1WDNA

Glutamine-binding protein
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
223
structure length
223
Chain Sequence
KLVVATDTAFVPFEFKQGDLYVGFDVDLWAAIAKELKLDYELKPMDFSGIIPALQTKNVDLALAGITITDERKKAIDFSDGYYKSGLLVMVKANNNDVKSVKDLDGKVVAVKSGTGSVDYAKANIKTKDLRQFPNIDNAYMELGTNRADAVLHDTPNILYFIKTAGNGQFKAVGDSLEAQQYGIAFPKGSDELRDKVNGALKTLRENGTYNEIYKKWFGTEPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The structure of glutamine-binding protein complexed with glutamine at 1.94 A resolution: comparisons with other amino acid binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMINE BINDING PROTEIN
molecule tags Complex (binding protein/peptide)
total genus 74
structure length 223
sequence length 223
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wdnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wdnA01
2O1LA 4OWDA 4U21A 3THIA 1JQFA 3H6UA 2RCAA 1PC3A 4F3GA 2BJJX 5KDTB 2O6AA 2YPNA 1FQAA 4YB5A 1JEVA 4ND9A 2NXOA 2RC9A 3ONMA 4EUOA 1MPBA 2FYIA 4U4XA 3IK6B 5M2VA 1B05A 3G7WA 4U1ZA 3FVGA 2Z23A 4O3AA 1Y1ZA 2Q8JA 2H9BA 1QUIA 2QS3A 2O7IA 4EF1A 3G3FA 2QS1A 1IITA 4OZ9A 3TPAA 3PMVA 3OD7A 3O6IA 1IIWA 3TTNA 1VFDA 4F1UA 2V3TA 2FNCA 4H8JA 2DWAA 1POTA 2IEEA 2Y7PA 4BDMA 4NF6B 4ZEBA 3T66A 2Z22A 5I2NA 3P7IA 3FVOA 2UVGA 4NF5A 5H8NA 4PQJA 1QVSA 1XVYA 5ITPA 4KCCA 3O97A 3K6WA 4DXCA 1MXZA 1KWHA 3JYRA 3W9WA 1POY1 3G3GA 1B1HA 3KBRA 4F3BA 4LA9A 5I56A 1I6QA 5AA2B 4XKQA 2A5TA 5HPQA 3WAFA 4U23A 3B6QA 4JSOA 3DELB 1PEBA 3VV5A 3VLUA 3FJMA 4LZ8A 1XC1A 2Z8FA 4DCYA 4ZEFA 3S9MC 3VVEA 4HS7A 1HSEA 1S50A 3DLNA 3S2VA 5DVJA 1NNKA 3G3IA 3O9PA 3SETA 3B6TA 2ZNSA 4R6KA 4TQUQ 5CMKA 4GOTA 4H5GA 3FASA 4ELPA 2I4BA 3MVZA 4H1XA 3QK6A 4RK9A 4JDFA 4OEUA 2O69A 1B5JA 4JWXA 5H8FB 1JW4A 3PPQA 1MG1A 1LSTA 1B4HA 4QSEA 1D3KA 3LSXA 4X9TA 5K2YA 3OELA 