ILUB 4GD5A 4JBZA 3TEPA 2PX1A 4ZS9A 1VR5A 2FYIA 4WKMA 5H8QA 5JTYA 3S2VA 4ZECA 3B7DA 1O7TA 2F6PA 1JW4A 2D21A 4HW8A 5KCJB 3R7XA 2Z8DA 1BTJA 1JW1A 4EF2A 3OD7A 3VV5A 3HHFA 3CFXA 1B2HA 1SQYA 4OYVA 5H8QB 1OLAA 1FTKA 2H5YA 1D9YA 5EHSA 4AQ4A 4R2FA 4WXJA 1EZ9A 2F36A 2RCBA 3TTLA 1B4ZA 3U72A 3OENA 5FTIA 3EQ1A 3SEXA 1QKAA 3V8XB 1TXFA 4OVJA 5KDTA 4MLVA 4FATA 1WDNA 1US5A 1I6BA 2A5TB 1URSA 4G68B 2OWTA 1FQBA 3OSRA 3SEUA 2IEEA 5L9MA 3O29A 1UIVA 2KLFA 3W9WA 1Y1ZA 1FQFA 1A55A 4R72A 2XXXA 5ITOA 2UVGA 3IX1A 4X9TA 3TMGA 1GR2A 3E9XA 2DVCA 4JSDA 4JDFA 5CMBA 1ELJA 1MS7A 2QS3A 3E13X 2D3IA 3Q26A 2DE3A 1IUDA 5I2KA 3MP1A 3PMVA 2OK2A 4R6YA 4TLMB 4LQ5A 3KEIA 3JZJA 1S7YA 3VFJA 1B3GA 3PUVE 4FORA 1OVTA 4OERA 2Q89A 3CSGA 4FEDA 4U21A 1OQGA 1N0TA 2ZYNA 5FHOA 1FTJA 2HZLA 3KBRA 1MXVA 5F1QA 5H8NA 2HAVA 4BDOA 4QRZA 3MJNA 4LATA 1SW4A 4OFLA 3KZGA 1DSNA 4BDQA 1Z7ME 3MPKA 5TP9A 1NH8A 3QAXA 4R9GA 3TFLA 2XX7A 1MQIA 2XD3A 3C34A 3UK4A 1VFDA 4MFIA 2DXYA 1SW5A 1GV8A 3IOUA 4YKJA 4ELRA 3K4UA 1BIYA 1PBQA 1DMBA 4ZZAA 2QSXA 2QS4A 5EYFA 1WVJA 4QFLA 1IEJA 1MQJA 3K1NA 2V3UA 2DSFA 2R9JA 2ANJA 1EZOA 3H6TA 4GWOA 2OLBA 2QPQA 4YB7A 5I59A 4ZDMA 2OBGA 1SW1A 1Y20A 1B46A 1IZ1A 3C4MA 5A5XB 3ZKKA 3PUXE 5HPQA 4F18A 1LB9A 4IY5A 1O63A 3MVZA 1JEUA 4XKRA 4H67A 2F6GA 3DM0A 3IJXB 1NKXA 2VOZA 3RLFE 2F8DA 1OQHA 4GL0A 3TQLA 4PFYA 2HXWA 3SERA 2X7QA 5AA2A 3M3FA 3UGWA 3S9NC 3E3KA 4GXAA 5I56B 4F2OA 1YAEA 1NL5A 4Q5TA 4XKQA 2IA4A 5AA2D 1AH5A 1JQFA 4ELQA 4F2QA 1TT1A 5IKBA 1J1NA 1Y1MA 3SKPA 4F19A 3RPWA 4G8MA 2DWHA 3OMBA 4L17A 1BP5A 4ZZEA 5DYHA 1FQEA 1MY3A 5DEXA 3IR1A 4KYSA 4H8IA 4XTCQ 2V3QA 1MM6A 4JWXA 4N13A 2GFEA 3PMWA 4PFUA 1H44A 4RYAA 1DOTA 1XHYA 1B1XA 4YU0A 4NMYA 2DE4A 3IB2A 3M8UA 1VSOA 4OMBA 2DQVA 2Z8FA 2Y7RA 3IJOB 1ZJLA 3TZAA 5I57B 4OZ9A 1OVBA 2QL3A 3QUFA 4GRKA 5L9OA 4EF1A 3LR1A 4NEDA 4RPNA 1NMUA 1URGA 1ZIUA 2B3FA 1TWYA 3I3VA 4LP2B 2F7CA 2H9BA 1FTOA 1MY2A 1USYH 3G3KA 5JEIA 1LAGE 2REGA 1AMFA 4IO6A 1MH3A 2I6EA 3IB0A 4JB7A 3VLUA 3O97A 1II5A 1NNFA 3FATA 4HCYA 3D4CA 1MXUA 3MP6A 3CFLA 2H99A 1B52A 3M3LA 4FIMA 3KGCA 3MC2A 4NF4B 2Q2AA 1GGGA 3C35A 4OWDA 2V84A 4YB6A 3A3UA 5H8SA 4OETA 3MZ9A 2F78A 4K3FA 1QW0A 3N6TA 4RK2A 2QS2A 3U92A 3LSXA 4F29A 1M5DA 3JV9A 3IK6B 4R9FA 4IO4A 3O6IA 1OIBA 1N7XA 4KCDA 4OTEA 3FVOA 4QSEA 4G4PA 5AA3A 2PT1A 4F39A 2VGQA 3ODBA 3C36A 1ATGA 2ZXTA 4AB5A 3TKDA 1N84A 2ONRA 1I69A 2GRVA 3FJGA 4WEDA 4H5GA 4EDPA 3OO9A 3MVXA 3H6UA 3F11A 2B3BA 3G3FA 2NWJA 3T9UA 1RYXA 1UTBA 4QSDA 4Q0CA 1XC1A 2GHBA 3RN8A 1B32A 4ZEKA 3O2AA 4JSOA 3DLNA 1IIWA 1LFIA 4F3GA 3O28A 3T66A 1RKMA 1USYE 1IXIA 1OLCA 3MZ1A 4X48A 1RYOA 3JYRA 4LA9A 3T22A 3TQWA 2H98A 3C31A 2I3WA 1T0KA 1PBPA 4YKKA 2XXWA 5KCJA 3RGYA 4YKIA 5DVJA 4DCXA 2RINA 2UVHA 4ELPA 1HSLA 5BWJA 4RXLA 1PB9A 2V25A 3PV0E 2I0CA 4X1BA 3CG1A 2PVUA 3RQTA 1MRPA 3IORA 5AA4B 2Z23A 3PMXA 3Q29A 1B5IA 2XXVA 2BJJX 4O3AA 1JETA 1IQ7A 4YZZA 4NWCA 5KZTA 3V89B 2Y7KA 2CZLA 3MVYA 4RK9A 1Y3QA 2A5TA 4I1DA 4G68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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