1Z7NE

Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
204
structure length
203
Chain Sequence
MIKIAITKGRIQKQVTKLLENADYDVEPILLGRELQIKTKDDLQIIFGKPNDVITFLEHGIVDIGFVGKDTLDENDFDDYYELLYLKIGQCIFALASYPDFSNKNFQRHKRIASKYPRVTKKYFAQKQEDIEIIKLEGSVELGPVVGLADAIVDIVETGNTLSANGLEVIEKISDISTRMIVNKSSFKFKKDKIIEMVERLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Activation of the hetero-octameric ATP phosphoribosyl transferase through subunit interface rearrangement by a tRNA synthetase paralog.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit
molecule tags Transferase
source organism Lactococcus lactis
total genus 56
structure length 203
sequence length 204
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2005-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1z7nE02
3GBAA 4H8JA 3TTLA 1B3GA 4YZZA 2DWAA 2Q2AA 2BJJX 2W7YA 2ZYKA 4WXJA 5JTYA 4R2BA 4OEUA 5IKBA 1B5IA 5JTYB 1LCFA 3IO6A 5DEXA 3S9EA 3A3CA 2FYIA 4RK2A 3EHUA 2UVJA 1SQYA 3PUXE 1NH8A 3RLFE 2Y84A 3TCFA 2ANJA 3IB2A 4MLQA 4IO4A 4ONYA 3TTMA 2V84A 2B3BA 1B58A 3KJTA 4MLVA 4Q0CA 1D4NA 3O6IA 4G68C 4RJZA 4P0IA 2HQ0A 1ZKBA 3U94A 2F6PA 4AB6A 2XXIA 3TQLA 4KR5A 3OSQA 2YPNA 3FIRA 4EQ7A 2OJTA 1B9JA 3O28A 3KG2A 3MVWA 3CFZA 4BDLA 1URGA 4ESXA 1WODA 4R2FA 4IGTA 3S9MC 3JV9A 1ATGA 3PPPA 1QKBA 4N13A 5EHSA 2QS3A 2H9BA 2Q89A 2ALUA 3PGFA 4F1UA 1BP5A 3THIA 5DT6A 5ICQA 1GV8A 1SI1A 3CSGA 4F18A 5K2YA 4YB5A 3IO4A 3KN3A 1TFDA 3FGSA 3OENA 4MH5A 4XIGQ 3V89B 3OEKA 3C35A 4OMBA 1JEVA 2O69A 1A99A 3EN3A 4U22A 3G7WA 4G68B 1NNKA 2V93A 4KFQA 3K1NA 5J1DA 5EYFA 1LAGE 4DCXA 3OO6A 3GBBA 2XXWA 2ONSA 3IOWA 1SI0A 2D21A 4NEDA 1POY1 3SKPA 2R71A 3FASA 3MC2A 3HV1A 2X26A 2PT1A 1B0HA 5I57B 1Y20A 1A40A 4H67A 2PX1A 1OLAA 1N0TA 5HM4B 2DP8A 1I6AA 4H5GA 5CBRA 3MZBA 1A8EA 3OMBA 4GFRA 4R6KA 