1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
2F35A 1LFGA 3L6HA 5EHMA 2QRYA 3E13X 1B5HA 1O7TA 3O2AA 1SW1A 4UA8A 1YCJA 3R6UA 4ZEFA 5I57B 1BIYA 4HW8A 1OVTA 4JWXA 3Q27A 3QIMA 4OVJA 4Q30B 2GFEA 5L9MA 4Q5TA 1MXVA 1J1NA 2CMOA 4ZECA 2O7UA 5I58B 4OMBA 3LC8A 4XKQA 4EUOA 4YKIA 2DWHA 3EPEA 1A7LA 1M5BA 1JNFA 2H99A 2RCAA 3B6WA 3H7MA 4WEDA 4MLVA 2OBGA 1B3HA 4ZEIA 3G3IA 4PFUA 1VFDA 1FTLA 4KFQA 4PE5B 4RA1A 3VV5A 3OO9A 1IXCA 3VLVA 4G68A 1PBPA 5I56B 1UTBB 3PMWA 1SQYA 3TCFA 3QSLA 3OEKA 5I2NA 3O6GA 1MS7A 3FJMA 4R2FA 5AA2B 1GTKA 1ANFA 1QJMA 4F2OA 3CI8A 1N7WA 3MQ9A 3T9XB 3CIJA 1IIWA 5CM6A 3KN8A 4YZZA 2FNCA 1I6AA 4OHNA 1EH3A 2Q9TA 3JYRA 5CRYA 1POY1 2UYFA 2V3TA 3FVOA 2HCAA 1LB9A 2IA4A 3VE1B 1P99A 4PFWA 3BKIB 2Y7IA 3PUWE 3N6TA 4TLLB 4ZZAA 3LR1A 4P11A 1MXWA 1MRPA 5I2KB 2I48A 1UIUA 4XKNA 3QXMA 5ELVA 4MH5A 3RY3A 4THIA 3H03A 1MQIA 3N6UA 1ZU0A 3U94A 4EF2A 1JW5A 3Q25A 3T9UA 1Q1KA 5H8QB 3RLFE 1Z7NE 3MP6A 4E0XA 5H8SA 4QSCA 1R9LA 3IK6B 3M3LA 4KYSA 3ZSFA 3QUFA 3RQTA 4ZZEA 4C1TA 1USYH 2D3IA 4O3CA 2A5SA 4G8NA 4YMBA 5AA4A 1N3XA 4KHZE 2Z8FA 3FATA 2QS4A 3SEWA 1QKBA 4LP2B 3I5OA 2UVIA 1LSTA 5ITPA 2AIXA 4H65A 4FAJA 4O3BA 4IO4A 4EF1A 1F9BA 3CG1A 1OQGA 5BWJA 1IQ7A 5B7DA 1TFDA 4ISUA 1MXYA 1XS5A 2F7AA 4FATA 3B6QA 2DE3A 3MWBA 3IB1A 4QSEA 4I1DA 4YAHX 3U72A 4E0WA 5DVIA 3S2VA 2O1LA 3K6UA 2ZNSA 4NF5B 4F1UA 1B7HA 2XXHA 3AXFA 3ZKLA 4F3SA 2DWJA 3IOTA 1NH8A 3G3GA 3MAMA 4EXKA 2OLBA 4JWYA 4OFJA 3E4RA 1MPDA 5CMBA 3EHTA 2VGQA 3Q28A 3QUJA 4POXA 3PUZE 3IORA 2RF1A 4EQ9A 5CMMA 5KCJB 2VHAA 2HAUA 4GF8A 1GR2A 2QS2A 2WKYA 1QKAA 2AYSA 1Y9UA 3SETA 1DTGA 3C4MA 4HCYA 2ONKE 3CSGA 2RC8A 2ZXTA 3DP8A 3WAFA 2Z22A 1BTJA 1JVYA 5ITOA 1JEUA 1H43A 1P1WA 1Y4TA 3H6VA 3A3CA 3Q26A 4QRZA 1NL5A 1A54A 2DWIA 5DYHA 3FASA 3PUVE 2ONSA 4POWA 3H4ZA 4H5FA 2OWTA 3KSJA 3E9XA 4GLIA 4R75A 4DDDA 1CB6A 3RT6B 4RK9A 4BDNA 3JV9A 4ELRA 4DXUA 