1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
3R7XA 1MXVA 1MM6A 5H8NA 3MP8A 4EXLA 1SI1A 1MH4A 1DTZA 3FV2A 1B9JA 2NWJA 1N7XA 1LLSA 3Q29A 1B40A 1BP5A 3H6TA 2OLBA 4R73A 5EHSA 4DE8A 5H8FB 3RLFE 4BDQA 3C32A 4RK9A 3IOWA 4H65A 5I56A 3A3CA 4NWCA 1NNTA 3EQ1A 1T0KA 1ZKBA 1M5CA 1ANFA 3WAFA 3RPWA 4HCWA 1XC1A 2XXPA 2PT1A 3TTLA 1Z7NE 4H8IA 1MY0A 2XX9A 4XKRA 3O29A 3KOSA 3ONMA 2GHAA 2OZZA 3S4UA 1SVXB 3EHTA 1JVXA 1MPCA 3TUSA 2DWJA 2YLNA 5DVFA 2X7PA 1SYIA 5I57B 1Y1ZA 4FEDA 3I3VA 1EH3A 5KCJA 2A5TA 2F6PA 1D4NA 5ICQA 1B51A 1I6AA 4EF2A 4G4PA 3V89B 2DXRA 4F1VA 3H6WA 1P1UA 4Q0CA 2PX1A 3TTMA 3VLVA 1GR2A 3OMBA 4YKPA 1JNFA 4G8MA 3OD7A 1FTMA 3K6WA 5BWJA 1QUJA 3T9UA 3R6UA 4RPNA 2HAUA 1B7HA 3KOTA 1VSOA 4F31B 1JW4A 3Q26A 3H6UA 4FJPA 1QKBA 1B2HA 1R9LA 3G3IA 4KD5A 1PB8A 5KDTA 3KN8A 3CIJA 1VFEA 2DYXA 1PB7A 3TMGA 2NUVA 3QSLA 4OQOA 3ILTB 1MS7A 1MY2A 4H6DA 1LCTA 3T96B 1LBBA 4FE8A 5M2VA 4YMBA 1IZ1A 2ESNA 2XXXA 4ELRA 1Y9UA 2ONRA 3TELA 1FQBA 2VD3A 3ZS6A 4WEPA 3H03A 5HBCA 5CI5A 3E9XA 3UIFA 3PUXE 3JZJA 1A8EA 1JW5A 5KZTA 5DEXA 3K6VA 3O6GA 4K3FA 1LCFA 3DELB 4LZ7A 2GHBA 1AOVA 1POTA 4ONYA 1FQFA 4GIZA 4BDLA 3DP4A 3FGSA 1N3WA 1LAGE 2I6EA 4AB6A 3TQWA 4H8JA 4F1UA 1O64A 3RUMA 2D5WA 4PP0A 3B6WA 3RTWB 4U2RA 2DXYA 1USYH 5FHNA 1H76A 3GLBA 5I2NB 3FIRA 2ALUA 3QAXA 4JXIA 2DE2A 3MC2A 3MZ1A 5DVJA 1ZU0A 3KFMA 5ITOA 4R6HA 4F3SA 3HO7A 5HPQA 3SETA 2VP1A 3N94A 4KI0E 2Y7IA 1Y3PA 2I49A 4LATA 5H8NB 1TFDA 4R2FA 3KSXA 3FJGA 2YPNA 1B3GA 2NOOA 4QFKA 3OO8A 2HAVA 2R9JA 5TP9A 4F1YA 4JSOA 1BKAA 5I57A 2RF1A 2ONKE 3RGYA 4GF8A 3RT8A 4XKNA 3N5LA 4OEUA 4DZ1A 4YAHX 4YKKA 4RK2A 3T9VA 3WAEA 2H9BA 1UQWA 4RJZA 3IR1A 3EN3A 1GTKA 3VV5A 3R26A 2DOJA 1SD3A 4RA1A 3SDFA 2B3BA 1Q35A 1O7TA 3UA8A 4G68C 2Z22A 1CB6A 3EHSA 4HTGA 5JTYA 3EF7A 2DVCA 4FEBA 1HSEA 1SQYA 3IOTA 3KN7A 2ZNTA 3O28A 5CM6A 1P1NA 3M3LA 2O84X 1MXWA 4GL8A 1RYXA 3K6UA 