1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
3CFZA 1B7HA 1M5CA 1B5IA 3TAJA 3GLBA 4GWOA 4KD5A 3H6VA 3OMBA 1NNTA 3QIMA 2Z8EA 3IL1B 4OYVA 2HEUA 4EQBA 1TT1A 1MG1A 5CMCA 4DCXA 1JVYA 3CSGA 2I3VA 5I58A 2O51A 5CMMA 3VDFA 3TTMA 1US4A 3HSTA 2B3FA 2REJA 2QMXA 4Q5TA 1O63A 2F34A 2NVUB 1UTHA 2OCUA 4QFPA 3MUQA 3HV1A 1USYE 2B65A 2VGQA 5HPQA 2F5XA 1BIYA 3MPLA 3Q28A 3TCGA 1MQHA 2FA7A 1B9JA 4MLQA 1MM7A 3O28A 4GFRA 4ND9A 4QFOA 5K2YA 2OJTA 3VVDA 3IO4A 1XC1A 3K6WA 3IORA 4JWXA 3KSJA 3KOTA 1URSA 3S9NC 5TP9A 2I0BA 2GH9A 1MXYA 2LAOA 3IOTA 1B7ZA 2QPQA 1PBPA 4KI0E 3RGYA 3PPRA 3ZKLA 3T9UA 1FQAA 5A5XB 3T96B 4KR5A 3SDFA 4HTGA 4BDQA 5CMKA 3TUSA 1SDXA 3R26A 4GLIA 3JV9A 1LCFA 2D3IA 3IB1A 3MP6A 3HO7A 4IY6A 2UVHA 3RT6B 4R2FA 3TODA 3SEWA 3RTWB 3PUZE 4X48A 1B40A 1RYOA 2XXQA 4DZ1A 3EHUA 4LA9A 5I56B 5FHOA 1B3FA 3T93B 2I49A 3OSRA 2DE3A 4ZZEA 2E0SA 5ICTA 1PB7A 5DYHA 1EH3A 2HZLA 1QW0A 3KN7A 4OQOA 4H5FA 3I3VA 3RTFB 4I62A 4ZEKA 4EXKA 4FAJA 3ZKKA 5B7DA 1QKAA 2DSFA 2ANJA 4NWCA 4DCYA 3E3KA 3S9EA 1Y4CA 5BWJA 1NFTA 3N6TA 2ZYOA 4OEUA 5H8NB 3L6HA 4EF2A 2O7IA 4F31B 1Y4TA 3BFTA 3S9LC 3THIA 1H76A 2NXOA 3KFMA 1SI1A 1NMUA 3UIFA 5I84A 2HXWA 1P1QA 1H45A 2XXHA 4R9GA 3TELA 2IA4A 2DWJA 2UXAA 3C32A 4M1VA 5KZTA 4ELPA 4Q8RA 5L9MA 1ZJLA 4KYDA 1JETA 4POXA 1SW2A 4FJPA 3H6TA 4ZEIA 2O68A 3H03A 2Y84A 4AB6A 5AA4B 2BJJX 1LFGA 3PUVE 1MDQA 3HCQA 2PT2A 5A5XA 4G68C 3CG1A 4WXJA 1B4ZA 4PFTA 3HHGA 3K4UA 3SEUA 4F18A 2DE4A 4OFOA 4C0RA 4RK2A 2F35A 1A99A 4EQ7A 1NH8A 3VVFA 4R6HA 1MXXA 2GFEA 2X7PA 4Q0CA 2DXYA 4MFIA 3KJTA 5H8HA 3U1OA 1B46A 3CVGA 3KZGA 3EPEA 5TU0A 1TWYA 1LLSA 1JNFA 2F7CA 4Q30B 3K6UA 3V8XB 3PD8A 4ESXA 1B2HA 3MZ1A 4IGRA 5I57B 3D4GA 3KN8A 2DWIA 4YKKA 2OWSA 5I56A 3K6XA 3HHFA 1MPCA 1MY4A 4LUBA 3N94A 3B6WA 4R75A 1B32A 4IO3A 3A09A 1MM6A 3MVXA 3R7XA 3SETA 3JYRA 1ZBMA 4RPOA 1A8EA 2UYFA 2Q8JA 4XKNA 2DVZA 1H44A 4I9DA 