1XVYA

Crystal structure of iron-free serratia marcescens sfua
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
GIVIYNAQHENLVKSWVDGFTKDTGIKVTLRNGGDSELGNQLVQEGSASPADVFLTENSPAMVLVDNAKLFAPLDAATLAQVEPQYRPSHGRWIGIAARSTVFVYNPAKLSDAQLPKSLLDLAKPEWKGRWAASPSGADFQAIVSALLELKGEKATLAWLKAMKTNFTAYKGNSTVMKAVNAGQVDSGVIYHYYPFVDGAKTGENSNNIKLYYFKHQDPGAFVSISGGGVLASSKHQQQAQAFIKWITGKQGQEILRTNNAFEYAVGVGAASNPKLVPLKDLDAPKVDAAQLNSKKVVELMTEAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Anion-independent Iron Coordination by Members of a Third Class of Bacterial Periplasmic Ferric Ion-binding Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords sfuA
molecule tags Iron binding protein
source organism Yersinia enterocolitica
total genus 109
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA02
2V25A 4IO5A 2Q2AA 2P2AA 3DP8A 3HHGA 4NWCA 4GIZA 4U1OA 5KCJA 1NKXA 3DP6A 4IO7A 1N04A 1B3FA 1QUKA 2O7UA 1QULA 1ANFA 4I9DA 1URGA 4X1DA 1B32A 5CBSA 3T9VA 4G4PA 3JV9A 1SBPA 1MG1A 1SYIA 2ESNA 3VLWA 3KJTA 5I84A 4ZEBA 5H8NB 3QAXA 1M5BA 3ZKKA 3PMVA 3QYTA 5ISUA 1N0TA 1LFIA 4OENA 4NF8A 4MH5A 5H8SA 3G3JA 4YU0A 1LBBA 2BJJX 3KSXA 1MPCA 3QUFA 4LQ5A 1MPDA 4R9GA 1AMFA 1DPPA 2PMSA 2O51A 4F29A 4XKPA 1BTJA 2HAUA 2DYXA 4H5FA 3N6TA 4FEBA 3HV1A 3AXFA 1N84A 3U72A 2RKMA 3TZAA 1LCTA 4FECA 1EZ9A 4LP2B 1VSOA 4RJZA 3PPNA 1NNPA 1WODA 5EHSA 3WAEA 3GXAA 3MWBA 3VXCA 1B0LA 2OJTA 4AB6A 4C0RA 1R1NA 2F78A 3KSJA 1H43A 4NF6B 1LAGE 1J1NA 3G3KA 4KYEA 4GL8A 3RN8A 3E4RA 3EF7A 3IJXB 2ZNTA 3N5LA 2ANJA 3K00A 2I48A 4JBZA 4U4XA 3KN8A 4RPNA 3S9LC 3ODBA 5L9MA 3A3CA 3UIFA 4PFTA 1YTVA 1HSEA 2PT1A 2DE3A 3KN3A 4I8CA 5I56B 1FTLA 5CRYA 1POY1 1SYHA 4GFRA 1LAHE 1EU8A 4F1YA 4G8NA 1JEUA 4IO2A 4R75A 4P0GA 1MXXA 1AIVA 4EF2A 5AA3A 4DE8A 1QW0A 3FJGA 1HSJA 3E9XA 4G68A 4FORA 