3MWBA 1PEBA 1P1QA 3I6VA 1US4A 2E0SA 2XX7A 2HCAA 5F1QA 2ZYKA 3PU5A 2I0CA 2DS9A 1MQJA 2A5TB 1A40A 1UTBA 3TQLA 3UK4A 2V25A 1MXUA 1DMBA 3TPAA 2O51A 2RC8A 3BFTA 5JEIA 1SI0A 2NXOA 2M8CA 1H45A 4NMYA 3TCHA 4GQOA 4YB7A 4BDRA 1B32A 2XHDA 3T66A 3KSJA 4Q30B 1ZTYA 1L5TA 4F19A 2XXWA 2XXVA 4BDNA 1IXIA 1QW0A 4MFIA 1YAEA 4F22A 4U4XA 1OLAA 4DDDA 2AL4A 4ZE8A 1EZPA 5AE4A 2A5SA 1O63A 3HSTA 2BJJX 3O97A 1D3KA 1JEUA 3FXRA 2G29A 4ZEBA 2IA4A 1LAFE 2XXYA 1H43A 4YICA 1NNKA 1OIBA 1J1NA 2OWTA 4R6KA 4P0IA 4ZEFA 5AA4B 4YB6A 3G7WA 5JK4A 5I58A 1XOCA 5ELVA 4ELQA 5DTBA 3VDFA 2H5YA 4F39A 3BFUA 2UYFA 2QRYA 3FV1A 4MH5A 1SBPA 2YJPA 1QVSA 3QK6A 2ZMBA 2IEEA 3CFLA 3QIMA 2O6AA 1N84A 3OOAA 1Q1KA 1QKAA 3HV1A 2F97A 4OYVA 2O69A 3PUZE 1FCKA 4R6YA 5DEXB 5AA2A 4R9GA 4LZ8A 1HSJA 1M5EA 5AA2D 4I9DA 2I4BA 3PPPA 4ISUA 1OQHA 3E3KA 3THIA 4GFRA 3AXFA 2THIA 4IO3A 2Y7RA 3C36A 2HZKA 1GV8A 3HPIA 4R75A 3S2VA 1B7UA 1F9BA 1MPBA 4FIMA 3K1NA 1IITA 2R71A 3O6IA 3A3UA 3LSWA 3OSQA 1WODA 4ZEKA 2Y7KA 4DXBA 3Q28A 2F8DA 4H0WA 2B65A 4ZS9A 3K02A 4ZE9A 3MPLA 3RTFB 4Z0IA 3MQ9A 1OVTA 2V3UA 4OENA 3RNNA 2H99A 4G8NA 3A09A 3PMWA 4R9FA 5FTHA 4IY6A 1CE2A 1LAHE 1ZBMA 2P0SA 2XXIA 5TP9B 1LSTA 4HS7A 3TCFA 4G2ZA 1B5JA 3S9LC 4U23A 3EHUA 4NF4A 3D4GA 2AIXA 1PBPA 3S9EA 3N6UA 3SKPA 2I58A 2ZYNA 2G93A 4GRKA 5FHMA 2HQ0A 2I48A 2RCBA 3U1OA 4HW8A 1MXYA 5B7DA 1QUKA 5JTYB 3CRBA 1QULA 1LFIA 4EUOA 2F6GA 4U21A 1YTVA 1JQFA 3SEVA 1MQHA 2PVUA 4GOTA 4IGRA 4ELPA 4DXUA 5DVIA 3FZVA 1OQGA 4ZECA 2QS2A 3OEKA 3VXBA 2REGA 3QUFA 5ITPA 4RNSA 2R6GE 4QF9A 1UTBB 1R9QA 3E13X 1NMUA 2XX8A 3VVEA 3SERA 1OLCA 1MPDA 3N26A 1OVBA 5AA4A 4LA9A 3IORA 5CBSA 1NNPA 4ESXA 3SESA 4N6PA 3LUYA 1AH5A 4BLAA 3OENA 1WDNA 2F7CA 4PETA 2RC7A 3K01A 2OWSA 4NWDA 4GWOA 1URDA 1B3HA 4OXVA 2HXWA 3P7IA 2FNCA 1UIVA 4BDMA 2I3WA 3KG2A 1VE4A 1MM7A 2Q9TA 4LUBA 1SDXA 3LR1A 3VXCA 4KCDA 4X48A 1EZ9A 4IO2A 3RY3A 5I58B 