2V84A 3MZBA 4DIGA 4EXLA 4NF6B 3R7XA 2GHBA 3UA8A 2REJA 3MVYA 4EQBA 4FEBA 4JWOA 4R72A 3K4UA 4NWCA 1B52A 5LOMA 3KG2A 3OD7A 1B7ZA 1Y3QA 1YPNA 1AOVA 3S9LC 4NF8B 4YICA 2DP8A 1NNPA 3MZ1A 4I9DA 5HPQA 1MY0A 2DOJA 5I57A 4F1VA 2I4CA 4GL8A 4DXBA 2DQVA 3TPAA 3OO7A 2ESNA 3LSLA 3SEXA 3IOWA 2QSXA 3TTNA 4G68C 4F19A 3OENA 1EZOA 4M1VA 1MY1A 3V89B 1IXIA 1P1UA 5CC2A 1RYXA 2DS9A 1EZPA 3RUMA 3RT8A 3GXAA 4H8IA 3MPLA 1FQAA 2O6AA 5I84A 3FIRA 1I6BA 1LB8A 1B05A 2RCBA 3IR1A 5CMCA 1I6QA 1FTJA 3MBPA 4LQ2A 3IJXB 2ZYMA 3MPKA 2QMXA 1UTBA 1MH3A 4QFLA 1MXZA 3MUQA 1PB9A 3LSXA 5JTYB 3T66A 1SW5A 2F36A 5H8HA 2NOOA 4P0IA 3A09A 5AA2A 3KFMA 4R73A 3PPRA 4NE4A 3UP9A 1OLAA 3TYHA 4WKMA 2AL5A 5K2YA 3VDFA 2YLNA 2PYYA 3G3HA 3PPQA 3S9NC 3ONMA 5FHOA 4QFPA 3H06B 3GBBA 1SYHA 1B58A 4U4SA 1H44A 3EHUA 3PMXA 3K01A 4DZ1A 1Q35A 1TFAA 4HTGA 1FW0A 4F31B 3ILUB 5DVFA 2QMWA 2XXPA 3SEVA 5H8NB 1VR5A 4H0WA 1MM6A 3SDFA 3PGFA 3VXCA 2O51A 1OQHA 4F3PA 3FV1A 2REGA 1GVCA 1VE4A 2ABHA 3C33A 4X9TA 5FHNA 4ECFA 2QS1A 2D5WA 5J1DA 3S4UA 2E0SA 1XVXA 3ZS6A 1R6ZA 2P0SA 3W15C 1VFEA 4QSDA 2V3QA 4NF4B 2I3WA 1MDQA 2F8DA 3KN7A 5AA1A 3FV2A 4GXSB 1LBCA 2DYXA 1PBQA 3MP8A 4ZEKA 3U92A 3T9HB 3WAEA 1QUKA 2P1SA 2F78A 1M5DA 3T22A 3UN6A 1BP5A 5TPAB 1T0KA 3N94A 3M3KA 1DPPA 3C9HA 4U4XA 4F2QA 1JW4A 3SEUA 4Z0IA 2UVHA 2I58A 1UTHB 2B65A 3PUYE 2R71A 4FJPA 1QVSA 4JXIA 1KWHA 1B3GA 4NEDA 5CBSA 4NF5A 2HQ0A 2ZMBA 3BBRA 1QUIA 4GD5A 3ILTB 2IEEA 1H45A 2NXOA 3DP6A 4AB5A 3SEYA 4ZEBA 3UK4A 3TTRA 1URSA 3MW0A 1WDNA 3QK6A 5H8FA 1US4A 2OK2A 2HAVA 1TT1A 4IGRA 3RNNA 2XD3A 5KCJA 2NUVA 4EQ7A 5AA3A 3K1NA 1ZKBA 2XXYA 2HZKA 3T96B 1DOTA 2Z8DA 2XXIA 5JEIA 4O3AA 3N26A 2ONRA 4F3BA 3CSBA 2ANJA 4JB7A 3EN3A 4IO6A 2F34A 3K6VA 4U1ZA 3LUYA 1DPEA 3VFJA 1FTKA 1XOCA 3UGWA 1Y4CA 3B7DA 2PVUA 4OENA 2V3UA 3IOUA 3TDJA 1GV8A 1NNKA 3FVNA 2H5YA 4LZ5A 4OESA 4GWOA 4JSDA 1S9TA 4X1BA 1B51A 4HS7A 5L9OA 