4Z7EA 5B7DA 3K6VA 2F7CA 3TQLA 4ZEFA 2ZXTA 4YKJA 5L9SA 5I2NA 5TP9A 4ESWA 2Y7PA 3I3VA 1UTBA 3O6GA 3EN3A 2I58A 1IITA 3BBRA 4F2QA 4YICA 3K2DA 1XT8A 5DVJA 3GBBA 4WEPA 1NL5A 4EQ9A 1FTMA 3RT6B 5H8FA 1PB8A 3MJNA 5I58B 3V89B 3N6UA 1S50A 2HEUA 1JVXA 4QSEA 4EDPA 4BDRA 1TXFA 3S9MC 1URDA 4IY5A 1B5IA 1WDNA 3IOVA 4XIGQ 3VVFA 1IXHA 1B2HA 5CMBA 5CMCA 2QS2A 4ELQA 5ITOA 2GH9A 3BFTA 3CFXA 2H98A 3TFLA 4GD5A 4OVJA 3LUYA 4EF1A 5AA4A 5JK4A 3RPWA 3H4ZA 2Z23A 1XOCA 4KI0E 1SW4A 4GQOA 3FXRA 3C32A 4FATA 2A5TB 1ZIUA 4GOTA 4OWDA 4F39A 5CI5A 3B6WA 3R7XA 4HCWA 1BP5A 2H4IA 5KZTA 3O29A 3B7DA 4ZE8A 2ALUA 1F9BA 1D9VA 2DVZA 3H06B 3IORA 1O64A 2XXQA 3HN0A 3PPQA 1LAFE 5AA2A 4NF5B 5A5XA 1MXWA 3F11A 3IB2A 2ABHA 2GRVA 4XTCQ 3KOSA 1RKMA 1IXCA 2XXXA 2DVCA 3MVXA 3GZGA 2F97A 4ZECA 4MBPA 3MZ1A 2X7PA 2XXUA 3EHSA 5H8HB 3IOWA 3DM0A 1OVTA 2Y7WA 2DXRA 1OQGA 5ICQA 2XXIA 4L17A 3TELA 4FJPA 4QHQA 3FXQA 4C1UA 1FQDA 3U94A 1Y4TA 2PBWA 1USYH 2H9BA 4E0XA 2OBGA 2B65A 4ELPA 1D9YA 3T66A 4Z0IA 1ZBMA 3SEWA 3MBPA 4H6DA 3JZJA 4F1VA 4N07A 3VV5A 3K6WA 4BDQA 4ELOA 4F1UA 2Y7RA 3OOAA 4ZDMA 3MVYA 1VFDA 1P1UA 2I4BA 2Z8FA 2ZMBA 3QUJA 3TODA 1US5A 3KBRA 5FHNA 1MQHA 3I5OA 1MRPA 2AL4A 3UN6A 3K6XA 3CR9A 1O7TA 3PUYE 1SQYA 1MQGA 1HSLA 1II5A 2F5XA 1GTKA 5CBRA 3PMXA 5CMKA 4IB2A 1H44A 4O3CA 5FHMA 3SKPA 4KPTA 3O97A 4G2ZA 3FD3A 3PUVE 2DXYA 3RTFB 4OESA 4H0WA 3OO9A 1Y1ZA 3LBSA 1MY4A 1Y3NA 1B3EA 4BLAA 4EXKA 1OMPA 1M5DA 1NFTA 2DSFA 4PQJA 3H3GA 1URSA 1BLFA 4FAJA 2DE4A 4RY1A 2A5SA 5I57B 1PC3A 1FW0A 2QPQA 5H8NA 5M2VA 1QKAA 1VFEA 4JWXA 1H3DA 1NNKA 2HQ0A 4LQ2A 3IK6B 2CMOA 3G3HA 3IX1A 4R2FA 4F3PA 1UQWA 4F3GA 2D3IA 4QF9A 1Z7NE 1LGBC 4HS7A 2O69A 1TFDA 3FJMA 1FTKA 1B7ZA 1FTJA 2R9JA 1JETA 3TPAA 5IAIA 1DOTA 4LZ7A 1FTOA 1GR2A 5FHOA 5J1DA 5JEIA 1VR5A 1M5EA 4EQBA 3RGYA 2VP1A 1AL3A 1UIUA 2IEEA 3C4MA 