1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
4GFRA 4FORA 1N04A 1R9QA 2QS2A 4GQOA 4NF5A 1Z7ME 3PPOA 1B40A 1L5TA 4DXBA 3T9XB 3FATA 3DP4A 4XKQA 4LQ5A 3OELA 4PFYA 5AE4A 4OEVA 2QJEA 3EF7A 1LAGE 4YB7A 3PU5A 4POWA 4N6PA 2Q88A 3U8QA 2OWSA 3EHSA 3USDA 3CFZA 4YB5A 4Q0CA 4ZEKA 3R7XA 3T9VA 3SEYA 2Z23A 3TYHA 1POTA 4ZS9A 2UYFA 3IB1A 2HXWA 3ZSFA 4OXVA 2XD3A 2XXUA 3GLBA 3TAJA 1ZLQA 4TLLB 2B3FA 4R6YA 2ZYMA 1KWHA 1LAFE 3Q28A 3UGWA 3UA8A 3K00A 3MBPA 4U23A 4BDLA 3E13X 2IEEA 5AA3A 4OQOA 5L9MA 4WEDA 2F7CA 2RC7A 4DIGA 4E0XA 4F22A 1MS7A 4Z0IA 2UVJA 4R73A 3TTMA 3CG1A 4GVOA 2I0CA 1IXGA 4EF1A 2ZMBA 2O84X 4KCDA 1AMFA 3S9EA 4LA9A 2UVHA 3ODBA 3IJOB 5DVIA 3D4CA 2PYYA 3PPNA 5ICTA 3LSLA 2PT2A 2HAVA 1B5IA 3OSQA 3PMWA 3V83A 1M5BA 4DDDA 4OYVA 3D4GA 3L6GA 3MPLA 2DVZA 1P1WA 4G8MA 2ZXTA 4U1ZA 3LBSA 2CZLA 3H4ZA 4FAJA 4ECFA 5DTBA 4KD5A 3O9PA 4MLQA 1QULA 4GWOA 1NKXA 3ECRA 2Q2AA 5CI5A 2GHAA 3TCFA 1SW4A 1IITA 4QFNA 1LGBC 1LBCA 1GGGA 3PPQA 3S9NC 2A5TB 3VLVA 2G29A 1MRPA 1J1NA 4Q5TA 3BBRA 2UVGA 5I2KB 3SEUA 3KN3A 2O6AA 3RN8A 1TFDA 4LP2B 1MDQA 5I2NA 2REGA 4P0IA 4ZEFA 1B6HA 4ZECA 1TWYA 4GXSB 5CMKA 4KR5A 3OOAA 4ZEBA 1QUKA 5CBRA 4BDRA 5I56B 3K01A 2ALUA 3PUWE 3CRBA 1SW5A 3N6UA 4DXCA 4QFOA 4FJPA 2XXVA 1POY1 3K2DA 3H3GA 5HBCA 5KCJA 2DVCA 3LSXA 1B2HA 3M8UA 3L6HA 1QKAA 3E9XA 5A5XB 5BWJA 4H65A 4IO5A 3PUXE 3ZKKA 3IOUA 2V93A 1QUIA 2E0SA 1B5JA 1Y9UA 2E1SA 1UTBB 2CMOA 3I6VA 3OEKA 3TEPA 2Y7WA 1LB8A 1MH3A 3K1PA 4G77A 2XXIA 4GOTA 3FGSA 5I59A 2ZNSA 1VE4A 2XXHA 1XT8A 2DSFA 3LUYA 4OFJA 4XKPA 3PUYE 1RKMA 3QIMA 2H5YA 4FE8A 1MPDA 3KN8A 3H7MA 2I48A 1A99A 1XHYA 2QMXA 1AH5A 1B05A 3K4UA 3U94A 4FATA 4HCWA 1US5A 4OFOA 3K6XA 2Y7RA 1URSA 1LFIA 4IB2A 4QSDA 4Q8RA 5AA2A 2F6GA 5I57B 4MLVA 1HSLA 2O7UA 5DVFA 3RLFE 1US4A 1IXIA 1FTOA 3LSWA 4NTLA 1MH4A 3WAFA 4ELRA 5DVJA 3VVEA 4X1DA 1JEVA 1MM6A 3ILUB 4BDOA 4OZ9A 2XXWA 2O51A 