1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
1TT1A 3ILTB 2ZXTA 5HM4B 3TDJA 5AA2D 1ATGA 2G29A 4F1VA 2HQ0A 1D3KA 3IOTA 1MS7A 2F36A 1IXGA 3SEWA 3N94A 4DXCA 4GWOA 2GRVA 3TTRA 1I69A 2PX1A 2NVUB 4X1BA 4LVQA 2RC7A 1H44A 4QFPA 2QPQA 2F7BA 2Z22A 3TZAA 1SYHA 4OHNA 3V5AA 3FUZA 5H8HB 3MQ9A 5I84A 3GLBA 2O51A 3FGSA 1MPBA 4ELRA 3G3GA 4EXLA 3Q28A 3H6UA 3T66A 2ZYOA 3LSWA 3K01A 1B46A 3LR1A 3KZGA 5FHOA 4RYAA 2CZLA 4DIGA 1FTJA 1FTMA 5DVFA 4EQBA 1S50A 4QFOA 1S7YA 1WVJA 5TP9B 4M4GA 3VVEA 1QJMA 4OETA 4F1UA 1RKMA 4G8MA 1N7XA 2O1MA 3B6QA 4FORA 2H25A 2HAVA 4PFTA 2NUVA 1BLFA 3L6GA 4F1YA 4OZ9A 3SEXA 1CE2A 3KGCA 4QSCA 3A09A 2NOOA 3K1NA 4ZS9A 3FVGA 4XXUA 1HSEA 1B1XA 1H45A 4IO2A 2DOJA 3VFJA 2O68A 2DXRA 1N04A 3HV1A 4F3BA 2H9BA 3FVNA 1R9LA 2D21A 1DPEA 3D4GA 1IXHA 1MY2A 3TTLA 2VD3A 4E0XA 1JVYA 1N3XA 1B32A 2PT2A 1MDQA 3RTWB 3B6TA 4YMAA 5ICTA 2H5YA 4JWXA 2V3UA 4ESWA 2XXRA 1YCJA 3QSLA 2Q8JA 2F7AA 2XD3A 2QMXA 2VGQA 3C31A 2H4IA 1AH5A 4OWDA 2W7YA 4KYSA 3MVWA 4XKRA 3VE1B 1BKAA 1F9BA 4JWOA 3RT6B 4FECA 1IXIA 4TLMB 1IITA 2D5WA 1URGA 3PUYE 4OEUA 2H99A 3V83A 4G77A 2I49A 5KZTA 5L9OA 4FE8A 4OFJA 4ZZEA 2XX9A 1B5IA 4O3BA 2O69A 3EHTA 1BP5A 3E13X 3JZJA 4QSEA 3G7WA 1XVYA 2ANJA 3R7XA 1KWHA 3VV5A 1SYIA 1AOVA 4OQOA 4KCDA 2QL3A 3JV9A 1LB9A 3A3UA 1H3DA 3MZ9A 1B6HA 1M5EA 4NWCA 4QFNA 1NFTA 2DE3A 3PPOA 4TOZA 4JDFA 3ILUB 4NF5A 4WEPA 2XXQA 1R9QA 3T96B 3TKDA 4ZDMA 5CM6A 5DT6A 3PPNA 4HCWA 1I6BA 1MRPA 2REJA 2Z23A 2ZMBA 3Q29A 4QHQA 2ABHA 1SBPA 1A54A 4YMBA 2YJPA 1HSJA 2I58A 4NF8A 4ELOA 3KJ7A 2B65A 4LQ2A 5BWJA 2REGA 4F18A 4OEVA 1Y3PA 4H6DA 4YAHX 3MVZA 4H8JA 4YU0A 1YPNA 2O1LA 4H5FA 2FYIA 3MVYA 1DTGA 5IAIA 3CG3A 1Z7NE 3T9HB 1DPPA 2X7QA 1B5JA 3M3FA 1LBBA 3A3CA 1FQBA 1Q35A 3VLWA 3MUQA 1FTLA 3FV1A 1IQ7A 4ESXA 4KFQA 3S9MC 4PFUA 4U1ZA 3U93A 2NWJA 3LC8A 1JW1A 1VE4A 1H43A 5AA3A 4NF5B 5L9SA 2IA4A 3RLFE 4OFLA 3C35A 