3UORA 4GXAA 4N6PA 4PFUA 3TCHA 4KYDA 4F2OA 2ZYKA 1XVXA 3ILTB 3TCFA 4QFOA 2PYYA 3MQ9A 1XHYA 2F6GA 3FASA 2NXOA 3U1OA 2I0BA 4NF6A 4KHZE 3VDFA 3VVEA 1KWHA 2VD2A 4H67A 2DWJA 3FZVA 2VHAA 4DXCA 3HPIA 1A8FA 4GF8A 4PP0A 3OEKA 2PX1A 4F31B 4LATA 3C33A 5HM4B 4IGTA 1IXIA 2HCAA 4X9TA 3MUQA 1XC1A 3OELA 1PB9A 1OLAA 5I56A 2Q8JA 1AH5A 4QFPA 1B0HA 4Q0CA 3FVOA 1UIVA 3K02A 1GV8A 2H25A 2QS4A 3CSBA 1AOVA 3IB0A 3B6TA 2F35A 1MDP1 4AB5A 1SDXA 4YKIA 2H5YA 2YJPA 2RC9A 5EHMA 3RLFE 4PFYA 3N94A 5K2YA 3BFUA 1PDAA 2IA4A 1I69A 2M8CA 5TU0A 2LAOA 1Y9UA 1DTGA 3MAMA 4OFLA 4WEDA 3DELB 4QSCA 1A99A 1B7HA 4X48A 5ELVA 1MM6A 4THIA 3S9EA 4YMBA 3K01A 4JXIA 3HSTA 5I58A 1B46A 2QJEA 2V84A 1B4ZA 3PV0E 2V3UA 2O1LA 3K6UA 5AA2D 2REJA 1YPNA 2XXPA 1YCJA 2DOJA 2HZKA 1M5CA 1R9LA 3ONMA 4Q30B 3IO6A 4NF4B 2O1MA 3K4UA 1TWYA 3TTLA 1OIBA 4R6YA 4KR5A 1GGGA 4RXLA 4FE8A 3OSQA 3O28A 4QFNA 4Q8RA 2ONSA 5CMMA 2A5TA 1MH4A 4F3BA 3G3FA 1D4NA 1BIYA 4NF8B 3FVKA 5DEXA 2H99A 1MY1A 2XXYA 2O68A 1D3KA 3SESA 4UA8A 2WKYA 3SERA 4WKMA 1SI1A 4DCXA 1TFAA 4G8HA 2F34A 3ZS6A 4NF5A 3O66A 3FV2A 4U23A 2ONKE 2Y84A 3KGCA 2Y7KA 3GLBA 4WXJA 1OQHA 2FA7A 4LZ5A 4TLMB 1IQ7A 1NNFA 4YB5A 4K3FA 3S9NC 2AL5A 2OCUA 2QS1A 4G77A 3W15C 2O7IA 5FTHA 4I62A 3PD8A 2DE2A 3TTRA 3TAJA 2ZYOA 4O3AA 4ESXA 3M3FA 1DTZA 1A54A 3UA8A 4U1ZA 1P1OA 3U92A 4F19A 3SETA 5I2KB 3THIA 2REGA 3O9PA 3PPOA 1QVSA 2ZYMA 5HPQA 3OENA 4OXVA 2OWTA 2QL3A 1MXVA 4U4SA 3LSFB 3MVZA 2XD3A 2XXWA 3KOTA 5EYFA 1N3WA 2D5WA 3ZSFA 2ZYNA 1FQAA 5LOMA 4ECFA 3RTWB 5JTYB 3RQTA 4KFQA 3T96B 2RCAA 3UK4A 1DSNA 2NVUB 2OK2A 5L9OA 4OFJA 4KD5A 1B3LA 3KJ7A 3C34A 1US4A 2HXWA 5IKBA 4G8MA 1T0KA 1H45A 4R73A 3PPPA 1Y20A 3WAFA 2NUVA 5TP9B 3A09A 1IXGA 3EPEA 3HHFA 1SW2A 1NNTA 3MP8A 2DWAA 4OETA 3C36A 1NMUA 2HZLA 4ZE9A 3C35A 1I6BA 2PVUA 1B3HA 2X7QA 3CFLA 1FQEA 1MM7A 