3FIRA 5M2VA 4PP0A 3MPKA 2F35A 4TQUQ 4EQBA 1Y3NA 4RA1A 1ZIUA 1A54A 3QK6A 4HTGA 2AIXA 4RK2A 1JEUA 1QUJA 4PFUA 3TODA 1OVBA 1MM7A 3MVXA 4UA8A 3TTLA 3T22A 2B3BA 4THIA 3OXNA 1B52A 3ZKLA 4NF4B 4R6KA 1MXUA 2FYIA 2THIA 2I3WA 3N6TA 2I0BA 3H6UA 3MVWA 2DS9A 4G68B 3W9VA 3EQ1A 3U93A 4OTEA 1N76A 1LFHA 1TFAA 1S7YA 3H6TA 3KJ7A 1MXXA 2Y7PA 3TFLA 2Q9TA 2DWIA 4PETA 4JWOA 4M1VA 1LSTA 2XXYA 1B7HA 4G4PA 5ELVA 4DE8A 2Z22A 1B3LA 3FVGA 4H67A 3TUSA 4NF6B 1Y4TA 4ESXA 3IOVA 3VDFA 4Q30B 2XHDA 4OEUA 4HS7A 1N7WA 2PVUA 4XXUA 3RUMA 3M3KA 2IA4A 4O3CA 3TTRA 4YZZA 3R6UA 3TKDA 2VP1A 1DMBA 2GHBA 2RC8A 2V3TA 2XXTA 3SEWA 3IL1B 3KOSA 3IJXB 4GRKA 2XXPA 1DTGA 3O29A 3TCHA 4FIMA 3S9MC 2ZYNA 4OERA 2QS3A 5AA4A 4ZEIA 3T96B 1P1OA 4YB6A 3T9UA 3FVNA 1P1NA 1XVXA 1SBPA 3A09A 3ZS6A 4I8CA 4YKKA 5DEXA 4AB6A 4UACA 5TP9A 1RYXA 1JQFA 1MXZA 2DWHA 3ILTB 5BUUA 1MQJA 3PPRA 4U22A 3O66A 2I4BA 4QHQA 4DCYA 4RPNA 3UP9A 3DP8A 3ONMA 3O28A 4OFLA 3MP8A 1SVXB 4HW8A 2QS1A 4ZDMA 1WDNA 1NNTA 5CM6A 4H5GA 3N5LA 1XVYA 1MY2A 3Q26A 4M4GA 2YJPA 3QUFA 1EZPA 1DPEA 1USYH 3K1NA 4R2BA 5H8HA 3QUJA 3TPAA 1N3WA 2M8CA 2RF1A 5B7DA 3C34A 4TOZA 1USYE 5ITPA 1ZU0A 3BFTA 1D9VA 3G3FA 4RXLA 5IKBA 3OSRA 2I6EA 4EF2A 4L17A 4PFWA 4R2FA 2HFBA 4K3FA 4GF8A 5CBSA 4OHNA 3KG2A 3FASA 2A5SA 4YKJA 5LOMA 3RQTA 2ONRA 3UN6A 3PMXA 3CR9A 1B51A 4YKPA 2OZZA 1MQDA 1TT1A 3MP1A 3TCGA 3FJ7A 3GZGA 4NWCA 5EYFA 1F9BA 3SEVA 1VFDA 5FHNA 1NNPA 2PBWA 1DTZA 1N3XA 3B6TA 2ABHA 3CSGA 1I6QA 1XC1A 4YICA 1IIWA 1D4NA 1MQGA 2GFEA 3IB2A 1B1HA 1UTHA 1ZTYA 1JNFA 1WVJA 3IORA 2H99A 2QPQA 3C35A 2BJJX 4X9TA 1Y4CA 4ELOA 3F11A 3RT6B 4GIZA 2P0SA 1OVTA 1R1NA 1CB6A 3TQLA 5AA2D 4X48A 1NNFA 3K6UA 1XOCA 2H98A 1P1QA 4JWXA 3KOTA 1MY0A 2QS4A 2O68A 2G93A 1SQYA 3UORA 3SKPA 3FV1A 1FTJA 1SYIA 1LCTA 4OESA 4RPOA 3RY3A 1ZJLA 1NNKA 3OO9A 3JV9A 4KI0E 4IO4A 4BDNA 4GL8A 3Q29A 4JSOA 2RC9A 1MY4A 3LC8A 4EUOA 1Y3QA 3EN3A 