1DTGA

Human transferrin n-lobe mutant h249e
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
Knots found
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDNYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSETVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mutation of the iron ligand His 249 to Glu in the N-lobe of human transferrin abolishes the dilysine "trigger" but does not significantly affect iron release.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords TRANSFERRIN
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
other databases KnotProt 2.0: K
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtgA02
3N26A 1IQ7A 4RPNA 4BDNA 4ISUA 3QUFA 2Y7PA 3QXMA 1TFAA 1LBBA 1NFTA 3A3CA 2LAOA 3S9MC 3K6WA 3PPPA 4F3SA 2H25A 3TTNA 5H8FA 2P0SA 2I58A 4GIZA 2ZYMA 4F1UA 3Q28A 4KD5A 1LFGA 1IUDA 3OD7A 3TTMA 2QSXA 3IR1A 5AA2D 3MJNA 4ZEDA 4YB6A 5I59A 4OWDA 1B3EA 1B58A 1LAHE 1AOVA 2DE4A 1LB8A 2PMSA 5AE4A 3ZS6A 4ELQA 3FV1A 3HV1A 1ZLQA 4BDLA 4H6DA 3HHGA 3G3IA 5I57A 4KYSA 3LC8A 4FATA 2ESNA 1M5CA 3BFUA 3O6IA 5DVJA 4YMAA 1H76A 2G93A 5CMKA 2XD2A 2VHAA 1PB9A 5H8QA 2H99A 4F29A 2D21A 1QULA 1DMBA 1FCKA 2IA4A 3CFLA 3OO6A 1Q35A 4KR5A 1WVJA 4M4GA 3FZVA 3RUMA 2Z8EA 4G4PA 4XTCQ 5EHMA 2DS9A 3R26A 4OMBA 2ZXTA 3L6HA 3O97A 2Y7WA 3N6TA 3IB2A 2ONKE 4F3PA 1LAFE 3MP8A 1S50A 1MQHA 2I3WA 2Y7RA 1M5DA 3OENA 4QFLA 2E1SA 1B7HA 1EH3A 1LAXA 3CVGA 3T66A 1RYOA 1Y4TA 4C1TA 4R2FA 2XXHA 5CC2A 1IIWA 1PEBA 5H8NB 1YAEA 1MM6A 3FXQA 3HCQA 3IOWA 1EU8A 1B7ZA 3EF7A 3RY3A 1FQFA 2QMWA 4U22A 2RC7A 4WKMA 3OOAA 2HZLA 1Q1KA 4WXJA 4ZDMA 1MPDA 1FTKA 4QSEA 4MH5A 1MXZA 1DSNA 2DXYA 5CMMA 4ZEIA 2REGA 3USDA 1AL3A 2XXRA 4GFRA 4XXUA 4GL8A 4LZ8A 1MXVA 2VGQA 3KN8A 2XXUA 1I6QA 1QUIA 1S7YA 2GHAA 3E4RA 1B51A 