1DTGA

Human transferrin n-lobe mutant h249e
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
Knots found
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDNYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSETVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutation of the iron ligand His 249 to Glu in the N-lobe of human transferrin abolishes the dilysine "trigger" but does not significantly affect iron release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 331
sequence length 331
other databases KnotProt 2.0: K
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dtgA02
5F7VA 3C35A 3FXUA 3KJ7A 2Q9TA 4BDNA 1SW4A 1R9QA 3KZGA 4GXAA 2NUVA 2Y7RA 2XXXA 3RLFE 3C32A 4DXBA 3OENA 1WVJA 1PB9A 3E4RA 2G93A 4MFIA 3H03A 4ZECA 3FXRA 4IGRA 1MQJA 3IAZA 3TCFA 1S50A 4ZDMA 1JVYA 3C33A 4KCCA 3TEPA 1GVCA 1M5BA 4YZZA 1MY2A 4EXLA 5DT6A 2RF1A 2D21A 4X48A 2I3WA 2RINA 3RY3A 1NNPA 4G4PA 2Q89A 4H1XA 4HW8A 4F3PA 1IZ1A 2REGA 1B5IA 1VE4A 2DYXA 2ZYKA 4FEDA 2O7UA 3H6WA 2B3BA 1B5JA 3OO7A 1TFAA 4H67A 2XXYA 3IR1A 1PBQA 3PMVA 2ZXTA 1P1WA 1XVYA 2D3IA 1B3EA 4MLVA 2ONKE 1I6QA 3F11A 4YKPA 2Q2CA 2V25A 5CRYA 3TQLA 4DIGA 3G3KA 4QFPA 4QFOA 1LBBA 4QF9A 3E13X 3B7DA 1N76A 4O3BA 1QULA 1LSTA 1IXIA 1XS5A 5L8DA 1PEBA 1VFDA 4ND9A 1B2HA 4DZ1A 1H76A 4R2FA 1ZKBA 1MXYA 3O97A 3DP6A 1B58A 5I58A 5DVFA 3IL1B 1NKXA 1Q1KA 3N5LA 3Q26A 3MZ9A 4P0GA 5CMMA 2DVCA 1H45A 4RK2A 2ZYMA 4OEUA 4ONYA 1HSJA 3C36A 1B1HA 3PGFA 3K1NA 4R9GA 4KFQA 3MAMA 4ELRA 3ZS6A 3OSQA 4WEDA 4BDMA 4JBZA 3BFUA 3JV9A 4F29A 1ELJA 5I2NA 1LFGA 1R6ZA 4LUBA 5J1DA 4ZZAA 2VOZA 2UVIA 3U92A 1FQCA 4JWOA 2F97A 3K0VA 2QMXA 3SESA 2Z8FA 1ZTYA 4GXSB 3MQ9A 4ISUA 1QVSA 4Q30B 4PFTA 4JSDA 1ZJLA 2R71A 3H3GA 1QUIA 2QL3A 1TXFA 4EF1A 1D9VA 1LB9A 