1EZ9A

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p1 crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural evidence for a dominant role of nonpolar interactions in the binding of a transport/chemosensory receptor to its highly polar ligands.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 123
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ez9A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ez9A01
4JSOA 3VV5A 1LBCA 4KYSA 1AOVA 2F36A 4G77A 3UA8A 2XXXA 4ESXA 2PX1A 1KWHA 4OESA 1VFDA 3PPQA 4NWCA 1B7UA 3DP6A 4LQ2A 1HSLA 2YLNA 1ELJA 3SEYA 1R6ZA 1MXZA 4BLAA 3DLNA 2DE2A 3V5AA 5CBSA 2DXYA 3WAEA 3SETA 4YMBA 4H67A 3IB0A 1US5A 2OK2A 4F18A 2V3UA 3M3FA 2O84X 3U92A 2ZMBA 3MP1A 2XX7A 1BTJA 3O29A 3LSLA 2VD3A 3TCGA 4K3FA 3QYTA 3OO8A 4PFYA 4OFOA 2H9BA 4KR5A 1N84A 2VOZA 3VDFA 4HTGA 1BP5A 3TTNA 4TLMB 3UP9A 5FTIA 2D21A 5IKBA 1LBBA 3GBBA 4NMYA 1PBQA 3IO4A 1URDA 3QK6A 5DEXB 3DP4A 3FGSA 3LSWA 5TP9A 1B7HA 1R9QA 1M5EA 5K2XA 4IO5A 1QVSA 3Q28A 2I4BA 3C34A 4OERA 2ALUA 4C0RA 3SEXA 3KEIA 4F29A 4Q0CA 5I2NA 1UQWA 3TYHA 3VVDA 1SI0A 4LATA 2X26A 3CFLA 2DWAA 4BDQA 4UA8A 2B3BA 3USDA 5BWJA 4HS7A 1GVCA 3E13X 5L9OA 1FQBA 5ICTA 1SYHA 4YKJA 3PUVE 4C1UA 4KYEA 3TPAA 4G68A 5KDTB 1FQDA 2XHDA 3PU5A 4KCCA 2DOJA 1N3WA 4NF4A 3KFMA 4QFKA 4F3BA 2VGQA 2F7CA 4X48A 3G3HA 4IY5A 3O28A 3S9NC 1Y3PA 4XKPA 1NNFA 3MBPA 5IAIA 3C4MA 3BFTA 4FJPA 1A54A 5DVIA 3IL1B 1FTLA 2O7UA 3VVFA 4F3PA 2THIA 1USYE 5TP9B 5AA3A 1DMBA 4QSEA 5TPAA 4WKMA 3BKIB 3FD3A 3C32A 2HCAA 3LR1A 3QUJA 3N94A 1WDNA 5I2NB 4DIGA 3IK6B 3ODBA 2RC7A 2R71A 2H4IA 2XX9A 1F9BA 1MQHA 5H8NA 3MWBA 1H45A 4ELQA 3UIFA 2XXYA 3M3LA 1URSA 2O1LA 1YAEA 1D9YA 2OLBA 3I5OA 3FVGA 4ZDMA 5DVJA 2UXAA 4KHZE 1ZMGA 