1US4A

Putative glur0 ligand binding core with l-glutamate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
AQEFITIGSGSTTGVYFPVATGIAKLVNDANVGIRANARSTGGSVANINAINAGEFEMALAQNDIAYYAYQGCCIPAFEGKPVKTIRALAALYPEVVHVVARKDAGIRTVADLKGKRVVVGDVGSGTEQNARQILEAYGLTFDDLGQAIRVSASQGIQLMQDKRADALFYTVGLGASAIQQLALTTPIALVAVDLNRIQAIAKKYPFYVGFNIPGGTYKGVDVTTPTVAVQAMLIASERLSEETVYKFMKAVFGNLEAFKKIHPNLERFFGLEKAVKGLPIPLHPGAERFYKEAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Receptor
source organism Thermus thermophilus
publication title Structure of the Thermus Thermophilus Putative Periplasmic Glutamate/Glutamine-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE GLUR0 LIGAND BINDING CORE
total genus 90
structure length 297
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF16868 NMT1_3 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1us4A01
3FASA 3IOTA 3G3KA 3C35A 2ZYKA 1MPDA 1VFEA 4C1UA 1OQGA 3LSWA 3WAFA 3IAZA 3UA8A 3N5LA 3PPNA 1MXYA 1MY4A 2O7IA 4F3PA 4GRKA 4TOZA 3D4GA 3TQLA 4YICA 2DE2A 2XXPA 3TDJA 2O69A 5IAIA 4K3FA 3DM0A 3M8UA 3BFUA 3T9HB 3MBPA 2F78A 1LFGA 5I59A 3IORA 4OQOA 3K4UA 1JVXA 2UVJA 1VFDA 1UTBA 1RYXA 1M5CA 3KGCA 3SEUA 4RK9A 4F22A 1YTVA 3H3GA 3TAJA 5IKBA 1MH3A 4XKPA 2HCAA 3LBSA 3MVYA 1EZ9A 2Q8JA 1US5A 3FD3A 1MXWA 1AH5A 5EHSA 4OVJA 1O64A 2Z8FA 3FZVA 4IO3A 4U23A 1I6BA 1N04A 3ILTB 3H6UA 4H0WA 4ZECA 1SI1A 3K6UA 2OBGA 3DLNA 4HS7A 3ECRA 2D21A 2UYEA 4ZDMA 2DQVA 4PFTA 4U1OA 4F1YA 3MZBA 4PETA 3JZJA 1P1NA 3U94A 3OMBA 4YB7A 1FTLA 1MQDA 4NF6B 3QIMA 2Q88A 1GR2A 4OFJA 4KYDA 4M4GA 4QF9A 1OMPA 2I58A 3MUQA 2PBWA 4YKKA 3TTLA 3PMVA 2UXAA 3MP8A 4DXUA 2QJEA 3E4RA 3H7MA 5HBCA 4Z7EA 1FQDA 5F1QA 2I49A 1MDP1 2VD2A 1MM7A 2AYSA 3EF7A 5I59B 3HCQA 2YLNA 4PP0A 1XHYA 1SYIA 1VSOA 1XVYA 3KOTA 3C32A 4X1BA 4RNSA 3UORA 1A55A 4KCDA 