1EU8A

Structure of trehalose maltose binding protein from thermococcus litoralis
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
IEEGKIVFAVGGAPNEIEYWKGVIAEFEKKYPGVTVELKRQATDTEQRRLDLVNALRGKSSDPDVFLMDVAWLGQFIASGWLEPLDDYVQKDNYDLSVFFQSVINLADKQGGKLYALPVYIDAGLLYYRKDLLEKYGYSKPPETWQELVEMAQKIQSGERETNPNFWGFVWQGKQYEGLVCDFVEYVYSNGGSLGEFKDGKWVPTLNKPENVEALQFMVDLIHKYKISPPNTYTEMTEEPVRLMFQQGNAAFERNWPYAWGLHNADDSPVKGKVGVAPLPHFPGHKSAATLGGWHIGISKYSDNKALAWEFVKFVESYSVQKGFAMNLGWNPGRVDVYDDPAVVSKSPHLKELRAVFENAVPRPIVPYYPQLSEIIQKYVNSALAGKISPQEALDKAQKEAEELVKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a liganded trehalose/maltose-binding protein from the hyperthermophilic Archaeon Thermococcus litoralis at 1.85 A.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermococcus litoralis
molecule keywords TREHALOSE/MALTOSE BINDING PROTEIN
total genus 144
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A01
2XXQA 3L6HA 4ZZEA 5A5XA 4NF8A 1S7YA 1LGBC 3EHSA 3UA8A 4PFYA 1DPEA 3EHUA 4M4GA 3MVYA 4R6YA 2I58A 3FVNA 1QKBA 3BFUA 4IO7A 3ODBA 3MP8A 1BP5A 1NNKA 3VVDA 1FTLA 3A3CA 3LSWA 4BDOA 1SDXA 3KBRA 3ZSFA 2D21A 4XTCQ 2THIA 4QSEA 3S9MC 3U8QA 3TAJA 1QKAA 4IB2A 1TT1A 1NNPA 1MXYA 4YICA 4ZEDA 1B1HA 3MQ9A 4MBPA 1B3GA 1URDA 5CMCA 1NMUA 4U23A 5LOMA 3SEVA 1B58A 4LZ7A 1GR2A 3AXFA 4OVJA 4GL0A 5KZTA 1OQGA 1SW1A 1PB8A 3G7WA 1LAGE 2I4BA 3IR1A 3PUVE 2F6GA 2Z8DA 1R9QA 3U93A 3PV0E 4WXJA 4KD5A 2F7CA 4RPOA 4OESA 1B0LA 2RCAA 2XD3A 4IO4A 3C34A 4WEDA 3K01A 3N26A 1SI0A 1MXXA 1CE2A 3QUJA 3TODA 1USYE 3HPIA 1MXUA 4ZE9A 4FEBA 2A5SA 3C4MA 2OLBA 1MQJA 4GLIA 3H6VA 2XX9A 4YKJA 1OVTA 3PMVA 3TEPA 2DWAA 1IUDA 3PPNA 2HQ0A 4EQ9A 3THIA 1B9JA 5AA2B 1LBCA 3RUMA 3N6UA 1MPDA 2NVUB 4OWDA 3W9WA 1LAHE 2QRYA 3ONMA 3H3GA 3SETA 4IGRA 4XKRA 2G93A 4NF4B 3VE1B 2RCBA 5HBCA 2PT2A 4H1XA 4X9TA 3UIFA 1FQAA 3FXUA 1O63A 4JSDA 3GBBA 3T93B 3C35A 1S9TA 3CFXA 4GRKA 1LB8A 5K2YA 1FQCA 4R9FA 2O6AA 1GV8A 3K6WA 3TTMA 1HSJA 3DP6A 3IL1B 5AA4B 3H06B 5L8DA 1PBQA 2XXRA 1Y20A 1L5TA 4G77A 2DOJA 4YAHX 1NH7A 2DWJA 