3S9LC 4NF4B 2VGQA 5B70A 5H8QA 1XT8A 4N13A 5HBCA 3TCHA 3ILTB 3IB1A 1TFAA 3KG2A 5CI5A 4RY1A 3PGFA 1IEJA 1SVXB 3EQ1A 1IXIA 4O3BA 3PMXA 3E9XA 1M5BA 1EZ9A 5TPAB 4IO7A 3UIFA 4Q8RA 2QMXA 4YICA 5EHSA 2E0SA 3BBRA 2F5XA 4PFYA 3CVGA 5DEXA 1DTGA 3D4CA 1SW5A 4GWOA 2XXVA 2O51A 1FQDA 2XD2A 2I0CA 2GFEA 3I6VA 1PB7A 3K6XA 2X7PA 4HW8A 3K0VA 2F7CA 3OSQA 3S9EA 1VSOA 3GLBA 2GHAA 5ELVA 4EXKA 1A8FA 3QIMA 3OO7A 3IR1A 2VOZA 3G3HA 2YJPA 4G8NA 2F36A 1TFDA 4I1DA 4F19A 5IAIA 1IXGA 4R75A 3TYHA 3SKPA 5KDTA 1MY3A 3Q29A 1US4A 1N3WA 3HO7A 2F35A 4Z7EA 2V84A 4OFJA 2D21A 4F31B 1HSJA 3U92A 4OTEA 4U22A 2Q88A 3MVXA 4AQ4A 4DXBA 4GRKA 2OBGA 4NWDA 1ZU0A 4RK2A 3ECRA 3ODBA 5EYFA 2QRYA 3RTWB 3B7DA 3N6UA 4BDLA 5I2KB 3VLWA 4OENA 5H8HA 3QAXA 2NOOA 3PD8A 1CE2A 1LFIA 4H67A 1MXWA 4EQ9A 1OIBA 1P1NA 4EDPA 1SQYA 4OVJA 1OVTA 1SI1A 2AL5A 2O7UA 3MP6A 4QFOA 1BKAA 4QFNA 4NF6A 5L8DA 3N26A 4F1YA 2I58A 2LAOA 1XHYA 1YTVA 3UP9A 4QFLA 2H4IA 3IAZA 2F8DA 1ZKBA 3MBPA 4WEPA 5DT6A 2I49A 3CI8A 3MPLA 2WKYA 1VFEA 5BUUA 4JWOA 3C9HA 4XTCQ 1B3GA 2F6PA 4R6HA 3QYTA 1UIUA 4QFPA 2G29A 4O3CA 4OETA 4EF2A 4EXLA 4NEDA 2B3BA 3MZBA 4OHNA 4OFLA 3K1MA 2ONRA 1P1OA 1SBPA 3CR9A 1SD3A 3E4RA 4FIMA 2O84X 1ZBMA 4YKPA 1H76A 1R6ZA 3PU5A 3OO6A 4LVQA 3MWBA 4BLAA 4ZEIA 2REJA 4I8CA 2V25A 3IOWA 4H65A 2Y7WA 5KCJB 4OFOA 3RLFE 5AA1A 4G68C 2OZZA 3T9UA 2HAVA 3I3VA 4QRZA 1YCJA 4ELRA 3IO6A 3H7MA 3MC2A 3OXNA 2X26A 2G93A 2QMWA 3H6VA 3OEKA 3TCFA 2F6GA 1HSLA 1LBBA 1OVBA 3FUZA 2VD3A 4G8HA 5I58A 1I6BA 2Y7IA 3QUFA 1GR2A 3TFLA 3CFXA 3FVKA 4LQ2A 2UYFA 1PBPA 2XD3A 5I59B 4PP0A 2ZMBA 3C31A 4XKNA 1AH5A 3TCGA 4Z0IA 4ELQA 5KZTA 1SW4A 3T22A 4R73A 5DVIA 1EH3A 3LSLA 3USDA 3ZKKA 3PPNA 3U1OA 3ILUB 3T96B 3LC8A 2ALUA 4OMBA 1DPEA 1R1NA 4F18A 5IKBA 4HCWA 1RYOA 1JVXA 3CSBA 4ELOA 1MY1A 3A09A 2OJTA 5ITOA 2QS2A 1SDXA 3MPKA 5HM4B 