1ZIUA

Crystal structure of nickel-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA01
1USYE 2QSXA 4JSDA 3IORA 1US4A 3FVKA 2V84A 4KQPA 3K00A 3TZAA 3E9XA 4Q5TA 1GTKA 1P1NA 4Q0CA 3D4GA 3O28A 3FVGA 2HQ0A 3IOVA 3RTWB 4KCDA 2Z23A 3VLVA 4NF8B 2H5YA 2THIA 4IGRA 3I6VA 1DOTA 2GHBA 3KN7A 2X7QA 5AA2A 2B3BA 2NUVA 1MXXA 1B9JA 1OLAA 3P7IA 2RCBA 4QHQA 1Y9UA 5ITOA 3CG1A 3BFUA 1EZ9A 4WEDA 1DPPA 2P2AA 2UXAA 3MVWA 5TPAA 1MQIA 1A8FA 2Q2AA 3FXQA 3IK6B 2DXYA 5I57A 1NNKA 3KOSA 4X48A 4KYDA 1PBQA 1B1HA 4YKPA 3MWBA 3C33A 2Z8DA 4ESWA 4X9TA 3WAFA 3MP1A 1RYXA 4OERA 5TP9B 3S9MC 2VD2A 1M5DA 2G93A 3W9WA 3TTLA 2UYEA 1B40A 4RPOA 5EHSA 3H6WA 2UVHA 1YTVA 2XXYA 2ZNTA 1URSA 3ZKKA 3RQTA 2OWSA 3MP6A 4Z0IA 1BKAA 3TKDA 1YCJA 2CMOA 2QS4A 2I0BA 4LATA 3PGFA 1DTZA 1B3HA 3PUVE 4IO6A 1LB9A 4R6YA 5EYFA 4U4XA 4R9FA 4ZS9A 4F31B 4O3CA 3HHFA 1H43A 4YKIA 1VSOA 3OOAA 1IXGA 3S9NC 3RT8A 4ELQA 4ZZAA 3O66A 5I58B 3MPLA 4IY6A 3VFJA 3H6TA 3TCHA 4IY5A 4R74A 1WODA 1DSNA 4BDLA 4DLDA 4IO4A 4RK9A 2UYFA 3MVZA 2Q9TA 3LC8A 2DE4A 5KDTA 1S7YA 4ND9A 4F2OA 5TPAB 3I3VA 1QKBA 1B52A 2BJJX 2VOZA 1MM7A 3CFZA 5I57B 4KYEA 4EUOA 1JVYA 1I6AA 3CG3A 1D3KA 3SDFA 4ELPA 2VGQA 3MZ1A 3RT6B 1N0TA 4LUBA 2DSFA 3IB1A 4G8MA 4EXLA 3U94A 5JTYA 3TTKA 3WAEA 3ILTB 1B2HA 1SI1A 1B05A 5FTIA 4F22A 1KWHA 4IO5A 2H98A 2D3IA 2XX7A 1LAXA 4RJZA 3TFLA 5I84A 2RKMA 1EH3A 3JZJA 2OK2A 3EHSA 3CIJA 4EXKA 4G8NA 3RNNA 1UIVA 1IIWA 3IB0A 3VV5A 2PMSA 2QS1A 3PPNA 2Y7RA 2DWHA 3PU5A 1I69A 1N04A 4QSCA 2ALUA 1B6HA 3MC2A 1L5TA 1SD3A 3A09A 4IO2A 3HN0A 3IOUA 1FTKA 3DP4A 5DEXB 1EZOA 1NNFA 3RN8A 4NF6B 2GH9A 4OQOA 4GF8A 4NE4A 2HZLA 1Z7ME 1R9LA 4ZEKA 3IR1A 5A5XA 5KDTB 3U8QA 2AL4A 2GRVA 1IQ7A 2UVGA 4HCWA 5CMMA 3TYHA 4Q30B 1MY1A 3PPPA 5AA4A 3UK4A 1QUJA 2AL5A 4KHZE 1VE4A 4PETA 2F78A 4QFKA 1LBBA 4G68C 4FEBA 3Q25A 3OSQA 4TOZA 3O6IA 4ZZEA 4U2RA 1USYH 3VVFA 1FQBA 3UORA 4GOTA 1B5IA 2DWIA 