5I2KB 1MQGA 3RT6B 4UACA 3JV9A 4OFLA 3ZSFA 3OO9A 2DP8A 3MP1A 1M5FA 2UXAA 2F35A 3U94A 1SYHA 3IAZA 5CMBA 4UA8A 3FJ7A 4GL0A 4U1OA 3K2DA 3FVNA 1NFTA 5AA2B 2B3FA 1SW4A 3KZGA 3UGWA 4L17A 2QJEA 2FYIA 3VE1B 1PC3A 3RQTA 1R1NA 3O6HA 5I84A 1Y3NA 4XTCQ 3TTRA 1URSA 1B5IA 1N7WA 4QSCA 1S50A 3EPEA 3FVKA 3MP6A 3U72A 3K4UA 4IO4A 4WEDA 1H44A 1I6BA 1Y1MA 4EF1A 3L6GA 1PB9A 1QJMA 5K2YA 2HZLA 1M5DA 1VFDA 2OBGA 4ELOA 2X26A 1MH3A 3T93B 3U92A 3PMXA 3CFZA 1JVYA 3LSFB 1FTKA 3CFXA 2UYEA 3C4MA 2Y84A 3OSRA 2V84A 1ZIUA 4GVOA 3FJMA 1R6ZA 1P1WA 1FTLA 1BIYA 3LBSA 3G3HA 4NEDA 2OK2A 4I1DA 3ZKKA 1DTGA 3SEXA 3IK6B 4ZDMA 2LAOA 4ECFA 2Q89A 3IB0A 3G3JA 3G3GA 1LGBC 3Q25A 1B58A 2F7AA 2QL3A 1A7LA 3MVZA 3MUQA 4NF4B 1B7ZA 1B6HA 1VR5A 5EHMA 2F5XA 1P99A 4PQJA 3FATA 2VOZA 3KBRA 3IO6A 2DWAA 1NKXA 4O3BA 3V8XB 1XS5A 4H67A 3GZGA 4G68A 1NH8A 2VHAA 4WXJA 3TDJA 2O7IA 4IO5A 3B6QA 3IL1B 1S7YA 2XXQA 3CG1A 3K0VA 2HEUA 4MBPA 4ZZAA 3V5AA 1WVJA 1B3EA 2CMOA 5H8QA 4TQUQ 4F29A 4LQ2A 4X1BA 2RC9A 1ATGA 3QYTA 3O66A 1FQDA 3HHFA 3QUJA 2FA7A 2QPQA 5TU0A 3IX1A 1P1OA 4POWA 4EQBA 4AB5A 1QUIA 3LSXA 5I2KA 2P1SA 2Z8FA 4BDOA 4U4SA 1DOTA 4G8HA 2WKYA 3FASA 3M3FA 3L6HA 1B5HA 2D21A 3U93A 4KYEA 2QMXA 1M5BA 2RINA 1TT1A 4NE4A 4MLQA 4IB2A 4EDPA 2Z8DA 4PE5B 1PBQA 2QSXA 4IGTA 1NH7A 4QSEA 1FQAA 3BKIB 3FD3A 4KHZE 4EXKA 1JETA 1SW1A 2Q2AA 1SW5A 4ZZEA 5CC2A 2O1MA 4KCCA 1XVYA 2QS4A 2XD3A 1B0HA 2RCAA 3W9WA 4RXLA 1AL3A 3VFJA 4F3BA 1LFHA 3MPKA 4TOZA 1LB8A 3C31A 2QS3A 3TODA 4JSDA 2GFEA 1MQIA 2I0BA 4ESWA 3OXNA 5I59A 3H4ZA 2NVUB 3KJTA 3ZKLA 2XXUA 1UTHB 5A5XB 4QFNA 1XHYA 1MY1A 3K00A 3JYRA 2OCUA 3KN3A 1GGGA 3IB2A 2AL5A 2F36A 1B52A 4E0WA 3MVYA 3T9XB 4RYAA 3PPRA 2HFBA 4KYSA 3ECRA 4OTEA 3H3GA 3PGFA 3CI8A 4MF3A 3IOVA 3MJNA 4YMAA 4OESA 3DP6A 3UN6A 4LVQA 3H7MA 1Y20A 4C1TA 1A54A 4Q5TA 3M3KA 2XD2A 3K1PA 5H8HA 1XVXA 3FXUA 2O1LA 3PUYE 3FVOA 3S9MC 4ZEIA 3KGCA 