4XKPA 1ATGA 4E0WA 1P1UA 3PUVE 4KHZE 1IZ1A 1A54A 3GZGA 2REGA 4GVOA 1FQCA 3KZGA 4BDNA 3C33A 3VXCA 2Z8DA 5CBRA 3U8QA 4G8MA 4R2BA 4F2OA 4JSDA 3PUWE 3PPOA 3Q26A 3SEYA 1A8EA 3VFJA 1I6AA 1FTOA 3H06B 3JZJA 3G3JA 1LCFA 3PPPA 3CSGA 3TTKA 1Z7ME 4PFUA 4OERA 4G77A 2QPQA 3KOTA 3RN8A 1D4NA 3TQLA 2GRVA 3C32A 3HN0A 1O64A 1QULA 4YU0A 4UACA 1NMUA 1D9YA 4Q30B 1N04A 2UVJA 1A55A 2ABHA 3O28A 1B3EA 3RQTA 4DIGA 1FTMA 2HEUA 2XXYA 1UTHB 1LGBC 2ESNA 3EF7A 3OSRA 1NH7A 4NF8A 3R26A 4MH5A 3TELA 1UQWA 3DM0A 3RY3A 5EHMA 2ANJA 3MVYA 2XX8A 1JW1A 1SYIA 3TKDA 2R6GE 1PB8A 1DSNA 3UORA 2Y84A 1JVYA 1UTBA 3TEPA 4QSCA 1B46A 1LFHA 1H43A 5JTYB 2DXYA 1URDA 3CG3A 3HCQA 3VLVA 3C4MA 3EHTA 4F1VA 4KR5A 4FECA 2D3IA 2OWSA 3MVWA 2RKMA 1PDAA 3Q25A 2UXAA 3N5LA 3K00A 3IB0A 1GGGA 2DQVA 1B7HA 5AA4A 2AL4A 1MXUA 3FATA 3T93B 1MH3A 2ZYKA 3FD3A 3C35A 1LAXA 3CIJA 3F11A 1QW0A 2Y7KA 5TP9B 1NNTA 2NUVA 4N07A 3M8UA 1Y9UA 3TTLA 1M5DA 3TDJA 5K2XA 3ZSFA 2ZYNA 3PMWA 2F97A 3HHFA 2VP1A 1NNFA 4EQ7A 3RT6B 5TU0A 1JETA 4M1VA 1OMPA 3FV2A 1USYH 1DOTA 5L9SA 5CMCA 1OQGA 1S9TA 1MM6A 5A5XB 4P11A 4U1OA 1PBQA 1ZJLA 5AE4A 4L17A 3IORA 2XXPA 5KCJA 4U4SA 1GV8A 2OK2A 4HCYA 2HQ0A 4DDDA 3O6HA 2QL3A 3SEWA 4GXSB 4KYEA 4DLDA 5I57A 3K4UA 1H45A 1FQBA 1JEUA 1JW5A 3HSTA 1ANFA 3H03A 3GXAA 3CRBA 4OYVA 1FQEA 4IO3A 3OEMA 1PB9A 1MRPA 2XXIA 3MP8A 3TUSA 1F9BA 1I69A 3RTFB 2QSXA 5CMMA 2XXUA 3FGSA 4ISUA 4AB6A 3FXQA 2XXQA 3VE1B 1RKMA 1MY2A 1B0HA 1FW0A 3V8XB 2XXTA 3LR1A 3H3GA 4OESA 1P1QA 2VHAA 3G3KA 4POXA 1YAEA 1VE4A 4UA8A 1UIVA 1QKBA 4R72A 1WODA 4XKRA 1B5HA 3H6TA 1MH4A 4IY6A 4K3FA 1IUDA 1LAHE 1M5CA 1IXHA 4H5FA 3IX1A 3HV1A 2P2AA 3BFTA 3PV0E 3EPEA 2V93A 2XX9A 1NKXA 2GH9A 3O2AA 4IO6A 1Y4CA 2W7YA 3SESA 2H25A 5FTHA 5I2NB 1B3HA 3IJXB 3KFMA 2CZLA 4NE4A 4NF5B 3K01A 3FXUA 3KJTA 2F78A 2FA7A 4KYDA 4JWYA 1P99A 1EZPA 2V3QA 