1Z7NE

Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
204
structure length
203
Chain Sequence
MIKIAITKGRIQKQVTKLLENADYDVEPILLGRELQIKTKDDLQIIFGKPNDVITFLEHGIVDIGFVGKDTLDENDFDDYYELLYLKIGQCIFALASYPDFSNKNFQRHKRIASKYPRVTKKYFAQKQEDIEIIKLEGSVELGPVVGLADAIVDIVETGNTLSANGLEVIEKISDISTRMIVNKSSFKFKKDKIIEMVERLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Activation of the hetero-octameric ATP phosphoribosyl transferase through subunit interface rearrangement by a tRNA synthetase paralog.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit
molecule tags Transferase
source organism Lactococcus lactis
total genus 56
structure length 203
sequence length 204
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE02
3IORA 1A55A 1QUIA 1B46A 3S9NC 3IB1A 4ESXA 3V5AA 4GOTA 3VXBA 4H5FA 5K2XA 3TUSA 4FECA 3B6TA 4H0WA 2B65A 3KZGA 5KZTA 1B51A 3SEUA 3TZAA 5LOMA 2I0BA 4X9TA 4YKPA 3TTRA 1NNFA 2QRYA 2CZLA 2QSXA 4FATA 4YB6A 3UK4A 3C32A 1LGBC 4FAJA 1SDXA 3KN3A 2HFBA 4NF8A 3EPEA 4G2ZA 3SETA 3MPLA 4GQOA 3C9HA 3MVZA 1Y4CA 1R6ZA 4N13A 2V84A 3D4CA 1BTJA 1MQHA 2UYFA 2YLNA 2F36A 1A99A 1S7YA 1FQFA 3C31A 4MLQA 4NF6A 4KHZE 1I6AA 1JQFA 4L17A 4OHNA 2P1SA 2I58A 4FORA 3K6XA 3K1NA 1YAEA 4R2FA 4R6HA 5A5XB 4WEDA 1TFDA 3TTKA 4KI0E 3FJGA 3HSTA 1B3HA 1LAHE 4I62A 4AB5A 4KD5A 1ZBMA 3RN8A 4R72A 2PT2A 4GXSB 4EQBA 4C0RA 4P0GA 4DLDA 4RXLA 3ECRA 5M2VA 3T9VA 3S4UA 1B3FA 4OXVA 5ITPA 1DSNA 5I2NA 1HSLA 5H8FB 5DT6A 1PB9A 4I8CA 4ZDMA 1B7UA 2A5SA 4U4SA 3PPNA 3A09A 3M8UA 3FJ7A 3KG2A 2P0SA 2RCAA 3F11A 3V8XB 1P1UA 2H25A 1F9BA 1IITA 4AQ4A 1UTBA 3JV9A 2V93A 4UACA 4H67A 3SDFA 2F6GA 1H44A 3M3FA 4OFOA 1JEUA 3LSWA 5CMCA 4I9DA 1EZ9A 1SW4A 5H8HB 4OZ9A 1I6BA 2OWSA 3PPQA 1LCTA 3E13X 5KDTA 2Q89A 1ZJLA 4EXKA 3ILUB 4NF8B 1GVCA 1QKAA 5KCJA 2NVUB 