4RPOA 3MW0A 5BUUA 1US5A 1I69A 4QRZA 2V3TA 4FAJA 1USYE 4F3GA 1LB9A 4YU0A 4WKMA 2QMWA 3PMVA 4H5GA 1MRPA 1N76A 4LQ5A 1MXXA 1YPNA 1EU8A 4NF5B 4KYDA 3PV0E 4C1UA 2E1SA 1OMPA 5TPAB 3B6TA 3PUVE 1Y4TA 2UVGA 3MZ9A 2XXHA 2V3QA 1AMFA 4LP2B 4JWYA 3PPQA 2F78A 1MG1A 1N0TA 4ZEDA 1DPEA 3ILUB 3OO7A 4FECA 4FORA 3RN8A 4NF6A 3O2AA 3KEIA 1A55A 1II5A 4LZ5A 2PT2A 2QS1A 4F18A 2DWIA 4LONB 4Q8RA 2F7BA 1MQDA 1ZLQA 5IKBA 4EQ7A 3C35A 5H8SA 4XXUA 5AA3A 4YKJA 4JWXA 1IUDA 5HM4B 2ONSA 4JBZA 2OJTA 3O9PA 4PFWA 3GBAA 1URGA 3LC8A 4YKIA 4G68B 4DIGA 4U22A 3HHGA 3IO4A 1MDP1 5CMKA 5CRYA 3H6VA 1AIVA 3MAMA 1DSNA 3G3FA 4N07A 3SEYA 2DVZA 4QSDA 5H8QB 4TLLB 1B0LA 4OFJA 1FTJA 4AQ4A 4OVJA 4OZ9A 5CMMA 2VD2A 5IAIA 3HN0A 1ZJLA 1B3FA 3FVGA 4KPTA 3TCGA 2Q2CA 3GXAA 4F2QA 3H06B 4DCXA 3IJXB 4THIA 4X9TA 1EZOA 1JEVA 4KR5A 1HSLA 1B4HA 3SEWA 1IXCA 3W9VA 3IB1A 3CSGA 4TLMB 1S9TA 4OFOA 1RYOA 3SEUA 4NF8A 4C0RA 3K6XA 1MXZA 4H1XA 4G77A 4OHNA 3TAJA 1MY4A 1UTHA 5A5XA 3C34A 3FUZA 4MLVA 5F7VA 2Y7WA 1RKMA 1LBCA 3PD9A 1TXFA 2H98A 4OWDA 3CR9A 4E0XA 1UIUA 3G3KA 2KLFA 5L8DA 5DYHA 4JB7A 3K1MA 3PPNA 4H5FA 3D4CA 4F3PA 4RY1A 5H8FA 2ZNUA 1TWYA 2P2AA 5L9MA 4O3CA 3CSBA 1JW1A 2PBWA 4F2OA 1A99A 1I6QA 4XKPA 4NTLA 3Q27A 5I59B 1IQ7A 3N6TA 1LFGA 4EQ9A 4DCYA 1SW2A 4XIGQ 3E4RA 1GVCA 4DXCA 3U8QA 1N3XA 3TTNA 3GBBA 4R72A 1IEJA 5CBRA 1POY1 1LAXA 4PFUA 4P0GA 3DLNA 4GD5A 4NF5A 2ZYMA 3LSLA 1N04A 3ODBA 3T9HB 3MVXA 2Z8EA 5TPAA 4OERA 1B05A 3MBPA 3IOUA 1PDAA 3FXQA 3TTKA 1IXHA 2UVJA 2UVIA 1Y4CA 5I56B 2CZLA 3VVDA 2H25A 1MDQA 4QFOA 3DM0A 1D9VA 2ANJA 1Y3QA 4I62A 5H8HB 1FTOA 1XT8A 2XXRA 1B1HA 5ISUA 3C9HA 2DE3A 3T22A 1FQCA 5FTIA 3F11A 2I3VA 4YZZA 3C33A 3TYHA 4OETA 2W7YA 2DE4A 4GXAA 4M4GA 1IXGA 1FQEA 5L9OA 5ICTA 4OMBA 1B3LA 4M1VA 2PMSA 2D3IA 5KCJB 2PYYA 4JWOA 5CMCA 2Q8JA 4FATA 3OELA 2ZXTA 4U1ZA 4QHQA 1Z7ME 2DQVA 1DPPA 3MVWA 3V83A 3OEMA 4XKQA 3CVGA 1B4ZA 4Z7EA 