3RNNA 2F35A 4NWCA 3PUYE 1B2HA 3M3FA 5H8QA 4FE8A 2QSXA 1T0KA 4H6DA 5H8QB 2OCUA 1Y3NA 2D5WA 4GF8A 1MM7A 4GRKA 3UGWA 2ZYOA 2XXHA 4PE5B 3W9WA 1MH3A 4ZEBA 1CB6A 4NWDA 4ISUA 2QL3A 2ESNA 3K02A 4G8HA 5H8HB 4O3AA 3C32A 2AL5A 4BDNA 5ELVA 4WKMA 1S9TA 4GXSB 3TTKA 3OO7A 2HZLA 3TTRA 3N6UA 3MVXA 4E0WA 1MS7A 4OERA 3I6VA 3KEIA 2Y7PA 4TOZA 3TKDA 3G3GA 4ZEIA 3S2VA 2ZYNA 5H8FB 3EF7A 3T9HB 5CI5A 3BFUA 3K2DA 4GWOA 4RXLA 2P2AA 5H8SA 1POTA 3FV1A 3PMXA 4BDRA 3RPWA 2Z8FA 4R9FA 5DVIA 3O2AA 1PBPA 1Y9UA 4OZ9A 1JETA 3MP8A 4Z0IA 2RC8A 1B7UA 1JW1A 4ELRA 2Z8DA 4EDPA 3TUSA 1MXVA 1N3XA 5I59B 1AH5A 3K6VA 1FTKA 2AIXA 3SEXA 4OQOA 1DPEA 4U4XA 3EHTA 2DWHA 3HPIA 4OETA 1M5BA 3KFMA 2LAOA 1MQJA 1SYIA 2NWJA 3U1OA 1GTKA 4XXUA 3K1MA 4LATA 2O6AA 5CC2A 1MQGA 1SW2A 4KI0E 1IEJA 5ITOA 1MPCA 3LC8A 1NNFA 3KZGA 3TCHA 3IB0A 5CBSA 1Q1KA 1JEUA 3DELB 2PVUA 1ZU0A 4P0GA 5KDTA 1Y3QA 3Q25A 5BWJA 4GXAA 4LUBA 2R9JA 5KZTA 3VVDA 1DTGA 1S50A 1FTLA 4QFKA 1FTMA 2UVHA 4DE8A 2XX8A 3B6QA 1MXXA 3JZJA 3LR1A 3UIFA 4U4SA 4U2RA 1USYE 3ONMA 1EZPA 1EU8A 1MY2A 1SW1A 3V8XB 1M5FA 5CRYA 3QXMA 5L9SA 3OEMA 2DXYA 4OESA 3V5AA 1D3KA 3FJMA 2QMXA 4EXKA 3ZKKA 1OQHA 5FTHA 4KYEA 3EHSA 5TU0A 2Q9TA 5DVFA 3CR9A 3PD8A 1QVSA 4OFJA 2OWSA 4HCYA 3DM0A 4QFPA 5FHMA 4LP2B 3CG3A 1Y1MA 1I6QA 2OLBA 4F3GA 1II5A 1UQWA 4F2OA 1ZBMA 2OK2A 4ND9A 4PP0A 2F34A 3C34A 4GL8A 1NKXA 1TWYA 4ZZAA 1JW4A 1MY1A 3ODBA 2NOOA 2QS2A 1JVXA 1VFEA 4YMAA 1ZLQA 4YICA 1NMUA 3DLNA 4XKQA 2YJPA 1MY0A 4TQUQ 4KYSA 4R9GA 5I56B 3T96B 2I6EA 3K1PA 5F7VA 5AA4A 1LB9A 4X48A 5BUUA 4NF4A 1RKMA 3BBRA 2NVUB 4GL0A 1P99A 1TT1A 4NF4B 3N5LA 4Q8RA 2ZNUA 1OQGA 4R74A 4H0WA 2XXQA 4BDQA 2O1MA 3QSLA 1M5CA 2E0SA 2DE2A 4LZ7A 5I58B 4OENA 4DXUA 1WDNA 2DE4A 1R9QA 5DYHA 4PFTA 1MXYA 1PC3A 1IITA 1FQFA 1FTJA 2I0BA 2A5SA 4PQJA 5LOMA 1NFTA 4K3FA 3B6TA 