1UTHB

Dntr from burkholderia sp. strain dnt in complex with thiocyanate
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
ALNTLETALTTRDSFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPGAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
molecule tags Transcription regulation
source organism Burkholderia sp.
total genus 58
structure length 226
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
B PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1uthB02
3TTNA 1LAHE 2QS3A 3FXUA 5EHMA 1YPNA 5I57A 2ABHA 1UQWA 3O29A 3O2AA 3KN8A 4DCXA 4YB5A 4HCWA 1R9QA 3IO6A 3R26A 4F3PA 1ZBMA 4KQPA 4QFPA 4XTCQ 3K6UA 1LFIA 2PMSA 3I3VA 4MLQA 4QRZA 1N76A 3BKIB 2REJA 1YCJA 4POWA 4DE8A 1US5A 1B0HA 4G77A 2NUVA 1H3DA 1MG1A 3O6IA 4RK9A 1MH3A 1GVCA 2ANJA 1ZU0A 1B2HA 4WEPA 2QMXA 1UIVA 1URDA 1OQGA 1SYHA 1UTBB 1SD3A 5AA1A 3PPQA 1FQEA 5H8NA 3PPOA 4C0RA 4K3FA 4PETA 5AA3A 1Y4TA 2O7IA 3MP6A 4QSCA 3MJNA 4R75A 4OEUA 4RNSA 3QK6A 5CI5A 2B3FA 1YAEA 2V93A 1UTHA 3JZJA 1N3WA 3B7DA 4X48A 3C33A 2Y7WA 3BFTA 5BWJA 3MZBA 4TQUQ 5TP9B 3G3GA 5FHMA 1QUKA 1FTMA 4ZE8A 5IKBA 4NE4A 1VSOA 4QHQA 3K0VA 2QS2A 4PQJA 5BUUA 4JWXA 2HQ0A 2DSFA 3KJTA 1JEUA 4XKPA 1MPCA 3VLVA 1MM7A 3TCHA 1QVSA 3L6GA 1A8EA 3KSJA 4FE8A 3OENA 4IO3A 2F97A 3PPPA 4KCDA 4F3GA 1H76A 1LCFA 4PE5B 1P1QA 1P99A 1QUIA 5B7DA 3DELB 4QFNA 2FYIA 4IO4A 4YU0A 3K00A 1VR5A 1LFGA 3T66A 3VLUA 5K2YA 4DXUA 3VV5A 1XVXA 1M5EA 5L8DA 3VLWA 1B58A 1MQDA 2WKYA 1EH3A 5TP9A 3USDA 2P2AA 3HV1A 3TCFA 4LUBA 2DXYA 2HFBA 3IAZA 1D3KA 4ISUA 3CR9A 3V83A 1FTJA 4IO5A 5TU0A 3SERA 1CE2A 1SI0A 5ICTA 4WKMA 4QSDA 2ZYNA 3HN0A 3KBRA 4NF6B 3FZVA 2CMOA 4H5GA 5H8QB 4I9DA 3C31A 4O3CA 3MVYA 2HAVA 2YJPA 3KJ7A 3K6XA 1ZTYA 3HHGA 4NF4A 4RYAA 2R71A 4KHZE 1N7WA 1JETA 1TFAA 3M8UA 3CFXA 4R9FA 1URGA 1SI1A 3FIRA 4ZEBA 1I6QA 4R74A 4ELRA 2O7UA 4C1TA 1MXWA 4ELOA 2Y7PA 3CRBA 4ZEKA 3KGCA 1LB8A 3IL1B 2Q89A 3H06B 1ZMGA 4ZS9A 3RQTA 2PBWA 5I2NB 4U21A 3M3FA 3RLFE 2Q2CA 1ZJLA 