3PU5A 2V3UA 5ICQA 4FE8A 4IO7A 1US5A 3JV9A 1XHYA 1B40A 3T93B 3MVWA 3MVXA 3HO7A 3VVFA 3RPWA 5ITPA 3G3HA 3M3FA 4FAJA 1ZIUA 1B3FA 3KOSA 4RK2A 1O63A 5F1QA 5JTYA 2PT2A 4NWDA 1B32A 4OERA 3ILUB 2G29A 1MY1A 2H98A 1PB7A 2B65A 1BKAA 4YMBA 3V83A 4E0WA 4Q8RA 3EQ1A 2NOOA 2V3QA 4OTEA 1DPEA 1XVYA 3KJTA 3K6XA 2XXXA 2CZLA 5H8HB 2XXQA 3VFJA 4HS7A 2A5SA 4X1DA 1MY3A 2QS1A 2ABHA 3CRBA 4P11A 1JQFA 2PVUA 1SW5A 4KCCA 1MPBA 3U1OA 2GH9A 3GBBA 3I5OA 4PFUA 2NVUB 4G68C 2ONSA 3RNNA 4F3GA 2ZNTA 5I56B 4GL0A 3IJXB 1MQDA 4ZEKA 2AL4A 5BWJA 2F7CA 1PDAA 2GHBA 1Z7NE 1JETA 1VE4A 1MQIA 3C4MA 3KSXA 4M1VA 2HZKA 1JW1A 2WKYA 3TZAA 2UVGA 1L5TA 5KDTB 3B6WA 3V5AA 4NF5B 2HFBA 4R9FA 4PFTA 1US4A 4ZZEA 3SKPA 3N6UA 4ZECA 4QSDA 4XKPA 5KCJB 1JVXA 1OMPA 3KN3A 2QMXA 1QJMA 4OENA 1B5JA 4GOTA 2XXTA 2ZNSA 4PFWA 4F3BA 3IOUA 4RYAA 4QFNA 1PBPA 4R9GA 2XX7A 2H5YA 3GLBA 3KJ7A 3VVDA 3LR1A 2ZYOA 3MZ9A 3IK6B 4OZ9A 3FVNA 4NF6A 3H7MA 1DPPA 4XKNA 3DELB 1A8EA 3I3VA 2E0SA 2O1MA 2O68A 1AIVA 2DE2A 4F18A 1LFHA 4IO6A 5L8DA 3IOVA 3TTKA 3EPEA 4GF8A 4I1DA 4N13A 4F31B 1FTOA 3W15C 2F36A 1B3HA 2UYEA 3Q25A 3TODA 5K2YA 3ILTB 1FQAA 4Z0IA 2ZMBA 1YTVA 3THIA 4U23A 1A8FA 5F7VA 2O51A 3SETA 3MPKA 4R6YA 4PETA 3PMXA 4OESA 3FATA 4U21A 4LA9A 3VDFA 1O7TA 1MRPA 3OXNA 2FA7A 2ZYNA 3MWBA 3G3GA 3HHFA 4G8HA 1XS5A 4OVJA 4RK9A 2OK2A 3HN0A 5A5XB 3SDFA 3FV2A 4DE8A 3OO7A 2B3BA 3GZGA 4YICA 4QFOA 3TCGA 1RKMA 3SEWA 2UYFA 3C36A 3U94A 5FTIA 3K00A 3KEIA 5TPAA 1S9TA 5B70A 3CIJA 4HTGA 3E13X 1VFDA 1FQBA 2OWSA 4AB6A 1B52A 4LONB 1N3XA 4YB7A 3RT8A 1NNFA 2A5TB 1DTGA 3RN8A 5L9SA 3ODBA 1Y20A 4ZEBA 1SYIA 1P1UA 3OELA 1A40A 3FVGA 4GRKA 2PBWA 2OBGA 4F1VA 4YB5A 4PE5B 1LB9A 5KZTA 3S9EA 4E0XA 4JWOA 5DTBA 1OLCA 1B05A 1IZ1A 3K2DA 4G68B 3E3KA 1M5BA 3K0VA 5J1DA 4NTLA 2X7PA 4KI0E 4EQ7A 4H65A 