1BLFA 2XD3A 5DEXB 4IGRA 2IEEA 4RPNA 3IJXB 3ILTB 4RY1A 2F97A 3MJNA 3O66A 2FNCA 3UP9A 4GOTA 1R6ZA 3PU5A 5JEIA 2QS4A 3SEUA 3SESA 4G8MA 3H6UA 3L6GA 4KHZE 2ZXTA 1B51A 3H7MA 4JWXA 4QFNA 4R73A 4FAJA 4OHNA 4YKIA 2V3QA 2AL4A 1LSTA 2O7UA 2O1LA 1Y3PA 4IY6A 3T66A 3TYHA 4H5FA 4R75A 2I3WA 1Y1ZA 3IOTA 1OVTA 2H25A 3L6HA 2I48A 4UACA 1DPPA 5HBCA 3E13X 3PPRA 3R6UA 3CI8A 2X7QA 1B3EA 1HSJA 1P1WA 1R1NA 1OMPA 2GHBA 2RCBA 2XXUA 5JK4A 1MXZA 2M8CA 4KPTA 3TFLA 1MDP1 1ZJLA 4FECA 3OO9A 3W15C 3UORA 3QAXA 2XHDA 3V83A 4F3BA 3CIJA 3QUJA 5FHNA 3U92A 5CMMA 4EF1A 1Y4TA 1LAXA 3PD9A 1SD3A 2Z8EA 2GFEA 3IOUA 4YU0A 3FZVA 4LVQA 5EHMA 4ZS9A 4EXLA 4U1OA 4DIGA 2NUVA 2YLNA 3MPLA 1XVXA 2I4CA 5I2KA 1FTOA 1QW0A 5TPAA 3FD3A 3K0VA 5TPAB 3HO7A 1B40A 5ITPA 3I3VA 3C4MA 1NH7A 3K01A 3C9HA 4KD5A 3CG1A 3MVYA 1IXHA 2F5XA 5F1QA 4TLLB 3VE1B 1LFIA 4HTGA 1Y4CA 1GVCA 4KCCA 3ZKLA 1H76A 2G29A 3ZSFA 4JWOA 1XHYA 1MXWA 1F9BA 1UTBA 3HN0A 2DWIA 3TQWA 1UTBB 3TTNA 3VXBA 3SEYA 1FQBA 1IUDA 1I6BA 4MF3A 1PBQA 2UVIA 2UVGA 3QYTA 2DXRA 2HAUA 4N07A 3CRBA 2QJEA 2H98A 1PB9A 2XXTA 3G3JA 2XX7A 4OYVA 3FVOA 2NXOA 5KCJA 1TXFA 3PPOA 2GRVA 3KSJA 2F36A 4R72A 3BFTA 2XXVA 1B3FA 4AQ4A 2Z22A 1SYHA 2GH9A 1VFDA 4O3BA 1SW5A 4JXIA 1QKAA 3FJGA 5AA2A 1P1NA 1D9YA 3G3HA 1GGGA 3VDFA 2GHAA 2VP1A 3G3FA 3O6GA 2B65A 4TLMB 4QSCA 3MAMA 3LBSA 1OIBA 2XXRA 4GD5A 2I58A 3K6UA 4IB2A 2UXAA 4RA1A 4NF5A 3U72A 5ISUA 5B70A 3TODA 1B1HA 2XXYA 4NF5B 1B3HA 3T93B 3CFXA 1B7HA 4JSOA 1ZTYA 3G3IA 1B3LA 1UTHA 2D3IA 1N76A 3MP6A 3MVZA 1UTHB 3KJ7A 1H3DA 1O7TA 3OSRA 3VXCA 1KWHA 4FEBA 3U8QA 3DP4A 5TP9A 5AE4A 1H44A 3H6WA 1FW0A 5TP9B 1IIWA 1Q35A 2XX9A 4ZEKA 1XOCA 1QUJA 4ZDMA 3RTFB 1B52A 4AB5A 1J1NA 1LAHE 2Q8JA 4Q5TA 3R26A 4JBZA 2V25A 4F31B 1SW4A 2Y7KA 4R6HA 3AXFA 3K4UA 3R7XA 3JYRA 1YAEA 3RGYA 1PB7A 4Z7EA 2XXPA 1JNFA 4FORA 