1EZOA

Global fold of maltodextrin binding protein complexed with beta-cyclodextrin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KTEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Global folds of proteins with low densities of NOEs using residual dipolar couplings: application to the 370-residue maltodextrin-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN
molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 57
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ezoA01
2HXWA 3U8QA 4H5FA 4TLMB 2DWIA 4Q0CA 3UK4A 3K0VA 2VOZA 3C34A 3W15C 3VV5A 2QL3A 3G3FA 2ANJA 1Y4CA 2F35A 3H6TA 4OTEA 4GLIA 3TTMA 1J1NA 4QFOA 3TMGA 4AB5A 1MDP1 1B52A 5H8NB 3L6GA 4YMBA 4FE8A 1GV8A 2UVIA 2D5WA 1LCFA 3G3HA 1MY0A 2DQVA 1N3WA 2UVHA 1B05A 4HCYA 3S2VA 1Y1ZA 2NVUB 2DE3A 3FJMA 5KCJB 3ODBA 4F19A 2HEUA 4DZ1A 2O6AA 3RTFB 3H4ZA 4JWYA 4F39A 4IB2A 3FVKA 5DVFA 3O29A 5H8FB 2F78A 4OFLA 1OLCA 3EF7A 4YAHX 1I6AA 3BKIB 3PU5A 5H8SA 1DTZA 4KYEA 2H25A 4RK9A 2DVZA 3H03A 5AA4A 4R72A 2OZZA 1QULA 3OO6A 5B7DA 2FYIA 2AL4A 1OQHA 1H43A 4KCDA 2XXWA 3MQ9A 1I6QA 3QYTA 2B65A 2V3UA 4O3AA 5JEIA 1UIVA 3FD3A 3CG1A 3MZBA 3OO8A 4U23A 3FZVA 3MP8A 1PB7A 1I69A 3MPKA 4C1UA 2QS4A 2M8CA 2Z23A 2ZNUA 4OHNA 1ZIUA 1M5FA 5F1QA 3ZS6A 1MS7A 3IB1A 5JTYB 3MVWA 4U2RA 4KR5A 4RY1A 1MM6A 1FW0A 2XXRA 2VD2A 1EZOA 2DXRA 3MP6A 1LLSA 3UN6A 1B3GA 3VXCA 3DELB 4ZEDA 4F29A 1SI0A 2I4CA 2PT1A 3WAEA 1Z7ME 2F6GA 1CE2A 4OENA 5ELVA 2OJTA 4KD5A 4IY6A 1SBPA 4U22A 2HCAA 5AA1A 4ZEIA 1SYHA 1MXZA 2XD3A 3N5LA 2Y84A 3KOSA 1MDQA 4XTCQ 1LFGA 1LB9A 2ZYMA 1B3EA 1OVBA 3MVZA 1ATGA 3EHTA 4E0WA 4DCYA 1TFDA 4I8CA 4I9DA 3LSXA 2P1SA 1PEBA 3ONMA 4F3SA 1EZPA 3KN7A 1JNFA 3MUQA 4PFWA 2V3QA 1BKAA 1UTHB 4TOZA 4NF6B 1SW2A 3OEKA 1N7XA 