4XXUA 4G68C 4RYAA 1ZTYA 3HHGA 1A55A 1I6BA 4IO5A 5I56B 4UACA 2FYIA 2QMWA 4FE8A 1D3KA 3I3VA 2HAUA 4MH5A 5CI5A 1VFDA 1FTKA 5H8QA 2E0SA 1AL3A 3RY3A 3TPAA 3OO6A 3N5LA 5A5XB 1PBPA 3CI8A 3ECRA 3PPPA 4NF8B 3TDJA 3TYHA 3OO8A 3TZAA 5FTHA 5CBSA 5DVJA 3TTLA 3CSBA 2X7QA 1MY3A 5DTBA 4ESWA 3VVEA 5ICQA 3P7IA 1VR5A 3E3KA 3N94A 3USDA 1Y1ZA 3G3HA 1TFDA 4ELQA 3VXCA 3H03A 4F39A 4F3SA 2F34A 1XHYA 3MP1A 1R1NA 2I49A 1YAEA 3KSJA 1SW5A 3SERA 3OSQA 1B7UA 1MQHA 3O29A 2Q8JA 4N13A 3C32A 1FQFA 2IA4A 3IO4A 5ISUA 3OENA 1DPPA 1YCJA 3H6TA 1B52A 1LAFE 5ITPA 2ZMBA 3S9EA 3K0VA 1B6HA 1VSOA 4RA1A 2UVJA 1T0KA 3RPWA 3QXMA 5CC2A 5AA1A 1CB6A 2P1SA 1QVSA 3FATA 2Z22A 3K1MA 2REGA 2NUVA 2AL5A 3TTRA 5EHSA 3MP6A 4EQ7A 2DQVA 3IJOB 2OWTA 1QW0A 4LATA 1PB7A 3FD3A 4O3BA 4GIZA 3UP9A 2R6GE 1F9BA 3D4GA 2HXWA 3CG1A 1B32A 1SVXB 1SD3A 2H99A 4OERA 3U72A 3PPOA 2H4IA 5DT6A 4BDQA 4LONB 2H25A 4U21A 2Q2AA 3KJ7A 1IXIA 4O3CA 4DIGA 3FASA 2M8CA 5TPAA 3E13X 2CZLA 1GTKA 1H76A 2V84A 1PDAA 2F97A 4QSDA 4IY6A 2R9JA 4JWYA 3G3FA 4R72A 1B7ZA 1N7WA 1TWYA 2O84X 3I5OA 1N04A 4R73A 1M5CA 4OTEA 1B3HA 3I6VA 4QHQA 2XD2A 4FAJA 1Q1KA 5F7VA 1QUKA 5L9OA 5J1DA 2QPQA 4XKNA 1XVYA 1UTHB 1H45A 3FVOA 1B5IA 3MJNA 5EHMA 2QS3A 2O68A 2E1SA 2YJPA 3HO7A 2QS4A 1B5JA 4OFLA 3VLWA 4F1VA 1MRPA 1Y3PA 3CRBA 3KN7A 4O3AA 5H8QB 2HEUA 4XIGQ 3O9PA 4HS7A 3CFZA 3M3FA 5I2KA 4AB6A 2OWSA 5CMKA 2GFEA 1DSNA 1J1NA 3T66A 4ZEBA 4KI0E 3RNNA 2Z8EA 3ZKKA 4THIA 2OK2A 4QFOA 4H8IA 3RQTA 1LCTA 3PMXA 2WKYA 4BDNA 1P1NA 4JB7A 1NH8A 4L17A 4YKPA 4GD5A 4YKIA 3SDFA 1FQEA 3G3JA 5B7DA 2DVCA 1M5BA 1FW0A 5CRYA 2A5TA 3JYRA 1N84A 4DCYA 3OO7A 2ZNUA 1N3WA 4OMBA 3O6GA 1MQIA 5H8SA 4ZS9A 3TUSA 4BDMA 5K2XA 3TTKA 3B6WA 3L6GA 2O1LA 3LSFB 2OCUA 1URSA 2REJA 3VFJA 3C33A 4ELPA 4GFRA 2RC7A 2RC9A 4R9GA 4DXUA 4PP0A 4R74A 2DWIA 4C1UA 3V89B 3KN8A 3G3GA 4QFPA 1QJMA 3OD7A 4E0XA 1RYXA 5M2VA 1O64A 2R71A 4H5GA 4RJZA 3MAMA 1MPCA 3EQ1A 1IXGA 4NF6A 4LQ2A 1IXHA 4GXSB 5H8HA 1JEVA 1Y4CA 2Y7WA 3TQWA 1JVYA 3G3IA 3FIRA 1H44A 1JETA 1MS7A 4NMYA 3TELA 3OO9A 2HZLA 4P11A 3OEKA 1GGGA 1JVXA 5TPAB 