4LQ2A 5KDTB 4LZ5A 4ZEFA 3OO8A 1BKAA 3U93A 5CMCA 3H03A 1N84A 1H43A 4WEDA 3PUWE 3ZS6A 3VVEA 1N7XA 3USDA 2RC9A 3CSBA 3QK6A 3RUMA 1ELJA 5HPQA 4GIZA 2REJA 4RYAA 3OOAA 4C1TA 3LUYA 4QHQA 3T9UA 4X1BA 3T9VA 4X9TA 3UA8A 1M5EA 2F6GA 2ZYMA 3SEWA 4BDOA 4DDDA 4KYDA 2REGA 1MDQA 1NL5A 4LQ5A 1B4ZA 3TEPA 2PYYA 1AMFA 3EPEA 4N6PA 4F3SA 1IXIA 3SDFA 3LSWA 1SVXB 3FVKA 4PFWA 3RT8A 4UA8A 3VLWA 3B6WA 2WKYA 3H6VA 2F8DA 3Q29A 3VVFA 1JW5A 4GQOA 1MH4A 5CMKA 4JB7A 4FATA 1US4A 3P7IA 3O29A 3RQTA 1AOVA 3IAZA 3B7DA 1MQIA 2Y7WA 5IAIA 1DOTA 4H8IA 3LSFB 5AA4B 1UIUA 1B5JA 5B7DA 2Z23A 4R6YA 3OD7A 2VD3A 1A7LA 2XXXA 2F78A 1VE4A 2IA4A 3M8UA 5L9OA 3FUZA 4NE4A 4DLDA 3IJOB 1O64A 2DE3A 4F19A 4ECFA 2H99A 1HSEA 2VHAA 3MW0A 4PETA 5H8NA 3IL1B 5H8NB 3IORA 1PB8A 1UIVA 5FTIA 3MWBA 2QS1A 4RPOA 4OVJA 1LLSA 1FQCA 1LAFE 1XS5A 5CM6A 2E1SA 4E0XA 1DTZA 3QIMA 5AA1A 3DP6A 1DSNA 1LCTA 2OZZA 2ZNSA 1B32A 3Q26A 2H4IA 3MQ9A 1RYOA 1YCJA 2PT2A 1WVJA 3CFLA 3TPAA 1MQDA 1QUIA 4NTLA 1QUKA 4RNSA 3GZGA 4ELQA 4EUOA 4YKJA 2ABHA 4DXCA 3IK6B 4OXVA 4BLAA 2ONRA 1A8FA 4X1DA 1Z7ME 1N3WA 1XT8A 2O68A 5FHOA 4LA9A 4IO2A 3TDJA 1FQAA 4PFYA 1FQEA 3CVGA 2HEUA 4NF6A 2HFBA 3FJ7A 1URSA 4NF6B 1P1OA 1MPDA 4M1VA 2F7BA 4XTCQ 1SBPA 3FV2A 2VOZA 4LZ8A 3LSXA 3O9PA 2Y7IA 1IZ1A 3KOSA 3W9VA 3TAJA 2Y7RA 1LB8A 1TFAA 1JQFA 2Q2CA 3H4ZA 3M3LA 3KBRA 1MM6A 4F39A 4HS7A 1B1XA 3OELA 1S7YA 4H1XA 4QF9A 3TZAA 4EF2A 1P1QA 2OWTA 1OVBA 2UYEA 3SETA 2P1SA 1SDXA 1RYXA 2I0CA 4DZ1A 4L17A 4QSDA 1M5DA 4XKNA 2THIA 4G77A 4U1ZA 1B4HA 3H6TA 4DCYA 3D4CA 3GXAA 5AA3A 2V3UA 5I2KB 1A54A 3IR1A 3QUFA 2F7CA 4POWA 2DS9A 3TCGA 5I84A 3S9LC 4G68A 2DQVA 1FCKA 3VLUA 3N94A 4MBPA 2DOJA 2HCAA 2HXWA 2P0SA 4OFOA 1IXCA 3MPKA 4YB6A 4I9DA 1ANFA 1Z7NE 3EQ1A 3PUZE 4EQBA 3N26A 4WEPA 3TMGA 5I57A 3ECRA 3A3UA 3ILUB 4G4PA 4F1VA 1D9VA 3RN8A 2DWJA 