2DQVA 2X26A 3CRBA 4TOZA 1IIWA 4P0IA 4BDOA 1RYXA 1I6AA 2HAVA 3H7MA 2VOZA 3KN7A 1DPEA 1M5FA 2ZNUA 3MVWA 4GVOA 1SW1A 3U93A 3C31A 3O6IA 4R74A 4HW8A 3TTMA 3CG1A 1POTA 3TTNA 4LA9A 4DXUA 2V3QA 3QXMA 2ZNSA 3V83A 2NWJA 5KDTB 2F7AA 1OVBA 1JW4A 3R6UA 3VLVA 1IUDA 3L6HA 4H5GA 3VXBA 1MY2A 1LLSA 5DVIA 4C1TA 5A5XB 4XKQA 1N7XA 4RYAA 2AIXA 3OO6A 3IAZA 1CB6A 1MDQA 2XD2A 3RT8A 1S9TA 3OSRA 4G68C 3U8QA 4Q5TA 3MP1A 5L8DA 1Z7ME 1MY0A 2UYEA 1ZJLA 4O3BA 4EXLA 3KFMA 2XXTA 3DP4A 2P0SA 2Q89A 1A55A 1ZU0A 4LUBA 4BDMA 3TUSA 3FATA 4QSDA 4YMAA 1JW5A 1B5JA 3SDFA 2UVGA 2YLNA 3KZGA 5DTBA 3T22A 1MY3A 2F8DA 2PT2A 4DXBA 1EZOA 3PU5A 2NOOA 1P1NA 1SI0A 2O84X 3LSXA 2UVIA 3S4UA 4XKRA 3EHUA 3DLNA 3FGSA 2Q9TA 4OEUA 1UTHB 4DCYA 4OFOA 3IO4A 2QS3A 4NEDA 2OZZA 4TLLB 3FIRA 3QIMA 1NH8A 5AE4A 5HBCA 3TYHA 2Q2CA 2HFBA 1O63A 2I3VA 2XX7A 5CC2A 3V8XB 4ZS9A 1SD3A 1A7LA 1MXZA 3G7WA 1SVXB 5DYHA 4P11A 5FTIA 4KQPA 4LZ8A 4GWOA 1N3XA 1PEBA 3OXNA 2F7BA 3PMWA 3CSGA 1QUIA 1LBCA 3BKIB 3IL1B 2F6PA 1MPBA 5CM6A 1PBPA 1LB9A 4E0WA 1MQIA 1Y3PA 2XXRA 4F18A 2KLFA 4NF4A 3IJOB 4OQOA 3JYRA 3CG3A 3FV1A 3S2VA 1MXYA 3OD7A 3H6UA 4FIMA 1QKBA 1EH3A 4MF3A 3SEXA 4X1BA 4IO3A 1ZLQA 1LAXA 1H76A 1JQFA 1B6HA 5I59B 5BUUA 1BKAA 4M1VA 4F22A 4HCYA 4YKKA 3VLUA 3MP6A 2W7YA 3HO7A 2E1SA 1B40A 2DP8A 4QFKA 5ITPA 3K1PA 4OTEA 2V3TA 3Q28A 1JNFA 5DT6A 4YZZA 4POWA 1JW1A 1FQCA 2V93A 3R26A 2F36A 4UACA 3W9VA 4YB6A 3IOUA 5H8QB 3O2AA 3TKDA 2QRYA 1B7UA 1B3GA 1A40A 1YAEA 1I6QA 4NTLA 1B05A 4ZZEA 3OEMA 4R2BA 4DLDA 3D4GA 4DZ1A 3FXUA 5TPAB 1CE2A 2P1SA 2DWHA 3T9HB 4ZEKA 1B52A 1PB7A 2YPNA 1Q35A 1Q1KA 4GLIA 1XS5A 2G93A 4R6KA 3OMBA 4M4GA 2RC8A 5KCJB 3IR1A 1MXUA 3KEIA 5I2KA 4NE4A 4KCDA 2UVHA 3M8UA 3OO7A 2XHDA 4U21A 4LVQA 1B1HA 3SEVA 2RINA 3ECRA 1B58A 2I3WA 4ZZAA 1SW5A 1R6ZA 4RPOA 1P99A 3V5AA 1MH3A 5JTYA 1LB8A 