4DCYA 2F8DA 3FXUA 3RTWB 3PPQA 2RC9A 3H6VA 3K01A 4FIMA 3U72A 3MVYA 5I2NA 2Z8FA 3FASA 4IO4A 4ELOA 2R9JA 5IAIA 3DLNA 2DSFA 4IGRA 1ZJLA 1B4HA 5HBCA 4Z7EA 5DVFA 4O3BA 2QPQA 3SEUA 3OO9A 4N6PA 5CM6A 2UVJA 1TWYA 4F39A 1B5IA 4XKQA 3SESA 3OMBA 4DLDA 2O7IA 5CMBA 1IITA 3G3JA 4ELRA 1XC1A 1FTJA 4ZE9A 1MXUA 3B6TA 3O9PA 3A09A 1FQDA 1UQWA 4F19A 3S9LC 4H67A 1UTHB 4IB2A 3GXAA 4GXAA 2DYXA 2DP8A 3U92A 4H5GA 5TP9B 2DVCA 1MXWA 4OETA 4F2QA 4ESXA 3O66A 3EHUA 1J1NA 3HPIA 3TKDA 4KHZE 1I6BA 4LZ7A 2OWTA 1JNFA 1PBQA 1TT1A 1P1QA 1A55A 3FJMA 3M8UA 1D9VA 3O2AA 3VXBA 3WAEA 5L9MA 3KOTA 3T9XB 3QIMA 4I8CA 3H3GA 3RTFB 2OJTA 4Q0CA 4RXLA 5L9OA 3LBSA 2DWIA 4DDDA 3PV0E 2Q88A 1MQJA 1HSJA 4G8NA 4OFLA 5DYHA 1IXIA 4QFPA 4R72A 5H8QB 2FNCA 1ZU0A 4XKRA 2Q2CA 4P0GA 4JXIA 1SI1A 4RA1A 1H43A 4BDQA 1II5A 3FJ7A 3PGFA 4OXVA 3MP6A 4G8MA 4LZ5A 3TAJA 4C0RA 1UTBA 3W9VA 1D9YA 2I0CA 4C1UA 1FTLA 4LP2B 3C34A 4GLIA 3F11A 3QUJA 5ELVA 4IO2A 5IKBA 4JB7A 4X9TA 1QVSA 3T22A 3U93A 1EZOA 1KWHA 1WDNA 5AA2A 1OQGA 2F34A 2REJA 1R9QA 5K2XA 1SYHA 2AIXA 4QRZA 1B1HA 3UN6A 4O3CA 1Y3PA 4FJPA 2DQVA 3R6UA 2P1SA 3TYHA 3LSWA 2OLBA 3PPRA 2OZZA 1R9LA 5DEXA 5FTHA 3TELA 4WEDA 3ONMA 3Q27A 3C33A 4EDPA 2R6GE 2BJJX 3BBRA 5AA4A 2RF1A 1LAGE 3D4CA 5I56A 2O69A 5EYFA 3B6QA 4NWCA 1M5FA 3LSLA 3T9VA 4KYDA 4IGTA 4BLAA 1OIBA 5KDTA 1POTA 4FEBA 3MUQA 3PMVA 2O6AA 1BTJA 3S2VA 3DP6A 4NEDA 1BIYA 1TXFA 2DOJA 5CRYA 3IOTA 4POXA 4DIGA 1USYE 1MH4A 1H3DA 3PPNA 4R73A 3TUSA 5JTYB 2HCAA 5CI5A 4KCDA 4JDFA 3SEVA 1N7WA 2QS3A 2HXWA 3MPLA 3MZ1A 1LCTA 5CBRA 2DE3A 3DM0A 4JWXA 4P0IA 4MLQA 4OEVA 2W7YA 3CG3A 2H9BA 1CB6A 4DCXA 1NKXA 4IO5A 4MLVA 3IB0A 3FJGA 4ESWA 4PQJA 2F97A 4KPTA 3AXFA 2F6GA 3O28A 1ELJA 2Y7KA 2XXIA 4JBZA 3G3FA 1LSTA 1SI0A 1I69A 4TQUQ 3DP4A 4NF4A 4OFJA 3QAXA 3QSLA 4R6KA 3PD9A 