2ZYNA 3TMGA 3O29A 3QSLA 3CVGA 3FJGA 4GVOA 4OFLA 5I58B 1A7LA 1M5FA 4ELOA 2Z23A 2Z8DA 5H8SA 2QJEA 4GIZA 1NH7A 4KQPA 1MY0A 1AIVA 4F1VA 4F1YA 2HZKA 5JK4A 4KD5A 5L9MA 1J1NA 4H5FA 5H8FA 1B0LA 1OQHA 3IK6B 4NF4B 4WEPA 4ZZEA 5IAIA 1GTKA 4BLAA 1FTOA 2UVGA 3E9XA 4C0RA 3K2DA 4ECFA 1VFEA 1B5HA 2I49A 1Z7ME 3EHSA 2IEEA 3OEKA 4G8NA 2ALUA 4LVQA 3IORA 1MXWA 3K1PA 3N94A 2ESNA 4NF5A 3KOSA 4X9TA 3O28A 4ZEFA 3T96B 3EQ1A 3ONMA 4G68A 4ESWA 3DLNA 5ICQA 4L17A 4LZ5A 1PDAA 5JTYA 1I6AA 4YICA 4JB7A 1MPBA 1US4A 4RPOA 4P0IA 3RT8A 3GBAA 1B52A 4Q0CA 4RPNA 2I0BA 4IB2A 1NL5A 3RN8A 3RQTA 4H0WA 3LR1A 4ZEBA 5I2KB 4UACA 3V83A 3CSBA 5BWJA 4RYAA 5I59A 1B3GA 1BKAA 4PP0A 1LAFE 3A3UA 2A5SA 3EHUA 1URSA 3PPOA 3T93B 4EQBA 3KFMA 3TZAA 4K3FA 1LGBC 3BBRA 3LBSA 3KEIA 3IJOB 2Z22A 3UGWA 5I57A 5DVJA 3KJTA 2BJJX 1SYIA 4MF3A 2Q8JA 4PFYA 1B0HA 2ZMBA 1N3XA 3QUFA 3IB0A 1FTKA 3USDA 4HTGA 2I48A 3TTKA 3H4ZA 1NNFA 1MY3A 3TCHA 3O9PA 3CFZA 1B7UA 4XKQA 2DWHA 4FEBA 3DP4A 4NF5B 1IXGA 3HCQA 2DOJA 4R6KA 5FTHA 1Y1MA 1SI0A 4G68B 2XXRA 3IJXB 1VSOA 3OXNA 2I4CA 4LQ5A 1FTLA 3OOAA 4ZEIA 2OBGA 4DLDA 1A99A 1Y9UA 3TPAA 4EUOA 3KOTA 2Q88A 4EXKA 3SEYA 4IO3A 1O7TA 4GFRA 1IQ7A 1PBPA 4PE5B 3IB2A 3RNNA 4NTLA 5AA4A 1YAEA 3PD8A 2PMSA 1NH8A 1ATGA 3W9WA 1TT1A 3OO6A 1FQAA 4R72A 5ISUA 4EQ7A 1A8EA 3MP1A 3PPPA 1MXXA 3HO7A 4JDFA 2DSFA 3PMXA 3SEUA 1XHYA 3T66A 4G2ZA 3T9HB 3ILUB 2XHDA 3KGCA 4YMBA 4FJPA 3PPNA 5EHMA 4U21A 1EZ9A 3FV1A 4TQUQ 1LCTA 5DEXA 3SDFA 2E0SA 3C31A 3S9LC 4OZ9A 4XKRA 3FV2A 2H4IA 4GL0A 1POTA 3FZVA 5ELVA 3M3LA 2R6GE 3A09A 1Y3QA 4PFUA 4QRZA 2O1MA 1II5A 2F78A 5TPAA 1TFDA 5CMBA 4JWYA 4NMYA 4Q5TA 3O66A 2A5TB 3Q27A 3VDFA 4PQJA 3K00A 1OQGA 1YPNA 3TUSA 5AA4B 1RYOA 4PETA 3UA8A 2XX9A 3MUQA 3N6TA 4YAHX 3FVKA 3RTWB 2DE2A 2QS3A 5CMKA 1US5A 3C9HA 