5CI5A 4ZEFA 4G68B 4LZ7A 2R6GE 3Q26A 3PUWE 2ONKE 3OD7A 3H3GA 1URGA 2ZYKA 3O2AA 4BDNA 5AA2A 3S9LC 1LAGE 5CBRA 1JW5A 2ONRA 4EQ9A 1JW4A 2G93A 3PMXA 5L9SA 4NWDA 1NFTA 3RTFB 1LGBC 3LSXA 4IO7A 1B7ZA 2XXWA 3QXMA 1RKMA 4U1OA 3C35A 2Y7IA 3TTKA 2RC8A 1LCFA 5TPAB 4IO2A 3TTMA 3U94A 4QSDA 2ABHA 3QUFA 4GL0A 2F97A 3CVGA 2DXRA 4GFRA 4XKNA 1H43A 2UVGA 1MQDA 4OEVA 4NTLA 3K01A 5H8NB 3FVOA 4OQOA 4U4XA 2OCUA 3A09A 3IR1A 2RINA 1POY1 1B0HA 1UIVA 3OXNA 3KJTA 1AH5A 2IA4A 3N26A 1OVTA 1M5DA 3MJNA 3IX1A 4OETA 1RYXA 3K0VA 2F7AA 1FQAA 1BKAA 2V25A 4JWOA 4ZE8A 5AA2B 4ELPA 3L6HA 4OMBA 1MY3A 4KI0E 4H1XA 1EZPA 4IGTA 1P1OA 2I0BA 2UVJA 3MC2A 2ANJA 2NVUB 2OZZA 1MG1A 4FECA 4JWXA 2QMWA 1Y1ZA 1O64A 1NNPA 2XXTA 5CRYA 3K00A 3Q29A 1PB7A 4JB7A 5I58A 2H98A 1XC1A 3H7MA 2O1MA 3ECRA 5L8DA 3QAXA 2AIXA 4N13A 2DP8A 4F1UA 3IB1A 2DVCA 2OBGA 1YPNA 1Y4TA 4ZEIA 1IITA 1T0KA 5TU0A 5BUUA 1FTJA 3MP6A 3R26A 4NF8A 1LFIA 4MFIA 1VFEA 4YZZA 2I6EA 4TLLB 1A7LA 5EHMA 3O6IA 4R72A 2XXRA 3LUYA 5I56A 3U72A 1MY2A 2Y7RA 3RGYA 4BDMA 1SYIA 5I84A 1LLSA 4ELOA 4DCXA 5F7VA 3R6UA 3ZS6A 1TWYA 4MLQA 5F1QA 4PFUA 3CG3A 2V93A 3H6UA 3TUSA 4IB2A 3DELB 4LA9A 4GLIA 1HSEA 4HCWA 3T22A 3K4UA 3FZVA 3RN8A 3TTRA 3G3JA 3S4UA 5I58B 5AA4A 3TTLA 4ZECA 2RF1A 2Y84A 4R6KA 2XXUA 3O66A 1XT8A 3P7IA 1VE4A 4NF8B 1MRPA 3SEVA 2I49A 1N7WA 1CE2A 2O68A 3HN0A 3MVXA 4O3BA 5HM4B 4RYAA 5FHOA 1A8EA 2D5WA 3VLVA 3A3CA 3MVWA 4X1DA 4ND9A 2XD3A 1IEJA 4FATA 5I56B 3SKPA 4OZ9A 2GH9A 3SESA 3ILTB 4HW8A 1OQGA 2Y7KA 5CC2A 2NWJA 1DTGA 1MH4A 3PUXE 3T66A 1EU8A 1Y1MA 5ITOA 3GBAA 4R9GA 4U2RA 1XVYA 3TEPA 3FXQA 1EH3A 1LB9A 4P11A 2HAVA 3VFJA 1H3DA 1FQFA 2I58A 3PD9A 1XOCA 1BIYA 4OTEA 2NUVA 4ZS9A 1Z7NE 1B05A 3VXCA 2XXVA 1DPPA 4H6DA 2ZYNA 3JZJA 3N6UA 4MF3A 4ESWA 