1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
4TQUQ 4XKRA 4KCDA 1ZU0A 1A8FA 5H8NB 3V8XB 3SEYA 1B3FA 3PPNA 4WXJA 1SBPA 3K6UA 2F36A 3EHUA 2I48A 4LVQA 1RYOA 2RC8A 3O97A 3DLNA 3S9EA 3MQ9A 2O7IA 3MWBA 1D3KA 3N94A 4NF4B 4GXSB 4LA9A 5TP9A 1LAHE 2F97A 5HBCA 3LR1A 3RN8A 1RYXA 1XT8A 1LGBC 4H8IA 3E13X 2XXXA 3USDA 3WAFA 4F31B 1B0LA 4WEPA 1SQYA 1L5TA 3VLVA 4KQPA 3BFUA 3BKIB 3FXUA 1BIYA 4F29A 4NE4A 3CFZA 4DIGA 3VLUA 3BFTA 4N07A 3C34A 2YJPA 4NF4A 1QULA 4DCYA 5I58A 3SERA 3T9VA 1OVBA 4N13A 3ZS6A 1SVXB 2PX1A 4G68B 2Z23A 3FJGA 1ZTYA 3Q29A 5H8SA 3EF7A 5J1DA 3C31A 3T93B 4H0WA 4G8HA 3M8UA 3OENA 3KOSA 1M5EA 3MW0A 3KSXA 4X9TA 5I59A 3KN7A 5B70A 4EXLA 1PB7A 5HM4B 5AA2B 2VD3A 1H76A 3IX1A 3RQTA 4AB5A 3K02A 4LQ2A 2GH9A 5F1QA 3GLBA 5KCJB 4KYDA 4G68C 3K1PA 4O3BA 3SEUA 2I4CA 3VFJA 1MY1A 4TLLB 3TMGA 5I2NA 3ODBA 4ZZAA 1Q35A 4QFLA 2HEUA 4H5GA 4NF8A 2XXQA 1FCKA 3FVOA 1MXWA 5HPQA 3KJ7A 3C36A 3ILTB 3CG1A 2DVZA 5TPAA 4PETA 4F39A 2DWAA 3H6WA 4U1OA 3U1OA 5KCJA 2HQ0A 3SEXA 4E0XA 3Q26A 3TQLA 1YPNA 4PFUA 2FA7A 3LC8A 4L17A 1LFIA 1AL3A 2AIXA 5KDTA 2XD3A 4PQJA 1CE2A 1P99A 3IAZA 4BDQA 3K00A 1JVXA 4P0IA 2QS2A 4QHQA 4Z7EA 4X48A 1N7XA 1MDQA 3HHGA 3FGSA 3PUVE 4RJZA 4YAHX 4F2OA 4LONB 2ONRA 2XXYA 5H8FB 2DWHA 5TU0A 4JWYA 3N5LA 3SEVA 4JWXA 4EUOA 3D4GA 2OCUA 1Y4CA 3EQ1A 4DZ1A 1SW5A 1OQGA 3U93A 2PT2A 3PD8A 4XKPA 2V84A 3MJNA 2O84X 1GVCA 4DXCA 1J1NA 4ELPA 5IKBA 3CIJA 1S7YA 4GIZA 4QFOA 3MP1A 1XVXA 1OQHA 1LAXA 1POY1 2Q89A 3ILUB 2I49A 2Q2CA 3IB1A 5ICQA 1FTLA 4H1XA 3K6XA 5DVIA 3TUSA 3A3UA 2NWJA 4GOTA 3TAJA 3IOUA 5CI5A 1QUIA 3MZBA 1UTHA 2QS4A 3H6TA 3FJ7A 1YCJA 3E3KA 2VGQA 1LBBA 4F22A 3WAEA 3TTRA 3O6GA 4PFYA 1USYE 4P11A 3FXRA 1US5A 3KN3A 2HZLA 3KN8A 3H4ZA 1ZBMA 2ZMBA 2I0CA 2THIA 1N04A 3S9MC 1LLSA 1URGA 3CSGA 3CR9A 1FQCA 2Y7PA 4ND9A 2GHAA 3TTNA 4M4GA 4THIA 1TFAA 4K3FA 1NMUA 1NNTA 1FQDA 3HCQA 3MVZA 3PPPA 2Q2AA 3CVGA 1USYH 2NXOA 1Y3PA 1XC1A 2I58A 2HCAA 5DEXA 2DYXA 1Y3QA 1LCTA 4DCXA 1IIWA 3G3JA 4PFWA 1ATGA 3N26A 5M2VA 1HSEA 3O28A 4TOZA 4OMBA 1DTZA 5I2KA 2XD2A 1R9QA 1NFTA 3PMWA 4OHNA 4DLDA 