1B4ZA 1US4A 2PT2A 5DEXA 4F3BA 3O2AA 4YICA 1M5CA 4LZ8A 1H3DA 3G3KA 1B0HA 4HTGA 3UIFA 3E3KA 3PUVE 4GWOA 5EHMA 3IB0A 3T96B 2FNCA 3B6WA 2ZNSA 3G3IA 3LSLA 3FV1A 3SESA 4FIMA 4DCXA 2UYFA 4NWDA 3CRBA 4P11A 2NWJA 3GBBA 3G3GA 3C36A 4ONYA 5CI5A 4FEBA 2XXVA 5CBRA 2H5YA 1I6BA 4DLDA 2DVCA 2DP8A 4DDDA 3PD9A 4WEPA 5B70A 4LZ5A 1URDA 2YLNA 3W9WA 1MY1A 4EF2A 3B6TA 5HPQA 3GZGA 4JBZA 3C33A 5FTIA 3LSWA 2ZNTA 1UIUA 1SD3A 3IJOB 3IL1B 4R9FA 4KYDA 2R9JA 4PQJA 5CMBA 5FHNA 4OMBA 4X48A 4BLAA 3MW0A 1URGA 3PUZE 3TZAA 4NF8A 1B7HA 2DE4A 3RLFE 4JWXA 3OEMA 2FA7A 4R74A 1MXUA 1B1XA 2DYXA 4X1DA 3K4UA 3O97A 2DSFA 4HW8A 3CG3A 4QFPA 3R6UA 1AIVA 3EHSA 3FUZA 1UQWA 4NF5A 4Q8RA 3PMWA 3RTWB 1B58A 4I1DA 1LSTA 3I5OA 2DWAA 2V25A 1B46A 1SDXA 2F7BA 2HQ0A 2HZKA 4GL8A 2VD3A 2Q9TA 1USYE 4YKKA 1XVYA 1JETA 2YPNA 3RNNA 2DXYA 3OMBA 5BUUA 3CI8A 2O68A 2RC7A 3PGFA 4BDOA 4F22A 3PUYE 3S9NC 3R26A 3TQLA 5H8HB 4P0IA 3GLBA 4KPTA 2QS3A 4RYAA 2GHBA 3KEIA 2O69A 1B9JA 1UTBA 4NE4A 4UA8A 2AYSA 3ZSFA 3IO4A 1FQEA 1S9TA 5CBSA 1LAGE 1XHYA 1CB6A 2F97A 5L8DA 4EQBA 4KYSA 3KGCA 4LZ7A 1BLFA 4KFQA 1RYXA 1MXWA 1LFHA 2Y7PA 4IO5A 4H8JA 3UORA 5A5XB 1GVCA 4KI0E 5TP9A 5DTBA 3CFZA 1MRPA 3C35A 3A3UA 3KN3A 1LBBA 2GFEA 1PB9A 2Y7KA 2ALUA 1MPCA 4GD5A 5I56B 1OMPA 5L9SA 3IK6B 3KOTA 5K2YA 1II5A 3FIRA 5KDTA 2XX9A 2PX1A 1JW5A 1B3LA 2Y7RA 2IEEA 3K6UA 2Q89A 4LQ2A 1NH8A 1FCKA 3VLVA 4PFYA 2UVJA 4JDFA 4MFIA 3LUYA 3MPLA 1FTLA 1Y4TA 3SEWA 1A40A 3T9VA 5K2XA 1B7ZA 2XX8A 2ONKE 1JW4A 4NF4B 5IAIA 2P2AA 4MLVA 3IOVA 2O1MA 1F9BA 5M2VA 3HCQA 4O3BA 1FTKA 4ZDMA 3TCHA 5KZTA 3IR1A 5I58A 5I57B 4G68B 3W9VA 3MZ9A 4H6DA 1FQCA 5LOMA 1EU8A 3TTLA 3Q29A 4QFNA 1ZKBA 2AL5A 3SEXA 1YTVA 1FQDA 1N3XA 5AA2A 1T0KA 3IOWA 3H06B 4H1XA 3G3JA 1YCJA 1R9LA 3THIA 3PUXE 