2HQ0A 4FORA 3K6UA 1I6AA 4OYVA 2O84X 3BKIB 2XHDA 3TPAA 1XT8A 4R74A 1URGA 5CMCA 2F5XA 4NF8B 5JEIA 1A99A 3OO8A 1B3GA 5ITOA 1P1NA 4DXBA 4GXSB 2DVZA 4XIGQ 4K3FA 1MY2A 4YKIA 3E9XA 4H1XA 1BP5A 2O7UA 3H4ZA 2VD2A 1YPNA 4F22A 4LUBA 5I84A 5A5XA 1JEUA 4Q5TA 2F78A 2ZYKA 4QFKA 3IO4A 3K02A 3FXRA 2B3FA 3T9HB 5TU0A 5I58A 1EZ9A 4THIA 3W9WA 2QRYA 4EUOA 2Z22A 3IJOB 1JEVA 1B4ZA 1QUKA 1Y9UA 4NF6B 4OHNA 4QSCA 4YZZA 1SQYA 2F6PA 1URDA 1MM7A 4EQBA 3BFTA 3TEPA 3IO6A 4EXKA 1IXGA 3VE1B 2AL5A 5FHMA 2F35A 1MPCA 3FUZA 3K1NA 2NUVA 1SW4A 3IAZA 3MZBA 3MW0A 5H8SA 5CBSA 4RNSA 1GV8A 3C9HA 3H6UA 2V84A 1D3KA 1LLSA 1R1NA 3GBAA 3VVEA 1UIVA 4DZ1A 1QKAA 1N76A 1LCFA 1MXYA 4YKJA 1DOTA 1XVXA 1EZPA 1RYXA 2DXRA 4R2BA 2YJPA 1B6HA 5FHNA 3B7DA 3TCHA 1OVTA 4N07A 2Q9TA 3KN7A 3UGWA 4LQ2A 5ISUA 4TLMB 1LBCA 3UORA 3P7IA 1GGGA 4BDOA 3H6TA 3MC2A 3K6VA 2KLFA 2Q8JA 3QK6A 2M8CA 3TQWA 1SW2A 3FIRA 1JW5A 3RQTA 4DXUA 3O6GA 4ND9A 1MQGA 2XX8A 3IB1A 3A3UA 5I2KB 4MBPA 3PUYE 5TPAB 3EN3A 1QUJA 3PUVE 1B0LA 1UTHA 4Q30B 3TMGA 1GR2A 3TDJA 5TP9A 2V93A 3U8QA 2X26A 2QL3A 3C32A 4HCYA 4ZE8A 1A54A 3M3KA 4HCWA 4FECA 1HSLA 1BLFA 1FQEA 1B5HA 4RJZA 1B7UA 1Y4CA 2Y7IA 4F2OA 1F9BA 4U1OA 2F7AA 3K1PA 3Q26A 3JZJA 3IL1B 1Z7ME 5AA3A 2I6EA 4F1YA 3UA8A 5H8FB 1NMUA 1T0KA 3LSXA 3IORA 3CFZA 1MH3A 1O64A 4O3AA 3M3LA 5H8NA 3TFLA 3KGCA 5EHSA 5HPQA 5I2NB 1ANFA 3V8XB 2IEEA 4GQOA 5LOMA 5I59B 4LVQA 1GTKA 4U4SA 3H06B 4ONYA 2HEUA 2P2AA 1B0HA 4YKKA 2D5WA 3OEMA 4U1ZA 2ANJA 1P1OA 2QS4A 1OQHA 1XOCA 5I57B 2GRVA 1R6ZA 2XXVA 3CG1A 4AB5A 4ZZAA 4QHQA 3N94A 1N7XA 2O1LA 3MBPA 1P1WA 2H4IA 1UIUA 3R7XA 1VR5A 2XXWA 1ZKBA 1H45A 2X7QA 1URSA 4RY1A 2DWAA 3EHSA 1USYH 3ZKLA 2XD3A 2XXPA 2YLNA 1DTZA 4R6HA 3SEYA 5BUUA 5M2VA 1LGBC 1P99A 2VD3A 2I0BA 3UIFA 1IXCA 2Z8DA 1WODA 4EF1A 1B2HA 2I3VA 