5FHNA 4QFKA 2GHBA 1P1NA 4IGRA 2RCAA 3RUMA 3FIRA 3V89B 2XXHA 3W9VA 4Q0CA 3TTKA 1NL5A 1A55A 2REGA 3MPLA 1MDP1 2DP8A 4RK9A 4BDLA 5I57A 2OBGA 3RLFE 4Q5TA 4XXUA 2R6GE 1Z7ME 2G93A 5K2XA 2F35A 1LB9A 1WVJA 4GL0A 3I3VA 3M3LA 2HXWA 3R6UA 5AA4A 2P1SA 3M3FA 1A40A 5DVJA 1BLFA 1EZ9A 1MY2A 4U4XA 3S4UA 1RKMA 4KYSA 1FQFA 1N3WA 3DELB 2UVGA 4ZS9A 2PT1A 4NF5A 4ZDMA 5K2YA 1NH8A 2QPQA 4ONYA 4G8NA 4WKMA 1P1QA 1NNFA 1DMBA 4YMAA 4R72A 2Y84A 4QFNA 4IY5A 4WEDA 3H03A 3L6HA 5LOMA 2XHDA 2RC7A 1B05A 4BLAA 2I3WA 3L6GA 1QKBA 4C0RA 2HAVA 1JETA 4X1BA 3OSQA 5DTBA 3O66A 4RNSA 2V25A 4MBPA 1EU8A 1FTMA 3FD3A 5TP9B 5CC2A 1AMFA 1AIVA 1NH7A 1UQWA 1MH3A 1R9LA 5EHMA 2CZLA 3IORA 3RTWB 4OVJA 3MC2A 5FTHA 3LBSA 1MQDA 4BDMA 3V83A 1A99A 5A5XA 4H5FA 4YICA 4FE8A 3TKDA 5EYFA 5I56A 2D5WA 2DE3A 4U21A 3R26A 1DTGA 4POWA 3EHSA 4LQ5A 1BP5A 1MXZA 3DP8A 3FVNA 4C1TA 4ZEKA 1PC3A 1POTA 5L8DA 1S50A 3AXFA 1VFDA 5I58B 2NUVA 4ZEBA 1M5FA 5AA1A 3SEWA 2Q9TA 5DVFA 3IJOB 5I84A 4HTGA 4PFTA 3CFLA 2H5YA 3LSFB 4QSDA 1DSNA 2YLNA 4H67A 3HV1A 1LB8A 2Z8DA 1MXXA 1KWHA 3M3KA 1AH5A 1SW4A 1IEJA 4ESXA 4HCYA 5I59B 3MP8A 2VD2A 3OELA 3PMXA 4ZE9A 3TPAA 3O2AA 3SESA 1MY0A 3TDJA 2UYFA 4X1DA 1GR2A 3VV5A 1IQ7A 3B6WA 2O69A 4F3PA 3GZGA 4OFLA 1ANFA 2V3TA 2LAOA 1MQGA 1OMPA 2YPNA 4ELOA 4R2BA 2Y7RA 2OWTA 5I2NB 4GXAA 3FVGA 4ZZEA 4FEDA 4FAJA 1O64A 3TCFA 3VVFA 4YB6A 3SDFA 2Y7IA 1D9YA 1LAFE 5BWJA 4NF8B 5B7DA 2E1SA 2OLBA 4ELQA 3K6WA 2DQVA 2R71A 3QUJA 4JDFA 3IK6B 3JV9A 3OO6A 1P1UA 1H44A 5TPAB 4IO7A 3H06B 3U94A 1P1OA 4GFRA 1SI1A 4R9FA 4YKPA 1JNFA 3V5AA 3A09A 4GD5A 5KDTB 4GL8A 3EPEA 5F7VA 3ECRA 4XTCQ 1MQIA 3TEPA 3O6HA 3SETA 3ZKLA 1FTOA 2XXVA 3G3GA 2VOZA 1A54A 4F3SA 3PUZE 3K2DA 3ONMA 4ZEIA 4TLMB 5ELVA 2I0BA 1B3GA 1IUDA 3S9LC 3JYRA 1FTKA 3VE1B 2CMOA 4KR5A 5L9MA 1B5JA 2PVUA 3FJMA 1URSA 1LAGE 1T0KA 3OO8A 4NEDA 2E0SA 3QK6A 1SI0A 2O1LA 1Z7NE 5BUUA 1MPBA 1ELJA 3EN3A 1N7WA 4LZ8A 1M5DA 5JK4A 4F18A 3BBRA 3OO9A 3OEMA 2H98A 5FHOA 5JEIA 1UTHB 1DPEA 1SDXA 1ZKBA 5CMBA 2Y7KA 2Z8EA 3OEKA 4UACA 3FXQA 1DPPA 1I69A 3MZ1A 3R7XA 3PUXE 4LATA 1MY3A 3MVYA 4DXBA 