2UXAA 1EH3A 1Y3NA 1JW1A 1GTKA 5AA3A 3DP6A 3OSRA 1MH3A 4FEDA 3Q27A 4NWCA 2PMSA 3O9PA 2QPQA 3SEUA 4YU0A 2DOJA 4F31B 1FQAA 3S9MC 3V5AA 4OWDA 1RKMA 5I2KB 2BJJX 5AA2D 4PFTA 4AB6A 2RINA 3A09A 4QFKA 1URSA 3Q28A 4EDPA 1B1HA 3CIJA 3T66A 4M1VA 4YMAA 4MBPA 1LBCA 5I58B 3C31A 3K1MA 2Z8FA 3B7DA 1M5EA 3OO9A 2QRYA 4ZEKA 2RC8A 4IO2A 4F2OA 4PETA 4POXA 4KHZE 2H9BA 3IOUA 2VHAA 3KN8A 1JVXA 1L5TA 4QRZA 1A8EA 4WKMA 4WXJA 3OO7A 4JSOA 4NMYA 3K00A 1IUDA 4M4GA 1AL3A 1EZ9A 3RY3A 2XXIA 2VP1A 1MPBA 3P7IA 4ELOA 3V8XB 4FAJA 3O66A 5TPAA 1WDNA 4YKPA 1NL5A 3U1OA 3N6UA 3S9LC 1WVJA 1SW5A 1QJMA 3C4MA 3M3FA 1R1NA 5AA4B 3K1PA 4LVQA 2QSXA 1M5DA 3TUSA 3FXUA 1N76A 2GH9A 2I49A 2GHAA 3IOTA 4O3CA 4HS7A 4IO4A 2ZXTA 2X7QA 4R9GA 4RNSA 3HO7A 3UA8A 4RJZA 2QJEA 4GIZA 3G7WA 3IB2A 5L9MA 3LSFB 3O28A 4NEDA 3VE1B 2O51A 1P1QA 2RF1A 4G4PA 3T9HB 4U1OA 1POTA 3PPPA 1VFEA 3R7XA 3QSLA 3RN8A 1MG1A 1QKBA 5HBCA 3OXNA 1IXHA 3KFMA 2D3IA 3MP1A 4QF9A 1FTJA 1IIWA 3H7MA 2V3TA 4UACA 3USDA 5EYFA 1DPPA 4H5GA 3T9XB 2QMXA 1TWYA 3AXFA 1QKAA 3QXMA 4LA9A 4R75A 3FVGA 5AE4A 3TYHA 5ITOA 1JEUA 4C1TA 4IO3A 2V84A 1H44A 2I0CA 2I6EA 4ZS9A 1SVXB 4ZZEA 1DSNA 1B3HA 1NNPA 1ZBMA 1VR5A 2O1LA 4ZZAA 1AOVA 1HSLA 2H4IA 1IZ1A 3FGSA 1MQHA 2OLBA 3O6HA 2DS9A 1Y9UA 3LR1A 5DEXB 3KJTA 3T93B 5DYHA 1IXIA 2P0SA 1SW4A 3QAXA 4DIGA 3FATA 1B5HA 2Z8EA 2XXXA 2ZMBA 4X9TA 3MWBA 4G8NA 3LC8A 5I2NA 2XXQA 1B7UA 4BDNA 1NH7A 4YKIA 1IEJA 2VGQA 2A5TA 5F7VA 2XXHA 3E9XA 4G2ZA 1P99A 4F3PA 2A5SA 3IO6A 3H3GA 1US5A 2RCBA 3K6VA 1A54A 4WEDA 2ZYNA 2ONSA 2F8DA 5ICTA 3U92A 1PBPA 4GFRA 4E0XA 4GOTA 1N7WA 2CZLA 3OENA 3OSQA 3RPWA 3Q25A 5JK4A 1N04A 1FQBA 2PBWA 3K01A 3DP8A 1B2HA 3FJGA 3I3VA 1MY2A 1SI1A 4RA1A 3JZJA 1A99A 3RQTA 3HN0A 1DMBA 3H6VA 4G8HA 3SERA 1B4HA 2UYEA 