3G3IA 2XXTA 5KZTA 3H6TA 1N84A 1FW0A 1BTJA 4E0XA 3IOVA 3M3LA 3RTFB 3CG3A 3PD8A 1IXHA 2DYXA 3CIJA 3MPLA 3K6XA 1IIWA 2Y7RA 3G3GA 5L8DA 2DVCA 3HHGA 4R74A 4EXLA 1UIVA 5I58A 4OETA 2PMSA 3IB2A 3RPWA 2RF1A 4DZ1A 1SD3A 4I8CA 4MF3A 5CBSA 1B0LA 1JVYA 3IB1A 1HSEA 1FQBA 1PBQA 2I4CA 3OELA 5I56B 1O63A 2DS9A 1PBPA 3KEIA 2Z23A 3VXBA 3VLWA 5KCJA 3TODA 2VHAA 3E9XA 1IQ7A 4ZEBA 4F19A 2CMOA 3LC8A 1NNPA 1POY1 4M1VA 1MXZA 3MP6A 3OO8A 4C1TA 2VD3A 4R9FA 3FJGA 4FECA 3ZS6A 3LSXA 2XX9A 4R2FA 3VE1B 3O6HA 4LZ8A 2HAVA 4R75A 5JEIA 1BKAA 2NOOA 5CBRA 1B9JA 1JEVA 5DVIA 1ZBMA 5DVFA 4N07A 2ONRA 4HCYA 3I3VA 4IO4A 3VDFA 4ZE8A 1NNKA 5AA4B 1JQFA 3GBAA 2THIA 3T22A 4ZEDA 2X7PA 3IB0A 4JDFA 2ESNA 3CFLA 3HV1A 2REGA 4YAHX 1P99A 3ZSFA 4KCCA 2UVHA 2O6AA 2DSFA 3QK6A 5TPAA 3IJXB 4NF5B 3DP8A 3W9WA 3T66A 2I3VA 3O2AA 4G68A 5B7DA 1SI0A 1GVCA 2RC7A 3DP6A 1H43A 1Z7ME 4DIGA 1I69A 2HQ0A 4NWCA 3CI8A 2R71A 4ISUA 4LVQA 5KCJB 1TFAA 4O3BA 5ISUA 3HHFA 2Q89A 4P11A 5H8FA 4AB5A 4HCWA 3QUFA 1YAEA 3HO7A 5DVJA 4JB7A 2ABHA 3C9HA 3MVWA 3ZKLA 4WEPA 1D9YA 4NF8A 4ELPA 1NNTA 4BDLA 3R6UA 3GBBA 4KQPA 1ZJLA 4Q0CA 4AB6A 5HM4B 2B3FA 1URDA 4TLLB 5A5XB 3S9LC 4FATA 4FEBA 3SEWA 1FTJA 2F7AA 4OFOA 4AQ4A 5AA2B 3TUSA 4GQOA 3OEMA 3SEYA 2E1SA 4RY1A 1PB8A 3WAEA 2GFEA 1NNFA 4PFYA 3E3KA 4DCXA 1A40A 3PUWE 3K1PA 2O1LA 2DXYA 4F31B 2G93A 1FTMA 3PPPA 2FA7A 3S9NC 2DWHA 3SDFA 1BIYA 5DEXB 3TKDA 1AMFA 1LAHE 4GL8A 2Y7IA 1UIUA 2F7BA 4IO6A 2HZLA 2V3UA 3UP9A 4GVOA 2DE3A 4WEDA 1EH3A 1QKAA 1CB6A 1MQGA 5B70A 3L6GA 1OLCA 3FXUA 4L17A 2H98A 4MFIA 4YB5A 3IX1A 4QFOA 2H4IA 2P1SA 2V84A 5ELVA 1Y4CA 4QRZA 5CMCA 1DTGA 3PUYE 1QVSA 3VVFA 3VLVA 3K0VA 4OWDA 1GGGA 1WVJA 3UN6A 3A3CA 3TTMA 4ONYA 3OO6A 2ANJA 3CVGA 1N3WA 3PPQA 3KN3A 3FXQA 3C36A 4H5GA 1ELJA 1B4ZA 1ZTYA 2ZNTA 1LAFE 2DE4A 2Y7PA 1LLSA 5ITPA 1B3GA 4NF6A 5BWJA 4PQJA 