3KN8A 5DVFA 3V83A 2I3WA 3S9NC 1MPCA 3HPIA 5I56B 2X7QA 3N6TA 3OMBA 2RF1A 2DSFA 4GIZA 4ZE9A 4GXAA 3EHUA 5CBSA 3FJ7A 2B3FA 1J1NA 4YB6A 1B7UA 2IA4A 1LLSA 4NTLA 1N76A 5BWJA 3SERA 5B7DA 1A7LA 5AA2D 1LBCA 3BFUA 4FJPA 1B51A 4IY5A 4XXUA 2I6EA 4TLMB 3EN3A 3VXBA 1AMFA 5CMBA 5AA2A 4YMAA 2PVUA 3QSLA 5ICTA 2F34A 4THIA 4R2FA 4AB5A 3C36A 1Q1KA 3UN6A 4BDRA 3QUJA 4YKJA 1LAGE 4FEBA 4QFKA 1T0KA 1XVXA 1OQHA 2OCUA 3L6HA 1B3FA 4G2ZA 4NMYA 3U93A 4XIGQ 5JTYA 3RPWA 2Q9TA 4R6YA 4F22A 2HZKA 4ZZAA 1DMBA 1EZOA 1B4ZA 3WAEA 1MQHA 3FVNA 3FV1A 1MM7A 1FQFA 3JV9A 3DP8A 2F7BA 1ZTYA 3GBBA 3E13X 2DVCA 1XOCA 3VVFA 1FCKA 3GBAA 3BKIB 5H8FA 4QSDA 2HAUA 1Y3NA 1TT1A 4RYAA 3S4UA 1B5IA 2DP8A 4NF4A 1MDQA 2KLFA 1B52A 3MW0A 1QJMA 4R74A 3FZVA 2I4CA 4GL8A 1A40A 1II5A 4ZEDA 2ZYMA 3RGYA 2DYXA 1OLAA 2UVHA 3QXMA 3O66A 1Y3PA 5TPAA 2Q2AA 1TXFA 1QKAA 2XX7A 4KCDA 4ZE8A 2DWJA 2AYSA 3KN3A 4RPNA 4EQBA 2XXRA 3FJGA 2DS9A 1MY4A 1B0LA 2QS4A 4GQOA 4OQOA 3LUYA 3RNNA 4F3PA 4C1UA 3V89B 4GF8A 3SEVA 5L9OA 2XHDA 4YAHX 2ZNUA 3MJNA 3UA8A 1FTKA 4FEDA 2Q2CA 4IO2A 2VD2A 3OENA 2PX1A 4HTGA 4ZEKA 4E0XA 1Y4TA 4ESWA 4ZS9A 3MP1A 4OXVA 3KN7A 5FHMA 2H5YA 4X48A 4F2QA 2Z8EA 4PFTA 1NFTA 2HXWA 1N0TA 2RC7A 4MLVA 3MUQA 4I62A 3RUMA 1QUJA 4P0IA 3K6UA 1M5FA 4RNSA 4P0GA 1OLCA 4C1TA 2P0SA 2I3VA 4H6DA 3Q28A 5H8HB 4RJZA 4MF3A 2UYEA 4NWCA 1D9VA 4BDOA 4X1BA 1TWYA 4YB7A 3V5AA 1IXCA 2NVUB 2PMSA 4POWA 1M5EA 4F39A 1AIVA 1QUKA 1N3XA 2XXWA 2GHBA 1FTLA 4H8IA 1SW1A 2DE3A 3U72A 4F29A 5ICQA 2H98A 5I2KA 3IOTA 4I9DA 4KPTA 5DYHA 3ZKLA 1AL3A 3UK4A 2P1SA 5I84A 4JB7A 2OWTA 3KSXA 2DE4A 3K1NA 3T9XB 4PETA 2B65A 1LCTA 1N7WA 2ZXTA 5DTBA 2RC8A 4G4PA 4IGTA 1URGA 3PPRA 1EU8A 3KJ7A 4KI0E 4YKKA 3M3LA 4IO4A 1MQDA 4KFQA 3TAJA 2DE2A 1XS5A 2OLBA 1MPDA 4YKIA 1O63A 2RCBA 1NH8A 3O29A 2THIA 1Z7NE 2Y7RA 3K6VA 2PT2A 3ZS6A 4YMBA 