3K6WA 1A54A 1L5TA 1OVBA 3K1MA 1B4HA 1MY4A 4KYEA 1AMFA 1B1XA 5A5XA 2DVZA 3QIMA 3IX1A 1DTGA 4MLQA 5KCJB 4X1BA 2DQVA 3K02A 1PB7A 1GGGA 4F18A 1QUKA 3MBPA 3THIA 2HZLA 3QYTA 1B46A 4OHNA 3LUYA 2B65A 4I62A 4OQOA 3S2VA 1OLCA 5EYFA 3T22A 1N04A 3H6VA 1UQWA 2XXIA 1AOVA 1DSNA 5K2XA 1Z7NE 5HM4B 1LLSA 3L6GA 1IIWA 3IOVA 1MQDA 1B05A 2ZNTA 2Z8EA 1YCJA 5ITOA 4R73A 3TKDA 3MVXA 1CB6A 3LC8A 4R9FA 4NF6A 4YKIA 1ZMGA 4DDDA 2O69A 1N84A 2B3FA 3V89B 5H8NA 2PVUA 3ZKKA 4R6HA 2XXUA 1FTJA 4GQOA 2OJTA 5JEIA 1B7HA 1FQFA 1HSEA 1URGA 4HCWA 4QHQA 1A40A 4XXUA 1ZU0A 3M3KA 3MW0A 3B6TA 3MVWA 2GFEA 2X7PA 1BIYA 3MPKA 2O1LA 1KWHA 5A5XB 1MRPA 2QS4A 3C34A 4LQ2A 4QFNA 1N3WA 4GD5A 1FQEA 3P7IA 4YKKA 4M1VA 4BDQA 4DXUA 4F19A 4YKJA 1BP5A 1Y3NA 4IO6A 3R7XA 1JW5A 1UIVA 1MXVA 1SYHA 5AA1A 3PD9A 3RPWA 2VD3A 4PFWA 3ZSFA 2OZZA 2YLNA 2NOOA 3K01A 5H8HA 1VR5A 1P1NA 3TTNA 1A55A 4DXCA 1UTBA 2V84A 4OTEA 4E0WA 3H6UA 4E0XA 3CRBA 1SW5A 1HSLA 2M8CA 2XXPA 4IO2A 3JYRA 2Y7KA 4NF6B 3O2AA 4ESXA 2V3QA 2RC9A 2XX7A 2QMWA 1DOTA 3TDJA 3CR9A 5HPQA 1T0KA 4RJZA 4FIMA 3VLVA 3TAJA 3RT6B 5I2NB 1Y20A 5TU0A 1S9TA 1UIUA 1FW0A 4MH5A 4QFLA 5I84A 4F39A 1MPCA 4OMBA 4FECA 2CZLA 5CBRA 1IITA 3KBRA 1R9LA 3I6VA 2HXWA 1LAGE 4GRKA 5KDTA 3FIRA 1LBCA 2F7AA 1A8FA 2AL5A 1RYXA 1XOCA 1SBPA 3MJNA 1GR2A 1ZBMA 4GOTA 2RCAA 4EQ9A 4QSEA 4JXIA 4R75A 4M4GA 4KR5A 4DCXA 2W7YA 2XXQA 3TODA 2ABHA 1MS7A 1MG1A 1SQYA 4JSOA 2HAUA 2DXYA 4IO7A 4F31B 1O63A 1CE2A 2F35A 3FD3A 1BLFA 4IGTA 3O6HA 4XIGQ 4Z0IA 5FTIA 3FJMA 1FQDA 3U72A 1MDP1 3M3FA 3UORA 1DPPA 3VVFA 4U23A 1UTBB 3K4UA 3V8XB 1JW4A 3FVNA 5H8FB 1YTVA 4GWOA 1S7YA 2D5WA 5M2VA 1MM6A 3HPIA 2RCBA 4F3GA 3DM0A 3FASA 3C4MA 3CFXA 4R2BA 3FVOA 4XTCQ 2DE4A 3V5AA 3EN3A 4G77A 4IO4A 2HCAA 3MVYA 5LOMA 5B70A 2CMOA 3ILTB 3UIFA 3U8QA 2KLFA 