1US4A

Putative glur0 ligand binding core with l-glutamate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
AQEFITIGSGSTTGVYFPVATGIAKLVNDANVGIRANARSTGGSVANINAINAGEFEMALAQNDIAYYAYQGCCIPAFEGKPVKTIRALAALYPEVVHVVARKDAGIRTVADLKGKRVVVGDVGSGTEQNARQILEAYGLTFDDLGQAIRVSASQGIQLMQDKRADALFYTVGLGASAIQQLALTTPIALVAVDLNRIQAIAKKYPFYVGFNIPGGTYKGVDVTTPTVAVQAMLIASERLSEETVYKFMKAVFGNLEAFKKIHPNLERFFGLEKAVKGLPIPLHPGAERFYKEAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the Thermus Thermophilus Putative Periplasmic Glutamate/Glutamine-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE GLUR0 LIGAND BINDING CORE
molecule tags Receptor
source organism Thermus thermophilus
total genus 90
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16868 NMT1_3 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us4A01
3OOAA 2I4BA 4N13A 1MY3A 3EQ1A 4XIGQ 4YZZA 2REGA 4YKPA 1DMBA 3PGFA 1MY0A 1S50A 2ZYKA 5TPAA 1N3WA 1H44A 2DVZA 5TU0A 3PPRA 4GXAA 5H8SA 4IO4A 3PMVA 3K6UA 4Q30B 3N6TA 1MXWA 2Y7KA 3DELB 5AA4A 3IO4A 2V3QA 3MBPA 3IB0A 1B9JA 3IL1B 2IA4A 4U1OA 5I59B 1ZLQA 3CR9A 2UYFA 1ZIUA 1FTMA 1B3LA 4JWYA 2O84X 4XKPA 3S9LC 2XXXA 2OWTA 3CG3A 4KR5A 4H67A 3DM0A 1JEVA 4MLQA 3S2VA 4F1YA 2DQVA 2VOZA 3VV5A 2XD2A 5ELVA 1HSJA 3K6VA 3K6XA 3USDA 4U22A 2OJTA 2DWHA 2UXAA 3M3KA 3MZBA 4THIA 3KSXA 5ICTA 1Y3PA 4KHZE 3T9XB 4R9GA 1XC1A 3G3GA 5JTYB 4OEUA 2H99A 2ONRA 2H4IA 4NTLA 4H5FA 4Z0IA 5DEXB 3IO6A 1LB8A 1LGBC 1DTGA 1NMUA 1NNTA 3QAXA 1FQFA 3K00A 1B58A 3KOSA 1B4HA 1IXCA 1JW1A 5AA2B 1LBCA 4KCDA 1JNFA 4QSDA 1ZJLA 3B6QA 5I57B 3H03A 1NNFA 4NF8B 3IJOB 4F2QA 3PUZE 1TXFA 2AL5A 3RT6B 2F97A 2THIA 5ISUA 3U8QA 5B7DA 1ANFA 3MJNA 3V89B 4HW8A 4OHNA 3H7MA 1AIVA 1WDNA 1MS7A 4DLDA 3TQLA 4EF1A 4ELRA 1DOTA 1B5IA 1MPDA 2XHDA 3LSFB 2O68A 1FTOA 3S4UA 2Q89A 3OEMA 