2Q89A 4DXUA 4R9FA 1B58A 1MS7A 3TODA 1YPNA 1ZMGA 2HZLA 1B2HA 5FTIA 1B3LA 4LP2B 3TTMA 3IL1B 1B9JA 4WKMA 3C34A 4Q0CA 3R7XA 3IO4A 3H6WA 1MQIA 5CRYA 3KSJA 1LAFE 1WVJA 3IOVA 1IQ7A 2F7AA 2DVZA 4FATA 2V3UA 5FHNA 5I58B 4G68B 3A3UA 2E1SA 3H4ZA 1CB6A 2PBWA 1SW2A 1N84A 3MQ9A 1DTZA 4QF9A 3EHSA 4RPOA 3MZ1A 3OOAA 1Q35A 2HFBA 2DWIA 2DOJA 1Y1MA 3W15C 2M8CA 4JBZA 3LSFB 2ONKE 5CC2A 4YZZA 3PUYE 1AOVA 2DWHA 1B6HA 2QJEA 1US5A 2ZNTA 3SEXA 1S7YA 3VDFA 1L5TA 3O6GA 3M3KA 4BDQA 3RT8A 1Y20A 4Q5TA 4RXLA 5I59A 4KD5A 1MQGA 3TQWA 4MLQA 4PE5B 4LUBA 1MDP1 3MZ9A 2AIXA 4QHQA 4MBPA 3SEUA 1A99A 4MFIA 4C0RA 2D5WA 3IJOB 1DPPA 4IGRA 4FE8A 3T9HB 2CMOA 2XXXA 4ESXA 4KQPA 5F7VA 5LOMA 4U2RA 4PFWA 2O68A 4TOZA 1SI0A 4RA1A 3KOSA 4TLLB 3PD9A 4LONB 5JK4A 4ECFA 4GFRA 1LB8A 3IOUA 1B7ZA 4WXJA 3PUZE 3MAMA 4LZ5A 1BLFA 4KYSA 3TTRA 5H8NB 3OO9A 4ONYA 2I48A 3L6GA 1B40A 1MXYA 2UVIA 1MQJA 2DXRA 3M3FA 1B32A 5CM6A 4H0WA 2HCAA 4R9GA 4NF8B 2I0BA 2A5TB 1URSA 1BP5A 1O7TA 3K2DA 4ZECA 4OEVA 3K02A 4DCXA 2H99A 2ZYOA 4FORA 2A5SA 2XXHA 3T9VA 5J1DA 4ZDMA 3FIRA 3W9VA 2PYYA 3CFZA 3A3CA 1UTBB 5FHOA 5F1QA 4LZ7A 3OO8A 1NL5A 4GD5A 1LB9A 3DP4A 2R71A 3KEIA 1ZLQA 1UTHA 1P1WA 2O1MA 3HHGA 4F3SA 1MXXA 2PT1A 3PUXE 2R9JA 1ELJA 5AA4B 4LATA 1SYHA 5AA3A 3Q27A 1WDNA 1H3DA 4DE8A 4ZZEA 1USYE 1FTJA 4IB2A 3U94A 1N7XA 5ISUA 1MXVA 3AXFA 4N6PA 1R9QA 3B6WA 1GVCA 3IB2A 5H8QB 3N94A 4FAJA 3LBSA 4WEDA 3UGWA 4DZ1A 1R9LA 2NWJA 3E3KA 5TP9A 2RINA 1VR5A 3K1PA 1H44A 1RYXA 3DP6A 5JEIA 1BIYA 3D4GA 2YLNA 5DEXB 5I57B 3KGCA 1ZIUA 3LSWA 4LQ5A 4M4GA 1JNFA 3SDFA 5H8SA 1GTKA 5A5XA 4G68A 1NNPA 4X1DA 4GLIA 5L9MA 1MY0A 3TZAA 1Y3QA 3R6UA 4IO5A 3I5OA 1BTJA 1LFGA 3VVDA 3FXRA 3TMGA 2ONSA 4GL0A 3CG1A 4JXIA 1B1XA 3CFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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