4FJPA 4N6PA 4Z0IA 2RINA 3M3FA 1PB9A 1XC1A 3P7IA 5L9SA 4GLIA 5CMMA 2H5YA 1A8EA 4FORA 5CMBA 3TPAA 3FGSA 3VLUA 4IO2A 4QFLA 3UGWA 3K2DA 3UK4A 3KJTA 3W15C 3LUYA 4EQ9A 4QSEA 4JSDA 2XHDA 1TXFA 2GHAA 3EHUA 3GLBA 2B65A 3Q25A 2F6PA 1A54A 1SYHA 4HTGA 4H1XA 2D3IA 1SBPA 1O7TA 4YB6A 2QL3A 4FE8A 1QUJA 1MS7A 4G8MA 1IXCA 4R72A 4F1UA 3B6TA 2B3BA 2XD2A 3LSLA 3QYTA 1SW5A 2XXIA 3PV0E 3MW0A 2AL4A 4I62A 3G3JA 3VFJA 2Y7WA 1AIVA 1B1HA 3O6IA 1LFIA 5EYFA 1VR5A 3T96B 2O7UA 1URSA 2XXUA 3R7XA 3RNNA 3VXCA 3V8XB 2QS4A 2QS2A 3N94A 4UA8A 3C4MA 3GZGA 4GF8A 4ZS9A 5I56A 1QULA 1YCJA 2I0CA 4H8IA 4GL0A 1JW4A 1B7HA 5H8NB 1P1UA 3TEPA 2NVUB 2GRVA 2F34A 4H65A 4ZEIA 2OZZA 2I6EA 1SW4A 3K6WA 5ICTA 5FHOA 4YKIA 3PPRA 4QHQA 4NMYA 3N6UA 1QW0A 2PYYA 4QFKA 5ITOA 1MDQA 1RYOA 1T0KA 1FQCA 3IL1B 4H67A 1N0TA 1ATGA 2OCUA 3FVKA 3VVDA 1S50A 5TU0A 5FHNA 3QXMA 4ZZAA 2NXOA 1WDNA 5AA4A 1EZPA 4IGTA 3U8QA 3FVNA 2VOZA 2ZNUA 5FTHA 4U4XA 2PVUA 4OENA 4XKQA 3OXNA 1R9LA 3K1MA 3S2VA 3A3UA 4N13A 3U72A 3OENA 1MXXA 3VV5A 4NF5A 1USYE 4QFPA 5LOMA 3N6TA 3K02A 3Q29A 1LBCA 4MLQA 1OIBA 3MZ1A 2RKMA 3TELA 4HW8A 2RC8A 2PX1A 2RC9A 4QSCA 3IJOB 3HSTA 5I2KB 1LCTA 3IO6A 1S7YA 4JSOA 1XS5A 1FCKA 4ESXA 1IXGA 1A8FA 2XXRA 1FQEA 1B2HA 3S9EA 4EF2A 3Q28A 1B7UA 1FQAA 1PDAA 2G29A 2F35A 2OK2A 4P0IA 3A09A 2O51A 4F39A 2QPQA 1EZOA 4U4SA 2OWSA 2GHBA 1B3EA 5A5XA 2BJJX 1DPPA 5J1DA 1B5JA 3IK6B 3V5AA 2XD3A 5DT6A 4TQUQ 1FTKA 2R6GE 4JWXA 4NTLA 3TTNA 5AA2A 4WXJA 2V93A 1KWHA 4JXIA 1LSTA 1LB9A 2XXQA 4PE5B 1Y3PA 2WKYA 2REJA 3H03A 1LCFA 3TYHA 5I2NB 4H8JA 4JWOA 3MC2A 3T93B 4IO5A 3BKIB 4EQBA 1B3LA 2QRYA 4IGRA 1FQFA 3U1OA 4G2ZA 1JW5A 2Y7KA 5DEXA 2E0SA 5AA3A 1II5A 3DP4A 5KDTA 1B4HA 1L5TA 1MY2A 1MY1A 4R6HA 3FVOA 1B40A 2IEEA 4OTEA 4XKRA 4IO7A 3MJNA 3EPEA 4RXLA 3TTRA 4OZ9A 4NE4A 4F3GA 4R73A 4GOTA 4RYAA 1N76A 1M5FA 3IO4A 