1RYOA 2CZLA 2XXXA 2RINA 5K2XA 3OXNA 3U93A 3CVGA 1Q35A 1B3GA 1MXWA 5BUUA 3HSTA 3PMWA 5CMBA 3TTRA 4L17A 2VP1A 1Y4CA 4I1DA 4YICA 1B4ZA 3TUSA 1XHYA 1B3FA 4PFWA 4KR5A 1OQHA 4WXJA 5I2KA 2XXQA 3IX1A 2PT1A 3JYRA 3R26A 4M1VA 3FD3A 1MPBA 1ZLQA 4E0WA 4YB7A 3GZGA 4LVQA 3S2VA 1B3EA 4F3SA 3IJXB 2AIXA 3V5AA 2XD2A 1S9TA 4H8JA 3KGCA 4NF8A 1NMUA 4YU0A 1TFAA 3IAZA 3USDA 4H6DA 2UVJA 1IXCA 1MG1A 4JB7A 2A5TB 1MRPA 2O68A 3CFLA 4H8IA 2KLFA 2Q2CA 2OLBA 1AMFA 4FIMA 2F34A 1FTLA 1GGGA 4LQ2A 2PBWA 2B3FA 2DP8A 2IA4A 4GFRA 4U23A 3RY3A 5A5XB 3ZKLA 2GHAA 1BIYA 1YPNA 3U92A 3HCQA 4BDNA 3MVXA 4AB5A 4LQ5A 5I2NB 1YAEA 1MQDA 4YMBA 5H8QB 3U1OA 4KYSA 2I0CA 4I62A 4H65A 3IO4A 2XXRA 2DWAA 4BDOA 2D21A 1Y3PA 1BLFA 1MXUA 2F36A 3O97A 1PC3A 1SDXA 2ZYNA 4GLIA 1IXHA 4QSDA 1B4HA 5F1QA 3VVEA 3KZGA 4G4PA 2P1SA 3SEYA 3VLUA 1PDAA 4BLAA 3DM0A 1MPDA 4RXLA 1FQCA 4PFTA 5I2KB 1OQGA 4OENA 3CSBA 2I58A 2WKYA 4PE5B 1S50A 4E0XA 1DTGA 4XKQA 2DS9A 4F19A 4U4SA 3PPOA 3V83A 4LA9A 1ANFA 4XKPA 3KJ7A 3LSWA 4HTGA 1SYIA 5I58A 4KD5A 4X1BA 1QVSA 1SQYA 1ZJLA 3N5LA 1B7UA 1PB7A 3C32A 1POTA 1PEBA 1JEVA 4IO7A 3TMGA 5FHNA 3K2DA 3JV9A 1HSEA 4FORA 1FTOA 3TCGA 1JW4A 3PUZE 4U1OA 4FAJA 2Q89A 2ONSA 5AA2D 1LAFE 3T96B 4JDFA 3H6VA 2Q88A 3HPIA 3O9PA 4GRKA 4G77A 3GXAA 4MF3A 4JWYA 2X7PA 3IL1B 3UN6A 3ZS6A 1MY2A 1ZTYA 4R2BA 3U72A 2D5WA 2Y7KA 2XXVA 1EZPA 1NNPA 4OFJA 3C9HA 4ELRA 1SW2A 1EU8A 4FECA 3KSJA 3BKIB 1VFEA 1UTBB 3M8UA 3OO7A 1SW5A 3Q29A 3CRBA 2I4BA 5ISUA 5AA1A 1ZKBA 2H4IA 4F1YA 1JEUA 3C36A 3EHUA 5HBCA 3VVDA 3PPRA 5EHMA 1O63A 2XXWA 2F7AA 1MY0A 1NKXA 2YLNA 2XXPA 2OZZA 1UIUA 4XXUA 1HSJA 5AA3A 3KN3A 4TLMB 4RNSA 4ZE8A 3VE1B 3K1NA 3FZVA 4GIZA 5CBSA 1FTMA 5TU0A 3OSRA 4YMAA 3PMXA 4ZEDA 3FGSA 2QL3A 2I6EA 1LFHA 3M3FA 2F6PA 4GD5A 3FVNA 2VD3A 2Y7PA 2ZYKA 3DELB 1JW1A 1P1UA 5KZTA 3SEWA 2PX1A 5DEXA 3RPWA 1QKAA 4NF6A 3CSGA 4JWOA 4K3FA 3PUYE 2GFEA 3G3IA 2HAVA 3VDFA 