4ONYA 1P1QA 3LR1A 3M3KA 3MZBA 2Q88A 2O6AA 3IOTA 4YKPA 4BDLA 4I1DA 4IGRA 4JSOA 3PUWE 3G3IA 4U2RA 3H6TA 3L6GA 1DMBA 4MLVA 4OHNA 3N26A 2UYFA 1IEJA 4NWDA 4GRKA 1N7WA 3E13X 1Y4CA 3H6VA 1MQDA 2RF1A 4JDFA 4JWOA 1MS7A 2XXVA 3QSLA 4POXA 5H8HA 2QMXA 3CVGA 2OWSA 3D4CA 3FVNA 5BWJA 3M3LA 1FQBA 1NH7A 1USYE 1B4HA 5F7VA 3C9HA 3VVDA 3MZ9A 4ZEDA 4PE5B 3LC8A 1TT1A 1XVYA 2Z8EA 3PUZE 1JEVA 2DS9A 3I6VA 1S7YA 1MQJA 3MPKA 1WVJA 1EZPA 4OERA 1ZKBA 3LSLA 3MC2A 1FQFA 4EUOA 1ATGA 4XKNA 4DIGA 2G29A 3TCGA 4KYSA 2XX8A 1R9QA 4RK9A 1L5TA 1P1WA 2FNCA 4H8JA 5ICTA 2UXAA 3KG2A 4ISUA 4NMYA 1FCKA 3HCQA 5KDTA 1Y3QA 3K1NA 1A8EA 4GXSB 4G68B 3O6HA 5DEXB 5DVFA 3PUXE 5I2NB 4HTGA 3VE1B 3SEYA 1ZTYA 1B1XA 3K0VA 2B3BA 3H6WA 5K2XA 4OZ9A 1UTBB 2RC7A 4GL0A 2XX9A 3FUZA 4TQUQ 4R72A 2GFEA 2ONRA 3USDA 1ZMGA 2Y7IA 3T9XB 3QK6A 1QJMA 4RK2A 4MFIA 3FVGA 4JWYA 2GHBA 5H8FB 3PD9A 4PFWA 3P7IA 3VFJA 3TTKA 2XXHA 3LSWA 3MPLA 2QSXA 4ZEIA 4OYVA 4LONB 3W9WA 5I57A 5F1QA 1QUJA 4H65A 2I4CA 1VE4A 4RA1A 1Y1MA 4ND9A 2I6EA 2B3FA 3RNNA 1GVCA 3TQWA 5AA4B 2E0SA 4U22A 2RCBA 4PETA 1B51A 3Q27A 5B70A 2I49A 2R6GE 2DWIA 3CFZA 2Z8DA 4DDDA 1UTHA 3A3UA 3EQ1A 4MLQA 2VGQA 3B6QA 3GBAA 3H03A 2VD3A 3Q25A 5AA1A 3FJ7A 4XXUA 3MW0A 3ZKLA 4H1XA 1LFGA 4IO4A 3EHTA 5AA2B 3TMGA 3PGFA 4QRZA 1LCFA 4YAHX 4H8IA 3RY3A 3OO8A 3E3KA 4EQ7A 2OLBA 2AYSA 4KCCA 4R6HA 4R9FA 2Z22A 1B9JA 3Q26A 3T93B 4OMBA 1LFHA 3TDJA 3ILUB 3T9UA 3UGWA 3UP9A 1RYOA 4AQ4A 3IB1A 4IO6A 2THIA 5I59A 4QFLA 4OEVA 3Q29A 4IY6A 1PBQA 4FEDA 3SEUA 3CI8A 3G3GA 3TEPA 4RNSA 4BDNA 3PPRA 1B5HA 2GHAA 2CZLA 1N76A 1LSTA 5H8QA 3CIJA 2FYIA 2I0CA 4JSDA 4N13A 1JVYA 4ELRA 4F3SA 2D21A 1OLCA 4YB7A 1ELJA 1IZ1A 2UVJA 2QMWA 4JB7A 3K1MA 2R71A 3RUMA 5TPAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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