2PVUA 1LGBC 2PX1A 3TTNA 3OXNA 2A5SA 3O6GA 4AB5A 3PPNA 4NF8B 3O6IA 3B7DA 1UIVA 4QRZA 1P99A 3O6HA 4OXVA 5H8NA 3OOAA 4QF9A 5L9OA 3IB0A 2DS9A 1RYXA 3Q27A 4F39A 1FQFA 2HAVA 1OVTA 2Y7RA 5I58B 3IOUA 3U8QA 4H0WA 3O2AA 4Z7EA 2PT1A 4OFJA 3V83A 3TTLA 4P11A 4ZECA 1YCJA 1IIWA 1R1NA 2QS2A 3IJOB 1UTHB 2F36A 4DLDA 1MS7A 1N0TA 2AL4A 3QUFA 1IUDA 3OD7A 3S9MC 1A55A 4F1VA 1XT8A 1DPPA 5M2VA 3D4CA 1Y3NA 3G7WA 3P7IA 2HAUA 1ZIUA 1GVCA 1NL5A 3KSXA 4DXBA 5TPAA 1JW4A 4THIA 2NWJA 3K00A 2I48A 1M5DA 3QSLA 5AA2D 3H4ZA 2QL3A 3MPKA 5DTBA 4H1XA 3DP6A 3PMXA 4OEVA 4RNSA 4MLVA 2NUVA 1VE4A 4FATA 4OFLA 5I57A 5AA3A 4OESA 1QUJA 2GHBA 4E0XA 3LBSA 2H9BA 3VXCA 4YU0A 4KQPA 1LAHE 1FQDA 5H8QB 3W9VA 1LAFE 2XXPA 1B51A 4R2BA 1SBPA 1Z7NE 3VVEA 1ZMGA 5CMBA 5KDTB 4LATA 1P1WA 2DWAA 2Q88A 4ZE9A 1IXGA 3QK6A 2ZYNA 4M4GA 4ZEBA 4H67A 4NF8A 3OEMA 4GOTA 3FUZA 5FHMA 4TQUQ 2R71A 1JEVA 1POTA 1SYIA 1RKMA 3SERA 2GHAA 3PUWE 4O3CA 2V93A 5B70A 4FIMA 3TEPA 4YKPA 4ZDMA 1MQDA 4XIGQ 2Q89A 4GIZA 1MXWA 1B7UA 2XXWA 1IZ1A 3IJXB 2V3TA 3IK6B 2XXXA 3PD9A 4KYEA 4UA8A 4O3BA 1SW4A 3FGSA 3KBRA 3MP8A 3QUJA 3H06B 1QJMA 4NF6A 1D9YA 3PPPA 3FVGA 1LFIA 1DTGA 3KOSA 1ANFA 2DYXA 1A40A 3O9PA 3DLNA 3H7MA 1HSJA 2QMWA 4JWOA 2Y7IA 1YTVA 3OO7A 1TFDA 2Z8FA 2XX7A 3QAXA 1T0KA 4F1YA 3Q25A 4OVJA 5CI5A 4F2QA 3MAMA 3EF7A 4E0WA 3CIJA 2ZYKA 1LAXA 3MC2A 3UP9A 3E9XA 3UGWA 3EN3A 3TKDA 2CZLA 3F11A 3B6TA 4EF1A 1I69A 1B3HA 1UQWA 3PMVA 1A7LA 4QSCA 4PFYA 2RF1A 3VE1B 3O29A 3MJNA 1R9LA 1PB8A 1MRPA 3I5OA 3C4MA 4QHQA 3Q26A 2ONRA 1LB9A 3PU5A 4N13A 3H3GA 2H98A 4F29A 1FW0A 5EHSA 5H8QA 3DP8A 4ELOA 2I4BA 5FTIA 4X1BA 5FTHA 1ZU0A 1SW5A 3DELB 4LONB 3MBPA 3MZBA 4NEDA 5KDTA 3ZS6A 4G68A 3K0VA 1LB8A 4FORA 4XTCQ 1M5EA 2Z22A 2O6AA 4U22A 4P0GA 4R72A 5H8HB 3OEKA 3CR9A 2UVJA 5HM4B 4LP2B 3G3GA 4JDFA 3TTKA 1B1HA 2FNCA 2Y7KA 1HSLA 1YAEA 2Q9TA 2FYIA 5JTYA 4ZEDA 3FIRA 3TZAA 5ITPA 1UTBB 2ZMBA 