5FHMA 1H3DA 3PUXE 3PV0E 3VXCA 3QUFA 1LLSA 5CMCA 1N3WA 1B5HA 1B32A 5ELVA 4H0WA 3RUMA 2PYYA 1MS7A 1ATGA 3SKPA 4QFPA 1DMBA 2ONKE 4PFUA 2DOJA 3KJTA 3PPQA 4DXCA 3FXRA 4GXSB 1MDQA 3QUJA 5K2YA 1URDA 3A3UA 1US5A 1B0HA 3MAMA 1P1WA 3VLWA 1Q1KA 5ITPA 2YPNA 3FV2A 4H67A 3K02A 3FXUA 4LONB 3SESA 3LSLA 3QXMA 3OO6A 1TXFA 2I48A 4QFLA 2RC8A 3UA8A 1MXVA 1VR5A 1SVXB 4OYVA 2NVUB 4LZ8A 3C4MA 4NWCA 2Z8FA 1AIVA 3LBSA 2FNCA 1OVTA 2REJA 1JETA 4BDMA 4R75A 2F7CA 3Q27A 5IKBA 1TWYA 2FA7A 5H8SA 3MW0A 3H4ZA 4YKJA 1BTJA 4C1TA 4EQ9A 4NMYA 1FQDA 1JW5A 4F18A 4R73A 4PFYA 3K6XA 3OELA 3W9VA 3QK6A 4ZDMA 1N7WA 2A5TA 1I6QA 3GBBA 1MQHA 4IB2A 4WKMA 2E0SA 3ODBA 5H8NA 3MUQA 3FJMA 4TLLB 3PUWE 1P1QA 3MPKA 4M4GA 4POWA 3T9UA 1OIBA 3UGWA 3EQ1A 4HCYA 2RCAA 2O51A 3THIA 2FYIA 1LAHE 2ANJA 4RPNA 5I2NA 1PB8A 5H8QA 3H03A 3TEPA 1FTJA 2Z22A 2I3WA 4O3AA 2H99A 1IITA 2O69A 3TCFA 4BDRA 3B6QA 2DE3A 4GWOA 2HAUA 4R72A 3S9EA 4GVOA 3E3KA 2QMWA 1H44A 2DYXA 1OVBA 2ONRA 2V93A 3G3HA 1SW4A 1LBCA 2ZMBA 5L9OA 4OFOA 3LUYA 1J1NA 1QUIA 2F6GA 3B7DA 3TQWA 4GQOA 1NH8A 5H8HA 1LAGE 1AOVA 2V3UA 4MLVA 1OMPA 1AL3A 1O64A 3QAXA 1B3LA 4QSEA 1ZMGA 1LCFA 3ILUB 3UIFA 4P11A 5FTHA 1UTHB 5M2VA 3B6TA 3FJ7A 4YB5A 4KI0E 4DXUA 3MZBA 3F11A 1D9YA 2QPQA 3TAJA 3V8XB 1M5FA 3PD8A 4ZEBA 1R1NA 1NFTA 3MJNA 4UACA 1JQFA 5H8NB 1XVXA 5DVIA 3R6UA 4PP0A 4F29A 2DVZA 3LR1A 3IOTA 5BWJA 4ZECA 4QFOA 3TQLA 4MH5A 3H7MA 1A55A 1MY4A 2ZNSA 4ISUA 1MQJA 1B58A 2DE2A 5HM4B 4F1VA 3KOTA 3N26A 2PVUA 3E13X 1D9VA 4LZ7A 4OMBA 2O1LA 4NEDA 4LP2B 3O2AA 1MQGA 4EF2A 1RKMA 5HPQA 4EQBA 1UTBA 4NWDA 4EQ7A 3RTFB 2QMXA 4YZZA 2DXRA 1MPCA 3OENA 3A3CA 2O1MA 2O6AA 3C35A 4DDDA 5I59B 5CBRA 3SEXA 1BP5A 1NNTA 3D4CA 2QS3A 2LAOA 3IO6A 4MFIA 4Z7EA 1FQFA 1MXYA 2OCUA 4JBZA 1LB8A 1FW0A 2QRYA 1JNFA 1II5A 4JXIA 4Q8RA 3PMVA 1QW0A 5H8HB 2DVCA 4ONYA 2I4CA 3MBPA 2HXWA 2ESNA 1AH5A 4JSOA 4R6HA 4IGTA 4JWXA 1UQWA 3ZSFA 4ESXA 