1JW4A 3H6VA 3C9HA 1A40A 2AL5A 5I2NB 4ISUA 2W7YA 4JSDA 1EU8A 1SYHA 1PBQA 3G3JA 1URDA 3OO7A 3K02A 2DP8A 1B1XA 4KCCA 1LAHE 4F3SA 3SERA 4KYSA 4ZE8A 3P7IA 1PDAA 4JWYA 3O6HA 3JYRA 1I6AA 5FTHA 3G3GA 3U92A 4RK9A 3BFUA 1SD3A 1GV8A 4I1DA 3Q27A 4LQ2A 1MDP1 4I9DA 2Q89A 4EQ7A 1Q35A 2O1MA 3MZ9A 1Y3PA 3VV5A 1OLCA 3V8XB 3N94A 2X26A 4P0GA 4QFLA 4DLDA 4LATA 3LSFB 4WXJA 3CFXA 5I59B 4C0RA 1MPCA 1VR5A 4WEPA 3VFJA 1B3EA 5ICQA 2OWTA 2F78A 5K2XA 4C1UA 3TQWA 2Z8EA 5AA1A 4EQ9A 3VE1B 1B3HA 3S9LC 2Z8FA 3DELB 1FTLA 1ELJA 4XTCQ 3DM0A 4Z7EA 2O7IA 3G3KA 2Y84A 4OENA 4QFKA 4G2ZA 3HN0A 4YKIA 2PMSA 2QMWA 5H8QB 1FQEA 1ZMGA 1OQGA 1B46A 3CIJA 4ZE9A 1M5EA 3SETA 1FQCA 2UXAA 4U1OA 5AA2B 5I58A 2H9BA 1Q1KA 2HEUA 5I84A 1LFGA 1ATGA 2F97A 1YCJA 5L9OA 2DE3A 3OMBA 4F18A 3T9HB 1PB9A 1LLSA 1N0TA 4O3BA 3I3VA 3MW0A 2GRVA 3S4UA 5TPAA 1DOTA 3HV1A 2VOZA 5FHOA 2F34A 4GD5A 3QXMA 1B7UA 1Z7NE 4POXA 1ZBMA 4TLMB 4AB5A 3FV2A 4MH5A 1MY1A 4QSCA 1I6BA 3W15C 4DCXA 1H43A 1Y20A 4ELPA 4R9GA 5JTYA 5IAIA 2Q8JA 3SDFA 3IOTA 1HSEA 3FVOA 3H06B 2OK2A 5ISUA 3TTNA 4XKRA 3B7DA 3IB0A 4H8JA 4P11A 4IGTA 4G8NA 2FA7A 1CE2A 2F5XA 1B32A 2HZLA 3CVGA 4YMBA 5ITOA 1FW0A 4PFTA 3K6WA 3T66A 2DXYA 3MVZA 2GH9A 4F2OA 3O97A 4KFQA 4LONB 3IOWA 5TU0A 1UQWA 2VHAA 1P1UA 4BLAA 3K0VA 3A3CA 4U4SA 2XXXA 1GTKA 3K6VA 4ZEDA 4LZ5A 5L8DA 3IO6A 2F6PA 3MAMA 1A8FA 3FUZA 1FQDA 3OEMA 1RYOA 3UK4A 3OENA 4N13A 3EHUA 3EHTA 1NH7A 3DP6A 5FTIA 1IXCA 5EHMA 2NUVA 4ELQA 2OCUA 5AA4B 4F2QA 3TZAA 3SEXA 2NWJA 4QFPA 1JVXA 1PB7A 1JW1A 3PUVE 5H8NB 3KFMA 3VVDA 5KDTA 2HCAA 4R9FA 3CFLA 3U1OA 4GXAA 1ANFA 3FXUA 4JXIA 1R9LA 2V84A 4IO3A 2F36A 1AIVA 2HQ0A 3B6QA 3H6WA 1MY3A 2R71A 4NF5B 2X7PA 2I49A 3S2VA 2Y7IA 3KGCA 2R9JA 3PGFA 1URGA 4NEDA 3KBRA 2NOOA 4YMAA 5H8FA 2VD2A 5H8HB 3QAXA 4NF8A 4IY5A 3TDJA 4JDFA 4PQJA 4IO7A 3HO7A 4GL0A 5L9SA 4O3AA 2NXOA 3RNNA 1IQ7A 1D3KA 4F29A 3VXBA 1R6ZA 2FNCA 3O6GA 