3IX1A 3N6TA 2RCAA 1LFGA 4FJPA 3H3GA 2DVCA 3GLBA 4BDMA 2QMWA 1YPNA 4I1DA 1DMBA 2DVZA 3T9XB 4GVOA 4POXA 4IO3A 3PPQA 3HHGA 1EH3A 1MQHA 5L8DA 1MY3A 1MRPA 1N04A 4O3CA 4G8NA 5KCJB 3RTWB 2ZMBA 4FEDA 4IY5A 5DTBA 3O6HA 1HSLA 1LFHA 5H8HA 2DSFA 1AL3A 1JVYA 1USYH 3FXQA 3MBPA 4IO5A 3KN8A 4MFIA 3S9NC 3Q27A 4IO6A 5AA2B 4YAHX 4F1YA 4NMYA 3SEVA 2HAVA 3K6WA 3KSXA 2UYFA 3VV5A 1FQDA 3MZ9A 4U23A 3RY3A 4JDFA 3FVNA 3PMWA 3G3KA 4FIMA 2F7AA 4M4GA 3VLVA 1A55A 1YTVA 4ELOA 1LGBC 2RINA 2H5YA 4C0RA 1US5A 2DYXA 3HSTA 5H8FA 2PMSA 4F22A 4DXBA 1NNPA 3LSLA 4ELPA 4PFUA 3SERA 3OXNA 3O97A 3FXUA 3FVGA 3IOVA 2VD2A 1MY4A 1VR5A 4THIA 4RK9A 2FA7A 1B7ZA 1QJMA 3BKIB 4I62A 3PMVA 1EZOA 1LBBA 4HCWA 2RC7A 2X7PA 5I59A 2CZLA 3HCQA 5ICTA 3K00A 5DVJA 3UN6A 3WAEA 4LONB 4QSEA 2RKMA 1R9LA 4KCDA 4F2QA 4OTEA 4ZZEA 1IXGA 4ZE8A 4F29A 1CE2A 3S4UA 4IO7A 3DP8A 4ZE9A 1OLCA 4JSDA 3KOTA 1PDAA 3VFJA 4ZEDA 1B5HA 1B0LA 5I2NA 1O63A 2QPQA 1L5TA 5I2NB 1MPBA 3TELA 2PBWA 3MZ1A 4OEVA 3IB1A 1XVYA 4EQ9A 1B05A 1MXUA 1VSOA 2KLFA 3MP1A 2O51A 2B3FA 2Q88A 1IQ7A 4U21A 2O84X 3Q28A 4YKKA 3PV0E 1URDA 4Q30B 2HZKA 3MUQA 2ZNTA 1ZIUA 3RT6B 3WAFA 3M3KA 2V3TA 3UK4A 1P1UA 3D4GA 3H06B 3E3KA 5A5XA 3E4RA 5A5XB 1BIYA 4GLIA 3I5OA 1EZ9A 4KQPA 3E9XA 4YKPA 3K6XA 2VGQA 3PPNA 1B46A 3C33A 1AIVA 4OWDA 2QRYA 4QFLA 1LBCA 3HHFA 2OBGA 4G2ZA 4HW8A 5K2XA 4YMBA 4QRZA 2RF1A 5L9MA 3T22A 4JWYA 4F3PA 4P11A 2I49A 3KGCA 4XKRA 2ONKE 3F11A 2A5TA 3C36A 1H45A 1MG1A 2AYSA 1PEBA 2A5TB 3C31A 2G93A 2O7IA 1XC1A 2XD2A 1BTJA 1NNTA 4YB7A 1ZMGA 2I4BA 4NF8A 3FATA 5AA2D 5I56A 1QULA 3FXRA 4NF8B 4XKPA 1I69A 3A09A 4C1UA 2CMOA 4ZECA 5M2VA 4OFLA 2R6GE 2I3VA 4QFOA 4ESWA 1N7WA 4I8CA 1GR2A 5I58A 3PUVE 5CMBA 3KN7A 4H65A 1B6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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