4EQ9A 3VVEA 2V3UA 4QFKA 3C4MA 1MY4A 4EDPA 3OXNA 4QRZA 1UIUA 3ZKKA 4NF6B 5AA1A 4POXA 1BKAA 4ELOA 2F97A 4HTGA 1QJMA 2DVCA 2RKMA 1FCKA 3LSFB 2O68A 1XVYA 1NMUA 3TYHA 1GV8A 4P11A 1M5CA 2DSFA 1JW5A 1URGA 4GXAA 1WDNA 2Y84A 4F1YA 4G4PA 4ELRA 3DM0A 3IB0A 4ONYA 1BP5A 3G3HA 1R1NA 2Z23A 2FA7A 2H9BA 3THIA 3SEWA 3H6UA 4YU0A 4I1DA 3E4RA 1B52A 1MXXA 3MQ9A 4XKRA 4GIZA 1A40A 3T9HB 4K3FA 4H6DA 3P7IA 2HZKA 5DEXA 4O3AA 5I2NB 2XD3A 1RYOA 2Z8DA 3QYTA 2Q8JA 4FEBA 2BJJX 4KYDA 5CM6A 4LZ7A 4G8NA 3VLWA 4IO2A 3G3KA 3IO4A 2AIXA 3TELA 1FTKA 1OIBA 3ONMA 4ZZEA 1Y9UA 1UTBB 1CE2A 3TQLA 3EF7A 2ZYKA 2Y7IA 1OQHA 2XHDA 2ONRA 3B7DA 1IXHA 2F8DA 2DYXA 3RY3A 1VSOA 3PU5A 3N6TA 2REGA 4MLVA 2PYYA 2F7AA 3H6VA 3EHSA 2H99A 4LATA 4LA9A 5TP9A 3O6IA 3V89B 3FVNA 1ZTYA 5KCJB 4NWCA 3Q29A 4KPTA 2DQVA 1ATGA 5B70A 5CMBA 3VVDA 1Q1KA 4F3BA 1DOTA 1B4HA 1T0KA 4NF5A 5L8DA 3CG3A 1MXUA 4RJZA 2XXYA 4LZ5A 5B7DA 4F3SA 1II5A 3CR9A 5L9SA 4NTLA 2V25A 4R75A 1JVYA 3CVGA 2XXUA 3H4ZA 4OTEA 1B0HA 3B6QA 4BDRA 3TQWA 1HSJA 2RINA 3Q28A 4G8MA 3K6VA 3GLBA 2NOOA 2IEEA 4EXLA 4GF8A 4DXCA 2ALUA 2GHBA 2VOZA 3H03A 2CMOA 4U4XA 4ZECA 1SBPA 2RC7A 1RYXA 2UYEA 5ELVA 3K1PA 4M1VA 3RNNA 4R6KA 4KYSA 3WAEA 5DEXB 3PMVA 4XXUA 4F1UA 3K2DA 3CFZA 4ZE9A 3K0VA 3LSXA 1B3LA 1OQGA 2GHAA 3MBPA 1MY3A 5TU0A 2QJEA 4DCYA 4HW8A 1CB6A 4G68C 4YICA 4YMBA 1A54A 4ZS9A 1AL3A 3OSQA 4ECFA 1MQGA 3GZGA 2XX8A 4ZEKA 3TTLA 1MY0A 1QUKA 2X7QA 1D4NA 5AE4A 3KN8A 3K6UA 2O84X 1LB8A 1NL5A 1N7WA 1SI0A 1PB7A 3KBRA 3RT8A 3ILTB 1DTZA 3HHGA 3K6WA 4RY1A 1P1WA 3FVKA 2D21A 4WXJA 2H4IA 1MQDA 4KCCA 4C1UA 1MPCA 2I4BA 4F3GA 1NKXA 3RUMA 4BDLA 5I59A 3N5LA 3L6GA 3PMWA 3MP1A 1AIVA 4H8JA 2O7UA 5TP9B 4FIMA 1TFAA 5DTBA 4RA1A 3Q25A 2ZYNA 2DE2A 1LFGA 1TXFA 4PFYA 1FQEA 1MXYA 2FYIA 1TWYA 3OSRA 4N6PA 4IGTA 2XXHA 4NF5B 3O97A 