1QUIA 1I6AA 1MH3A 3MUQA 2H5YA 3H03A 3KOTA 5AA4B 4YICA 3MPLA 1I6QA 4LVQA 1Y9UA 3N5LA 2XD2A 1D4NA 2QRYA 1JQFA 3U93A 5J1DA 5KDTA 3KN7A 2Z23A 3MZ9A 4E0XA 4U1ZA 4L17A 3KGCA 1SI1A 1USYH 1B9JA 2GFEA 4YB7A 2ZYMA 5EHSA 4OEUA 5ELVA 5JTYA 1UTBA 1GR2A 3MP8A 4Q8RA 2Z8EA 4EXLA 4BDRA 2O6AA 1B0LA 2RCBA 1LAHE 3T9UA 3O6GA 1FCKA 1P1NA 1MPCA 3IOWA 5AA1A 4YB6A 1SD3A 1Q35A 3MQ9A 1XHYA 3G3KA 4M1VA 4EQBA 3TQWA 2F5XA 1ZJLA 1IXCA 4H65A 1B58A 1PB8A 1S7YA 1N04A 4KYDA 4I8CA 1B3EA 2X7QA 3BFUA 2PBWA 2YJPA 4QRZA 4GXAA 2YPNA 3CSGA 2VD2A 1LAXA 3C31A 3FV2A 4I9DA 1FTMA 3DM0A 4TOZA 1MQGA 4FORA 3RQTA 4I1DA 1QW0A 5DVFA 1AL3A 4U23A 3TELA 5CMBA 3QIMA 3MZBA 1P1WA 4XIGQ 5ISUA 3T93B 2ONSA 1POTA 4JBZA 4H5GA 1UIUA 5JTYB 2DQVA 1UTBB 2DSFA 4G68C 4R74A 4PP0A 3RPWA 4P0IA 2FNCA 5JK4A 2DE4A 1IIWA 1JVYA 4NEDA 1N76A 3BBRA 4AQ4A 5EYFA 2HAUA 3PUZE 4YKKA 1O7TA 2XXQA 3TQLA 3W9WA 3I6VA 4MBPA 2VHAA 3UK4A 3KOSA 3LBSA 3TCHA 2B3FA 5FHMA 1M5BA 2F78A 4RA1A 2FYIA 1MDP1 4OFLA 4NF5A 1LCTA 1EZ9A 3M8UA 3OSQA 2A5TA 3HV1A 4RPOA 5CMKA 3PPPA 4RJZA 1N0TA 3F11A 1OMPA 2I3VA 4PE5B 1SW1A 1RYOA 1MQJA 3OENA 1OQHA 1NNKA 1MY1A 3B6WA 1M5FA 2M8CA 2QJEA 3SDFA 5M2VA 3W15C 2F35A 3H6VA 2QPQA 4GD5A 3EHTA 4FIMA 3CFZA 4E0WA 2AL4A 1WVJA 2P1SA 3MZ1A 3H6WA 5H8HA 3E9XA 2P2AA 1MXYA 1GGGA 3RT6B 4KD5A 4R2BA 1OLAA 2DE3A 2QS3A 4LUBA 4F19A 2DWJA 3OOAA 3IOUA 1PEBA 1PC3A 4F2QA 1FTKA 3HHFA 1OIBA 1R1NA 1H44A 3KSJA 2Z22A 4ZEKA 4IY6A 5FTHA 4NF5B 3TAJA 2I48A 3DP8A 3T9VA 5AE4A 3VXBA 4YMAA 2F8DA 4ELRA 4R73A 2A5TB 4RNSA 3LC8A 3SERA 1AIVA 2RCAA 2ZXTA 1QULA 1B52A 3CIJA 4IO4A 4DXCA 3H6TA 1NL5A 2UVHA 1D3KA 1JNFA 1ZLQA 2ZYOA 3FJGA 2X7PA 4THIA 4QFPA 3PV0E 3T96B 4AB6A 4XKRA 4FE8A 2A5SA 1ANFA 1II5A 5K2YA 1GV8A 4ONYA 4GWOA 4KQPA 4DDDA 