1D3KA 1B3LA 5I2NA 3QXMA 3GZGA 3TCFA 3EHSA 4JSDA 4G4PA 4I1DA 3OELA 1EU8A 2VHAA 5CC2A 1Y1ZA 4KCDA 2XXTA 3BKIB 4C1UA 4EXLA 4YB7A 1FTMA 1GR2A 1ZKBA 4KCCA 1XVYA 3L6GA 1MH3A 3FJ7A 4R73A 1I6AA 4NTLA 4PQJA 2RKMA 5AA1A 4GF8A 4ESWA 1PBQA 4DE8A 4OERA 3E13X 2RC9A 3C9HA 4PFWA 1Z7ME 4K3FA 3SEXA 2O7UA 3BFUA 3SEVA 4IB2A 2Q2CA 3IOVA 3VLUA 1EZPA 2O84X 3IX1A 4RA1A 3RLFE 1N84A 1DOTA 2F6PA 2X7QA 2W7YA 3RUMA 2RCBA 3M3FA 2F7AA 4RXLA 3T9XB 4LZ8A 3TPAA 3DM0A 2P1SA 2I3WA 4H5GA 4YAHX 4GRKA 4IO4A 1LAGE 4GVOA 4JSOA 4YB6A 4F1UA 3HN0A 3MZ9A 2B3BA 3K1NA 3U93A 3TYHA 1QVSA 1BKAA 4HW8A 3OSQA 4NF5B 2KLFA 4YMAA 3MP1A 5TPAB 5L9SA 3H6WA 3CFXA 2ZNSA 3LSWA 5F7VA 3TMGA 1IITA 5FHNA 3K2DA 4DXCA 3FD3A 4WKMA 3ODBA 3CI8A 1UTBA 3PV0E 2IEEA 2XXIA 3N6UA 3CRBA 1NNKA 2QJEA 3C33A 1N04A 4MH5A 4P0IA 4YZZA 1IXHA 1FTJA 3EQ1A 4BDNA 4F19A 4F3BA 2HCAA 3VFJA 1AL3A 3FZVA 1B1XA 1OIBA 4ELRA 3W15C 3MW0A 3RN8A 3G3HA 2ALUA 2ESNA 3EHTA 3DP4A 1B52A 4RY1A 1VFDA 4R6KA 5H8FA 4PETA 1N7XA 4G77A 3UK4A 3V89B 2F7BA 2OBGA 1M5BA 4KHZE 4BDRA 2OK2A 5K2XA 4RYAA 5DVIA 1TFAA 2WKYA 1MY3A 1FQCA 4H65A 2I0CA 4JB7A 2DOJA 4HCYA 4ELQA 4NF6B 2Y7PA 5DVJA 3QYTA 1MQGA 2G29A 4IO2A 3CG3A 4IY5A 4BDMA 1USYH 1FTOA 2YPNA 3N26A 2XXRA 4ZE8A 1SYHA 3RPWA 1O64A 3C35A 1P1OA 3PUYE 4FEDA 4F2OA 4TOZA 2RC8A 2ZNUA 1GTKA 3A3CA 4QSEA 4NF5A 1B58A 1XOCA 4G8HA 1B3EA 1OVBA 5I59A 1WDNA 2I4CA 4BLAA 2F78A 1AIVA 2ZYMA 4C1TA 4XKRA 3K01A 3ILTB 2QSXA 1MQIA 3OENA 3HPIA 1B5JA 4U4XA 4TLLB 2X26A 1SI0A 2QS3A 3U92A 3MWBA 1SQYA 4DDDA 4YKJA 1S50A 3VXBA 5DEXA 5J1DA 5DVFA 2THIA 2PBWA 3UA8A 2R9JA 4PFUA 4OMBA 3SEYA 2H99A 2AIXA 4IO5A 2F6GA 1JW1A 4GQOA 2QRYA 4G68B 1AH5A 2H4IA 4AQ4A 4OHNA 4DIGA 3MQ9A 3LSLA 1OLCA 3Q29A 2I6EA 2XX8A 2XD3A 1Q1KA 3KG2A 5JTYB 3C31A 3IR1A 1URDA 1A54A 5I2NB 4F3SA 4ECFA 4R74A 4KFQA 4U4SA 1BTJA 2RCAA 2YJPA 2REGA 5CRYA 3K1MA 2VD2A 3T9VA 1US5A 2HFBA 5I2KA 4H6DA 