4GL0A 5KCJB 3SEVA 1A8EA 4FJPA 3RGYA 3G7WA 3TPAA 2VHAA 1P99A 3TTNA 2HFBA 4N07A 3SERA 5B7DA 3QYTA 3AXFA 3G3JA 4THIA 3O6HA 3IOWA 4P0IA 3S4UA 2RC7A 4OEUA 3SETA 4G8HA 2G29A 3N6UA 1WVJA 1MM6A 3MVYA 4NF4B 3FASA 2Y84A 1N3XA 3CI8A 1SYHA 3T9HB 2RF1A 3FJGA 3M3KA 2I49A 3UP9A 1FQEA 2PT2A 4TQUQ 1D4NA 2R9JA 1N84A 2XX9A 2O7IA 1M5BA 2OJTA 1DPEA 1Y1MA 3FV1A 5DYHA 2XD3A 4PQJA 4UA8A 1M5CA 2M8CA 1GR2A 3IJOB 3R7XA 1MH3A 3K01A 2OWTA 4U1ZA 2V3QA 3K4UA 4YKKA 1Y3QA 1URGA 4WEPA 1VFDA 4RK2A 5H8FB 4DCXA 4FE8A 4OEVA 1M5EA 1XT8A 2W7YA 2Y7IA 2XXTA 4O3BA 4F3GA 3C34A 4I8CA 3BFTA 4BDQA 3L6GA 2XXIA 4EF1A 5DT6A 3N6TA 1N7XA 2QJEA 4OTEA 5JEIA 5IAIA 4N6PA 3TELA 4QFNA 1PBPA 1N76A 1F9BA 4OHNA 2ZYOA 4ELOA 3OMBA 3Q28A 4MLQA 1IUDA 1Z7NE 2Z8EA 1R6ZA 3EPEA 5AA2B 2NXOA 3FVOA 4HW8A 4AB6A 1P1OA 1MDP1 1GVCA 1Y3NA 1HSLA 2A5SA 3FATA 1Y1ZA 3G3KA 5DVJA 3H6UA 1ZIUA 3EF7A 2ZYMA 4C0RA 4RA1A 4KCCA 4H5FA 3KN8A 2H25A 4ZEIA 3MZ9A 4FEDA 3T93B 4DXBA 1Y20A 4LZ5A 3H3GA 3T66A 4G68A 3RLFE 2P0SA 3KFMA 4XKRA 1B7HA 4R2FA 1FQAA 1JVXA 3LSXA 2F7BA 1LCTA 3EHTA 3SEUA 3L6HA 5ICTA 5B70A 3KG2A 3H06B 1ZU0A 4ZE9A 1IXIA 1I6BA 3B6WA 1WDNA 1ELJA 4F3PA 2V3TA 4FATA 3QIMA 1OLCA 1LFIA 1UTHA 2ZNUA 3K1PA 3ONMA 1LSTA 5I56A 3G3GA 1H45A 4OFLA 3HHGA 2X26A 1QUKA 2XX8A 4OZ9A 3TODA 3EN3A 3DLNA 2O84X 2XHDA 5J1DA 3OEMA 2YJPA 1T0KA 4XKNA 3MP8A 1FCKA 4U21A 3O6GA 4YAHX 3O29A 3ECRA 4ECFA 2H9BA 1B5JA 4H1XA 2HZKA 3N94A 3I5OA 4KPTA 4G2ZA 1SI0A 3PD9A 1MH4A 4OETA 3K6WA 4NF5A 1A40A 4GL8A 4POXA 2F35A 2I3VA 3S9LC 3KSXA 4U22A 3CFXA 4OESA 3OO8A 2XXHA 4AQ4A 3MQ9A 4R6KA 3K6UA 1GV8A 4H5GA 1NL5A 5CMKA 3FIRA 4GXAA 3LSFB 3V89B 4HS7A 2R6GE 5I59A 3BBRA 1SW1A 3HO7A 4OVJA 1SBPA 4MBPA 1B1XA 4G68B 2R71A 1XS5A 3K0VA 5FHOA 2NWJA 4P0GA 4RYAA 3W15C 1A99A 4QF9A 4DZ1A 5JTYB 2AYSA 4I9DA 2REGA 2V25A 1B51A 4DE8A 2DQVA 2F97A 5CC2A 3VXBA 4F1UA 3K1MA 5L9MA 5LOMA 5F7VA 1LFGA 1CB6A 5CRYA 4XTCQ 