1IZ1A 5H8HB 3G3GA 3OEKA 4PETA 3VVEA 4POXA 1L5TA 1NH8A 3ZSFA 3H4ZA 5LOMA 3FATA 2DWIA 4O3AA 3M3KA 2F6GA 2HXWA 4GVOA 4DXBA 1B6HA 4F2OA 3CRBA 1B51A 1LFHA 1XS5A 2H25A 1OVBA 1MXWA 5HPQA 2AL5A 2HFBA 4LONB 4OFJA 3HCQA 3FIRA 3THIA 3TMGA 3HO7A 3TODA 4YU0A 1MM6A 5I2KA 2XX8A 2GRVA 3KBRA 1O63A 4G8MA 1JW1A 3K1NA 1XVXA 3N6TA 2DWHA 1SQYA 4DE8A 1NNTA 3K6UA 4JXIA 2UVIA 4RXLA 1QKAA 3EF7A 4GXSB 1B5HA 4OVJA 3TFLA 1FQEA 2D3IA 1N7XA 4PFWA 3A3UA 1B3LA 3IB2A 3K2DA 5H8QB 2NXOA 3IJXB 3HSTA 2F6PA 1FTOA 4OYVA 3EN3A 4OENA 4QFLA 2B65A 2DYXA 1YCJA 4IO6A 3K6XA 4G8NA 4QSCA 3ZKKA 3D4CA 1B46A 5KCJA 3FASA 1R9LA 2W7YA 4LP2B 3UGWA 5CMMA 1PB9A 5DYHA 4M4GA 3V83A 2PMSA 3VE1B 1MDQA 1ZBMA 5KZTA 3U1OA 3QSLA 2RKMA 3GZGA 1B2HA 3KZGA 4N07A 3O97A 4WEDA 3PMVA 3SEUA 1MXXA 3K1PA 5I2KB 1LFGA 1ZTYA 1QUJA 3FJ7A 1DOTA 1B32A 3KN8A 3D4GA 2QMXA 4XKQA 4KCDA 1NH7A 4YAHX 3RNNA 3C33A 3T9XB 4C1TA 4YKIA 1SW5A 2UYFA 1FQCA 2LAOA 1I6BA 5DTBA 4U4SA 1D9VA 2Q8JA 3GLBA 4DZ1A 4RY1A 1P1UA 2HQ0A 2PT1A 2XXIA 5KCJB 5I57A 1M5CA 2PT2A 4BDLA 1LSTA 3C36A 2RC9A 4NF6A 1DPEA 4OXVA 3E4RA 3V8XB 2OJTA 4GIZA 5CM6A 2O69A 4EUOA 4EXKA 3WAFA 3JYRA 1ZIUA 5FHNA 4XTCQ 3IORA 4YB5A 3MAMA 4R6HA 3FVKA 3FUZA 4TQUQ 4XXUA 4H8JA 4MLVA 4ZEBA 3C9HA 3IAZA 3L6GA 3R7XA 4LQ5A 1JEUA 4IO3A 3TDJA 2QS1A 1B4HA 4I62A 1PBPA 2E1SA 3S9EA 4RK9A 2G29A 1S50A 1JEVA 3H06B 4O3CA 4F1YA 3FV1A 3MW0A 2I4CA 1Y4CA 3KG2A 1S9TA 1EZOA 1ATGA 3E3KA 4DLDA 2ZNTA 4F3SA 1HSJA 1GTKA 4JWYA 2QSXA 1BLFA 2DS9A 4OWDA 3IJOB 5H8FA 5I57B 5B70A 3ZKLA 5L9MA 1SW2A 1QJMA 4GL8A 4N6PA 4HCYA 1UTHA 2UYEA 4ZZAA 4PQJA 4NF6B 2Y7PA 3CSBA 3PPOA 5H8SA 3OELA 5ICQA 4PFTA 3G3IA 3G7WA 5AA2D 3RY3A 1MY4A 4ZEDA 3B7DA 1TT1A 1CB6A 1DSNA 5ITPA 4QFNA 2FA7A 4FEBA 2ZNUA 1A55A 3IO6A 2XXPA 