4JDFA 1D9YA 4PQJA 1JW1A 1ATGA 1B1HA 5DT6A 4G8MA 4U21A 1MPCA 4ND9A 4LATA 5CBRA 1LCFA 5AA2D 1CE2A 4ZEDA 3K1MA 1ZBMA 3TTLA 1B5JA 3OMBA 1A8EA 1FQEA 2PBWA 2Q88A 5TP9B 3G7WA 1P1OA 1SW2A 1JETA 4X48A 3U93A 4OETA 1LAGE 4JSOA 3EF7A 3MC2A 5DEXA 3BFTA 1WODA 1SI0A 4KQPA 3U8QA 5EHSA 4OTEA 1B4ZA 3VLWA 4GFRA 3T93B 4I8CA 4KCCA 4R6YA 2XXVA 2X7PA 1Y20A 3CFLA 2XXTA 2VP1A 2B3BA 4G68B 2FA7A 2QS3A 1SI1A 4FE8A 3TMGA 5KZTA 3QAXA 3CR9A 1IITA 2XXWA 2DXYA 3H3GA 4AQ4A 3G3JA 4NTLA 1MXUA 5JTYA 3KEIA 2CZLA 2AL4A 2HFBA 2O7IA 3PPOA 1ELJA 3SERA 1PB7A 2XD2A 2ZYNA 4F39A 1RYOA 4NMYA 1SDXA 3PMVA 2I4BA 2Y7RA 2M8CA 4YKJA 4MLQA 2A5TB 3D4GA 1MM7A 4ELQA 2XHDA 3KBRA 2BJJX 1B9JA 1MDP1 2B3FA 1MG1A 1B2HA 3O9PA 4H6DA 2PMSA 4F22A 3ODBA 3TZAA 2H98A 3FXUA 2HEUA 2UVGA 1B40A 3RGYA 2P2AA 5L9SA 3K1PA 1M5EA 1MQHA 4X1DA 3FD3A 1LBBA 4QFOA 3I6VA 4LA9A 1M5CA 4OFOA 2XX7A 3H6TA 2XXRA 4LZ7A 3TUSA 2HXWA 3OXNA 4G4PA 4MFIA 4P0GA 3FVGA 1XVYA 3PPNA 2ZYKA 5AA4B 2XX8A 5CMKA 3TFLA 2F7BA 1NMUA 2W7YA 3UORA 4OQOA 4UACA 3LSWA 3OO6A 1P1QA 1N7XA 4TQUQ 3K00A 1EZ9A 1NFTA 4OFLA 1UIVA 2G29A 2KLFA 3PUXE 5I58A 5A5XB 4ESWA 3S9MC 3HN0A 4OEUA 5TPAA 4RY1A 1SYIA 1SW4A 4ELPA 1N0TA 2UXAA 1PDAA 4R74A 3LBSA 1NNFA 3I3VA 1IXGA 1UTHA 2FYIA 4WXJA 1LAHE 3QYTA 1LAFE 4YU0A 4R6HA 1ZTYA 2VD3A 1RKMA 4G77A 3OSQA 1A55A 5I56A 5ICQA 3KJ7A 1XC1A 1AL3A 3V83A 3H6WA 1SVXB 1N84A 4IB2A 4KR5A 4YB7A 3IB0A 3R26A 1R1NA 4GRKA 4FECA 4M4GA 4ZS9A 1LAXA 4KYEA 5K2XA 2XX9A 3SESA 1N76A 1O63A 1IXHA 5M2VA 2RC9A 4MF3A 2DE2A 5IKBA 4IO7A 2Y84A 1D9VA 1A40A 2Q2CA 2R6GE 3M3FA 3S9EA 2V93A 5I2KA 4YB5A 3RPWA 2H4IA 1OIBA 2F97A 4XXUA 1POTA 3VVEA 4C0RA 2Y7KA 4AB6A 4Q0CA 4RK2A 3OEMA 5DTBA 3USDA 5CI5A 2UVJA 5H8QA 2DWAA 1QUJA 2ZYOA 4BDRA 2ALUA 2Z23A 4NWDA 1PEBA 4R9GA 1SD3A 1MY2A 4LVQA 4PP0A 3O66A 4F29A 4BDLA 2NVUB 2ZNUA 2I49A 1MY4A 2QL3A 4R9FA 1DTZA 4L17A 4LZ8A 2X26A 4OWDA 4LQ5A 2QPQA 5TP9A 