1XHYA 1GGGA 2GFEA 1IXCA 5H8HA 1Y3NA 1DMBA 1MY1A 4QFPA 3R26A 3ODBA 1M5EA 5CMMA 2UVJA 3U8QA 4N07A 4Q5TA 4OFLA 1D9YA 2DWJA 2F35A 3MUQA 5CRYA 4OESA 1POY1 3K1MA 1MXWA 1O7TA 3K00A 4F39A 4QF9A 3C35A 3FASA 1MDQA 4DIGA 1VFEA 4KFQA 1P99A 3TCGA 2YJPA 3UN6A 2RCBA 2OCUA 2NWJA 4BDNA 1O64A 4NF4A 4PP0A 4XKNA 2Z8FA 4Q30B 3FIRA 3U93A 2ZNUA 3IO6A 1SW2A 2IA4A 2HAUA 2VHAA 4XTCQ 3U1OA 2Y7RA 5CBRA 1M5DA 2ZNTA 4YKKA 4Z7EA 4QSCA 1EZOA 1MXZA 1PC3A 3C34A 3QUJA 1YTVA 4F1VA 4GL0A 4AB6A 4ELPA 2F34A 4POWA 3L6HA 2Q9TA 2E1SA 1URDA 5FHNA 1OLAA 2DVZA 3R7XA 2UVHA 2M8CA 4TLLB 5EHSA 3O6GA 1JNFA 3B6WA 4JWYA 4HCYA 2VD3A 5I59B 4HS7A 3OOAA 3QXMA 3S9LC 1N3WA 3DLNA 3M3KA 2Z8EA 5CC2A 3PUYE 1LB9A 2REJA 3CIJA 4ESWA 3FXRA 3UA8A 1B1XA 1MPDA 1URSA 1S9TA 4LZ8A 4GLIA 3MZ1A 1MS7A 1Q35A 3OELA 4YKIA 4FEDA 3A3UA 5BWJA 3ZKLA 4RK9A 5K2YA 3FVGA 1IEJA 1I6QA 2YPNA 4BDQA 4IY6A 3QIMA 1LFHA 1N7XA 3VFJA 3W15C 3CSBA 1WODA 3ZSFA 4GL8A 1JW4A 3KSJA 3MZBA 2QS1A 4IO5A 4DE8A 2H98A 4O3BA 3EHTA 1ELJA 2R71A 3M3LA 2P2AA 3S2VA 1BIYA 2ZMBA 3RGYA 1FTOA 4G77A 1DPPA 1N0TA 1LAFE 5H8SA 3N6UA 2F6PA 3CFLA 1WVJA 1LLSA 2QS4A 4F22A 3T9XB 3OO6A 4PE5B 1SW5A 2Q2CA 2AYSA 2Y7PA 3OENA 4NF4B 1LCFA 2DOJA 3G3IA 3KEIA 5I58A 3O28A 1SYHA 3FXUA 2KLFA 3H7MA 4X48A 3CG1A 5I57A 2DE3A 5I2KA 1H45A 1MM6A 4ND9A 1AH5A 3TTNA 4E0XA 3IJXB 1B5HA 1NH7A 5DVJA 3MVYA 3FD3A 3ZS6A 5TPAA 3SEVA 3T96B 1FQCA 4JB7A 4JDFA 4PFTA 4FE8A 3FV2A 3K4UA 2ONKE 3OD7A 2Y7WA 3LBSA 1LFIA 1SYIA 4LVQA 2QS2A 4EF2A 4OERA 4X1DA 2D5WA 3PPOA 2DE4A 1AMFA 4GRKA 4U2RA 4RPOA 3IB2A 1P1OA 3DP8A 2Z22A 4QFNA 5FTIA 4R2BA 5I56A 3C36A 1ZKBA 1MRPA 1JEVA 2R9JA 1B0LA 4XIGQ 4QHQA 1MQIA 2PT1A 2B3FA 2DWIA 1B05A 4PETA 2THIA 3PUXE 3KN7A 4ZE8A 1LBCA 1TT1A 5HBCA 4KCDA 3TPAA 4GFRA 2F7CA 5L9OA 3RQTA 3OO7A 1B5JA 4MBPA 3SEXA 4YB5A 1ZMGA 3TFLA 