5CMKA 4JSDA 3OOAA 1JVXA 5B7DA 4BLAA 3Q26A 1SW2A 1II5A 3WAEA 1LAXA 1B58A 1B4HA 5BUUA 1PBPA 1MH4A 2X26A 3HHGA 1H76A 4NF8B 3C34A 3MBPA 3HO7A 3QYTA 2Z8FA 1MXYA 4XTCQ 3GBBA 4DZ1A 1GV8A 1IXCA 4RNSA 2V3TA 2DE2A 3DP8A 1B3LA 3UORA 1IEJA 1XT8A 1UTHB 5A5XB 4R2FA 4YICA 3RPWA 3JYRA 1Q1KA 4O3CA 4KI0E 3TUSA 3DLNA 3VVDA 3S9EA 3RN8A 3PPQA 1LB8A 3PU5A 2P0SA 1JNFA 2VHAA 4IGTA 3DM0A 3E3KA 2PVUA 1R1NA 3FVOA 4QSDA 4LUBA 4XKQA 3MWBA 1LAFE 1XHYA 2ZNTA 3IOUA 1B5HA 1QUKA 5JTYA 4Q5TA 5KDTA 4QFLA 4YKPA 4F3SA 1AL3A 1B1HA 3OXNA 4ELQA 2F6GA 1RYXA 1Y3QA 1A8FA 4F31B 3VXCA 4OYVA 5FTIA 2XXVA 1MXUA 2ALUA 1IZ1A 5DTBA 2DWHA 2OK2A 3TPAA 4GXSB 4U4XA 4BDNA 2F34A 3G3JA 4ZECA 3H3GA 4EF1A 3FATA 1OLAA 3SKPA 1LSTA 3F11A 2M8CA 3SERA 4LATA 3SEUA 5AE4A 4YB7A 2Q88A 4IO3A 5HBCA 5H8QA 1FQEA 4OESA 3IB1A 3THIA 3OO8A 2E1SA 4XIGQ 5LOMA 3IK6B 3KJTA 3TCGA 5JTYB 4POXA 3N6UA 2RKMA 4PP0A 3T9UA 3MZBA 1GVCA 3PUVE 2V84A 4RK2A 1B2HA 1SVXB 3G3IA 4UA8A 4LA9A 1JW4A 3TEPA 2R71A 4NWDA 4K3FA 1WDNA 4N6PA 3H06B 4GL0A 4KR5A 2P2AA 3KBRA 3M3KA 2F6PA 4IO4A 2DWAA 3USDA 3EPEA 3IOWA 3TQWA 4R74A 5FHMA 4WEDA 3KSXA 2V93A 4JSOA 3WAFA 4H1XA 4Q30B 4IY5A 2ZYKA 3R6UA 5CMCA 2OWSA 3TYHA 5KCJA 2G93A 4Z0IA 4E0WA 2PT1A 1VSOA 4MLVA 3TFLA 3SEYA 1EH3A 5J1DA 3PMXA 1M5BA 1DSNA 4N13A 2RCAA 1QVSA 2OZZA 4DDDA 3KFMA 3N26A 4F29A 1PBQA 1XOCA 1LGBC 3EHSA 4U2RA 2I3VA 1QUIA 1NKXA 3M3LA 3KOSA 3W15C 4ND9A 5I2KA 2ZNSA 3LSXA 2RCBA 4DCXA 1QUJA 3FJGA 1MY3A 4R9FA 1N0TA 3OSRA 1A40A 4EDPA 1LBCA 4O3AA 4C1TA 1XC1A 4PQJA 3C33A 5CMMA 2UXAA 3I3VA 4PFYA 1MDP1 4G8HA 2F7CA 3BFUA 1GR2A 4OMBA 4H0WA 4OTEA 1B40A 1B3FA 4MBPA 1ZIUA 2XXWA 3IO6A 3OO6A 1B7UA 3N5LA 4GL8A 4ZZAA 3IAZA 1MM6A 2XXTA 4NTLA 1FQFA 3K6WA 3U72A 5HPQA 5KCJB 1PEBA 3KN7A 1FTKA 2A5TA 1UQWA 3P7IA 2DYXA 3KN8A 4YB6A 4BDMA 3CVGA 4F3GA 1POTA 2UVIA 5K2XA 1O7TA 3ZSFA 3LBSA 4OXVA 4UACA 1SW5A 3O6HA 2Y7KA 2Y84A 4M1VA 3PMVA 