5FHOA 3UORA 4NF6B 1A8FA 2I4CA 2ABHA 3I5OA 3W15C 4KQPA 4I8CA 3CG3A 2DSFA 3OO6A 4JDFA 3USDA 2REJA 3B7DA 5K2XA 4P11A 1H3DA 2ZYOA 2Y7PA 2XXTA 5B70A 3M8UA 3QXMA 1D9YA 2Q88A 4X1DA 3TZAA 5KDTB 4GXSB 5DT6A 1NNFA 2VGQA 4OEVA 2UVHA 1IIWA 2Z23A 4R74A 1NL5A 3BBRA 1B46A 4IO6A 3S9NC 2GH9A 3VVFA 1ZMGA 4ND9A 5LOMA 2X7QA 2ZNSA 3VLUA 1ELJA 4POXA 3MZBA 1MY3A 2O7UA 5AA1A 3TEPA 4DLDA 1BLFA 1YCJA 4YB5A 1B1XA 3IJOB 3TFLA 5J1DA 2V93A 3PD8A 4O3AA 1FW0A 5L9SA 3PPOA 4QFLA 2RKMA 4IO7A 4IY5A 3PUWE 5I2NA 4KFQA 4GLIA 4HCYA 3VLWA 2GRVA 2O68A 2AYSA 5EYFA 3HCQA 3KJ7A 4N13A 3UP9A 4PFTA 4PFYA 2F34A 1KWHA 4QFPA 1TFAA 3DP8A 3TKDA 1BTJA 2DWHA 2H4IA 4NF8B 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3R7XA 4KXPA 1MXVA 1MM6A 5H8NA 3MP8A 4EXLA 1SI1A 1MH4A 1DTZA 3FV2A 4N8YA 1B9JA 2NWJA 1N7XA 1LLSA 3Q29A 1B40A 1BP5A 1NV5A 3H6TA 2XWOA 5I5PA 2OLBA 4R73A 5EHSA 5ET5A 4DE8A 5H8FB 3RLFE 4BDQA 3C32A 2GQ1A 4RK9A 4N6KA 3IOWA 1FJ6A 4H65A 5EQ8A 5I56A 3A3CA 4GX4A 4NWCA 1NNTA 3EQ1A 1T0KA 1ZKBA 1M5CA 1ANFA 3WAFA 3RPWA 4HCWA 1XC1A 2XXPA 2PT1A 3TTLA 1Z7NE 4H8IA 1FJ9A 1MY0A 2XX9A 4XKRA 3O29A 3KOSA 3ONMA 4NAPA 2GHAA 2OZZA 3S4UA 2CZKA 2WYKA 1SVXB 3EHTA 1JVXA 4PDDA 1MPCA 3TUSA 2DWJA 4OVSA 2YLNA 5DVFA 2X7PA 1SYIA 5I57B 1Y1ZA 4FEDA 3I3VA 1EH3A 4MNPA 1D9QA 5KCJA 2A5TA 2F6PA 2CZHA 1D4NA 2XWKA 5ICQA 1B51A 1I6AA 4EF2A 4G4PA 3V89B 2DXRA 4F1VA 3H6WA 2ZZWA 1P1UA 4Q0CA 2V4CA 1LBXA 4N15A 2PX1A 3TTMA 3VLVA 1GR2A 3OMBA 4YKPA 1JNFA 4G8MA 3OD7A 4GWXA 1FTMA 3K6WA 5BWJA 1QUJA 3T9UA 3R6UA 4RPNA 2HAUA 1B7HA 4HE1A 1DK4A 3KOTA 1VSOA 4F31B 1JW4A 3Q26A 3H6UA 4FJPA 1QKBA 1B2HA 1R9LA 3G3IA 4KD5A 4PF8A 1PB8A 5KDTA 3KN8A 4NGUA 3CIJA 1VFEA 2DYXA 1PB7A 3TMGA 2NUVA 1SPIA 3QSLA 4OQOA 3ILTB 1MS7A 1MY2A 4H6DA 1LCTA 3T96B 1FBPA 1LBBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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