4H5FA 3KJ7A 1MS7A 3K02A 3LSFB 3TKDA 3TZAA 4KFQA 5I59A 3GXAA 3OEMA 3KN3A 4BDOA 5H8FB 1A8FA 4QHQA 1IUDA 3EQ1A 1OLCA 4JDFA 4DCYA 1WODA 1J1NA 2ESNA 3I3VA 1UTHB 3K6WA 2REJA 4EF1A 3V89B 3Q25A 2QS4A 4G8HA 1P99A 1Y20A 1I69A 2ZNSA 5CMCA 3OMBA 2V3QA 5HBCA 3HPIA 2PYYA 3IOVA 1MY0A 2NOOA 4Q30B 2PVUA 2V84A 5JEIA 4G4PA 3UN6A 4NF4B 1B3GA 2HZKA 4GRKA 1B40A 1IXGA 2Q89A 2AYSA 3MVYA 1H76A 1MXUA 1YTVA 4GQOA 4R9FA 2Q88A 5I59B 2QS2A 3AXFA 1LB8A 2H99A 1SBPA 2XXHA 3T9HB 1B5IA 2O7IA 2I0CA 2OWTA 1Y3NA 1N3XA 4G2ZA 3B6QA 4ISUA 1NMUA 2O51A 3TCFA 4P0GA 4X9TA 4U22A 3MPKA 4NE4A 3EPEA 1B4ZA 1A99A 5A5XA 2KLFA 3B6TA 1PDAA 1US4A 1Z7ME 2Q9TA 4R6YA 1IQ7A 1P1QA 4LZ5A 3O9PA 4MH5A 3K6VA 2CMOA 4Z0IA 1VR5A 1B1XA 1SDXA 3UORA 3FJMA 5H8QA 3VLWA 3PD8A 5DT6A 2V3TA 2F7BA 4F31B 1A40A 1MM7A 2Q2AA 3G3FA 4OHNA 4DXUA 2GHAA 2P0SA 3MVZA 2BJJX 4GOTA 2HZLA 4KPTA 4POWA 3OO7A 2REGA 2IEEA 4QFOA 4FEDA 4EDPA 3U8QA 3OO9A 1B1HA 1ZU0A 4F3GA 1LAFE 2OWSA 3HHGA 3Q27A 3RUMA 1MPBA 1MQIA 4H0WA 4GF8A 4UACA 4F22A 2R9JA 1TFAA 1IXIA 1B3FA 4Q5TA 3PUYE 2CZLA 3W9VA 5A5XB 1TXFA 3CG1A 2HEUA 3EHSA 4QF9A 2E0SA 3VLUA 1NKXA 3PPNA 2I3WA 3RLFE 3CI8A 4JSDA 2WKYA 4R2FA 3FXRA 4WEPA 3JV9A 4RK2A 4H8IA 3RTWB 4WXJA 2Z8DA 1ZKBA 2Q2CA 4ECFA 3PMWA 3FXUA 3KSXA 1Q1KA 4RPNA 4Z7EA 4R75A 4X1BA 1AMFA 4F1VA 3S2VA 1B3HA 2DVZA 4U21A 5B7DA 2F34A 3FVNA 4LZ8A 1QKBA 3PPRA 4EQ7A 1MPDA 4YKPA 3K1MA 1MXVA 1VSOA 3OSRA 1IXHA 2VP1A 2Z8FA 3ILUB 4AB5A 1DTZA 4F39A 1JETA 3CR9A 3S9MC 3CFXA 4FAJA 3PGFA 2QL3A 1FW0A 1B5JA 2Y7WA 2GHBA 3O6HA 4ZE9A 1QUKA 3OO6A 3RT8A 1JVXA 3IOTA 1TFDA 4EF2A 1SVXB 4IGRA 1Y3QA 1SW4A 5DEXA 3SEWA 4ZZEA 3ONMA 3EHUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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