4NF4B 3R26A 2Y84A 2A5SA 3C33A 4X9TA 3TZAA 4PFUA 3FUZA 1GV8A 2RCBA 1TFDA 2D5WA 2QS3A 3CSBA 2F6GA 1LAGE 4OHNA 4DE8A 5K2YA 1Y1MA 1JETA 3TFLA 3G3HA 2PT2A 1B3FA 4LZ7A 2I0BA 1IEJA 3SEXA 3L6HA 1H76A 1OQHA 3C34A 1UTHB 3RLFE 1NL5A 5AE4A 4JBZA 4NEDA 4F18A 2I4BA 1F9BA 4OEUA 5CC2A 3H6VA 3Q27A 4F3BA 1FTOA 1MY0A 4QFNA 1MPCA 3AXFA 3MWBA 3MVXA 1EU8A 1OVTA 4YU0A 5KDTB 1Y3QA 1VE4A 1MQIA 2DWAA 5FTIA 1US4A 2IA4A 4MLVA 3K00A 2V3QA 3LR1A 3O66A 2Z8DA 3O29A 3S9MC 1B7ZA 2Z22A 4XKNA 2OJTA 4ND9A 5M2VA 1DOTA 3TCGA 4LQ2A 3KZGA 3BBRA 4KFQA 5TP9A 1MRPA 4UACA 1DTZA 2XXVA 4YKPA 5AA1A 4BLAA 1P1OA 1SW2A 2Z8EA 3RY3A 1R9QA 3ONMA 5H8HB 3RTWB 4G4PA 2ZYNA 4GWOA 4FEDA 3CFXA 5HPQA 4ZZEA 3O9PA 1AOVA 4GFRA 1AL3A 5H8NA 2ZNSA 4LATA 3IOWA 3RUMA 4R9GA 1I6QA 2H99A 3QAXA 1Y9UA 1M5BA 4O3CA 4R6KA 1Q35A 4IY6A 3KJ7A 3T9VA 3THIA 4G8HA 2HEUA 3D4CA 3B6WA 4KYSA 2PT1A 3FIRA 2O68A 3EHSA 2A5TB 3KN7A 3PMWA 1NH7A 4RPNA 3PPOA 4G68C 4U2RA 1WODA 1QJMA 3KBRA 1QUKA 2XXYA 1D4NA 3LSFB 3OSRA 3EHTA 5BUUA 2RCAA 4EUOA 5CI5A 4OERA 4POXA 5TP9B 3U93A 3JYRA 4GIZA 2V25A 1TT1A 3CRBA 4OXVA 4ELOA 1NMUA 4F2OA 3RGYA 1B58A 4KR5A 4ZE9A 1LB8A 4EQ7A 1D9VA 4ZEKA 4YKJA 5H8QA 3DELB 5ICQA 3KSXA 2Q2CA 4FAJA 1N7XA 3O28A 2I3WA 4RPOA 4U21A 2F8DA 3W9VA 3C31A 3U92A 5I2KA 3N26A 5K2XA 1Y1ZA 2QMWA 4OFLA 2GH9A 4MH5A 3JV9A 2I48A 4LQ5A 3V83A 5I57A 1ZKBA 4BDQA 4LONB 3FVGA 3TCFA 3CG1A 5CRYA 4O3AA 3CR9A 3CSGA 4ELRA 1MXUA 5JK4A 2DP8A 3FV1A 2AL5A 5F7VA 5DYHA 5L9OA 2NUVA 2AIXA 2W7YA 1Y3NA 3BFTA 3RT8A 4OYVA 3SETA 1UTBB 5L9MA 1XT8A 2HAUA 4U22A 3T9XB 2KLFA 1LGBC 1NFTA 3E13X 1B05A 1J1NA 2X7QA 4ECFA 2F7CA 4POWA 1D3KA 4DDDA 1DPEA 3ODBA 3B7DA 1R1NA 3EQ1A 1MXVA 5I2NA 4GXAA 1CE2A 4RJZA 3PGFA 4MBPA 3RN8A 3UIFA 4E0WA 1B32A 3B6QA 1I6AA 3FV2A 4Q30B 4F2QA 2O84X 3G7WA 1B5IA 5H8QB 1Q1KA 2QS1A 2DWJA 1NKXA 3MQ9A 4EXKA 2O1MA 