4IO3A 2M8CA 5BUUA 5JTYA 5AE4A 1PEBA 2Q2CA 4N6PA 3C31A 2HFBA 5DEXA 1QULA 4G68C 4ESXA 5TP9B 3PUVE 4H1XA 1URSA 4MH5A 1B7UA 1TT1A 3ZKLA 3RTWB 4GXSB 2I58A 1P1UA 3D4GA 4JSOA 2QPQA 4Q5TA 3VVFA 4L17A 4ZEDA 3EPEA 3N6UA 3TYHA 3P7IA 1LLSA 5JEIA 5AA2A 2O7UA 1B40A 3TEPA 2D21A 1M5BA 2H5YA 3FD3A 4OTEA 5I57A 3MQ9A 1LFHA 1IIWA 4NF8A 3SEWA 4JWXA 5L9MA 1FW0A 4TLLB 1RYOA 2OWSA 3IJXB 3ECRA 2Q8JA 4FIMA 4DXUA 1PBQA 1S7YA 2PBWA 4G8MA 2F5XA 4GVOA 2F36A 5KCJB 1MY1A 2XXIA 3MZ9A 1NL5A 3ODBA 1B32A 1MXXA 2I3WA 4GOTA 5KZTA 1PB7A 3KJ7A 4FEBA 4QFOA 4M1VA 4RK9A 1MXUA 1LAXA 3OD7A 4X48A 5TP9A 2UYEA 1XT8A 2HEUA 3R6UA 3PU5A 2HAUA 4R72A 1B51A 1MQJA 5K2YA 5BWJA 3K2DA 4YU0A 1IEJA 3QUFA 1NH8A 1QUIA 2VD2A 4C0RA 2O1LA 2H9BA 4F22A 1B0LA 4QRZA 4RJZA 1TFAA 4R6HA 3ZKKA 4MFIA 3O6IA 2G29A 3O9PA 4KPTA 4EF2A 3BFTA 1Y3QA 5CM6A 2ZYOA 2YJPA 3JZJA 1EZOA 1SYHA 4NE4A 5I2NB 3KG2A 2QS2A 3Q28A 5L8DA 4FATA 1N7WA 3T96B 4JWOA 4XKRA 3PPNA 5DYHA 1D9VA 1L5TA 3M3FA 2HCAA 4X9TA 3T9VA 1PB8A 3IORA 1N0TA 4FE8A 3WAEA 2I4CA 5KCJA 2W7YA 4QSEA 2Y7IA 2NOOA 5JK4A 1B7HA 4POXA 2DOJA 2F34A 4K3FA 5AA2D 1IUDA 2IEEA 1IXGA 4G8HA 4ZECA 2UVHA 3KZGA 4H6DA 3E3KA 4GD5A 3KGCA 3KJTA 2B3BA 3E9XA 1BIYA 3H6WA 3S9EA 3U1OA 2ZNUA 3H4ZA 1B5JA 1QKAA 3C35A 1Z7NE 2LAOA 2XXUA 4ISUA 1II5A 3FVKA 1YCJA 1B2HA 1GVCA 1BKAA 4ZE9A 2X7QA 3T9UA 4MF3A 3B6TA 5EHMA 1B05A 3IK6B 5HBCA 4R73A 4C1UA 3KN7A 1SW2A 3KEIA 4C1TA 4G68B 2R71A 4YAHX 1NNPA 1D3KA 1JW4A 3VXBA 4O3AA 4LVQA 3LBSA 1SYIA 2A5TA 4R2BA 2HZKA 3LSWA 3E13X 3MVXA 1DPPA 1SBPA 2AIXA 3IOTA 2DXYA 3VXCA 4U1ZA 3FJMA 2RCBA 4RYAA 1LCTA 2I0BA 4OZ9A 3SEUA 2FA7A 5FHOA 3HSTA 1OVBA 2OCUA 1EZ9A 3HHGA 3OO8A 1YAEA 2ALUA 3CVGA 4F31B 4KI0E 3IR1A 1JEUA 1USYE 4PE5B 4AQ4A 1MPCA 4NEDA 1LFGA 1OMPA 2Z8FA 3PPQA 3LC8A 1AMFA 2VP1A 4GQOA 3VLWA 2DWJA 3UIFA 4RNSA 1R6ZA 1A7LA 4Q8RA 