1FQCA 1JVYA 4YKPA 5H8HA 2RCBA 3CSGA 1LFIA 4JSDA 1D4NA 1MY4A 3OEKA 3H03A 1IEJA 4X48A 5HM4B 3PD8A 3PUWE 4DXCA 1B9JA 4L17A 4RPOA 1AMFA 1YCJA 4GD5A 1N84A 4U2RA 3N5LA 1UTBB 2I4CA 3ZSFA 2RINA 2VOZA 2XX9A 3VLVA 3TQLA 4IY5A 3C31A 3CSBA 2RCAA 3MP1A 5ICTA 1AH5A 2PX1A 4PFYA 5AA2B 4NF5A 3MAMA 4G2ZA 2UVIA 1MY0A 1OVBA 4UA8A 2R71A 1Y1MA 1M5EA 3CFXA 4EF2A 4KFQA 5KCJA 5DT6A 3I6VA 1A7LA 4NE4A 3KG2A 5DEXB 1ZBMA 4PP0A 3RGYA 4BDMA 1NH7A 1ZTYA 3VLUA 5AA4B 3UP9A 1MG1A 4TOZA 1OLAA 1ZMGA 3S4UA 3ECRA 4NF8A 2RKMA 4ELPA 4GWOA 2QJEA 3K1MA 4U4XA 2AYSA 3HSTA 3PUZE 3H6WA 4LATA 5JK4A 2OCUA 3LUYA 3PMWA 3CI8A 1B1XA 1POY1 4MFIA 1B3LA 4IO3A 1SVXB 2YPNA 3RT6B 3KFMA 3T96B 1HSEA 1Y3NA 3RLFE 2UXAA 3SEXA 3OSQA 1JW4A 4ZEFA 2I48A 1SDXA 4H0WA 2PT1A 1Y3QA 2NXOA 2ONRA 1TFDA 3FVOA 3EHTA 3SERA 1SBPA 3D4GA 3O29A 4R75A 4G77A 1B46A 3G3KA 3T9UA 3K4UA 3MQ9A 1NH8A 1SW1A 5AA1A 2Q89A 1N3WA 3LSFB 4UACA 1N0TA 1GVCA 4BDRA 1MS7A 2F7BA 2ALUA 3PPOA 4JSOA 4ECFA 2Z23A 4FEDA 4I9DA 2DWHA 4H5FA 4X1BA 1IXHA 1VFEA 2Y84A 3VLWA 4NF4B 4H8IA 4OQOA 3VXCA 2V3TA 1NL5A 1NNPA 1QW0A 4POWA 1FW0A 3QYTA 2VP1A 1ATGA 4LQ5A 2DWJA 1MDP1 2PYYA 3Q29A 4JWYA 3IX1A 3KBRA 4YAHX 4AQ4A 3UK4A 3TTLA 3MVZA 2UVHA 3DP8A 2A5TA 2RC8A 2ZNUA 3L6GA 4H8JA 4YU0A 4I62A 5B7DA 2I49A 3JYRA 2FYIA 3FVKA 2XXYA 3TTRA 1Y1ZA 1CE2A 4ZS9A 4IY6A 1MDQA 1QKBA 3FGSA 3OSRA 4QF9A 4TLLB 3ZKKA 3FD3A 2CMOA 4G68A 1N04A 1VSOA 2HAVA 2V25A 1MXXA 2GFEA 3PUXE 5I58B 2I4BA 4KQPA 3KSJA 3S9NC 1FTMA 2THIA 3G7WA 2QS2A 4OFOA 3O6HA 5DVIA 5I2KA 3CR9A 3TCFA 3V89B 2NWJA 2Q2AA 5FHOA 1PB8A 1PC3A 4HW8A 2D3IA 1SD3A 1NNTA 3C35A 4WEPA 3KZGA 1H44A 4EQ9A 4KYEA 3WAFA 4NMYA 3VV5A 2HAUA 1NNKA 4GVOA 4MF3A 4EXLA 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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