3DLNA 2DWAA 1XS5A 3JZJA 4ND9A 3FJMA 4YAHX 3MUQA 3FVKA 3W9WA 4FECA 3RTFB 3KSXA 4KQPA 3KJTA 4BDMA 3MP6A 1QVSA 1SDXA 4NMYA 3SESA 5DT6A 2ONSA 1BTJA 3PUZE 2AYSA 4LUBA 3HCQA 1IZ1A 2OBGA 1JW5A 2I4CA 2Y7KA 4F3BA 2ZNTA 3VXCA 3FXQA 3MVYA 3IK6B 4IY6A 4H6DA 4OETA 4R72A 1H76A 4FEDA 1PC3A 4IGRA 1UTHB 3RPWA 1Y1MA 3IR1A 4F3GA 2RINA 3GXAA 3CSBA 2XXRA 1A55A 1UIVA 1IEJA 2XXQA 2DWJA 1AL3A 2VD3A 2AL4A 4HCYA 3GBAA 1DPPA 1O64A 4E0WA 1FCKA 2DE2A 2XX7A 5FHMA 5JK4A 1B0HA 4OVJA 1JETA 1M5CA 2F7BA 1VSOA 1B5HA 3MQ9A 4ONYA 3MZ1A 3B6WA 3BKIB 4IO6A 2OLBA 1DSNA 4MBPA 1S9TA 4BDQA 3G3IA 2REJA 4RNSA 3FZVA 1B3GA 3HHGA 2XX9A 4R6HA 3O2AA 4N07A 5F1QA 1A7LA 3VLUA 1MXWA 4C1TA 4KHZE 1GR2A 3OO8A 3PD9A 4LVQA 4DXUA 4U21A 2UVIA 4JBZA 1EZ9A 1UIUA 4KYDA 3LR1A 1B7ZA 4EXLA 2RCBA 1GVCA 1HSJA 1MXYA 5CMMA 3E3KA 1FQBA 2DOJA 3M3FA 4LZ7A 4KYEA 4F31B 2PX1A 2XD2A 2QL3A 1NFTA 2D21A 4NE4A 1BP5A 5CMBA 3FJGA 2A5TA 1YAEA 4RJZA 3H03A 4XIGQ 3THIA 3TMGA 1B4ZA 1SI1A 2V25A 5KCJB 1B4HA 3G7WA 4GLIA 4H0WA 1B58A 1MXVA 2V3UA 3V89B 5I2KA 1M5FA 3R26A 3U72A 3G3HA 5KZTA 4H8IA 1AOVA 1QW0A 3KEIA 2DE4A 1FQFA 1B0LA 3TTKA 3CG3A 1NH8A 2P2AA 4X1BA 3TELA 1MPBA 3C4MA 5I56A 4F1UA 5CRYA 4F3PA 1FTKA 1Y1ZA 1NL5A 2YLNA 3VLWA 2ZNUA 4XKNA 1SW1A 5DYHA 1OIBA 5I58B 2HZKA 2PT1A 3E4RA 4QRZA 1QKBA 3OO6A 4YU0A 1LAXA 4U2RA 5A5XA 1B9JA 4JB7A 4PE5B 1EZOA 3OD7A 1SI0A 4F1YA 4R74A 3I5OA 3QSLA 1UTBA 1SW2A 5HM4B 2D5WA 3MZBA 1PEBA 2KLFA 4NWDA 2ZYOA 1T0KA 5TPAB 4ZZAA 1OMPA 1N84A 1YTVA 4RYAA 2YPNA 4LZ8A 3IO4A 2D3IA 2ONKE 4WKMA 5CC2A 5HPQA 5B70A 5H8QA 2ESNA 4H5FA 4ESWA 1YPNA 1H45A 1O63A 4DZ1A 2F8DA 3N26A 3QYTA 1H3DA 5J1DA 5JTYB 3Q25A 3PV0E 4OWDA 1S50A 1VFEA 2R6GE 2ANJA 3KSJA 1P99A 3MJNA 4KPTA 3UIFA 1MQIA 3FD3A 4U4XA 5CMCA 3HHFA 3VVFA 3IX1A 1FQAA 5I57A 1LBBA 2O1LA 1ZKBA 2DQVA 4I62A 1PB8A 4IO2A 2QSXA 3MWBA 1MQHA 4MF3A 2Q2CA 1NMUA 1JVYA 5K2YA 3KZGA 1BIYA 5H8SA 