5F7VA 1Q1KA 4QFLA 4IB2A 3U93A 3OD7A 4IY5A 1AOVA 4F1UA 2GFEA 4BLAA 4I62A 4YAHX 3U94A 1B3EA 1OVBA 4OZ9A 3GBBA 3T96B 3O66A 2FNCA 4LQ5A 2ZYOA 3FGSA 1O64A 3THIA 4MF3A 3KN3A 4F1YA 4HW8A 2HEUA 1GTKA 2UYEA 4AB5A 3CSBA 5TPAB 5FHOA 4KYDA 3KFMA 4OFLA 5F1QA 3U8QA 4BDMA 1MXYA 3G3KA 4MH5A 3Q29A 4XKRA 4OESA 3QUFA 2VP1A 5CC2A 5ITPA 1A99A 1Y20A 1S7YA 1B3GA 2F5XA 2V3QA 2V84A 4RXLA 3K1NA 5A5XA 2ZNUA 4LATA 4XKNA 4TOZA 3IB1A 3LSLA 1MY2A 1LLSA 1SW2A 4MFIA 3RGYA 2DWIA 2XD3A 1Z7NE 3FXQA 3VXBA 2KLFA 3OSQA 2XHDA 4U1ZA 4ZEFA 3GBAA 2W7YA 1LFHA 2DVCA 5DTBA 1N04A 2V3TA 3N6UA 4R9GA 3TYHA 3Q28A 4ONYA 3FASA 2HXWA 2RC7A 2D5WA 4F3BA 2O69A 3IOVA 5ELVA 2F7CA 4X1BA 3T9HB 4N6PA 4GVOA 4YB7A 4YICA 3Q25A 3E9XA 1S9TA 3CFZA 2HCAA 1B5JA 5AE4A 4YKIA 2G29A 1R6ZA 3ILUB 4POXA 1MY1A 4YB6A 5HM4B 3G7WA 2DWHA 4NEDA 5I56B 4IO2A 4ZZAA 3KEIA 3RUMA 4AQ4A 2DXRA 1USYH 3PD8A 4P11A 1I6BA 1MXUA 2RC9A 1DMBA 2F6GA 4GOTA 2QSXA 2F6PA 1OIBA 4RJZA 5ISUA 1A7LA 2I48A 1OLCA 2GHAA 2VD2A 3F11A 4Z0IA 1B4HA 2O1MA 5H8FA 5I59A 1MY0A 3QYTA 4H67A 2DOJA 3TQWA 1BP5A 4FECA 4G2ZA 3G3FA 3MPKA 4LA9A 4ND9A 4EQ7A 2VGQA 3MC2A 1Y4CA 3MW0A 3UIFA 4F18A 1Y1ZA 2M8CA 5EHSA 1B5IA 3MWBA 1B6HA 3V8XB 5I2KA 5AA2A 3UP9A 1ZKBA 1POTA 3EQ1A 4NMYA 2I4CA 1A55A 3N94A 1M5BA 5DEXA 4FATA 2H98A 4NF5B 2UVHA 3FVOA 1D9YA 3ZSFA 2PT1A 1IXIA 3CVGA 3T9XB 4WXJA 3K6WA 4OEVA 4EQ9A 4N07A 3SEWA 5KDTA 2ZMBA 2XXYA 4R6KA 5CMCA 3PU5A 2H5YA 1MPBA 5AA4B 3TTKA 2AL5A 5L9MA 4PFUA 3Q27A 4DXCA 4ECFA 5ICQA 3VVEA 1RKMA 1B46A 1TXFA 4JBZA 4MLVA 4U4XA 1DPEA 1J1NA 4KYSA 3KN7A 1S50A 2I3VA 2O6AA 4OHNA 3RT8A 1QJMA 3VE1B 4ZDMA 3G3HA 2NXOA 3ZKKA 1N84A 2DE2A 2Z8DA 4H1XA 3MP1A 4G8NA 3TEPA 1PB9A 4KI0E 4DIGA 3S9LC 3L6HA 5FTIA 3K02A 3TELA 1MXZA 2OWTA 1DSNA 1SW1A 5KCJB 1TFDA 1NNTA 4X9TA 3QSLA 1H45A 2XXVA 3UGWA 1PBPA 4NWCA 3PMVA 1UTBA 3HHFA 1SW4A 3RN8A 4GLIA 3DP6A 5CMBA 2A5TB 4ZEDA 2OZZA 2A5SA 4H0WA 3H7MA 2ZYMA 3H6WA 3QUJA 1ATGA 2OJTA 3H4ZA 2H99A 3LBSA 3MPLA 5H8SA 2O84X 2IA4A 3GZGA 