2F7CA 4F29A 3CSBA 4G68A 4WEDA 2F78A 3TUSA 1O64A 2VD3A 4ZZEA 3K1NA 5DVIA 3TTNA 2XXVA 3K1MA 4DXCA 1P1QA 2RF1A 3BKIB 4ZEFA 1DTZA 1PC3A 2E1SA 3TTRA 2X7PA 4G4PA 4X1DA 1USYH 2Y7RA 1AOVA 3W9WA 3O2AA 1ELJA 3IAZA 1KWHA 4F3SA 3K4UA 4OXVA 3VLUA 2NWJA 3VLVA 3UORA 3FXQA 4RXLA 4YICA 2UVIA 4TLMB 2PMSA 4PQJA 1AL3A 2HQ0A 3I5OA 2PT1A 2ZNTA 4BDNA 1GR2A 4KYSA 2GHAA 1MXVA 3RT8A 5I2KB 3OEKA 4H0WA 1IZ1A 5I58B 4LATA 2YLNA 3K02A 2O7IA 1FTJA 3HCQA 4NMYA 3OO9A 3TAJA 3LUYA 3S9MC 2Z8EA 2A5SA 3FIRA 1O63A 2XX9A 1A99A 1M5EA 3H06B 4LQ5A 4P0GA 4IGRA 1LFIA 4OMBA 1MM7A 1MY4A 3EF7A 4RPOA 1N7XA 2ZYNA 1P1NA 2Y84A 3ONMA 5CMCA 2RC9A 4IO7A 2WKYA 4NF5B 1ZBMA 3G7WA 1P1OA 4I1DA 3IX1A 3EHSA 4JSDA 3Q29A 3G3KA 1POTA 1XOCA 1WODA 1NFTA 1MRPA 1N3XA 2Q9TA 4DIGA 3Q27A 1LSTA 2RINA 3N26A 5EYFA 3G3FA 1I6QA 4XXUA 2DWIA 5I2KA 5I58A 3KOTA 1N04A 3T9HB 3A09A 2OZZA 4PP0A 4R2FA 4NWDA 4R6YA 3FXUA 4PFYA 3H3GA 4GIZA 4BDMA 2ZMBA 3E4RA 3FV2A 2ONKE 4G77A 3S9NC 5CBSA 3MPLA 5ICQA 1MQGA 4E0XA 3FV1A 1XS5A 5F1QA 4O3CA 1NNKA 3RQTA 3BBRA 4HS7A 1BTJA 1B3HA 3HN0A 4I8CA 1QJMA 1GV8A 5H8NB 2P1SA 3M3LA 3O28A 1MDQA 2XXTA 1P99A 1EZPA 3IB1A 4H65A 4H5GA 1MG1A 4NF5A 3SEVA 4HCWA 3K01A 4EQBA 2QS3A 1Q1KA 3O6GA 5B70A 4RA1A 5CI5A 4I62A 4YMAA 1VSOA 2QRYA 1M5CA 4GFRA 3UP9A 2FNCA 3Q25A 3MWBA 1VE4A 4LA9A 2GRVA 1MH4A 3MVWA 3W15C 3JYRA 5CC2A 2HZLA 1EH3A 3OXNA 3O66A 4RK2A 2PVUA 4R74A 1BLFA 3MVYA 4O3BA 3T93B 3TTLA 1DPEA 4GL0A 3MPKA 3H6VA 1RYXA 4U21A 3OELA 1OIBA 1FTLA 2DE2A 4PFUA 1Y9UA 3OO7A 1B46A 1QUJA 4KQPA 1Y20A 3CFLA 4HTGA 5H8NA 2V93A 3OMBA 5I84A 2B65A 3OO6A 3F11A 3C32A 4XTCQ 1WVJA 3DP4A 3L6GA 2DSFA 2OLBA 1Y4CA 1N84A 3QXMA 3G3HA 4AB5A 5H8QB 1SW5A 4TQUQ 4OEVA 4OFOA 2V84A 4FECA 4POWA 5CBRA 3U94A 2ZYMA 4H8IA 3V5AA 1SQYA 2XXHA 2A5TB 3TTKA 2G93A 1B1XA 4FAJA 1XVXA 1AH5A 4BDOA 3CG1A 2OBGA 4KYEA 