4YZZA 3HPIA 2YJPA 3OEKA 4DXBA 1M5EA 2UYFA 2OLBA 2XXWA 3PUZE 1P1QA 5CM6A 1Z7NE 2ZXTA 5I57B 1MPBA 1B52A 4DCYA 2QMXA 1NH8A 2XXXA 4OEVA 1ANFA 3MPKA 3KFMA 3FJ7A 1B5HA 2F5XA 1ZLQA 5I84A 1DMBA 4JWYA 3F11A 2X26A 1IXIA 1SDXA 4NF4A 4KD5A 4NWDA 4BDNA 3S4UA 4KYEA 4LP2B 3M3KA 3MZ9A 1YPNA 2DWIA 1B6HA 3SESA 4H5FA 5FHMA 4ESWA 1ZMGA 3PUXE 4XTCQ 3FATA 3O6GA 4GD5A 3SKPA 1HSJA 5H8SA 3RQTA 1POTA 1UTHA 2NWJA 2YPNA 1OLAA 2M8CA 2XX8A 4THIA 4Q8RA 2P0SA 1PB7A 4F3SA 3IR1A 3KSJA 1UQWA 5I58B 5CMKA 1QKBA 3ILUB 1M5DA 4LZ5A 1B51A 4X48A 1N7WA 1MM6A 3RT6B 2UVIA 1B46A 3TMGA 1SVXB 4OMBA 1B3HA 3FJMA 1ZIUA 2Q9TA 3IOUA 3QSLA 1MQHA 1LFHA 2HZKA 2ONSA 1MH4A 2XX7A 4DLDA 3KG2A 2VP1A 3OO7A 3MP1A 1MQJA 2LAOA 1DSNA 3I6VA 4P0GA 1H45A 2ZMBA 1RKMA 4XIGQ 3O97A 1OVBA 3VVEA 1XVXA 1P1WA 2ZYOA 4BDOA 2HFBA 4H6DA 4LA9A 4G77A 3MAMA 3OD7A 3EN3A 3HN0A 2OWTA 1S9TA 4R2BA 4BDMA 4KI0E 1BP5A 1Y20A 3QUJA 1LAXA 3KN8A 5H8HA 3V89B 2DOJA 4EF1A 1ZU0A 4OESA 3ZKKA 2FNCA 4U1ZA 3K1NA 1IUDA 2H9BA 1R6ZA 1BLFA 4XXUA 4ZEFA 1SW1A 5JTYA 3TCHA 4WKMA 4RK2A 3SERA 1PEBA 4I1DA 1H44A 2XXHA 3OO9A 2DXRA 1MY3A 3KOSA 3H4ZA 3H6WA 4G8NA 1SQYA 2ZYMA 1B0HA 5TPAB 1B1XA 4KPTA 4YMBA 1USYH 1PC3A 1JW1A 1MG1A 4G68B 2HXWA 4YMAA 4KHZE 2A5TA 4Q5TA 4BDRA 2UVGA 4I9DA 3K6VA 3TQWA 2FYIA 2P2AA 4F1VA 4X1DA 3I5OA 1JEUA 3OOAA 3PD9A 3PUVE 4TLMB 2ONKE 4QSDA 2R9JA 3H06B 3TTKA 2VGQA 5H8FB 4C0RA 3PMXA 3G3FA 3Q26A 1HSLA 1H3DA 1N3XA 1XOCA 4IY5A 4ELQA 4DXCA 3MVZA 4EDPA 4FIMA 1IITA 2F97A 3FXRA 1LBBA 3GXAA 3USDA 1IZ1A 3K01A 5DTBA 4RA1A 2F36A 3OSQA 1TWYA 4NF8B 1A99A 1A7LA 4PFWA 4IB2A 4F29A 5AA2D 3CFZA 2DVZA 2Q2AA 3SEVA 2ALUA 3PU5A 4GXSB 1URGA 3T9UA 2QSXA 1QUIA 1JNFA 1Y4TA 4LUBA 2V3TA 4R6YA 2H25A 2CZLA 5JTYB 5EHMA 1GTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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