3HPIA 2YLNA 3O97A 3K1PA 2QS4A 3E13X 4L17A 4EXKA 3CG3A 2UVJA 4QSEA 5CBRA 1JW1A 2NOOA 1QW0A 2REGA 2VD3A 3C35A 3PUWE 4H8JA 1JW4A 2I3WA 5FHNA 3ZS6A 1VFDA 4IY6A 4YKJA 1VFEA 5I58B 2XX8A 4JSOA 4GF8A 3FVKA 2GH9A 2XX9A 4KYEA 1YTVA 2Z8EA 1T0KA 2RINA 3O6HA 1FQDA 1FQCA 4Q30B 1B40A 4KPTA 5B70A 4MBPA 3S9NC 3EHUA 3TFLA 3MUQA 4EXLA 4G68B 4EQBA 4JXIA 4F1VA 2ESNA 1B51A 4BDOA 2Y7KA 3PUYE 5LOMA 4LP2B 1FTLA 1AMFA 3VVFA 3W15C 4ELPA 1BLFA 4G8HA 1WDNA 2Q88A 3H6TA 2XXPA 5JTYB 1B7ZA 1MM6A 3PUZE 1QUJA 4F22A 5KZTA 5H8HB 5DYHA 1II5A 1R9LA 1Y9UA 1P1UA 1Z7ME 3H6VA 1UIUA 3H6UA 4XXUA 3MBPA 2O68A 1TWYA 3O28A 3EPEA 2OBGA 1ZIUA 1IXHA 1HSJA 4NF8B 1IITA 2I0CA 3FJ7A 3MZ1A 2Q8JA 2QMWA 4DXBA 4M1VA 4NF6A 3RPWA 4GRKA 1Q35A 5H8QA 1ELJA 1TT1A 4EUOA 4OFOA 4DDDA 4LZ7A 2ONRA 3PGFA 4I1DA 3V5AA 3JV9A 3TTLA 1MY3A 2Y7IA 1MQIA 5FTHA 4OWDA 3T9VA 3FJMA 4O3AA 4QFKA 2I0BA 4U2RA 3U1OA 2THIA 4LQ2A 1HSEA 1BTJA 4Q8RA 1GV8A 2I4BA 2R6GE 3QIMA 3TKDA 1IIWA 2B65A 1MQHA 4HTGA 2QRYA 2B3BA 2XXQA 4XIGQ 5I2NA 3RNNA 2QPQA 3OSRA 4E0WA 1FTKA 4F19A 1LAGE 2R9JA 4OMBA 1N7XA 3BBRA 2G93A 1DTGA 1RYXA 3VFJA 3CFLA 4P0GA 4RY1A 4BDRA 1GGGA 2F36A 4JWOA 1LBCA 4F2OA 2X7PA 3O6GA 2O51A 3LSFB 3TODA 1MQGA 3Q26A 3KSXA 2ZYKA 1B7UA 5CRYA 3VXCA 5JEIA 1JVXA 3EHSA 4F29A 3W9VA 3B6TA 3TQLA 3LSXA 2IEEA 4KCCA 4O3BA 2PVUA 3H03A 4BDLA 5CBSA 3HCQA 2OCUA 4DCYA 1MDQA 3CIJA 5TPAA 3CI8A 1D4NA 4PP0A 3TCGA 4KFQA 4F39A 1SDXA 3B6QA 3WAEA 1AH5A 4RK2A 2ZNSA 1MY4A 4RPNA 2ONSA 1FQFA 4R6HA 4PFWA 1RYOA 3R6UA 1N0TA 4OFJA 1QKAA 4Q0CA 4I8CA 1JNFA 3BFUA 2RCBA 4OENA 1IEJA 2RKMA 5I57B 2Q9TA 5DVIA 3E3KA 4OYVA 1P1WA 1PBQA 2H9BA 2V3UA 3FUZA 2BJJX 4KD5A 4BDQA 2AIXA 5L9OA 1MXXA 1M5FA 4F2QA 3QAXA 4E0XA 2DE4A 4IO6A 4LONB 1FTOA 3KG2A 3KOSA 4EF2A 2Z23A 4NWDA 3DLNA 3IB2A 4AB6A 1EU8A 1SYIA 1KWHA 4TLMB 4N13A 1HSLA 1ANFA 5J1DA 3CG1A 4OTEA 3JYRA 1ZLQA 3IX1A 1B7HA 4M4GA 1JW5A 3K2DA 4BDNA 4H5FA 4RA1A 3ILTB 1MXVA 3C4MA 4X1DA 4WEDA 3I5OA 3SKPA 4YMBA 2I6EA 3IOTA 4Q5TA 