4E0WA 4F3PA 1VR5A 2FYIA 3CFZA 3N5LA 4PFWA 1JQFA 2O69A 1MPBA 1UQWA 1SDXA 1IXHA 2D5WA 4BDRA 4FJPA 4ZZAA 2YPNA 4LZ5A 1LCFA 1PB9A 2NUVA 5L9OA 5FTHA 3QYTA 3SKPA 1FQEA 2PT2A 4ZEIA 1M5FA 3OSRA 3M8UA 1UTHB 1MQIA 5KDTB 5HM4B 2DE4A 4F19A 2XXRA 4LQ2A 2I0CA 2QL3A 5ITOA 1P1WA 2F6GA 2XXPA 1R9QA 1UIVA 1JETA 3CFXA 1PBPA 2Z8DA 2RC8A 4EQ9A 5J1DA 2UVJA 2QSXA 3SDFA 1TFDA 4ELPA 4JXIA 1HSLA 3MP6A 3TTMA 3LR1A 3CRBA 4GLIA 1URDA 5H8QA 2NVUB 4ZEBA 1MQHA 3RUMA 3U92A 4F1VA 4ELQA 2DWAA 3PMXA 4BDLA 5IKBA 1Y4TA 1B3GA 3SEXA 4QHQA 2ABHA 4N07A 4YB5A 2B3FA 1RKMA 3VVDA 5A5XB 2XX7A 1BP5A 4GF8A 4AB6A 1A8FA 2Y7PA 2F8DA 1SW1A 3AXFA 4TOZA 3FJGA 2V25A 3I6VA 1XHYA 2AL4A 4YKJA 4ND9A 2OK2A 1QKBA 4ZS9A 2VGQA 2X26A 4QFPA 1UTHA 5KDTA 3QK6A 1LAFE 1R9LA 1ATGA 2REJA 5F7VA 3TPAA 1JW5A 3OSQA 4F3GA 3HO7A 1OVTA 3SETA 3CI8A 4EUOA 2F35A 5DT6A 3FJ7A 4ZDMA 3CIJA 3C34A 1D9YA 3MP1A 1OLAA 3RY3A 3O97A 4OENA 3FASA 3Q26A 1SI0A 1A40A 2CMOA 2I48A 4IO5A 4F3BA 4GRKA 4ZE8A 1FQDA 3KN3A 3QSLA 1US4A 1Y3NA 1CE2A 1YTVA 1H45A 5H8HB 1LAHE 1LB9A 5A5XA 1HSEA 4IB2A 2KLFA 3RGYA 4F1UA 3GBAA 3FVGA 4F39A 1S9TA 1CB6A 1UIUA 4OWDA 3SERA 3ZSFA 2HXWA 2R9JA 2O6AA 1A54A 3RTFB 2H25A 5EHSA 3TQWA 1MY2A 1Y1ZA 3C33A 3TDJA 4QFNA 1QW0A 5CMMA 3ZS6A 1Y1MA 1I6AA 3MAMA 1XVYA 3LSXA 4ZEKA 4LONB 2Y7WA 3G3IA 1B4ZA 2GH9A 3KSJA 3HHFA 3K6WA 2DS9A 3EHTA 4IO2A 4DXBA 2VHAA 2AYSA 3TFLA 1IQ7A 3I3VA 3VFJA 1MXZA 4LUBA 1FQBA 4ELOA 4KD5A 1OLCA 4F2OA 1O7TA 4OESA 3IB2A 4P0IA 4YMBA 3KN8A 1FCKA 3UA8A 2Z23A 2F7AA 4ESWA 4LZ7A 2Z22A 5H8HA 4YKIA 5K2XA 4YKKA 2O51A 2ANJA 2DP8A 4EQ7A 3GZGA 4KYDA 4RPNA 1ZTYA 4UACA 2V3TA 3N94A 1MM6A 3U93A 3PPOA 5H8FB 1OQHA 1SVXB 3PD9A 4PETA 4NWCA 1M5DA 4NF6B 3UN6A 2DVCA 3DP6A 3QIMA 2I3VA 3CSGA 3TELA 3C4MA 5I59A 1ZKBA 4FEDA 4G2ZA 1QVSA 1Z7ME 1IITA 2I6EA 2DYXA 4IY5A 1TWYA 4R75A 4LP2B 4KCCA 