2QMXA 1P99A 4GVOA 1EZOA 3EN3A 1SI1A 5TU0A 3TMGA 4LUBA 5IKBA 1B4HA 4FECA 1DOTA 1Y3QA 3K6XA 3K6UA 4R2FA 2XXVA 5I57A 2AL4A 1JW4A 1OIBA 3FXRA 2Y7PA 3TCFA 1B3EA 5AA3A 4TOZA 4JWXA 5I58A 3ILUB 2UVGA 4ND9A 3TCHA 1ZJLA 4OETA 4QFNA 3MZ9A 4YB5A 1ZLQA 3KZGA 4G4PA 3VLVA 2ONSA 2XXWA 3OOAA 4YZZA 2O7UA 3MC2A 2BJJX 4R6KA 4XKPA 3LUYA 4TLMB 2HAVA 2F35A 4NEDA 5I2KB 4QF9A 4OEVA 1EH3A 3UN6A 3LBSA 4Q0CA 2Q88A 1MQGA 2RINA 4E0WA 2RF1A 3U92A 1UQWA 3T9XB 3KN3A 3KJTA 1I6AA 2YLNA 5DVFA 2B3FA 2NOOA 4QFKA 4GOTA 1ELJA 2F78A 3QSLA 1M5FA 3CR9A 4N07A 5BUUA 2ONRA 3K00A 3U94A 2DE2A 4LQ5A 4KHZE 1NL5A 4FEDA 3OEMA 1B7HA 1JEUA 3KSXA 4F2OA 4C0RA 3PUZE 1A8FA 1SYHA 3BBRA 2A5TB 3TQLA 3KG2A 4EDPA 1I69A 3IB0A 4F1UA 4X1DA 3CSGA 4QRZA 4PFTA 4H65A 4LA9A 3PMWA 3UORA 4LVQA 2B3BA 2ZYMA 1MY1A 4F29A 4AQ4A 5CM6A 1A7LA 5FHMA 2Y7RA 5AE4A 4IGTA 5FHNA 5TP9A 4PQJA 5JEIA 1OLAA 4ELOA 1R9LA 4WEPA 1R6ZA 4PFWA 3MVXA 3DLNA 3MVWA 1BKAA 2DXRA 2Q89A 4NF6B 2PMSA 4JSOA 1PC3A 3OELA 3IJXB 5H8HB 1VFEA 1I6QA 2LAOA 4UA8A 3O28A 3IAZA 1ATGA 1A99A 5CMBA 3M3LA 3MVZA 4ESXA 2HZKA 1OQHA 3RN8A 3RGYA 4GL8A 4AB5A 4OFJA 1H3DA 3RLFE 1Z7ME 1FQDA 1ZKBA 5DEXA 3GLBA 1UTBA 1LFGA 3OMBA 5ELVA 3KOSA 1JW1A 1FTMA 3MBPA 3RT8A 5I57B 2ALUA 3W9VA 4KQPA 1H43A 3C36A 4POXA 2ESNA 3H6WA 5AA2D 4OFOA 1SYIA 3OSRA 4DCXA 2PT1A 3FGSA 1QUJA 4Q30B 1OVBA 1ZBMA 4F3BA 3V83A 4NE4A 2O51A 3RTFB 3EF7A 5I58B 3MZ1A 4XKQA 3SEYA 2XX7A 1MY4A 1M5DA 2ZYNA 4NWDA 4YMBA 3LC8A 4FATA 1POY1 4Z0IA 4G2ZA 4Q8RA 3R26A 4F22A 2XXTA 3PPRA 4U1ZA 4FIMA 3IK6B 2QSXA 4MF3A 3FVKA 2XXIA 4FJPA 3S9LC 1LBBA 2H9BA 2F36A 1BTJA 4OHNA 4I8CA 3SESA 3EHTA 5FHOA 4RPNA 5JTYA 1POTA 3JZJA 2X7PA 2I3WA 4QFLA 3DM0A 3S4UA 1XS5A 3IOTA 4EF1A 1B3FA 4DE8A 4N6PA 2Y7KA 2XXYA 4JBZA 2DE4A 4JWOA 2PBWA 1N7XA 1A8EA 1Y3NA 2YPNA 2D3IA 4GQOA 1MXWA 2ABHA 4X48A 4ZZAA 3PD8A 1B5HA 4KYDA 5KDTA 2I3VA 3K6VA 3MWBA 3A09A 3KOTA 3C9HA 2DSFA 3CFLA 3LSXA 2DS9A 4ECFA 3TTNA 3MPLA 4YMAA 2KLFA 4G8HA 4U4SA 2GHBA 2OBGA 1AOVA 2Z23A 1MDP1 5IAIA 3CIJA 3ZS6A 3WAEA 4HCWA 2I48A 4I1DA 4EXLA 4IY5A 2F6PA 3GBAA 1PB9A 1Y1MA 