4P0IA 3JZJA 3S9MC 1N76A 3H6TA 4OWDA 4U21A 5JTYB 4OQOA 3QK6A 2XX9A 3PV0E 1B32A 1UQWA 4OMBA 1Y4TA 2O1LA 4GWOA 5HPQA 1SVXB 4IO3A 3DP4A 4ISUA 5AA3A 3G3GA 1NNTA 4LP2B 1XT8A 1MM7A 2PBWA 5I58B 4E0WA 3PD8A 2O69A 3BFTA 4F2OA 4IO4A 3OMBA 4F2QA 5I57B 3E3KA 1GTKA 5I2KB 3R6UA 1FTMA 2X26A 3IOWA 2I3VA 2R6GE 2GRVA 4UA8A 3FV1A 1AOVA 1B6HA 4U23A 3QUFA 5TPAB 1N04A 1USYH 4PFWA 1D3KA 4G68B 3HO7A 5AA2A 2RC8A 3QAXA 4MF3A 4PQJA 1DPEA 3IX1A 2XXWA 3VDFA 2I4CA 3PMXA 1R9LA 3T66A 1N3XA 1PBQA 4JWOA 2Y7KA 2G93A 4R9FA 1MXVA 4QSEA 2XXQA 2ZXTA 1UTHA 1Y3QA 3VVFA 2DXRA 3MW0A 4X1BA 5AA2D 4TLMB 5I56B 3DELB 3SEYA 3O6HA 2O51A 1B3EA 3PPRA 2HAVA 4OEUA 3VLUA 2ABHA 3TDJA 3KSXA 3CFXA 4LONB 4JSDA 4BDMA 2A5TA 3MZ9A 4YB7A 2UVIA 2ZNSA 2AL5A 5HM4B 4RNSA 4U1ZA 2QPQA 3N94A 3Q27A 4QFLA 2LAOA 3EN3A 3CI8A 5ITOA 3VE1B 1XVXA 4F31B 3TODA 1QVSA 2HXWA 2D3IA 2UVGA 1B3GA 3D4GA 4LQ5A 1IQ7A 2OZZA 4NMYA 3K01A 2HZLA 1B2HA 4F3PA 4H8IA 1Y1ZA 1B7HA 2VP1A 2WKYA 1PB8A 4RK2A 3KGCA 2O1MA 4H1XA 2ANJA 2OK2A 1Z7NE 3RTFB 4XKQA 4ZEIA 1ZLQA 3PPPA 1LBBA 4IGRA 3IJOB 4MH5A 4OFJA 3HPIA 5IKBA 3O2AA 1I69A 3VLVA 2O7IA 4OENA 2OWTA 3PUVE 4BDOA 4OEVA 3T9UA 2ONSA 4JWXA 4U1OA 3MPKA 3OEMA 2HQ0A 4OYVA 5AA2B 4ZEBA 5ISUA 3SERA 1POTA 2DP8A 1IXGA 2QMWA 4R6YA 5CBSA 4NEDA 3RPWA 3VV5A 3RLFE 3I3VA 3MWBA 3OO9A 2DXYA 2I48A 3IOTA 3I6VA 2ZYOA 3CRBA 1UTHB 5DYHA 2OBGA 3KOSA 3KOTA 2ESNA 2XD2A 4JBZA 5AA4A 1MDP1 1QULA 3UGWA 3PUWE 3IL1B 3I5OA 4MFIA 4QFOA 4XKPA 1PDAA 1PBPA 2B3BA 3TKDA 3RTWB 2I0CA 5FHMA 2A5TB 2F7BA 3E9XA 1XOCA 2F5XA 1MQJA 4R73A 3PD9A 4YKJA 2XXIA 3FGSA 4RPNA 4NE4A 2PMSA 4O3CA 4ZEFA 4OETA 3FXQA 4LQ2A 5H8NB 3TTMA 1IIWA 3IOUA 3FJMA 3TEPA 5EYFA 5L9MA 3CSGA 1Y3PA 4IB2A 1B4ZA 4M4GA 3TMGA 3TCHA 4G8HA 1FQAA 3WAFA 2X7PA 5IAIA 3UP9A 1S50A 3K02A 3VXCA 3U94A 1SD3A 1R9QA 3OO8A 1SW1A 