5ISUA 1P1NA 2X26A 5CMCA 3C32A 4LONB 2F7CA 1O64A 4H0WA 3RT8A 3CSBA 4YZZA 3HHFA 1Q35A 3BBRA 4NF8B 1MQDA 5I59A 1XVXA 4K3FA 3SKPA 4X1BA 2AIXA 3RUMA 4IO7A 4ECFA 1S50A 2H98A 2KLFA 1ZJLA 1DPEA 1TFAA 4XKRA 4PE5B 4NF5B 1IXCA 2H99A 2E0SA 3K6XA 5FHOA 5ITPA 3KBRA 2Z22A 1MQJA 5FHMA 4RXLA 3FVOA 1A7LA 3U72A 4RK2A 1MXYA 4TLLB 3BFUA 3PMXA 2O84X 1QUJA 3ZKKA 2REGA 3TELA 1R9QA 2IA4A 2O7UA 3KG2A 1JQFA 3TTNA 4Q5TA 1MXXA 1ZMGA 3JV9A 3T9UA 4GL0A 4U21A 3CSGA 2QS1A 4F3GA 4MLQA 4Z7EA 5H8NA 2X7PA 5CMMA 4F1YA 4JWOA 4EUOA 4I62A 4GQOA 3TODA 3WAFA 4ELPA 4JB7A 5I84A 4DXUA 4R6YA 4OEUA 5KCJA 2ABHA 3UP9A 3TKDA 1UTBB 1MM7A 2RC9A 4THIA 4YB5A 2NUVA 1MPDA 2I58A 4OYVA 4EXKA 1ELJA 1MQGA 1PB8A 5H8FA 3OELA 4FECA 4MH5A 4EF1A 1S7YA 3ILTB 1IQ7A 4XXUA 1XS5A 3EPEA 4TQUQ 5TU0A 4OEVA 3TTRA 3N26A 1QUIA 4IGTA 3VVDA 4JXIA 3VVEA 1GGGA 1YPNA 5TP9B 1NNTA 1QUKA 3I6VA 1FTOA 3IX1A 3KZGA 5DT6A 5H8QA 1VFDA 2G29A 1NFTA 3D4GA 2UVGA 2OBGA 3M3LA 2B3BA 1DTGA 4XKPA 1YAEA 2E1SA 2R6GE 4PP0A 3VXBA 5KDTB 3EHUA 3MC2A 1FQFA 3PPRA 2OCUA 4F2QA 5JTYA 3S4UA 3OOAA 4YB7A 3V89B 4R6KA 3PPOA 2OWSA 3GXAA 1MQIA 1M5BA 2I4BA 1LAFE 4BDLA 3M3KA 3VDFA 4ELQA 1NKXA 2THIA 1Y3QA 3FXQA 4POWA 3FASA 2DWHA 4NTLA 2Q2CA 4OFJA 1BP5A 5H8QB 1BTJA 4P0GA 4R2BA 1WODA 4ZEFA 1UTHA 3DP4A 3M8UA 3E4RA 4NF6A 1TT1A 2D21A 3MVYA 2GRVA 5AA2B 1HSJA 3OD7A 4U1ZA 3E13X 3VVFA 1N84A 1A55A 1XOCA 1ANFA 4ELRA 3IJXB 3FXRA 1LGBC 4H8IA 4R2FA 3VFJA 4R6HA 4MF3A 3HSTA 2Q88A 1MY3A 3K02A 3HHGA 3SEVA 2I3VA 2F6PA 1H76A 4FORA 3JYRA 4DXBA 1Y3PA 1LCTA 3TDJA 3K1NA 1RYOA 3PV0E 3F11A 3ILUB 1TXFA 3PPNA 2HFBA 1VSOA 3TQWA 4GF8A 4N6PA 4OFOA 3CR9A 2XXPA 4XKNA 3D4CA 2Q2AA 1B6HA 1B32A 1NNKA 2B3FA 2NOOA 4ISUA 4GRKA 3U93A 3PUWE 3O6GA 1Y20A 3DLNA 2Y7WA 4C0RA 1LAHE 2QS2A 4LATA 2PYYA 