1B4HA 3Q27A 3P7IA 1BTJA 1B5IA 2IA4A 4RXLA 4G77A 4R75A 1OLCA 2DVCA 1JW5A 1MPDA 3VLWA 1Y4TA 3KFMA 1FQEA 3IR1A 1O63A 2Z22A 4JWOA 3D4CA 2QS1A 2F6PA 4OYVA 1D4NA 1NNKA 4PP0A 1XVYA 3LSXA 2W7YA 1B1HA 1S9TA 4QFPA 4KYEA 1LBCA 1UIVA 1ZIUA 3H6UA 5CMCA 3B6TA 1N76A 2UXAA 3S9NC 3UGWA 2D3IA 4LUBA 4KCCA 3HPIA 4I1DA 4R74A 3K4UA 5DEXB 3U92A 1UTBB 2VHAA 3DM0A 2PYYA 5ITPA 5H8HB 4M1VA 4P0GA 2QRYA 5H8QB 3KG2A 4MF3A 2F5XA 5I2KB 4U2RA 2FNCA 1B58A 2VP1A 4NF6A 2XXTA 1MXUA 1IXHA 3CG3A 3FUZA 2X26A 4U4SA 1I6QA 3VVDA 4G8MA 3C32A 5ITOA 2I6EA 3K1NA 2OK2A 1EZOA 1VFEA 5CRYA 2F7BA 3PPQA 3B7DA 4AB6A 1SW1A 5AE4A 2IEEA 4UA8A 1PB9A 2F8DA 2O6AA 3ZKKA 3CSBA 4FJPA 4R9GA 1M5CA 1UTBA 4F1UA 5I57B 4JXIA 2XXWA 3KZGA 5H8HA 1NNPA 5H8QA 4ZECA 1Y3NA 4OENA 4BDRA 4MH5A 3TYHA 3QIMA 5DYHA 2ONKE 2O68A 4F1VA 1EZPA 1TWYA 1B7UA 3QXMA 4RPNA 5AA4B 2GFEA 3PPOA 1QVSA 2B3BA 3N6UA 2Q88A 1QJMA 3OD7A 1MQHA 1I6BA 5CBRA 2A5SA 5FHMA 4EQ9A 3H6VA 3QUFA 3G3KA 4RPOA 2H25A 5CMKA 1QUJA 2AYSA 1II5A 3A3CA 3KSJA 4NF5B 4KPTA 1O7TA 1N0TA 1BKAA 1DOTA 1XOCA 4FORA 4AQ4A 3PUYE 4F2QA 2ONSA 1MS7A 3H3GA 1IZ1A 1JW1A 2DSFA 4U1ZA 2DOJA 4KHZE 4GRKA 2DE2A 3O29A 1GGGA 4JSDA 1Y1ZA 4FATA 2NVUB 2XXPA 4POXA 1B6HA 1QUKA 1R1NA 2D21A 4G2ZA 4JBZA 2ZYKA 4F19A 4MFIA 2RC9A 1SD3A 4H65A 4KFQA 2ZNUA 4R6YA 4RA1A 5IAIA 1Y20A 2NOOA 4MLVA 2B65A 2WKYA 2DXYA 4IGTA 5ISUA 5A5XB 1WDNA 3KGCA 4EDPA 3IOVA 2QMXA 1B2HA 1H43A 3T22A 4H8JA 5I56B 1JVYA 2RF1A 3RY3A 1B0HA 2O7UA 3I6VA 3G3HA 4XKQA 1GTKA 3RPWA 4C1UA 1Y1MA 1YAEA 3TELA 4I9DA 3FZVA 3LUYA 5CMMA 1M5BA 1VSOA 4BDOA 4EF2A 1MM7A 4RYAA 1SW2A 4OQOA 2R9JA 4ZEDA 2X7PA 2UVJA 5EHSA 3C9HA 1XS5A 3IL1B 3RGYA 1IITA 4GF8A 1JEVA 1MM6A 1EH3A 4RK2A 1B7HA 3VVEA 3PPRA 3OMBA 1HSJA 3IOWA 5JTYA 3MBPA 4ZE8A 2XX9A 4DDDA 3UK4A 1B1XA 1LCFA 2QS3A 1P1WA 2REJA 3UA8A 3RNNA 4R6KA 3I5OA 4FEBA 4YKJA 5H8NA 4ESWA 1LSTA 2DS9A 2KLFA 4OESA 1AOVA 4FIMA 1I6AA 2UVIA 2ZXTA 2ZYMA 2H4IA 1H45A 4IY6A 3E9XA 3K6VA 3KEIA 3PD9A 4DXUA 4NWCA 4ELRA 2V93A 3PUWE 3PV0E 1XHYA 3UP9A 2P0SA 2X7QA 3TTMA 1B9JA 3KOTA 1MXVA 1B7ZA 2V3UA 2AL4A 4LZ7A 4F3BA 1HSLA 