4LVQA 4HCWA 4BDLA 4ZS9A 2DQVA 5ICQA 2Q2AA 4GXAA 4LQ5A 4KYSA 1QKBA 3LSFB 2H25A 2QS4A 1PEBA 1QULA 4DXUA 3FV2A 1OMPA 2DXRA 3PPOA 1WODA 1UIUA 2DWHA 3AXFA 3T22A 4X9TA 1O7TA 2YLNA 3MVZA 3TQWA 3FV1A 5BUUA 2UVIA 3T66A 1XHYA 3BBRA 1FTLA 4R9FA 3FXRA 2CMOA 4RPNA 1MDP1 3ZSFA 2RC7A 3USDA 2UVGA 2XXVA 3VLVA 4N07A 4TLMB 2ZNTA 3E4RA 1N3WA 3LUYA 3JZJA 2XX9A 1N3XA 2OWTA 2A5TA 1B0LA 1NNPA 3GBBA 1H43A 2V3UA 1ZTYA 5IAIA 3RNNA 4IO6A 3FVNA 2Y7WA 4LQ2A 1IXCA 4YB5A 4G8NA 4WEDA 4ZZAA 1Y20A 3A3UA 1MY2A 2M8CA 1B4HA 3C36A 1M5FA 3O97A 4OTEA 2V25A 2DVCA 1VSOA 2O1MA 1A8FA 4GL0A 5H8SA 2R6GE 5F1QA 1HSEA 4G2ZA 4L17A 4H8IA 4MBPA 3OO9A 1OQGA 1JVXA 4O3AA 1JQFA 5EHMA 4KPTA 3V5AA 5IKBA 5ELVA 5KCJA 1XS5A 3ECRA 1WVJA 4EUOA 2V3QA 4FEBA 2Z8DA 4JWYA 4XKPA 1MQJA 1SD3A 2HQ0A 1OQHA 2RINA 4NE4A 2OLBA 1I6QA 1GGGA 1CB6A 4IGTA 4R6YA 3FJMA 1MY0A 1B05A 4F3GA 3WAEA 3U72A 3FVKA 2O69A 2XD2A 3G3FA 1Y1MA 3K02A 3G3JA 4G8MA 1JW5A 5CBSA 4NMYA 3LR1A 1IEJA 4ISUA 3MVWA 5CBRA 4OETA 5H8FB 1S7YA 2E1SA 1YPNA 1AMFA 2XHDA 4QFKA 1VFEA 3IO6A 2G93A 3IOWA 1N76A 1PDAA 5AA2B 1PC3A 2HZKA 2GRVA 4UACA 1MH4A 3ONMA 1VR5A 5LOMA 2VOZA 3C34A 4NF4B 4EQ9A 1MPBA 2PYYA 1ZLQA 1ELJA 3M3LA 4RJZA 1S9TA 3GBAA 1IXIA 3SESA 5EYFA 2D21A 4IO7A 1URGA 3M8UA 3K1PA 1L5TA 1H3DA 1BLFA 2ONSA 1DSNA 2OZZA 3K6VA 3RQTA 2P2AA 3PMWA 1MPDA 5CM6A 4POWA 3OO8A 4NWDA 2VD3A 2QS1A 3O66A 2F8DA 1FTKA 3GXAA 4GL8A 5I59B 3G3KA 3S4UA 3KEIA 4YICA 4HS7A 1DPEA 3TCHA 1LSTA 1EZ9A 1PB9A 3TTRA 1FQEA 2O1LA 3KN3A 4X1DA 1FCKA 1II5A 1Y9UA 2D5WA 4OENA 5DEXB 3M3KA 3TDJA 2Z23A 2PMSA 4PE5B 1MXVA 1P1UA 4QSDA 3FASA 3RY3A 1GV8A 4GD5A 4WEPA 1N7WA 4LZ5A 2H5YA 4QFLA 4RK9A 1LFHA 4PP0A 3LSXA 3FJGA 1NH7A 3LC8A 4LZ7A 1J1NA 3RT8A 4U21A 1DTZA 3FXUA 4YMBA 2XXYA 1Y3QA 2ZXTA 1KWHA 1ATGA 1P1NA 1R9QA 1LCTA 1BP5A 3FXQA 3U94A 4XKQA 2ABHA 3CFLA 3SKPA 4Z0IA 3VLWA 1XVXA 1B5HA 4JXIA 5L8DA 2VP1A 4GXSB 4FECA 3B6QA 