1POY1 3H6TA 3IOVA 2GFEA 4OETA 1ZMGA 3FVNA 3A3CA 1MXYA 4DZ1A 4JB7A 4Q0CA 4YB7A 1VFDA 4DDDA 1D4NA 4RY1A 4BLAA 4ONYA 3JV9A 2QJEA 2XXYA 2DXRA 4BDQA 5I56B 3K0VA 4H8JA 1SD3A 1H3DA 1A55A 3A3UA 3GBBA 3PUYE 1GTKA 3TCGA 2ESNA 3IOWA 1MH3A 3HV1A 3TMGA 3PV0E 4U4SA 3WAFA 2E0SA 4DE8A 3FXRA 3TODA 4QSCA 1MDP1 5H8FA 1MQDA 3C9HA 4NF4B 5DVFA 4NF6A 4XKNA 4OYVA 2ZNSA 2UVGA 1F9BA 2O1MA 3RLFE 1PDAA 3MVZA 3VE1B 1OQGA 3MW0A 4HCYA 3T66A 3VDFA 3FZVA 3GXAA 1I6BA 5ITPA 4QFLA 1URGA 4EXLA 5AA3A 5DTBA 4WEPA 3R7XA 3PD8A 1YPNA 1H76A 3HPIA 3DLNA 4X1BA 2V3UA 1LAGE 3VVEA 5I56A 4LZ8A 4ECFA 3PUXE 2PX1A 2ONSA 4F18A 3C36A 4MLVA 2D3IA 3ILUB 1IXIA 4EXKA 3FVOA 3MP8A 1LBBA 5HPQA 3EN3A 2BJJX 4EDPA 3U72A 3KFMA 3SESA 2CZLA 4NF4A 4WXJA 5LOMA 1J1NA 1B5HA 3V83A 2P2AA 4OVJA 3RNNA 2XXWA 1SI1A 2Q2AA 4DCYA 3UK4A 3O29A 4MBPA 4YB6A 5M2VA 3PMWA 1JVYA 2R6GE 2H98A 2P0SA 2F7BA 3B7DA 2QMWA 3BFUA 1FQCA 5CRYA 4IGTA 3KBRA 4IO6A 5CMKA 3TCFA 3FATA 2ZXTA 2QS1A 4P11A 4FORA 4I9DA 3MUQA 3D4CA 4PFTA 3SEYA 4U2RA 5FHMA 4OERA 2PYYA 3L6HA 3O6HA 3QUJA 4G8NA 2NXOA 2QMXA 2GHBA 1FQAA 2XXQA 1T0KA 2Q88A 1N76A 1Q35A 4U4XA 1I69A 5AA1A 2QS4A 1UTBB 4JDFA 4U23A 1QUKA 3B6WA 4Z7EA 1B7ZA 1A8EA 3R26A 3PPPA 2XD3A 3T22A 3UGWA 3W9VA 5FHNA 2RKMA 4GL8A 1JVXA 4XKQA 4M4GA 1DSNA 1H43A 5I2NA 3GLBA 5TPAB 1SW4A 4WKMA 3IOUA 4R9FA 4JBZA 1VFEA 1NH7A 3LSLA 3K1PA 1B0HA 1B1HA 1B3EA 1B3FA 5DVJA 4OFJA 2RC7A 4UA8A 3TKDA 5AA4B 4OQOA 3DP8A 4OFLA 3PUWE 5IAIA 2HAVA 5CMBA 2I49A 4KFQA 1R1NA 1US5A 3OENA 1GGGA 3MC2A 1FTKA 3TCHA 1B52A 1EU8A 3TZAA 3FGSA 3ILTB 1ZU0A 5FTIA 1NKXA 3H6UA 5L9SA 4DCXA 1B6HA 2XX8A 2RCAA 4QFKA 4GWOA 2DE3A 3FUZA 3THIA 2F6PA 3RPWA 4QF9A 3G3JA 1UTBA 3RN8A 4IY6A 3MZ1A 3EHUA 4R6KA 3V8XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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