4LONB 1URGA 1D3KA 3HCQA 4HCWA 4BDOA 1Y3PA 1TWYA 3RN8A 1TXFA 3FVKA 3TCHA 2PT2A 3FZVA 3IX1A 4U1OA 1B7UA 3MVWA 2XXQA 4QFKA 1FQFA 4OXVA 4ONYA 3K6XA 1PB8A 3C35A 2UYEA 1OMPA 5DVJA 1BKAA 1B6HA 3HO7A 5TU0A 4R6KA 3C31A 4PFTA 3PV0E 2F7CA 4G8HA 3B6TA 3ZKKA 1Z7ME 1AH5A 2Q8JA 4H8JA 3OO8A 3KN3A 3O29A 4IGTA 2Y7PA 1MQGA 3IL1B 3W9VA 3O6IA 1ZIUA 3VVDA 4WEPA 5ICTA 3VVFA 3D4CA 5H8HB 2XXXA 3THIA 5FHMA 1II5A 3BFUA 1N04A 1B3LA 1MQDA 1Y1MA 3OSRA 4XKRA 2F6GA 2O1MA 3TODA 1H76A 1MPBA 3FGSA 4ZE9A 1FCKA 3DP4A 3PD8A 2A5TA 3DM0A 3EHSA 1VSOA 2DE4A 4DXCA 4RYAA 3T9VA 5KDTB 1Y3NA 1FTOA 3TTMA 3GBAA 5F1QA 5IAIA 2QJEA 4KPTA 1B0LA 1URDA 1A8FA 4OYVA 3MP1A 3CRBA 3HHFA 1P1NA 4NF6A 5I59B 4YMAA 1LLSA 4BDQA 3IO4A 1FTMA 1B1XA 4JBZA 3TEPA 2PT1A 3C34A 4YKKA 4RXLA 3FJGA 4U22A 5HM4B 1IUDA 3F11A 4ZE8A 1EU8A 3MZ9A 1XT8A 1Y1ZA 4OEVA 1AMFA 4TOZA 4NF8A 2XXUA 4N13A 3G3KA 2THIA 2E1SA 2YJPA 2V25A 3M8UA 3G3FA 3K2DA 1JVXA 3L6GA 3O6HA 5L8DA 2Y7WA 1NNTA 1N3WA 1MQJA 4H67A 4IY5A 5A5XA 3HV1A 1S7YA 1XHYA 1HSLA 1QW0A 3VLUA 2Q2AA 4KD5A 4C1UA 2I6EA 2RINA 1HSJA 3EQ1A 5ISUA 4IO3A 4GOTA 3E3KA 4LUBA 2VD2A 4IO5A 1IZ1A 2RKMA 3K6WA 4RPNA 1MY3A 3TTKA 2Q89A 3P7IA 5I2NB 4K3FA 4QHQA 4DCYA 2ZNTA 3KGCA 4RNSA 1B3EA 1FQBA 3CFZA 1S50A 3TELA 4Z7EA 4YB6A 5H8FB 1MXXA 5B70A 3A3UA 1BLFA 1UQWA 3IO6A 4F3GA 4DE8A 4GIZA 1LCTA 5FTIA 2Z8EA 1M5FA 2HZLA 2I0BA 3MVXA 3RTWB 4F1YA 5EYFA 4YKPA 2GH9A 1B46A 2R9JA 3HSTA 3HHGA 3KZGA 3DELB 3K0VA 1ZMGA 2OWSA 2LAOA 3TCGA 4F18A 3FJ7A 4ZDMA 3Q29A 4BLAA 1NKXA 2X7QA 1DMBA 3KOTA 5H8NA 4IO2A 2VOZA 3MVZA 5BUUA 1FQCA 3CG3A 4TLMB 4MBPA 2I3VA 2DVZA 2YPNA 4ELOA 1MH4A 3UIFA 3IB2A 3CVGA 4FIMA 4KYDA 3O28A 4H1XA 3SKPA 4NF4A 1B4HA 1WVJA 1A99A 3KJTA 3IAZA 2O69A 1LFHA 1I69A 3PU5A 5HBCA 1IEJA 2I0CA 1H3DA 3VXBA 1R9QA 1NH7A 4I62A 5AE4A 2GHAA 4QFNA 4RJZA 4GXAA 3IJOB 1B5IA 4GQOA 5DEXB 4QF9A 1QULA 4DLDA 3FXRA 4Q8RA 3O97A 1ZJLA 