2UXAA 1P1WA 4ELRA 3E9XA 3O66A 3MW0A 2XX8A 2I0CA 3K1PA 1MQDA 1IEJA 5TP9B 1SBPA 2OJTA 4Q5TA 2IEEA 3SKPA 2H5YA 4GF8A 5JK4A 2ANJA 5H8NA 2I0BA 4HTGA 4EQBA 1XT8A 2DVZA 4H6DA 1D9VA 1IQ7A 1S50A 5EYFA 3HN0A 4IO2A 2V25A 4RK2A 1UIUA 1N76A 1PEBA 3K4UA 3IOUA 3CG3A 2UYEA 3K1NA 1GVCA 1UIVA 1MM7A 1MDQA 4KYSA 2DP8A 4H67A 4KCDA 1XC1A 1SW4A 3IORA 4MLVA 3M8UA 3QAXA 3OXNA 1B05A 5H8FA 5KCJA 5DEXB 1ZIUA 1UTBB 5BWJA 1IXCA 4P0IA 1N3XA 1LFHA 3G3KA 1XVXA 3FV1A 3V8XB 2DE3A 2PX1A 3R7XA 4EUOA 2F8DA 2ZXTA 2I6EA 1LB9A 3H6UA 5HPQA 1B40A 5L9SA 5ITOA 1IITA 4HW8A 5L9MA 4YKKA 2FA7A 2UVIA 1US4A 1DTZA 3FV2A 3B7DA 2V3QA 1MY0A 2RKMA 3FJGA 1HSEA 4OENA 3FZVA 2VD3A 4POWA 4DXCA 2XHDA 2Q9TA 4YU0A 2FNCA 1JNFA 1AIVA 3FXQA 5HM4B 1KWHA 1FQBA 2B65A 2ZNSA 1DMBA 4NWCA 5F1QA 4RXLA 2F5XA 1A54A 4OQOA 1MY2A 4PE5B 1LLSA 1Z7NE 3CVGA 4NF5A 4F3PA 1MXVA 1RYOA 3TFLA 1TFAA 1OLCA 3QYTA 5CMMA 5I59A 4EXKA 2X26A 4RY1A 5JTYB 1NNFA 3PUWE 4ISUA 1P1QA 1YPNA 2AYSA 3Q29A 4R75A 2F7BA 3Q27A 1NFTA 4JXIA 2VGQA 4P0GA 2VD2A 3MZBA 3T9HB 2ZYKA 4BDRA 4NTLA 2XXXA 3QUFA 2Q2CA 2W7YA 1JQFA 5B70A 1Q35A 2Y7IA 3VXBA 3PGFA 5KDTB 1DTGA 3BKIB 1P1OA 1OMPA 4X1BA 4ZECA 1D4NA 1IIWA 4LZ5A 1US5A 2V3TA 4F2QA 1MXZA 3SEUA 4I9DA 1SQYA 2NXOA 4FORA 3Q25A 4KR5A 4ZEKA 2CMOA 1LFIA 2DWHA 4F18A 3HCQA 3UK4A 3GZGA 1MM6A 4H0WA 5ICTA 3VV5A 1UTHA 3IO6A 1HSLA 2V93A 1B46A 1MG1A 3T9VA 2RC8A 4MFIA 3ZKLA 3RTWB 3SEXA 2XXPA 1IZ1A 3K02A 5I2NA 3B6QA 2P0SA 3IOVA 2Y84A 3O97A 4H5FA 1XOCA 3VVFA 2QL3A 5H8NB 1QUIA 3KFMA 3FJMA 3PUXE 3EPEA 1ZMGA 2PYYA 3MPKA 1NKXA 2O69A 3VLUA 3IX1A 4G68A 1FTJA 2I4CA 2D5WA 4F19A 3M3KA 1N0TA 3PPQA 4TLLB 3H4ZA 5DVIA 1LAXA 3SEWA 3C31A 1EU8A 3PUYE 2GH9A 3V5AA 3MUQA 1O7TA 4F3GA 1B3LA 1Y9UA 3JV9A 4F1YA 1RKMA 4H8JA 5H8FB 3QK6A 4BLAA 5KCJB 2VP1A 3E4RA 3IOWA 3T9UA 3B6TA 1Y4TA 3ILTB 4IO6A 3FVGA 1WDNA 4LP2B 1AMFA 1MH3A 4I62A 1B2HA 3BFTA 3LSLA 1URGA 2GHAA 4YB6A 2VHAA 1BLFA 1NNTA 1FCKA 1A40A 1B1XA 1M5EA 2GRVA 4MLQA 4GWOA 3W15C 2PVUA 4U4XA 1VE4A 1WVJA 4U1OA 2Z8FA 2XXUA 3QIMA 4C1TA 4KFQA 1LSTA 4BDLA 1D9YA 3R6UA 4NF5B 2P2AA 4LZ8A 