1D9VA 2UVIA 5H8NB 3FJGA 4G8MA 4LZ5A 5I56A 3M3KA 2QL3A 2DQVA 2PX1A 3FV1A 4U23A 1NH7A 1MH4A 4NTLA 4C1UA 4KR5A 4ESXA 4F31B 1FCKA 1LCTA 2F8DA 4H65A 1B5HA 3VVDA 1AIVA 1B0LA 1EZOA 2VOZA 1Y3PA 3SDFA 5K2XA 1UTHB 5DVJA 3S4UA 3W9WA 4R2FA 5CMMA 1DPPA 2GRVA 3LSWA 3OO8A 1FQBA 4ESWA 1H44A 3OO6A 3FV2A 3OXNA 3FD3A 4OETA 3OEKA 3LC8A 4OQOA 3G3IA 3MVWA 3IOUA 1SBPA 1B3LA 2P0SA 2F78A 5IAIA 2XD2A 1LAXA 3IORA 2XX7A 2Z22A 3UK4A 1QKBA 3C34A 4XKQA 2QJEA 2RF1A 3FVNA 1POY1 3A3CA 3ZKLA 3TTRA 1PDAA 4JDFA 1OLAA 1LAFE 1P1NA 2RCAA 1PC3A 3TPAA 2XXRA 1SVXB 1IUDA 1LB9A 4YKPA 1L5TA 4OERA 3DP4A 3O9PA 4FORA 4THIA 3T9UA 3WAFA 4NF5A 4LZ8A 4JB7A 1AL3A 2ZXTA 4R6YA 1H43A 1DOTA 3N26A 4IGTA 1JQFA 4PFTA 3TUSA 5HPQA 4OVJA 3PUXE 3RY3A 3FVGA 5JK4A 1MQJA 3A09A 3G3JA 2XXIA 1IZ1A 3EF7A 3N6TA 2E1SA 2FA7A 2V25A 3EHTA 5CM6A 5AA4A 3K6VA 1R1NA 2UVGA 4GWOA 1NL5A 2D21A 3OEMA 2E0SA 2XXXA 1WVJA 1PB8A 4GD5A 3TZAA 2Y7RA 5DT6A 3IJXB 4GL0A 4H6DA 1MPDA 2UXAA 3RTFB 2XXTA 4P0IA 2F35A 1OQHA 4DLDA 4NF4B 4QF9A 1B52A 4R73A 4UA8A 3T22A 3OELA 2AYSA 1PB7A 2OK2A 3S9EA 3UN6A 3IJOB 1OVTA 4ZECA 5KCJA 3GXAA 2DYXA 3MVXA 1B3HA 5DVFA 2XXWA 3C9HA 3PPRA 2GHBA 3PMXA 2A5TA 1WODA 3AXFA 3UA8A 4JWYA 2P1SA 2ZNTA 4GXAA 1N3XA 2H25A 4GFRA 3SEUA 1XOCA 2DS9A 3CSGA 3RT6B 3KOTA 2HZKA 1URSA 1NNFA 2NVUB 2F34A 1SW5A 1OMPA 4DZ1A 2HZLA 5AA2D 3I6VA 2AL4A 3ONMA 2XXUA 4IO7A 3PD9A 3N5LA 3MAMA 1EZPA 2DP8A 3SEYA 5I58A 3OO9A 4R72A 4LVQA 1IXGA 4RPOA 1O7TA 1PEBA 3PMWA 1NKXA 1B3FA 4YKKA 4YZZA 3SEXA 4UACA 1XVYA 4QFOA 3OO7A 4U4SA 1I69A 3IK6B 4GXSB 3FXRA 4GIZA 3MP8A 2LAOA 3M3LA 3IOWA 4G68A 3SESA 3EN3A 4YMAA 4EDPA 2Q2AA 2DWAA 1A40A 4GL8A 1XHYA 1EZ9A 1I6AA 1JEVA 2RC8A 3K1MA 1B1HA 1NNKA 3RTWB 3HO7A 5A5XB 4FEDA 2O1LA 4IGRA 3U92A 3OOAA 5CMKA 2F7AA 3DP8A 5JTYA 4HCYA 1B32A 3TDJA 4H8IA 5H8HA 4JSDA 2PT2A 3MZ9A 5HBCA 1B1XA 3IR1A 2XXHA 2CZLA 4ZE9A 3OMBA 1MS7A 1NMUA 2UYFA 2OLBA 4ZEIA 2DE3A 2PYYA 2X7QA 4NF8A 4ELQA 3R7XA 1M5CA 4G68C 3LR1A 1FW0A 3TTMA 3MVZA 2ALUA 