3VVEA 1M5CA 2RC8A 4NE4A 1IUDA 3CSGA 4FE8A 3MPLA 4I1DA 3OEMA 1MY1A 1DPEA 5L9SA 1B9JA 4NEDA 1QJMA 2F8DA 1H44A 4OETA 5CBSA 3VXCA 2NWJA 3IO6A 1D9YA 3G3JA 2F34A 2GHBA 3TQWA 3VE1B 1Y3PA 1SW2A 4GLIA 3VVDA 1EZOA 4GF8A 2QS1A 1JETA 2F7CA 4OESA 4OXVA 5FHNA 2HQ0A 3QXMA 4OFOA 5JTYB 4ELPA 2H25A 3TTRA 3FVGA 2P0SA 3S9MC 3PUZE 5ICTA 3ODBA 3BFTA 3TYHA 3WAFA 2V3UA 4U1ZA 1MDQA 2ZNSA 3GLBA 5I56A 1JEUA 4GL8A 4XKNA 3FUZA 1B4ZA 4THIA 3UN6A 2WKYA 3RUMA 4FATA 5I59B 1B32A 2PT1A 3PPRA 2P2AA 1B7ZA 4ZEDA 4OEVA 5FHMA 4DE8A 1B3FA 1XVXA 5DTBA 4G68C 5I57B 1PB8A 4KPTA 1ANFA 2DWIA 1JVXA 3Q29A 3GBBA 2ANJA 3TCGA 3MC2A 2F7BA 1D4NA 2ZNUA 4KCDA 4QFKA 1F9BA 3CIJA 4QSDA 2I58A 3IOTA 3ECRA 4F2QA 3OMBA 2OWSA 1ZIUA 4AB6A 4I8CA 3TFLA 3S4UA 2H5YA 3O6GA 3K6XA 2FYIA 4H5GA 1OMPA 3U1OA 2DE3A 2PBWA 4F2OA 4IY6A 2UYFA 1DTZA 3KN3A 4AB5A 2AIXA 3G3FA 4H6DA 1XC1A 1AH5A 5I56B 1ZLQA 1OLAA 5DVIA 2YJPA 2VHAA 5B7DA 1XT8A 1LFHA 3T9VA 4RNSA 4ZE9A 1MXUA 1NMUA 1LAXA 3QK6A 2G29A 1PC3A 3Q28A 4POWA 2I3VA 1FCKA 3G3HA 3MP6A 4AQ4A 5K2YA 2XXTA 3G7WA 3KG2A 3BKIB 5ITPA 4C1UA 3RTFB 3GZGA 4BDOA 1MQIA 3S9EA 4WKMA 4NF8A 3KSJA 3I5OA 1IEJA 3T9XB 5DEXB 4F1UA 4YB7A 4I9DA 1MQHA 2UYEA 5F1QA 2HAVA 1QKAA 2FNCA 4HS7A 5HBCA 1OIBA 2UVHA 4OFJA 4KYDA 4N13A 3CI8A 2HFBA 4RXLA 4H65A 5AA2A 2Y7IA 5FHOA 2AYSA 4F3SA 2ZYOA 4KI0E 1BTJA 2ONSA 3VXBA 4XKPA 4FORA 3HN0A 3UP9A 3FJ7A 4LA9A 3PUYE 3H06B 1JW1A 5TPAB 3U94A 2GRVA 2OWTA 2E1SA 4ZEKA 4NF4A 3G3IA 2XD2A 4R6YA 3TTLA 2QPQA 2X7QA 3L6HA 3WAEA 4HCYA 1IXHA 3SEVA 2O6AA 2DP8A 3E3KA 1DMBA 3OO8A 2O51A 3LSXA 3PMWA 1TWYA 5H8QA 2H99A 2I0CA 4YMAA 3R26A 3EF7A 5IKBA 3TELA 3LSLA 2H9BA 4C1TA 4IY5A 3PUWE 3N6UA 3N26A 3SEWA 2V3TA 2ONRA 4P11A 1UTHA 3KN7A 4F3BA 2DWJA 3FGSA 3CFLA 1H3DA 1M5EA 3U93A 1EU8A 4NF8B 4RK9A 2I4BA 5KZTA 