5I56B 1MXZA 2NOOA 5L8DA 3C31A 5KCJA 2O7UA 3TDJA 4EDPA 3Q26A 4DIGA 5AE4A 3G3FA 3E4RA 2F5XA 5L9SA 4R9GA 1IEJA 1QJMA 3OEKA 2DWJA 3CR9A 1TT1A 4QRZA 1LGBC 1B7ZA 4F39A 3GLBA 2Q8JA 1XVYA 1A54A 4X1DA 4YB6A 1QULA 3QSLA 5DTBA 3OO9A 4NTLA 4F2QA 4NF5B 3DP6A 4F3BA 1POY1 2OBGA 1O7TA 4NF4A 4C1UA 4XIGQ 1B46A 1NH7A 2ZXTA 1H76A 2UVIA 4KFQA 4RY1A 2HEUA 1Y4TA 1IZ1A 2QS2A 1XOCA 2RC9A 5AA4B 5DVFA 3T9XB 3HV1A 5JK4A 2E1SA 3OD7A 5TP9A 4ZEFA 1R9QA 4OWDA 5ICQA 1XC1A 3M3LA 2Y7WA 1PB9A 2HCAA 2B65A 4DCYA 3K6VA 5CM6A 1A7LA 3T22A 2F8DA 3TTMA 5CI5A 2ABHA 3DP8A 1MY3A 3FUZA 4N13A 2XXUA 1TFDA 1ZBMA 3KEIA 2IEEA 3GBAA 5H8FA 4IO3A 1B0LA 4OXVA 3IB2A 3T9VA 3KBRA 1CE2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1USYE 2QSXA 4JSDA 3IORA 1US4A 3IFAA 3FVKA 3SZPA 2V84A 4KQPA 3K00A 3TZAA 3E9XA 1NUZA 4Q5TA 1GTKA 1P1NA 4Q0CA 3D4GA 3O28A 3FVGA 2HQ0A 3IOVA 3RTWB 4KCDA 2Z23A 3VLVA 1IMCA 4NF8B 2H5YA 2THIA 4IGRA 1NUWA 3I6VA 1DOTA 2GHBA 3KN7A 2X7QA 5AA2A 2B3BA 4QXDA 2NUVA 1MXXA 1B9JA 1OLAA 3P7IA 2RCBA 4QHQA 1Y9UA 5ITOA 1NI9A 3CG1A 3BFUA 5F24A 4MNCA 1EZ9A 4PAFA 4WEDA 1DPPA 2P3VA 4GWWA 2P2AA 2UXAA 3MVWA 5TPAA 1MQIA 4PGNA 1A8FA 2Q2AA 3FXQA 4OVQA 3IK6B 2DXYA 5I57A 1NNKA 1FBGA 3KOSA 4X48A 4KYDA 1PBQA 1B1HA 3KC0A 4YKPA 3MWBA 3C33A 1FPKA 2Z8DA 4ESWA 4X9TA 3WAFA 3MP1A 1RYXA 4OERA 5TP9B 3S9MC 2VD2A 1M5DA 2G93A 3W9WA 3TTLA 2UYEA 1B40A 4RPOA 5EHSA 2VT5A 3H6WA 2UVHA 1YTVA 2XXYA 1FJ6A 2ZNTA 1URSA 3ZKKA 3RQTA 2OWSA 3MP6A 4Z0IA 1BKAA 3TKDA 1YCJA 2CMOA 2QS4A 2I0BA 4I3YA 4LATA 3PGFA 1DTZA 1NV5A 4I40A 4HE0A 1B3HA 1FPEA 3PUVE 4IO6A 1LB9A 4R6YA 1FBEA 5EYFA 4U4XA 4R9FA 4ZS9A 5T3JA 4F31B 2WEFA 4O3CA 3HHFA 4JVCA 1H43A 4YKIA 4PF8A 1VSOA 5EYHA 3OOAA 1IXGA 3S9NC 3RT8A 4ELQA 4ZZAA 3O66A 5I58B 3MPLA 4IY6A 3VFJA 2XWIA 3H6TA 3TCHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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