3B6WA 5EYFA 3A3UA 3E4RA 3SETA 1NNPA 3SEVA 1US4A 2D3IA 3PPNA 4F3SA 2DWJA 2H4IA 1CB6A 3U72A 5L9SA 1XT8A 2OWSA 1GR2A 2Y84A 5I84A 4U22A 1DTZA 4FIMA 2X26A 3ODBA 2NWJA 1MRPA 4PFYA 2DVZA 3C32A 4EF1A 1F9BA 3KZGA 3H3GA 1LBBA 3C36A 5M2VA 5H8FB 5I59B 4ZZEA 2HAUA 3S2VA 4U1OA 1XC1A 1P1OA 4FAJA 1USYE 4HS7A 3K01A 4TLLB 4OXVA 5ITOA 1NH8A 2QS1A 3VDFA 3PUVE 4R2BA 2I58A 1BKAA 4FEBA 2I49A 5I2KB 1Y3QA 1SQYA 3D4CA 5AA2B 2Z8FA 4GQOA 3S9MC 3TMGA 1B4ZA 3DM0A 3IO4A 1VE4A 4G4PA 3TAJA 2VHAA 3V89B 1A8FA 4Z7EA 2F7BA 1O63A 3PV0E 1Y3NA 1LGBC 3ECRA 1IQ7A 5DEXB 3LUYA 2YPNA 1XS5A 1NFTA 1Y1MA 3HSTA 2ONKE 1LSTA 3P7IA 1A54A 1FQAA 1QULA 3GLBA 3QXMA 1MDP1 3D4GA 3IB0A 3UORA 1M5DA 4FJPA 3MQ9A 3FATA 1IXCA 5KDTB 3T93B 3K4UA 1B05A 1BIYA 1JVYA 1B9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4P56A 3TTNA 1EYIA 1LAHE 2QS3A 3FXUA 1FPDA 3GYYA 5EHMA 1YPNA 5I57A 2ABHA 1UQWA 3O29A 3O2AA 4JVDA 3IFAA 3KN8A 4DCXA 5LDZA 4YB5A 4HCWA 1FJ9A 1R9QA 4I40A 3IO6A 3R26A 2PCRA 4F3PA 1ZBMA 4KQPA 4QFPA 3D1RA 4XTCQ 3K6UA 1LFIA 2PMSA 3I3VA 4MLQA 4QRZA 1N76A 4XFEA 5IZ3B 3BKIB 2REJA 1YCJA 4POWA 4DE8A 1US5A 1B0HA 4PGNA 1NUXA 4G77A 2NUVA 1H3DA 1MG1A 3O6IA 4RK9A 1MH3A 1GVCA 2ANJA 1ZU0A 1B2HA 4WEPA 2V4CA 2QMXA 1UIVA 1URDA 1OQGA 1SYHA 1UTBB 1SD3A 5AA1A 3PPQA 1FQEA 5H8NA 3PPOA 2FIXA 4C0RA 4NX1A 4K3FA 4PETA 5AA3A 1Y4TA 2O7IA 3MP6A 4QSCA 3MJNA 4R75A 4OEUA 4RNSA 3QK6A 1IMDA 5CI5A 2B3FA 1YAEA 2V93A 1UTHA 3JZJA 1N3WA 3B7DA 3C33A 4X48A 2Y7WA 3BFTA 5BWJA 3BIGA 3MZBA 4TQUQ 5TP9B 3G3GA 5FHMA 1QUKA 1FTMA 1YZ0A 4ZE8A 4LN5A 2P3NA 5IKBA 4NE4A 1VSOA 4QHQA 3K0VA 2QS2A 1NV6A 4OANA 1YXIA 3B50A 4PQJA 5ET6A 5BUUA 4JWXA 2HQ0A 2DSFA 3KJTA 1JEUA 4XKPA 1MPCA 3VLVA 1MM7A 3TCHA 1QVSA 3L6GA 1A8EA 3KSJA 4FE8A 3OENA 4AS5A 4OVTA 4IO3A 2F97A 3PPPA 4KCDA 4O7IA 4F3GA 1H76A 1FPJA 2WBDA 1LCFA 4PE5B 1P1QA 1P99A 1QUIA 5B7DA 3DELB 4QFNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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