4RPOA 5ICQA 3LBSA 3TPAA 1SW1A 1B5JA 2REJA 4EQ9A 1NMUA 4QSCA 3V83A 4RPNA 3CFLA 3SDFA 2W7YA 3CFXA 3C9HA 3O6IA 4G8MA 1FTMA 1B0LA 1XC1A 5TPAB 5CC2A 2YJPA 2PVUA 3QK6A 5CM6A 4H65A 1MXVA 1LAXA 1D9YA 1D9VA 1Y1MA 1O63A 4U4SA 1LFIA 2HAUA 3U94A 1ZU0A 2I0BA 3K6WA 2O7IA 4H67A 4HCWA 4QSDA 3MZ1A 3PPQA 1Z7NE 1P1WA 4N13A 4L17A 4N07A 2G93A 1AH5A 5DVIA 1A8FA 4XIGQ 2Y7IA 4G77A 3MVXA 3KSXA 1R6ZA 5EHSA 1IXGA 4ESWA 3ECRA 3IORA 3DM0A 4LP2B 3PD8A 3ZKLA 1QVSA 4LQ5A 4ZE9A 4OERA 4GXSB 3SEYA 4FJPA 2XX7A 3QUJA 3RT6B 3N94A 2ESNA 5CMKA 2HAVA 3A3CA 1OQGA 4IY5A 1SYIA 1JVYA 4DE8A 5H8HA 2XXUA 3VLWA 2DE2A 5DVJA 4YKJA 2F7AA 5L9OA 2XXTA 2I48A 1OIBA 4U4XA 2ZYOA 3EQ1A 3HV1A 2OWTA 3QIMA 4QFLA 3FV2A 4ZE8A 4ND9A 3BFTA 1PDAA 3TEPA 3T22A 3PMVA 2DWJA 2XHDA 4EQ7A 1B40A 4OXVA 4DXCA 4OETA 5CRYA 2RKMA 4KQPA 2OK2A 3FVNA 3SETA 1B51A 3VLUA 3B6QA 2HZLA 3MJNA 1QW0A 1XT8A 1USYH 1ZLQA 2CMOA 3MBPA 5A5XA 4GVOA 4ZEBA 2ZYKA 1OVTA 2NXOA 2ONRA 1IITA 3TCFA 4AQ4A 2R71A 1VE4A 1LB8A 2F36A 2Z8DA 5I56A 1PC3A 5I2NB 4IO6A 3IAZA 3N6TA 1OLAA 5FTHA 3UGWA 3Q26A 1O7TA 2A5TB 1MH4A 3EN3A 4FATA 1BIYA 5BWJA 4JSDA 4OVJA 1H45A 1P1OA 1B3FA 4Z0IA 4ESXA 3H6WA 4G68C 2V93A 4XKQA 3CVGA 3TFLA 3TCGA 1B5IA 4R73A 4PFUA 1D4NA 3RGYA 1D3KA 4IGRA 4NF4A 3MAMA 4Q30B 3S9EA 1P1UA 3KJ7A 5HM4B 5I57A 4G68A 3FJ7A 2F34A 2I3WA 1MY4A 1POY1 4F1VA 4QSEA 1NNFA 2WKYA 3H6UA 4ZECA 4F18A 1ZTYA 1KWHA 4LUBA 1GR2A 4F1UA 2XXYA 2QMWA 3K2DA 4OESA 1SQYA 3HPIA 1AMFA 4QHQA 5I59B 4EXLA 1PBQA 4BDRA 2LAOA 4OQOA 1Q1KA 4OZ9A 3TAJA 1HSEA 3L6HA 1N0TA 5J1DA 1DOTA 3TTKA 2Q8JA 3QUFA 4YB6A 2XD2A 4GXAA 2RCAA 4BDMA 4KCCA 5IKBA 4BDQA 5I2KA 2F5XA 3KSJA 1JEVA 3GBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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