4FATA 1PB8A 3DP6A 3PUZE 3IO4A 3MVXA 3FXUA 2QSXA 3U92A 4XKPA 1P1OA 1QW0A 2HAUA 4AQ4A 3G3KA 4OFOA 3CG1A 2HZLA 1NNKA 2UYEA 3C9HA 5EHMA 3IJOB 1O64A 3SEVA 1SQYA 3GZGA 1NMUA 3QXMA 3TTKA 2YPNA 4Z7EA 4JB7A 4EF2A 2AYSA 4U22A 2DVZA 4RK9A 5EHSA 1ZBMA 4GFRA 1IIWA 1O63A 3S4UA 3O28A 3CI8A 4C1UA 5JEIA 2VOZA 1IUDA 2A5TB 1FQCA 4F39A 1MY1A 1QULA 2QRYA 1UIVA 3TQLA 3TMGA 3GBAA 4IB2A 4R6YA 3O29A 3KEIA 3VLUA 4GVOA 1EU8A 1P1QA 5CBRA 4IO5A 3MJNA 4F3PA 3CFZA 3W9WA 2DS9A 3O6IA 1MXWA 1MQIA 2RC8A 3ZKLA 1Y4CA 1Y9UA 4RA1A 4KD5A 1LAHE 1Z7ME 3UGWA 3MAMA 2UVGA 1ZKBA 5ITOA 3K02A 2OCUA 3I5OA 1GTKA 1MXXA 4NF4A 2UVJA 3MP1A 1MQJA 1OQGA 5CC2A 3EHUA 4AB6A 4WKMA 3VLVA 2Y7IA 1FTOA 3CR9A 3TTNA 5L8DA 3H6VA 3O9PA 5K2YA 1Y1ZA 2IEEA 3TCHA 2X7PA 5EYFA 2QJEA 1POY1 3IX1A 1B0LA 5AA1A 3T22A 5TU0A 2I48A 1USYE 1URSA 2AL4A 4I62A 2XHDA 2XX7A 1Y1MA 3OO9A 3O6GA 4X48A 2I0BA 2B3BA 1B05A 2HFBA 2KLFA 4IY6A 1TWYA 2XXYA 3T93B 1LFIA 2THIA 3OEMA 4KYDA 1MQGA 4H8IA 1FQDA 2QS2A 1MQDA 2O7UA 1EZPA 1EZOA 1OVTA 3U1OA 4L17A 3RUMA 3MPLA 1B51A 1BIYA 2XXPA 1P1WA 2GFEA 1Y4TA 2Q2AA 3BKIB 5B70A 1FW0A 1UTBA 4G8NA 3IJXB 2P1SA 3CFLA 3MP6A 3ODBA 4FAJA 1MPCA 5CI5A 1B0HA 1ZTYA 2XD2A 4OERA 3I6VA 1P1UA 3SESA 2R6GE 2ONRA 1ELJA 2RINA 1YAEA 4EXKA 3IORA 3UK4A 1YTVA 4U23A 1ZU0A 1BTJA 3MP8A 3R26A 5IKBA 3LSFB 1M5FA 2O7IA 2O6AA 1MG1A 1SW1A 3O97A 5FHNA 4R2BA 4U21A 3PPRA 1NH8A 3IOVA 1MXZA 1JEVA 3K1PA 2HZKA 4RJZA 5I58A 3W9VA 2I4CA 4DE8A 1DTZA 5H8HA 3OD7A 1JW5A 4HW8A 4ISUA 4GXAA 3S2VA 1LCTA 1N84A 2DP8A 4LONB 4HS7A 3E9XA 4GOTA 4C0RA 2UVHA 1B52A 3IL1B 1M5CA 3D4CA 3HN0A 3K4UA 5TPAA 2ZYMA 1DOTA 2PMSA 1JQFA 1SD3A 5KDTB 1PB7A 4YKKA 1UTBB 2F97A 2GH9A 4IO7A 4F2QA 2XX8A 1TXFA 4EQ9A 2DWIA 3EN3A 3KOTA 5AA2A 2ZNUA 3K6UA 3U94A 2QS1A 1P1NA 2A5SA 3OELA 3FIRA 2Y7RA 2Q9TA 3QUJA 4PE5B 5JK4A 2RF1A 3OMBA 1A99A 3UN6A 1EZ9A 4ZEBA 3K00A 4U4SA 1LFGA 1NH7A 1N76A 4R73A 5DVIA 