4N07A 4FEDA 4BDMA 3GZGA 3PD9A 4GL0A 2F6PA 3IOVA 1USYE 2OCUA 3ECRA 3MJNA 2O68A 2RC7A 1JEVA 4N6PA 2PX1A 3N5LA 4IY6A 1US5A 1OLCA 2DSFA 2DXRA 3H6UA 3KOSA 4OZ9A 1YTVA 3TQWA 1DSNA 4XKPA 1HSEA 3RTFB 1B3FA 1L5TA 3K02A 3U1OA 2OZZA 4EDPA 3GLBA 3V8XB 4XIGQ 4FORA 4KCDA 4RPOA 4U2RA 3V5AA 1B0HA 4PFYA 4OERA 2DVCA 2GRVA 4KI0E 3W9WA 2O84X 3JZJA 4U23A 1PC3A 3PPPA 2H25A 4R2BA 1ZLQA 2NWJA 4H5GA 1SBPA 4G2ZA 1JQFA 1FQDA 5FTHA 2H9BA 3LSFB 3FUZA 3KSXA 4ESXA 1D4NA 2G93A 5KDTA 5F7VA 3TAJA 5JK4A 1LGBC 1O64A 4GVOA 4XTCQ 4DCXA 3OELA 1B32A 3TQLA 1GGGA 3HPIA 3C32A 1AIVA 1OVBA 4PETA 3TKDA 3OOAA 3FXQA 3C36A 2D21A 2F5XA 2OJTA 3DLNA 1LFIA 3CFXA 5I59A 1YAEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F35A 1LFGA 3L6HA 5EHMA 1FSAA 2QRYA 4PF6A 4PFIA 3E13X 1B5HA 1O7TA 4PCDA 3O2AA 4OVTA 1SW1A 3RPLB 4UA8A 1YCJA 3R6UA 4ZEFA 5I57B 1BIYA 4HW8A 1OVTA 4JWXA 3Q27A 4XFEA 3QIMA 4OVJA 4Q30B 2GFEA 5L9MA 4GBVA 4Q5TA 1MXVA 1J1NA 2CMOA 4ZECA 2O7UA 4GWUA 4QBAA 5I58B 4OMBA 4MJOA 3LC8A 4XKQA 4YKIA 4EUOA 2DWHA 3EPEA 5ET6A 1A7LA 1M5BA 1JNFA 2H99A 2RCAA 3B6WA 3B50A 3H7MA 4WEDA 4MLVA 1RDZA 2OBGA 1B3HA 5EQ7A 3CHGA 1NUXA 4ZEIA 3G3IA 4PFUA 1VFDA 1FTLA 4KFQA 4PE5B 5ESYA 4RA1A 3VV5A 3OO9A 1IXCA 3VLVA 4G68A 2GQ1A 1PBPA 5I56B 1UTBB 3PMWA 3A29A 1SQYA 3TCFA 1EYKA 5LDZA 3QSLA 3OEKA 1RDYA 4P1EA 5I2NA 3O6GA 1MS7A 3FJMA 4R2FA 5AA2B 1GTKA 1ANFA 1QJMA 4GWXA 4F2OA 2WYPA 3CI8A 4P8BA 1N7WA 3MQ9A 3T9XB 3CIJA 1IIWA 5CM6A 3KN8A 4YZZA 3PTYA 2FNCA 1I6AA 4OHNA 1EH3A 2Q9TA 3JYRA 1LBWA 5CRYA 1POY1 2UYFA 2V3TA 3FVOA 2HCAA 1LB9A 1LBYA 2QVRA 4AS5A 2IA4A 3VE1B 1P99A 4PFWA 2CZKA 3BKIB 2Y7IA 3PUWE 3N6TA 2WBBA 1IMEA 4TLLB 4ZZAA 3RYDA 3LR1A 4P11A 1MXWA 1MRPA 5I2KB 2I48A 1UIUA 4XKNA 3QXMA 5ELVA 3SZPA 4MH5A 3RY3A 4THIA 3H03A 1MQIA 3N6UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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