1NNFA 1Y3PA 1QUIA 3PUXE 3IAZA 3H6UA 5AA2A 2AYSA 1R6ZA 4EDPA 1LBCA 3W9WA 3S2VA 3I6VA 2AL5A 3TQLA 2XXUA 1Q35A 5I2KB 4NF4A 4U1OA 1OLAA 4ZEFA 3OO6A 5JEIA 4F22A 3T9HB 2UYEA 4ONYA 1QUKA 1EZOA 4FE8A 4U2RA 1F9BA 3MVYA 2I58A 4YKIA 4I8CA 1B0HA 3VV5A 1SVXB 4JBZA 1I6BA 1SW1A 4QFNA 3IB2A 1D9VA 5AA4A 3TFLA 3PGFA 3N5LA 2ONKE 1B6HA 1D4NA 3G3IA 3FATA 1FQBA 3UORA 1MXZA 5ISUA 4MF3A 5ITOA 1NKXA 3ILUB 1AOVA 1TXFA 2F97A 1CE2A 3FVOA 5JK4A 1POY1 4BDOA 2A5TB 4XXUA 5DT6A 2V84A 3PPQA 4U23A 4U1ZA 3CSBA 5TP9B 1JEUA 5AE4A 1B3GA 4F3PA 3UN6A 3R6UA 4OWDA 4N6PA 1LBBA 3WAFA 2P0SA 1MY1A 2DE2A 4OZ9A 1DMBA 1IQ7A 2NOOA 2DP8A 3KJ7A 5KCJB 4H8JA 5HBCA 1MXUA 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CFZA 1B7HA 1M5CA 1B5IA 3TAJA 3GLBA 4GWOA 4KD5A 3H6VA 1FPFA 3OMBA 4GX3A 1NNTA 3QIMA 2Z8EA 3IL1B 1FBFA 4OYVA 2HEUA 4EQBA 2FHYA 4MX6A 1TT1A 1MG1A 5CMCA 4DCXA 1JVYA 2L5VA 3CSGA 2I3VA 5I58A 2O51A 5CMMA 3VDFA 4PDDA 3TTMA 4PBQA 1US4A 3HSTA 2B3FA 5I5PA 2REJA 4GWWA 2QMXA 5ET5A 4Q5TA 1O63A 2F34A 2VT5A 2NVUB 1UTHA 2DDKA 2OCUA 4QFPA 3MUQA 3HV1A 1USYE 2B65A 3KBZA 2VGQA 5HPQA 2F5XA 1BIYA 1NV4A 3MPLA 3Q28A 3TCGA 1MQHA 2FA7A 1B9JA 4MLQA 1MM7A 3T1BA 3O28A 4GFRA 4ND9A 4QFOA 5K2YA 2OJTA 4PBHA 3VVDA 3IO4A 1XC1A 3K6WA 3IORA 4JWXA 3KSJA 3KOTA 1URSA 2WYPA 3S9NC 5TP9A 4JVCA 2I0BA 4P1EA 2GH9A 4H46A 5EYGA 1MXYA 1FBEA 2LAOA 3IOTA 1B7ZA 2QPQA 1PBPA 4KI0E 1FPIA 3RGYA 3PPRA 3ZKLA 5DW8A 3T9UA 1FQAA 4OVSA 5A5XB 3T96B 4KR5A 3SDFA 4HTGA 4BDQA 5CMKA 3TUSA 1SDXA 4PFBA 3R26A 4GLIA 3JV9A 1LCFA 2D3IA 3IB1A 3MP6A 3HO7A 4IY6A 2UVHA 3RT6B 4R2FA 2PFYA 3TODA 3SEWA 3RTWB 3PUZE 4X48A 1B40A 4PTKA 1RYOA 2R8TA 2XXQA 4DZ1A 3EHUA 4LA9A 5I56B 5J16A 5FHOA 1B3FA 3T93B 2I49A 3OSRA 2DE3A 2PFZA 4ZZEA 2E0SA 5ICTA 1PB7A 5DYHA 1EH3A 2HZLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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