5I59A 1VFDA 1OQHA 2DWJA 1TFAA 2VP1A 4QF9A 4POWA 2F8DA 4QFKA 1SDXA 1D9VA 4G2ZA 4PFWA 1US4A 1DMBA 5CMBA 2Z8DA 4ZE8A 4LZ7A 5I58B 3MPKA 3QIMA 3OSQA 1VR5A 4N07A 3C36A 3PUXE 3SETA 2XXHA 5CRYA 4KYEA 3H7MA 3B6WA 3ECRA 3BFTA 4RY1A 5H8QB 5F1QA 2PYYA 1US5A 2Q2CA 4ZEKA 2OWTA 4BDQA 2DXYA 2XXUA 3PV0E 3BBRA 4EQ7A 3K2DA 3E4RA 1JEUA 3CSBA 5TPAB 2DE4A 4YB5A 1A8EA 1B4ZA 2YLNA 3UIFA 1J1NA 4I9DA 2Z8EA 2H98A 2QMWA 3FJMA 3ZS6A 4NF6A 4KQPA 5AA2B 2GHBA 1A7LA 2E0SA 3N6TA 4GIZA 4EUOA 4F22A 3UP9A 3O66A 4WXJA 3K6VA 1ZMGA 4U1OA 3B7DA 2RC9A 4H5GA 3U8QA 5I59B 1S9TA 2BJJX 5L9MA 3KN3A 4R9GA 2I4BA 1MPDA 5ELVA 3OEKA 3MC2A 3CIJA 3M8UA 4HCYA 3MZ1A 5I57A 3MW0A 1OIBA 1B3GA 2GHAA 1B3EA 1B9JA 3SDFA 4XKNA 4R6HA 2VD2A 1CB6A 4MH5A 4JBZA 1TFDA 3O2AA 3AXFA 2HEUA 2CMOA 1PDAA 5M2VA 1QKAA 5AA4A 3FD3A 1D9YA 3S9LC 3H6WA 2Y7WA 4DCYA 4F2OA 2LAOA 3H6TA 2AL5A 1AIVA 1WODA 1SW4A 4KPTA 4QRZA 3VVFA 4FEBA 2OLBA 4ONYA 3QUFA 2F78A 3FXRA 3PMWA 1MM7A 1N3WA 1UIUA 5I2KB 4NF6B 2DVCA 3H03A 3C32A 3T9XB 3V89B 4P0IA 2B3FA 2QS4A 4TLLB 2V25A 3Q27A 4DXUA 5I2NA 4JXIA 4KCCA 2OJTA 1P99A 2WKYA 3S9NC 1ANFA 2Y7PA 4Q0CA 5I57B 1ZLQA 3PD8A 4G4PA 3G3FA 1XVXA 3RTFB 2V3QA 4ECFA 5AA4B 1HSLA 2I3WA 3CSGA 3PD9A 4P0GA 1T0KA 3FJ7A 2I6EA 4G68C 3UA8A 3KSJA 1A55A 3Q25A 1NNPA 1MY0A 4YKIA 1Y20A 2XXXA 4GD5A 2UYFA 4GLIA 4I8CA 3FV2A 4OENA 3QK6A 3FZVA 1OVBA 3IB0A 2DQVA 3TTMA 1I6QA 1MQHA 2NXOA 5I56A 3PPPA 2ONKE 4ZEDA 3QAXA 4P11A 5DYHA 1N7WA 5H8FA 1FQAA 1QKBA 2DSFA 3V8XB 3C4MA 2R9JA 3HHFA 1SI1A 4LP2B 1UTHA 5I2NB 4LQ5A 3K6XA 5A5XA 1B7ZA 4ZEIA 1LLSA 4X1DA 1URDA 3IR1A 4DLDA 4RXLA 4YKJA 2ZYNA 3RT8A 1LFHA 5F7VA 4TQUQ 2QS3A 3DP4A 5FTHA 4RPNA 3HCQA 3DELB 1NL5A 3K1MA 3EQ1A 3ONMA 2HCAA 1L5TA 4KHZE 3ZKKA 4IO6A 1USYH 4MLQA 4MFIA 3RNNA 1AMFA 1LAGE 1PC3A 2FNCA 5H8NA 2ONSA 3LSLA 3LUYA 4RPOA 3RGYA 3PGFA 4H65A 1D4NA 1NNTA 3TCFA 3TELA 3VXBA 3RY3A 1MXVA 3OENA 4YZZA 