4ONYA 3HSTA 3IB1A 2F7AA 4U2RA 5I59B 4DDDA 3D4CA 4ZE8A 3LR1A 5FTIA 1EZ9A 4DXBA 4DZ1A 4KYEA 3Q26A 3PU5A 2O1MA 3FUZA 1WODA 2V3UA 2G29A 4R6HA 3IB2A 3T22A 1USYH 2ZYOA 1II5A 1BIYA 4M1VA 4RNSA 2VOZA 3PD9A 4WKMA 2QS2A 4RK9A 4U22A 3S2VA 3FJ7A 5CBRA 4OZ9A 1EZPA 4QSCA 4HCYA 3O2AA 3KGCA 2O7IA 3T96B 2ZNTA 3N6TA 2H98A 1YTVA 4EF2A 3U1OA 2QS1A 1B51A 1SW2A 3O6IA 3DP4A 2AIXA 3HV1A 5AA2A 2NWJA 2HFBA 4G8NA 3H7MA 4F31B 3Q28A 4NF4A 2UVHA 3S9NC 3A3UA 2QJEA 1MPBA 3VDFA 2ONKE 3UGWA 4OXVA 5I2NB 1AH5A 2DXYA 1QULA 3KEIA 1ANFA 3K2DA 4KPTA 3WAFA 3DELB 1MH4A 2XXHA 4GXAA 5I84A 4TQUQ 4PFUA 4G68B 1P1UA 3DP8A 5AA4A 4DLDA 2HCAA 4G8MA 4Z7EA 1JW5A 1B0HA 1B4ZA 4ZDMA 2UYFA 3F11A 4K3FA 1ZU0A 3GXAA 1LCFA 4OEUA 3TCGA 4R2BA 4KCCA 5I56A 1TXFA 4PETA 4ZEIA 3TKDA 2DYXA 4YB7A 3RT6B 2OZZA 3HHFA 5DYHA 4ZEFA 4IO3A 4OYVA 4JDFA 3O6HA 1FTOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXQA 3L6HA 4ZZEA 3CHGA 5A5XA 4NF8A 1S7YA 1FBGA 1LGBC 3EHSA 3UA8A 4PFYA 1DPEA 3EHUA 4M4GA 3MVYA 4R6YA 2I58A 3FVNA 1QKBA 3BFUA 4IO7A 3ODBA 4XEQA 3MP8A 1RDZA 1BP5A 1SPIA 1NNKA 1XI6A 3VVDA 1FTLA 3A3CA 3LSWA 4BDOA 1SDXA 3KBRA 3ZSFA 2D21A 3LV0A 4XTCQ 2THIA 4QSEA 3S9MC 1IMBA 3U8QA 3TAJA 4JVDA 1QKAA 4IB2A 1TT1A 1NNPA 1MXYA 4YICA 4ZEDA 3ROJA 4PFRA 1B1HA 3MQ9A 4MBPA 1B3GA 1URDA 5CMCA 1NMUA 4U23A 5LOMA 3SEVA 1B58A 4LZ7A 1GR2A 3AXFA 4OVJA 4GL0A 5KZTA 1FJ9A 1OQGA 4GBVA 1SW1A 1PB8A 3G7WA 1LAGE 2I4BA 3IR1A 3PUVE 2F6GA 2Z8DA 1R9QA 4PBHA 3U93A 3PV0E 4WXJA 1NV1A 4KD5A 2F7CA 4RPOA 4MX6A 4OESA 1B0LA 2RCAA 2XD3A 4IO4A 3C34A 4WEDA 1NUYA 3K01A 3IFAA 3N26A 1SI0A 1MXXA 2WYPA 4GX4A 1NUZA 1CE2A 3QUJA 3TODA 1USYE 3HPIA 1LBVA 1MXUA 4ZE9A 4FEBA 2A5SA 4NG7A 3C4MA 2OLBA 1MQJA 4GLIA 3H6VA 2XX9A 4YKJA 1OVTA 3PMVA 5IM2A 3TEPA 4PE3A 2DWAA 1IUDA 1FPDA 3PPNA 2HQ0A 4N91A 4EQ9A 3THIA 1K9YA 1LEVA 1VDWA 1B9JA 5AA2B 1LBCA 3RUMA 3N6UA 1MPDA 2NVUB 4OWDA 4OANA 2R8TA 3W9WA 1LAHE 2QRYA 3ONMA 3H3GA 3KC0A 3E79A 3SETA 4IGRA 4XKRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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