1EH3A 2VP1A 1MH3A 3KSXA 4DCYA 4X1DA 1MM7A 3MP8A 2PYYA 3PUXE 4OYVA 1R1NA 2R9JA 1B3HA 2QRYA 1H43A 1AL3A 1JQFA 5AA2B 1LFIA 2X26A 3CG1A 3HHGA 5TP9A 3B6QA 1Y4TA 3IOWA 2XXHA 5I2KA 4OERA 3D4GA 2XXVA 3IO4A 3QUJA 1FTMA 3G3GA 2OLBA 4H8IA 5H8NB 3I3VA 3MZBA 1RKMA 1NNTA 5EHSA 1M5DA 3FATA 4LZ7A 4OVJA 1USYH 2P1SA 2XX8A 3OD7A 3W9VA 3FXQA 1LCFA 5H8QB 3CG3A 2FA7A 2UXAA 5CM6A 3K6VA 1O64A 2NVUB 5AE4A 3SEXA 3K6UA 1P99A 3AXFA 5CC2A 2QS2A 3PUVE 4KYSA 2QSXA 4Z7EA 2H98A 3LSFB 3RGYA 3VLUA 4O3AA 3T9UA 2XXWA 1UTHB 2XD3A 1OVTA 4NWDA 5BUUA 2UVJA 1P1UA 4YB6A 4JWXA 3ZKLA 1N7XA 3PPQA 2LAOA 4ELQA 2Y84A 2O7IA 1MXZA 4IO5A 3QAXA 2O84X 3HHFA 3UK4A 1P1OA 4OWDA 3GXAA 4U4XA 4OENA 3OSRA 2DS9A 5H8HB 4WXJA 1Q35A 4KHZE 2F6PA 4N07A 2REJA 3SETA 1B6HA 3W15C 2Q2AA 4TLMB 4O3CA 3H6TA 1I6BA 5TP9B 3SERA 2F36A 1Y4CA 3KN8A 4EF2A 3PV0E 1MH4A 3OELA 1NFTA 3IB1A 1MQGA 1SDXA 1P1QA 5CI5A 2PT2A 3Q25A 1IXCA 2THIA 3VFJA 2DWAA 1JEVA 1SD3A 4LZ8A 1USYE 2YPNA 1D3KA 4FAJA 3VLWA 2DXRA 1WDNA 3S9NC 2Y7WA 4R74A 2HEUA 1B51A 3JZJA 4QSCA 2VD2A 3B6WA 1I69A 5AA3A 1MPDA 1WODA 2OCUA 3IOUA 3MWBA 4U1OA 3R6UA 1N7WA 5KDTB 4NWCA 3A3CA 1GV8A 3MVZA 2PX1A 4U22A 1QUJA 4Q8RA 1LAHE 3VV5A 4EDPA 4TOZA 1QW0A 4U2RA 1URDA 1FQBA 2I6EA 2RC7A 3EHTA 1SVXB 4RY1A 2F6GA 3OO9A 4ZS9A 4N6PA 3HSTA 5L9OA 1POY1 1SI1A 1EZPA 3MZ1A 4RA1A 1Y1ZA 4ZE8A 2IA4A 3O6IA 1N0TA 1QKBA 4UA8A 3PU5A 1SW1A 3DP8A 4YB5A 4LP2B 3HV1A 2RKMA 4POXA 2NXOA 3M8UA 2OK2A 2GHAA 4YU0A 5DYHA 2A5TA 1B3LA 2VGQA 3LSWA 1B40A 5CMCA 4LONB 4F22A 2AL4A 3SKPA 3EPEA 5AA2D 4BDRA 4G8MA 4U4SA 2Y7PA 2F5XA 4LATA 1LB8A 4H8JA 2O68A 2GH9A 4MBPA 4BDLA 5KCJA 3D4CA 4TLLB 3TTMA 1NNKA 3DELB 1JNFA 3H7MA 4G8HA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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