1NNFA 5DVJA 4NEDA 5I56B 1ZJLA 5DEXA 5H8FB 2HXWA 4G68A 3GXAA 4GRKA 4R6KA 3PUWE 4NMYA 3RQTA 4PETA 4H67A 3HPIA 4FJPA 2I0CA 4ZEFA 4NF4B 2OBGA 1SI0A 3OO7A 3T9VA 3CRBA 4F19A 2O84X 2PBWA 4GQOA 4FEDA 3FXQA 1B3HA 4THIA 1GGGA 1PB9A 3EF7A 3HSTA 4BDLA 2XXIA 3FASA 3VDFA 5H8NB 2FA7A 1R6ZA 3G3HA 2Q89A 4R75A 2F35A 4MF3A 1FCKA 4NE4A 2ESNA 1OMPA 3TODA 4ELPA 4GF8A 1MY4A 4BDOA 4OVJA 4Q8RA 5ICQA 1VFEA 4LZ5A 4R72A 3TAJA 4HTGA 4I1DA 4LZ8A 3KG2A 4JWYA 1XS5A 1MH3A 3K0VA 1JETA 2AIXA 5ISUA 1B7HA 3FVKA 5ITPA 3CFXA 5DEXB 1M5DA 4G68B 5CBSA 2F5XA 4X9TA 4ZE9A 1LCFA 4BDRA 4DXBA 1Y3NA 4IGRA 3IB2A 3L6HA 5H8SA 1RYOA 1I6AA 3H4ZA 5TP9A 1OLCA 2D3IA 4AB5A 4FIMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TT1A 3ILTB 2ZXTA 5HM4B 3TDJA 5AA2D 1ATGA 2G29A 4F1VA 2ZZVA 2HQ0A 2XWOA 4OVSA 2F3DA 1D3KA 3IOTA 1MS7A 5IM2A 2F36A 1IXGA 3SEWA 2GQ1A 3N94A 4DXCA 4GWOA 3IFAA 2GRVA 1FJ6A 3TTRA 1I69A 2PX1A 1CNQA 2NVUB 4X1BA 4LVQA 2RC7A 1H44A 4QFPA 2QPQA 2F7BA 2Z22A 3TZAA 1SYHA 4OHNA 3V5AA 3FUZA 5H8HB 4QXDA 3MQ9A 5I84A 3GLBA 2O51A 3FGSA 1MPBA 4ELRA 3G3GA 4EXLA 3Q28A 3H6UA 3T66A 2ZYOA 3LSWA 3K01A 1NV7A 1B46A 5IZ3A 4QBAA 3LR1A 3KZGA 4OA4A 5FHOA 4RYAA 2CZLA 4DIGA 1FTJA 1FTMA 3MYUA 5DVFA 4EQBA 1S50A 4QFOA 1S7YA 1WVJA 5TP9B 2QVRA 4GX4A 4M4GA 3QMFA 3VVEA 1QJMA 4OETA 4F1UA 1RKMA 4G8MA 1N7XA 2O1MA 3B6QA 4FORA 2H25A 2HAVA 4PFTA 2NUVA 4MHFA 1AWBA 1BLFA 3L6GA 4F1YA 4OZ9A 3SEXA 2XA5A 1CE2A 3KGCA 4QSCA 3A09A 2NOOA 3K1NA 4ZS9A 3FVGA 4MAGA 4XXUA 1HSEA 1DK4A 1B1XA 1H45A 4IO2A 2DOJA 3VFJA 2O68A 2DXRA 1N04A 3HV1A 4F3BA 4OVPA 2H9BA 2KR0A 3FVNA 1R9LA 1NUXA 2XXKA 2D21A 3SZPA 1DPEA 3D4GA 1IXHA 1MY2A 3TTLA 2VD3A 4MNCA 4E0XA 1JVYA 1N3XA 1B32A 4GWWA 2PT2A 1MDQA 3RTWB 5IZ3B 3B6TA 4MX6A 4YMAA 5ICTA 2H5YA 4JWXA 2V3UA 4ESWA 2XXRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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