3KN7A 2F7AA 1EH3A 2UYEA 4RY1A 2X7QA 3RGYA 4H1XA 3RT8A 1M5DA 1MG1A 3IAZA 2QRYA 3EPEA 1LCFA 3GBBA 5F7VA 2ZYKA 1QJMA 4F19A 2LAOA 4EXKA 4ZZEA 4NF4A 5EHSA 2WKYA 3T93B 4G68C 3WAEA 3HSTA 1OQHA 3AXFA 2DYXA 4G68A 3K1MA 4QSEA 4AQ4A 1OLAA 4R75A 2DXRA 3C32A 2H4IA 5KDTB 3C31A 4OMBA 4G8HA 1BKAA 1H44A 3C36A 2B65A 1LB9A 4MFIA 1IXHA 4F1VA 2I3VA 4NF6A 5DEXB 5TP9B 2P1SA 2RKMA 1N7XA 5JEIA 2Z8DA 3CI8A 2NVUB 1D9YA 1A8EA 2I58A 4QF9A 1B3FA 4EDPA 3PPPA 1II5A 2OJTA 3M3LA 5H8FB 2HAUA 4NF8B 3FXRA 1TXFA 3C33A 3A3UA 3V5AA 5H8NA 1IUDA 1O7TA 3HPIA 4F39A 3MC2A 1WODA 2H25A 1PBPA 3PMVA 2O69A 2VGQA 1FTMA 3O6IA 3PD8A 4FEBA 2V3QA 2RCAA 2XX8A 3RTWB 1BLFA 1I69A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GFRA 4FORA 1N04A 1R9QA 2QS2A 4GQOA 4NF5A 1Z7ME 3PPOA 4IR8A 4N4UA 1EYKA 1B40A 1L5TA 4DXBA 3T9XB 3FATA 3DP4A 4XKQA 5IZ3A 4LQ5A 3OELA 4PFYA 1NUZA 5AE4A 2V4CA 4OEVA 2QJEA 3EF7A 1LAGE 4YB7A 1NV6A 3PU5A 4POWA 3KC0A 4N6PA 2OWZA 2Q88A 3U8QA 2OWSA 3EHSA 3USDA 3CFZA 1FBFA 4I40A 4YB5A 4GBWA 4Q0CA 4ZEKA 3R7XA 3T9VA 3SEYA 3RPLA 2Z23A 3TYHA 1POTA 4ZS9A 2UYFA 3IB1A 2HXWA 3ZSFA 4OXVA 2XD3A 2XXUA 3GLBA 3TAJA 1ZLQA 4TLLB 2B3FA 4R6YA 2ZYMA 1KWHA 1LAFE 3Q28A 3UGWA 3UA8A 3K00A 3MBPA 4U23A 4BDLA 3E13X 2IEEA 2PFZA 5AA3A 4OQOA 5L9MA 4WEDA 4X04A 1FBPA 2F7CA 2RC7A 4DIGA 4NG7A 4E0XA 4F22A 4N6DA 4GWSA 1MS7A 4Z0IA 2UVJA 4R73A 4MIJA 4N8GA 3TTMA 3CG1A 4MNPA 4GVOA 2I0CA 1IXGA 4EF1A 2ZMBA 2O84X 4KCDA 1AMFA 3S9EA 4LA9A 2UVHA 3ODBA 3IJOB 5DVIA 3D4CA 2PYYA 3PPNA 5ICTA 4O8MA 3LSLA 2PT2A 2HAVA 1B5IA 3OSQA 1QGXA 3PMWA 3V83A 1M5BA 4DDDA 4OYVA 3D4GA 3L6GA 3MPLA 2DVZA 1P1WA 4G8MA 4G61A 2ZXTA 4U1ZA 3LBSA 2CZLA 5IGAA 3H4ZA 4FAJA 4ECFA 5DTBA 4KD5A 3O9PA 4MLQA 1QULA 4GWOA 4AS4A 5ET7A 4PGNA 4NF0A 1NKXA 3ECRA 2Q2AA 5IZ1A 5CI5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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