4N6PA 2DWJA 1TT1A 1H3DA 4F1YA 4OFOA 1D9VA 3HO7A 4EXKA 3TZAA 4IO4A 4ECFA 3K0VA 1B46A 3IB0A 2ZNSA 3W15C 1SYHA 4GLIA 4OERA 5DT6A 2G29A 3UORA 5CM6A 2PMSA 3F11A 4GWOA 1PEBA 3G7WA 3FV2A 2O1MA 4PE5B 2RCBA 3E4RA 1OIBA 4NMYA 4EQ7A 3K1MA 4QSCA 2XXRA 2RINA 3TFLA 5L9OA 1MRPA 2HZKA 1MPCA 4G68A 3U8QA 4NTLA 2RKMA 2ALUA 1MXYA 2DE4A 4R73A 2OZZA 4OTEA 3HHFA 3C4MA 4Q30B 3QSLA 5AA3A 1FQAA 1B52A 4YKIA 3Q25A 3MVWA 4RY1A 1FQBA 5ICTA 2I3VA 3LSWA 5AA2A 3H7MA 4JB7A 3OXNA 1ZJLA 2ZNTA 3G3IA 1B32A 1MH4A 3THIA 1IXCA 3IOTA 1LFGA 3FATA 4Q8RA 1VR5A 4MLQA 1N3XA 3LSLA 1URDA 2M8CA 1LFHA 3MZ9A 2XX7A 3C33A 4O3AA 3UN6A 1WODA 2XX8A 1FW0A 2QJEA 4OEVA 4U23A 2Z8FA 2F7CA 3QAXA 3IB2A 3EHTA 1B40A 2OJTA 3QYTA 4EQBA 1PB8A 3W9WA 3GXAA 5L9SA 1CB6A 4NF6B 4JSOA 3UIFA 3G3FA 2XXIA 3TODA 2ESNA 4FECA 4OZ9A 5AA2D 4ISUA 4YU0A 3TQWA 3TCHA 4U22A 2V3QA 4QF9A 1B3HA 3CRBA 4YMBA 4EF1A 4GQOA 3T9UA 5H8FA 1QKAA 2P2AA 1OVTA 3VDFA 1MG1A 3C35A 2B3FA 3MAMA 4OWDA 3TTLA 2BJJX 4HW8A 3B6QA 4LZ5A 1MQJA 1B4ZA 3RT6B 2O51A 2GRVA 1IXGA 3KBRA 4BDNA 2DXRA 4IO2A 5CBSA 3O6IA 1TFDA 4GVOA 2Y7WA 3SKPA 1TXFA 4OFJA 3Q28A 1QW0A 3DP4A 1SYIA 1N84A 3VXCA 4IO3A 2F34A 3RTFB 4IO6A 1R6ZA 2HAUA 1UIUA 1YTVA 3T9XB 2F78A 1B5HA 2ZYOA 3IO4A 3FASA 4E0WA 4H6DA 1US4A 3T66A 4IO5A 1PDAA 4KI0E 1ZLQA 2A5TB 2FYIA 2ANJA 3S2VA 3PGFA 2DWIA 5KZTA 1A7LA 4R6HA 4O3CA 2I4BA 1F9BA 3TCGA 4HS7A 4XKNA 3HSTA 1IXIA 2PBWA 1A8EA 3HN0A 1PBPA 3PU5A 5FTIA 3T96B 3K01A 2H99A 3MPKA 1GV8A 4YB7A 3FVKA 2HFBA 1Q1KA 2UYEA 3ZSFA 3MUQA 2UVHA 2ABHA 4HCWA 2XXUA 2OWSA 2A5TA 4I8CA 3JZJA 1JW4A 3T9HB 1B3LA 3OO7A 4OXVA 3GBAA 3IO6A 1OLAA 1B3EA 2F6GA 3MVXA 4R2FA 1PBQA 4NWDA 4OEUA 4QRZA 2F7AA 4Z0IA 3MP6A 4OETA 2QSXA 2H9BA 3OOAA 4YB5A 2QL3A 2ZYNA 4QSEA 1MY4A 3IJXB 1NKXA 3U72A 3OSRA 4LP2B 4ZEFA 1B51A 4DE8A 1JQFA 4YKKA 4G4PA 3PMVA 4I62A 4XIGQ 3GBBA 4YZZA 4IB2A 3FV1A 3DP6A 3CI8A 2Q8JA 1ZMGA 1VE4A 1JEUA 5JTYB 3O9PA 4F3GA 2QMWA 1Y9UA 4KD5A 1FTJA 2AL5A 3KJTA 3CFXA 3VXBA 3RT8A 3N6TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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