4GD5A 4DXUA 3MP8A 5DVFA 1SQYA 1QW0A 1Y1MA 2RF1A 4U22A 3FATA 1FQBA 4ELQA 2VD2A 1YPNA 1B58A 4IO7A 5CMKA 3UIFA 1H43A 1QKBA 3V83A 4TQUQ 5JTYA 3S9EA 1JW1A 3MP6A 5BUUA 1LAGE 4JSOA 2QS3A 3A3CA 1N84A 4ZEDA 3USDA 3U92A 3MAMA 1MPBA 4THIA 4EF1A 1NFTA 1LSTA 4DZ1A 3BKIB 3BFUA 1B1HA 3PGFA 1B7ZA 2F78A 1L5TA 5J1DA 2DWHA 1ANFA 1US5A 4BLAA 3KFMA 4NWDA 2DS9A 4Q0CA 1J1NA 1ZIUA 2AL4A 1HSEA 5F1QA 3GBAA 3HHFA 3T93B 3LR1A 5AA4B 1M5FA 4G68A 1JVXA 5EHMA 3EHUA 5FTHA 1MH3A 1RKMA 5H8QA 3EQ1A 1GR2A 4YAHX 4DXBA 1NH8A 1B40A 4F18A 4DCXA 1A8EA 2OLBA 3H6WA 2HCAA 2XXXA 4KR5A 2FNCA 1EZPA 2W7YA 1D9VA 5JEIA 1EH3A 1OLCA 3FVOA 3HCQA 1QUJA 4EUOA 3LSLA 2XXPA 3FZVA 3G3JA 4LUBA 1EU8A 3GXAA 2XXVA 3O9PA 3Q26A 1P1QA 1USYE 2V3TA 4Z0IA 4C1TA 1FTLA 1OMPA 4TOZA 4WKMA 2ZYMA 1VR5A 2HEUA 4F19A 1US4A 3SKPA 2E0SA 2PX1A 3DP6A 1ZU0A 4RYAA 3C33A 4R9GA 4Q8RA 3HV1A 1OVBA 2VGQA 3H3GA 5ICQA 1XC1A 1XS5A 5KDTB 4H65A 4IO6A 3RT6B 4JXIA 1M5BA 3G7WA 5ICTA 2I6EA 3AXFA 3MC2A 3QSLA 3O29A 5CI5A 1IUDA 3KJTA 4KYEA 3IR1A 2DWAA 1P1NA 4F29A 1FQDA 1LAXA 1A8FA 4WEPA 5FHOA 3MJNA 5F7VA 3UORA 4GVOA 2GH9A 1YCJA 2NXOA 1FTJA 3BBRA 3U72A 2G29A 4PFUA 4EQ7A 4IY5A 2XX7A 3W9WA 2NUVA 1O63A 3LC8A 5DVIA 2I49A 3IK6B 1PEBA 2XXRA 3IAZA 1Z7ME 1H3DA 3LUYA 2PVUA 3PUZE 1NNKA 1VFDA 2Q2AA 2RC9A 3G3FA 1IZ1A 3KJ7A 2H5YA 5H8QB 4KQPA 4QSDA 4HCWA 1MH4A 1KWHA 1MY2A 1VE4A 1H76A 3TAJA 5A5XA 4DDDA 3T22A 1MG1A 3MVXA 2I3WA 5I84A 2V3QA 1IXIA 3SESA 2QMXA 1OVTA 2UXAA 3IOVA 2QL3A 2XXTA 3GBBA 3JYRA 4ZZAA 3O66A 1NNPA 3N26A 1JETA 1DTGA 3W9VA 5H8FA 4OVJA 4R74A 1UIVA 2OJTA 4YZZA 1BLFA 3FUZA 1A7LA 3TCFA 1B5IA 3H06B 3MVWA 5H8NA 5JK4A 3HN0A 4YMAA 1FW0A 1SI1A 2Q88A 1B9JA 1Y20A 4H5GA 3OEKA 2O6AA 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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